As Delegações Provinciais são dirigidas por Delegados Provinciais, nomeados pelo Ministro que superintende a área da Saúde sob proposta do Director-geral do INS.
Dirigir a Delegação provincial e coordenar as actividades, praticando os actos necessários ao seu efectivo funcionamento;
Submeter ao Director-geral do INS o plano de actividades da Delegação e respectivos relatórios periódicos de execução de actividades programadas;
Gerir os recursos humanos afectos à Delegação e promover o desenvolvimento de acções de formação e capacitação dos funcionários;
Representar o INS junto dos Governos Provinciais, assegurando a necessária articulação na implementação de políticas e estratégias no âmbito da investigação em saúde e da saúde pública;
Exarar Despachos, Circulares e Ordens de Serviço que se mostrem necessários ao pleno funcionamento da Delegação;