Regeringen meddelade 2014 att man ville bygga en tunnel vid sidan av världsarvet.
Men Highways England överväger också en väg som skulle ta A303 söder om staden.
En 2 miljarder £ 1,8-mils tunnel (2,9km) är regeringens föredragna alternativ i Stonehenge, men vissa arkeologer hävdar att det kan skada den gamla platsen.
I ett e-postmeddelande, sett av BBC, tyder Highways England på att en sydlig förbifartsled skulle "övervägas" som en del av "design samråd" fasen av uppgraderingen.
Förra veckan tilldelades Atkins/Arup ett designkontrakt på 17,5 miljoner pund för projektet.
Gruppen kommer att "utveckla alternativ" för att uppgradera vägen - inklusive en tunnel - med målet att bygga upp en anläggning från och med 2020.
1,4 miljarder pund
Föreslagen kostnad för Stonehengetunneln
1,8 mil är längden på den föreslagna tunneln (2,9 km)
9.6 kvm runt Stonehenge är ett världsarv (25 km2)
33 % av rutten är enkelspårig
84 år sedan A-vägen öppnades
Det finns växande oro över trängsel på A303 som har beskrivits som "mycket skadlig" av English Heritage, som förvaltar monumentet.
Men en grupp historiker - som kallas Stonehenge Alliance - har krävt "inga ytterligare skador" på världsarvet.
Historikern Tom Holland, från gruppen, sade att det södra alternativet var "bättre än att plöja genom den rikaste arkeologiska platsen i Europa" och krävde "lateralt tänkande" över A303 trängsel.
Och Icomos, som råder FN: s kulturella organ Unesco, sade att det var "berörda" alla uppgraderingar kan ha en "mycket negativ inverkan" på världsarvet runt stenarna.
Både English Heritage och National Trust har gett sitt stöd till alternativet "den längsta möjliga tunneln".
I ett uttalande sade Highways England: " Som en del av vårt offentliga engagemang är vi fast beslutna att överväga de alternativa vägar som föreslås och kommer att se på dessa som en del av vårt engagemangsarbete.
"Förbättringarna befinner sig för närvarande i ett tidigt utvecklingsstadium. När vi utvecklar våra förslag i enlighet med de lagstadgade processerna kommer vi att samråda med en mängd olika intressenter, inklusive lokalbefolkning, företag, trafikanter och berörda parter.
"Vi siktar på att inleda ett bredare och offentligt samråd i början av 2017."
Ett liknande tunnelsystem för rutten, som förbinder London och Sydväst, lades ned 2007 på grund av de stigande kostnaderna.
Regeringen sade att kostnaden för en uttråkad 1,3m (2,1km) tunnel inte kunde motiveras på £ 540m - dubbla den ursprungliga uppskattningen på £ 223m.
En södra bypass av Salisbury betraktas som ett alternativ till en Stonehenge tunnel, har BBC lärt sig.