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Residue conformations -------------------------------------------
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2 |
+
R3 : A C3p_endo anti
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3 |
+
R4 : U C3p_endo anti
|
4 |
+
R5 : G C3p_endo anti
|
5 |
+
R6 : A C2p_exo syn
|
6 |
+
R7 : G C3p_endo anti
|
7 |
+
R8 : G C3p_endo anti
|
8 |
+
R9 : A C3p_endo anti
|
9 |
+
R10 : U C2p_endo anti
|
10 |
+
R11 : U C2p_endo anti
|
11 |
+
R12 : A C2p_endo anti
|
12 |
+
R13 : C C3p_endo anti
|
13 |
+
R14 : C C3p_endo anti
|
14 |
+
R15 : C C3p_endo anti
|
15 |
+
R16 : A C3p_endo anti
|
16 |
+
R17 : U C3p_endo anti
|
17 |
+
R18 : G C4p_exo anti
|
18 |
+
S4 : U C3p_endo anti
|
19 |
+
S5 : G C3p_endo anti
|
20 |
+
S6 : A C2p_exo syn
|
21 |
+
S7 : G C3p_endo anti
|
22 |
+
S8 : G C3p_endo anti
|
23 |
+
S9 : A C3p_endo anti
|
24 |
+
S10 : U C1p_exo anti
|
25 |
+
S11 : U C2p_endo anti
|
26 |
+
S12 : A C2p_endo anti
|
27 |
+
S13 : C C3p_endo anti
|
28 |
+
S14 : C C3p_endo anti
|
29 |
+
S15 : C C3p_endo anti
|
30 |
+
A1 : ALA
|
31 |
+
A2 : SER
|
32 |
+
A3 : ASN
|
33 |
+
A4 : PHE
|
34 |
+
A5 : THR
|
35 |
+
A6 : GLN
|
36 |
+
A7 : PHE
|
37 |
+
A8 : VAL
|
38 |
+
A9 : LEU
|
39 |
+
A10 : VAL
|
40 |
+
A11 : ASP
|
41 |
+
A12 : ASN
|
42 |
+
A13 : GLY
|
43 |
+
A14 : GLY
|
44 |
+
A15 : THR
|
45 |
+
A16 : GLY
|
46 |
+
A17 : ASP
|
47 |
+
A18 : VAL
|
48 |
+
A19 : THR
|
49 |
+
A20 : VAL
|
50 |
+
A21 : ALA
|
51 |
+
A22 : PRO
|
52 |
+
A23 : SER
|
53 |
+
A24 : ASN
|
54 |
+
A25 : PHE
|
55 |
+
A26 : ALA
|
56 |
+
A27 : ASN
|
57 |
+
A28 : GLY
|
58 |
+
A29 : VAL
|
59 |
+
A30 : ALA
|
60 |
+
A31 : GLU
|
61 |
+
A32 : TRP
|
62 |
+
A33 : ILE
|
63 |
+
A34 : SER
|
64 |
+
A35 : SER
|
65 |
+
A36 : ASN
|
66 |
+
A37 : SER
|
67 |
+
A38 : ARG
|
68 |
+
A39 : SER
|
69 |
+
A40 : GLN
|
70 |
+
A41 : ALA
|
71 |
+
A42 : TYR
|
72 |
+
A43 : LYS
|
73 |
+
A44 : VAL
|
74 |
+
A45 : THR
|
75 |
+
A46 : CYS
|
76 |
+
A47 : SER
|
77 |
+
A48 : VAL
|
78 |
+
A49 : ARG
|
79 |
+
A50 : GLN
|
80 |
+
A51 : SER
|
81 |
+
A52 : SER
|
82 |
+
A53 : ALA
|
83 |
+
A54 : GLN
|
84 |
+
A55 : ASN
|
85 |
+
A56 : ARG
