DNA有哪些主要类别？
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脱氧核糖核酸(DNA)结构由众所周知的双螺旋支配，由沃森-克里克(Watson-Crick)碱基对C与G和A与T形成。这被称为B型DNA，并且绝大多数是最有利和最常见的DNA状态; 其高度特异性和稳定的碱基对是可靠的遗传信息存储的基础。DNA有时可以作为单链（通常需要通过单链结合蛋白稳定）或作为A-DNA型或Z-DNA型螺旋来发生，偶尔也会出现在更复杂的3D结构中，例如DNA复制期间霍利迪交叉(Holliday junctions)连接处的交叉。
生物分子
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C-DNA又稱C型DNA，是一種DNA雙螺旋型態，目前已知C-DNA與B-DNA（自然界最常見的DNA型態）有相似的構象。會出現於含鋰離子，且溼度較低的狀態下。研究顯示，B與C兩型的DNA實際上都含有兩種稍有不同的構型，分別稱為B-I與B-II，其中B-DNA的B-II含量約佔10%；C-DNA的B-II則大約佔了40%以上。
C-DNA
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双螺旋是生物DNA的主要三级结构，也是RNA的可能结构。据信在自然界中发现了三种DNA构象，即A-DNA，B-DNA，和Z-DNA。 詹姆斯·杜威·沃森(James D. Watson)和弗朗西斯·克里克(Francis Crick)描述的“B”形式被认为在细胞中占主导地位。詹姆斯·D·沃森和弗朗西斯·克里克将这种结构描述为半径为10Å且间距为34Å的双螺旋，每隔10 bp序列绕其轴旋转一圈。双螺旋在溶液中每10.4-10.5碱基对围绕其轴旋转一圈。这种扭曲频率（称为螺旋节距）很大程度上取决于每个基座对链中的邻居施加的堆叠力。双螺旋RNA采用类似于A型结构的构象。
核酸三级结构
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DNA结合区域的分类 最细化的转录因子分类方式，通过其主要的与DNA结合区域来划分。这里以Superclass・Class・Family三个等级来进行表记，某些情况下提供Subfamily作为更加细化的分类。 1 基础域 1.1 碱性亮氨酸拉链 1.1.1 AP-1类似组件（例如c-Fos、c-Jun） 1.1.2 CREB 1.1.3 CCAAT增强子结合蛋白（C/EBP）类似因子 1.1.4 bZIP/PAR 1.1.5植物G-box结合因子 1.1.6 单纯ZIP 1.2 上游碱性基团的螺旋-环-螺旋结构 1.2.1 普适因子（class A） 1.2.2 生肌转录因子（MyoD） 1.2.3 Achaete-Scute 1.2.4 Tal/Twist/Atonal/Hen 1.3 螺旋-环-螺旋-亮氨酸拉链（bHLH-ZIP） 1.3.1 普适bHLH-ZIP因子（例如USF、SREBP） 1.3.2 细胞周期调节因子（例如c-Myc） 1.4 NF-1 1.4.1 NF-1（NFIC） 1.5 RF-X 1.5.1 RF-X（NFX） 1.6 bHSH 2 锌配位DNA結合域 2.1 Cys4（核内受体型） 2.1.1类固醇激素受体 2.1.2甲状腺激素受体类似因子 2.2 diverse Cys4 zinc fingers 2.2.1 GATA因子 2.3 Cys2His2锌指域 2.3.1 普适因子（例如TFIIIA、Sp1） 2.3.2有NF-6B类似结合能力的大型因子 2.4 Cys6 cysteine-zinc cluster 2.5 交互配置型锌指 3 螺旋-转角-螺旋 3.1 同源box 3.1.1 单纯同源box（Ubx） 3.1.2 POU因子（例如Oct） 3.1.3 具有LIM区域的同源域 3.1.4具有锌指的同源域 3.2 Paired box 3.2.1具有同源域的Paired box 3.2.2 单纯Paired box 3.3 Fork head/Winged helix 3.3.1 発生調節因子（例如forkhead） 3.3.2 组织特异性调节因子 3.3.3 细胞周期调节因子 3.3.0 其他调节因子 3.4 热休克因子（HSF） 3.4.1 HSF 3.5 色氨酸集群 3.5.1 Myb 3.5.2 Ets类 3.5.3干扰素调节因子 3.6 TEA域 3.6.1 TEA 4 