Uefas chef kommer inte att tillåta sin kongress att diskutera Jerseys bud eftersom ön inte erkänns av FN som en självständig nation.
Representanter från Uefa besökte ön, som är ett kronberoende av Storbritannien, i september för att träffa Jerseys fotbollstjänstemän.
"Detta var svaret vi förväntade oss", sade Jersey FA president Phil Austin.
"Från ett fotbollsperspektiv så uppfyller vi mer än väl kriterierna.
"Genom att avvisa vår ansökan har Uefas verkställande direktör sagt att de inte lägger fram vår ansökan inför kongressen. Vi tror inte att den verkställande makten har befogenhet att göra det, vi tycker att det ska gå till kongressen," Austin berättade BBC Sport.
Jersey lämnade in ett försök att lämna den engelska FA och ansluta sig till Uefa i december 2015, efter godtagandet av Gibraltar och Kosovo, som inte är oberoende nationer.
Men Gibraltars första ansökan 2007 kom innan reglerna ändrades, medan Kosovo, som anslöt sig till Uefa i maj och spelade i sin första VM-kvalificerare i september förklarade sig självständigt från Serbien 2008.
"Jag har ingen aning om hur lång tid det kommer att ta, vi väntar på ett domstolsdatum förhoppningsvis inom de kommande sex månaderna, men jag vet inte," tillade Austin.
"Vi bevakar kostnaderna mycket noga och vi kommer att ta det varje steg i taget och hantera vår budget därefter.
"En eller två personer har trätt fram som tror på vad vi gör och kommer att hjälpa oss med vår finansiering."
Jersey ska överklaga till Skiljedomsdomstolen för idrott (CAS) efter att deras försök att ansluta sig till Uefa avvisades.