O Instituto Bacuri desenvolve projetos nos quais atua diretamente na gestão e financiamento das ações, sejam elas criadas pelo Bacuri, sejam concebidas em parceria com outras instituiçoes e/ou junto a instâncias governamentais. Estes projetos próprios estão agrupados em dois grandes programas:
Arte de Educar: projetos e ações educacionais onde a arte ocupa lugar de destaque - espetáculos teatrais interativos e oficinas de formação para professores da rede pública de ensino.
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Espetáculo Circo Lambreta;
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Brincando com Histórias - oficinas para professores da rede pública de ensino.
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Ubatuba Sustentável: projetos e ações de caráter cultural, esportivo e socioambiental desenvolvidas em comunidades da parcela norte do município de Ubatuba - SP.​​