Polisen sa att barnet, som tros ha blivit skjuten av sin far som hittades död på platsen i Northiam, är sju år gammalt.
Ch Supt Neil Honnor sa att ett vapen hade återfunnits, men ville inte bekräfta förhållandet mellan flickan och mannen.
Mannens kropp hittades i en bil parkerad utanför ett hus i Spring Hill-området i byn.
Böner har framförts vid den skadade flickans skola, Beckley Church of England Primary i Beckley nära Rye.
Området runt scenen har spärrats av sedan skottlossningen, som skedde vid cirka 16:00 BST på torsdag.
Ch Supt Honnor sa att officerare hade identifierat "förövaren av brottet".
"Detta verkar inte vara en händelse som nödvändigtvis är relaterad till Northiam annat än det faktum att det hände där.
"Vi tror att detta är en inhemsk-relaterad incident," sade han.
I ett uttalande sade en talesman för Beckley CE Primary: " Vi har fått bekräftelse på att det barn som blev skjuten är en elev på vår skola.
"Detta är en fruktansvärt sorglig och chockerande händelse och hela skolsamhället ber för henne och hennes familj."
Flickan behandlas på King's College Hospital i London.
En ung flicka som sköts i huvudet i East Sussex är fortfarande allvarligt sjuk på sjukhus.