Agnius Naumovas, som var från Litauen men hade bott i staden, hittades på Margaret's Avenue omkring 20:00 lokal tid på juldagen.
Han fördes till sjukhus, där hans skador beskrevs som allvarliga.
Naumovas, som var 29 år, avled på torsdag kväll.
En obduktion har utförts av den irländska statspatologen.
En 41-årig man greps i Waterford på fredagsmorgonen.
En man i 40-årsåldern har gripits efter att en man som hittades med huvudskador i Waterfords centrum på juldagen dog på sjukhus.