DSCPA säger att två individer försökte skeppa valparna från Dublin Port till Holyhead Port i norra Wales.
Hundarna hölls i "olämpliga" förhållanden, trånga i små behållare med "liten eller inget utrymme, ingen mat eller vatten".
Räden var en del av Operation Delphin, ett samarbete mellan djurskyddsorganisationer och andra organ.
Valparna tros vara ungefär sex eller sju veckor gamla och raserna inkluderade beagles, basset hounds, labradoodles och pomeranianer.
De har nu återlämnats till Dublin och under DSPCA-vård. Ett antal av dem är sjuka och genomgår veterinärvård på ett härbärge i Rathfarnham.
Operationen var en del av en underrättelseledd razzia och involverade gränsstyrkan som stoppade två fordon på olika färjeöverfarter.
Ian Briggs, som tillhör RSPCA:s specialenhet, sade: " Dessa stackars valpar kördes in i Wales under mycket olämpliga förhållanden tidigt på morgonen.
"För skrupelfria langare är dessa unga ungar ingenting annat än en cash bonanza - och handlare skulle ha siktat mot tiotusentals pund från dessa transporter.
"Detta är ytterligare ett chockerande exempel på att människor är beredda att agera olagligt och äventyra välfärden för försvarslösa djur för att tjäna snabba pengar - men lyckligtvis stoppades de i sina spår."
Brian Gilles, VD för DSPCA, tillade, "Vi är glada över resultatet av denna operation.
"Vi i DSPCA tror att samarbete med myndigheter på båda sidor om Irländska sjön för att dela information, resurser och samarbete i slutändan kommer att segra mot dem som är inblandade i denna avskyvärda, giriga handel."
Nästan 100 valpar har beslagtagits som en del av en operation i den olagliga valphandeln från Irland till Storbritannien.