Barnet skadades allvarligt i händelsen och dog senare på sjukhus.
Olyckan inträffade klockan 15:00 lokal tid (19:00 GMT) på fredag.
Restaurangen Sun Dial, där händelsen ägde rum, har enligt uppgift stängts tills vidare.
Enligt ett uttalande från Atlantapolisen slutade restaurangens svänggolv automatiskt att röra sig när barnet fastnade på fredagen.
Anställda lyckades rubba pojken, som drabbades av förkrossande skador på huvudet och hjärnan, enligt en rapport från Fulton Countys rättsläkare.
"Killen bara vandrade som barn kommer att göra. På något sätt befann han sig i en kritisk situation där han är instängd mellan det roterande golvet och väggen," polisen talesman Warren Pickard berättade reportrar på lördag.
Pojkens död är en olyckshändelse.
Restaurangen ligger på toppen av Westin Hotel, en Atlanta attraktion som erbjuder en 360-graders utsikt över staden.
En femårig pojke har dött efter att hans huvud blev instängd mellan en vägg och ett bord fast på en långsamt rörlig våning på en restaurang i Atlanta, sade polisen.