O conhecimento científico atual não permite que o uso preventivo de probióticos seja sistematicamente generalizado. Contudo, em certos casos é possível recomendar a administração de probióticos específicos como medida preventiva (diarreia associada a antibióticos, diarreia do viajante, cistite recorrente, rinite alérgica, etc.).
Disbiose é o reflexo de um desequilíbrio na microbiota, devido a alterações quantitativas e qualitativas na composição da flora bacteriana. Está associada a consequências negativas para o hospedeiro, que podem estar na origem do desenvolvimento de determinadas doenças.