|
86 |
+
A57 : LYS
|
87 |
+
A58 : TYR
|
88 |
+
A59 : SER
|
89 |
+
A60 : ILE
|
90 |
+
A61 : LYS
|
91 |
+
A62 : VAL
|
92 |
+
A63 : GLU
|
93 |
+
A64 : VAL
|
94 |
+
A65 : PRO
|
95 |
+
A66 : LYS
|
96 |
+
A67 : VAL
|
97 |
+
A68 : ALA
|
98 |
+
A69 : THR
|
99 |
+
A70 : GLN
|
100 |
+
A71 : THR
|
101 |
+
A72 : VAL
|
102 |
+
A73 : GLY
|
103 |
+
A74 : GLY
|
104 |
+
A75 : VAL
|
105 |
+
A76 : GLU
|
106 |
+
A77 : LEU
|
107 |
+
A78 : PRO
|
108 |
+
A79 : VAL
|
109 |
+
A80 : ALA
|
110 |
+
A81 : ALA
|
111 |
+
A82 : TRP
|
112 |
+
A83 : ARG
|
113 |
+
A84 : SER
|
114 |
+
A85 : TYR
|
115 |
+
A86 : LEU
|
116 |
+
A87 : ASN
|
117 |
+
A88 : MET
|
118 |
+
A89 : GLU
|
119 |
+
A90 : LEU
|
120 |
+
A91 : THR
|
121 |
+
A92 : ILE
|
122 |
+
A93 : PRO
|
123 |
+
A94 : ILE
|
124 |
+
A95 : PHE
|
125 |
+
A96 : ALA
|
126 |
+
A97 : THR
|
127 |
+
A98 : ASN
|
128 |
+
A99 : SER
|
129 |
+
A100 : ASP
|
130 |
+
A101 : CYS
|
131 |
+
A102 : GLU
|
132 |
+
A103 : LEU
|
133 |
+
A104 : ILE
|
134 |
+
A105 : VAL
|
135 |
+
A106 : LYS
|
136 |
+
A107 : ALA
|
137 |
+
A108 : MET
|
138 |
+
A109 : GLN
|
139 |
+
A110 : GLY
|
140 |
+
A111 : LEU
|
141 |
+
A112 : LEU
|
142 |
+
A113 : LYS
|
143 |
+
A114 : ASP
|
144 |
+
A115 : GLY
|
145 |
+
A116 : ASN
|
146 |
+
A117 : PRO
|
147 |
+
A118 : ILE
|
148 |
+
A119 : PRO
|
149 |
+
A120 : SER
|
150 |
+
A121 : ALA
|
151 |
+
A122 : ILE
|
152 |
+
A123 : ALA
|
153 |
+
A124 : ALA
|
154 |
+
A125 : ASN
|
155 |
+
A126 : SER
|
156 |
+
A127 : GLY
|
157 |
+
A128 : ILE
|
158 |
+
A129 : TYR
|
159 |
+
B1 : ALA
|
160 |
+
B2 : SER
|
161 |
+
B3 : ASN
|
162 |
+
B4 : PHE
|
163 |
+
B5 : THR
|
164 |
+
B6 : GLN
|
165 |
+
B7 : PHE
|
166 |
+
B8 : VAL
|
167 |
+
B9 : LEU
|
168 |
+
B10 : VAL
|
169 |
+
B11 : ASP
|
170 |
+
B12 : ASN
|
171 |
+
B13 : GLY
|
172 |
+
B14 : GLY
|
173 |
+
B15 : THR
|
174 |
+
B16 : GLY
|
175 |
+
B17 : ASP
|
176 |
+
B18 : VAL
|
177 |
+
B19 : THR
|
178 |
+
B20 : VAL
|
179 |
+
B21 : ALA
|
180 |
+
B22 : PRO
|
181 |
+
B23 : SER
|
182 |
+
B24 : ASN
|
183 |
+
B25 : PHE
|
184 |
+
B26 : ALA
|
185 |
+
B27 : ASN
|
186 |
+
B28 : GLY
|
187 |
+
B29 : VAL
|
188 |
+
B30 : ALA
|
189 |
+
B31 : GLU
|
190 |
+
B32 : TRP
|
191 |
