Todos os pesticidas utilizados por ambos os métodos agrícolas deviam ser sujeitos a controlo anual. No entanto, esse controlo é muito mais apertado nesse aspeto, na agricultura convencional.
Neste sentido, as alegações de que os alimentos orgânicos são mais seguros do ponto de vista alimentar do que os alimentos convencionais , ainda não foram apoiadas por evidência científica definitiva.
Outro dos factos que surge quando se fala de alimentos biológicos, é que estes são mais saudáveis do que os convencionais, visto que como se desenvolvem de forma mais natural, as suas propriedades nutricionais ficam potenciadas.
No entanto, já vários estudos foram feitos para comprovar esta questão e os resultados foram praticamente os mesmos: pode haver algumas diferenças nutricionais entre os alimentos biológicos e convencionais, em particular a nível do teor de antioxidantes, mas essas diferenças não parecem ser significativas nem ter impacto relevante na saúde.