Totò Riina sarebbe il mandante della strage del rapido 904. L'inchiesta della Direzione Distrettuale Antimafia di Napoli ha portato a un'ordinanza di custodia cautelare nei confronti del famoso boss di Cosa Nostra. L'ordinanza e' stata firmata dal gip presso il Tribunale di Napoli Carlo Modestino su richiesta dei pubblici ministeri Sergio Amato e Paolo Itri coordinati dal procuratore aggiunto Alessandro Pennasilico. Ad incastrare Riina,che attualmente si trova in carcere in regime di 41 bis, sarebbero state le dichiarazioni di alcuni pentiti siciliani. Per l'attentato erano già stati condannati in via definitiva altri esponenti della criminalità organizzata. Nel 1994 il boss Pippo Calò, considerato uno dei mandanti, è stato condannato all'ergastolo dalla quinta sezione della Corte di Cassazione. Con lui anche Guido Cercola. Dal'inchiesta della Dda di Napoli è emerso anche un particolare tutt'altro che secondario. L'esplosivo utilizzato per la strage del rapido 904 è infatti lo stesso che venne usato nella strage di via D'Amelio del 19 luglio 1992 nella quale persero la vita il giudice Paolo Borsellino e gli uomini della sua scorta. In quella data, in via Mariano D'Amelio a Palermo dove viveva la madre di Borsellino, esplose una Fiat 126 imbottita di 100 Kg di tritolo.
L’inchiesta della Dda di Napoli sulla strage del rapido 904 ha portato a un’ordinanza di custodia cautelare nei confronti di Totò Riina, ritenuto il mandante dell’attentato.