När han tar itu med frågan om att studenterna ska få valuta för pengarna, kommer han att utmana en "uppåtriktad spiral" i universitetsledarnas lön.
Universiteten kommer att uppmanas att offentligt motivera hur de kan betala sina huvuden mer än premiärministern.
Frågan om universitetsvärdet har varit under granskning, med avgifter som ökar till 9 250 pund i England.
I ett tal till universitetsledarna på torsdag kommer John Johnson att uppmana universiteten att fastställa mycket tydligare kontrakt för studenter om vad de kan förvänta sig.
Han kommer att lova bättre "konsumentskydd" för studenter.
En årlig studie har visat en minskande känsla av valuta för pengarna bland studenter - med oro för att få färre undervisningstimmar än vad de förväntade sig.
Johnson kommer att lyfta fram oron över ökningen av rektorernas löner - med dussintals universitetschefer som nu får över 300.000 pund och vissa som får mer än 400 000 pund.
"När studenter och skattebetalare investerar så mycket i vårt system för högre utbildning bör valuta för pengarna garanteras.  Ändå hör jag fortfarande elever säga att deras kurs är dålig kvalitet.
"Detta är inte tillräckligt bra, särskilt när vissa rektorer tar hem en lön som i vissa fall överstiger premiärministerns."
Det har funnits farhågor om de stigande kostnaderna för universitet i England - med undervisningsavgifter som ökar till 9,250 pund och räntor på lån som stiger till 6,1 procent.
Institutet för skattestudier säger att de genomsnittliga skulderna för utexaminerade nu kommer att vara över 50.000 pund - och att räntekostnaderna kommer att ha nått 5 800 pund innan studenterna ens har tagit examen.
Före detta utbildningsminister Lord Adonis säger att så höga nivåer av intresse är "oförsvarliga" och förutspår att de kommer att ändras.
Och chefen för Russell Group av ledande universitet har beskrivit sådana räntekostnader som "orörliga" och krävde att de skulle ses över.
Men Johnson förväntas försvara det nuvarande systemet med studentfinansiering och universitetsfinansiering.
Universitet Minister Jo Johnson kommer att utmana universitet över "överdriven" lön för rektorer.