Böterna är de största i Kinas företagshistoria och kommer att kräva att företaget sänker royaltyavgifterna på patent som används på Kinas mobiltelefonmarknad.
Flytten kan hjälpa kinesiska smartphone beslutsfattare Xiaomi och Huawei.
Qualcomm sade i måndags att det inte skulle bestrida utslaget att det bröt Kinas anti-monopol lag.
"Även om Qualcomm är besviken på resultaten av undersökningen, är det glädjande att NDRC (National Development and Reform Commission) har granskat och godkänt företagets rättelse plan," teknikjätten sade i ett uttalande på måndag.
Företaget, som är den största leverantören av chips som används i smartphones, kommer nu att ta ut royalties baserat på 65% av försäljningspriset för telefoner i Kina, i stället för på hela priset.
Kinas expanderande 4G-nätverk med hög hastighet driver efterfrågan på världens största smartphone-marknad, där Qualcomm som nyckelspelare.
Chip jätten gjorde ungefär hälften av sina globala intäkter på $ 26,5 miljarder i Kina under sitt senaste räkenskapsår.
Nyheten om avtalet sände bolagets aktier i New York upp 2,8% i efterhandel.
Företaget ökade också sin vinst- och intäktsprognos för det innevarande räkenskapsåret.
Verkställande direktör Steve Mollenkopf sade att han var glad att resolutionen hade tagit bort "osäkerhet" omgivningar sin verksamhet i Kina.
"Vi kommer nu att fokusera vår fulla uppmärksamhet och resurser på att stödja våra kunder och partners i Kina och fullfölja de många möjligheter som ligger framför oss", sade han.
Den amerikanska chipmakern Qualcomm kommer att betala 975 miljoner pund (640 miljoner pund) till kinesiska myndigheter för att avsluta en 14 månaders antitrustundersökning av sina patentlicenser.