Bricks kastades och bränder tändes utanför Stratford busstation och Forest Gate polisstation i London.
Protester hävdar Edir Frederico Da Costa, 25 år, blev "bruttiskt slagen" av Met-poliser tidigare denna månad.
Den oberoende polisklagomålskommissionen (IPCC) undersöker behandlingen av Da Costa, som dog sex dagar efter att han stoppades av polisen.
Borough Commander Supt Ian Larnder stod mitt i en grupp demonstranter som försökte besvara deras frågor och lugna spänningar.
En av demonstranterna körde upp sin motorcykel till polislinjen och rev upp sin motor framför officerarna.
En annan motorcyklist vände sin cykel mot officerarna och spänna hans hjul så rök blåste mot dem.
Brandmän, skyddade av polisen, spolade ut en brand som hade startats i en soptunna i Richmond Road. Bins sattes också i brand nära en McDonald's i Romford Road.
Bricks hade slitits från en vägg och kastats på polisen.
Familjekämpar sade att våldet inte kom från dem och att det hade satts upp som en fredlig marsch.
Polisen sa att det inte hade varit några gripanden, men vissa officerare fick mindre skador.
Kraften tillade att antalet demonstranter började minska strax före 23:00.
Mr Da Costa, känd av vänner som Edson, dog den 21 juni, sex dagar efter att ha stannat i en bil i Woodcocks i Beckton i Newham i östra London.
Campaigners hävdar att hans nacke var bruten och han drabbades av huvudskador och andra skador efter att han stoppades i en bil, som innehöll tre personer, av Met officerare.
IPCC sa att en preliminär obduktion, utförd på torsdag, visade att det inte fanns några ryggmärgsskador orsakade av polisen.
Transport till London sade att från strax före 18:00 hade det varit "ett antal buss avledning på polisens begäran" på grund av demonstrationen i Stratford.
Protester har ställts inför polisen i en demonstration över en mans död efter ett trafikstopp.