Ao todo fora 441 edições publicadas, como o herói não fez parte da reformulação da editora chamada "Heroes Reborn" onde a Marvel reiniciou algumas numerações, esta primeira fase do personagem pôde continuar sua numeração original até novembro de 1998, onde finalmente seria interrompida e introduzida a segunda série de Amazing Spider-Man com a numeração reiniciada.
Esta segunda fase do personagem, iniciada em janeiro de 1999 teve 58 edições publicadas, na edição seguinte o Homem-Aranha completaria 40 anos de existência e para comemorar a Marvel resolveu alterar a numeração para a edição #500, que seria caso não houvesse a interrupção da primeira série, e assim ficou até a edição #700, publicada em fevereiro de 2013.
Esta série de anuais são histórias complementares às edições regulares, porém em algumas delas tem ligações diretas com grandes eventos da editora Marvel. É importante lembrar que entre os anos 1996 até 2001 a editora quebrou a sequencia de numerações e colocou somente o ano de publicação nas capas, porém as numerações originais retornaram em 2008 com a edição #35 e assim seguiu até a edição #39 desta fase de anuais.