Scrum-halv Murray tog ett hårt slag mot huvudet i en tackling men tilläts att återvända till fältet efter att sent skickas för en bedömning.
Men Munster säger att Murray inte visade några tecken på hjärnskakning.
Nyligen fann man att Northampton hade brutit mot reglerna genom att låta George North spela vidare efter en huvudskada.
Försäljning utreds för närvarande för en incident som involverar TJ Ioane.
Arrangörerna av European Cup bekräftade för BBC Sport att en granskningsgrupp för Untoward Incident kommer att sammankallas tidigt denna vecka för att avgöra om Munster hade brutit mot hjärnskakningsprotokollen.
Munster insisterar Murray bedömdes vid tidpunkten för händelsen och verkade inte vara hjärnskakning.
Klubben sa att efter ytterligare granskning av filmen av Munster läkare, togs han bort för en huvudskada bedömning som en försiktighetsåtgärd. Han passerade det och återvände till spelplanen och därefter passerade en andra huvudskada bedömning efter matchen.
Den 14-12 seger över Glasgow innebär Munster är nu garanterat att topp Pool One, tätning en kvartsfinal plats i Europas elit turnering för 16: e gången på 22 säsonger.
Munster kommer att undersökas över deras hantering av Conor Murrays huvudskada i European Champions Cup seger över Glasgow på lördag.