Den 33-årige tar över rollen från Charlotte Burton, som han hjälpte förra säsongen tillsammans med sina coaching åtaganden på Brighton College.
Seamer Anyon tog 199 wickets i 63 första klass framträdanden för Sussex mellan 2010 och 2014 och gick i pension förra året på grund av en knäskada.
Han kommer också att träna kvinnornas under-19 och under-21 sidor.
"Detta är en stor möjlighet att fortsätta arbeta med Sussex", sade han.
"Kvinnospelet växer snabbt och jag ser fram emot att ta med mina egna erfarenheter från professionell cricket och använda dem för att hjälpa flickorna."
Alexia Walker, Sussexs mest kapade kvinnliga spelare och tränare på den under 17-sidan, kommer att ta på sig roller med de äldre, under 21 och under 19 sidor.
Sussex har utsett James Anyon till huvudtränare för sina kvinnor.