Den unga flickan skadades av patrullhunden i Belmarshfängelset i Woolwich den 31 mars.
Justitieministeriet (MoJ) sade att händelsen hade rapporterats till polisen och hunden drogs tillbaka från tjänsten.
2015 sade MoJ att det fanns mer än 530 hundar utplacerade i fängelser i England och Wales.
Spegeln rapporterade att attacken hade ägt rum under ett rutinmässigt drogtest, och flickan behövde genomgå plastikkirurgi på grund av sina skador.
MoJ sade att det inte kunde släppa mer detaljer på grund av "purdah" regler i upptakten till det allmänna valet.
Ett litet barn blev bitet av en sniffhund medan hon besökte en släkting i ett högsäkerhetsfängelse i östra London, har det dykt upp.