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Residue conformations -------------------------------------------
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2 |
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Q0 : C C3p_endo anti
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3 |
+
Q1 : C C3p_endo anti
|
4 |
+
Q2 : U C1p_endo anti
|
5 |
+
Q3 : G C2p_exo anti
|
6 |
+
Q4 : G C3p_endo anti
|
7 |
+
Q5 : U C3p_endo anti
|
8 |
+
Q6 : A C3p_endo anti
|
9 |
+
Q7 : U C3p_endo anti
|
10 |
+
Q8 : U C2p_endo anti
|
11 |
+
Q9 : G C3p_endo anti
|
12 |
+
Q10 : C C3p_exo anti
|
13 |
+
Q11 : A C3p_endo anti
|
14 |
+
Q12 : G C2p_endo syn
|
15 |
+
Q13 : U C2p_endo anti
|
16 |
+
Q14 : A C1p_endo anti
|
17 |
+
Q15 : C C3p_endo anti
|
18 |
+
Q16 : C C1p_exo anti
|
19 |
+
Q17 : U C3p_endo anti
|
20 |
+
Q18 : C C3p_endo anti
|
21 |
+
Q19 : C C3p_endo anti
|
22 |
+
Q20 : A C3p_endo anti
|
23 |
+
Q21 : G C3p_endo anti
|
24 |
+
Q22 : G C3p_endo anti
|
25 |
+
Q23 : U C2p_exo anti
|
26 |
+
R0 : C C3p_endo anti
|
27 |
+
R1 : C C3p_endo anti
|
28 |
+
R2 : U C1p_endo anti
|
29 |
+
R3 : G C2p_exo anti
|
30 |
+
R4 : G C3p_endo anti
|
31 |
+
R5 : U C3p_endo anti
|
32 |
+
R6 : A C3p_endo anti
|
33 |
+
R7 : U C3p_endo anti
|
34 |
+
R8 : U C2p_endo anti
|
35 |
+
R9 : G C3p_endo anti
|
36 |
+
R10 : C C3p_exo anti
|
37 |
+
R11 : A C3p_endo anti
|
38 |
+
R12 : G C1p_exo syn
|
39 |
+
R13 : U C2p_endo anti
|
40 |
+
R14 : A C1p_endo anti
|
41 |
+
R15 : C C3p_endo anti
|
42 |
+
R16 : C C2p_endo anti
|
43 |
+
R17 : U C3p_endo anti
|
44 |
+
R18 : C C3p_endo anti
|
45 |
+
R19 : C C3p_endo anti
|
46 |
+
R20 : A C3p_endo anti
|
47 |
+
R21 : G C3p_endo anti
|
48 |
+
R22 : G C3p_endo anti
|
49 |
+
R23 : U C1p_endo anti
|
50 |
+
A2 : VAL
|
51 |
+
A3 : LYS
|
52 |
+
A4 : LEU
|
53 |
+
A5 : THR
|
54 |
+
A6 : ALA
|
55 |
+
A7 : GLU
|
56 |
+
A8 : LEU
|
57 |
+
A9 : ILE
|
58 |
+
A10 : GLU
|
59 |
+
A11 : GLN
|
60 |
+
A12 : ALA
|
61 |
+
A13 : ALA
|
62 |
+
A14 : GLN
|
63 |
+
A15 : TYR
|
64 |
+
A16 : THR
|
65 |
+
A17 : ASN
|
66 |
+
A18 : ALA
|
67 |
+
A19 : VAL
|
68 |
+
A20 : ARG
|
69 |
+
A21 : ASP
|
70 |
+
A22 : ARG
|
71 |
+
A23 : GLU
|
72 |
+
A24 : LEU
|
73 |
+
A25 : ASP
|
74 |
+
A26 : LEU
|
75 |
+
A27 : ARG
|
76 |
+
A28 : GLY
|
77 |
+
A29 : TYR
|
78 |
+
A30 : LYS
|
79 |
+
A31 : ILE
|
80 |
+
A32 : PRO
|
81 |
+
A33 : VAL
|
82 |
+
A34 : ILE
|
83 |
+
A35 : GLU
|
84 |
+
A36 : ASN
|
85 |
+
A37 : LEU
|
86 |
+
A38 : GLY
|
87 |
+
