O Jaborandi como quase todas as plantas medicinais e ou medicamentos têm ou podem ter efeitos indesejáveis, no caso especifico devemos ter particular atenção aos seguintes aspectos:
Contra-Indicações: Não deve ser utilizada em qualquer forma, mesmo que usada em uso externo, na forma de banhos ou em massagens por mulheres grávidas.
Efeitos Colaterais: Se consumida em elevadas doses, pode causar vômitos, diarréia e insuficiência cardíaca. O seu uso externo pode causar irritação nos olhos, pelo que deve tomar as devidas precauções.