Efter 11 år i rollen sa Prof Christianne Glossop till BBC Wales: "Det har inte funnits en dag då jag inte har fokuserat på tbc."
Hon försvarade den walesiska regeringens ansträngningar för att bekämpa sjukdomen, efter anklagelser om att fackföreningarna "matade" upp sig.
Jordbrukarnas ledare har förnyat kraven på en grävlingsslakt.
De hävdade på Royal Welsh Show i Llanelwedd att efter-Brexit handelsavtal kan vara i riskzonen.
Statistiken visar att 8 103 nötkreatur slaktades i Wales till följd av bovin tbc 2015 - en ökning med mer än en fjärdedel jämfört med 2014, då 6 378 nötkreatur dödades.
Prof Glossop sade att det var viktigt att inte bedöma utrotningsprogrammet i Wales baserat enbart på en indikator.
"Om vi vinner kampen måste vi förstå allt om sjukdomen.
– Vi gräver djupare in i gårdarna som har tuberkulos, vi testar hårdare, vi använder känsligare tester och vi tar också fler djur som har en ofullständig reaktion.
"Syftet är att få ut smittan ur gården så snabbt som möjligt - och som ett resultat av det tar vi fler djur just nu."
Sedan den walesiska regeringens program för att utrota tuberkulos inleddes 2008 har antalet fall av tuberkulos minskat med 37 %.
Prof Glossop sade att omkring 5 procent av gårdarna i Wales för närvarande har problem.
Men frågan är koncentrerad, med mycket högre incidensnivåer i västra Wales och längs gränsen till England.
Ett femårigt projekt för att vaccinera grävlingar i norra Pembrokeshire pågår för närvarande på grund av en global brist på BCG jab.
Fackföreningarna har uppmanat regeringen att minska sina förluster och skrota det de säger är "punktlös och kostsam" rättegång.
Prof Glossop sa att det var för tidigt att säga om det hade fungerat eller om regeringen skulle starta om projektet 2017.
"Ska vi vara i en position för att få tillgång till vaccin nästa år skulle vi behöva titta på datormodellering och fråga är ett femte år av vaccin i ett område kommer att leverera fördelar som är värda kostnaden," sade hon.
"Det är ett dyrt företag och mycket arbetsintensivt."
Gareth Richards, en mjölkbonde från Abergwili i Carmarthen vars gård har drabbats tre gånger av bovin tbc, beskrev regeringens ansträngningar att utrota sjukdomen som "i grunden fruktansvärd".
Han tillade: "Det är för mycket av en politisk het potatis och det decimerar den walesiska landsbygden som ett resultat."
FUW:s ordförande Glyn Roberts sade: "Vi vet att de nuvarande nivåerna av bovin tbc kan utgöra ett betydande hot när det gäller kött- och mejeriexport när vi väl är utanför EU, och det finns en verklig risk för att vår nuvarande tbc-status kan användas mot oss under handelsförhandlingar.
"Det innebär att vi måste ta itu med problemet på ett proaktivt sätt, annars kan vi äventyra alla handelsförhandlingar i Storbritannien med Europa."
I höst kommer grävlingsslakten tillbaka i England och pilotslakten pågår i Gloucestershire, Somerset och Dorset.
Prof Glossop kommer att hålla ett seminarium i FUW-paviljongen på Royal Welsh Showground i onsdags om frågan om att ta itu med bovin tbc i framtiden.
Ministern för landsbygdsfrågor Lesley Griffiths har åtagit sig att göra ett uttalande om programmet i början av hösten.
"Det görs mer arbete under sommaren", berättade hon för BBC Wales. "Jag vet att det är ett område av stor oro för jordbrukare."
Bovin tbc är det "största problemet" för djurens hälsa och välbefinnande under en generation, har Wales chefsveterinär sagt.