Durante 1963, o PCP toma cada vez mais posições francamente anti-chinesas: Francisco Miguel e Álvaro Cunhal participam em vários congressos de partidos comunistas como delegados do PCP e fazem intervenções contra a China. Cunhal, no Congresso do PC Checoslovaco, condenou firmemente a posição aventureira dos dirigentes albaneses, assim como apoio e encorajamento que eles estão recebendo dos camaradas chineses e afirmou o apoio sem restrições  do PCP ao Partido Comunista da União Soviética (PCUS). Entre os textos traduzidos e difundidos pelo PCP em 1963 conta-se o relatório de Krutchev ao Soviete Supremo em 12 de Dezembro de 1962, A Situação Internacional Actual e a Política Externa da União Soviética, que incluía um duro ataque à China por causa de Macau.
Uma conclusão é para mim, forçosa. É que com este documento do CC se enfileira o nosso Partido nas posições dum grupo de partidos excluindo assim outros partidos irmãos que têm pontos de vista diferentes, favorecendo-se uma cisão no movimento comunista internacional
Entretanto, começava a haver uma crescente irritação com as posições de Martins Rodrigues na Comissão Executiva (CE).
Castanheira conta como este começa a levantar problemas, com ideias sobre a Revolução chinesa, sobre a necessidade da luta armada, etc. Como a discussão interna na CE não chegava a conclusões nenhumas (…) eles queixavam-se: “Temos tantos assuntos para resolver e estamos a perder tempo com estes debates”. Martins Rodrigues é acusado de ao mesmo tempo que manifestava incompreensões políticas sérias e divergências acerca da orientação do Partido, começar a cumprir deficientemente as suas tarefas e a criar tais dificuldades que a CE propõe ao CC a sua saída do organismo. A CE lembra, em Julho de 1963, aos militantes que mesmo não tendo ainda a carta soviética de resposta à carta dos 25 pontos a porá em discussão imediatamente, mas recorda que o nosso partido já tomou posição pública nestas divergências pelo menos duas vezes, no documento de 1960, sobre os Três problemas da actualidade e na declaração do CC de Janeiro de 1963, pelo que é essa posição do PCP que deve ser estudada e nenhuma outra.
Esta situação de conflito interno somou-se a uma série de desastres conspirativos e à primeira grande traição do período pós-desvio de direita, a traição de Rolando Verdial membro do CC. Tudo isto levou à convocação de uma reunião do CC para Agosto de 1963 em Moscovo, a primeira que se realizava fora do território nacional na história do PCP. Estavam presentes Cunhal, Francisco Miguel, F.M.Rodrigues, Vilarigues, Joaquim Gomes do CC, e Pedro Ramos de Almeida e Veiga de Oliveira, que não eram do CC, assistem.
Francisco Martins Rodrigues é confrontado na reunião com um informe de Cunhal A Situação no Movimento Comunista Internacional, cujo objectivo é por termo de vez à discussão com uma posição clara e sem ambiguidades sobre o conflito sino-soviético. O documento abre num tom pessimista: a situação no movimento comunista internacional tem evoluído duma forma desfavorável. A unidade é precária e existe o real perigo duma cisão. O culpado é o Partido Comunista Chinês (PCC) que está em desacordo com a linha geral do movimento comunista internacional (..) combate violentamente esta linha, não a segue na sua acção prática e leva a cabo uma actividade cisionista. Neste contexto, diz Cunhal, o PCP teve uma posição consequente comprovada pela posição nas reuniões internacionais e pelos documentos publicados pelo PCP.
Seguem-se uma série de elogios à coexistência pacífica que abre o caminho mais curto e menos custoso para o triunfo do comunismo à escala mundial e a acusação ao PCC de combater este conceito com aspectos mais chocantes como seja contestar os acordos para a suspensão das experiências nucleares. Cunhal afirma que a coexistência pacífica é altamente vantajosa à luta de libertação nacional, o que os dirigentes do PCC não entendem. Pretendem, diz Cunhal, isolar o movimento nacional libertador do campo socialista e do movimento operário internacional, acusando a URSS e os seus aliados de abandonarem, desprezarem e pretenderem conter a sua luta, de não quererem lutar contra o imperialismo, de sacrificarem as revoluções libertadoras ao medo da guerra; de pretenderem com a luta pelo desarmamento desarmar os povos que lutam pela sua independência.