De fördes till huvudstaden Lima med flyg från en isolerad dal i Amazonasregionen.
Armén sa att deras kolonn hade gömt sprängämnen och vapen nära en rörledning som förbinder ett gasfält till huvudstaden.
Förra månaden befriade armén 39 fångar, främst kvinnor och barn som hade hållits som slavarbete av gruppen efter att ha blivit kidnappade.
Några av fångarna sa att de hade gripits för 30 år sedan.
Försvarsministeriet sade att 26 av dem var barn, av vilka några hade fötts i fångenskap.
Offren sa att de var tvungna att arbeta på fält.
De två stridskolonnen hade varit verksamma i Shining Path Heartland - ett hörn av den peruanska Amazonas korsas av tre viktiga floder som kallas VRAEM (dalen av Apurimac, Ene och Mantaro floder).  Det är Perus största kokainproducerande region.
Shining Path avvecklades till stor del efter tillfångatagandet av sin ledare, Abimael Guzman, 1992.
Men i Amazonas slutna djungel har gruppen visat sig vara svår att förstöra helt och hållet.
Regeringen uppskattar att det fortfarande finns 350 medlemmar av Shining Path kvar.
Den peruanska regeringen har meddelat att två ledare för den maoistiska gerillagruppen, Shining Path, tillfångatagits.