Ministeriet för Peshmerga Affairs sa att blodprover från omkring 35 jaktplan avslöjade spår av svavelsenap.
Det stod inte om någon av peshmerga hade dött till följd av attacken, eller hur allvarligt de hade skadats.
Senapsgas kan bränna huden och orsaka allvarliga andningsproblem, och är förbjuden enligt internationell rätt.
Exponeringen ägde rum längs frontlinjen nära de norra irakiska städerna Makhmour och Gwer, sade ministeriet i ett uttalande.
Ungefär 37 granatkastare avfyrades i attacken, tillade uttalandet, "bortskaffande av vit rök och en svart vätska".
Ministeriet uppmanade de länder som bekämpar IS att ge peshmergasoldater utrustning för skydd mot kemiska angrepp. Flera länder, däribland Förenta staterna, ger redan militärt bistånd till de kurdiska kämparna.
Detta är inte första gången IS anklagas för att använda kemiska vapen. I mars sade de kurdiska myndigheterna i Irak att de hade bevis för att IS hade använt klorgas.
Detta påstående från Kurdistans regions säkerhetsråd följde på liknande påståenden om att gruppen hade använt kemiska vapen av låg kvalitet mot irakiska säkerhetsstyrkor.
Direktören för Organisationen för förbud mot kemiska vapen uttryckte i augusti "allvarlig oro" över möjligheten att IS använde förbjudna kemiska vapen.
FN antog nyligen en resolution som syftar till att identifiera dem som ligger bakom attacker av kemiska vapen i Syrien.
IS har redan en stor arsenal av konventionella vapen och militära fordon beslagtagna från den irakiska armén, varav en stor del produceras av Förenta staterna.
Irak Kurder var offer för en stor kemisk vapen attack av den irakiska militären under Saddam Hussein 1988, som lämnade tusentals döda i staden Halabja.
Islamic State (IS) militanta avfyrade granatkastare som innehåller senap agent på kurdiska peshmerga fighters i norra Irak, kurdiska tjänstemän säger.