A proteína do ponto SARS-CoV-2 permanece conservada notàvel entre 37 variações de Hong Kong
Enquanto a pandemia da doença 2019 do coronavirus (COVID-19) continua a intensificar em muitas partes do mundo, a revelação vacinal está continuando rapidamente. Certamente, as vacinas aprovadas as mais adiantadas estão sendo administradas agora às centenas de milhares de pessoas o mundo sobre.
Contudo, a ocorrência das mutações que conduzem à emergência de variações múltiplas conduziu à incerteza sobre a possibilidade de mutações do escape, que tornariam estas vacinas ineficazes.
Uma pré-impressão nova no server do bioRxiv*, parecendo em dezembro de 2020, indica que estes medos podem ser desnecessários, dado o estado actual de conhecimento sobre o vírus.
Análise da má combinação: a expansão demográfica e espacial avalia para os 37 haplotypes da proteína do PONTO SARS-CoV-2. Crédito de imagem: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.12.16.423166v1.full.pdf
O vírus atrás de COVID-19 é o coronavirus 2 da Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-CoV-2), que é sabido para negociar sua entrada na pilha de anfitrião através de sua proteína do ponto. Isto consiste em uma classe mim proteína da fusão, com a uma extremidade encaixada no envelope viral e a outro que projecta-se da superfície. Esta proteína ambos reconhece diplomatas a, e funde-os com a membrana de pilha do anfitrião para conseguir a internalização na pilha de anfitrião.
O vírus dentro da pilha continua agora replicate seu genoma e traduzir seus componentes estruturais e não-estruturais, para montar virions maduros novos. A proteína expor do ponto é um alvo pronto para as pilhas de T, que são activadas desse modo para produzir anticorpos polyclonal a diversos resumos e domínios específicos da proteína do ponto. Estes anticorpos estão neutralizando frequentemente na natureza, obstruindo o acessório do vírus ao receptor da pilha de anfitrião, a enzima deconversão 2 (ACE2).
A proteína do ponto é metastable em seu formulário do prefusion, que é compor de duas subunidades, S1 e S2. O primeiro negocia o emperramento ao receptor através de seu domínio receptor-obrigatório (RBD) e o segundo é responsável para a fusão da membrana da vírus-pilha. Isto permite que o vírus incorpore a pilha, mas este processo é dependente dos proteases da pilha de anfitrião, que devem fender as subunidades.
Alvo do ponto para antivirais e imunoterapias
O papel chave da proteína de S fez-lhe um alvo principal para imunoterapias e antivirais, assim como para vacinas em desenvolvimento.
Mais cedo, a descoberta da natureza antigénica poderoso da proteína do ponto nos SARS-CoV e MERS-CoV provocaram o uso desta proteína como um antígeno vacinal. Em estudos do rato, os anti-soros recolhidos dos ratos imunizados com a proteína de S dos SARS-CoV mais adiantados reduziram marcada a entrada do vírus nas pilhas de alvo.
Isto sugere a indução da imunidade cruz-reactiva contra os resumos da proteína do ponto, que são conservados altamente nos coronaviruses. No prazo de uma cargo-imunização de 14 dias, os anticorpos de neutralização e as pilhas de T que visam a proteína do ponto são detectáveis. Estes animais foram encontrados para ter baixas cargas virais nas vias respiratórias que seguem a exposição subseqüente ao vírus.
Quando outras terapias forem exploradas, incluindo extractos das plantas medicinais e as moléculas ou os peptides pequenos que visam esta proteína, há um uma grande distância a percorrer, falando tecnològica, antes que estes se tornem disponíveis como drogas comercialmente viáveis inteiramente testadas e aprovadas.
O estudo actual apontou explorar a diversidade molecular da proteína do ponto nas populações virais diferentes, que podem ter mudado a conformação genética e ter permitido a evasão imune. A equipe dos pesquisadores, do laboratório da genética de população e da biologia evolutiva computacional (LaBECom-UNIVISA), realizou uma análise da variação molecular (AMOVA) em 37 variações diferentes da proteína do ponto SARS-CoV-2.
Estes haplotypes referem grupos ligados de variações no genoma. Todos foram recuperados publicamente - da plataforma nacional disponível do centro de informação da biotecnologia (NCBI).
Os pesquisadores encontraram um muito de baixo nível da diversidade entre os haplotypes. O número de inserções, os supressões, as transições, e os transversions eram muito baixos. Observaram somente 17 locais polimorfos na proteína do ponto. Os deslocamentos predeterminados moleculars da diversidade mostraram uma ausência de mutações significativas para estes haplotypes, e nenhuma expansão significativa da população foi observada qualquer um.
Os pesquisadores, conseqüentemente, encontrados que os haplotypes do ponto SARS-CoV-2 são altamente similares. "Nós supor essa diversidade molecular para esta proteína, se encontrado nos estudos futuros, pode ser associado com os componentes da variação a não ser as substituições encontradas geralmente no genoma SARS-CoV-2."
Estes resultados concordam com a conservação conhecida da seqüência do ponto. Assim, dizem, a variabilidade genética relatada do vírus poupa alguns genes virais, saindo de algumas proteínas ancestrais intactos. Os métodos usados neste estudo permitiram a maneira descontínua em que os haplotypes desenvolveram variações genéticas, através de diversas fases intermediárias mutational. As estimatrizes usadas concordaram com a uniformidade dos resultados, apesar de sua sensibilidade alta para toda a variação molecular.
Estas considerações asseguram-se de que o uso de neutralizar anticorpos possa poder suprimir a proliferação do vírus, mais adicional justificando a revelação das vacinas baseadas na proteína S."
Thomas, Liji. (2020, December 21). A proteína do ponto SARS-CoV-2 permanece conservada notàvel entre 37 variações de Hong Kong. News-Medical. Retrieved on May 12, 2021 from https://www.news-medical.net/news/20201221/SARS-CoV-2-spike-protein-remains-remarkably-conserved-among-37-variants-from-Hong-Kong.aspx.
Thomas, Liji. "A proteína do ponto SARS-CoV-2 permanece conservada notàvel entre 37 variações de Hong Kong". News-Medical. 12 May 2021. <https://www.news-medical.net/news/20201221/SARS-CoV-2-spike-protein-remains-remarkably-conserved-among-37-variants-from-Hong-Kong.aspx>.
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