Ett uttalande utfärdat av regionen sade att spelaren hade misslyckats med att återhämta sig från en huvudskada han lidit under Premiership Sevens i augusti 2015.
25-åringen började sin karriär med Blackwood och spelade sjuor för Wales.
"Jag är förkrossad över att jag har tvingats gå i pension från rugby genom skada, men jag vet att det är rätt beslut", sade Pewtner.
I maj 2015 var en annan Dragons spelare Ashley Smith tvungen att gå i pension vid 28 års ålder efter en "serie av konkussiva händelser".
Och i september tidigare Wales back-row Jonathan Thomas pensionerades efter att ha fått diagnosen epilepsi kopplad till huvud traumas led under leken.
Dragons chef för rugby Lyn Jones tillade: " Det gör oss alla ledsna att höra att Matthew har tvingats gå i pension.
"Vi är alla tacksamma för Matthews fantastiska bidrag till teamet genom åren han har varit med regionen. Vi önskar honom lycka till i framtiden."
Förutom att spela sju för Wales, var Pewtner begränsad till under-20 nivå under 2009-10.
Han sade att han skulle studera för en lärarexamen.
Newport Gwent Dragons vinge Matthew Pewtner har tvingats gå i pension från skada på medicinsk rådgivning.