Outra opção de tratamento é a metformina, com eficácia menor que a do citrato de clomifeno, no entanto, as pacientes que não respondem à monoterapia com o citrato de clomifeno podem se beneficiar da associação dessas duas drogas. Além disso, há evidências de que um pré-tratamento com a metformina por 3 meses pode aumentar a eficácia do tratamento com o citrato de clomifeno.
Podemos usar também Inibidores da Aromatase. A aromatase é uma enzima responsável pela conversão de andrógenos em estrógenos. Ao inibir a atividade dela, há um bloqueio dessa conversão de andrógenos em estrógenos, o que faz com que tenha um menor feedback do estrógeno no hipotálamo, aumentando o GnRH e, consequentemente, o FSH, o que estimula o desenvolvimento folicular e ovulação. Essa opção geralmente é utilizada nas pacientes resistentes ou com efeitos colaterais à terapia com o citrato de clomifeno.
O FSH recombinante também é utilizado no tratamento da infertilidade em pacientes com Síndrome dos Ovários Policísticos, principalmente nas resistentes ao citrato de clomifeno. No entanto, essa terapia acarreta um maior risco nos casos de Síndrome de Hiperestimulação Ovariana e gravidezes múltiplas.
Uma opção mais invasiva é o Drilling ovariano laparoscópico, o qual consiste em uma cirurgia de estimulação física ovariana. Não é muito utilizada por ter um resultado passageiro e os riscos de uma cirurgia. Além disso, não acarreta melhorias na resistência insulínica.
Por último, temos a opção da Fertilização in vitro (FIV). É realizada principalmente em pacientes resistentes a outras terapias ou com outros problemas reprodutivos, como algum problema anatômico nas trompas, endometriose ou parceiro infértil.
Já quando se trata de uma paciente que não tem interesse em engravidar, temos como tratamento de primeira linha o uso de anticoncepcionais orais. Tais medicamentos atuam regulando o ciclo menstrual, reduzindo o risco de carcinoma endometrial, além de acarretar uma melhora no quadro de hiperandrogenismo. Quanto à escolha do ACO a ser utilizado, dá-se preferência aos que possuem baixa dose de etinilestradiol, exceto no caso de pacientes obesas, que podem precisar de uma dose maior.
Em casos de intolerância ao ACO ou em pacientes que não precisam de contracepção, pode ser realizada a administração cíclica de progestágeno, uso de acetato de medroxiprogesterona ou metformina. Dessas três outras opções, a administração cíclica de progestágeno e o acetato de medroxiprogesterona são as únicas que possuem efeito protetor endometrial.