Ainda de acordo com os especialistas do CMBA, as dores de cabeça crônicas, como as enxaquecas, por exemplo, que, em muitas vezes, estão presentes no período da TPM, também ocorre devido a uma disfunção nos neurotransmissores. Sendo assim, através da acupuntura é possível obter resultados positivos no tratamento.
Quando uma agulha de acupuntura é inserida em um ponto específico do corpo, para exercer seu efeito, deve ultrapassar a pele, a gordura e em nível de músculo, estimular as chamadas terminações nervosas livres, que são estruturas especializadas em captar os estímulos e enviá-los ao cérebro. Quando o estímulo desencadeado pela agulha de acupuntura atinge áreas específicas do sistema nervoso central, ele desencadeia uma série de reações neuro-químicas, que terão como resposta a produção de um variado número de substâncias, de extrema importância na manutenção do equilíbrio orgânico - os neurotrasmissores: serotonina, noradrenalina, dopamina, beta endorfina, cortisol.