Chernova, nu 27, slog Briton Ennis-Hill till guld på 2011 års VM i Korea.
Denna vecka fick hon ett förbud och fick tidigare resultat ogiltigförklarade efter att ett prov från 2009 testades på nytt - men behöll sin världstitel.
"Hon satte ett personligt bästa med fördelen av droganvändning," Minichiello sade.
Den ryska antidopningsbyrån straffade Chernova med ett tvåårigt förbud, som förlängdes till den 22 juni 2013.
Det upphävde också hennes resultat från 15 Augusti 2009 till 14 Augusti 2011 - en period som slutade bara 16 dagar innan hon vann världsguld i Daegu med ett personligt bästa av 6,880 poäng, slå försvarare Ennis-Hills 6,751.
Forskning som genomfördes av universitetet i Oslo i oktober 2013 visade att musklerna kan behålla de fördelar som anabola steroider ger årtionden efter den tidpunkt då de togs.
Minichiello vill att idrottsvärldens styrande organ IAAF och World Anti-Doping Agency (Wada) ska ha en "lång, hård titt" på den ryska anti-dopningsbyråns straff.
IAAF berättade för BBC Sport att den väntar på en fullständig förklaring från de ryska myndigheterna innan den beslutar om den behöver vidta några åtgärder.
"Kanske det belyser att det finns en lucka inom anti-dopning koden som tillåter bara ett tvåårigt förbud från den ursprungliga testet och sedan ett annat förbud från datumet för omtest," tillade Minichiello.
"Jag tycker nog att allt ska gå sömlöst och idrottare ska förbjudas hela tiden. Annars har du ett förbud för Chernova som verkligen ser ganska ineffektiv ut."
Chernovas retroaktiva förbud löper ut den 21 juni, och med kvalificeringsperioden för 2015 års VM i Peking som löper fram till den 10 augusti, kunde hon tävla både där och på 2016 års olympiska spel i Rio.
"Det skulle vara frustrerande om hon ställer upp på startlinjen men det är reglerna där ute och vi måste följa dem", sade Minichiello.
– Det är därför vi anser att Wada behöver titta på sin kod och påföljder för att visa att det finns ett potentiellt kryphål som behöver ses. Jag är säker på att den ryska anti-doping byrån har administrerat suspensioner enligt reglerna, så därför måste det undersökas. "
Förra veckan avgick Rysslands atletiske huvudtränare Valentin Maslakov efter att ett antal idrottsmän från landet befunnits skyldiga till dopingbrott.
Wada undersöker anklagelser om utbredd dopning och korruption inom rysk idrott efter att påståendena sändes i en ny tysk tv-dokumentär, med en rapport som ska publiceras i slutet av året.
IAAF sade förra veckan att den var bekymrad över antalet ryska dopningsfall inom idrotten.
Jessica Ennis-Hills tränare Toni Minichiello vill att ryska heptathlete Tatyana Chernovas drogförbud ska granskas på nytt av idrottsmyndigheterna.