Besökarna gick nära efter 15 minuter när Reuben Reid tvingade Matt Macey till en räddning på hans nära post.
Luton hotade sporadiskt i öppningen halvtimme, Jonathan Smith volleying över och Jordan Cook smalt missa målet med en 30-yards frispark.
Exeter målvakt Bobby Olejnik gjorde en fin räddning för att hålla ute Jack Marriott huvud, innan Hylton missade uppföljningen.
Efter pausen blockerades Reids skott på nära håll av försvararen Alan Sheehan, med anfallaren som sedan sköt sorgset över toppen från åtta meter.
Besökarna tog ledningen strax före timtalet när Jack Stacey tog Jake Taylor för att lugnt slå Macey.
Luton tryckte på för en equalizer och efter Ollie Palmer såg hans ansträngningar rensas bort av Luke Croll, substitutet för Hylton att driva en header hem i 68: e minuten.
Hylton hade en ansträngning uteslutits för offside, medan Macey nekade Ollie Watkins i andra änden som ingen sida kunde hitta en vinnare.
Rapport från Pressföreningen.
Matchen slutar, Luton Town 1, Exeter City 1.
Andra halvlek, Luton Town 1, Exeter City 1.
Försöket räddades. Ollie Palmer (Luton Town) höger fotade skott från vänster sida av lådan sparas i mitten av målet.
Alan Sheehan (Luton Town) vinner en frispark i den defensiva halvan.
Foul av Ollie Watkins (Exeter City).
Hörnet, Exeter City. Förföljd av Alan Sheehan.
Substitution, Exeter City. Matt Oakley ersätter Jake Taylor.
Hörnet, Exeter City. Förföljd av Matt Macey.
Försöket räddades. Ollie Watkins (Exeter City) höger fotade skott från höger sida av lådan sparas i nedre högra hörnet.
Jack Senior (Luton Town) visas det gula kortet för en dålig foul.
Foul av Jack Senior (Luton Town).
David Wheeler (Exeter City) vinner en frispark i den defensiva halvan.
Substitution, Luton Town. Olly Lee ersätter Jordan Cook.
Glen Rea (Luton Town) vinner en frispark i anfallshalvan.
Foul av Jake Taylor (Exeter City).
Foul av Danny Hylton (Luton Town).
Luke Croll (Exeter City) vinner en frispark i defensiva halvan.
Hörnet, Luton Town. Förföljd av Troy Brown.
Substitution, Exeter City. Jordan Tillson ersätter Reuben Reid.
Försök missade. Ollie Palmer (Luton Town) vänster fotade skott från mitten av lådan är nära, men missar till vänster.
Hörnet, Luton Town. Förföljd av Troy Brown.
Jack Senior (Luton Town) vinner en frispark på högerkanten.
Stöld av David Wheeler (Exeter City).
Försöket räddades. Glen Rea (Luton Town) huvud från mitten av lådan sparas i mitten av målet.
Hörnet, Luton Town. Förföljd av Jack Stacey.
Foul av Ollie Palmer (Lutonstaden).
Jack Stacey (Exeter City) vinner en frispark på vänsterflygeln.
Mål!  Luton Town 1, Exeter City 1. Danny Hylton (Luton Town) header från mycket nära håll till nedre vänstra hörnet. Hjälpt av Ollie Palmer.
Ollie Palmer (Luton Town) träffar baren med en vänster fotad skott från mitten av lådan.
Substitution, Luton Town. Ollie Palmer ersätter Luke Gambin.
Hörnet, Luton Town. Förföljd av Luke Croll.
Försök blockerat. Jordan Cook (Luton Town) höger fotade skott från mitten av lådan är blockerad.
Pelly Rudock (Luton Town) vinner en frispark i anfallshalvan.
Foul av Jake Taylor (Exeter City).
Jack Senior (Luton Town) vinner en frispark i den defensiva halvan.
Stöld av David Wheeler (Exeter City).
Handboll av Reuben Reid (Exeter City).
Mål!  Luton stad 0, Exeter stad 1. Jake Taylor (Exeter City) höger fotade skott från mitten av lådan till nedre vänstra hörnet. Hjälpt av Jack Stacey.
Hörnet, Luton Town. Förföljd av Craig Woodman.
Handboll av Jonathan Smith (Luton Town).
Danny Hyltons equalizer mot Exeter City hjälpte Luton Town att rädda sin fjärde dragning i sex League Two matcher.