| Residue conformations ------------------------------------------- | |
| P1 : G C1p_exo syn | |
| P2 : U C2p_endo anti | |
| P3 : U C1p_exo anti | |
| P4 : G C2p_endo anti | |
| P5 : U C2p_endo anti | |
| P6 : U C1p_exo anti | |
| P7 : U C2p_exo anti | |
| P8 : U C4p_exo anti | |
| P9 : U C2p_endo anti | |
| P10 : U C2p_endo anti | |
| P11 : U C2p_exo anti | |
| P12 : U C4p_endo syn | |
| Q1 : G O4p_endo syn | |
| Q2 : U O4p_exo syn | |
| Q3 : U C2p_endo anti | |
| Q4 : G C3p_exo anti | |
| Q5 : U C2p_endo anti | |
| Q6 : U C1p_exo anti | |
| Q7 : U C2p_exo anti | |
| Q8 : U C3p_endo anti | |
| Q9 : U C2p_endo anti | |
| Q10 : U C2p_endo anti | |
| Q11 : U O4p_endo anti | |
| Q12 : U O4p_endo syn | |
| A123 : SER | |
| A124 : ASN | |
| A125 : THR | |
| A126 : ASN | |
| A127 : LEU | |
| A128 : ILE | |
| A129 : VAL | |
| A130 : ASN | |
| A131 : TYR | |
| A132 : LEU | |
| A133 : PRO | |
| A134 : GLN | |
| A135 : ASP | |
| A136 : MET | |
| A137 : THR | |
| A138 : ASP | |
| A139 : ARG | |
| A140 : GLU | |
| A141 : LEU | |
| A142 : TYR | |
| A143 : ALA | |
| A144 : LEU | |
| A145 : PHE | |
| A146 : ARG | |
| A147 : ALA | |
| A148 : ILE | |
| A149 : GLY | |
| A150 : PRO | |
| A151 : ILE | |
| A152 : ASN | |
| A153 : THR | |
| A154 : CYS | |
| A155 : ARG | |
| A156 : ILE | |
| A157 : MET | |
| A158 : ARG | |
| A159 : ASP | |
| A160 : TYR | |
| A161 : LYS | |
| A162 : THR | |
| A163 : GLY | |
| A164 : TYR | |
| A165 : SER | |
| A166 : TYR | |
| A167 : GLY | |
| A168 : TYR | |
| A169 : ALA | |
| A170 : PHE | |
| A171 : VAL | |
| A172 : ASP | |
| A173 : PHE | |
| A174 : THR | |
| A175 : SER | |
| A176 : GLU | |
| A177 : MET | |
| A178 : ASP | |
| A179 : SER | |
| A180 : GLN | |
| A181 : ARG | |
| A182 : ALA | |
| A183 : ILE | |
| A184 : LYS | |
| A185 : VAL | |
| A186 : LEU | |
| A187 : ASN | |
| A188 : GLY | |
| A189 : ILE | |
| A190 : THR | |
| A191 : VAL | |
| A192 : ARG | |
| A193 : ASN | |
| A194 : LYS | |
| A195 : ARG | |
| A196 : LEU | |
| A197 : LYS | |
| A198 : VAL | |
| A199 : SER | |
| A200 : TYR | |
| A201 : ALA | |
| A202 : ARG | |
| A203 : PRO | |
| A204 : GLY | |
| A205 : GLY | |
| A206 : GLU | |
| A207 : SER | |
| A208 : ILE | |
| A209 : LYS | |
| A210 : ASP | |
| A211 : THR | |
| A212 : ASN | |
| A213 : LEU | |
| A214 : TYR | |
| A215 : VAL | |
| A216 : THR | |
| A217 : ASN | |
| A218 : LEU | |
| A219 : PRO | |
| A220 : ARG | |
| A221 : THR | |
| A222 : ILE | |
| A223 : THR | |
| A224 : ASP | |
| A225 : ASP | |
| A226 : GLN | |
| A227 : LEU | |
| A228 : ASP | |
| A229 : THR | |
| A230 : ILE | |
| A231 : PHE | |
| A232 : GLY | |
| A233 : LYS | |
| A234 : TYR | |
| A235 : GLY | |
| A236 : SER | |
| A237 : ILE | |
| A238 : VAL | |
| A239 : GLN | |
| A240 : LYS | |
| A241 : ASN | |
| A242 : ILE | |
| A243 : LEU | |
