Han fängslades i sitt hem i Moskva tidigare i måndags, inför antikorruptionsdemonstrationer i Ryssland.
Hundratals människor hölls under sammankomsterna över hela landet.
Upploppspolisen i centrala Moskva valde ut demonstranter ur folkmassan på måfå, har en BBC-korrespondent vid demonstrationen sagt.
En domstol i Moskva meddelade sin dom sent på måndagen och avvisade krav från Alexei Navalnys försvarsadvokater att lägga ner målet.
Den 41-årige oppositionsledaren bekräftade senare detta i en tweet på sin Twitter-sida (på ryska).
Navalny, som har för avsikt att ställa upp i det ryska ordförandeskapet nästa år, skulle ha deltagit i det otillåtna mötet i huvudstaden tidigare på måndagen.
OVD-Info, en oberoende icke-statlig organisation, sade att 825 personer hade fängslats vid protesterna i huvudstaden.
Polisen i Moskva säger att omkring 5 000 deltog i demonstrationen där, rapporterar Interfax nyhetsbyrå.
OVD-Info sade också att hundratals personer hölls i St Petersburg.
Rysslands inrikesministerium säger att omkring 3.500 personer deltog i protesten i den nordvästra staden, och 500 fängslades.
Detta var en märklig protest.
Först var det svårt att avgöra vem som deltog. Tverskaya Street var full av familjer som markerade Russia Day med underhållare i historiska kostymer.
Sedan dök tusentals demonstranter upp. Ett stort antal upploppspoliser var precis bakom dem.
Först meddelade de att rallyt var olagligt då arresteringarna började. Vi såg dussintals människor som rycktes ur folkmassan - många av dem unga - och släpades grovt mot polisbussar.
Genom att kalla folk till ett otillåtet möte visste Alexei Navalny att han riskerade en konfrontation. Polisen är skyldig.
Men folk jag pratade med sa att de kände till risken och ändå ville att deras röster skulle höras. Bland annat ramsade dessa röster högt: "Putin, tjuv!" och "Ryssland kommer att vara fritt".
I en direktsändning från den ryska liberala TV-kanalen Dozhd hördes demonstranter i S:t Petersburg ropa "skammen" då de fängslades av polisen. Bland dem som arresterades var Maxim Reznik, stadens lagstiftande församlings ställföreträdare.
Den framträdande aktivisten Daniil Ken sa att han blev arresterad när han lämnade sitt hem i S:t Petersburg. Han uppmanade människor att ansluta sig till rallyt på stadens Champ de Mars torg. "Kör för mig, snälla!" Tweetade han. Han har blivit frisläppt sedan dess.
Polisen hade tidigare fängslat flera personer vid demonstrationer i städerna Vladivostok, Blagovesjtjensk och Kazan.
Navalny uppmanade ryssarna att gå ut på gatorna på måndagen - Rysslands dag - för att uttrycka sin ilska över påstådd korruption på högsta nivå.
Antikorruptionskampanjen använder YouTube, tweets och bloggar för att nå ny publik.
En video som publicerades i mars anklagar Rysslands premiärminister Dmitrij Medvedev för att ackumulera en enorm privat förmögenhet. Medvedev förnekar påståendena. Videon, som innehåller anklagelsen att statsministern har ett ankhus på en av sina fastigheter, har setts nästan 23 miljoner gånger.
I en uppmaning till människor att ansluta sig till honom på måndagen skrev Navalny: " Jag vill ha förändringar. Jag vill leva i en modern demokratisk stat och jag vill att våra skatter ska omvandlas till vägar, skolor och sjukhus, inte till yachter, palats och vingårdar."
Navalny fick tidigare tillstånd att hålla ett möte på Sacharova Avenue men ändrade platsen - utan tillstånd - strax före demonstrationen till Tverskaya Street, nära Kreml.
Protesten kallades över regeringen planer på att riva sovjetiska-era hyreshus i staden.
Tillstånd beviljades för demonstrationer på 169 platser över hela landet, varav några sändes live på Navalny Live YouTube-kanalen.
Protesterna sammanföll med en rad officiella evenemang - inklusive festivaler, konserter och militära handlingar - som ägde rum över hela landet för att markera Rysslands dag, den nationella högtiden tillägnad 1990 års självständighetsförklaring.
Liknande möten leddes av Navalny i mars och ledde till hundratals arresteringar.
Dessa protester var de största sedan 2012, och drog tusentals människor - däribland många tonåringar - till möten över hela landet, upprörda av en rapport som publicerades av Navalny som anklagade premiärminister Dmitrij Medvedev för korruption.
Rysslands oppositionsledare Alexei Navalny har dömts till 30 dagars administrativt gripande för upprepade brott mot lagen om iscensättande av möten.