Mer än 1000 skolor i USA:s näst största stad söktes igenom på tisdagen efter att lektionerna hade ställts in.
Tjänstemännen i New York, den största staden, sade att de hade fått ett liknande hot men hade ignorerat det som en bluff.
Los Angeles polischef Charlie Beck sa att det var "mycket lätt i efterhand att kritisera beslutet".
"Vi har lidit för många skolskjutningar i Amerika för att ignorera denna typ av hot," tillade han.
I New York, poliskommissarie William Bratton och federala tjänstemän som bad att inte identifieras beskrev beslutet i Los Angeles som en "överreaktion", Reuters nyhetsbyrå rapporterar.
New Yorks borgmästare Bill de Blasio hade avslutat hotet med "inget trovärdigt".
Skolor i Los Angeles förbereder sig för att öppna igen efter att ha stängts av över ett e-post hot, i ett drag ifrågasatt av poliser i New York.