Presidentundersökningen kommer att äga rum nästa månad och Uhuru Kenyatta söker omval.
På fredag, efter ett fall som framfördes av oppositionen, beordrade Högsta domstolen valkommissionen att inte trycka röstsedlar.
Kenyatta insisterade på att valet skulle fortsätta som planerat.
"Denna typ av hot kommer inte att tillåtas och valdatumet kommer inte att ändras", sade han.
Han sade att rättsväsendet inte kunde göra anspråk på oberoende och sedan använda det för att störa den verkställande maktens och andra regeringsvapens funktion.
Högsta domstolen hävdade att anbudsförfarandet för valsedlarna inte hade varit tillräckligt öppet för insyn.
Oppositionen National Super Alliance (Nasa) hävdade att presidenten hade kopplingar till Al Ghurair, Dubai-baserade företaget som vann $ 24m (Â £ 18m) anbud.
Al Ghurair och Mr Kenyatta förnekar alla förseelser.
Domarna slog fast att bolaget fortfarande kunde skriva ut valsedlar för riksdags- och länsvalen, men anbudsförfarandet för presidentval bör återanmälas.
Lokala medier har rapporterat att vem som än tar på sig uppgiften att trycka och distribuera röstsedlarna kommer att ha bara 30 dagar på sig att göra vad som vanligtvis är en 45-dagars uppgift.
I en separat utveckling togs Raila Odinga, Kenyattas främsta utmanare, sjuk och togs in på sjukhus på söndagen med vad hans kampanjteam sade var misstänkt matförgiftning.
Odinga, som talade kort efter det att han blivit utskriven från sjukhuset i kuststaden Mombasa, sade att han var "lämplig som en fiol".
"Jag hade magsmärtor, som sedan dess har försvunnit efter att ha fått behandling", sade Odinga och tillade: "Jag har blivit utskriven för att åka till Nairobi för att fortsätta med mina kampanjer."
Under tiden har flera människor enligt uppgift dödats i sammandrabbningar mellan rivaliserande politiska grupper, vilket återuppväcker minnen av våld efter valet 2007–2008 som gjorde att mer än 1.000 människor dog.
Kenyas president har varnat landets rättsväsende för att hjälpa oppositionen att kasta nästa val i oordning.