NEQUIMED/IQSC/USP – Grupo de Química Medicinal – NEQUIMED/IQSC/USP, Grupo de Química Medicinal, IQSC-USP, blog em química medicinal
NEQUIMED/IQSC/USP, Grupo de Química Medicinal, IQSC-USP, blog em química medicinal
Por que o Nequimed?
Estudos de (Q)SAR/(Q)SPR/(Q)STR
Linhas de Pesquisa & técnicas empregadas
EMU/FAPESP – Citômetro de fluxo
SQM0485
slc0673-slc0674
Análise Exploratória de Dados em Química
Bio & Quiminformática. Proteínas.
Verbetes em Planejamento Molecular
QM/MM em ação
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O Professor Jerônimo Lameira Silva está disposto a co-orientar discentes em parceria com Professor Carlos Alberto Montanari no Instituto de Química de São Carlos. O Prof. Jerônimo Lameira desenvolve pesquisa nos seguintes temas: Simulação computacional de catálise e inibição enzimática, modelagem de proteínas, métodos hibridos QM/MM e dinâmica molecular. O professor Lameira ficará como Pesquisador visitante de Janeiro de 2019 a Janeiro de 2020 no Laboratório do Professor Montanari, onde irá desenvolver o estudo computacional de inibidores da enzima cruzaína. Mais informações sobre o trabalho do professor Lameira pode ser encontrado no endereço: http://lattes.cnpq.br/7711489635465954
Publicado por nequimed às 10:42
Novos agentes tripanossomicidas identificados
O NEQUIMED/IQSC/USP, em parceria com grupos especializados em parasitologia do Trypanosoma cruzi, o agente causador da doença de Chagas, identifica novos candidatos a fármacos para o tratamento dessa doença. Uma das etapas fundamentais da gênese planejada de fármacos, nessa fase do processo, é o escalonamento da síntese para a produção dos produtos desejados em escala de gramas. Os ensaios in vivo são agora essenciais para a avaliação da potência e toxicologia, com consequente determinação da dosagem. Os químicos sintéticos desejosos em contribuir para a química medicinal sintética com escalonamento e melhora dos rendimentos das reações são bem-vindos a juntar-se ao nosso grupo. Os interessados devem enviar mensagem através de nossos contatos.
Publicado por nequimed às 10:55
Descoberta sim. Recompensa talvez!
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"O treinamento recebido no grupo não é previsível nem quantificável; da mesma forma, não se pretende produzir um produto que, por exemplo, a indústria deseja. Desde que nada original é intencionalmente descoberto por cientistas que não toleram um alto grau de incerteza (na verdade, deveriam aceitá-la), o grupo per se não garante resultados. Por causa da natureza de nossa pesquisa, no entanto, os membros do grupo se pré-selecionam e possuem um alto grau de independência de pensamento, bem como motivos científicos voltados para a descoberta, não para a recompensa. Barry Sharpless.
"The training received in the group is neither predictable nor quantifiable; likewise, it is not intended to produce a product that, for example, industry wants. Since nothing original is intentionally discovered by scientists who cannot tolerate (indeed, they should welcome it) a high degree of uncertainty, group membership does not guarantee results. Because of the nature of our research, however, group members preselect themselves and possess a remarkably high degree of independence of thought as well as scientific motives tilted toward discovery, not reward." Barry Sharpless.
Publicado por nequimed às 06:46
NEQUIMED/IQSC/USP na mídia
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Três novas substâncias desenvolvidas no Instituto de Química de São Carlos (IQSC) da USP apresentaram ótimos resultados na missão de combate à doença de Chagas.
Publicado por Rádio UFSCar 95,3 FM em Sexta, 14 de setembro de 2018
Publicado por nequimed às 10:31
CalCon2018. Prof. Michael Gilson Talk
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O Prof. Michael Gilson, UCSD, gentilmente ofereceu sua apresentação e gravação sobre sua apresentação recente durante a CalCon2018.
"In case you or your students are interested in my lecture from CalCon, I recorded the audio and posted it here while the slides are here."