A39 : ALA
|
88 |
+
A40 : THR
|
89 |
+
A41 : LEU
|
90 |
+
A42 : ASP
|
91 |
+
A43 : GLN
|
92 |
+
A44 : PHE
|
93 |
+
A45 : ASP
|
94 |
+
A46 : ALA
|
95 |
+
A47 : ILE
|
96 |
+
A48 : ASP
|
97 |
+
A49 : PHE
|
98 |
+
A50 : SER
|
99 |
+
A51 : ASP
|
100 |
+
A52 : ASN
|
101 |
+
A53 : GLU
|
102 |
+
A54 : ILE
|
103 |
+
A55 : ARG
|
104 |
+
A56 : LYS
|
105 |
+
A57 : LEU
|
106 |
+
A58 : ASP
|
107 |
+
A59 : GLY
|
108 |
+
A60 : PHE
|
109 |
+
A61 : PRO
|
110 |
+
A62 : LEU
|
111 |
+
A63 : LEU
|
112 |
+
A64 : ARG
|
113 |
+
A65 : ARG
|
114 |
+
A66 : LEU
|
115 |
+
A67 : LYS
|
116 |
+
A68 : THR
|
117 |
+
A69 : LEU
|
118 |
+
A70 : LEU
|
119 |
+
A71 : VAL
|
120 |
+
A72 : ASN
|
121 |
+
A73 : ASN
|
122 |
+
A74 : ASN
|
123 |
+
A75 : ARG
|
124 |
+
A76 : ILE
|
125 |
+
A77 : CYS
|
126 |
+
A78 : ARG
|
127 |
+
A79 : ILE
|
128 |
+
A80 : GLY
|
129 |
+
A81 : GLU
|
130 |
+
A82 : GLY
|
131 |
+
A83 : LEU
|
132 |
+
A84 : ASP
|
133 |
+
A85 : GLN
|
134 |
+
A86 : ALA
|
135 |
+
A87 : LEU
|
136 |
+
A88 : PRO
|
137 |
+
A89 : ASP
|
138 |
+
A90 : LEU
|
139 |
+
A91 : THR
|
140 |
+
A92 : GLU
|
141 |
+
A93 : LEU
|
142 |
+
A94 : ILE
|
143 |
+
A95 : LEU
|
144 |
+
A96 : THR
|
145 |
+
A97 : ASN
|
146 |
+
A98 : ASN
|
147 |
+
A99 : SER
|
148 |
+
A100 : LEU
|
149 |
+
A101 : VAL
|
150 |
+
A102 : GLU
|
151 |
+
A103 : LEU
|
152 |
+
A104 : GLY
|
153 |
+
A105 : ASP
|
154 |
+
A106 : LEU
|
155 |
+
A107 : ASP
|
156 |
+
A108 : PRO
|
157 |
+
A109 : LEU
|
158 |
+
A110 : ALA
|
159 |
+
A111 : SER
|
160 |
+
A112 : LEU
|
161 |
+
A113 : LYS
|
162 |
+
A114 : SER
|
163 |
+
A115 : LEU
|
164 |
+
A116 : THR
|
165 |
+
A117 : TYR
|
166 |
+
A118 : LEU
|
167 |
+
A119 : CYS
|
168 |
+
A120 : ILE
|
169 |
+
A121 : LEU
|
170 |
+
A122 : ARG
|
171 |
+
A123 : ASN
|
172 |
+
A124 : PRO
|
173 |
+
A125 : VAL
|
174 |
+
A126 : THR
|
175 |
+
A127 : ASN
|
176 |
+
A128 : LYS
|
177 |
+
A129 : LYS
|
178 |
+
A130 : HIS
|
179 |
+
A131 : TYR
|
180 |
+
A132 : ARG
|
181 |
+
A133 : LEU
|
182 |
+
A134 : TYR
|
183 |
+
A135 : VAL
|
184 |
+
A136 : ILE
|
185 |
+
A137 : TYR
|
186 |
+
A138 : LYS
|
187 |
+
A139 : VAL
|
188 |
+
A140 : PRO
|
189 |
+
A141 : GLN
|
190 |
+
A142 : VAL
|
191 |
+
A143 : ARG
|
192 |
+
A144 : VAL
|
193 |
+
A145 : LEU
|
194 |
+
A146 : ASP
|
195 |
+
A147 : PHE
|
196 |
+
A148 : GLN
|
197 |
+
A149 : LYS
|
198 |
+
A150 : VAL
|
199 |
+
A151 : LYS
|
200 |
+
A152 : LEU
|
201 |
+
A153 : LYS
|
202 |
+
A154 : GLU
|
203 |
+
A155 : ARG
|
204 |
+
A156 : GLN
|
205 |
+
A157 : GLU
|
206 |
+
A158 : ALA
