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1asy_MC ADDED
@@ -0,0 +1,1305 @@
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
+ Residue conformations -------------------------------------------
2
+ R601 : U C3p_endo anti
3
+ R602 : C C3p_endo anti
4
+ R603 : C C3p_endo anti
5
+ R604 : G C3p_endo anti
6
+ R605 : U C3p_endo anti
7
+ R606 : G C3p_endo anti
8
+ R607 : A C2p_endo anti
9
+ R608 : U C3p_endo anti
10
+ R609 : A C2p_endo anti
11
+ R610 : G C3p_endo anti
12
+ R611 : U C3p_endo anti
13
+ R612 : U C3p_endo anti
14
+ R613 : PSU
15
+ R614 : A C3p_endo anti
16
+ R615 : A C3p_endo anti
17
+ R616 : H2U
18
+ R617 : G C2p_endo anti
19
+ R618 : G C2p_endo syn
20
+ R619 : H2U
21
+ R620 : C C3p_endo anti
22
+ R621 : A C3p_endo anti
23
+ R622 : G C3p_endo anti
24
+ R623 : A C3p_endo anti
25
+ R624 : A C3p_endo anti
26
+ R625 : U C3p_endo anti
27
+ R626 : G C3p_endo anti
28
+ R627 : G C3p_endo anti
29
+ R628 : G C3p_endo anti
30
+ R629 : C C3p_endo anti
31
+ R630 : G C3p_endo anti
32
+ R631 : C C3p_endo anti
33
+ R632 : PSU
34
+ R633 : U C3p_endo anti
35
+ R634 : G C3p_endo anti
36
+ R635 : U C3p_endo anti
37
+ R636 : C C3p_endo anti
38
+ R637 : 1MG
39
+ R638 : C C3p_endo anti
40
+ R639 : G C3p_endo anti
41
+ R640 : U C3p_endo anti
42
+ R641 : G C3p_endo anti
43
+ R642 : C C3p_endo anti
44
+ R643 : C C3p_endo anti
45
+ R644 : A C3p_endo anti
46
+ R645 : G C3p_endo anti
47
+ R646 : A C3p_endo anti
48
+ R648 : U C2p_endo anti
49
+ R649 : 5MC
50
+ R650 : G C3p_endo anti
51
+ R651 : G C3p_endo anti
52
+ R652 : G C3p_endo anti
53
+ R653 : G C3p_endo anti
54
+ R654 : 5MU
55
+ R655 : PSU
56
+ R656 : C C3p_endo anti
57
+ R657 : A C3p_endo anti
58
+ R658 : A C2p_endo syn
59
+ R659 : U C3p_endo anti
60
+ R660 : U C2p_endo syn
61
+ R661 : C C3p_endo anti
62
+ R662 : C C3p_endo anti
63
+ R663 : C C3p_endo anti
64
+ R664 : C C3p_endo anti
65
+ R665 : G C3p_endo anti
66
+ R666 : U C3p_endo anti
67
+ R667 : C C3p_endo anti
68
+ R668 : G C3p_endo anti
69
+ R669 : C C3p_endo anti
70
+ R670 : G C3p_endo anti
71
+ R671 : G C3p_endo anti
72
+ R672 : A C3p_endo anti
73
+ R673 : G C3p_endo anti
74
+ R674 : C C3p_endo anti
75
+ R675 : C C3p_endo anti
76
+ R676 : A C2p_endo anti
77
+ S601 : U C3p_endo anti
78
+ S602 : C C3p_endo anti
79
+ S603 : C C3p_endo anti
80
+ S604 : G C3p_endo anti
81
+ S605 : U C3p_endo anti
82
+ S606 : G C3p_endo anti
83
+ S607 : A C2p_endo anti
84
+ S608 : U C3p_endo anti
85
+ S609 : A C2p_endo anti
86
+ S610 : G C3p_endo anti
87
+ S611 : U C3p_endo anti
88
+ S612 : U C3p_endo anti
89
+ S613 : PSU
90
+ S614 : A C3p_endo anti
91
+ S615 : A C3p_endo anti
92
+ S616 : H2U
93
+ S617 : G C2p_endo anti
94
+ S618 : G C2p_endo anti
95
+ S619 : H2U
96
+ S620 : C C3p_endo anti
97
+ S621 : A C3p_endo anti
98
+ S622 : G C3p_endo anti
99
+ S623 : A C3p_endo anti
100
+ S624 : A C3p_endo anti
101
+ S625 : U C3p_endo anti
102
+ S626 : G C3p_endo anti
103
+ S627 : G C3p_endo anti
104
+ S628 : G C3p_endo anti
105
+ S629 : C C3p_endo anti
106
+ S630 : G C3p_endo anti
107
+ S631 : C C3p_endo anti
108
+ S632 : PSU
109
+ S633 : U C3p_endo anti
110
+ S634 : G C3p_endo anti
111
+ S635 : U C3p_endo anti
112
+ S636 : C C3p_endo anti
113
+ S637 : 1MG
114
+ S638 : C C3p_endo anti
115
+ S639 : G C3p_endo anti
116
+ S640 : U C3p_endo anti
117
+ S641 : G C3p_endo anti
118
+ S642 : C C3p_endo anti
119
+ S643 : C C3p_endo anti
120
+ S644 : A C3p_endo anti
121
+ S645 : G C3p_endo anti
122
+ S646 : A C3p_endo anti
123
+ S648 : U C2p_endo anti
124
+ S649 : 5MC
125
+ S650 : G C3p_endo anti
126
+ S651 : G C3p_endo anti
127
+ S652 : G C3p_endo anti
128
+ S653 : G C3p_endo anti
129
+ S654 : 5MU
130
+ S655 : PSU
131
+ S656 : C C3p_endo anti
132
+ S657 : A C3p_endo anti
133
+ S658 : A C2p_endo syn
134
+ S659 : U C3p_endo anti
135
+ S660 : U C2p_endo anti
136
