Många människor har varit ovilliga att söka medicinsk behandling för Ebola, eftersom de fruktar att diagnosen kan betyda döden, eftersom det inte finns något bevisat botemedel.
Ett team på 30 000 människor ska gå från hus till hus för att hitta de smittade och distribuera tvål.
Men kritiker säger att nedstängningen kommer att skada allmänhetens förtroende för läkare.
Under tiden har man i grannlandet Guinea hittat kropparna av åtta saknade hälsoarbetare och journalister som deltog i kampanjen Ebola.
En talesman för regeringen sa att några av kropparna hade hittats från en septiktank i byn Wome. Teamet hade attackerats av byborna på tisdag.
Guineas premiärminister sa att en utredning pågick och lovade att fånga förövarna av "de avskyvärda morden".
Korrespondenterna säger att många bybor är misstänksamma mot officiella försök att bekämpa sjukdomen, och händelsen illustrerar de svårigheter som vårdpersonalen ställs inför.
Sierra Leone är ett av de länder som drabbats hårdast av Västafrikas ebolautbrott, med över 550 offer bland de 2600 dödsfall som hittills registrerats.
I huvudstaden, Freetown, brukade livliga gator vara tysta, och polisen bevakade vägspärrar.
Under utegångsförbudet kommer 30.000 frivilliga att leta efter personer som smittats med ebola, eller kroppar, som är särskilt smittsamma.
De kommer att dela ut stänger av tvål och information om att förhindra infektion.
Tjänstemän säger att teamen inte kommer in i människors hem utan kommer att ringa räddningstjänsten för att hantera patienter eller kroppar.
Volontärer kommer att märka varje hus med ett klistermärke när de har besökt det, säger rapporter.
I enlighet med artikel 11.315 i förordning (EU) nr 1307/2013 ska medlemsstaterna se till att följande villkor är uppfyllda:
Dödsfall - sannolika, bekräftade och misstänkta
(Inkluderar en i USA och sex i Mali)
4,809 Liberia
3 955 Sierra Leone
2 536 Guinea Ordförande
8 Nigeria
På torsdag sa president Ernest Bai Koroma: "Extraordinära tider kräver extraordinära åtgärder."
Han uppmanade medborgarna att undvika att röra vid varandra, att besöka de sjuka eller att inte vara med vid begravningar.
Freetown bosatt Christiana Thomas berättade för BBC: "Folk är rädda för att gå till sjukhuset eftersom alla som går dit testas för Ebola."
En annan invånare i Kenema, i östra delen av landet, berättade för BBC-familjerna att de kämpade därför att priset på mat hade stigit.
Under de timmar som ledde fram till Sierra Leones nedlåsning fanns det trafikgaller i Freetown när människor fyllde på med mat och förnödenheter.
BBC: s Umaru Fofana i Sierra Leone
Städer och städer runt om i landet var tyst utan den vanliga tidiga morgonen Muselman anrop till bön och kakofonin av fordon och motorcyklar som folk vaknar upp till här.
Tusentals frivilliga och hälso- och sjukvårdspersonal har samlats vid utsedda centra i Sierra Leone och börjat flytta in i hemmen.
Men de var tvungna att vänta i timmar innan deras kit - tvålar och flygblad - kunde nå dem.
MP Claude Kamanda, som representerar staden Waterloo i närheten av Freetown, berättade för lokala medier att alla hälsocentraler där var stängda, timmar efter att hälso- och sjukvårdspersonal och frivilliga skulle samlas för utplacering till hem.
Han klagade över att förseningarna inte hjälpte kampanjen.
FN:s säkerhetsråd förklarade på torsdag utbrottet som en "hot mot internationell fred" och uppmanade staterna att tillhandahålla mer resurser för att bekämpa det.
Samtidigt har den amerikanska militären börjat arbeta i Liberias huvudstad Monrovia för att upprätta en flygbro - en länk med flyg - för att ta sjukvårdsarbetare och förnödenheter till drabbade länder.
Förenade kungariket har lovat att hjälpa till att bygga nya vårdcentraler och tillhandahålla 700 nya sjukhussängar i Sierra Leone, även om en majoritet av sängarna kan ta flera månader att komma fram.
Hjälparbetare har välkomnat det brittiska stödet men säger att alla sängar krävs omedelbart, BBC:s internationella utvecklingskorrespondent Mark Doyle rapporterar.
Medicinsk välgörenhet Medecins Sans Frontieres (MSF) har varit starkt kritisk mot lockdown, hävdar att det i slutändan kommer att bidra till att sprida sjukdomen som sådana åtgärder "sluta köra människor under jorden och äventyra förtroendet mellan människor och vårdgivare".
I Sierra Leone pågår tre dagars utegångsförbud för att låta hälso- och sjukvårdspersonalen hitta och isolera fall av ebola för att stoppa sjukdomens spridning.