A surdez congênita pode ser um problema em alguns Border Collies, e mais criadores estão começando a testar os reprodutores e a audição das ninhadas (BAER).
Esta é uma condição muito séria, embora bastante incomum, que afeta alguns Border Collies. Os sintomas típicos incluem cambalear após um breve período (5 ou 10 minutos) de exercício. Se deixados para correr, eles entrariam em colapso. As temperaturas corporais sobem extremamente altas e demoram muito para voltar ao normal, mesmo em climas frios. Qualquer exercício ou estresse pode desencadear um ataque. Se a temperatura subir o suficiente, pode causar convulsões, derrames ou até a morte. Cães com esta condição devem ter seu exercício cuidadosamente controlado e monitorado.
Por causa de sua baixa gordura corporal, alguns Border Collies podem ser sensíveis aos anestésicos à base de barbitúricos. Isso é algo que você deve discutir com seu veterinário antes de qualquer tipo de cirurgia ou procedimento para o qual seu cão será anestesiado.