+ S661 : C C3p_endo anti
137
+ S662 : C C3p_endo anti
138
+ S663 : C C3p_endo anti
139
+ S664 : C C3p_endo anti
140
+ S665 : G C3p_endo anti
141
+ S666 : U C3p_endo anti
142
+ S667 : C C3p_endo anti
143
+ S668 : G C3p_endo anti
144
+ S669 : C C3p_endo anti
145
+ S670 : G C3p_endo anti
146
+ S671 : G C3p_endo anti
147
+ S672 : A C3p_endo anti
148
+ S673 : G C3p_endo anti
149
+ S674 : C C3p_endo anti
150
+ S675 : C C3p_endo anti
151
+ S676 : A C2p_endo anti
152
+ A68 : GLU
153
+ A69 : ASP
154
+ A70 : THR
155
+ A71 : ALA
156
+ A72 : LYS
157
+ A73 : ASP
158
+ A74 : ASN
159
+ A75 : TYR
160
+ A76 : GLY
161
+ A77 : LYS
162
+ A78 : LEU
163
+ A79 : PRO
164
+ A80 : LEU
165
+ A81 : ILE
166
+ A82 : GLN
167
+ A83 : SER
168
+ A84 : ARG
169
+ A85 : ASP
170
+ A86 : SER
171
+ A87 : ASP
172
+ A88 : ARG
173
+ A89 : THR
174
+ A90 : GLY
175
+ A91 : GLN
176
+ A92 : LYS
177
+ A93 : ARG
178
+ A94 : VAL
179
+ A95 : LYS
180
+ A96 : PHE
181
+ A97 : VAL
182
+ A98 : ASP
183
+ A99 : LEU
184
+ A100 : ASP
185
+ A101 : GLU
186
+ A102 : ALA
187
+ A103 : LYS
188
+ A104 : ASP
189
+ A105 : SER
190
+ A106 : ASP
191
+ A107 : LYS
192
+ A108 : GLU
193
+ A109 : VAL
194
+ A110 : LEU
195
+ A111 : PHE
196
+ A112 : ARG
197
+ A113 : ALA
198
+ A114 : ARG
199
+ A115 : VAL
200
+ A116 : HIS
201
+ A117 : ASN
202
+ A118 : THR
203
+ A119 : ARG
204
+ A120 : GLN
205
+ A121 : GLN
206
+ A122 : GLY
207
+ A123 : ALA
208
+ A124 : THR
209
+ A125 : LEU
210
+ A126 : ALA
211
+ A127 : PHE
212
+ A128 : LEU
213
+ A129 : THR
214
+ A130 : LEU
215
+ A131 : ARG
216
+ A132 : GLN
217
+ A133 : GLN
218
+ A134 : ALA
219
+ A135 : SER
220
+ A136 : LEU
221
+ A137 : ILE
222
+ A138 : GLN
223
+ A139 : GLY
224
+ A140 : LEU
225
+ A141 : VAL
226
+ A142 : LYS
227
+ A143 : ALA
228
+ A144 : ASN
229
+ A145 : LYS
230
+ A146 : GLU
231
+ A147 : GLY
232
+ A148 : THR
233
+ A149 : ILE
234
+ A150 : SER
235
+ A151 : LYS
236
+ A152 : ASN
237
+ A153 : MET
238
+ A154 : VAL
239
+ A155 : LYS
240
+ A156 : TRP
241
+ A157 : ALA
242
+ A158 : GLY
243
+ A159 : SER
244
+ A160 : LEU
245
+ A161 : ASN
246
+ A162 : LEU
247
+ A163 : GLU
248
+ A164 : SER
249
+ A165 : ILE
250
+ A166 : VAL
251
+ A167 : LEU
252
+ A168 : VAL
253
+ A169 : ARG
254
+ A170 : GLY
255
+ A171 : ILE
256
+ A172 : VAL
257
+ A173 : LYS
258
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260
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271
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272
+ A188 : GLU
273
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274
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+ A191 : ILE
276
+ A192 : THR
277
+ A193 : LYS
278
+ A194 : ILE
279
+ A195 : TYR
280
+ A196 : THR
281
+ A197 : ILE
282
+ A198 : SER
283
+ A199 : GLU
284
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+ A201 : PRO
286
+ A202 : GLU
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+ A203 : ALA
288
+ A204 : LEU
289
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290
+ A206 : ILE
291
+ A207 : LEU
292
+ A208 : LEU
293
+ A209 : GLU
294
+ A210 : ASP
295
+ A211 : ALA
296
+ A212 : SER
297
+ A213 : ARG
298
+ A214 : SER
299
+ A215 : GLU
300
+ A216 : ALA
301
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302
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+ A219 : GLU
304
+ A220 : ALA
305
+ A221 : ALA
306
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307
+ A223 : LEU
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310
+ A226 : VAL
311
+ A227 : ASN
312
+ A228 : LEU
313
+ A229 : ASP
314
+ A230 : THR
315
+ A231 : ARG
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445
+ A361 : LEU
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447
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451
+ A367 : SER
452
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453
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460
