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O Comitê de Ética em Pesquisa (CEP) é um colegiado multidisciplinar, de caráter consultivo, deliberativo e educativo, que tem como finalidade ajudar a garantir o cumprimento das determinações éticas decorrentes dos princípios e valores que orientam a Unisinos. O conselho controla, em pesquisas que envolvem seres humanos, o cumprimento das exigências éticas e científicas fundamentais à defesa dos interesses, da integridade e da dignidade dos participantes pesquisados. Também contribui para o desenvolvimento da pesquisa orientada por padrões éticos.
O Comitê Técnico-Científico é um organismo de apoio científico e acadêmico da Unidade de Pesquisa e Pós-Graduação, e também um colegiado consultivo que tem como funções o assessoramento e a assistência técnico-científica, à Diretoria da Unidade, na avaliação de planos e projetos de pesquisa.
A Comissão de Ética no Uso de Animais da Unisinos (CEUA – Unisinos) estabelece as regras e parâmetros éticos para a utilização de animais nas atividades de ensino e pesquisa científica e tecnológica dentro da universidade. A trabalha na avaliação dos projetos, protocolos de pesquisa e planos de aula nos quais são utilizados animais vertebrados, e também acompanha os projetos aprovados e avalia a relevância didática e científica dos estudos.