| A244 : ARG | |
| A245 : ASP | |
| A246 : LYS | |
| A247 : LEU | |
| A248 : THR | |
| A249 : GLY | |
| A250 : ARG | |
| A251 : PRO | |
| A252 : ARG | |
| A253 : GLY | |
| A254 : VAL | |
| A255 : ALA | |
| A256 : PHE | |
| A257 : VAL | |
| A258 : ARG | |
| A259 : TYR | |
| A260 : ASN | |
| A261 : LYS | |
| A262 : ARG | |
| A263 : GLU | |
| A264 : GLU | |
| A265 : ALA | |
| A266 : GLN | |
| A267 : GLU | |
| A268 : ALA | |
| A269 : ILE | |
| A270 : SER | |
| A271 : ALA | |
| A272 : LEU | |
| A273 : ASN | |
| A274 : ASN | |
| A275 : VAL | |
| A276 : ILE | |
| A277 : PRO | |
| A278 : GLU | |
| A279 : GLY | |
| A280 : GLY | |
| A281 : SER | |
| A282 : GLN | |
| A283 : PRO | |
| A284 : LEU | |
| A285 : SER | |
| A286 : VAL | |
| A287 : ARG | |
| A288 : LEU | |
| A289 : ALA | |
| B123 : SER | |
| B124 : ASN | |
| B125 : THR | |
| B126 : ASN | |
| B127 : LEU | |
| B128 : ILE | |
| B129 : VAL | |
| B130 : ASN | |
| B131 : TYR | |
| B132 : LEU | |
| B133 : PRO | |
| B134 : GLN | |
| B135 : ASP | |
| B136 : MET | |
| B137 : THR | |
| B138 : ASP | |
| B139 : ARG | |
| B140 : GLU | |
| B141 : LEU | |
| B142 : TYR | |
| B143 : ALA | |
| B144 : LEU | |
| B145 : PHE | |
| B146 : ARG | |
| B147 : ALA | |
| B148 : ILE | |
| B149 : GLY | |
| B150 : PRO | |
| B151 : ILE | |
| B152 : ASN | |
| B153 : THR | |
| B154 : CYS | |
| B155 : ARG | |
| B156 : ILE | |
| B157 : MET | |
| B158 : ARG | |
| B159 : ASP | |
| B160 : TYR | |
| B161 : LYS | |
| B162 : THR | |
| B163 : GLY | |
| B164 : TYR | |
| B165 : SER | |
| B166 : TYR | |
| B167 : GLY | |
| B168 : TYR | |
| B169 : ALA | |
| B170 : PHE | |
| B171 : VAL | |
| B172 : ASP | |
| B173 : PHE | |
| B174 : THR | |
| B175 : SER | |
| B176 : GLU | |
| B177 : MET | |
| B178 : ASP | |
| B179 : SER | |
| B180 : GLN | |
| B181 : ARG | |
| B182 : ALA | |
| B183 : ILE | |
| B184 : LYS | |
| B185 : VAL | |
| B186 : LEU | |
| B187 : ASN | |
| B188 : GLY | |
| B189 : ILE | |
| B190 : THR | |
| B191 : VAL | |
| B192 : ARG | |
| B193 : ASN | |
| B194 : LYS | |
| B195 : ARG | |
| B196 : LEU | |
| B197 : LYS | |
| B198 : VAL | |
| B199 : SER | |
| B200 : TYR | |
| B201 : ALA | |
| B202 : ARG | |
| B203 : PRO | |
| B204 : GLY | |
| B205 : GLY | |
| B206 : GLU | |
| B207 : SER | |
| B208 : ILE | |
| B209 : LYS | |
| B210 : ASP | |
| B211 : THR | |
| B212 : ASN | |
| B213 : LEU | |
| B214 : TYR | |
| B215 : VAL | |
| B216 : THR | |
| B217 : ASN | |
| B218 : LEU | |
| B219 : PRO | |
| B220 : ARG | |
| B221 : THR | |
| B222 : ILE | |
| B223 : THR | |
| B224 : ASP | |
| B225 : ASP | |
| B226 : GLN | |
| B227 : LEU | |
| B228 : ASP | |
| B229 : THR | |
| B230 : ILE | |
| B231 : PHE | |
| B232 : GLY | |
| B233 : LYS | |
| B234 : TYR | |
| B235 : GLY | |
| B236 : SER | |
| B237 : ILE | |
| B238 : VAL | |
| B239 : GLN | |
| B240 : LYS | |