+ A376 : GLU
461
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462
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464
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511
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516
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518
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521
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525
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526
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527
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529
+ A445 : LEU
530
+ A446 : ASP
531
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532
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533
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+ A450 : LEU
535
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536
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537
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+ A456 : TYR
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543
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545
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547
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550
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551
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552
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553
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554
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555
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556
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557
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558
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559
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560
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561
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562
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563
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564
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565
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566
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567
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568
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573
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574
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578
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579
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581
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582
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583
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584
+ A500 : GLY
585
+ A501 : LEU
586
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587
+ A503 : PRO
588
+ A504 : GLU
589
+ A505 : ASP
590
+ A506 : PRO
591
+ A507 : GLY
592
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593
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594
+ A510 : ASP
595
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596
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597
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598
+ A514 : GLY
599
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600
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601
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602
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603
+ A519 : CYS
604
+ A520 : PRO
605
+ A521 : PRO
606
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607
+ A523 : ALA
608
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609
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610
+ A526 : GLY
611
+ A527 : ILE
612
+ A528 : GLY
613
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614
+ A530 : GLU
615
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616
+ A532 : VAL
617
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618
+ A534 : MET
619
+ A535 : PHE
620
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621
+ A537 : LEU
622
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623
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624
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625
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627
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628
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629
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630
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631
+ A547 : LEU
632
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633
+ A549 : PRO
634
+ A550 : ARG
635
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636
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637
+ A553 : LYS
638
+ A554 : ARG
639
+ A555 : LEU
640
+ A556 : ARG
641
+ A557 : PRO
642
+ B68 : GLU
643
+ B69 : ASP
644
+ B70 : THR
645
+ B71 : ALA
646
+ B72 : LYS
647
+ B73 : ASP
648
+ B74 : ASN
649
+ B75 : TYR
650
+ B76 : GLY
651
+ B77 : LYS
652
+ B78 : LEU
653
+ B79 : PRO
654
+ B80 : LEU
655
+ B81 : ILE
656
+ B82 : GLN
657
+ B83 : SER
658
+ B84 : ARG
659
+ B85 : ASP
660
+ B86 : SER
661
+ B87 : ASP
662
+ B88 : ARG
663
+ B89 : THR
664
+ B90 : GLY
665
+ B91 : GLN
666
+ B92 : LYS
667
+ B93 : ARG
668
+ B94 : VAL
669
+ B95 : LYS
670
+ B96 : PHE
671
+ B97 : VAL
672
+ B98 : ASP
673
+ B99 : LEU
674
+ B100 : ASP
675
+ B101 : GLU
676
+ B102 : ALA
677
+ B103 : LYS
678
+ B104 : ASP
679
+ B105 : SER
680
+ B106 : ASP
681
+ B107 : LYS
682
+ B108 : GLU
683
+ B109 : VAL
684
+ B110 : LEU
685
+ B111 : PHE
686
+ B112 : ARG
687
+ B113 : ALA
688
+ B114 : ARG
689
+ B115 : VAL
690
+ B116 : HIS
691
+ B117 : ASN
692
+ B118 : THR
693
+ B119 : ARG
694
+ B120 : GLN
695
+ B121 : GLN
696
+ B122 : GLY
697
+ B123 : ALA
698
+ B124 : THR
699
+ B125 : LEU
700
+ B126 : ALA
701
+ B127 : PHE
702
+ B128 : LEU
703
+ B129 : THR
704
+ B130 : LEU
705
+ B131 : ARG
706
+ B132 : GLN
707
+ B133 : GLN
708
+ B134 : ALA
709
+ B135 : SER
710
+ B136 : LEU
711
+ B137 : ILE
712
+ B138 : GLN
713
+ B139 : GLY
714
+ B140 : LEU
715
+ B141 : VAL
716
+ B142 : LYS
717
+ B143 : ALA
718
+ B144 : ASN
719
+ B145 : LYS
720
+ B146 : GLU
721
+ B147 : GLY
722
+ B148 : THR
723
+ B149 : ILE
724
+ B150 : SER
725
+ B151 : LYS
726
+ B152 : ASN
727
+ B153 : MET
728
+ B154 : VAL
729
+ B155 : LYS
730
+ B156 : TRP
731
+ B157 : ALA
732
+ B158 : GLY
733
+ B159 : SER
734
+ B160 : LEU
735
+ B161 : ASN
736
+ B162 : LEU
737
+ B163 : GLU
738
+ B164 : SER
739
+ B165 : ILE
740
+ B166 : VAL
741
+ B167 : LEU
742
+ B168 : VAL
743
+ B169 : ARG
744
+ B170 : GLY
745
+ B171 : ILE
746
+ B172 : VAL
747
+ B173 : LYS
748
+ B174 : LYS
749
+ B175 : VAL
750
+ B176 : ASP
751
+ B177 : GLU
752
+ B178 : PRO
753
+ B179 : ILE
754
+ B180 : LYS
755
+ B181 : SER
756
+ B182 : ALA
757
+ B183 : THR
758
+ B184 : VAL
759
+ B185 : GLN
760
+ B186 : ASN
761
+ B187 : LEU
762
+ B188 : GLU
763
+ B189 : ILE
764
+ B190 : HIS
765
+ B191 : ILE
766
+ B192 : THR
767
+ B193 : LYS
768
+ B194 : ILE
769
+ B195 : TYR
770
+ B196 : THR
771
+ B197 : ILE
772
+ B198 : SER
773
+ B199 : GLU
774
+ B200 : THR
775
+ B201 : PRO
776
+ B202 : GLU
777
+ B203 : ALA
778
+ B204 : LEU
779
+ B205 : PRO
780
+ B206 : ILE
781
+ B207 : LEU
782
+ B208 : LEU
783
+ B209 : GLU
784
+ B210 : ASP
785
+ B211 : ALA
786
+ B212 : SER
787
+ B213 : ARG
788
+ B214 : SER
789
+ B215 : GLU
790
+ B216 : ALA
791
+ B217 : GLU
792
+ B218 : ALA
793
+ B219 : GLU
794
+ B220 : ALA
795
+ B221 : ALA
796
+ B222 : GLY
797
+ B223 : LEU
798
+ B224 : PRO
799
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800
+ B226 : VAL
801
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802
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803
