شنية تحليل الجينوم؟
تسلسل الجينوم للكائن الحي يتضمن تسلسل الحمض النووي الجماعي لكل كروموسوم في الكائن الحي. بالنسبة للبكتيريا اللي فيها كروموسوم واحد، مشروع الجينوم يستهدف رسم خريطة لتسلسل الكروموسوم هذا. بالنسبة للفصيلة البشرية، واللي جينومها يتضمن 22 زوج من الكروموسومات الذاتية و 2 كروموسومات جنسية، تسلسل الجينوم الكامل يشتمل على 46 تسلسل كروموسوم منفصل.  مشروع الجينوم البشري هو مثال معروف على مشروع الجينوم.  تجميع الجينوم يشير لعملية أخذ عدد كبير من تسلسلات الحمض النووي القصيرة وإعادة تجميعها لخلق تمثيل للكروموسومات الأصلية التي نشأ منها الحمض النووي. في مشروع تسلسل البندقية، كل الحمض النووي من مصدر (عادة كائن حي واحد، أي حاجة من البكتيريا إلى الثدييات) يتكسر أولاً في ملايين من القطع الصغيرة. و بعدين "يقرؤو" القطع هذي من قبل آلات تسلسل آلي. الخوارزمية متكونة من الجينوم تعمل من خلال اخذ كل القطع و ترتيبها مع بعضها، و اكتشاف كل البلايص الي فيها اثنين من التسلسلات القصيرة، او القراءات، تتداخلوا. القراءات المترابطة هذي تتم دمجها، و العملية تواصل.  تجميع الجينوم هو مشكلة حاسوبية صعبة جداً، وتزداد صعوبة لأن كتير من الجينومات تحتوي على أعداد كبيرة من التسلسلات المتطابقة، المعروفة باسم التكرار. التكرار هذا يمكن يبلغ طوله آلاف النيوكليوتيدات، ويحدث في أماكن مختلفة، خاصة في الجينومات الكبيرة للنباتات والحيوانات.  ويتم إنتاج تسلسل الجينوم (المسودة) الناتج عن طريق الجمع بين المعلومات المتسلسلة و من بعد باستخدام المعلومات المتصلة لخلق السقالة. السقالات موجودة على طول الخريطة الفيزيائية للكروموسومات لتخلق "طريق ذهبي".  في البداية، معظم مراكز تسلسل الحمض النووي على نطاق كبير طوروا برنامجهم الخاص لتجميع التسلسلات التي أنتجوها. إما، هذا تغير مع تزايد تعقيد البرمجيات وزيادة عدد مراكز التسلسل. مثال على حزمة تحليل الأوليجونوكليوتيدات القصيرة المجمعة من قبل بي جي آي للتجميع الجديد من الجينومات بحجم البشر، والمواءمة، وكشف SNP، وإعادة التسلسل، وإيجاد الفراغ، وتحليل التباين الهيكلي.  من ثمانينيات القرن العشرين، البيولوجيا الجزيئية و المعلوماتية الحيوية خلقت الحاجة للتعليق على الحمض النووي. التفسير في الحمض النووي أو التفسير في الجينوم هو عملية التعرف على المعلومات البيولوجية المرفقة مع التسلسلات، وبخاصة في التعرف على مواقع الجينات وتحديد ما يفعله تلك الجينات.  وقت ما نسلسل الجينوم، فما في العادة مناطق صعوبة في التسلسل (غالباً مناطق فيها الحمض النووي المتكرر بشدة). ونتيجة لذلك، التركيبات الجينومية "المكتملة" نادرا ما تكون كاملة، و استخدموا مصطلحات مثل "مسودة عمل" أو "كاملة بشكل أساسي" لتوصيف وضعية مشاريع الجينوم هذه بشكل أكثر دقة. حتى وقتلي تتم تحديد كل زوج أساس من تسلسل الجينوم، فما ما زالت احتمالية وجود أخطاء موجودة عشان تسلسل الحمض النووي ميش عملية دقيقة بالكامل. يُمْكِنْ يِتْقَالْ زَادْ الِّي مشروع جينوم كامل يلزم يْشُمْلْ التَّرَتُّبْ مْتَاع الميتوكوندريا و (للبُزُور) الكلوروبلاست، عْلَى خَاطِرْ العضياتْ هَاذِي عِنْدْهُمْ جينوماتْ.  في الغالب يقال إن الهدف من تسلسل الجينوم هو الحصول على معلومات عن المجموعة الكاملة من الجينات في تسلسل الجينوم المحدد. النسبة من الجينوم اللي يرمز للجينات ممكن تكون صغيرة جدا (خاصة في النوويات النووية مثل البشر، حيث إن الحمض النووي المرمز ممكن يشكّل فقط بضعة بالمئة من التسلسل الكامل). إما، ما فماش ممكن (أو مُشْتَهِي) نْقَيَّدوا بثلاثة أجزاء متفرقين. إضافة للي، مع فهم العلماء أكثر عن دور الحمض النووي غير المشفر هذا (اللي في الغالب يُقال عليه الحمض النووي غير المطلوب) ، بيقولوا إنه من المهم إمتلاك تسلسل جينوم كامل كخلفية لفهم علم الوراثة والبيولوجيا لأي كائن حي.  فِي بَرْشَة طُرُق، مشاريع الجينوم ما تقتصرش على تحديد تسلسل الحمض النووي للكائن الحي. المشاريع هذي ممكن تشتمل برؤية الجينات حتى تتعرف على أماكن الجينات في الجينوم، وماذا تعمل الجينات هذي. ويمكن زاد يكون فما مشاريع متعلقة بسلسلة ESTs أو mRNAs للمساعدة في معرفة أماكن الجينات في الواقع.