β-Scaffold因子（伴有Minor Groove Contact） 4.1 RHR（Rel homology region） 4.1.1 Rel/ankyrin、NF-kB 4.1.2 ankyrinのみ 4.1.3 NF-AT 4.2 STAT 4.2.1 STAT 4.3 p53 4.3.1 p53 4.4 MADS-box 4.4.1 分化调节因子（例如Mef2） 4.4.2 細胞外シグナル応答因子（SRF） 4.5 β-Barrel α-helix 4.6 TATA结合蛋白（TBP） 4.6.1 TBP 4.7.1 SOX、SRY 4.7.2 TCF-1 4.7.3 HMG2关联因子、SSRP1 4.7.5 MATA 4.8 Heteromeric CCAAT factor 4.8.1 Heteromeric CCAAT factors 4.9 Grainyhead 4.9.1 Grainyhead 4.10 冷休克域 4.10.1 csd 4.11 Runt 4.11.1 Runt 0 其他转录因子 0.1 铜拳头蛋白 0.2 HMGI(Y) 0.2.1 HMGI(Y) 0.3 口袋域 0.4 E1A类似因子 0.5 AP-2/EREBP关联因子
转录因子
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由於RNA二級結構差不多全都是由鹼基對作為中介，它可以說是確定在一個分子或複合物中哪些鹼基成對。但是，傳統的華生—克里克鹼基對並非唯一在RNA的配對方法，霍氏配對方法亦很普遍。 脱氧核糖核酸（DNA）的二级结构主要是各种形式的螺旋，特别是B型双螺旋、此外还有A型双螺旋、Z型双螺旋、三螺旋和四螺旋结构等。除了上述3种最常见的标准二级结构（B型、A/C型和Z型）外，细胞内DNA在特殊条件下亦可形成其他几种非标准二级结构，如弯曲(bending)、十字形(cruciforms)、三螺旋(triple helix)、滑动(slipped mispaired DNA,SMP-DNA)错配和剪辑翻转(base flipping)等。
二級結構
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脱氧核糖核酸（DNA）是由脱氧核糖核苷酸构成的一种核酸。其主要负责生物体遗传信息的携带。组成DNA的碱基有四种：腺嘌呤（A）、鸟嘌呤（G）、胸腺嘧啶（T）与胞嘧啶（C）。DNA主要为双链构成的双螺旋结构，但病毒中也有单链DNA。利用体外分子进化技术，也可合成出类似核酶的脱氧核酶。
核酸
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蛋白质、核酸和多糖是3类主要的生物大分子，它们在分子结构和生理功能上差别很大，然而，在以下几个方面又显出共性：核酸（）是由核苷酸构成的生物大分子，可分为脱氧核糖核酸（DNA）与核糖核酸（RNA）。
生物大分子
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基因的分子基础是脱氧核糖核酸（DNA）。DNA由核苷酸相互连接而形成的链分子，其中的核苷酸有四类：腺苷酸（A）、胞嘧啶（C）、鸟苷酸（G）和胸腺嘧啶（T）。遗传信息就储存在这些核苷酸序列中，而基因则以连续的核苷酸序列存在于DNA链中。病毒是唯一的例外，有一些病毒利用核糖核酸（RNA）分子来代替DNA作为它们的遗传物质。
遗传学
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一些人体内的衛星DNA类型包括： 重复的脱氧核糖核酸核鹼基模式的长度可以从1对核鹼基到数千对核鹼基不等，整个卫星DNA的长度可以达不中断的数百万核鹼基。大多数卫星DNA位于染色体的端粒或着丝粒部位，不同种之间重复的核苷酸系列模式被保持完好，但是在长的系列里也常有变换。
衛星DNA
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常見的核鹼基共有5种：胞嘧啶（缩写C）、鸟嘌呤（G）、腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T，通常為DNA专有）和尿嘧啶（U，通常為RNA专有）。腺嘌呤和鸟嘌呤属于嘌呤族（缩写作R），它们具有双环结构。胞嘧啶、尿嘧啶、胸腺嘧啶属于嘧啶族（Y），它们的环系是一个六元杂环。RNA中，尿嘧啶取代了胸腺嘧啶的位置。胸腺嘧啶比尿嘧啶多一个5位甲基，这个甲基增大了遗传的准确性。
核鹼基