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804
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805
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806
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807
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808
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809
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810
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811
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812
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813
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814
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815
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816
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817
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818
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819
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820
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821
+ B247 : ILE
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823
+ B249 : ARG
824
+ B250 : ILE
825
+ B251 : GLN
826
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827
+ B253 : GLY
828
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829
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831
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832
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833
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834
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835
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836
+ B262 : LEU
837
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838
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839
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840
+ B266 : LYS
841
+ B267 : PHE
842
+ B268 : THR
843
+ B269 : GLU
844
+ B270 : VAL
845
+ B271 : HIS
846
+ B272 : THR
847
+ B273 : PRO
848
+ B274 : LYS
849
+ B275 : LEU
850
+ B276 : LEU
851
+ B277 : GLY
852
+ B278 : ALA
853
+ B279 : PRO
854
+ B280 : SER
855
+ B281 : GLU
856
+ B282 : GLY
857
+ B283 : GLY
858
+ B284 : SER
859
+ B285 : SER
860
+ B286 : VAL
861
+ B287 : PHE
862
+ B288 : GLU
863
+ B289 : VAL
864
+ B290 : THR
865
+ B291 : TYR
866
+ B292 : PHE
867
+ B293 : LYS
868
+ B294 : GLY
869
+ B295 : LYS
870
+ B296 : ALA
871
+ B297 : TYR
872
+ B298 : LEU
873
+ B299 : ALA
874
+ B300 : GLN
875
+ B301 : SER
876
+ B302 : PRO
877
+ B303 : GLN
878
+ B304 : PHE
879
+ B305 : ASN
880
+ B306 : LYS
881
+ B307 : GLN
882
+ B308 : GLN
883
+ B309 : LEU
884
+ B310 : ILE
885
+ B311 : VAL
886
+ B312 : ALA
887
+ B313 : ASP
888
+ B314 : PHE
889
+ B315 : GLU
890
+ B316 : ARG
891
+ B317 : VAL
892
+ B318 : TYR
893
+ B319 : GLU
894
+ B320 : ILE
895
+ B321 : GLY
896
+ B322 : PRO
897
+ B323 : VAL
898
+ B324 : PHE
899
+ B325 : ARG
900
+ B326 : ALA
901
+ B327 : GLU
902
+ B328 : ASN
903
+ B329 : SER
904
+ B330 : ASN
905
+ B331 : THR
906
+ B332 : HIS
907
+ B333 : ARG
908
+ B334 : HIS
909
+ B335 : MET
910
+ B336 : THR
911
+ B337 : GLU
912
+ B338 : PHE
913
+ B339 : THR
914
+ B340 : GLY
915
+ B341 : LEU
916
+ B342 : ASP
917
+ B343 : MET
918
+ B344 : GLU
919
+ B345 : MET
920
+ B346 : ALA
921
+ B347 : PHE
922
+ B348 : GLU
923
+ B349 : GLU
924
+ B350 : HIS
925
+ B351 : TYR
926
+ B352 : HIS
927
+ B353 : GLU
928
+ B354 : VAL
929
+ B355 : LEU
930
+ B356 : ASP
931
+ B357 : THR
932
+ B358 : LEU
933
+ B359 : SER
934
+ B360 : GLU
935
+ B361 : LEU
936
+ B362 : PHE
937
+ B363 : VAL
938
+ B364 : PHE
939
+ B365 : ILE
940
+ B366 : PHE
941
+ B367 : SER
942
+ B368 : GLU
943
+ B369 : LEU
944
+ B370 : PRO
945
+ B371 : LYS
946
+ B372 : ARG
947
+ B373 : PHE
948
+ B374 : ALA
949
+ B375 : HIS
950
+ B376 : GLU
951
+ B377 : ILE
952
+ B378 : GLU
953
+ B379 : LEU
954
+ B380 : VAL
955
+ B381 : ARG
956
+ B382 : LYS
