Por tratar de ciência em muitos de seus enredos e por achar que existe uma guerra entre ciência e religião, tem gente que torce o nariz para ficção científica. Além de essa guerra não existir (exceto para os sensacionalistas) a FC consegue tratar com bastante propriedade sobre religião e até fundamentalismo em seus enredos. São tantos os exemplos que tive que refinar a pesquisa para caber no post.
Um dos primeiros exemplos que lembrei foi em Babylon 5. Na primeira temporada, no episódio Believers, um casal de uma raça alienígena leva o filho doente para a estação em busca de tratamento médico. O garoto ficaria curado e se recuperaria rapidamente com uma simples cirurgia. Mas os pais, por motivos religiosos, não deixariam que seu corpo fosse aberto, com medo que seu espírito fosse danificado ou se perdesse.