澎湖群岛位于台湾本岛与中国之间,由于具有先天地理与港湾的优越特殊条件,自古即为军事要冲及重要的移民中继站,是台湾开发最早的地区.
根据考古学家的考证,澎湖在五千年前即有以粗绳文陶为代表的新石器文化存在,证明澎湖至少在五千年前已有先住民生活的足迹.
澎连雅堂台湾通史称:"澎湖之有居人,尤远在秦和汉之际,或曰楚灭越,越之子孙迁于闽,流落海上,或居于澎湖".宋朝时"澎湖"一名正式见于野史及方志,而史书上有汉人居住澎湖的确实记载始自南宋,在南宋理宗宝庆元年(公元1225年)宗室赵汝适著"诸蕃志"中明确的指出"泉有海岛曰彭湖,隶晋江县".
元世祖至元18年(公元1281年)11月澎湖正式设巡检司,隶属福建同安,使澎湖收入中国版图早于台湾403年.至明太祖洪武21年(公元1388 年),因东南沿海长年海盗倭寇为患,朝廷追剿无功,澎湖反成盗寇巢穴,遂依部将汤和所请,行徙民墟地政策,废巡检司,将原有居民迁至泉,漳二州安置.
明朝废巡检司后,澎湖更沦为海盗,倭寇剽掠沿海的根据地,造成无穷的后患.嘉靖末叶之后巨盗林道干,林凤,曾一本等都曾利用澎湖为基地以窜扰沿海,天启六年至永历12年(公元1626-1658年)郑芝龙亦占据统制澎湖.明朝廷为追剿盗寇数度追击至澎湖,嘉靖42年(公元1563年)俞大猷痛击占澎海贼与倭寇,驻偏师于澎湖,朝廷依其所奏复设澎湖巡检司,唯俞大猷去职后巡检司也被废止.明自洪武21年废巡检司至永历15年郑成功收澎湖(西元 1388-1661年),经251年近三世纪之盗寇据乱,使澎湖回溯荒芜.
明朝废巡检司后近三世纪之盗寇据乱时期,亦予荷兰人有机可趁.明万历32年(公元1604年)7月12日荷兰人韦麻郎率大船三艘开入澎湖,是时澎湖无兵驻守,即登陆,半商半军,在娘妈宫(现今马公)开洋货摊,万历32年(公元1604年)10月25日明廷派浯屿都司沈有容谕退韦麻郎,有石碑记录之,现存于天后宫内.万历37年(公元1609年)荷兰商船至澎湖,适逢澎湖汛兵戍守期,无法登陆而离去.明熹宗天启2年(公元1622年)7月1日晨荷将雷尔生率舰12艘,兵1024人侵入妈宫港,当时澎湖汛兵已撤离,即在风柜尾登陆,居民数千人抵抗,被杀3余人,荷军占据澎湖后为长期防备,役民搬石筑城,除建造红毛城,并在风柜尾,金龟头(金龙头),嵵里,四角屿,渔翁岛建筑炮台以守海道,其后荷舰出入海洋,对南北海运商旅影响至巨.天启4年(公元1624年)福建巡抚南居益奏准攻澎湖荷兰人,擒高文律12人,驱荷大胜后南居益于暗澳(今文澳)筑天启城,设游击一,把总二,统兵三千,建炮台以守.
明崇祯17年(公元1644年)吴三桂引清兵入关,明沦于满清,郑成功在东南沿海与清兵周旋,努力抗清复国.永历8年(公元1654年)郑成功在金门势力巩固,奉宗室于金门.永历15年(公元1661年)决东征台湾,2月初三率舰数百艘,兵二万五千人从金门料罗湾出发,初四早晨望见澎湖八罩岛,黄昏抵达妈宫驻扎,初六郑成功祭祷海岳,巡视附近诸岛,初八早晨由澎湖出发东征鹿耳门,至12月初三战胜荷兰人,设承天府一府及天兴,万年二县,在澎湖设安抚司,屯戍重兵,以为台湾门户.永历16年(公元1662年)5月初八郑成功病逝,郑经嗣位,改东都为东宁.永历18年(公元1664年)3月初七郑经自铜山退守东宁而至澎湖.永历19年(公元1665年)2月郑经闻报施琅要攻澎湖,与部将会商对策部署防御,唯施琅攻澎因遇风失败而还,北调内大臣,裁福建水师提督.永历35年(公元1681年)郑经逝去,郑克塽继位,施琅得再治兵厦门领水师提督征台湾,5月施琅谋伐台湾,10月郑克塽派刘国轩率二万余人,战船二百余艘守澎湖,永历37年(公元1683年)6月14日施琅率师由铜山出发,15日到花屿攻澎湖,22日刘国轩战败逃回台湾,7月16日郑克塽正式投降,8月13日施琅入台,澎湖一战失利,明代终告覆亡.郑氏守备澎湖自永历15年至永历37年(公元1661- 1683年)计23年.
