Milagres podem alterar a substância de um objeto, modificando-o completamente. A Bíblia lista vários casos em que ocorre uma transubstanciação de um elemento da natureza em outro e casos que escapam ao controle das leis que regem a esfera do mundo natural. Em Jó 9:10 diz; 'O Senhor realiza maravilhas que não se podem perscrutar, milagres incontáveis.'