957
+ B383 : GLN
958
+ B384 : TYR
959
+ B385 : PRO
960
+ B386 : VAL
961
+ B387 : GLU
962
+ B388 : GLU
963
+ B389 : PHE
964
+ B390 : LYS
965
+ B391 : LEU
966
+ B392 : PRO
967
+ B393 : LYS
968
+ B394 : ASP
969
+ B395 : GLY
970
+ B396 : LYS
971
+ B397 : MET
972
+ B398 : VAL
973
+ B399 : ARG
974
+ B400 : LEU
975
+ B401 : THR
976
+ B402 : TYR
977
+ B403 : LYS
978
+ B404 : GLU
979
+ B405 : GLY
980
+ B406 : ILE
981
+ B407 : GLU
982
+ B408 : MET
983
+ B409 : LEU
984
+ B410 : ARG
985
+ B411 : ALA
986
+ B412 : ALA
987
+ B413 : GLY
988
+ B414 : LYS
989
+ B415 : GLU
990
+ B416 : ILE
991
+ B417 : GLY
992
+ B418 : ASP
993
+ B419 : PHE
994
+ B420 : GLU
995
+ B421 : ASP
996
+ B422 : LEU
997
+ B423 : SER
998
+ B424 : THR
999
+ B425 : GLU
1000
+ B426 : ASN
1001
+ B427 : GLU
1002
+ B428 : LYS
1003
+ B429 : PHE
1004
+ B430 : LEU
1005
+ B431 : GLY
1006
+ B432 : LYS
1007
+ B433 : LEU
1008
+ B434 : VAL
1009
+ B435 : ARG
1010
+ B436 : ASP
1011
+ B437 : LYS
1012
+ B438 : TYR
1013
+ B439 : ASP
1014
+ B440 : THR
1015
+ B441 : ASP
1016
+ B442 : PHE
1017
+ B443 : TYR
1018
+ B444 : ILE
1019
+ B445 : LEU
1020
+ B446 : ASP
1021
+ B447 : LYS
1022
+ B448 : PHE
1023
+ B449 : PRO
1024
+ B450 : LEU
1025
+ B451 : GLU
1026
+ B452 : ILE
1027
+ B453 : ARG
1028
+ B454 : PRO
1029
+ B455 : PHE
1030
+ B456 : TYR
1031
+ B457 : THR
1032
+ B458 : MET
1033
+ B459 : PRO
1034
+ B460 : ASP
1035
+ B461 : PRO
1036
+ B462 : ALA
1037
+ B463 : ASN
1038
+ B464 : PRO
1039
+ B465 : LYS
1040
+ B466 : TYR
1041
+ B467 : SER
1042
+ B468 : ASN
1043
+ B469 : SER
1044
+ B470 : TYR
1045
+ B471 : ASP
1046
+ B472 : PHE
1047
+ B473 : PHE
1048
+ B474 : MET
1049
+ B475 : ARG
1050
+ B476 : GLY
1051
+ B477 : GLU
1052
+ B478 : GLU
1053
+ B479 : ILE
1054
+ B480 : LEU
1055
+ B481 : SER
1056
+ B482 : GLY
1057
+ B483 : ALA
1058
+ B484 : GLN
1059
+ B485 : ARG
1060
+ B486 : ILE
1061
+ B487 : HIS
1062
+ B488 : ASP
1063
+ B489 : HIS
1064
+ B490 : ALA
1065
+ B491 : LEU
1066
+ B492 : LEU
1067
+ B493 : GLN
1068
+ B494 : GLU
1069
+ B495 : ARG
1070
+ B496 : MET
1071
+ B497 : LYS
1072
+ B498 : ALA
1073
+ B499 : HIS
1074
+ B500 : GLY
1075
+ B501 : LEU
1076
+ B502 : SER
1077
+ B503 : PRO
1078
+ B504 : GLU
1079
+ B505 : ASP
1080
+ B506 : PRO
1081
+ B507 : GLY
1082
+ B508 : LEU
1083
+ B509 : LYS
1084
+ B510 : ASP
1085
+ B511 : TYR
1086
+ B512 : CYS
1087
+ B513 : ASP
1088
+ B514 : GLY
1089
+ B515 : PHE
1090
+ B516 : SER
1091
+ B517 : TYR
1092
+ B518 : GLY
1093
+ B519 : CYS
1094
+ B520 : PRO
1095
+ B521 : PRO
1096
+ B522 : HIS
1097
+ B523 : ALA
1098
+ B524 : GLY
1099
+ B525 : GLY
1100
+ B526 : GLY
1101
+ B527 : ILE
1102
+ B528 : GLY
1103
+ B529 : LEU
1104
+ B530 : GLU
1105
+ B531 : ARG
1106
+ B532 : VAL
1107
+ B533 : VAL
1108
+ B534 : MET
1109
+ B535 : PHE
1110
+ B536 : TYR
1111
+ B537 : LEU
1112
+ B538 : ASP
1113
+ B539 : LEU
1114
+ B540 : LYS
1115
+ B541 : ASN
1116
+ B542 : ILE
1117
+ B543 : ARG
1118
+ B544 : ARG
1119
+ B545 : ALA
1120
+ B546 : SER
1121
+ B547 : LEU
1122
+ B548 : PHE
1123
+ B549 : PRO
1124
+ B550 : ARG
1125
+ B551 : ASP
1126
+ B552 : PRO
1127
+ B553 : LYS
1128
+ B554 : ARG
1129
+ B555 : LEU
1130
+ B556 : ARG
1131
+ B557 : PRO
1132
+ Adjacent stackings ----------------------------------------------
1133
+ R602-R603 : adjacent_5p upward
1134
+ R603-R604 : adjacent_5p upward
1135
+ R604-R605 : adjacent_5p upward
1136
+ R605-R606 : adjacent_5p upward
1137
+ R606-R607 : adjacent_5p upward
1138
+ R610-R611 : adjacent_5p upward
1139
+ R611-R612 : adjacent_5p upward
1140
+ R614-R615 : adjacent_5p upward
1141
+ R622-R623 : adjacent_5p upward
1142
+ R623-R624 : adjacent_5p upward
1143
+ R624-R625 : adjacent_5p upward
1144
+ R625-R626 : adjacent_5p upward
1145
+ R626-R627 : adjacent_5p upward
1146
+ R627-R628 : adjacent_5p upward
1147
+ R628-R629 : adjacent_5p upward
1148
+ R630-R631 : adjacent_5p upward
1149
