Förslaget har lockat mer än 27.000 röster i en online-undersökning av namn för Royal Research fartyget, vilket orsakar webbplatsen att krascha.
Före detta BBC presentatör James Hand sa att han hittade listan över möjliga namn "riktigt roligt" så bestämde sig för att "kasta en i ringen".
Han "ursäktade rikligt" till Naturmiljöforskningsrådet.
Det finns ingen garanti för att fartyget kommer att få det namn som toppar undersökningen, med det slutliga beslutet som ska fattas av NRC:s verkställande direktör.
Andra namn i löpningen är RRS Pingu, RRS Usain Boat och RRS David Attenborough.
EN NERC talesman sade att personalen var "mycket njuta av att höra allas idéer".
Mr Hand sade: "Jag läste historien om att namnge fartyget på BBC:s webbplats på torsdag och några av bidragen var riktigt roliga - min favorit var Clifford The Big Red Boat.
"Jag trodde att jag skulle kasta en i ringen. På fredagskvällen leddes den av ett par tusen, och när platsen kraschade på söndagen ledde den med 8.000. Det har varit helt bisarrt."
Boaty McBoatface är 25.000 röster före andra plats förslag, RRS Henry Worsley.
Båten byggs på Cammell Laird varvet i Birkenhead på Merseyside och när den är klar 2019 kommer den att studera istäcken, havsströmmar och marint liv som en del av Cambridge-baserade brittiska Antarktis Survey.
"Jag har bett om ursäkt ymnigt till folket bakom webbplatsen," den tidigare Good Morning Jersey värd sade.
"Det hade faktiskt inget med mig att göra. Det var mitt förslag, men stormen som har skapats har egna ben.
"Jag föreslog detta för Condor Liberation när de hade en opinionsundersökning, jag slår vad om att de sparkar sig själva nu."
Mr Hand, som presenterade Good Morning Jersey från juli 2013 till september 2015, tillade: "Det är verkligen roligt, men det är så surrealistiskt."
Lord West, före detta förste sjöherre, berättade för BBC Radio 4's Today program att han var "stolt över att vi har fåniga namn som går runt" men hoppades att ingen av dem faktiskt valdes ut.
Alison Robinson, chef för företagsfrågor vid NRC, som grundades i Swindon, sade: " Vi har fått tusentals förslag på webbplatsen sedan vi officiellt lanserade; många av dem återspeglar vikten av fartygets vetenskapliga roll genom att fira stora brittiska upptäcktsresande och vetenskapsmän.
"Vi är glada att människor omfamnar idén i en anda av kul."
En man som föreslog namngivning av ett nytt fartyg på 200 miljoner pund, Boaty McBoatface, har bett om ursäkt.