Stjärnan står för årets huvudpris, årets album, för sitt ambitiösa visuella album, Lemonade, som tar itu med teman som ras och kvinnlig identitet.
Hennes singel Formation är också upp för sång och rekord av året.
I alla tre kategorierna är hon upp mot Adele - som tidigare vann ceremonins tre bästa priser 2012.
Beyonce har nu 62 Grammy nomineringar över hela sitt arbete som solokonstnär och som en del av Destinys barn, vilket gör henne till den fjärde mest nominerade konstnären någonsin.
Hon har vunnit 20 troféer helt och hållet, även om hon ännu inte har knuffat albumet av årets pris, efter att ha blivit slagen till titeln av Beck 2015 - mycket till avsky av Kanye West, som stormade scenen i protest.
West får åtta nomineringar i år för sitt album The Life Of Pablo - allt i rap-kategorierna.
Drake och Rihanna har också åtta nomineringar, varav tre för deras hitsamarbete, Work.
Att göra Grammy historia är Chicago-födde musiker Chance The Rapper, vars album Coloring Book är den första streaming-bara skivan som erkänns av Recording Academy.
Han får sju nomineringar, inklusive bästa nya artist, utan att någonsin släppa ett fysiskt album eller digital nedladdning.
Beyonce och Adele går head to head med Justin Bieber, Drake och countrystjärnan Sturgill Simpson i den bästa albumkategorin.
Om Adele vinner blir hon bara den andra kvinnan som får det bästa albumpriset två gånger, efter Taylor Swift.
Särskilt frånvarande från shortlisten är David Bowie, som tipsades att vinna för sitt kritikerrosade Blackstar album.
Skivan gör ett framträdande i den bästa alternativa albumkategorin, liksom Radioheads A Moon Shaped Pool.
Coldplay har också klarat sig dåligt och fått bara en enda nominering - bästa musikvideo - trots att de sålt miljontals exemplar av sitt senaste album, A Head Full Of Dreams.
Prinsen får en postum nominering till sitt sista album, Hit N Run Phase Two, i den bästa konstruerade, icke-klassiska kategorin, där Blackstar också gör kortlistan.
Brittiska stjärnan James Corden kommer att vara värd för 2017 Grammy Awards, som äger rum på Staples Center i Los Angeles söndagen den 12 februari.
Årets album
Årets rekord
Årets sång
Bästa ny konstnär
Bästa alternativa album
Bästa popalbum
Bästa rap-album
Följ oss på Facebook, på Twitter @BBCNewsEnts, eller på Instagram på bbcnewsents. Om du har en berättelse förslag e-post underhållning.news@bbc.co.uk.
Beyonce har samlat nio nomineringar till 2017 års Grammy Awards, vilket utökar hennes huvudroll som den mest nominerade kvinnan i Grammys historia.