Bågskytte, fäktning, tyngdlyftning och rullstolsrugby har också missat.
Cykling - som gav Team GB 12 medaljer i Rio - har fått sin finansiering nedskuren med mer än £ 4m till £ 25,98m.
Badminton Englands verkställande direktör Adrian Christy sade att han var "övertalad" av det "oförståeliga" beslutet att ta bort sportens finansiering.
Totalt 345 miljoner pund kommer att investeras i 31 olympiska och paralympiska sporter - 2 miljoner pund mindre än rekordet 347 miljoner pund som tilldelats Rio Games.
Som ett resultat har UK Sport satt Team GB ett mål att vinna 51-85 olympiska medaljer och 115-162 paralympiska medaljer i Tokyo.
Storbritannien fick aldrig tidigare skådad framgång i Rio 2016, med OS med 67 medaljer och Paralympics 147.
Ordförande för UK Sport Rod Carr sade regeringen, som tillhandahåller finansiering tillsammans med National Lottery pengar, har "bekräftat sitt åtagande" för Tokyo 2020.
Han tillade: "Detta är avgörande finansieringsbeslut för idrott att ta dem på sin resa till Tokyo 2020 och därefter så att den historiska framgången i Rio kan upprätthållas."
Badminton, som sattes som mål att vinna en medalj i Rio, är den enda sport som tjänade en podium plats på sommaren för att få sin finansiering bort.
Marcus Ellis och Chris Langridge tog brons i herrdubbelt efter sporten fick £5.74m i den sista cykeln.
Christy sa att beslutet representerar en "katastrofal inverkan på sporten" och Badminton England skulle "kampa för sina spelares förhoppningar och drömmar".
"Hur kan du komma tillbaka från de bästa spelen i mer än ett decennium, på ett år där våra spelare har demonstrerat föreställningar i världsklass och där vi kan visa resan till Tokyo är på rätt spår, bara att få varje penny av investeringar tillbaka?" sade han.
"Vad har vi gjort för fel?" tillagd GB Badmintons performanceregissör Jon Austin.
Judo, som fick samma mål som badminton och även krävde en bronsmedalj, har fått sin finansiering att öka något.
Liz Nicholl, VD för UK Sport, sade att beslutet att skära ner på finansieringen inte togs lättvindigt.
"Vi skulle vilja investera i alla sporter men verkligheten är att vi måste prioritera för att skydda och förbättra medaljpotentialen", sade hon.
"Om vi underinvesterar över hela linjen kommer de brittiska lagen i slutändan att underprestera vid spelen och medalj framgång kommer att äventyras."
Sportminister Tracey Crouch tillade: "UK Sports strategi för elitidrott har visat sig framgångsrik i Peking, London och Rio och ambitionen att vinna fler medaljer i Tokyo är en djärv som, om uppnås, skulle innebära en sensationell sommar av idrott 2020."
Basket fick sin finansiering indragen 2014 - och handboll och volleyboll förlorade sin i 2012 - men säger en UK Sport översyn förra året för att bygga "prestanda vägar för framtida framgång" var tänkt att inriktas på sådana sporter.
I ett brittiskt basketuttalande, i samband med volleyboll och handboll, sades det: " Det verkar som om UK Sport inte har något intresse för lagsporter och i synnerhet vägrar att ta ansvar för behovet av att finansiera sin prestationsutveckling, som identifierades i sin egen översyn.
"Med Storbritannien Sports investeringsbudget närmar sig £ 350m, det gränsar till omedgörlighet att överlåta ansvaret till regeringen och andra finansiärer som inte är inrättade för att finansiera utvecklingen av högpresterande idrott."
UK Sport säger att investeringar i de fem olympiska sporterna och två Paralympiska sporter som lagts till för Tokyo 2020 ännu inte har bekräftats.
Baseball/softball kommer att återvända till programmet, med karate, skateboard, sportklättring och surfing också, medan Para-taekwondo och Para-badminton går med i Paralympic programmet.
UK Sport säger att finansieringen kommer att fastställas "efter ytterligare utforskning av medaljpotentialen", med 9 miljoner pund av de 345 miljoner pund som återstår att fördela.
Liam Carroll, chef coach för GB baseball laget, sade: "Nyckeln till att låsa upp vår potential är investering och jag är glad att UK Sport har lämnat dörren öppen.
"Vi ser fram emot möjligheten att imponera på dem att komma bakom Storbritannien Baseball kan förlänga deras enorma meriter av att investera i olympiska medalj utmanare."
Badminton är en av fem sporter att förlora alla brittiska Sport finansiering för 2020 OS i Tokyo - efter Storbritannien hävdade en brons i sporten i Rio.