Fotografier av den hotade Magnolia dealbata, som hölls av Bristol-baserade Arkive, sågs av en botanist vid ett mexikanskt universitet mer än 8.500 miles bort.
Växterna spårades till biosfärreservatet Serra Gorda i Mexiko och identifierades.
Lucie Muir, chef för Arkive, sa att de blev "drabbade" av upptäckten.
Efter att ha sett bilder på blommorna bad botanikern dr Jose Antonio Vazquez den ursprungliga fotografen om fler bilder av växten.
Fotograf Roberto Pedraza Ruiz sade att han sedan gjorde flera fler resor till skogen "dokumentera blommor och frukter av träden tills slutligen få bekräftelse på att jag hade fotograferat inte bara en men två helt nya arter av magnolias".
Det första exemplaret hette Magnolia rzedowskiana, efter emininet mexikansk botanist, Dr Jerzy Rzedowski, medan det andra ska heta Magnolia pedrazae, till ära för sin fotograf.
Ruiz sade: "Detta är utan tvekan den största ära som en naturvårdare och naturfotograf kan få."
På Arkives hemsida, som drivs av välgörenhetsorganisationen Wildscreen, finns 16.000 bilder av flora och fauna.
Den påstår sig vara världens största uppslagsverk på nätet och tar emot donationer av bilder från naturfilmare, fotografer, naturvårdare och forskare.
Två nya arter av magnoliablomma har identifierats efter att ha setts på Noahs Ark online arkiv.