A cidade de Muaná foi elevada a essa categoria pela Lei nº 324, de 6 de julho de 1895 e inaugurada a 7 de setembro seguinte.
O seu território foi acrescido da zona do Município de São Sebastião da Boa Vista, que havia sido extinto pela Lei nº 16, de 3 de novembro de 1922. Os Decretos nº 6, de 3 de novembro de 1930 e nº 72, do mês seguinte, mantivera Muaná, permanecendo constituído somente pelo distrito-sede.
A divisão territorial do Estado, fixada pelo Decreto -Lei nº 3.131, de 31 de outubro de 1938, para vigorar no período de 1939-43, extinguiu do Município os Distritos de Atatá e Santa Bárbara e suas zonas foram anexadas ao distrito-sede que, por sua vez, perdeu a zona de Pracuúba transferida para o Distrito de São Sebastião da Boa Vista.
Em cumprimento ao Decreto-Lei nº 4.505, de 30 de dezembro de 1945, perdeu com a criação do Município de São Sebastião da Boa Vista, o distrito desse nome, ficando incorporada a Muaná a zona de Pracuúba.
Apresenta-se na divisão, fixada para vigorar no período de 1944-48, constituído apenas pelo distrito-sede.