Malka Leifer, före detta rektor för en judisk flickskola i Melbourne, flydde till Israel 2008 efter anklagelser mot henne.
Ms Leifer säger att panikattacker hindrar henne från att komma till domstol. Utlämningsförhören har hittills försenats i två år.
Baserat på en psykiatrisk rapport har en domare beslutat att Leifer inte kommer att ställas inför rätta förrän hon avslutat behandlingen.
Leifer påstås ha våldtagit och oanständigt överfallit flickor vid den ultraortodoxa Adass Israel School i Melbourne i Australien.
Rätten i Jerusalem har också lyft sitt husarrest, vilket innebär att hon kommer att kunna röra sig fritt för första gången sedan den israeliska polisen arresterade henne 2014. Åklagarna förväntas överklaga detta beslut.
Leifer inleder en första behandlingsperiod på sex månader innan en kommitté bedömer om hon kan ställas inför ett framtida utlämningsförfarande.
"Vi är fast beslutna att se denna kvinna utlämnas till Australien för att möta dessa mycket allvarliga barn sexuella övergrepp anklagelser," Australiens ambassadör i Israel, Dave Sharma, berättade Australian Broadcasting Corp.
"Vi är fast beslutna att vara tålmodiga och uthålliga i detta syfte med sikte på att få se henne utlämnad."
En israelisk kvinna som anklagas för 74 sexuella övergrepp mot barn i Australien är mentalt olämplig att bli utlämnad, säger en domstol.