John Lahiff, 75 år, berättade för lokala medier att han störde krokodilen medan han letade efter en boll i vatten på banan i Port Douglas i Queensland.
Han fördes till sjukhus med ett djupt skärsår på sitt sken och punkteringsskador på sin kalv, men sade att han inte skulle skjutas upp att spela golf.
Han sa till ABC News att han skulle försöka att inte slå bollar i vattnet i framtiden.
Crocodiles är en vanlig syn på golfbanan, australiska medier rapporteras, och skyltar varnar spelare om farorna.
Polisinspektör James Coate berättade för ABC att den 1,2m (4ft) saltvatten krokodilen hade varit i en vattenväg på 11: e hålet
Mr Lahiff, som talade från Cairns sjukhus, sade att han hade sett krokodiler där förut och "skulle ha insett att vara lite mer medveten".
"Jag såg inte krokodilen sola precis på kanten av vattnet. Jag gick förbi den och sedan fick den mig på väg tillbaka och så fort den tog tag i mig tog den av i vattnet."
Han lyckas köra sig själv tillbaka till klubbhuset för att få hjälp.
Den australiska tidningen rapporterade att naturvårdare skulle försöka ta bort krokodilen och flytta den till en krokodilfarm eller ett zoo.
Men mr Lahiff sa till ABC att han ville att krokodilen skulle stanna där den var. "Jag tror att han blev mer rädd än jag. Han mår bra, sa han.
Palmer Sea Reef golfbanan ägs av australisk miljardär och politiker Clive Palmer.
Efter händelsen twittrade han att han önskade golfaren en snabb återhämtning.
Han skämtade: "Crocodile har tagits bort från alla menyer på Palmers fastigheter efter dagens incident."
Krokodiler är ett vanligt drag i Australiens tropiska norra del och antalet har ökat sedan de förklarades som skyddade arter 1971.
En golfare har fått benskador efter att ha blivit biten av en krokodil på en australisk golfbana.