|
207 |
+
A159 : GLU
|
208 |
+
A160 : LYS
|
209 |
+
A161 : MET
|
210 |
+
A162 : PHE
|
211 |
+
A163 : LYS
|
212 |
+
C2 : VAL
|
213 |
+
C3 : LYS
|
214 |
+
C4 : LEU
|
215 |
+
C5 : THR
|
216 |
+
C6 : ALA
|
217 |
+
C7 : GLU
|
218 |
+
C8 : LEU
|
219 |
+
C9 : ILE
|
220 |
+
C10 : GLU
|
221 |
+
C11 : GLN
|
222 |
+
C12 : ALA
|
223 |
+
C13 : ALA
|
224 |
+
C14 : GLN
|
225 |
+
C15 : TYR
|
226 |
+
C16 : THR
|
227 |
+
C17 : ASN
|
228 |
+
C18 : ALA
|
229 |
+
C19 : VAL
|
230 |
+
C20 : ARG
|
231 |
+
C21 : ASP
|
232 |
+
C22 : ARG
|
233 |
+
C23 : GLU
|
234 |
+
C24 : LEU
|
235 |
+
C25 : ASP
|
236 |
+
C26 : LEU
|
237 |
+
C27 : ARG
|
238 |
+
C28 : GLY
|
239 |
+
C29 : TYR
|
240 |
+
C30 : LYS
|
241 |
+
C31 : ILE
|
242 |
+
C32 : PRO
|
243 |
+
C33 : VAL
|
244 |
+
C34 : ILE
|
245 |
+
C35 : GLU
|
246 |
+
C36 : ASN
|
247 |
+
C37 : LEU
|
248 |
+
C38 : GLY
|
249 |
+
C39 : ALA
|
250 |
+
C40 : THR
|
251 |
+
C41 : LEU
|
252 |
+
C42 : ASP
|
253 |
+
C43 : GLN
|
254 |
+
C44 : PHE
|
255 |
+
C45 : ASP
|
256 |
+
C46 : ALA
|
257 |
+
C47 : ILE
|
258 |
+
C48 : ASP
|
259 |
+
C49 : PHE
|
260 |
+
C50 : SER
|
261 |
+
C51 : ASP
|
262 |
+
C52 : ASN
|
263 |
+
C53 : GLU
|
264 |
+
C54 : ILE
|
265 |
+
C55 : ARG
|
266 |
+
C56 : LYS
|
267 |
+
C57 : LEU
|
268 |
+
C58 : ASP
|
269 |
+
C59 : GLY
|
270 |
+
C60 : PHE
|
271 |
+
C61 : PRO
|
272 |
+
C62 : LEU
|
273 |
+
C63 : LEU
|
274 |
+
C64 : ARG
|
275 |
+
C65 : ARG
|
276 |
+
C66 : LEU
|
277 |
+
C67 : LYS
|
278 |
+
C68 : THR
|
279 |
+
C69 : LEU
|
280 |
+
C70 : LEU
|
281 |
+
C71 : VAL
|
282 |
+
C72 : ASN
|
283 |
+
C73 : ASN
|
284 |
+
C74 : ASN
|
285 |
+
C75 : ARG
|
286 |
+
C76 : ILE
|
287 |
+
C77 : CYS
|
288 |
+
C78 : ARG
|
289 |
+
C79 : ILE
|
290 |
+
C80 : GLY
|
291 |
+
C81 : GLU
|
292 |
+
C82 : GLY
|
293 |
+
C83 : LEU
|
294 |
+
C84 : ASP
|
295 |
+
C85 : GLN
|
296 |
+
C86 : ALA
|
297 |
+
C87 : LEU
|
298 |
+
C88 : PRO
|
299 |
+
C89 : ASP
|
300 |
+
C90 : LEU
|
301 |
+
C91 : THR
|
302 |
+
C92 : GLU
|
303 |
+
C93 : LEU
|
304 |
+
C94 : ILE
|
305 |
+
C95 : LEU
|
306 |
+
C96 : THR
|
307 |
+
C97 : ASN
|
308 |
+
C98 : ASN
|
309 |
+
C99 : SER
|
310 |
+
C100 : LEU
|
311 |
+
C101 : VAL
|
312 |
+
C102 : GLU
|
313 |
+
C103 : LEU
|
314 |
+
C104 : GLY
|
315 |
+
C105 : ASP
|
316 |
+
C106 : LEU
|
317 |
+
C107 : ASP
|
318 |
+
C108 : PRO
|
319 |
+
C109 : LEU
|
320 |
+
C110 : ALA
|
321 |
+
C111 : SER
|
322 |
+
C112 : LEU
|
323 |
+
C113 : LYS
|
324 |
+
C114 : SER
|
325 |
+
C115 : LEU
|
326 |
+
C116 : THR
|
327 |
+
