Dasuki anklagas för att ha gett fantomkontrakt för att köpa 12 helikoptrar, fyra stridsflygplan och ammunition. Han förnekar anklagelserna.
Utrustningen var avsedd för kampen mot Boko Haram Islamistiska militanter.
Dasuki hämtades tidigt på morgonen av säkerhetsagenter, sade en PR-firma som representerade honom.
För två veckor sedan beordrade president Muhammedu Buhari mr Dasuki att gripas efter att ha åtalats av en panel som undersökte vapenanskaffningen under den förra presidenten Goodluck Jonathans senaste administration.
PRNigeria sa att han greps av underrättelseagenter från sitt hem i huvudstaden Abuja, där han redan befann sig i husarrest och åtalades separat.
Senare på tisdagen fängslades den tidigare guvernören i Sokoto State, Attahiru Bafarawa och ägaren av en Lagos-baserad privat TV-station, Raymond Dokpesi, separat av Nigerias ekonomiska och finansiella brottskommission (EFCC), i samband med det påstådda bedrägeriet.
Båda männen, som är politiska allierade med den tidigare presidenten, har förnekat all inblandning i vapenaffären.
Deras gripande följer några av mr Dasukis medarbetares gripande av EFCC i måndags.
Antikorruptionsorganet sade att de inkluderade f.d. finansminister Bashir Yuguda och sönerna till några framstående politiker i det tidigare styrande partiet över anklagelser om oegentligheter i samband med vapenaffären.
Tidigare sade Dasuki att han inte hade fått en chans att försvara sig inför utredningsgruppen och beskrev dess rekommendation som "politiskt motiverad".
Den f.d. arméöversten står redan inför en rättegång för påstådd innehav av olagliga vapen.
Han är den första ledande tjänstemannen i den tidigare regeringen som ska åtalas under president Muhammedu Buharis styre, som tillträdde i maj.
BBC:s Martin Patience i Lagos säger att Dasukis gripande kommer att stärka president Buharis budskap om att han inte kommer att tolerera korruption oavsett hur högt uppsatt tjänstemannen är.
Presidenten valdes delvis på ett löfte att rensa upp Nigerias ökända korrupta politik, säger vår korrespondent.
Boko Haram har dödat tusentals i nordöstra Nigeria i sin sexåriga kampanj för att skapa en islamisk stat.
Nigerias tidigare nationella säkerhetsrådgivare, Sambo Dasuki, har arresterats för att ha stulit 2 miljarder dollar, säger hans representanter.