+
B33 : ILE
|
192 |
+
B34 : SER
|
193 |
+
B35 : SER
|
194 |
+
B36 : ASN
|
195 |
+
B37 : SER
|
196 |
+
B38 : ARG
|
197 |
+
B39 : SER
|
198 |
+
B40 : GLN
|
199 |
+
B41 : ALA
|
200 |
+
B42 : TYR
|
201 |
+
B43 : LYS
|
202 |
+
B44 : VAL
|
203 |
+
B45 : THR
|
204 |
+
B46 : CYS
|
205 |
+
B47 : SER
|
206 |
+
B48 : VAL
|
207 |
+
B49 : ARG
|
208 |
+
B50 : GLN
|
209 |
+
B51 : SER
|
210 |
+
B52 : SER
|
211 |
+
B53 : ALA
|
212 |
+
B54 : GLN
|
213 |
+
B55 : ASN
|
214 |
+
B56 : ARG
|
215 |
+
B57 : LYS
|
216 |
+
B58 : TYR
|
217 |
+
B59 : SER
|
218 |
+
B60 : ILE
|
219 |
+
B61 : LYS
|
220 |
+
B62 : VAL
|
221 |
+
B63 : GLU
|
222 |
+
B64 : VAL
|
223 |
+
B65 : PRO
|
224 |
+
B66 : LYS
|
225 |
+
B67 : VAL
|
226 |
+
B68 : ALA
|
227 |
+
B69 : THR
|
228 |
+
B70 : GLN
|
229 |
+
B71 : THR
|
230 |
+
B72 : VAL
|
231 |
+
B73 : GLY
|
232 |
+
B74 : GLY
|
233 |
+
B75 : VAL
|
234 |
+
B76 : GLU
|
235 |
+
B77 : LEU
|
236 |
+
B78 : PRO
|
237 |
+
B79 : VAL
|
238 |
+
B80 : ALA
|
239 |
+
B81 : ALA
|
240 |
+
B82 : TRP
|
241 |
+
B83 : ARG
|
242 |
+
B84 : SER
|
243 |
+
B85 : TYR
|
244 |
+
B86 : LEU
|
245 |
+
B87 : ASN
|
246 |
+
B88 : MET
|
247 |
+
B89 : GLU
|
248 |
+
B90 : LEU
|
249 |
+
B91 : THR
|
250 |
+
B92 : ILE
|
251 |
+
B93 : PRO
|
252 |
+
B94 : ILE
|
253 |
+
B95 : PHE
|
254 |
+
B96 : ALA
|
255 |
+
B97 : THR
|
256 |
+
B98 : ASN
|
257 |
+
B99 : SER
|
258 |
+
B100 : ASP
|
259 |
+
B101 : CYS
|
260 |
+
B102 : GLU
|
261 |
+
B103 : LEU
|
262 |
+
B104 : ILE
|
263 |
+
B105 : VAL
|
264 |
+
B106 : LYS
|
265 |
+
B107 : ALA
|
266 |
+
B108 : MET
|
267 |
+
B109 : GLN
|
268 |
+
B110 : GLY
|
269 |
+
B111 : LEU
|
270 |
+
B112 : LEU
|
271 |
+
B113 : LYS
|
272 |
+
B114 : ASP
|
273 |
+
B115 : GLY
|
274 |
+
B116 : ASN
|
275 |
+
B117 : PRO
|
276 |
+
B118 : ILE
|
277 |
+
B119 : PRO
|
278 |
+
B120 : SER
|
279 |
+
B121 : ALA
|
280 |
+
B122 : ILE
|
281 |
+
B123 : ALA
|
282 |
+
B124 : ALA
|
283 |
+
B125 : ASN
|
284 |
+
B126 : SER
|
285 |
+
B127 : GLY
|
286 |
+
B128 : ILE
|
287 |
+
B129 : TYR
|
288 |
+
C1 : ALA
|
289 |
+
C2 : SER
|
290 |
+
C3 : ASN
|
291 |
+
C4 : PHE
|
292 |
+
C5 : THR
|
293 |
+
C6 : GLN
|
294 |
+
C7 : PHE
|
295 |
+
C8 : VAL