| B241 : ASN | |
| B242 : ILE | |
| B243 : LEU | |
| B244 : ARG | |
| B245 : ASP | |
| B246 : LYS | |
| B247 : LEU | |
| B248 : THR | |
| B249 : GLY | |
| B250 : ARG | |
| B251 : PRO | |
| B252 : ARG | |
| B253 : GLY | |
| B254 : VAL | |
| B255 : ALA | |
| B256 : PHE | |
| B257 : VAL | |
| B258 : ARG | |
| B259 : TYR | |
| B260 : ASN | |
| B261 : LYS | |
| B262 : ARG | |
| B263 : GLU | |
| B264 : GLU | |
| B265 : ALA | |
| B266 : GLN | |
| B267 : GLU | |
| B268 : ALA | |
| B269 : ILE | |
| B270 : SER | |
| B271 : ALA | |
| B272 : LEU | |
| B273 : ASN | |
| B274 : ASN | |
| B275 : VAL | |
| B276 : ILE | |
| B277 : PRO | |
| B278 : GLU | |
| B279 : GLY | |
| B280 : GLY | |
| B281 : SER | |
| B282 : GLN | |
| B283 : PRO | |
| B284 : LEU | |
| B285 : SER | |
| B286 : VAL | |
| B287 : ARG | |
| B288 : LEU | |
| B289 : ALA | |
| P42 : HOH | |
| P59 : HOH | |
| P62 : HOH | |
| P104 : HOH | |
| P116 : HOH | |
| P128 : HOH | |
| P149 : HOH | |
| Q20 : HOH | |
| Q32 : HOH | |
| Q48 : HOH | |
| Q78 : HOH | |
| Q123 : HOH | |
| Q132 : HOH | |
| Q143 : HOH | |
| Q145 : HOH | |
| A290 : HOH | |
| A291 : HOH | |
| A292 : HOH | |
| A293 : HOH | |
| A294 : HOH | |
| A295 : HOH | |
| A296 : HOH | |
| A297 : HOH | |
| A298 : HOH | |
| A299 : HOH | |
| A300 : HOH | |
| A301 : HOH | |
| A302 : HOH | |
| A303 : HOH | |
| A304 : HOH | |
| A305 : HOH | |
| A306 : HOH | |
| A307 : HOH | |
| A308 : HOH | |
| A309 : HOH | |
| A310 : HOH | |
| A311 : HOH | |
| A312 : HOH | |
| A313 : HOH | |
| A314 : HOH | |
| A315 : HOH | |
| A316 : HOH | |
| A317 : HOH | |
| A318 : HOH | |
| A319 : HOH | |
| A320 : HOH | |
| A321 : HOH | |
| A322 : HOH | |
| A323 : HOH | |
| A324 : HOH | |
| A325 : HOH | |
| B290 : HOH | |
| B291 : HOH | |
| B292 : HOH | |
| B293 : HOH | |
| B294 : HOH | |
| B295 : HOH | |
| B296 : HOH | |
| B297 : HOH | |
| B298 : HOH | |
| B299 : HOH | |
| B300 : HOH | |
| B301 : HOH | |
| B302 : HOH | |
| B303 : HOH | |
| B304 : HOH | |
| B305 : HOH | |
| B306 : HOH | |
| B307 : HOH | |
| B308 : HOH | |
| B309 : HOH | |
| B310 : HOH | |
| B311 : HOH | |
| B312 : HOH | |
| B313 : HOH | |
| B314 : HOH | |
| B315 : HOH | |
| B316 : HOH | |
| B317 : HOH | |
| B318 : HOH | |
| B319 : HOH | |
| B320 : HOH | |
| B321 : HOH | |
| B322 : HOH | |
| Adjacent stackings ---------------------------------------------- | |
| P7-P8 : adjacent_5p upward | |
| Q7-Q8 : adjacent_5p upward | |
| Non-Adjacent stackings ------------------------------------------ | |
| Number of stackings = 2 | |
| Number of adjacent stackings = 2 | |
| Number of non adjacent stackings = 0 | |
| Base-pairs ------------------------------------------------------ | |
| Q3-Q4 : U-G O2P/Hh O2P/Hh adjacent_5p pairing | |
| Q9-Q10 : U-U Ss/Hh adjacent_5p pairing parallel cis one_hbond | |