Durante la fosforilación oxidativa, la fuerza protón-motriz que se genera por el trasporte electrónico se usa para:
Crear un poro en la membrana mitocondrial interna.
Generar los sustratos (ADP y Pi) para la ATP sintasa.
Inducir un cambio conformacional en la ATP sintasa.
Oxidar NADH a NAD+.
Reducir O2 a H2O.