Akinfenwa kladdade ner i lådan och såg hans avböjda skott flyga förbi Bobby Olejnik för att fortsätta Wycombes imponerande hem form - de har förlorat bara en av sex liga matcher på Adams Park denna term.
Paul Hayes borde ha gett värdarna ledningen efter 18 minuter när en studsande boll föll till honom fem meter ut, men hans looping huvudet rensat crossbaren.
Exeter-strejkaren Reuben Reids 27 minuter långa skott studsade farligt framför Wycombe-vakten Jamal Blackman, som tillfälligt spillde, och besökarna nekades då en härlig chans som Ollie Watkins straffades för en foul när en-mot-en.
Chairboys dominerade den andra perioden som ersättare för Akinfenwa nickade över och Paris Cowan-Hall slog Joe Jacobsons leverans brett.
Men efter 85 minuter föll Anthony Stewarts upphöjda boll från vänster direkt till Akinfenwa, så att den stora strejkaren kunde vända och slå bollen förbi Olejnik för sitt andra mål sedan han gick med i klubben.
Rapport från Pressföreningen.
Matchen slutar, Wycombe Wanderers 1, Exeter City 0.
Andra halvlek, Wycombe Wanderers 1, Exeter City 0.
Hörnet, Wycombe Wanderers. Förföljd av Jordan Moore-Taylor.
Hörnet, Wycombe Wanderers. Förföljd av Craig Woodman.
Substitution, Wycombe Wanderers. Matt Bloomfield ersätter Sam Wood.
Substitution, Exeter City. Liam McAlinden ersätter Robbie Simpson.
Handboll av Robbie Simpson (Exeter City).
Substitution, Exeter City. David Wheeler ersätter Lee Holmes.
Mål!  Wycombe Wanderers 1, Exeter City 0. Adebayo Akinfenwa (Wycombe Wanderers) höger fotade skott från mitten av lådan till nedre vänstra hörnet. Hjälpt av Anthony Stewart.
Jake Taylor (Exeter City) visas det gula kortet för en dålig foul.
Scott Kashket (Wycombe Wanderers) vinner en frispark i defensiva halvan.
Foul av Jake Taylor (Exeter City).
Substitution, Wycombe Wanderers. Scott Kashket ersätter Paris Cowan-Hall.
Foul av Dan Rowe (Wycombe Wanderers).
Jake Taylor (Exeter City) vinner en frispark i den defensiva halvan.
Joe Jacobson (Wycombe Wanderers) visas det gula kortet för en dålig foul.
Foul av Joe Jacobson (Wycombe Wanderers).
Ollie Watkins (Exeter City) vinner en frispark i den defensiva halvan.
Substitution, Exeter City. Pierce Sweeney ersätter Jack Stacey.
Försök blockerat. Sam Wood (Wycombe Wanderers) vänster fotade skott från vänster sida av lådan är blockerad.
Försök missade. Paris Cowan-Hall (Wycombe Wanderers) huvudet från mitten av lådan är nära, men missar till höger.
Joe Jacobson (Wycombe Wanderers) vinner en frispark i anfallshalvan.
Foul av Jake Taylor (Exeter City).
Paris Cowan-Hall (Wycombe Wanderers) vinner en frispark i anfallshalvan.
Foul av Luke Croll (Exeter City).
Försök missade. Adebayo Akinfenwa (Wycombe Wanderers) huvudet från mitten av lådan är nära, men missar till höger.
Substitution, Wycombe Wanderers. Adebayo Akinfenwa ersätter Paul Hayes.
Hörnet, Wycombe Wanderers. Förföljd av Lloyd James.
Foul av Paul Hayes (Wycombe Wanderers).
Luke Croll (Exeter City) vinner en frispark i anfallshalvan.
Hörnet, Exeter City. Förföljd av Joe Jacobson.
Dominic Gape (Wycombe Wanderers) vinner en frispark i anfallshalvan.
Foul av Lloyd James (Exeter City).
Hörnet, Wycombe Wanderers. Förföljd av Jack Stacey.
Joe Jacobson (Wycombe Wanderers) vinner en frispark i defensiva halvan.
Stöld av Robbie Simpson (Exeter City).
Sam Wood (Wycombe Wanderers) vinner en frispark på högerkanten.
Foul av Jake Taylor (Exeter City).
Andra halvan börjar Wycombe Wanderers 0, Exeter City 0.
Första halvlek, Wycombe Wanderers 0, Exeter City 0.
Adebayo Akinfenwas vinnare fem minuter från tiden gav Wycombe en svårköpt 1-0 hem seger över Exeter i League Two.