Após esse sinal de abertura a passagem a fundação, vários elementos da comunidade académica de Coimbra mostraram-se contra essa possibilidade e, em dezembro de 2016, aquando da eleição dos membros do Conselho Geral (órgão que pode aprovar ou não essa passagem), as listas mais votadas dos professores, estudantes e do pessoal não docente assumiam-se contra a fundação.