Já na área de transporte, entre as inovações prometidas por Covas, está a ideia de criar um sistema de transporte público por barcos nas represas da cidade, que seja integrado ao bilhete único.
Covas promete apenas um corredor de ônibus, um BRT (Bus Rapid Transit, mais eficiente e também mais caro que corredores comuns), na avenida Aricanduva (zona leste), integrando as linhas 15-prata e 3-vermelha do Metrô e o BRT metropolitano ABD.
Boulos, por sua vez, diz apenas que pretende ampliar os corredores de ônibus, sem definir um número. Além disso, promete também tarifa zero para desempregados e estudantes.
As promessas do candidato do PSOL geralmente são criticadas por falta de fontes de recursos nos cofres municipais. Entre as propostas dele está a criação de um fundo para financiar o sistema de ônibus.
Para Rafael Calabria, do Idec (Instituto Brasileiro de Defesa do Consumidor), o ponto fraco dos planos dos dois candidatos é a segurança no trânsito.