Det skotska nationalpartiet hade hävdat att dess Commons-ledare hade stöd av fler parlamentsledamöter än arbetsledaren Jeremy Corbyn.
Det finns för närvarande 54 SNP-parlamentariker, men bara 40 av Labours 229 parlamentsledamöter uttryckte sitt stöd för Corbyn i tisdags.
Talare John Bercow sade att han hade sökt expertråd.
Han sade att Labour "för närvarande utgör" den officiella oppositionen och dess ledare erkänns av talmannen "för lagstadgade och parlamentariska syften" som oppositionens ledare.
Bercow svarade på en ordningsfråga som togs upp av SNP:s parlamentsledamot Pete Wishart, som sade till talmannen att Labour hade förlorat två tredjedelar av sitt skuggskåp och att dess ledare inte längre hade befälet över majoriteten av sina parlamentsledamöter i backbench.
Den SNP MP sade: "Det kan nu längre ge skuggor för stora departement i staten. Det är uppenbart att det inte är i någon form att ta makten och uppfylla dessa viktiga ansvarsområden och skyldigheter enligt Erskine May (den parlamentariska regelboken)."
SNP sade att det skulle kunna fylla alla relevanta skuggposter till regeringen.
Corbyn har ännu inte utsett någon skuggskotsk sekreterare.
Den tidigare etablerade, Ian Murray, har inte ersatts efter att ha blivit en av mer än 20 medlemmar av labours skuggskåp för att sluta tidigare i veckan i ett försök att tvinga Corbyn att avgå.
Corbyn förlorade därefter ett misstroendevotum med 172 röster mot 40 men sade att omröstningen inte hade någon konstitutionell legitimitet och att han inte skulle "förråda" de ledamöter som röstade på honom genom att avgå.
Hans allierade har utmanat Corbyns kritiker att starta en formell ledarskapstävling om de vill ersätta honom.
Tidigare sade Labours skuggkansler John McDonnell - som har förblivit lojal mot Corbyn - att SNP skulle "alltid spela några stunts och det kan man inte klandra dem för".
SNP vann 56 platser vid valet i maj, men Michelle Thomson och Natalie McGarry har sedan dragit sig tillbaka från partiet piska bland polisutredningar.
SNP:s försök att göra den officiella oppositionen i Westminster har förkastats av underhusets talman.