Wick Joint Campus byggs för att ersätta Wick High School och Pulteneytown och South primaries.
Den kommer också att ha samhällsresurser som kommer att vara tillgängliga för allmänheten.
Highland Council sade att dess entreprenör Hub North Scotland (Wick) Ltd hade informerat den om förseningar som påverkar slutförandet av anläggningen.
Den lokala myndigheten sade: " Tyvärr verkar det osannolikt att campus kommer att vara redo att öppna i oktober, som planerat.
"Highland Council har för avsikt att erbjuda bästa möjliga faciliteter för barn och personal, och kommer inte att acceptera dessa byggnader förrän arbetet är slutfört.
"Rådet arbetar tillsammans med uppdragstagaren för att fastställa tidigast möjliga datum för slutförandet av hela Wick Joint Campus-projektet, och kommer att göra ytterligare tillkännagivanden så snart som möjligt."
Ett nytt 48,5 miljoner pund skola campus i Highlands är osannolikt att öppna i oktober som planerat, Highland Council har sagt.