Stängningen av tunneln nära Linlithgow i West Lothian kommer att innebära att järnvägstrafiken mellan Edinburgh och Glasgow kommer att drabbas hårt.
Arbetet är en del av en uppgradering på £750m för att möjliggöra snabbare, större och grönare elektriska tåg att köra på linjen.
Störningen kommer att pågå från den 13 juni till den 27 juli.
Ingenjörer sade att tunneln stängning var nödvändig så spår kunde sänkas för att skapa utrymme för overhead kraftledningar för de nya tågen, som kommer att införas i slutet av nästa år.
Uppgraderingen är den senaste fasen av den skotska regeringens förbättringsprogram Edinburgh Glasgow (EGIP).
Tågoperatör ScotRail har en särskild webbplats för att ge råd om avbrottet, som främst kommer att drabba resor mellan Glasgow - eller Stirling / Dunblane - och Edinburgh men det kommer också att ha en dominoeffekt i områden som Fife Circle.
Många passagerare kommer att ha längre resor eller bussbyten. ScotRail rådde passagerarna att lägga till minst 30 minuter till sina planerade restider.
Stängningen kommer att innebära att passagerare som vill resa från Glasgow till Edinburgh inte längre kommer att kunna ta ett tåg från Queen Streets plattformar på hög nivå, eftersom tågen bara kommer att gå så långt som Linlithgow.
Istället måste de byta till den långsammare Queen Street lågplanståg eller resa på den längre rutten från Glasgows centralstation.
ScotRail sade att de viktigaste berörda linjerna skulle vara:
Dessutom kommer följande tjänster att vara mer trafikerade än normalt i båda riktningarna:
Hur påverkas du av arbetet?
Rodger Querns, programchef för EGIP för Network Rail, sade tunnelarbetet under de kommande sex veckorna skulle se spåret tas bort och golvet i tunneln sänkas för att skapa utrymme för att installera ny elektrifieringsutrustning.
Han sade: " Vi kan inte undvika arbetet i Winchburghtunneln. Vi uppskattar den olägenhet som detta kommer att orsaka passagerarna. Vi har planerat arbetet minutiöst och arbetar hårt för att minimera den störningen.
"Vi jobbar dygnet runt. Vi har ingenjörer på plats 24/7 för att få igång järnvägen som planerat den 27 juli."
Phil Verster, verkställande direktör för tågoperatören ScotRail Alliance, sade: " EGIP-programmet är en investering på 750 miljoner pund i denna mycket viktiga korridor mellan Edinburgh och Glasgow.
"Det elektrifierar linjen och den magnifika fördelen det ger våra kunder är att vi kommer att ha längre tåg, ca 30% mer kapacitet, kortare resor eftersom vi kommer att köra tåg snabbare och raka ca åtta till 10 minuter utanför en 50-minuters restid, och det kommer att bli grönare också.
"Så på alla punkter är det bra för kunderna och bra för landet."
För omkring 150 år sedan, när denna tunnel byggdes, var utmaningen att skapa tillräckligt utrymme för att ånglokens tratt skulle kunna passa igenom när de dundrade längs banan.
Idag handlar utmaningen om att skapa tillräckligt med utrymme för luftledningarna för elektriska tåg.
Ingenjörerna kan inte gå upp så de måste gå ner och släppa hela banan.
Vissa har ifrågasatt varför arbetet med att förbättra järnvägarna genomfördes samtidigt som stora uppgraderingar av vägnätet i centrala Skottland.
Arbete på 500m M8 M73 M74 Motorvägsförbättringsprojekt i Lanarkshire leder redan till störningar eftersom trafikbegränsningar är i kraft.
Transportminister Derek Mackay rådde folk att planera sina resor och försäkrade dem att det skulle vara värt det.
Han sade: " För både väg- och järnvägsnätet skulle den bästa tiden att göra det vara över sommaren. Det är då de minsta kommer att resa.
"Detta är stora förbättringar och de är nödvändiga förbättringar. Vi kan inte bara låta infrastrukturen upplösas.
"Det här är bättre än så. Det är inte bara underhåll, det är en uppgradering av vår järnvägs- och väginfrastruktur så den är lämplig för framtiden och kan frigöra ännu mer ekonomisk potential och förbättra förbindelserna i vårt land."
Querns sade att EGIP-projektet kommer att fortsätta på sträckor under nästa år, men att det mesta av arbetet kommer att utföras nattetid.
Han sa: "Nästa år kommer vi att arbeta i Queen Street tunnel rensa den för elektrifiering i april 2016."
Verster sade att Glasgow Queen Street skulle "omformas" av förändringarna och att hela sammankomsten skulle omformas.
Han sade: " Det kommer att sätta Glasgow Queen Street på samma nivå som vad vi har på St Pancras eller King's Cross. Det kommer att bli helt fantastiskt."
Tågpassagerare i Skottlands centrala bälte står inför sex veckors avbrott från denna helg när arbetet börjar på Winchburghtunneln.