O chefe no primeiro ato chama-se Tunnelbot (Gakin no Japão). Basta esperar que quando ele virar pra furar o chão para acertar ele. Ou então, acerte o FDP por baixo dele.
Sabe o "carro-furadeira" na Emerald Hill do Sonic 2? Pois é, irá ser a mesma coisa, porém, você estará voando com Tails para acertar o Dr. Pança. Com o ManoKnux, a Egg Robô aparece para certar o Knux com umas bolas espinhentas. Com tudo, ManoKnux não enfrenta a mesma fase que Tails e Sonic. Passando isso você irá para Carnival Night, fase inesquecível pelas latas de cores de canudos (vulgo caramelo).