No que se refere à contratualização, o TCU encontrou muitos ajustes firmados entre HU e gestores locais que não estão adequadamente dimensionados, não são devidamente acompanhados e não são atualizados periodicamente.
Apontaram os auditores, ainda, os reflexos para os HU da desorganização da rede de atenção básica e da política de referência e contra-referência dos municípios e estados, denotando a importância de que sejam adotadas ações para incrementar a resolutividade da rede SUS, e, assim, permitir a devida inserção dos HU e o devido aproveitamento de sua capacidade.