El North West sa att 680 kunder i Bury och 480 i Rochdale fortfarande var avskurna.
Företaget har återanslutit mer än 24 750 kunder under de senaste två dagarna.
Tacka människor för deras "goodwill", incident manager Steve Cox sade "fokus idag är att se till att makten återställs för de återstående kunderna".
Ytterligare uppdateringar om detta och andra översvämningshistorier på BBC:s livesida
På andra håll i området fortsätter en omfattande sanering efter översvämningarna på lördagen.
I Rochdale befann sig dussintals av stadens centrumföretag under vatten, efter det att floden Roch hade sprängt sina stränder, medan omkring 100 fastigheter och två vårdhem i närheten måste evakueras.
Rochdale Labour MP Simon Danczuk sade mer behöver göras för att förhindra översvämningar, inklusive omdirigering av utländska biståndsfonder.
"Varför spenderar vi pengar i Bangladesh när det behöver spenderas i Storbritannien?" sade han.
"Det vi måste göra är att reda ut de problem som uppstår här och inte koncentrera oss så mycket på utvecklingsländerna. Det måste vara vår prioritet."
Miljöbyrån har sagt att översvämningsskydd över hela Förenade kungariket behöver en "fullständig omprövning" efter den senaste översvämningen.
Uppklarningsverksamheten i Bury har sett en bostadsförening berömma den "instinktiva samhällsandan" hos dem som drabbats av översvämningarna.
Irwell Valley Housing Association's Cath Mustafa sade att omkring 100 av deras invånare hade drabbats och "hållsamheten hos alla drabbade och den instinktiva samhällsandan att dra sig samman i en så svår tid är verkligen häpnadsväckande".
Central Salford drabbades av sina värsta översvämningar i nästan 70 år, då bostäderna i Kersal, Lower Broughton och Trinity evakuerades.
En talesman för brand- och räddningstjänsten i Manchester sa att de hade fått mer än 300 översvämningsrelaterade samtal.
Hon sade att man trodde att besättningarna hade "räddat upp till 1000 personer på mindre än 24 timmar när vattennivåerna steg så snabbt igår att hela städer blev avskurna".
Mer än 1.100 bostäder i Greater Manchester förblir utan ström efter översvämningar i området över helgen.