O jogo também oferece indicadores que podem ser ligados ou desligados com um botão para mostrar os pontos em que você está exposto ou não. Também, diferentes terrenos criam efeitos variados sobre um mesmo personagem.
Em Fire Emblem: Three Houses a relação de itens também é muito importante. Todo equipamento e mágica possuem uma quantidade específica de vezes que podem ser utilizados. Ou seja, sempre antes de ir para uma batalha, é preciso ficar de olho em quem está equipado com o quê e se o item aguenta a contenda inteira.
Para isso, antes de qualquer enfrentamento, é possível trocar todos os itens e comprar outros nas lojas, ferreiro e arsenal.
Apesar disso, a batalha de Fire Emblem não oferece exatamente o maior desafio nem é tão mais diferente e complicado se comparado a outros títulos de batalha por turno. A beleza aqui, mais uma vez, é que há uma série de diálogos e animações para cada golpe. (os quais podem ser desligados para agilizar a partida).
Um dos pontos de melhoria de vida em Fire Emblem: Three Houses é que você pode escolher se quer sofrer com mortes permanentes ou não. O jogo oferece um modo casual, no qual seus alunos não morrem.