Sammanslutningen och grupperna, däribland det skotska bergsrådet, har tidigare uttryckt oro över att avfall lämnas kvar i skyddsrummen.
Användningen av bådadera ökar under sommarmånaderna.
MBA har nu utfärdat ett nytt meddelande som ber folk att hjälpa till att hålla båda parter i ett snyggt tillstånd.
Föreningen sade: "Med sommaren över oss ser vi många besökare till båda sidor, särskilt på de mer populära långdistansleder, som kanske inte har använt en tidigare och som verkar omedvetna om att till skillnad från i vissa andra länder, våra berg båda inte betjänas och har ingen sophämtning service.
"Båda litar på att du tar bort din skräp, och det av alla tanklösa andra, så snälla hjälp där du kan."
Förra året berättade en av två frivilliga som tar hand om Corrour Boty i Lairig Ghru, Cairngorms, om att ta fyra timmar att sortera igenom och bränna avfall kvar där.
Neil Reid sa att bergsvandrare måste vara villiga att plocka upp skräp de hittar.
Mountain Boties Association har vädjat till hillwalkers och klättrare att hjälpa till att hålla mer än 100 skyddsrum som den ser efter i Storbritannien ren och prydlig.