"Jag var väldigt nervös och mina ord bara kom ut fel", skrev han på Facebook.
Night Manager stjärnan drog misstro mot sociala medier för ett tal där han hänvisade till hjälparbetare i södra Sudan "binge-watching" programmet.
Den brittiske skådespelaren sade att hans "enda avsikt" hade varit "att hylla [deras] otroliga mod och mod".
"Jag ber om ursäkt för att mina nerver fick övertaget av mig", fortsatte hans post.
Hildleston vann sin första Golden Globe på söndag - för bästa uppträdande av en skådespelare i en miniserie eller TV-film - för sin roll i BBC:s anpassning av John le Carres roman om en hotellchef som var inblandad i vapensmuggling.
Efter att ha tackat sina medstjärnor och showens regissör berättade han "en snabb historia" om ett besök nyligen i "det yngsta landet i världen".
"En kväll... ville en grupp läkare och sjuksköterskor säga hej... eftersom de hade tittat på The Night Manager", fortsatte han.
Tanken att vi skulle kunna ge lite lättnad och underhållning åt de människor som... håller på att fixa världen på de platser där den är bruten gjorde mig oerhört stolt.
West Wing stjärna Joshua Malina var bland dem att ta strid med talet, som drog en blandad respons från Golden Globes publik.
"Tack till Tom Hiddleston och alla skådespelare som vågar uppträda i projekt som visas i några av de farligaste delarna av världen", tweetade han.
"Det var en lång historia Tom Hildleston berättade för att ge sig själv en komplimang", skrev författaren och producenten Gary Janetti.
Andra kommentatorer riktade uppmärksamheten på skådespelarna Naomie Harris och Christian Slater under Hildlestons tal.
Ändå fick hans ord ett varmare gensvar från Världslivsmedelsprogrammet, som sade att det kändes "hederligt" att ha fått ett omnämnande.
Hildlestons pris var ett av tre Golden Globes som vanns av The Night Manager, som också fick stöd till skådespelarens priser för Olivia Colman och Hugh Laurie.
Colman, som inte var på ceremonin i Los Angeles, sa att hon var "kastad" att hon inte hade varit närvarande för att acceptera "en sådan enorm ära".
Följ oss på Facebook, på Twitter @BBCNewsEnts, eller på Instagram på bbcnewsents. Om du har en berättelse förslag e-post underhållning.news@bbc.co.uk.
Skådespelare Tom Hildleston har bett om ursäkt för sitt mycket kritiserade accepttal vid Golden Globe-utmärkelserna och erkänt att det var "olegant uttryckt".