A Academia Paulista de Contabilidade contará com 5 (cinco) departamentos que serão compostos por 5 (cinco) membros escolhidos entre os Acadêmicos, tendo um coordenador e um relator escolhidos entre seus pares. São eles:
1) Departamento de Estudo da Doutrina que terá a finalidade de estudar as Teorias Contábeis, produzindo comunicações escritas sobre as conclusões desses estudos.
2) Departamento de Educação que terá a finalidade de analisar os currículos e conteúdos ensinados nas Instituições de Ensino de Ciências Contábeis e propor modificações objetivando o aprimoramento da qualidade de Ensino.
3) Departamento de Publicações que terá a finalidade de editar publicações técnicas produzidas pelos Acadêmicos e/ou Trabalhos Científicos de interesse da Academia sobre Ciências Contábeis.
4) Departamento de Intercâmbio Cultural que terá a finalidade de promover intercâmbios com as Academias, congêneres, Instituições, Associações de Classe através de Eventos e Seminários para valorizar os Profissionais das Ciências Contábeis.
5) Departamento de Consultoria Técnica e Científica que terá a finalidade de estudar e analisar os questionamentos sobre temas ligados às Ciências Contábeis e propor as soluções técnicas a fim de solucionar dúvidas a ele dirigidas.
- Compete aos departamentos elaborar reuniões onde serão discutidos temas de sua área de atuação e propor sugestões para a diretoria com intuito de contribuir com o Plano de Trabalho da Academia.