Guineaner förväntas fira landmärket med konserter och fyrverkerier.
Sjukdomen dödade mer än 2.500 människor i landet och ytterligare 9.000 i Sierra Leone och Liberia.
Sierra Leone förklarades fri från ebola i november, men nya fall har dykt upp i Liberia, som hade förklarats fri från ebola i september.
Ett land anses fritt från mänsklig överföring när två 21-dagars inkubationsperioder har passerat sedan det senast kända fallet testades negativt för en andra gång.
Sjukdomen har haft en enorm social och ekonomisk inverkan på Guinea, säger BBC:s Ibrahima Diane i Conakry.
Enligt FN har 6 220 guineanska barn förlorat en eller båda föräldrarna till Ebola.
Mer än 100 hälso- och sjukvårdspersonal miste också livet i kampen mot sjukdomen.
Samtidigt lever överlevande fortfarande i rädsla för stigmatisering och långsiktiga biverkningar i samband med viruset, tillägger vår korrespondent.
Kampen mot ebola var särskilt svår i Guinea, säger han.
Vissa samhällen trodde till en början inte att det fanns någon epidemi, medan andra skyllde den på västländerna och de guineanska myndigheterna.
Regeringen har skyllt på viruset för dåliga ekonomiska resultat och säger att det också har fått människor att misstro landets hälso- och sjukvård.
President Alpha Conde har fördubblat hälsobudgeten sedan han vann omvalet i november.
Guinea kommer att förklaras fritt från ebola av Världshälsoorganisationen (WHO), två år efter det att epidemin började där.