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1av6_MC
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1 |
+
Residue conformations -------------------------------------------
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2 |
+
B402 : G C2p_exo anti
|
3 |
+
B403 : A C3p_endo anti
|
4 |
+
B404 : A C3p_endo anti
|
5 |
+
B405 : A C3p_endo anti
|
6 |
+
B406 : A C2p_exo anti
|
7 |
+
B407 : A C3p_endo anti
|
8 |
+
A3 : VAL
|
9 |
+
A4 : VAL
|
10 |
+
A5 : SER
|
11 |
+
A6 : LEU
|
12 |
+
A7 : ASP
|
13 |
+
A8 : LYS
|
14 |
+
A9 : PRO
|
15 |
+
A10 : PHE
|
16 |
+
A11 : MET
|
17 |
+
A12 : TYR
|
18 |
+
A13 : PHE
|
19 |
+
A14 : GLU
|
20 |
+
A15 : GLU
|
21 |
+
A16 : ILE
|
22 |
+
A17 : ASP
|
23 |
+
A18 : ASN
|
24 |
+
A19 : GLU
|
25 |
+
A20 : LEU
|
26 |
+
A21 : ASP
|
27 |
+
A22 : TYR
|
28 |
+
A23 : GLU
|
29 |
+
A24 : PRO
|
30 |
+
A25 : GLU
|
31 |
+
A26 : SER
|
32 |
+
A27 : ALA
|
33 |
+
A28 : ASN
|
34 |
+
A29 : GLU
|
35 |
+
A30 : VAL
|
36 |
+
A31 : ALA
|
37 |
+
A32 : LYS
|
38 |
+
A33 : LYS
|
39 |
+
A34 : LEU
|
40 |
+
A35 : PRO
|
41 |
+
A36 : TYR
|
42 |
+
A37 : GLN
|
43 |
+
A38 : GLY
|
44 |
+
A39 : GLN
|
45 |
+
A40 : LEU
|
46 |
+
A41 : LYS
|
47 |
+
A42 : LEU
|
48 |
+
A43 : LEU
|
49 |
+
A44 : LEU
|
50 |
+
A45 : GLY
|
51 |
+
A46 : GLU
|
52 |
+
A47 : LEU
|
53 |
+
A48 : PHE
|
54 |
+
A49 : PHE
|
55 |
+
A50 : LEU
|
56 |
+
A51 : SER
|
57 |
+
A52 : LYS
|
58 |
+
A53 : LEU
|
59 |
+
A54 : GLN
|
60 |
+
A55 : ARG
|
61 |
+
A56 : HIS
|
62 |
+
A57 : GLY
|
63 |
+
A58 : ILE
|
64 |
+
A59 : LEU
|
65 |
+
A60 : ASP
|
66 |
+
A61 : GLY
|
67 |
+
A62 : ALA
|
68 |
+
A63 : THR
|
69 |
+
A64 : VAL
|
70 |
+
A65 : VAL
|
71 |
+
A66 : TYR
|
72 |
+
A67 : ILE
|
73 |
+
A68 : GLY
|
74 |
+
A69 : SER
|
75 |
+
A70 : ALA
|
76 |
+
A71 : PRO
|
77 |
+
A72 : GLY
|
78 |
+
A73 : THR
|
79 |
+
A74 : HIS
|
80 |
+
A75 : ILE
|
81 |
+
A76 : ARG
|
82 |
+
A77 : TYR
|
83 |
+
A78 : LEU
|
84 |
+
A79 : ARG
|
85 |
+
A80 : ASP
|
86 |
+
A81 : HIS
|
87 |
+
A82 : PHE
|
88 |
+
A83 : TYR
|
89 |
+
A84 : ASN
|
90 |
+
A85 : LEU
|
91 |
+
A86 : GLY
|
92 |
+
A87 : VAL
|
93 |
+
A88 : ILE
|
94 |
+
A89 : ILE
|
95 |
+
A90 : LYS
|
96 |
+
A91 : TRP
|
97 |
+
A92 : MET
|
98 |
+
A93 : LEU
|
99 |
+
A94 : ILE
|
100 |
+
A95 : ASP
|
101 |
+
A96 : GLY
|
102 |
+
A97 : ARG
|
103 |
+
A98 : HIS
|
104 |
+
A99 : HIS
|
105 |
+
A100 : ASP
|
106 |
+
A101 : PRO
|
107 |
+
A102 : ILE
|
108 |
+
A103 : LEU
|
109 |
+
A104 : ASN
|
