Offret, som inte kan namnges för att skydda sin säkerhet, misshandlades i mer än 10 år och fick två barn.
Våld mot kvinnor är endemiskt i Afghanistan och offer för sexuella övergrepp fängslas ofta själva för "moraliska brott".
Jag träffade offret, som är i tjugoårsåldern, för första gången förra året efter rättegången mot hennes far avbröts med domaren som bad om DNA-bevis.
Hon var gravid till följd av misshandeln och höll sin fyraåring i knät.
"Det här är min dotter och min fars dotter", sa hon. "Hon är resultatet av att min far våldtog mig. Vi är både mor och dotter och systrar på samma gång."
När solljuset strömmade genom de dragna gardinerna i det fattiga hem som hon delar med sin mor, berättade hon den historia som hon hade presenterat i rätten för första gången förra sommaren.
Enligt offret började övergreppet när hennes far återvände från Iran efter åtta år utomlands. Hon var 12 år.
"Jag förväntade mig att min far kommer att älska mig som mina farbröder älskar sina barn för att jag var törstig på en pappas kärlek under alla de år jag berövades honom", säger hon. "Men när jag befann mig i min fars armar var det för mycket."
Hon minns hur han rörde henne intimt och fick henne att känna sig obekväm.
"Jag gick till min mormor och klagade men hon skyllde på mig. Jag fick höra att varje far smeker sina barn."
En kväll våldtog hennes far henne: "Jag var jätterädd, jag blev chockad och låg i hörnet av rummet och visste inte vad jag skulle göra."
När hon blev gravid flyttade fadern familjen till en annan provins. Barnet föddes men han tog det ifrån henne - hon såg det aldrig mer.
Missbruket varade i mer än 10 år, under vilken dottern gick igenom flera graviditeter och aborter. Hon säger att hennes far använde en mängd olika läkemedel som hon senare fick lära sig var försök till preventivmedel.
Till slut föddes ett annat barn. "När jag blev gravid igen behöll jag barnet och aborterade inte mitt barn", säger hon: "Jag behöll det för att ha bevis för mina påståenden mot min far - mitt barn var mitt enda bevis."
Med sin mors stöd lyckades hon till slut få slut på övergreppet. Den sista attacken, berättade hon, inträffade i juli förra året, en dag före Eid.
"Jag och min mor hade berättat hela historien för mulla, grannäldste och distriktspolisen och de sa åt oss att informera dem om jag blev attackerad igen."
Den kvällen skickade fadern ut sin fru ur hemmet innan han överföll sin dotter igen. Han greps när modern återvände med polisen och de äldste som vittnen.
Även om han ställdes inför rätta, var dotterns prövningar långt ifrån över.
Eftersom fadern förnekade alla anklagelser och påstod att hans dotter hade utomäktenskapliga förbindelser med andra män, ifrågasattes offret själv i rätten.
"Domaren frågade mig varför jag inte dödade barnet i min mage?" Hon berättade det för mig. "Jag svarade att om jag dödade barnet kunde jag anklagas för att avbryta det eftersom fadern var en annan person. Jag behöll mitt barn för att bevisa att jag har ett mål mot min far."
Rätten avbröt sedan rättegången och bad om DNA-prover på den anklagade, offret och hennes dotter.
Det som följde var en kampanj för att söka rättvisa.
Offret hade tagit det ovanliga steget att visa sig i den afghanska televisionen för att berätta sin historia. Kvinnorättsaktivister började organisera stöd.
Det finns praktiskt taget inga anläggningar för genetisk rättsmedicinsk testning i Afghanistan, vilket gör utländskt bistånd absolut nödvändigt.
Kvinnans anhängare lobbade ambassader och icke-statliga organisationer för hjälp, Men det tog fortfarande nästan ett år innan ett DNA-test kunde ordnas, vid vilken tid offret hade fött ett annat barn.
Slutligen tog en kommitté bestående av tjänstemän från justitieministern och inrikesdepartementet på sig uppgiften.
– De tog blod- och salivprover från fadern, kvinnan och hennes barn och överförde dem till USA via Bagrams flygbas, säger Ruhulla, offrets advokat. "Om vi inte hade fått detta testresultat, skulle min klient ha straffats utifrån landets koder och lagar", säger hon.
Proverna behandlades av det amerikanska företaget "Ideal Innovations", specialister på rättsmedicinska tester som också är verksamma i Afghanistan, ger fingeravtryck och biometrisk identifiering teknik. De gjorde testet gratis.
När resultaten slutligen kom tillbaka, visade de att den anklagade verkligen hade fött sin dotters barn. Domaren dömde honom till döden.
Fallet är dock ännu inte avslutat. Fadern överklagar domen och protesterar mot sin oskuld.
DNA-bevis är mycket sällsynta i afghanska rättsfall, vilket gör denna rättegång mycket ovanlig.
Offret berättade för mig att även om hennes förövare avrättas, så är hon fortfarande rädd.
"Jag är så orolig för mina barns framtid", säger hon, "Vad ska jag berätta för dem när de är äldre och fråga mig om deras far?"
En afghansk domstol har avkunnat en avgörande dom med hjälp av DNA-bevis för att döma en man för flera våldtäkter på hans dotter.