Proguanil é mais caro, de gosto amargo, e deve ser tomado todos os dias. Resistências também apareceram. Sua eficácia é maior se tomado com cloroquina.
Mefloquina é recomendado pela Organização Mundial da Saúde (OMS) como a droga de primeira escolha para a prevenção da malária em áreas onde há uma resistência de P. falciparum à cloroquina. Isso inclui grandes áreas da América do Sul, quase toda a África sub-saariana, Sul e Sudeste da Ásia e Oceania. No entanto, este medicamento não deve ser tomado em casos de mulheres grávidas, alergia a medicamentos, uma história de doença mental, epilepsia e assim por diante.
Doxiciclina é uma alternativa para mefloquina, mas não deve ser utilizado em mulheres grávidas ou crianças com menos de 12 anos, e leva a sensibilidade aumentada da pele à radiação solar. A doxiciclina é um antibiótico do grupo das tetraciclinas, e não é licenciado para a profilaxia da malária em todos os países.
Outras alternativas são, em adultos, primaquina, a combinação de atovaquone e proguanil em crianças, ou um novo produto está no mercado desde 1998 - o Malarone.
Outras medidas de prevenção autoridades sanitárias competentes, incluem a erradicação do mosquito, o estudo do sangue usado em transfusões e assim por diante.