Publicado por nequimed às 15:46
Sobre o NEQUIMED/IQSC/USP
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Veja aqui porque você deveria trabalhar no NEQUIMED/IQSC/USP.
Publicado por nequimed às 13:56
Planejamento Molecular e o Engajamento do Alvo
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O engajamento do alvo em programas de descoberta de fármacos (veja aqui) encompassa a correta descrição e identificação do alvo biomacromolecular tanto em experimentos in vitro (ensaios baseados em células) como in vivo. Seu correto entendimento melhora a capacidade da química medicinal em planejar novos agentes químicos com ação biológica sobre o alvo desejado. Não falo essencialmente sobre o alvo biomacromolecular isolado. Ou seja, a definição do estado de doença com base em um alvo que é produzido de forma recombinante usando um hospedeiro. Esse, muitas vezes, é passível de modulação in vitro em ensaios bioquímicos ou biofísicos. A correta transferência da inibição do alvo in vitro para a ação do agente químico em experimentos baseados em célula (in vitro) ou em animais (in vivo) é essencial para a sua validação como alvo. Além disso, é fundamentalmente necessário que seja descrita a relação estrutura-atividade (SAR) pertinente, sob a pena de fracassar em experimentos ulteriores. Facilitar o engajamento do alvo biomacromolecular, resulta em seletividade com melhor avaliação da fase farmacodinâmica do processo. Evita efeitos off-target e ajuda na validação do alvo. A gênese planejada de fármacos é longa e complexa. Os ensaios in vivo em modelos animais adequados é importante para a transição das fases pré-clínicas para as fases clínicas. A correta indentificação e seleção de animais-modelo é pivotal nesse processo. Naturalmente, o engajamento do alvo deve ser efetivamente avaliado nesse estágio considerando-se, principalmente, que muitos candidatos a fármacos que são descontinuados das fases clínicas o são também por falta de aderência ao alvo previamente imaginado como essencial para a atividade farmacológica de interesse. O pipeline de identificação de pequenas substâncias químicas bioativas deve ser adequado e eficientemente estabelecido em projetos de descoberta e desenvolvimento de novos candidatos a fármacos. Por exemplo, a AstraZeneca identificou recentemente cinco determinantes técnicos que são críticos para o sucesso do projeto (amoedado aqui como os 'cinco C's'): o alvo certo, o paciente certo, o tecido certo, a segurança certa e o potencial comercial correto.
Publicado por nequimed às 12:30
Sobre os números do jogo
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Se analisarmos a lista de descobertas e invenções de fármacos, são os países pioneiros na síntese química (por exemplo, EUA, Reino Unido e Alemanha) que foram os locais de nascimento da indústria de hoje.
Só que não basta fazer a síntese indiscriminada de novas substâncias químicas para encontrar novos fármacos. Por exemplo, quando do advento da química combinatória uma miríade de substâncias químicas poderia (e pode) ser sintetizada. Entretanto, na grande maioria das vezes, sem as características fármaco-similares necessárias. A verdadeira diversidade química foi perdida enquanto os químicos estavam presos a modelos e reações familiares. O principal motivo disso é a falta de propriedades ajustadas ao espaço químico desejado como, por exemplo, massa molecular (MM), lipofilia (como logP) e área polar de superfície (PSA). Um problema extra refere-se à busca por substâncias isentas de centros estereogênicos que, se negligenciados, podem perfeitamente perder a astúcia natural do mundo L. É claro, há exceções reconhecidas.
Considerando que o espaço químico pode ser o universo (veja aqui), é melhor pensarmos apropriadamente como construí-lo usando, por exemplo, a nossa estratégia em planejamento molecular baseado em hipóteses (veja aqui e aqui). Em nossas hipóteses, entretanto, aparecem algumas sínteses dificeis de fazer. Talvez, entretanto, seja por isso que estejamos decolando para um espaço de acertos. A escadaria para o sucesso é inclinada e exige um ciclo eficiente de planeja-sintetiza-testa-analisa-planeja! Repete o ciclo. Então, os inibidores subnanomolar de cisteíno proteases aparecem e alguns deles matam o Trypanosoma cruzi.