|
296 |
+
C9 : LEU
|
297 |
+
C10 : VAL
|
298 |
+
C11 : ASP
|
299 |
+
C12 : ASN
|
300 |
+
C13 : GLY
|
301 |
+
C14 : GLY
|
302 |
+
C15 : THR
|
303 |
+
C16 : GLY
|
304 |
+
C17 : ASP
|
305 |
+
C18 : VAL
|
306 |
+
C19 : THR
|
307 |
+
C20 : VAL
|
308 |
+
C21 : ALA
|
309 |
+
C22 : PRO
|
310 |
+
C23 : SER
|
311 |
+
C24 : ASN
|
312 |
+
C25 : PHE
|
313 |
+
C26 : ALA
|
314 |
+
C27 : ASN
|
315 |
+
C28 : GLY
|
316 |
+
C29 : VAL
|
317 |
+
C30 : ALA
|
318 |
+
C31 : GLU
|
319 |
+
C32 : TRP
|
320 |
+
C33 : ILE
|
321 |
+
C34 : SER
|
322 |
+
C35 : SER
|
323 |
+
C36 : ASN
|
324 |
+
C37 : SER
|
325 |
+
C38 : ARG
|
326 |
+
C39 : SER
|
327 |
+
C40 : GLN
|
328 |
+
C41 : ALA
|
329 |
+
C42 : TYR
|
330 |
+
C43 : LYS
|
331 |
+
C44 : VAL
|
332 |
+
C45 : THR
|
333 |
+
C46 : CYS
|
334 |
+
C47 : SER
|
335 |
+
C48 : VAL
|
336 |
+
C49 : ARG
|
337 |
+
C50 : GLN
|
338 |
+
C51 : SER
|
339 |
+
C52 : SER
|
340 |
+
C53 : ALA
|
341 |
+
C54 : GLN
|
342 |
+
C55 : ASN
|
343 |
+
C56 : ARG
|
344 |
+
C57 : LYS
|
345 |
+
C58 : TYR
|
346 |
+
C59 : SER
|
347 |
+
C60 : ILE
|
348 |
+
C61 : LYS
|
349 |
+
C62 : VAL
|
350 |
+
C63 : GLU
|
351 |
+
C64 : VAL
|
352 |
+
C65 : PRO
|
353 |
+
C66 : LYS
|
354 |
+
C67 : VAL
|
355 |
+
C68 : ALA
|
356 |
+
C69 : THR
|
357 |
+
C70 : GLN
|
358 |
+
C71 : THR
|
359 |
+
C72 : VAL
|
360 |
+
C73 : GLY
|
361 |
+
C74 : GLY
|
362 |
+
C75 : VAL
|
363 |
+
C76 : GLU
|
364 |
+
C77 : LEU
|
365 |
+
C78 : PRO
|
366 |
+
C79 : VAL
|
367 |
+
C80 : ALA
|
368 |
+
C81 : ALA
|
369 |
+
C82 : TRP
|
370 |
+
C83 : ARG
|
371 |
+
C84 : SER
|
372 |
+
C85 : TYR
|
373 |
+
C86 : LEU
|
374 |
+
C87 : ASN
|
375 |
+
C88 : MET
|
376 |
+
C89 : GLU
|
377 |
+
C90 : LEU
|
378 |
+
C91 : THR
|
379 |
+
C92 : ILE
|
380 |
+
C93 : PRO
|
381 |
+
C94 : ILE
|
382 |
+
C95 : PHE
|
383 |
+
C96 : ALA
|
384 |
+
C97 : THR
|
385 |
+
C98 : ASN
|
386 |
+
C99 : SER
|
387 |
+
C100 : ASP
|
388 |
+
C101 : CYS
|
389 |
+
C102 : GLU
|
390 |
+
C103 : LEU
|
391 |
+
C104 : ILE
|
392 |
+
C105 : VAL
|
393 |
+
C106 : LYS
|
394 |
+
C107 : ALA
|
395 |
+
C108 : MET
|
396 |
+
C109 : GLN
|
397 |
+
C110 : GLY
|
398 |
+
C111 : LEU
|
399 |
+
C112 : LEU
|
400 |
+
C113 : LYS
|
