شنو علم الجينوم المقارن؟
جوهر تحليل الجينوم المقارن هو تأسيس المراسلات بين الجينات (تحليل علم النسب) أو الميزات الجينومية الأخرى في الكائنات الحية المختلفة. هذه الخرائط بين الجينومات هي التي تجعل من الممكن تتبع العمليات التطورية المسؤولة عن الاختلاف بين جينومين. عدد كبير من الأحداث التطورية التي تعمل على مستويات تنظيمية مختلفة تشكل تطور الجينوم. على أدنى مستوى، الطفرات النقطية تؤثر على النيوكليوتيدات الفردية. على مستوى أعلى، تخضع الأجزاء الكروموسومية الكبيرة للتكرار، والنقل الجانبي، والانعكاس، والتحويل، والحذف، والإدراج. في نهاية المطاف، الجينومات بأكملها تشارك في عمليات التهجين والتكثيف والتكافل الداخلي، والتي غالباً ما تؤدي إلى التنوع السريع. تعقيد تطور الجينوم يطرح العديد من التحديات المثيرة لمطوري النماذج والخوارزميات الرياضية، الذين يلجأون إلى طيف من التقنيات الخوارزمية والإحصائية والرياضية، بدءاً من الخوارزميات الدقيقة والهيورستية والبارامتر الثابتة والتقدير للمشاكل القائمة على نماذج التقشف إلى خوارزميات سلسلة ماركوف مونتي كارلو للتحليل البايزي للمشاكل القائمة على نماذج احتمالية.  كتير من هذه الدراسات تستند إلى اكتشاف التسلسل المتجانس لتعيين التسلسلات لعائلات البروتين.