شو تحليل الجينوم؟
تسلسل الجينوم للكائن الحي بيتضمن تسلسل الحمض النووي الجماعي لكل كروموسوم في الكائن الحي. عشان البكتيريا اللي بتحتوي على كروموسوم واحد، مشروع الجينوم رح يهدف عشان يرسم خريطة تسلسل الكروموسوم. بالنسبة للأنواع البشرية، اللي الجينوم فيها 22 زوج من الكروموسومات الذاتية و 2 كروموسومات جنسية، بتتضمن تسلسل الجينوم الكامل 46 تسلسل كروموسوم منفصل.  مشروع الجينوم البشري مثال معروف لمشروع الجينوم.  تجميع الجينوم بتشير لعملية أخذ عدد كبير من تسلسلات الحمض النووي القصيرة وإعادة تجميعها علشان تصنع تمثيل للكروموسومات الأصلية اللي منشأ منها الحمض النووي. في مشروع تسلسل البندقية، كل الحمض النووي من مصدر (عادة كائن حي واحد، أي شي من بكتيريا إلى ثديية) بتتكسّر أولًا لملايين القطع الصغيرة. بعدين بتت "قرا" القطع عن طريق آلات تسلسل آلية. خوارزمية تجميع الجينوم بتعمل عن طريق اخذ كل القطع وتحديدها مع بعضها، وبتكتشف كل الاماكن اللي بتتداخل فيها اثنين من التسلسلات القصيرة، أو القراءات. هيدا القراءات المتداخلة ممكن تتحد، والعملية بتستمر.  تجميع الجينوم مشكلة حاسوبية صعبة جدًا، صارت أصعب لأن كتير من الجينومات تحتوي على أعداد كبيرة من التسلسلات المتطابقة، المعروفة باسم التكرار. هالتكرار ممكن يكون طولها آلاف النيوكليوتيدات، وبتحصل بمناطق مختلفة، خصوصاً في الجينومات الكبيرة للنباتات والحيوانات.  بتنتج تسلسل الجينوم الناتج (المسودة) عن طريق الجمع بين المعلومات المتسلسلة وبعدها باستخدام معلومات الربط علشان يخلق مساريس. المراسي بتتمركز على طول الخريطة المادية للكروموسومات اللي بتخلق "طريق ذهبي".  أصلاً، معظم مراكز تسلسل الحمض النووي على نطاق كبير طوروا برمجياتهم الخاصة لتجميع التسلسلات اللي أنتجوها. ومع كدا، هيك تغير مع تعقيد البرمجيات وزيادة عدد مراكز التسلسل. مثال على هيك حزمة تحليل أوليغونوكليوتيد قصير المجمعة اللي طورها بي جي آي للتجميع الجديد للجينومات بحجم الإنسان، والمواءمة، واكتشاف SNP، وإعادة التسلسل، وإيجاد الفراغ، وتحليل التباين الهيكلي.  من سنة 1980، بيولوجيا الجزيئية والمعلوماتية الحيوية خلقت الحاجة للتعليق على الحمض النووي. تعليق الحمض النووي أو تعليق الجينوم هيي عملية تحديد المعلومات البيولوجية المرفقة بالترتيبات، وبالأخص في تحديد مواقع الجينات وتحديد أيش بتعمل هالجينات.  لما بتتسلسل الجينوم، في عادة مناطق صعبة التسلسل (غالباً مناطق بتكرار كبير للحمض النووي). عشان كدا، كتير نادراً ما تكون تسلسلات الجينوم "المكتملة" كاملة، واستعملوا مصطلحات زي "مسودة عمل" أو "كامل بشكل أساسي" علشان يوصفوا بشكل أكتر دقة حالة مشاريع الجينوم دي. حتى بعد ما اتحدد كل زوج أساس من تسلسل الجينوم، لسه من المرجح وجود أخطاء لأن تسلسل الحمض النووي مش عملية دقيقة تمامًا. ممكن بردو نقول إن مشروع الجينوم الكامل لازم يشمل تسلسل الميتوكوندريا والكلوروبلاست (للبمباتات) لأن هالأعضاء اللي في الجينوم ليها جينوماتها.  غالبًا بيتقال إن الهدف من تسلسل الجينوم هو الحصول على معلومات عن المجموعة الكاملة من الجينات في تسلسل الجينوم المحدد. نسبة الجينوم اللي بيديل الجينات ممكن تكون صغيرة كتير (خاصة في النواة النووية زي البشر، وبيديل الحمض النووي اللي بيديل الرموز ممكن يكون بس بنسبة قليلة من التسلسل الكامل). ومع كدا، مش ممكن (أو من المطلوب) بس تسلسل مناطق التشفير بشكل منفصل. كمان، كلما فاهم العلماء أكتر عن دور هيدنا غير المشفر (بيتقال عادة عنوانه "حمض نووي غير ضروري") ، بيكون أكتر أهمية إن يكون لدينا تسلسل جينوم كامل كخلفية لفهم علم الوراثة وبيولوجيا أي كائن حي.  بطرق كتير مشروعات الجينوم ما بتقتصر بس على تحديد تسلسل الحمض النووي للكائن الحي. المشاريع دي ممكن بردو تشمل التنبؤ بالجينات عشان تعرف وين موجودة الجينات في الجينوم، و شو بتعمل هالجينات. ممكن كمان يكون في مشاريع ذات صلة بتسلسل إي إس تي أو آر إن أي إم للمساعدة في معرفة مكان الجينات فعلياً.