Båda männen gick i pension på 105 när de straffade en tröttsam elev attack.
Donald, 19, är den näst yngsta spelaren som når tre siffror för Glamorgan.
Skivan hålls fortfarande av Mike Llewellyn, som var 18 år när han gjorde ett sekel mot Cambridge University 1972.
Donald hade tidigare gjort 98 i den sista matchen i säsongen 2015 mot Gloucestershire.
"Det var trevligt att ticka av det, det har trängt över mig lite under vintern.  Det är verkligen speciell, trevligt att komma över linjen i den första matchen för säsongen," Donald berättade BBC Wales Sport.
"Trevligt för Dai också, att ha två jungfru första klass ton i ett spel var en ganska bra insats."
Lloyd, vars tidigare bästa var 92 i Northampton 2015, nådde sitt århundrade med en sexa.
"Jag var bara glad att komma över linjen, och för Aneurin också", sade han.
"Förra säsongen var en språngbräda för mig och förhoppningsvis kan jag gå ett steg längre med slagträ och boll."
Parets run-scoring bedrifter kommer sannolikt att ge ett svårt urval beslut för Glamorgans Championship öppnare mot Leicestershire, med Sydafrika internationella fladdermöss Colin Ingram ännu kommer i sidan.
"Förhoppningsvis har vi satt upp oss där för urval. Det handlar om att vara i mixen, och du kan inte be fler av oss själva att både få hundratals, "sade Donald.
"Vi accepterar i år kommer det att bli mer konkurrens om platser som är en stor sak för klubben, driver oss som smetar och bowlare."
Donald kunde fortfarande slå Matthew Maynard rekord för det yngsta Championship århundradet, uppnås 1985.
Tidigare Glamorgan topp order hade alla tillbringat tid på Wicket utan att gå vidare för att göra stora poäng, som James Turpin och Alex Thomson hävdade två Wickets styck.
De run-scoring bedrifter kom efter dag en av de tre-dagars match spolades ut.
Glamorgan fladdermöss Aneurin Donald och David Lloyd båda slog jungfru första klass århundraden som de staplade upp 444-7 mot Cardiff MCCU.