C117 : TYR
|
328 |
+
C118 : LEU
|
329 |
+
C119 : CYS
|
330 |
+
C120 : ILE
|
331 |
+
C121 : LEU
|
332 |
+
C122 : ARG
|
333 |
+
C123 : ASN
|
334 |
+
C124 : PRO
|
335 |
+
C125 : VAL
|
336 |
+
C126 : THR
|
337 |
+
C127 : ASN
|
338 |
+
C128 : LYS
|
339 |
+
C129 : LYS
|
340 |
+
C130 : HIS
|
341 |
+
C131 : TYR
|
342 |
+
C132 : ARG
|
343 |
+
C133 : LEU
|
344 |
+
C134 : TYR
|
345 |
+
C135 : VAL
|
346 |
+
C136 : ILE
|
347 |
+
C137 : TYR
|
348 |
+
C138 : LYS
|
349 |
+
C139 : VAL
|
350 |
+
C140 : PRO
|
351 |
+
C141 : GLN
|
352 |
+
C142 : VAL
|
353 |
+
C143 : ARG
|
354 |
+
C144 : VAL
|
355 |
+
C145 : LEU
|
356 |
+
C146 : ASP
|
357 |
+
C147 : PHE
|
358 |
+
C148 : GLN
|
359 |
+
C149 : LYS
|
360 |
+
C150 : VAL
|
361 |
+
C151 : LYS
|
362 |
+
C152 : LEU
|
363 |
+
C153 : LYS
|
364 |
+
C154 : GLU
|
365 |
+
C155 : ARG
|
366 |
+
C156 : GLN
|
367 |
+
C157 : GLU
|
368 |
+
C158 : ALA
|
369 |
+
C159 : GLU
|
370 |
+
C160 : LYS
|
371 |
+
C161 : MET
|
372 |
+
C162 : PHE
|
373 |
+
C163 : LYS
|
374 |
+
C164 : GLY
|
375 |
+
C165 : LYS
|
376 |
+
C166 : ARG
|
377 |
+
C167 : GLY
|
378 |
+
C168 : ALA
|
379 |
+
C169 : GLN
|
380 |
+
C170 : LEU
|
381 |
+
C171 : ALA
|
382 |
+
C172 : LYS
|
383 |
+
C173 : ASP
|
384 |
+
C174 : ILE
|
385 |
+
C175 : ALA
|
386 |
+
B6 : ILE
|
387 |
+
B7 : ARG
|
388 |
+
B8 : PRO
|
389 |
+
B9 : ASN
|
390 |
+
B10 : HIS
|
391 |
+
B11 : THR
|
392 |
+
B12 : ILE
|
393 |
+
B13 : TYR
|
394 |
+
B14 : ILE
|
395 |
+
B15 : ASN
|
396 |
+
B16 : ASN
|
397 |
+
B17 : MET
|
398 |
+
B18 : ASN
|
399 |
+
B19 : ASP
|
400 |
+
B20 : LYS
|
401 |
+
B21 : ILE
|
402 |
+
B22 : LYS
|
403 |
+
B23 : LYS
|
404 |
+
B24 : GLU
|
405 |
+
B25 : GLU
|
406 |
+
B26 : LEU
|
407 |
+
B27 : LYS
|
408 |
+
B28 : ARG
|
409 |
+
B29 : SER
|
410 |
+
B30 : LEU
|
411 |
+
B31 : TYR
|
412 |
+
B32 : ALA
|
413 |
+
B33 : LEU
|
414 |
+
B34 : PHE
|
415 |
+
B35 : SER
|
416 |
+
B36 : GLN
|
417 |
+
B37 : PHE
|
418 |
+
B38 : GLY
|
419 |
+
B39 : HIS
|
420 |
+
B40 : VAL
|
421 |
+
B41 : VAL
|
422 |
+
B42 : ASP
|
423 |
+
B43 : ILE
|
424 |
+
B44 : VAL
|
425 |
+
B45 : ALA
|
426 |
+
B46 : LEU
|
427 |
+
B47 : LYS
|
428 |
+
B48 : THR
|
429 |
+
B49 : MET
|
430 |
+
B50 : LYS
|
431 |
+
B51 : MET
|
432 |
+
B52 : ARG
|
433 |
+
B53 : GLY
|
434 |
+
B54 : GLN
|
435 |
+
B55 : ALA
|
436 |
+
B56 : PHE
|
437 |
+
B57 : VAL
|
438 |
+
B58 : ILE
|
439 |
+
B59 : PHE
|
440 |
+
B60 : LYS
|
441 |
+
B61 : GLU
|
442 |
+
B62 : LEU
|
443 |
+
B63 : GLY
|
444 |
+
B64 : SER
|
445 |
+
B65 : SER
|
446 |