401 |
+
C114 : ASP
|
402 |
+
C115 : GLY
|
403 |
+
C116 : ASN
|
404 |
+
C117 : PRO
|
405 |
+
C118 : ILE
|
406 |
+
C119 : PRO
|
407 |
+
C120 : SER
|
408 |
+
C121 : ALA
|
409 |
+
C122 : ILE
|
410 |
+
C123 : ALA
|
411 |
+
C124 : ALA
|
412 |
+
C125 : ASN
|
413 |
+
C126 : SER
|
414 |
+
C127 : GLY
|
415 |
+
C128 : ILE
|
416 |
+
C129 : TYR
|
417 |
+
R60 : HOH
|
418 |
+
R214 : HOH
|
419 |
+
R2059 : HOH
|
420 |
+
S169 : HOH
|
421 |
+
A130 : HOH
|
422 |
+
A131 : HOH
|
423 |
+
A132 : HOH
|
424 |
+
A133 : HOH
|
425 |
+
A134 : HOH
|
426 |
+
A135 : HOH
|
427 |
+
A136 : HOH
|
428 |
+
A137 : HOH
|
429 |
+
A138 : HOH
|
430 |
+
A139 : HOH
|
431 |
+
A140 : HOH
|
432 |
+
A141 : HOH
|
433 |
+
A142 : HOH
|
434 |
+
A143 : HOH
|
435 |
+
A144 : HOH
|
436 |
+
A145 : HOH
|
437 |
+
A146 : HOH
|
438 |
+
A147 : HOH
|
439 |
+
A148 : HOH
|
440 |
+
A149 : HOH
|
441 |
+
A150 : HOH
|
442 |
+
A151 : HOH
|
443 |
+
A152 : HOH
|
444 |
+
A153 : HOH
|
445 |
+
A154 : HOH
|
446 |
+
A155 : HOH
|
447 |
+
A156 : HOH
|
448 |
+
A157 : HOH
|
449 |
+
A158 : HOH
|
450 |
+
A159 : HOH
|
451 |
+
A160 : HOH
|
452 |
+
A161 : HOH
|
453 |
+
A162 : HOH
|
454 |
+
A163 : HOH
|
455 |
+
A164 : HOH
|
456 |
+
A165 : HOH
|
457 |
+
A166 : HOH
|
458 |
+
A167 : HOH
|
459 |
+
A168 : HOH
|
460 |
+
A169 : HOH
|
461 |
+
A170 : HOH
|
462 |
+
A171 : HOH
|
463 |
+
A172 : HOH
|
464 |
+
A173 : HOH
|
465 |
+
A174 : HOH
|
466 |
+
A175 : HOH
|
467 |
+
A176 : HOH
|
468 |
+
A177 : HOH
|
469 |
+
A178 : HOH
|
470 |
+
A179 : HOH
|
471 |
+
A180 : HOH
|
472 |
+
A181 : HOH
|
473 |
+
A182 : HOH
|
474 |
+
A183 : HOH
|
475 |
+
A184 : HOH
|
476 |
+
A185 : HOH
|
477 |
+
A186 : HOH
|
478 |
+
A187 : HOH
|
479 |
+
A188 : HOH
|
480 |
+
A189 : HOH
|
481 |
+
A190 : HOH
|
482 |
+
A191 : HOH
|
483 |
+
A192 : HOH
|
484 |
+
A193 : HOH
|
485 |
+
A194 : HOH
|
486 |
+
A195 : HOH
|
487 |
+
A196 : HOH
|
488 |
+
A197 : HOH
|
489 |
+
A198 : HOH
|
490 |
+
A199 : HOH
|
491 |
+
A200 : HOH
|
492 |
+
A201 : HOH
|
493 |
+
A202 : HOH
|
494 |
+
A203 : HOH
|
495 |
+
B130 : HOH
|
496 |
+
B131 : HOH
|
497 |
+
B132 : HOH
|
498 |
+
B133 : HOH
|
499 |
+
B134 : HOH
|
500 |
+
B135 : HOH
|
501 |
+
B136 : HOH