康熙23年(公元1684年)清正式将台澎纳入版图,置戍兵守台澎,澎湖仿元代设巡检司,附属台湾县,分兵驻守澎湖,设水师副将一员,兵二千,下设游击,都司,守备千把总等,武备衙门林立.雍正元年(公元1723年)复议澎湖巡检不足治澎,拟升为厅,殆至雍正5年(公元1727年)升澎湖巡检为海防同知,添置防兵.雍正6年(公元1728年)改台厦兵备道为台湾道,设澎湖海防粮捕厅,置通判.澎湖早于台湾403年即自元代入版图起算至清正式将台湾纳入版图.清治澎湖212年,仅有赈恤,文事与造城筑炮台,并无其他重大民生发展建设,较重要史实事件有:乾隆31年(公元1766年)通判胡建伟呈请创建文石书院,次年夏文石书院落成;乾隆32年(公元1767年)胡建伟编成"澎湖纪略"为澎湖首创完整志书;乾隆43年(公元1778年 )建西屿外垵灯塔,次年完成,为台湾灯塔之滥觞,厦门航行台湾船只以此为标识;道光9年通判蒋镛完成"澎湖纪略续编";光绪9年(公元1883年)通判李嘉棠奉令筑炮台于西屿内外堑;光绪11年(公元1885年)2月13日法将孤拔率舰攻澎,清方失利,孤拔入澎,时疫大流行,孤拔病死,葬于妈宫城,3月清法议和,6月24日法军撤退;光绪13年(公元1887年)海坛镇总兵吴宏洛任澎湖水师总兵接管澎湖,督造澎湖城(妈宫城);光绪20年(公元1894 年)清日甲午战争开始,21年(公元1895年)3月20日本伊东中将率联合舰队到达澎湖将军澳,23日由良文港(龙门)里正角登陆,24日攻陷拱北炮台,再进逼妈宫城,25日占领全澎湖.
光绪21年(公元1895年)4月17日李鸿章与伊藤博文签订马关条约,正式割让台湾澎湖与日本,台澎自此被日本统治51年.光绪21年(公元1895 年)3月25日日本占领澎湖后,任命海军少将田中纲常为"澎湖列岛行政厅长官"施行军政,6月28日全台置三县一厅,澎湖称为"澎湖岛厅".明治29年(公元1896年)5月废止军政.明治31年(公元1898年)6月改称"澎湖厅"直属于台湾总督府.明治36年(公元1903年)设澎湖要塞司令部,整理测天岛海军军区巩固殖民地防务.大正9年(公元1920年)"澎湖厅"改为"澎湖郡"改隶属高雄州;12年(公元1923年)日皇太子裕仁亲王来台并专程视察澎湖;15年(公元1926年)澎湖复改为厅,仍隶属于台湾总督府.
日治时代日本在澎湖的主要建设为:明治30年(公元1902年)建立北岛灯塔于目斗屿;大正2年(公元1913年)设立电灯株式会社,首开澎湖电化先声,大正2至9年(公元1913-1920年)建设邮电交,通鼓励日商来澎经营各种 商业;大正15年(公元1926年)创"澎湖水产会";昭和2年(公元1927年)于马公湖西开办公共汽车,组织地方自治,6月开建马公自来水厂,昭和5年(西元 1930年)自来水厂竣工输水;昭和12年(公元1937年)完成弥荣,万岁桥(中正,永安桥)改建,使本岛连结白沙岛可通行车辆;昭和16年(公元1941年)儿童初等教育之公学改为国民学校;昭和18年(公元1943年)设立马公高等女学校等.
公元1945年8月15日日本宣布无条件投降,民国34年12月25日澎湖改为"澎湖县";35年(公元1946年)1月22日正式成立澎湖县政府,首任官派县长傅纬武.39年(公元1950年)首届议会(民选)成立,郑大洽当选议长.40年(公元1951年)1月7日李玉林当选首届民选县长.