Catherine Seeley utsattes för övergreppet efter att hon blev biträdd som Sinn Féin-fullmäktigeledamot i Craigavon, County Armagh.
Hon tackade eleverna på Boys' Model School i det lojala området Ballysilan för deras "fullständiga stöd".
Seeley talade vid Sinn Feins årliga konferens i Wexford.
Hon sade: " Under de senaste veckorna, i min roll som lärare, har jag utsatts för en kampanj av sekteristiska hotelser.
"Jag har redan uttryckt mitt varma tack till alla som har erbjudit mig stöd, inklusive familj, vänner, kollegor, utbildare och politiker från olika partier.
"Jag vill ta tillfället i akt att offentligt sända ett budskap av tacksamhet till de elever från Boys' Model School i norra Belfast som modigt har erbjudit mig sitt fulla stöd.
"De är ett vittnesbörd om de värderingar som bör genomsyra inte bara utbildning utan alla aspekter av samhället.  De inger hopp och förtroende för mig inför framtiden."
Hon tillade att hennes senaste erfarenhet hade visat "att elever kan vara mycket klokare, mognare, mer ansvarsfulla och mer respektfulla än vissa som påstår sig tala för deras räkning".
Seeleys beslut att lämna sin tjänst meddelades i fredags i ett gemensamt uttalande av skolans styrelse och Belfast Education and Library Board.
Hon ska flytta till ett annat utbildningsområde.
Den protestantiska koalitionsgruppen hade invänt mot hennes anställning på skolan.
Det sades att hennes roll i skolan borde ses över på grund av hennes politiska åsikter.
Under sitt tal ställde vice premiärministern Martin McGuinness miss Seeleys elever i kontrast till vissa fackföreningspolitikers svar.
"Om denna situation var omvänd och en ung protestantisk lärare som också var en medlem av DUP tvingades från sitt arbete i en katolsk skola, skulle jag vara vid dörren och följa henne till hennes arbete", sade han.
McGuinness uppmanade också dem som han beskrev som "känsliga människor inom fackföreningsrörelsen" att använda sitt inflytande för att säkra en överenskommelse om flaggor, parader och det förflutna.
Sinn Féin President Gerry Adams berättade för delegaterna under sitt anförande på lördagskvällen att frågan om stridslystna apelsinparader fortfarande behövde lösas.
"Även om det kan finnas hinder, vara säker på en sak - förändring kommer inte att stoppas", sade han.
"Jag är glad att träffa Orange Order när som helst för att diskutera dessa frågor.
"Jag vill se Orange behandla sina katolska grannar med respekt.
"Jag vill se det upprätthålla lag och ordning.
"Irlands Orange Order är en av våra nationella traditioner.
"Och Sinn Féin vill att alla våra traditioner befrias från sekterism från alla håll, att leva tillsammans i fred och respekt och med tolerans från alla för alla."
Läraren som slutade sitt jobb på en skola i norra Belfast efter att ha blivit utsatt för sekteristisk misshandel på nätet har talat offentligt för första gången.