Den 32-årige registrerade en tid av 34,259 sekunder i Szeged i Ungern, förbättra på 35,197 som vann guld i Rio förra året.
Liksom i Brasilien var fransmannen Maxime Beaumont tvåa, spetsad på linjen av Heath med 0,05 sekunder mellan dem.
Jon Schofield, Heaths partner och Rio Olympic silvermedaljör i K2 200m, slutade nionde i 36.213.
Paret har tvingats fokusera på det enda kajakevenemanget, eftersom K2 200m har tagits bort från OS-programmet för Tokyo 2020.
"Detta är ett riktmärke för resten av säsongen för mig", säger Heath, från Guildford.
"Den första loppet är den mest nervvrakande eftersom ni inte har sett varandra på några månader, så det är bra att komma tillbaka på vattnet och se hur de gör i jämförelse med dig."
Ta reda på hur du kommer in på kanot eller kajakpaddling med vår inkluderande guide.
Storbritanniens K1 200m olympiska mästare Liam Heath vann sin första tävling för säsongen vid Canoe Sprint VM.