O Mestrado está voltado significativamente à formação do docente e do pesquisador, vinculando-se à graduação da FOUSP por meio das disciplinas pertinentes à cada área de concentração, enquanto o Doutorado busca o aprimoramento e excelência na produção científica do saber odontológico comum e específico da área de concentração com treinamento em orientações associadas a programas de iniciação científica.
Desde a implantação, há 34 anos, do primeiro Programa de Pós-Graduação na Faculdade de Odontologia da Universidade de São Paulo (FOUSP), esta unidade de ensino e pesquisa qualificou, entre mestres e doutores, cerca de 3.283 cirurgiões dentistas.