Det betyder att serien totalt kommer att försöka köra mer än 700 miles i temperaturer på upp till 30 C.
Betydelsen av siffran 27 kommer från antalet år Nelson Mandela tillbringade i fängelse.
Anti-apartheid-kampanjen var Sydafrikas president 1994–1999 innan han avled 2013 i åldern 95 år.
Izzard sade att han var "glad" att ta sig an utmaningen men tillade: "Självklart 27 maraton på 27 dagar är ingenting jämfört med vad Nelson Mandela gjorde genom att avtjäna 27 år i fängelse.
"Han var en stor själ och lämnar ett fantastiskt arv för världen."
Under sina maraton kommer Izzard att utforska Sydafrikas och Nelson Mandelas historia, samt besöka samhällen, organisationer och familjer som alla har fått hjälp av arbetet med Comic Relief och Sport Relief.
Hans resa ska avslutas den 20 mars när han anländer till Union Buildings i Pretoria där Nelson Mandela höll sitt installationstal som Sydafrikas första demokratiskt valda president.
Izzard, 54, försökte tidigare en liknande bedrift i Sydafrika 2012, men var tvungen att dra sig ur av hälsoskäl.
Han avslutade också 43 maraton på 51 dagar över hela Storbritannien för Sport Relief under 2009, höja över 1,8m i processen.
Izzard talade om sina tidigare försök och sade: " Jag försökte göra detta för fyra år sedan och misslyckades. Den här gången kommer jag att lyckas.
"Men om jag misslyckas, kommer jag tillbaka om och om igen och igen tills jag lyckas. För det är vad Nelson Mandela skulle ha gjort."
De maraton kommer att täckas på BBC Three, som är på väg att gå från TV till online.
Sporthjälp ger pengar till missgynnade människor i några av världens fattigaste samhällen.
Den äger rum vartannat år, alternerande med Red Nose Day.
Eddie Izzard kommer att försöka köra 27 maraton i 27 dagar genom Sydafrika för Sport Relief, har BBC meddelat.