|
502 |
+
B137 : HOH
|
503 |
+
B138 : HOH
|
504 |
+
B139 : HOH
|
505 |
+
B140 : HOH
|
506 |
+
B141 : HOH
|
507 |
+
B142 : HOH
|
508 |
+
B143 : HOH
|
509 |
+
B144 : HOH
|
510 |
+
B145 : HOH
|
511 |
+
B146 : HOH
|
512 |
+
B147 : HOH
|
513 |
+
B148 : HOH
|
514 |
+
B149 : HOH
|
515 |
+
B150 : HOH
|
516 |
+
B151 : HOH
|
517 |
+
B152 : HOH
|
518 |
+
B153 : HOH
|
519 |
+
B154 : HOH
|
520 |
+
B155 : HOH
|
521 |
+
B156 : HOH
|
522 |
+
B157 : HOH
|
523 |
+
B158 : HOH
|
524 |
+
B159 : HOH
|
525 |
+
B160 : HOH
|
526 |
+
B161 : HOH
|
527 |
+
B162 : HOH
|
528 |
+
B163 : HOH
|
529 |
+
B164 : HOH
|
530 |
+
B165 : HOH
|
531 |
+
B166 : HOH
|
532 |
+
B167 : HOH
|
533 |
+
B168 : HOH
|
534 |
+
B169 : HOH
|
535 |
+
B170 : HOH
|
536 |
+
B171 : HOH
|
537 |
+
B172 : HOH
|
538 |
+
B173 : HOH
|
539 |
+
B174 : HOH
|
540 |
+
B175 : HOH
|
541 |
+
B176 : HOH
|
542 |
+
B177 : HOH
|
543 |
+
B178 : HOH
|
544 |
+
B179 : HOH
|
545 |
+
B180 : HOH
|
546 |
+
B181 : HOH
|
547 |
+
B182 : HOH
|
548 |
+
B183 : HOH
|
549 |
+
B184 : HOH
|
550 |
+
B185 : HOH
|
551 |
+
B186 : HOH
|
552 |
+
B187 : HOH
|
553 |
+
B188 : HOH
|
554 |
+
B189 : HOH
|
555 |
+
B190 : HOH
|
556 |
+
B191 : HOH
|
557 |
+
B192 : HOH
|
558 |
+
B193 : HOH
|
559 |
+
B194 : HOH
|
560 |
+
B195 : HOH
|
561 |
+
B196 : HOH
|
562 |
+
C130 : HOH
|
563 |
+
C131 : HOH
|
564 |
+
C132 : HOH
|
565 |
+
C133 : HOH
|
566 |
+
C134 : HOH
|
567 |
+
C135 : HOH
|
568 |
+
C136 : HOH
|
569 |
+
C137 : HOH
|
570 |
+
C138 : HOH
|
571 |
+
C139 : HOH
|
572 |
+
C140 : HOH
|
573 |
+
C141 : HOH
|
574 |
+
C142 : HOH
|
575 |
+
C143 : HOH
|
576 |
+
C144 : HOH
|
577 |
+
C145 : HOH
|
578 |
+
C146 : HOH
|
579 |
+
C147 : HOH
|
580 |
+
C148 : HOH
|
581 |
+
C149 : HOH
|
582 |
+
C150 : HOH
|
583 |
+
C151 : HOH
|
584 |
+
C152 : HOH
|
585 |
+
C153 : HOH
|
586 |
+
C154 : HOH
|
587 |
+
C155 : HOH
|
588 |
+
C156 : HOH
|
589 |
+
C157 : HOH
|
590 |
+
C158 : HOH
|
591 |
+
C159 : HOH
|
592 |
+
C160 : HOH
|
593 |
+
C161 : HOH
|
594 |
+
C162 : HOH
|
595 |
+
C163 : HOH
|
596 |
+
C164 : HOH
|
597 |
+
C165 : HOH
|
598 |
+
C166 : HOH
|
599 |
+
C167 : HOH
|
600 |
+
C168 : HOH
|
601 |
+
C169 : HOH
|
602 |
+
