1997年数学科学学院成立,并保留数学系,顾沛为系主任;1998年2月,梁科为系主任;2003年4月,刘春根为系主任;2007年6月,邓少强为数学系主任(现任),丁龙云为副系主任;2022年5月李磊为副系主任(现任).党支部书记李磊.
2010年1月撤销金融信息技术系后成立,金应烈为系主任;2022年5月,史永堂为系主任(现任).党支部书记江一鸣.
(金融信息技术系1997年学院成立时设立,张效成为系主任;2001年12月,陈典发为系主任;2007年6月,金应烈为系主任.)
1997年学院成立时设立,名为信息科学与概率统计系,吴喜之为系主任,梁朴为副系主任;1999年5月,更名为信息与概率系,阮吉寿为系主任;2021年2月,杨建益为系主任(现任);2016年6月,更名为信息与数据科学系;2022年5月,高建召为副系主任.党支部书记高建召.
下设生物信息学实验室.
1999年5月在数理统计专业的基础上设立统计学系,张润楚为系主任;2001年12月,王兆军为系主任;2008年11月,刘民千为系主任;2016年6月,更名为概率统计系,陈鲁生为系主任(现任).党支部书记高建召.
1997年学院成立时设立,名为科学计算与应用软件系,胡健伟为系主任;2001年12月,杨庆之为系主任;2005年10月,朱少红为系主任;2008年12月,杨庆之为系主任;2016年7月,吴春林为系主任;2022年5月,胡广辉为系主任(现任).党支部书记薛运华.
2009年11月,更名为科学与工程计算系.
2010年1月撤销金融信息技术系后成立,王永进为系主任,江一鸣为副系主任;2021年2月,江一鸣为系主任(现任).党支部书记江一鸣.
1997年学院成立时设立,陈吉象为教学部主任;2001年12月,张效成为教学部主任;2009年9月,周迈为教学部主任.党支部书记李磊.