+ R639-R640 : adjacent_5p upward
1150
+ R641-R642 : adjacent_5p upward
1151
+ R643-R644 : adjacent_5p upward
1152
+ R650-R651 : adjacent_5p upward
1153
+ R651-R652 : adjacent_5p upward
1154
+ R652-R653 : adjacent_5p upward
1155
+ R656-R657 : adjacent_5p upward
1156
+ R662-R663 : adjacent_5p upward
1157
+ R663-R664 : adjacent_5p upward
1158
+ R664-R665 : adjacent_5p upward
1159
+ R665-R666 : adjacent_5p upward
1160
+ R666-R667 : adjacent_5p upward
1161
+ R668-R669 : adjacent_5p upward
1162
+ R669-R670 : adjacent_5p upward
1163
+ R670-R671 : adjacent_5p upward
1164
+ R671-R672 : adjacent_5p upward
1165
+ R672-R673 : adjacent_5p upward
1166
+ R673-R674 : adjacent_5p upward
1167
+ R674-R675 : adjacent_5p upward
1168
+ S602-S603 : adjacent_5p upward
1169
+ S603-S604 : adjacent_5p upward
1170
+ S604-S605 : adjacent_5p upward
1171
+ S606-S607 : adjacent_5p upward
1172
+ S610-S611 : adjacent_5p upward
1173
+ S614-S615 : adjacent_5p upward
1174
+ S622-S623 : adjacent_5p upward
1175
+ S623-S624 : adjacent_5p upward
1176
+ S624-S625 : adjacent_5p upward
1177
+ S626-S627 : adjacent_5p upward
1178
+ S627-S628 : adjacent_5p upward
1179
+ S628-S629 : adjacent_5p upward
1180
+ S630-S631 : adjacent_5p upward
1181
+ S635-S636 : adjacent_5p upward
1182
+ S639-S640 : adjacent_5p upward
1183
+ S641-S642 : adjacent_5p upward
1184
+ S642-S643 : adjacent_5p upward
1185
+ S644-S645 : adjacent_5p upward
1186
+ S650-S651 : adjacent_5p upward
1187
+ S651-S652 : adjacent_5p upward
1188
+ S652-S653 : adjacent_5p upward
1189
+ S656-S657 : adjacent_5p upward
1190
+ S659-S660 : adjacent_5p upward
1191
+ S662-S663 : adjacent_5p upward
1192
+ S663-S664 : adjacent_5p upward
1193
+ S664-S665 : adjacent_5p upward
1194
+ S665-S666 : adjacent_5p upward
1195
+ S666-S667 : adjacent_5p upward
1196
+ S668-S669 : adjacent_5p upward
1197
+ S669-S670 : adjacent_5p upward
1198
+ S670-S671 : adjacent_5p upward
1199
+ S671-S672 : adjacent_5p upward
1200
+ S672-S673 : adjacent_5p upward
1201
+ S673-S674 : adjacent_5p upward
1202
+ Non-Adjacent stackings ------------------------------------------
1203
+ R604-R670 : outward
1204
+ R606-R668 : outward
1205
+ R609-R645 : inward
1206
+ R609-R646 : outward
1207
+ R614-R622 : outward
1208
+ R617-R657 : inward
1209
+ R617-R658 : outward pairing
1210
+ R618-R657 : outward
1211
+ R621-R646 : inward
1212
+ R621-R648 : outward
1213
+ R627-R644 : outward
1214
+ R630-R641 : outward
1215
+ R650-R665 : outward
1216
+ R658-R661 : upward
1217
+ S604-S670 : outward
1218
+ S606-S668 : outward
1219
+ S609-S645 : inward pairing
1220
+ S609-S646 : outward
1221
+ S614-S622 : outward
1222
+ S617-S657 : inward pairing
1223
+ S617-S658 : outward pairing
1224
+ S618-S657 : outward
1225
+ S621-S646 : inward
1226
+ S621-S648 : outward pairing
1227
+ S627-S644 : outward
1228
+ S630-S641 : outward
1229
+ S648-S659 : upward
1230
+ S650-S665 : outward
1231
+ S658-S661 : upward
1232
+ Number of stackings = 98
1233
+ Number of adjacent stackings = 69
1234
+ Number of non adjacent stackings = 29
1235
+ Base-pairs ------------------------------------------------------
1236
+ R601-R672 : U-A Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
1237
+ R602-R671 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1238
+ R603-R670 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1239
+ R604-R669 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1240
+ R605-R668 : U-G Ws/Ww pairing antiparallel cis XXVIII
1241
+ R606-R667 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1242
+ R607-R666 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
1243
+ R608-R614 : U-A Ws/Hh pairing antiparallel trans XXIV
1244
+ R608-R621 : U-A Ss/Bs pairing parallel trans one_hbond
1245
+ R609-R610 : A-G O2'/Hh adjacent_5p pairing
1246
+ R609-R623 : A-A Hh/Hh pairing parallel trans II
