A fórmula estrutural de uma substância é, portanto, a forma como átomos se ligam entre si como quando eles se ligam em formato de cristal (sal, diamante, etc...) ou quando eles têm ligação dupla ( O=O ), ou ainda uma ligação simples ( O-O )
Apresenta linhas, nos quais os carbonos e os hidrogênios ligados a eles ficam subentendidos. Cada extremidade da linha é um carbono com seus hidrogênios, se houver. Os heteroátomos são representados, assim como grupos funcionais, quando necessários.