+
B66 : THR
|
447 |
+
B67 : ASN
|
448 |
+
B68 : ALA
|
449 |
+
B69 : LEU
|
450 |
+
B70 : ARG
|
451 |
+
B71 : GLN
|
452 |
+
B72 : LEU
|
453 |
+
B73 : GLN
|
454 |
+
B74 : GLY
|
455 |
+
B75 : PHE
|
456 |
+
B76 : PRO
|
457 |
+
B77 : PHE
|
458 |
+
B78 : TYR
|
459 |
+
B79 : GLY
|
460 |
+
B80 : LYS
|
461 |
+
B81 : PRO
|
462 |
+
B82 : MET
|
463 |
+
B83 : ARG
|
464 |
+
B84 : ILE
|
465 |
+
B85 : GLN
|
466 |
+
B86 : TYR
|
467 |
+
B87 : ALA
|
468 |
+
B88 : LYS
|
469 |
+
B89 : THR
|
470 |
+
B90 : ASP
|
471 |
+
B91 : SER
|
472 |
+
B92 : ASP
|
473 |
+
B93 : ILE
|
474 |
+
B94 : ILE
|
475 |
+
B95 : SER
|
476 |
+
B96 : LYS
|
477 |
+
B97 : MET
|
478 |
+
B98 : ARG
|
479 |
+
B99 : GLY
|
480 |
+
D6 : ILE
|
481 |
+
D7 : ARG
|
482 |
+
D8 : PRO
|
483 |
+
D9 : ASN
|
484 |
+
D10 : HIS
|
485 |
+
D11 : THR
|
486 |
+
D12 : ILE
|
487 |
+
D13 : TYR
|
488 |
+
D14 : ILE
|
489 |
+
D15 : ASN
|
490 |
+
D16 : ASN
|
491 |
+
D17 : MET
|
492 |
+
D18 : ASN
|
493 |
+
D19 : ASP
|
494 |
+
D20 : LYS
|
495 |
+
D21 : ILE
|
496 |
+
D22 : LYS
|
497 |
+
D23 : LYS
|
498 |
+
D24 : GLU
|
499 |
+
D25 : GLU
|
500 |
+
D26 : LEU
|
501 |
+
D27 : LYS
|
502 |
+
D28 : ARG
|
503 |
+
D29 : SER
|
504 |
+
D30 : LEU
|
505 |
+
D31 : TYR
|
506 |
+
D32 : ALA
|
507 |
+
D33 : LEU
|
508 |
+
D34 : PHE
|
509 |
+
D35 : SER
|
510 |
+
D36 : GLN
|
511 |
+
D37 : PHE
|
512 |
+
D38 : GLY
|
513 |
+
D39 : HIS
|
514 |
+
D40 : VAL
|
515 |
+
D41 : VAL
|
516 |
+
D42 : ASP
|
517 |
+
D43 : ILE
|
518 |
+
D44 : VAL
|
519 |
+
D45 : ALA
|
520 |
+
D46 : LEU
|
521 |
+
D47 : LYS
|
522 |
+
D48 : THR
|
523 |
+
D49 : MET
|
524 |
+
D50 : LYS
|
525 |
+
D51 : MET
|
526 |
+
D52 : ARG
|
527 |
+
D53 : GLY
|
528 |
+
D54 : GLN
|
529 |
+
D55 : ALA
|
530 |
+
D56 : PHE
|
531 |
+
D57 : VAL
|
532 |
+
D58 : ILE
|
533 |
+
D59 : PHE
|
534 |
+
D60 : LYS
|
535 |
+
D61 : GLU
|
536 |
+
D62 : LEU
|
537 |
+
D63 : GLY
|
538 |
+
D64 : SER
|
539 |
+
D65 : SER
|
540 |
+
D66 : THR
|
541 |
+
D67 : ASN
|
542 |
+
D68 : ALA
|
543 |
+
D69 : LEU
|
544 |
+
D70 : ARG
|
545 |
+
D71 : GLN
|
546 |
+
D72 : LEU
|
547 |
+
D73 : GLN
|
548 |
+
D74 : GLY
|
549 |
+
D75 : PHE
|
550 |
+
D76 : PRO
|
551 |
+
D77 : PHE
|
552 |
+
D78 : TYR
|
553 |
+
D79 : GLY
|
554 |
+
D80 : LYS
|
555 |
+
D81 : PRO
|
556 |
+
D82 : MET
|
557 |
+
D83 : ARG
|
558 |
+
D84 : ILE
|
559 |
+
D85 : GLN
|
560 |
+
D86 : TYR
|
561 |
+
D87 : ALA
|
562 |
+
D88 : LYS
|
563 |
+
D89 : THR
|
564 |
+
D90 : ASP
|
565 |
+
D91 : SER
|
566 |
+
D92 : ASP
|
567 |
+
D93 : ILE