110 |
+
A105 : GLY
|
111 |
+
A106 : LEU
|
112 |
+
A107 : ARG
|
113 |
+
A108 : ASP
|
114 |
+
A109 : VAL
|
115 |
+
A110 : THR
|
116 |
+
A111 : LEU
|
117 |
+
A112 : VAL
|
118 |
+
A113 : THR
|
119 |
+
A114 : ARG
|
120 |
+
A115 : PHE
|
121 |
+
A116 : VAL
|
122 |
+
A117 : ASP
|
123 |
+
A118 : GLU
|
124 |
+
A119 : GLU
|
125 |
+
A120 : TYR
|
126 |
+
A121 : LEU
|
127 |
+
A122 : ARG
|
128 |
+
A123 : SER
|
129 |
+
A124 : ILE
|
130 |
+
A125 : LYS
|
131 |
+
A126 : LYS
|
132 |
+
A127 : GLN
|
133 |
+
A128 : LEU
|
134 |
+
A129 : HIS
|
135 |
+
A130 : PRO
|
136 |
+
A131 : SER
|
137 |
+
A132 : LYS
|
138 |
+
A133 : ILE
|
139 |
+
A134 : ILE
|
140 |
+
A135 : LEU
|
141 |
+
A136 : ILE
|
142 |
+
A137 : SER
|
143 |
+
A138 : ASP
|
144 |
+
A139 : VAL
|
145 |
+
A140 : ARG
|
146 |
+
A141 : SER
|
147 |
+
A148 : PRO
|
148 |
+
A149 : SER
|
149 |
+
A150 : THR
|
150 |
+
A151 : ALA
|
151 |
+
A152 : ASP
|
152 |
+
A153 : LEU
|
153 |
+
A154 : LEU
|
154 |
+
A155 : SER
|
155 |
+
A156 : ASN
|
156 |
+
A157 : TYR
|
157 |
+
A158 : ALA
|
158 |
+
A159 : LEU
|
159 |
+
A160 : GLN
|
160 |
+
A161 : ASN
|
161 |
+
A162 : VAL
|
162 |
+
A163 : MET
|
163 |
+
A164 : ILE
|
164 |
+
A165 : SER
|
165 |
+
A166 : ILE
|
166 |
+
A167 : LEU
|
167 |
+
A168 : ASN
|
168 |
+
A169 : PRO
|
169 |
+
A170 : VAL
|
170 |
+
A171 : ALA
|
171 |
+
A172 : SER
|
172 |
+
A173 : SER
|
173 |
+
A174 : LEU
|
174 |
+
A175 : LYS
|
175 |
+
A176 : TRP
|
176 |
+
A177 : ARG
|
177 |
+
A178 : CYS
|
178 |
+
A179 : PRO
|
179 |
+
A180 : PHE
|
180 |
+
A181 : PRO
|
181 |
+
A182 : ASP
|
182 |
+
A183 : GLN
|
183 |
+
A184 : TRP
|
184 |
+
A185 : ILE
|
185 |
+
A186 : LYS
|
186 |
+
A187 : ASP
|
187 |
+
A188 : PHE
|
188 |
+
A189 : TYR
|
189 |
+
A190 : ILE
|
190 |
+
A191 : PRO
|
191 |
+
A192 : HIS
|
192 |
+
A193 : GLY
|
193 |
+
A194 : ASN
|
194 |
+
A195 : LYS
|
195 |
+
A196 : MET
|
196 |
+
A197 : LEU
|
197 |
+
A198 : GLN
|
198 |
+
A199 : PRO
|
199 |
+
A200 : PHE
|
200 |
+
A201 : ALA
|
201 |
+
A202 : PRO
|
202 |
+
A203 : SER
|
203 |
+
A204 : TYR
|
204 |
+
A205 : SER
|
205 |
+
A206 : ALA
|
206 |
+
A207 : GLU
|
207 |
+
A208 : MET
|
208 |
+
A209 : ARG
|
209 |
+
A210 : LEU
|
210 |
+
A211 : LEU
|
211 |
+
A212 : SER
|
212 |
+
A213 : ILE
|
213 |
+
A214 : TYR
|
214 |
+
A215 : THR
|
215 |
+
A216 : GLY
|
216 |
+
A217 : GLU
|
217 |
+
A218 : ASN
|
218 |
+
A219 : MET
|
219 |
+
A220 : ARG
|
220 |
+
A221 : LEU
|
221 |
+
A222 : THR
|
222 |
+
A223 : ARG
