Man fann att barn till minoritetsfamiljer inte får tillräckligt med stöd för att lära sig kantonesiska – de hamnar på efterkälken i skolan och orsakar långsiktiga problem på arbetsmarknaden.
– Ett av de största hindren för lika tillgång har i praktiken varit en rassegregering av etniska minoritetsstudenter från kinesiska studenter i det offentliga skolsystemet, säger professor i juridik vid Hong Kongs universitet, Puja Kapai, som genomförde studien.
Bruket att studera separat har också inneburit att barn växer upp utan att interagera med andra kulturer.
Hong Kong är hem för 365.000 etniska minoriteter, som utgör 6 procent av landets totala befolkning. Kommuner av indianer, pakistanier, nepalesiska och filippinska har bott i Hong Kong i generationer.
Men staden saknar fortfarande en läroplan för barn som talar kinesiska som andraspråk, vilket skulle göra det möjligt för dem att lära sig kantonesiska, ett krav på många jobb och universitetsplatser.
– Språkkravet som utgör ett hinder för etniska minoriteter att få lika tillgång till utbildning och arbetsmarknaden kan ses som en indirekt form av diskriminering, säger Raymond Ho, senior ledamot av jämställdhetskommissionen i Hongkong.
Men han är övertygad om att eftersom regeringen gjorde det olagligt att diskriminera på grund av ras 2009 finns det en större medvetenhet bland allmänheten om de etniska minoriteternas behov.
Fler berättelser ur BBC:s Knowledge economy-serie som tittar på utbildning ur ett globalt perspektiv och hur man kommer i kontakt
Tidigare har man hävdat att kinesiska lokalbefolkningen är "mindre accepterande" av människor med mörkare hud. Det var påståendet i en rapport 2008 från Unison, en grupp som driver kampanjer för etniska minoriteters rättigheter.
Denna acceptansnivå konstaterades vara lägst inom utbildningssektorn.
Språk är ett stort hinder för etniska minoriteter att få tillgång till utbildning.
Det bästa stället att börja lära sig kinesiska och träffa människor med andra bakgrunder är på dagis, säger Holing Yip från Unison.
Men Unisons studie Kindergarten Support Report 2015 visade att 62 % av förskolorna använde kantonesiska enbart som intervjuspråk.
Den fann också att privatägda förskolor var ovilliga att ge ansökningsblanketter till icke-kinesiska föräldrar, och många ber barn att ha kinesiska talförmåga vid tre års ålder.
Till följd av detta finns det en koncentration av etniska minoriteter på ett litet antal förskolor.
Ho säger att kommissionen för lika möjligheter har "uppmuntrat förskolor att vara öppna för etniska minoriteter.  Men inte heller att använda språkkunskaper som urvalskriterier."
Det har funnits ett mönster av kinesiska elever som anmält sig till vanliga grund- och gymnasieskolor, där klasser undervisas i kantonesiska.
Etniska minoriteter skulle delta i engelsk-medelhöga "utsedda skolor".
Men de utsedda skolorna utrustade eleverna med en så låg kantonesiskanivå att de skulle finna det svårt att komma in på universitet eller arbete.
Som sådana väljer vissa föräldrar att skicka sina barn till Cantonese-medium skolor.
– Efter att ha kämpat med sig själva vill många etniska minoritetsföräldrar att deras barn ska lära sig kantonesiska så att de inte går igenom vad de gjorde, säger Ms Yip.
Men att få information om hur man ansöker till kinesiska-medelhögskolor är ofta bara tillgängligt på kinesiska. Somliga har avskräckt föräldrar till etniska minoriteter från att ansöka.
De som får plats kan kämpa, eftersom alla klasser är i kantonesiska utan extra stöd i klassen och föräldrar inte kan hjälpa till hemma.
Många föräldrar tvingas söka extra undervisning för att hjälpa barn med läxor.
"Det finns situationer där om en lärare inte kan komma en dag, kommer deras barn inte att kunna lämna in sina läxor och kommer att straffas. Det är också en enorm ekonomisk börda, säger Ms Yip.
Kinesiska University of Hong Kong student Deepen Nebhwani deltog i båda typerna av skolor.
"Jag lärde mig mer kinesiska i den vanliga skolan där alla mina vänner var kinesiska, bara genom att träna utanför klassen, än jag gjorde på den utsedda skolan där jag studerade kantonesiska som språkkurs."
Efter påtryckningar från lokala icke-statliga organisationer och FN upplöste Hongkongs regering utnämnda skolor 2013.
Men tendensen att sända barn från etniska minoriteter till särskilda skolor fortsätter.
"Ultimat står föräldrar inför beslutet om deras barn ska lida nu i en kinesisk-medelhög skola, eller senare på arbetsmarknaden. Och det är inte ett rättvist val för en förälder att göra, säger Ms Yip.
I september 2014 tog Hongkongs regering ett steg framåt genom att införa en "läranderam" som syftar till att stödja elever från etniska minoriteter i att lära sig kantonesiska.
Beroende på antalet inskrivna etniska minoriteter, kan skolorna få från HK$800.000 (Â £68.000) till HK$1500.000 för att hjälpa dem.
Men Prof Kapai är skeptisk till dess effektivitet.
"Det har helt enkelt brutit ner läroplanen i steg, men ingenting har faktiskt förändrats. Det måste finnas en kinesisk som en andra språkundervisning för att lära icke-infödda talare hur man lär sig kantonesiska ordentligt, säger hon.
– Etniska minoriteter kan fortfarande brottas med ämnen som matematik till följd av att klassen och materialet är på kinesiska, säger Unisons Ms Yip
I Prof Kapais betänkande betonas problem som hänger samman med varandra för minoritetsgrupper.
Bristen på kantonesiska språkkunskaper kommer att utgöra hinder för sysselsättningen, vilket leder till ökad fattigdom och svårigheter att få tillgång till hälso- och sjukvård.
Kantonesiska språkkunskaper är ett grundläggande krav för vissa arbeten, t.ex. offentlig förvaltning.
Typiska yrken som tas upp av etniska minoriteter finns inom catering-, byggnads- och manuella arbetsindustrier.
Hong Kong Council of Social Welfare säger att många pakistanska, indonesiska och thailändska hushåll ligger under stadens fattigdom.
"Jag identifierar mig som en Hongkonger", säger Nebhwani. Men han är utestängd från många arbeten på grund av begränsningarna i hans språkkunskaper.
"Om jag skulle försöka helt integrera, skulle det vara svårt på grund av min nivå av kantonesiska."
"Regeringen är fast besluten att uppmuntra och stödja icke-kinesiska talande elevers integration i samhället, inklusive att underlätta deras tidiga anpassning till skolutbildningssystemet och behärska det kinesiska språket," sade en talesman för Hong Kongs utbildningsbyrå.
Etniska minoriteter i Hongkong "marginaliseras" av utbildningssystemet, säger en universitetsstudie.