Den nypräglade miljonären rapporterades just ha återvänt från en semester med sin familj när de fick höra nyheten.
"Min man bokstavligen pumpa luften när han var i telefon," sade det namnlösa barnets mamma, enligt lokala medier.
Det är inte känt hur vinnaren reagerade.
Bonus Bonds är en investering som betalar ut tusentals priser till sparare, lotteristil, varje månad. NZ$1m är det största månatliga priset.
Barnets Bonus Bonds konto rapporterades vara upprättat när han föddes med bara NZ$250 (180; £140) värde av obligationer, ges av en släkting.
ANZ bank, som driver programmet, bekräftade vinsten men sade att det var att respektera familjens önskemål genom att inte ge ytterligare information om vinnaren.
Ett nyzeeländskt barn har vunnit NZ$1m ($726600; £560700) i Bonus Bonds prispengar - den yngsta någonsin vinnaren av investeringslotteriet.