|
223 |
+
A224 : VAL
|
224 |
+
A225 : THR
|
225 |
+
A226 : LYS
|
226 |
+
A227 : SER
|
227 |
+
A228 : ASP
|
228 |
+
A229 : ALA
|
229 |
+
A230 : VAL
|
230 |
+
A231 : ASN
|
231 |
+
A232 : TYR
|
232 |
+
A233 : GLU
|
233 |
+
A234 : LYS
|
234 |
+
A235 : LYS
|
235 |
+
A236 : MET
|
236 |
+
A237 : TYR
|
237 |
+
A238 : TYR
|
238 |
+
A239 : LEU
|
239 |
+
A240 : ASN
|
240 |
+
A241 : LYS
|
241 |
+
A242 : ILE
|
242 |
+
A243 : VAL
|
243 |
+
A244 : ARG
|
244 |
+
A245 : ASN
|
245 |
+
A246 : LYS
|
246 |
+
A247 : VAL
|
247 |
+
A248 : VAL
|
248 |
+
A249 : VAL
|
249 |
+
A250 : ASN
|
250 |
+
A251 : PHE
|
251 |
+
A252 : ASP
|
252 |
+
A253 : TYR
|
253 |
+
A254 : PRO
|
254 |
+
A255 : ASN
|
255 |
+
A256 : GLN
|
256 |
+
A257 : GLU
|
257 |
+
A258 : TYR
|
258 |
+
A259 : ASP
|
259 |
+
A260 : TYR
|
260 |
+
A261 : PHE
|
261 |
+
A262 : HIS
|
262 |
+
A263 : MET
|
263 |
+
A264 : TYR
|
264 |
+
A265 : PHE
|
265 |
+
A266 : MET
|
266 |
+
A267 : LEU
|
267 |
+
A268 : ARG
|
268 |
+
A269 : THR
|
269 |
+
A270 : VAL
|
270 |
+
A271 : TYR
|
271 |
+
A272 : CYS
|
272 |
+
A273 : ASN
|
273 |
+
A274 : LYS
|
274 |
+
A275 : THR
|
275 |
+
A276 : PHE
|
276 |
+
A277 : PRO
|
277 |
+
A278 : THR
|
278 |
+
A279 : THR
|
279 |
+
A280 : LYS
|
280 |
+
A281 : ALA
|
281 |
+
A282 : LYS
|
282 |
+
A283 : VAL
|
283 |
+
A284 : LEU
|
284 |
+
A285 : PHE
|
285 |
+
A286 : LEU
|
286 |
+
A287 : GLN
|
287 |
+
A288 : GLN
|
288 |
+
A289 : SER
|
289 |
+
A290 : ILE
|
290 |
+
A291 : PHE
|
291 |
+
A292 : ARG
|
292 |
+
A293 : PHE
|
293 |
+
A294 : LEU
|
294 |
+
A295 : ASN
|
295 |
+
A296 : ILE
|
296 |
+
A297 : PRO
|
297 |
+
B408 : MGT
|
298 |
+
A400 : SAH
|
299 |
+
Adjacent stackings ----------------------------------------------
|
300 |
+
B402-B403 : adjacent_5p upward
|
301 |
+
B403-B404 : adjacent_5p upward
|
302 |
+
B405-B406 : adjacent_5p upward
|
303 |
+
B406-B407 : adjacent_5p upward
|
304 |
+
Non-Adjacent stackings ------------------------------------------
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305 |
+
Number of stackings = 4
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306 |
+
Number of adjacent stackings = 4
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307 |
+
Number of non adjacent stackings = 0
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308 |
+
Base-pairs ------------------------------------------------------
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