Hong Kong polisen sa att en man 39-årig utlänning larmade flygpersonal tidigt på måndagen, som sedan ringde myndigheterna.
Polisen sa att mannen hade förlorat två klockor och utländsk valuta.
Lokala medier sa att mannen var en turkisk vakthandlare som flög i ekonomiklass från Dubai.
En talesman för Emirates, flygbolaget som mannen tog till Hong Kong, sade till BBC: "Emirates arbetar nära polisen och ger information för att hjälpa till med deras utredning." Emirates sade att det inte skulle ge ytterligare kommentarer, med hänvisning till den pågående undersökningen.
Det har förekommit ökande rapporter om stölder i luften runt om i världen, av vilka vissa sägs involvera organiserade gäng.
En man har förlorat HK$2m ($257.730; £175.530) i kontanter och värdesaker från sitt handbagage, under ett flyg till Hong Kong, sade polisen.