Valkommissionen sade att 38 parlamentsledamöter hade lyft fram människor, inklusive studenter, som påstod sig ha röstat två gånger, vilket är ett brott.
Det sades att de enskilda valregistren som drivs av råden bättre borde kopplas samman för att bidra till att identifiera dubbla bidrag.
Labour varnade för att göra det svårare för ungdomar att registrera sig för att rösta.
I valet den 8 juni registrerades rekordmånga 46,8 miljoner personer, 500 000 fler än 2015 och även fler än 46,4 miljoner i EU-omröstningen.
Av dessa röstade 68,7% faktiskt på dagen, det högsta valdeltagandet för ett allmänt val sedan 1997.
Det var en kraftig ökning av antalet ansökningar om registrering till omröstningen under dagarna efter att Theresa May ringde snap-undersökningen den 18 april och även under de dagar som ledde fram till tidsfristen den 22 maj.
Totalt inkom 2,9 miljoner ansökningar under sexveckorsperioden.
Flera valkretsar fann att storleken på deras väljare ökade med mer än 10 procent, inklusive platser med stora studentpopulationer som Canterbury, Cambridge, Bristol West och Leeds Central.
Men oron över antalet dubbla ansökningar - ett problem som först uppstod efter förra årets folkomröstning i EU - kvarstår fortfarande.
För närvarande finns det ingen direkt koppling mellan valregistren, som hålls och förvaltas av valregistreringstjänstemän runt om i Storbritannien, och den online-registreringstjänst som nu används av en majoritet av befolkningen.
De två systemen använder olika databaser och kan inte kommunicera direkt med varandra.
Mellan den 1 december 2016 och tidsfristen den 22 maj har cirka 4,9 miljoner ansökningar om rösträtt lämnats in, varav de flesta har gjorts online.
Men nettoökningen av antalet poster i röstlängden under den perioden var bara 1,4 miljoner, vilket tyder på att "en betydande andel av ansökningarna sannolikt kommer att ha varit dubbleringar".
Eftersom det inte finns något sätt för människor att på nätet kontrollera om de redan är registrerade, beräknas andelen dubbla ansökningar ha varierat mellan 30 % och 70 % inom olika områden.
Vakthunden sade att detta hade orsakat betydande administrativa och ekonomiska bördor för valtjänstemän och bör åtgärdas genom tydligare information om registreringsplatser, inklusive potentiellt en kontrollfunktion som det sade användes i Australien, Nya Zeeland och Republiken Irland.
Trots ansträngningarna att flagga upp till människor som de inte behövde registrera om de hade skickats ett valkort eller hade röstat i maj kommunalval, sade vakthunden att det verkade ha gjort liten skillnad och brådskande åtgärder behövdes nu.
"Den relativa lättheten att lämna in en ansökan om att registrera sig för att rösta med hjälp av online-tjänsten, i jämförelse med svårt att kontakta en lokal myndighet valtjänst team per telefon eller e-post för att kontrollera om de redan var registrerade, innebar att många människor helt enkelt lämnat in en annan ansökan," sade rapporten.
Även om det fanns en brist på bevis för att backa upp påståenden på sociala medier att vissa människor hade röstat två gånger, väktaren sade att det tog frågan mycket allvarligt och alla med information bör kontakta polisen.
Det betonades att även om vissa personer - även studenter och personer med andra hem - lagligen kan registrera sig i mer än en valkrets och avlägga mer än en röst i lokala val, var det ett brott att rösta två gånger i ett allmänt val som kan bestraffas med obegränsade böter.
Den "dispergerade och osammanhängande" karaktären hos de 381 valregistren i Storbritannien innebär att det inte är möjligt att kollektivt dubbelkolla poster, sade vakthunden, och att kunna göra det skulle avsevärt minska risken för dubbel röstning.
Man kräver också att personer som är registrerade på två platser i förväg ska välja vilken plats de ska rösta i vid kommande allmänna val.
Labours skuggminister för valdeltagande, Cat Smith, sade att röstning två gånger var ett allvarligt brott och polisen behövde ha resurser för att kunna åtala människor som misstänks för det.
Men hon varnade för en reflexion med tanke på ökningen av registrering och valdeltagande, särskilt bland yngre väljare.
"Ett totalförbud mot att vara registrerad på två adresser skulle utesluta dem som av arbets- eller studieskäl måste registreras på två platser", sade hon. "Detta kan inte vara ett försök att göra det svårare för ungdomar och studenter att registrera sig för att rösta."
Rapporter om folk som röstar mer än en gång i juni val är "doubling" men det finns få tecken på utbredd missbruk, val vakthund har sagt.