A loucura da Wanda, a raiva de Hulk, e tantos outros problemas causados por heróis fora de controle levam o governo propor um ato de registro de heróis. A coisa começa a ficar séria mesmo depois de um acidente que mata mais de 600 pessoas por causa de inexperiência. Nesse momento em que o mundo se divide: de um lado os pró-registro (encabeçados pelo Homem de Ferro) e do outro, os anti-registro (com Capitão América no comando). Agora o negócio é herói contra herói. Inclusive, o senhor Homem de Ferro emprega vilões na sua busca cega pela vitória. Nessa saga que Tony Stark comete três grandes erros que irão lhe perseguir por muito tempo em seus pesadelos: para se livrar do Hulk, ele o manda para outro planeta; coloca Norman Osborn do lado do bem; e mata um grande amigo dele indiretamente.