شنية الجينوميكا المقارنة؟
أساس تحليل الجينوم المقارن هو تأسيس المراسلات بين الجينات (تحليل الأورثولوجيا) أو الميزات الجينومية الأخرى في الكائنات الحية المختلفة. الخرائط المختلفة بين الجينومات هذي تخلق إمكانية لتعقب العمليات التطورية المسؤولة عن الاختلاف بين جينومين. فَيْدُومْ تَبْدِيلْ الجينومْ عْلَى ثَمَّة بَرْشَة حَاجَات تَبْدِيلْ تِتْحَرِّكْ فِي مستويات تنظيمية مُختلفة. في أدنى مستوى، الطفرات النقطية تؤثر على النيوكليوتيدات الفردية. في مستوى أعلى، شرائح الكروموسومات الكبيرة تمر بتكرار، نقل جانبي، عكس، نقل، حذف وإدراج. في النهاية، الجينومات الكاملة تشارك في عمليات التهجين والتكثيف والتكثيف والتكافل الداخلي، واللي غالبا ما يؤدي لتنوع سريع. تعقيد تطوير الجينوم يطرح تحديات كثيرة مشوقة على مطوري النماذج الرياضية والخوارزميات، واللي يستخدموا طيف من التقنيات الخوارزمية والإحصائية والرياضية، من الخوارزميات الدقيقة والهيورستيكية والبارامتر الثابتة والتقدير للمشاكل القائمة على نماذج التكافل لخوارزميات سلسلة ماركوف مونتي كارلو للتحليل البايسي للمشاكل القائمة على نماذج احتمالية.  كتير من الدراسات هاذم مبنية على اكتشاف تسلسل متجانس لتعيين التسلسلات لعائلات البروتين.