Reviderade siffror visade att Japans ekonomi ökade med 1 % under de första tre månaderna jämfört med de föregående tre, en ökning från en preliminär uppskattning på 0,6 %.
Den ökade också med 3,9 % per år, jämfört med en preliminär beräkning på 2,4 %, och var mycket högre än prognoserna om en tillväxt på 2,7 %.
Riktmärket Nikkei 225 index slutade plant på 20.457.19 punkter.
Aktierna var också lägre trots en positiv rapport från amerikanska arbetstillfällen på fredag som hjälper till att pressa ner yenen mot dollarn, vilket är bra för japanska exportörer eftersom det gör dem mer konkurrenskraftiga utomlands och ökar vinsten när de repatrieras.
Dollarn var på 125.47 yen mot 124.45 yen i Tokyo på fredag. Det hade helt kort nått en 13-års hög på 125,86 yen på fredag.
De kinesiska andelarna ökade trots handelsuppgifterna som visade att exporten minskade för tredje månaden i maj, medan importen minskade för en sjunde månad.
Hong Kongs Hang Seng index stängde upp 0,21% på 27 316.28 poäng, medan Shanghai Composite avslutade dagen upp 2,17% på 5.131.88 poäng - dess högsta punkt sedan början av 2008 och ledande regionens vinster.
Huvudaktien i CRRC ökade med 10 % efter ett månadslångt handelsstopp, eftersom investerare staplade in den kinesiska tågtillverkaren som nu är världens största när det gäller marknadsvärdet efter sammanslagningen.
CSR och China CNR, som hade varit landets två största tågtillverkare, meddelade förra veckan att de hade slutfört sin regeringsdrivna fusion genom en aktieswap, som såg CNR absorberas i CSR och avnoteras.
I Sydkorea stängde referensvärdet Kospi index 0,1 % till 2 065,19 efter att ha fallit till en nästan två månaders låg på 2 056,50 tidigt i sessionen.
Regeringen försöker stoppa ett utbrott av Mellersta Österns Andningssyndrom (MERS) efter hälsoministeriet rapporterade 23 nya infektioner på måndagen, vilket ger totalt 87.
Sex personer har dött av sjukdomen i Sydkorea, som nu har det näst högsta antalet infektioner i världen, efter Saudiarabien.
Marknaderna i Australien är stängda för en allmän helgdag.
Positiva uppgifter om den ekonomiska tillväxten i Japan lyckades inte driva fram större andelar i världens tredje största ekonomi.