En poliskälla berättade för BBC Radio WM en passagerare sågs hälla en vätska i en låda, som sedan började röka.
De 48 passagerarna på tjänsten Megabus Preston till London leddes av bussen och tvingades sitta åtskilda i en avspärrning på den motsatta körbanan.
Polisen sa att en rapport om ånga som kom ut ur en påse som ledde till säkerhetsvarningen orsakades av "ett hälsoförbättringsstöd för rökare".
Motorvägen stängdes mellan korsningarna T3 och T4 nära Lichfield innan polisen sade att de inte längre behandlade händelsen som misstänkt, men den har nu öppnats igen.
Staffordshire polisen sa att tränaren stannade på den hårda axeln "av sig själv" vid 08:20 BST.
Omkring fyra timmar efter det att beväpnade poliser hade anlänt bekräftade polisen att platsen var säker. Strax före 1500 BST återöppnades M6 Toll.
Passagerarna har fått fortsätta sin resa till London, även om några har valt att återvända norrut, till Manchester.
En talesman för polisen sade: " Vi fick en rapport från en verkligt bekymrad person bland allmänheten om misstänkt aktivitet på en buss som reste på M6-tåget i Weeford, nära Lichfield.
"Med tanke på rapportens karaktär reagerade vi snabbt och proportionellt och behandlade informationen som trovärdig och ytterst allvarlig.
"M6-tågvägarna var stängda åt båda hållen, bussen var riktad mot motorvägens hårda axel och beväpnade officerare evakuerade lugnt passagerarna med deras fulla stöd och samarbete.
"Efter en första bedömning kan vi bekräfta att ingen har skadats och att det inte finns någon fara för passagerare på platsen eller andra resenärer som var på motorvägen vid den tidpunkten.
"Vi behandlar inte heller någon som misstänkt."
En taleskvinna från Megabus sa att tränaren hade lämnat Preston kl. 05.10 och skulle vara i London kl. 22.55.
Tidigare, beväpnade poliser kunde ses bredvid en-decker coach på södra körbanan, som passagerare leddes av en efter en.
Passagerarna tvingades sitta på den norra körbanan, bortsett från varandra, medan de var omringade av officerare.
Snifferhundar och rättsmedicinska poliser fördes också in för att underlätta sökandet, eftersom poliser i rättsmedicinska dräkter och andra i militär trötthet kontrollerade området.
Försvarsministeriet bekräftade att militär personal på deras begäran hjälpte polisen under rutinförfarande.
En av passagerarna på bussen berättade för BBC att hon inte hade någon aning om vad som pågick, att hon inte såg något misstänkt och inte fick veta varför de blev stoppade.
Hon tvingades sitta korsbent på asfalten och fick fortfarande inte veta vad som hände. Hon sa att hela upplevelsen hade varit väldigt "lug och skrämmande".
Brandkåren, polisen från West Midlands och Staffordshires styrkor och ambulanspersonal var alla inblandade i operationen.
Nick Jones, en försäljningschef från Cambridge, sa att han låg fyra fordon bakom bussen när polisen stoppade trafiken.
"Jag har aldrig sett så många ambulanser dyka upp, även beväpnade poliser, helikopter och dussintals polisbilar.
"Vi blev tillsagda att stanna i våra bilar, hålla fönstren uppe och inte sätta luftkonditionering på.
"Polisen tittade i häckar och kanter på den norra vagnen.
"Allt bara tog fart, ambulanser till höger och center och beväpnade poliser i svarta mössor."
En annan ögonvittne Barry Jarvis berättade för BBC att bilar rensades från tullbås.
Han sade: " Det var mycket förbryllande vad som pågick i början, eftersom det inte fanns så många poliser där.
"Det var först efter 20 minuter eller så när alla dessa omärkta bilar kom igenom som vi trodde att något stort hände.
"När vi avleds, kunde vi se beväpnade poliser i tullbåsen, och brandkåren."
Motorister på själva M6 upplever förseningar på upp till två och en halv timme.
I ett uttalande sade Staffordshire polisen: "Vi vill be om ursäkt för eventuella olägenheter och hoppas att allmänheten förstår att vi har vår skyldighet att skydda allmänhetens säkerhet."
Beväpnad polis svepte på en buss på motorvägen M6 Toll i West Midlands.