HM Revenue and Customs sa att det fanns 13 miljoner nya konton öppnade 2014-15, en minskning från 13,5 miljoner året innan.
Siffran, den lägsta sedan 2004–2005, kommer att bli en besvikelse för statskassan, som försöker uppmuntra fler människor att spara.
Det kommer trots en ökning av det belopp sparare kan lägga i en Isa.
I juli förra året höjdes det maximala abonnemangsbeloppet till 15.000 pund för både kontanter och aktier i Isas.
Den nuvarande gränsen är £15,240.
Räkenskaperna är fria från både inkomst- och kapitalvinstskatt.
En orsak till nedgången kan vara att sparräntorna har varit så låga att det inte ger några större fördelar att vara skattefri.
Faktum är att en typisk ettårig fast ränta kontanter Isa erbjuder en 1,75% avkastning, medan omkring ett år sparobligationer erbjuder så mycket som 2%.
Men Junior Isas, för dem under 18 år, visade sig vara populärare.
År 2014-15 öppnades 510 000 nya konton, från 432000 året innan.
Av besparingar som redan finns i Isas hålls 80 % kontant och 20 % i aktier och andelar enligt HM Revenue och Customs.
Den genomsnittliga investeringen är 6064 pund.
Antalet vuxna som tar ut individuella sparkonton (Isa) har sjunkit till sin lägsta nivå på tio år, enligt officiella siffror.