Raramente, a shigelose se inicia de forma repentina, com fezes em água de arroz ou fezes sorosas (ocasionalmente sanguinolentas). O paciente pode ter vômitos e rapidamente logo fica desidratado. A infecção pode se apresentar com delirium, convulsões e coma, mas com pouca ou nenhuma diarreia. Morte pode ocorrer em 12 a 24 h.
Em crianças pequenas, o início é súbito, com febre, irritabilidade ou sonolência, anorexia, náuseas ou vômitos, diarreia, dor abdominal, distensão e tenesmo. Dentro de 3 dias, sangue, pus e muco aparecem nas fezes. A frequência das fezes pode aumentar ≥ 20/dia e a perda ponderal e a desidratação tornam-se graves. Sem tratamento, uma criança pode morrer nos primeiros 12 dias. Se a criança sobreviver, os sintomas agudos diminuem por volta da 2ª semana.
A síndrome hemolítico-urêmica pode complicar a shigelose em crianças, devido ao S. dysenteriae tipo 1.
Infecções bacterianas secundárias podem ocorrer, em especial em pacientes debilitados e desidratados.
Pacientes (especialmente aqueles com o genótipo HLA-B27) podem desenvolver artrite reativa (artrite, conjuntivite, uretrite) após shigelose (e outras enterites).
Outras complicações não são comuns, mas incluem convulsões em crianças, miocardite e, raramente, perfuração intestinal.