C170 : HOH
|
603 |
+
C171 : HOH
|
604 |
+
C172 : HOH
|
605 |
+
C173 : HOH
|
606 |
+
C174 : HOH
|
607 |
+
C175 : HOH
|
608 |
+
C176 : HOH
|
609 |
+
C177 : HOH
|
610 |
+
C178 : HOH
|
611 |
+
C179 : HOH
|
612 |
+
C180 : HOH
|
613 |
+
C181 : HOH
|
614 |
+
C182 : HOH
|
615 |
+
C183 : HOH
|
616 |
+
C184 : HOH
|
617 |
+
C185 : HOH
|
618 |
+
C186 : HOH
|
619 |
+
C187 : HOH
|
620 |
+
C188 : HOH
|
621 |
+
C189 : HOH
|
622 |
+
C190 : HOH
|
623 |
+
C191 : HOH
|
624 |
+
C192 : HOH
|
625 |
+
C193 : HOH
|
626 |
+
C194 : HOH
|
627 |
+
C195 : HOH
|
628 |
+
C196 : HOH
|
629 |
+
C197 : HOH
|
630 |
+
C198 : HOH
|
631 |
+
C199 : HOH
|
632 |
+
C200 : HOH
|
633 |
+
Adjacent stackings ----------------------------------------------
|
634 |
+
R3-R4 : adjacent_5p upward
|
635 |
+
R7-R8 : adjacent_5p upward
|
636 |
+
R8-R9 : adjacent_5p upward
|
637 |
+
R15-R16 : adjacent_5p upward
|
638 |
+
R16-R17 : adjacent_5p upward
|
639 |
+
S4-S5 : adjacent_5p upward
|
640 |
+
S7-S8 : adjacent_5p upward
|
641 |
+
S8-S9 : adjacent_5p upward
|
642 |
+
S13-S14 : adjacent_5p upward
|
643 |
+
Non-Adjacent stackings ------------------------------------------
|
644 |
+
R3-R18 : outward
|
645 |
+
R5-R7 : upward
|
646 |
+
R5-R16 : outward
|
647 |
+
R9-R11 : upward
|
648 |
+
S5-S7 : upward
|
649 |
+
S7-S15 : outward
|
650 |
+
S9-S11 : upward
|
651 |
+
S9-S13 : outward
|
652 |
+
Number of stackings = 17
|
653 |
+
Number of adjacent stackings = 9
|
654 |
+
Number of non adjacent stackings = 8
|
655 |
+
Base-pairs ------------------------------------------------------
|
656 |
+
R3-R17 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
|
657 |
+
R4-R16 : U-A Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
|
658 |
+
R5-R15 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
|
659 |
+
R7-R14 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
|
660 |
+
R8-R13 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
|
661 |
+
S5-S15 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
|
662 |
+
S7-S14 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
|
663 |
+
S8-S13 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
|