Ashton Carter, USA:s försvarsminister, sade att omkring 90 personer utbildades på en säker plats, och att de skulle få betalt av Förenta staterna.
Han sade att fler soldater snart skulle börja träna på platser i Jordanien, Turkiet, Qatar och Saudiarabien.
Att stödja trupperna militärt på slagfältet har inte uteslutits.
Nästan 4.000 fighters anmälde sig frivilligt till programmet, men efter en omfattande screeningprocess fick endast 400 platser.
"Vi börjar med de människor som vi har som vi har granskat mycket noggrant," Mr Carter sade, "Vi förväntar oss att vara framgångsrik och därför att växa. Men du måste börja någonstans, och det är här vi börjar."
Carter hade svårt att påpeka att styrkans roll skulle vara att ta sig an den islamiska staten och inte president Bashar al-Assads regim. Men han sade inte vad som skulle hända om rebellerna engagerade sig i den syriska armén.
"Vi har ännu inte bestämt alla regler för engagemang... men vi har erkänt att vi har ett visst ansvar att stödja dem", sa försvarssekreteraren.
Krigarna kommer att betalas av Förenta staterna, och när de sätts in kommer de att fortsätta att få stöd och stöd från koalitionsstyrkorna.
Det finns omkring 450 koalitionsstyrkor inblandade i utbildningen på de fyra platserna, däribland omkring 350 amerikaner.
Pentagon har för avsikt att utbilda och beväpna mer än 15 000 rebeller under de kommande tre åren.
Carter klargjorde att stödet kom med stränga villkor.
"En uttrycklig del av deras utbildning är hur man uppför sig på ett sätt som är förenligt med internationell rätt", tillägger: "Allt fortsatt stöd för dem skulle vara starkt beroende av deras fortsatta goda uppförande."
Pentagon skulle inte avslöja när trupperna skulle vara redo att gå in på slagfältet.
Sedan förra året har USA varit en del av en internationell koalition som bedriver en flygstrejkkampanj mot Islamiska staten, som tog över stora delar av Syrien och Irak i en blixtoffensiv.
Den amerikanska militären har börjat utbilda en liten grupp syriska rebeller i ett försök att bygga upp en styrka som kan besegra Islamiska statens militanter.