Bowe, 32, spelade i första halvan av spelet i Naas och kom igenom unscathed innan ersättas vid halvtid som hade varit planen.
Lionsstjärnan hade varit ute efter att ha lidit en knäskada i Irlands VM nederlag av Argentina.
Bowe led av bakre ligament och meniskala skador.
Hans återkomst är ett snabbt uppsving när Belfast klubben försöker säkra en plats i Pro12 play-offs.
Les Kiss män är för närvarande femte i ställningarna och har tre matcher kvar, mot Zebre, Leinster och Ospreys.
Darren Cave kapten Ulster A laget som de tjänade en 38-31 seger i torsdagens match.
Irland ytter Tommy Bowe spelade sin första match sedan oktober i Ulsters En match mot sina Munster motsvarigheter på torsdag.