A partir daí, Casane e Laurenti, criticam várias ideias que ainda assombram o jargão da biologia evolutiva e da sistemática moderna, como as encarnadas nas expressões ‘linhagem basal’ ou “ramificação precoce”, pois elas passam a falsa ideia que certas linhagens ficaram para traz no tempo, tendo perdido a ‘corrida de diversificação’ do resto da linhagem, quando na verdade isso é apenas um artefato causado por uma interpretação ingênua das árvores filogenéticas tendo como base a ideia implícita de uma escala naturae [3], mas este é um tema para outro post.
Porém, mesmo sem considerar as objeções de Casane e Laurenti [3], algumas partes do genoma da Latmeria não mostram quaisquer sinais (mesmo ambíguos) de estarem evoluindo de maneira tão lenta, o que é mostrado e discutido pelos próprios autores do artigo da Nature sobre os resultados do sequenciamento do genoma deste animal. No artigo a equipe de cientistas relata que o celacanto exibe um grande número de elementos transponíveis – que são sequencias não envolvidas da codificação de proteínas diretamente ligadas a sobrevivência e reprodução do organismo – mas que são capazes de se moverem e expandirem-se ao longo do genoma a um ritmo relativamente rápido. Estas sequências, muitas delas truncadas e não funcionais, podem, entretanto, influenciar na evolução genômica e organísmica, ao interferirem com genes funcionais ou mesmo ao serem recrutadas como novos genes e elementos de regulação [2]. Porém, como explica Amemiya, por enquanto, o papel do destas sequencias na evolução e especiação ainda não é claro [4].
Os pesquisadores puderam verificar que o genoma do celacanto contém uma ampla gama de elementos transponíveis de várias superfamílias, com conteúdo relativamente alto destes elementos, pelo menos 25%. Ao analisarem os dados de RNA-seq e sobre a divergência entre as cópias dos elementos transponíveis individuais em relação as sequências consenso, os cientistas perceberam que 14 superfamílias de elementos transponíveis, nos celacanto, estão atualmente ativos. Estes resultados indicam que o genoma dos celacantos atuais mostra-se bem parecido com outros genomas de organismos modernos, tanto em abundância como em relação a atividade de elementos transponíveis, o que contrasta com a evolução dos genes codificadores de proteína que tem acontecido de maneira mais lenta [2].
De acordo com os cientistas, não foi fácil sequenciar o genoma do Celacanto por vários motivos [2]. Estes animais são uma espécie ameaçada e isso torna amostras são bastante difíceis de serem obtidas.por tanto, cada amostra obtida era extremamente preciosa, o que fez com que os pesquisadores tivessem uma única oportunidade para sequenciar o pouco material disponível, mas foram também estas e outras dificuldades que mantiveram unidos o time de cientistas.