A análise mais minuciosa e detalhada da máquina genômica levou tempo para se consolidar. Em meados do século 17, o microscopista britânico pioneiro Robert Hooke inventou a palavra cell, ou célula, como resultado de suas observações de uma fina fatia de cortiça. Os pequenos compartimentos que viu, o fizeram lembrar-se dos apertados cômodos de monges – suas celas. Em 1710, Antonie van Leeuwenhoek detectou minúsculos compartimentos no interior de células, mas foi o botânico escocês Robert Brown, descobridor do famoso movimento browniano, que cunhou a palavra nucleus, ou núcleo, para descrever esses compartimentos no início da década de 1830. Meio século depois, em 1888, o anatomista alemão Heinrich Wilhelm Gottfried von Waldeyer-Hartz olhou por seu microscópio e decidiu usar a palavra cromossomo, que quer dizer “corpo colorido”, para os diminutos filamentos de corantes que ele e outros podiam ver dentro de núcleos com auxílio dos melhores microscópios da época.
Durante o século 20, biólogos descobriram que o DNA em cromossomos, e não os seus componentes proteicos, são a encarnação molecular de informação genética. A soma total do DNA contido nos 23 pares de cromossomos é o Genoma. Mas, como esses cromossomos se combinavam, continuou sendo em grande parte um mistério.
Arqueólogos genômicos como Dekker inventaram e aplicaram técnicas de “escavação molecular” para descobrir a arquitetura do genoma, na esperança de finalmente discernirem como toda essa estrutura ajuda a orquestrar a vida na Terra. Ao longo da última década mais ou menos, eles têm exposto uma “hierarquia aninhada” de motivos estruturais em genomas que são tão elementares para a identidade e atividade de cada célula como a própria dupla hélice. O objetivo do Projeto Genoma Humano (PGH) era descobrir como essas substâncias químicas estão organizadas na longa fita retorcida do DNA. Então, no início da década de 90, Katherine Cullen e uma equipe da Vanderbilt University (?) desenvolveram um método para fundir artificialmente pedaços de DNA que estão próximos no núcleo. Essa façanha permitiu analisar a estrutura ultra-dobrada (comprimida) do DNA ao simplesmente ler sua sequência.
Essa abordagem foi sendo aprimorada ao longo dos anos e, uma de suas interações mais recentes, chamada Hi-C, possibilita mapear a dobradura de genomas inteiros.