1247
+ R610-R625 : G-U Ww/Ws pairing antiparallel cis XXVIII
1248
+ R610-R645 : G-G Hw/Bs pairing parallel cis one_hbond 113
1249
+ R611-R624 : U-A Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
1250
+ R612-R623 : U-A Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
1251
+ R614-R621 : A-A Wh/Ss pairing antiparallel cis one_hbond 40
1252
+ R615-R648 : A-U Ww/Ws pairing parallel trans XXI
1253
+ R617-R658 : G-A Bs/O2P outward pairing
1254
+ R618-R656 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1255
+ R622-R646 : G-A Hh/Wh pairing antiparallel trans one_hbond 60
1256
+ R626-R644 : G-A Ww/Ww pairing antiparallel cis VIII
1257
+ R627-R643 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1258
+ R628-R642 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1259
+ R629-R641 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis one_hbond
1260
+ R630-R640 : G-U Ww/Ws pairing antiparallel cis XXVIII
1261
+ R631-R639 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1262
+ R634-R635 : G-U O2'/Hh adjacent_5p pairing
1263
+ R650-R664 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1264
+ R651-R663 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1265
+ R652-R662 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1266
+ R653-R661 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1267
+ R658-R660 : A-U Ss/Hh pairing antiparallel trans one_hbond
1268
+ R660-R661 : U-C O2P/Bh O2P/Bh adjacent_5p pairing
1269
+ R675-R676 : C-A O2'/Hh adjacent_5p pairing
1270
+ S601-S672 : U-A Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
1271
+ S602-S671 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1272
+ S603-S670 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1273
+ S604-S669 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1274
+ S605-S668 : U-G Ws/Ww pairing antiparallel cis XXVIII
1275
+ S606-S667 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1276
+ S607-S666 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
1277
+ S608-S614 : U-A Ws/Hh pairing antiparallel trans XXIV
1278
+ S608-S621 : U-A Ss/Bs O2'/Ww pairing parallel trans one_hbond
1279
+ S609-S610 : A-G O2'/Hh adjacent_5p pairing
1280
+ S609-S623 : A-A Hh/Hh pairing parallel trans II
1281
+ S609-S645 : A-G O2'/Ss inward pairing
1282
+ S610-S625 : G-U Ww/Ws pairing antiparallel cis XXVIII
1283
+ S610-S645 : G-G Hw/Bs pairing parallel cis one_hbond 113
1284
+ S611-S624 : U-A Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
1285
+ S612-S623 : U-A Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
1286
+ S614-S621 : A-A Wh/Ss pairing antiparallel cis one_hbond 40
1287
+ S615-S648 : A-U Ww/Ww pairing parallel trans XXI
1288
+ S617-S657 : G-A O2'/Ww inward pairing
1289
+ S617-S658 : G-A Bs/O2P outward pairing
1290
+ S618-S656 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1291
+ S621-S648 : A-U Bh/O2P outward pairing
1292
+ S622-S646 : G-A Hh/Ww pairing antiparallel trans one_hbond 60
1293
+ S625-S645 : U-G Wh/Ws pairing antiparallel cis one_hbond 94
1294
+ S626-S644 : G-A Ww/Ww pairing antiparallel cis VIII
1295
+ S627-S643 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1296
+ S628-S642 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1297
+ S629-S641 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1298
+ S630-S640 : G-U Ww/Ws pairing antiparallel cis XXVIII
1299
+ S631-S639 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1300
+ S650-S664 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1301
+ S651-S663 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1302
+ S652-S662 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1303
+ S653-S661 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
1304
+ S660-S661 : U-C O2P/Bh O2P/Bh adjacent_5p pairing
1305
+ S674-S675 : C-C O2P/Bh adjacent_5p pairing