Uchanganuzi wa genome ni nini?
Msingi wa uchambuzi wa kulinganisha genome ni uanzishwaji wa mawasiliano kati ya jeni (uchambuzi wa ortholojia) au sifa nyingine genomic katika viumbe tofauti. Ni ramani hizi za kati ya jeni ambazo hufanya iwezekane kufuatilia michakato ya mageuzi inayohusika na kutofautiana kwa jenomu mbili. Matukio mengi ya mageuzi yanayotukia katika viwango mbalimbali vya tengenezo hufanyiza mageuzi ya jenomu. Katika kiwango cha chini kabisa, mabadiliko ya hatua huathiri nucleotides za mtu mmoja-mmoja. Katika kiwango cha juu zaidi, sehemu kubwa za kromosomu hugawanyika, kuhamishwa upande mmoja, kugeuzwa, kuingizwa, kuondolewa na kuingizwa. Hatimaye, genomes nzima ni kushiriki katika michakato ya hybridization, polyploidization na endosymbiosis, mara nyingi kusababisha speciation haraka. Ugumu wa mageuzi ya genome unaleta changamoto nyingi za kusisimua kwa watengenezaji wa mifano ya hisabati na algorithms, ambao wanatumia wigo wa mbinu za algorithmic, takwimu na hesabu, kuanzia sahihi, heuristics, parameter iliyowekwa na algorithms ya kukaribia kwa shida kulingana na mifano ya parsimony kwa algorithms ya mlolongo wa Markov Monte Carlo kwa uchambuzi wa Bayesian wa shida kulingana na mifano ya uwezekano.  Mengi ya masomo haya yanategemea kugundua homolojia ya mfululizo ili kugawa mfululizo kwa familia za protini.