Essa história se passa na Academy City, uma cidade ao Oeste de Tóquio tecnologicamente avançada e que é especialista em desenvolver poderes físicos, em um mundo onde a magia é real. Touma Kamijou é um estudante que possui uma magia conhecida como Imagine Breaker. Quando ele conhece uma garota chamada Index, sua vida irá mudar por completo e uma grande jornada de aventuras estará prestes a começar.