Polisen sa att han hittade den svarta leksaken i en polisskjorta på en polisstation i centrala London.
Scotland Yard lovade att undersöka saken men detektiven var själv utredd för att ha hittat på historien.
Han blev senare godkänd vid ett felförhör och fick skadestånd från polisen efter att ha vidtagit rättsliga åtgärder.
Detaljerna kom fram efter ett separat fall i Themes Valley-polisen där en polis satte en apa på en svart kollegas skrivbord.
En felpanel drog förra månaden slutsatsen att Det Sgt Andrew Mottau inte var rasistisk utan borde ha insett att leksaksdjuret kunde vara stötande.
Incidenten med Metropolitan Police började i september 2013 när den indiskfödde detektiv konstapeln påstod sig ha sett en stor apa leksak på kontoret för Case Progression Unit vid Belgravia polisstation.
Han sa att den uppstoppade svarta leksaken hade en polisskjorta på sig och en etikett med "nattlig ERO" - Evidential Review Officer.
En av ERO:erna på den tiden var en svart polis.
Detektiven var bekymrad över att leksaken var rasistisk och inte hade undersökts ordentligt.
Han tog upp frågan under en live intern webbchatt som kallas "kommissionärsforumet", där personalen uppmuntras att diskutera problem med Met-kommissionären, som då var Sir Bernard Hogan-Howe.
Detektiven fick ett svar på nätet och sade: "Vad som beskrivs - om det är korrekt - är oacceptabelt" och fick veta att det skulle undersökas "omedelbart".
Men en månad senare blev detektiven själv utredd för att ha postat "osanna och potentiellt inflammatoriska kommentarer".
Han fick veta att hans handlingar hade "uppnått normerna för yrkesmässigt beteende... i samband med "ärlighet och integritet" och "misskrediterat beteende", påståenden som, om bevisas, kunde ha lett till hans avskedande
Så småningom, i juni 2015, efter utdragna interna disciplinära förfaranden, deltog officeren i en grov fel utfrågning där det fastslogs att det inte fanns "inget fall att besvara" och han godkändes.
Paul Turpin, som var representant för Metropolitan Police Federation och stödde officeren genom processen, sade: "Jag blev förvånad när ärendet hänvisades till en grov fel utfrågning och var inte förvånad när den utfrågningen fann officeren hade inget fall att svara."
Han föreslog att påståendet aldrig skulle ha kommit så långt: "Matter bör behandlas på lägsta lämpliga nivå så snart som möjligt."
Scotland Yard sade att det hade gjorts en "intern granskning" av handläggningen av ärendet efter förhandlingen.
Det sades att den ursprungliga anklagelsen om apan hade "undersökts lokalt och framskridit så långt det kunde vara", även om undersökningen inte kunde fastställa vem som hade placerat det svarta leksaksdjuret på polisstationen.
Den asiatiska detektiven, som inte har namngetts av BBC på egen begäran, inledde rättsliga förfaranden mot Met vid en arbetsdomstol som påstod att han hade blivit rasistiskt diskriminerad och utsatt för övergrepp.
Men innan en fullständig utfrågning ägde rum nådde styrkan en uppgörelse och gick med på att betala skadestånd.
Detaljerna i avtalet är konfidentiella men storleken på ersättningen tros vara i regionen 35.000 pund.
Officeren avböjde att kommentera och har inte avslöjat några detaljer om avtalet för BBC.
Met bekräftade att en uppgörelse hade nåtts "efter rättslig medling" vid personaldomstolen i mars 2016.
Biträdande kommissionsledamot Richard Martin, som ansvarar för professionalism på Scotland Yard, sade att styrkan hade gjort "betydande investeringar" för att förbättra det sätt på vilket den hanterade personalklagomål kopplade till diskriminering, mobbning eller trakasserier och hade infört en ny "whistle-blowing"-politik.
"Vi har länge insett att människor... fruktar att bli offer om de väcker ett klagomål, oavsett om denna rädsla är berättigad", sade han.
"Det har aldrig varit acceptabelt och vi fortsätter att göra det mycket tydligt för vår personal att viktimisering aldrig kommer att tolereras, att det kommer att undersökas och att det kommer att få allvarliga återverkningar om det inträffar."
Men Janet Hills, ordförande för Metropolitan Black Police Association, sade användningen av en svart apa leksak och behandlingen av den asiatiska polisen visade att det fortfarande fanns en lång väg att gå.
"Vi försöker fortfarande bli av med dinosaurierna inom polisväsendet som fortfarande skyddar den kulturen", sade hon, och beskrev "monkey"-incidenten som "otrolig" och "oacceptabel".
"Det är inte bara en leksak, det är en leksak att användas för att säga "detta är vad jag tycker om dig", sade hon.
"Det är rasistiskt och diskriminerande beteende", sade hon, och tillade att det fortsatte eftersom folk trodde att de kunde "komma undan med det".
Få nyheter från BBC i din inkorg, varje vardag morgon
En asiatisk polis som uttryckte oro över en "rasist" leksak apa på jobbet anklagades för grov tjänstefel, har BBC News lärt sig.