国清寺的历史与如东掘港的成陆几乎相等.唐朝初年,一道捍海围堤把掘港与海滩分开,国清寺便带着人们对太平盛世的期盼应运而建.掘港国清寺是在唐朝宗宪年代建起来的,来建的和尚名叫行满,是天台山国清寺的第十年祖师,所以掘港的国清寺和天台山的国清寺是一个名字,原来的结构方式也是一个模式.行满法师在建筑佛寺时,曾有"寺若成,国即清"之说,然而,这座在历史长河中跌宕起伏千年的古刹,并没有象行满法师所期望的清净太平.
 从唐到宋元,国清寺饱受战火之乱,至明清虽然多次重修,但仍在上世纪六十年代被夷为平地.现在的国清寺是从1991年由如东县,南通市两级政府批准,准予落实宗教政策开始筹建,到现在己有15年了.
 国清大殿内供奉的是三世佛:释家牟尼居中,右尊为西方极乐世界的阿弥陀佛,左尊为东方琉璃世界的琉璃光佛.药师佛救死扶伤,阿弥陀佛接引众生,与其它寺院中释家牟尼两侧侍者是阿难和迦叶有所不同.国清寺最珍贵的当属念佛堂供奉的白玉千手观音.这尊缅甸国赠送的玉观音由一块整体的缅甸玉石雕刻而成,玉质细腻,高三点八米,重四吨.这样造型的玉观音在全国也是罕见的.睡下来的释家牟尼佛,卧佛那种玉佛很多,象国清寺这种千手观音玉佛,是唯独少见的,可以说在全国国清寺是第一尊.
 古寺还是中日友好的见证.唐开成年间,日本高僧圆仁随第13批遣唐使西渡求法,来到掘港国清寺,住宿寺内半月有余.圆仁后来所写的"入唐求法巡礼行记"中,对掘港国清寺有详细记述.在世界旅游文化宝库里,圆仁的"入唐求法巡礼行记",与我国唐玄奘的"大唐西域记",意大利旅行家马可.波罗的"东方见闻录"被列为"世界三大旅行游记"."行记"的面世使"掘港",如东"国清寺"在历史典籍中首次亮相,也成为中日文化交流的一段佳话.