I måndags förnekade Robinson, som nu råder ekonomiministern, alla familjelänkar till incitamentet för förnybar värme.
MLA Jonathan Bell sade att han fick veta att han inte kunde bestrida systemet eftersom två DUP-speciella rådgivare hade "extensiva intressen inom fjäderfäindustrin".
Bell framförde anklagelsen i måndags och talade under parlamentariskt privilegium.
DUP sa att påståendena var "överraskande".
Men på tisdagen berättade Robinson för Pressföreningen att hans svärfar ansökte om detta i augusti 2015, innan han gifte sig i oktober.
"Jag har aldrig haft något personligt ekonomiskt intresse i RHI Scheme", sade han i ett uttalande.
"Jag har aldrig gett någon råd om att gå med i planen eller på något sätt försöka dra nytta av den.
"Varken min fru eller jag har någonsin haft någon roll i verksamheten eller vi har fått någon nytta, ekonomiska eller andra, av verksamheten.
"Jag utsågs till rådgivare vid avdelningen för ekonomi i juni 2016. Jag var inte involverad i någon aspekt av RHI Scheme innan jag tillträdde tjänsten."
Den andre rådgivaren som hette Bell, Timothy Johnston, förnekade också sina påståenden.
MLA diskuterade RHI-systemet i Stormont.
RHI-systemet inrättades av den tidigare förste ministern Arlene Foster 2012 när hon var företagsminister.
Syftet var att öka förbrukningen av värme från förnybara källor.
Företagen fick dock mer i subventioner än de betalade för bränsle, och systemet blev kraftigt övertecknat.
Det kan leda till ett överskott på 490 miljoner pund under de kommande 20 åren.
Bell sade när han var företagsminister till sin särskilde rådgivare Timothy Cairns: "Han kommer inte att tillåtas sänka tullarna på systemet (RHI)" på grund av Johnston och Robinsons "extensiva intressen inom fjäderfäindustrin".
Han tillade att han "höll skivorna i många, många format" och att han hade blivit avstängd från partiet för att ha "berättat sanningen".
Han hävdade också att Robinson och dr Andrew Crawford, rådgivare för DUP-partiet, hade gett instruktioner om att "försöka att inte få Arlene kallad till Public Accounts Committee (PAC)" och "under inga omständigheter låta Jonathan Bell kallas" över sina roller i RHI-systemet.
I måndags sade DUP att varken Johnston eller Robinson har intressen inom fjäderfäindustrin, och tillade att Robinsons "familjehemsgård har hönshus men inte ingår i RHI-systemet och aldrig har varit mottagare eller sökande".
Johnston, den särskilde rådgivaren till Arlene Foster när hon var förste minister, sade: "Jag har inga familjekontakter med fjäderfäindustrin och jag har ingen koppling till RHI-systemet.
"Det här är ogrundade anklagelser. Jag har två svåger inom fjäderfäindustrin. De har ingen koppling till RHI."
Robinson, särskild rådgivare åt ekonomiministern Simon Hamilton, sade: " Jag har inget personligt intresse för fjäderfäindustrin. Två av mina bröder är fjäderfäuppfödare men de har inga kopplingar till RHI."
Dr Crawford, tidigare särskild rådgivare till finansministeriet, berättade för BBC förra månaden att hans bror är direktör för ett företag som framgångsrikt ansökte om RHI-systemet.
Han sade: "Jag försökte aldrig hålla RHI-systemet öppet i den ursprungliga högre tariffen mot ministerns vilja."
Mr Bell bröt leden med sitt parti och gjorde allvarliga anklagelser mot DUP om systemets verksamhet i en BBC-intervju i december.
Han hävdade att DUP-rådgivare hade försökt ta bort Fosters namn från dokument kopplade till RHI.
Mr Bell blev senare avstängd från DUP.
Den svågerfar till före detta DUP-chef för kommunikation John Robinson driver två gröna energipannor inom ramen för ett missriktat energisystem.