|
568 |
+
D94 : ILE
|
569 |
+
D95 : SER
|
570 |
+
D96 : LYS
|
571 |
+
D97 : MET
|
572 |
+
D98 : ARG
|
573 |
+
Adjacent stackings ----------------------------------------------
|
574 |
+
Q0-Q1 : adjacent_5p upward
|
575 |
+
Q1-Q2 : adjacent_5p upward
|
576 |
+
Q3-Q4 : adjacent_5p upward
|
577 |
+
Q4-Q5 : adjacent_5p upward
|
578 |
+
Q6-Q7 : adjacent_5p upward
|
579 |
+
Q11-Q12 : adjacent_5p inward
|
580 |
+
Q14-Q15 : adjacent_5p upward
|
581 |
+
Q15-Q16 : adjacent_5p upward
|
582 |
+
Q17-Q18 : adjacent_5p upward
|
583 |
+
Q19-Q20 : adjacent_5p upward
|
584 |
+
Q20-Q21 : adjacent_5p upward
|
585 |
+
Q21-Q22 : adjacent_5p upward
|
586 |
+
Q22-Q23 : adjacent_5p upward
|
587 |
+
R0-R1 : adjacent_5p upward
|
588 |
+
R1-R2 : adjacent_5p upward
|
589 |
+
R2-R3 : adjacent_5p upward
|
590 |
+
R3-R4 : adjacent_5p upward
|
591 |
+
R4-R5 : adjacent_5p upward
|
592 |
+
R6-R7 : adjacent_5p upward
|
593 |
+
R11-R12 : adjacent_5p inward
|
594 |
+
R14-R15 : adjacent_5p upward
|
595 |
+
R15-R16 : adjacent_5p upward
|
596 |
+
R17-R18 : adjacent_5p upward
|
597 |
+
R19-R20 : adjacent_5p upward
|
598 |
+
R20-R21 : adjacent_5p upward
|
599 |
+
R21-R22 : adjacent_5p upward
|
600 |
+
R22-R23 : adjacent_5p upward
|
601 |
+
Non-Adjacent stackings ------------------------------------------
|
602 |
+
Q3-Q20 : outward
|
603 |
+
Q6-Q17 : outward
|
604 |
+
R3-R20 : outward
|
605 |
+
R6-R17 : outward
|
606 |
+
Number of stackings = 31
|
607 |
+
Number of adjacent stackings = 27
|
608 |
+
Number of non adjacent stackings = 4
|
609 |
+
Base-pairs ------------------------------------------------------
|
610 |
+
Q0-Q22 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
|
611 |
+
Q1-Q21 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
|
612 |
+
Q2-Q20 : U-A Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
|
613 |
+
Q3-Q19 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
|
614 |
+
Q4-Q18 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
|
615 |
+
Q5-Q17 : U-U Ws/Ww pairing antiparallel cis XVI
|
616 |
+
R0-R22 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
|
617 |
+
R1-R21 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
|
618 |
+
R2-R20 : U-A Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
|
619 |
+
R3-R19 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
|
620 |
+
R4-R18 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
|
621 |
+
R5-R17 : U-U Ws/Ww pairing antiparallel cis XVI
|