Mark Moogalian och fem andra passagerare övermannade den misstänkte, marockanska medborgaren Ayub El-Khazzani.
Moogalian sköts i nacken under kampen på höghastighetståget från Amsterdam till Paris.
Legion d'honneur gavs av president Francois Hollande på Elyseepalatset.
När en fransk passagerare försökte gå in på en toalett på tåget, stötte han på skytten och försökte övermanna honom.
När herr Moogalian såg kampen försökte han ingripa, men blev träffad av en kula.
Tre andra amerikaner - off-duty militärer Spencer Stone och Alek Skarlatos, och Anthony Sadler - sedan övermannade angriparen.
De fick också hjälp av den brittiske affärsmannen Chris Norman.
Amerikanerna och britterna fick äran i augusti 2015.
Den franska digitala TV-kanalen BFMTV rapporterade förra månaden (på franska) att Ayub El-Khazzani förblev häktad i Frankrike i väntan på rättegång.
Legion d'honneur grundades 1802 av Napoleon Bonaparte. Priset delas upp i fem kategorier och passagerarna fick chevalieren, den mest utdelade.
Francoise Rudetzki, tidigare chef för SOS Attentats, en sammanslutning för offer för terrorism, dekorerades med Legion d'honneur vid samma ceremoni på torsdag.
En fransk-amerikansk man som hjälpte till att stoppa en tungt beväpnad revolverman på ett tåg i Frankrike 2015 har fått landets högsta ära.