SARS-CoV
Le coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère ou ' (acronyme anglais de "severe acute respiratory syndrome coronavirus") (parfois ' pour bien le différencier du SARS-CoV-2 apparu en 2019) est le coronavirus responsable de l'épidémie de syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS) qui a sévi de 2002 à 2004. C'est une souche de l'espèce de coronavirus SARSr-CoV (pour "-related coronavirus", soit ). Cet agent infectieux serait apparu en dans la province du Guangdong, en Chine. Entre le et le , le virus aurait infecté dans une trentaine de pays, causant 774 décès, essentiellement en Chine, à Hong Kong, à Taïwan, et en Asie du Sud-Est. Issu d'une espèce de coronavirus bien implantée chez les chauve-souris (Rhinolophes), le SARS-CoV-1 infecte civettes, blaireaux et humains.

Il s'agit d'un virus à ARN monocaténaire de polarité positive (groupe de la classification Baltimore) appartenant au genre des "Betacoronavirus". Ce virus enveloppé présente un génome long d'environ , ce qui est l'un des plus grands génomes parmi les virus à ARN. On y a identifié codant . La région 5'-UTR compte tandis que la région 3'-UTR en compte 342. Comme pour d'autres coronavirus, l'expression de ce génome commence par la transcription de deux grands cadres de lecture ouverts (), notés 1a et 1b, qui sont tous les deux traduits en polyprotéines.

On connaît la fonction de plusieurs de ces protéines<ref name="10.3390/v4112902">
</ref>. Les cadres de lecture ouverts 1a et 1b codent l'ARN polymérase ARN-dépendante et quatre protéines structurelles importantes : la protéine N de nucléocapside, la protéine S de spicule, la protéine M de membrane et la protéine E d'enveloppe. Il existe également huit protéines dites accessoires dont aucune n'a d'homologue connu. La fonction de ces protéines accessoires demeure obscure.

Les coronavirus expriment généralement les polyprotéines pp1a et pp1ab avec les cadres de lecture ouverts 1a et 1b. Ces polyprotéines sont ensuite traitées par des enzymes codées dans l'ORF 1a. Parmi les protéines issues du traitement des polyprotéines par ces enzymes, on compte plusieurs enzymes de réplication telles qu'une ARN polymérase ARN-dépendante, une hélicase et une peptidase. Le complexe de réplication des coronavirus est également responsable de la synthèse de divers ARN messagers en aval du cadre de lecture ouvert 1b, qui donnent des protéines structurelles et accessoires. Deux protéines distinctes, 3CLpro et PL2pro, clivent les grandes polyprotéines en plus petites. Ce génome ne contient pas de gène codant l'hémagglutinine estérase, présente chez les coronavirus de classe .
Q82069695
SARS-CoV-2
Concept
Q25274
2019
TIME
Q89469904
coronavirus
Concept
Q103177
syndrome respiratoire aigu sévère
Concept
Q1987
2002
TIME
Q2014
2004
TIME
Q278567
SARSr-CoV
Concept
Q170065
agent infectieux
Concept
Q15175
Guangdong
LOC
Q148
Chine
LOC
Q8646
Hong Kong
LOC
Q865
Taïwan
LOC
Q11708
Asie du Sud-Est
LOC
Q278567
espèce
Concept
Q2000632
Rhinolophe
Concept
Q887918
civettes
Concept
Q15978631
humains
Concept
Q751911
virus à ARN
Concept
Q3321098
monocaténaire
Concept
Q1362279
polarité
UNK
Q782725
classification Baltimore
MISC
Q34740
genre
Concept
Q16532287
Betacoronavirus
Concept
Q808
virus enveloppé
Concept
Q7020
génome
Concept
Q11053
ARN
Concept
Q180618
codant
Concept
Q937624
5'-UTR
Concept
Q3272830
3'-UTR
Concept
Q89469904
coronavirus
Concept
Q26972
expression
Concept
Q177900
transcription
Concept
Q908550
cadres de lecture ouverts
Concept
Q185917
traduits
Concept
Q2103086
polyprotéine
UNK
Q2919111
ARN polymérase ARN-dépendante
Concept
Q830465
nucléocapside
Concept
Q1587185
membrane
Concept
Q994215
enveloppe
UNK
Q224180
homologue
Concept
Q89469904
coronavirus
Concept
Q8047
enzyme
Concept
Q3933202
réplication
Concept
Q2919111
ARN polymérase ARN-dépendante
Concept
Q138864
hélicase
Concept
Q212410
peptidase
Concept
Q188928
ARN messagers
Concept
Q5638175
hémagglutinine estérase
UNK
Q85438966
SARS-CoV
Concept
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