A síndrome de abstinência de álcool cursa com insônia e a alteração de sono costuma ser mais severa nos primeiros dias (sono curto, leve, fragmentado e alterações consistentes no sono REM) e, caso a abstinência seja severa (delirium tremens), pode persistir por tempo mais prolongado. Após meses de abstinência, pode perdurar a queixa de insônia, acompanhada de alterações na polissonografia, mas é necessário excluir que tal sintoma seja decorrente da presença de transtornos afetivos e ansiosos.
A insônia também pode acompanhar a abstinência de drogas sedativo-hipnóticas, como os benzodiazepínicos. Ocorre na descontinuação abrupta, especialmente de benzodiazepínicos de meia-vida curta. A interrupção de tais medicações também pode precipitar a recorrência dos sintomas (p. ex., a própria insônia) que geraram a sua própria demanda.
Os estimulantes incluem drogas como cocaína, anfetaminas, derivados anfetaminérgicos, efedrina e cafeína. A insônia é componente do efeito destas substâncias e tipicamente ocorre a diminuição do tempo total de sono e do sono REM, além do prolongamento da latência dos mesmos. É importante a investigação e a estimativa do consumo de cafeína e nicotina dos pacientes com queixa de insônia.
Os pacientes com síndromes demenciais, como a doença de Alzheimer, podem apresentar insônia, fragmentação do sono e sono de má qualidade (redução da eficiência do sono). As doenças degenerativas do SNC podem cursar com despertares frequentes e alteração da arquitetura do sono, assim como as cefaléias crônicas.
Alterações de sono geralmente acompanham as endocrinopatias, especialmente as alterações de função tireoidiana (mais frequentemente o hipertireoidismo). Entretanto outras patologias, como a síndrome de Cushing (hipercortisolemia), a doença de Addison (insuficiência adrenocortical) e diabetes mellitus também foram associadas à insônia.
A fibromialgia e a síndrome da fadiga crônica são condições nas quais as queixas de insônia e sono não-restaurador são comuns, muitas vezes em associação com quadros depressivos e ansiosos.
Das alterações de sono podem decorrer patologias cardíacas, como angina pectoris, arritmias cardíacas ou insuficiência cardíaca congestiva (devido a sintomas respiratórios como dispnéia, ortopnéia e dispnéia paroxística noturna).