Ashya behandlades på sjukhus i Southampton när hans föräldrar tog honom utomlands utan att berätta för personalen förra året.
De ignorerade medicinska råd och tog honom till Prag för proton strålbehandling.
Det avslöjades senare Ashya inte fick efterföljande kemoterapi i Prag, ett drag laget i Southampton säger kan äventyra hans återhämtning.
Doktor Peter Wilson, barnläkare vid Southampton General Hospital, talade uteslutande med BBC och sade: " Vi är osäkra på exakt vilken behandling han får, men vad vi vet är... varje månad som går att han inte får kemoterapi, hans resultat förvärras.
"Det finns experter i landet som redan har citerat siffror om halvering av överlevnad - så överlevnad går från 80% till 40% eller 50%, vilket är ganska dramatiskt."
Kings version av händelser förra året utlöste ett offentligt skrik och personal i Southampton sade att de fick arga e-postmeddelanden, brev och telefonsamtal som i ett skede tvingade sjukhuset att stänga sin växel.
Kungsfamiljen, som i mars sade att femåriga Ashya nu var cancerfri, avböjde att bli intervjuad som en del av BBC-programmet.
I mars, fyra månader efter det att protonbehandlingen avslutats, berättade Brett King för en nationell tidning att en undersökning nyligen visade "inga tecken" på tumören.
Men cancerexperter har berättat för BBC även om det verkar Ashya är i remission det är alldeles för tidigt att säga att han har blivit helt botad.
Professor Karol Sikora, som är specialist på onkologi, sade: " Ashya är ännu inte helt ute ur skogen, men 78 procent av barnen med denna typ av sällsynt cancer överlever faktiskt och blir botade.
"Det faktum att han är sjukdomsfri vid denna tidpunkt är stort, men det betyder inte att han är botad ännu."
Nedbrytningen i förhållandet mellan Brett King och sjukhuset berodde på hans tro att Ashya inte skulle få strålbehandling och kemoterapi efter operation för att avlägsna en hjärntumör.
Mr King hävdade i en YouTube-video att personalen hotade honom med ett domstolsbeslut om han vägrade Ashya behandling, något sjukhuset har förnekat.
Han berättade för journalister i Spanien efter gripandet: "De skulle döda honom i England eller förvandla honom till en grönsak."
Genom medierna höjde kungafamiljen tiotusentals pund för Ashyas behandling innan NHS gick med på att betala för protonterapi i Prag.
Doktor Nicky Thorp, från barncancergruppen och leukemigruppen, sade: " Vi blev bestörta, men när vi begrundade detta kan jag förstå varför NHS England gick med på att finansiera detta barns fall. Barnet var där, barnet behövde strålbehandling.
"Användandet av protoner förbättrar inte botandet av tumörer... och det gör mig ledsen att se hur sanningen kan förvrängas och missförstås."
I Prag vägrade Ashyas föräldrar cellgiftsbehandlingen, som hade rekommenderats av läkare och beordrats av Högsta domstolen.
Men i mars, fyra månader efter att protonbehandlingen avslutats, sade King att hans son var cancerfri.
Pediatrisk onkologikonsult dr Ramya Ramanujachar, som var inblandad i Ashyas behandling, varnade för att fallet skulle kunna utgöra ett oroande prejudikat.
Hon sa: "Jag tror inte att föräldrarna kan ta hand om sitt eget barn med en hjärntumör och inte bara vara vårdare utan också proffsen som leder, hanterar och dikterar deras barns behandling."
Dr Wilson sa att fallet hade lett till en "omöjlig situation" för kliniker som står inför familjer i samma situation.
"Det är djupt orättvist när NHS alltid ska handla om lika sjukvård för alla", tillade han.
Ashya: The Untold Story kommer att sändas på BBC1 i södra regionen på fredag kl 19:30 BST.
Läkare och sjuksköterskor som behandlade cancerpatienten Ashya King har kritiserat sina föräldrar för att för första gången tala ut i en BBC-dokumentär.