En contraste con los bacterianos, los cromosomas eucarióticos necesitan múltiples orígenes de replicación porque:
No pueden replicarse bidireccionalmente.
No suelen ser circulares.
La procesividad de la ADN polimerasa eucariótica es muy inferior a la de la bacteriana.
Su tasa de replicación es mucho más lenta, y necesitarían demasiado tiempo usando un solo origen.
Tienen varias ADN polimerasas para distintos propósitos, y necesitan la correspondiente variedad de orígenes.