إيه علم الجينوم المقارن؟
جوهر تحليل الجينوم المقارن هو تأسيس المراسلات بين الجينات (تحليل علم الأورثولوجيا) أو الميزات الجينومية التانية في الكائنات الحية المختلفة. الخرائط بين الجينوم بتساعد على تتبع العمليات التطورية المسؤولة عن الاختلاف بين الجينومين. كتير من الأحداث التطورية اللي بتعمل على مستويات تنظيمية مختلفة بتشكل تطور الجينوم. في أدنى مستوى، بتؤثر الطفرات النقطية على النيوكليوتيدات الفردية. على مستوى أعلى، بتخضع الأجزاء الكروموسومية الكبيرة للتضاعف والنقل الجانبي والانعكاس والتحويل والحذف والإدراج. في نهاية المطاف، بيتورط الجينومات كلها في عمليات التهجين والتكثيف والتكافل الداخلي، واللي غالبًا ما بيدي إلى التنوع السريع. بتشكل تعقيد تطور الجينوم العديد من التحديات المثيرة لمطوري النماذج والخوارزميات الرياضية، اللي بيستخدموا طيف من التقنيات الخوارزمية والإحصائية والرياضية، اللي بتتراوح من الخوارزميات الدقيقة والهيورستيكية والبارامتر الثابتة والمقربة للمشاكل المستندة إلى نماذج التكافؤ إلى خوارزميات سلسلة ماركوف مونتي كارلو للتحليل البايزي للمشاكل المستندة إلى نماذج احتمالية.  بتعتمد كتير من الدراسات دي على اكتشاف التسلسل المتماثل عشان نعطي التسلسلات لعائلات البروتين.