Sir Christopher Pitchford, utredningens ordförande, sade att han erkände allmänhetens intresse av att förfarandet är "så öppet som möjligt".
Domaren sa att han skulle bedöma varje anonymitetsbegäran individuellt.
Metropolitan Police har redan begärt att stora delar av utredningen ska vara privat.
Kampanjer som säger sig ha blivit förorättade under operationer som pågått i årtionden kräver största möjliga avslöjande.
De inkluderar kvinnor som inte insåg att deras partner var under täckmantel officerare, och en lång lista av social rättvisa kampanjtagare som försöker fastställa om de orättvist övervakas.
Förhandsavgörandet innebär att det inte kommer att finnas några generella restriktioner för material som rör under täckmantel verksamhet avslöjas om Sir Christopher regler det allmänna intresset ligger i att avslöja dem.
Omkring 33 personer, nio av dem tidigare under täckmantel poliser, har redan bett om anonymitet.
Scotland Yard, som stöds av regeringen, har också hävdat att det inte bör tvingas erkänna förekomsten av vissa operationer.
Undercover Förfrågan: Varför är det viktigt - vad står på spel?
Bedragna kvinnor: Vem har fått en ursäkt från polisen?
I ett 85-sidigt utslag säger Sir Christopher att utredningen kommer att behöva brottas med till synes "oförsonliga" argument om huruvida allmänhetens intresse ligger i att hålla känslig polisinformation hemlig och skydda de verkliga identiteterna hos tidigare under täckmantel officerare - eller i att avslöja tidigare händelser på grund av allmänhetens oro.
– Utgångspunkten är att det inte kommer att införas någon begränsningsorder, i det allmännas intresse av öppenhet i undersökningen och dess förfaranden, såvida det inte är nödvändigt för att utjämna allmänintresset av skyddet av enskilda personer mot skada och/eller effektiv polisverksamhet, säger domen.
"Det är inte möjligt att på principnivå eller på allmän nivå ange var balansen i allmänhetens intresse kommer att ligga.
"Ordföranden kommer från fall till fall att ta ställning till utvärderingen med hänsyn till arten av och kvaliteten på de bevis som inkommer till stöd för ansökan."
En kvinna som blev lurad in i en hemlig relation, känd endast som "Lisa", sade att hon inte var optimistisk om att domen skulle leda till att sanningen kom ut - hon fruktade att utredningen hade misslyckats med att erkänna att det fanns en skyldighet att avslöja sanningen för människor som hade varit offer.
"Jag är glad att de inte har fått ha filt anonymitet", berättade hon BBC.
"Men min största rädsla är att polisen ska kunna dra ut på det här.
"De kommer inte att ge upp en enda bit information utan att ansöka om restriktioner order.
"Det tog fyra och ett halvt år för mig att få en ursäkt i mitt fall."
I domen betonas att poliser som vill förbli anonyma måste bevisa att de kan utsättas för den skada de kan utsättas för, om de namnges offentligt.
Detta skulle behöva inbegripa bevis om arten eller allvaret i den risk som en individ skulle ställas inför och komplexa argument om huruvida namngivning skulle bryta mot deras mänskliga rättigheter.
På samma sätt måste styrkorna visa hur avslöjandet av operativa detaljer skulle skada den under täckmantel polisen.
Metropolitan Police, med stöd av andra polischefer och regering, hade hävdat att det helt enkelt borde tillåtas att "inte bekräfta eller förneka" uppgifter om operationer.
Sir Christopher måste nu börja bedöma de 33 nuvarande ansökningarna om reklambegränsningar och om någon av dem behöver backas upp av ytterligare bevis.
I juni kommer Sir Christopher också att börja överväga om staten måste tvingas tala om för föräldrar till döda barn att deras barns identitet användes för att skapa falska personer för under täckmantel officerare.
Under täckmantel poliser som ställs inför påståenden om orätt kommer inte automatiskt att få anonymitet vid en kommande större offentlig undersökning.