En del av Dunsdale Haugh i Selkirk ska stängas med en avledningsväg på plats via Level Crossing Road.
Stängningen, med start den 3 maj, kommer att se en ny översvämningsskyddsvägg byggas och en kulvert installeras.
Scottish Borders Council sade att ett "betydligt arbete" hade gått in på avledningsvägen för att undvika störningar.
Flodskyddssystemet - som kommer att skydda nästan 600 fastigheter i staden mot en större översvämningshändelse - kommer att vara slutfört i slutet av detta år.
Ledamot Gordon Edgar sade: "Selkerk Flood Protection Scheme är nu mindre än ett år från slutförandet och kommer att erbjuda långsiktigt skydd till stora områden i staden.
"Programmets effektivitet har redan bevisats under de senaste vinterstormarna."
Han betonade att företagen i området kommer att förbli öppna under avstängningen av vägarna.
Rådet tillade att arbetet på Selkirk kommun återvinning centrum - som var stängd för att tillåta avledning vägen att passera genom sin gamla plats - var "progress bra" med anläggningen som ska öppnas i slutet av juni.
En gränsstad står inför en 20-veckors stängning av vägarna i takt med att arbetet med sitt översvämningsskyddssystem på 31,4 miljoner pund fortsätter.