Över en natt blev många vägar ogenomträngliga, medan järnvägstrafiken ställdes in eller försenades.
Miljöbyrån utfärdade fem översvämningsvarningar över hela länet.
Warwickshire Fire and Rescue sade att det hade räddat ett antal människor fångade i sina bilar på grund av stigande översvämningsvatten.
Mer om denna berättelse och andra från Coventry och Warwickshire
Network Rail sade översvämningar på tåglinjer runt Daventry, Rugby och Wolverton försenade tjänster mellan Birmingham New Street och London Euston.
Tågen på västkusten Mainline körde också med reducerade hastigheter på grund av kraftiga översvämningar.
Rose Plumbley, rektor för Leamington Hastings C vid E-akademin i Rugby, sade att många elever och personal inte hade lyckats komma in i skolan.
"Vi är i Leam Valley och det är översvämmad på båda vägarna in i skolan", sade hon.
"En del elever lyckades komma in, men det blev väldigt tydligt att många inte skulle komma in. Vi bestämde oss för att stänga så att barnen tryggt kan komma hem i dagsljus."
Brandmän räddade förare från strandsatta fordon i Great Alne, Wolston, Baginton och Princethorpe.
Det fanns också rapporter om bilar som fastnat i Kenilworth Ford.
Det fanns översvämningsvarningar vid floden Dene vid Walton, floden Sherbourne vid Allesley, floden Stour vid Mitford Bridge, Shipston på Stour och Tredington, floden Stour från Halford till Clifford Chambers och floden Alne vid Bird in Hand.
Fjorton skolor tvingades stänga på grund av svåra översvämningar i Warwickshire.