O Bramaputra é também uma fronteira biogeográfica para muitas espécies. Assim, o macaco Trachypithecus geei, o coelho do Assam (Caprolagus hispidus), e o javali-anão (Sus salvanius) estão confinados ao norte do rio, enquanto que o gibão Hylobates hoolock e o macaco-de-rabo-curto (Macaca arctoides) estão confinados no sul.