Theresa May har utsett sitt första kabinett efter att ha tagit över David Cameron som avgick som premiärminister på onsdag.
Mundell har varit parlamentsledamot för Dumfriesshire, Clydesdale och Tweeddale sedan 2005.
Han var statssekreterare för Skottland 2010–2015 och blev skotsk sekreterare i maj 2015.
Mundell bekräftades i detta inlägg av fru May.
Han sade: " Det gläder mig att bli återutnämnd till utrikesminister för Skottland och att få möjlighet att bygga vidare på mitt arbete under det gångna året.
"Premiärministern har klargjort att vi måste förena landet och arbeta för allas bästa i Storbritannien.
"Mitt fokus nu är att arbeta med den skotska regeringen för att få den bästa uppgörelsen för Skottland och Storbritannien när vi lämnar EU."
Fru May har gjort stora ändringar i kabinettet, bland annat att utse Brexiter Boris Johnson till utrikesminister; Philip Hammond till kansler och Amber Rudd till inrikesministeriet.
Både Labour och SNP sade att det nya kabinettet var oroande högerflygel.
Nationalist MP Angus Robertson sade: "Det finns allvarliga skäl till oro med en rad utnämningar - vi bevittnar skapandet av en av de mest högerkantiga kabinett i den moderna eran.
"Från Boris Johnson som vår utrikesminister - en man som nu kommer att representera oss på världsscenen - till David Davis som Brexit minister och Liam Fox for Trade, kommer det att vara Brexiters som för den brittiska utrikespolitiken framåt."
Han tillade att även om May talade om social rättvisa hade hennes "mask redan halkat" och "verkligheten är att vi bevittnar en skarp sväng till höger i brittisk politik".
Skottlands enda Labour MP Ian Murray sade: "Trots Theresa May retorik på trappan nummer 10 i går kväll, denna nya Tory kabinett ser ännu mer högerkanten än den som vi precis lämnat kvar.
"Människor i hela Skottland kommer inte att luras av den nya ledningen på toppen av Toryregeringen.
"Deras ekonomiska trovärdighet ligger i spillror efter att ha tagit en chansning med Brexit och de har satt facket på spel, inte bara som ett resultat av denna folkomröstning."
Skottlands enda konservativa parlamentsledamot, David Mundell, har behållit sitt jobb som utrikesminister för Skottland.