اشنو هي الجينوميات المقارنة؟
ويتمثل جوهر تحليل الجينوم المقارن في إقامة المراسلات بين الجينات (تحليل علم الأورثولوجيا) أو الميزات الجينومية الأخرى في الكائنات الحية المختلفة. وهذه الخرائط بين الجينومات هي التي تجعل من الممكن تتبع العمليات التطورية المسؤولة عن الاختلاف بين الجينومين. يشكّل عدد كبير من الأحداث التطورية التي تعمل على مستويات تنظيمية مختلفة تطور الجينوم. وعلى أدنى مستوى، تؤثر الطفرات النقطية على النيوكليوتيدات الفردية. وعلى مستوى أعلى، تتكرر الأجزاء الكروموسومية الكبيرة، وتنتقل جانباً، وتعكس، وتتحول، وتحذف، وتدخل. وفي النهاية، تشارك الجينومات بأكملها في عمليات التهجين والتكثيف والتكافل الداخلي، والتي غالباً ما تؤدي إلى التنوع السريع. يطرح تعقيد تطور الجينوم العديد من التحديات المثيرة على مطوري النماذج والخوارزميات الرياضية، الذين يلجأون إلى مجموعة من التقنيات الخوارزمية والإحصائية والرياضية، بدءًا من الخوارزميات الدقيقة والهيورستيكية والبارامتر الثابتة والتقدير للمشاكل القائمة على نماذج التكافؤ إلى خوارزميات سلسلة ماركوف مونتي كارلو للتحليل البايسي للمشاكل القائمة على نماذج احتمالية.  تعتمد العديد من هذه الدراسات على اكتشاف التوافق في التسلسل لتعيين التسلسلات لعائلات البروتين.