Uma vez que o Lúpus Eritematoso Sistémico não tem causa conhecida, também não existe tratamento curativo específico, daí ser considerada uma doença crónica.
No entanto, estão disponíveis fármacos que, comprovadamente, são eficazes no controlo das manifestações clínicas dos vários órgãos e/ou da atividade inflamatória da doença. Entre eles, destacam-se os corticosteroides (cortisona) e os imunossupressores, além dos anti-palúdicos de síntese (Hidroxicloroquina) que desempenham um papel muito importante na redução da sua morbilidade e da sua mortalidade.
Por outro lado, é sabido que algumas medidas não farmacológicas são cruciais para o bom controlo da doença, nomeadamente:
Apesar da sua potencial gravidade, na maioria dos casos e desde que a situação clínica seja bem controlada e vigiada, a esperança média de vida dos doentes com Lúpus Eritematoso Sistémico poderá ser sobreponível à da população em geral.