2008 års mästare från Portrush värmde upp till nästa veckas Open på Royal Troon genom att avsluta på nio under och fem bakom vinnaren Alex Noren av Sverige.
McDowell plockade upp fåglar vid ett, sex och 16 men bogeys vid 15 och 17 avslutade hans titel förhoppningar.
Padraig Harrington var sex under efter en 71 medan Belfasts Michael Hoey var tillbaka på fyra över efter en 72.
Noren knöt ihop en enslig seger över närmaste utmanare Tyrrell Hatton.
McDowell, som har halkat till 78:e i världens ranking, går in i Open i förbättrad form och har redan spelat två träningsrundor på Troon förra helgen.
Graeme McDowell kortade en sista omgång 71 för att avsluta Scottish Open på Castle Stuart i gemensam 10: e.