Edward Maher förhörde den soldat som ansvarade för riskbedömningen under övningen i juli 2013.
Han sa att instruktörer inte märkte på nästan en timme att hans son, L/Cpl Edward Maher, var "överskådlig, över tid, och ur spåret" på marschen.
Medreservister L/Cpl Craig Roberts och Cpl James Dunsby dog också.
L/Cpl Mahers far ifrågasatte varför en soldat, känd som 1B för att skydda sin identitet, inte insåg att hans son hade gått "ur spåret" förrän 16:10 BST när han hade förväntats vid nästa kontrollpunkt vid 15:34 BST.
Soldat 1B förklarade att han bara hade märkt L/Cpl Mahers spårningsenhet på skärmen vid den tidpunkten.
Mr Maher sa: "De var försenade, övertid, ur spåret... tror du att din process hade misslyckats?"
"Vid den tiden, sir, nej jag [inte]", svarade soldaten.
Tidigare på tisdagen sa soldat 1B att det inte var i hans tankeprocess att stoppa testet eftersom de flesta soldater klarade sig bra under testet på 26 kilometer på en av årets hetaste dagar.
Han berättade för förhöret i Solihull att av de 78 reservister som deltog den dagen hade sex dragit sig tillbaka tidigt på eftermiddagen - två av medicinska skäl.
Men han sa att han inte var orolig eftersom kursen var "tuff".
"De var alla slutföra marschen i tid.... vid den tiden de två skadade hade återhämtat sig inom 10 minuter... ingen av de kvalificerade läkare där berättade för mig att de behövde kvalificerad hjälp," sade han.
"Alla de andra löpare var alla inom tid... som inkluderar Craig, som inkluderar Ed, som inkluderar James.
"Var det larmklockor i mitt huvud vid den tiden? Nej, det fanns det inte."
David Turner QC, som representerar Cpl Dunsbys änka Bryher, frågade 1B om han skulle ha fortsatt marschen om befälhavare 1A hade berättat för honom om värmeskadorna.
"Jag skulle ha tittat på vad som pågick... alla pressar sig själva... det krävs en annan typ av person att verka inom den teatern, på den tiden skulle jag ha sagt att det inte skulle ha varit i min tankeprocess att stoppa den marschen", sade han.
Soldat 1B sade att han sade till kandidater att vara medveten om det varma vädret och stigande temperaturer, men han ansåg inte värmeuttömmande vara en större risk än normalt.
Han sade också att han inte var medveten om ny vägledning om värmeskador och när en övning bör stoppas, efter en marin död under liknande omständigheter 2008.
Utredningen fortsätter.
Fadern till en reservist som dog efter att ha försökt en SAS urval övning i Brecon Beacons har berättat en begäran processer "misslyckades" den dagen.