Coronavírus: análise de genoma sugere combinação de dois vírus - Se Liga Chapada
23/03/2020 23/03/2020 Kleber Medrado	coronavírus, morcego, pangolim
No espaço de algumas semanas, todos aprendemos muito sobre a Covid-19 e o vírus que a causa: SARS-CoV-2. Mas também houve muitos rumores. E embora o número de artigos científicos sobre esse vírus esteja aumentando, ainda existem muitas áreas cinzentas quanto às suas origens.
© Pangolim: a parte do novo vírus que favorece sua entrada nas células humanas parece ter vindo desse animal …
Em dezembro de 2019, 27 das primeiras 41 pessoas hospitalizadas (66%) passaram por um mercado localizado no coração da cidade de Wuhan, na província de Hubei. Mas, de acordo com um estudo realizado no Hospital Wuhan, o primeiro caso humano identificado não frequentou esse mercado. Em vez disso, uma estimativa de datação molecular baseada nas sequências genômicas do SARS-CoV-2 indica uma origem em novembro. Isso levanta questões sobre o vínculo entre essa epidemia de Covid-19 e a vida selvagem.
O genoma do SARS-CoV-2 foi rapidamente sequenciado por pesquisadores chineses. É uma molécula de RNA de cerca de 30 mil bases contendo 15 genes, incluindo o gene S, que codifica uma proteína localizada na superfície do envelope viral (para comparação, nosso genoma está na forma de uma dupla hélice de DNA, com cerca de 3 bilhões de bases de tamanho, e contém cerca de 30 mil genes).
Análises genômicas comparativas mostraram que o SARS-CoV-2 pertence ao grupo dos betacoronavírus e está muito próximo do SARS-CoV, responsável por uma epidemia de pneumonia aguda que apareceu em novembro de 2002 na província chinesa de Guangdong e depois se espalhou para 29 países em 2003. Foram registrados 8.098 casos, incluindo 774 óbitos. Sabe-se que os morcegos do gênero Rhinolophus (potencialmente várias espécies de cavernas) foram o reservatório desse vírus e que um pequeno carnívoro, a civeta-de-palma-mascarada (Paguma larvata), pode ter servido como hospedeiro intermediário entre os morcegos e os primeiros casos humanos.
Desde então, muitos betacoronavírus foram descobertos, principalmente em morcegos, mas também em humanos. Por exemplo, o RaTG13, isolado de um morcego da espécie Rhinolophus affinis coletado na província chinesa de Yunan, foi recentemente descrito como muito semelhante ao SARS-CoV-2, com 96% de sequências genômicas idênticas. Esses resultados indicam que os morcegos, e em particular as espécies do gênero Rhinolophus, constituem o reservatório dos vírus SARS-CoV e SARS-CoV-2.
© Fornecido por Revista Planeta Morcego Rhinolophus affinis : reservatório do vírus RaTG13, que tem 96% de sequências genômicas idênticas às do SARS-CoV-2. Crédito: foto fornecida por Alexandre Hassanin
Mas como você define um reservatório? Um reservatório é uma ou várias espécies de animais que não são sensíveis, ou não são muito sensíveis, ao vírus, que hospedarão naturalmente um ou vários vírus. A ausência de sintomas da doença é explicada pela efetividade de seu sistema imunológico, o que lhes permite combater muita proliferação viral.
Em 7 de fevereiro de 2020, descobrimos que um vírus ainda mais próximo do SARS-CoV-2 havia sido descoberto no pangolim. Com 99% de concordância genômica relatada, ele sugeriu um reservatório mais provável do que os morcegos. No entanto, um estudo recente sob revisão mostra que o genoma do coronavírus isolado do pangolim-malaio (Manis javanica) é menos semelhante ao SARS-Cov-2, com apenas 90% de concordância genômica. Isso indicaria que o vírus isolado do pangolim não é responsável pela epidemia de Covid-19 que está ocorrendo atualmente.
No entanto, o coronavírus isolado do pangolim é semelhante a 99% em uma região específica da proteína S, que corresponde aos 74 aminoácidos envolvidos no domínio de ligação ao receptor da ECA (enzima conversora da angiotensina 2), aquele que permite a entrada do vírus nas células humanas para infectá-las. Por outro lado, o vírus RaTG13 isolado do morcego R. affinis é altamente divergente nessa região específica (apenas 77% de similaridade). Isso significa que o coronavírus isolado do pangolim é capaz de entrar nas células humanas, enquanto o isolado do morcego R. affinis não é.
Além disso, essas comparações genômicas sugerem que o vírus SARS-Cov-2 é o resultado de uma recombinação entre dois vírus diferentes, um próximo ao RaTG13 e outro mais próximo ao vírus do pangolim. Em outras palavras, é uma quimera entre dois vírus preexistentes.
Esse mecanismo de recombinação já havia sido descrito nos coronavírus, em particular para explicar a origem do SARS-CoV. É importante saber que a recombinação resulta em um novo vírus potencialmente capaz de infectar uma nova espécie hospedeira. Para que a recombinação ocorra, os dois vírus divergentes devem ter infectado o mesmo organismo simultaneamente.
Alexandre Hassanin é professor (HDR) da Universidade Sorbonne, ISYEB – Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité (CNRS, MNHN, SU, EPHE, UA), Museu Nacional de História Natural (MNHN)
** Este artigo foi republicado do site The Conversation sob uma licença Creative Commons. Leia o artigo original aqui. Fonte: MSN BRASIL – Alexandre Hassanin
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