En av Tatas två galvaniserade stållinjer skulle kunna stängas från slutet av oktober eller november, enligt Keith Jordan från gemenskapsunionen.
Företaget sa att linjen kunde startas om under bättre marknadsförhållanden.
Förra månaden meddelade Tata att det var malboll en del av sin anläggning i Newport för tredje gången på sex år med förlusten av hundratals arbetstillfällen.
Jordan sade att man hoppades att många av Shottonarbetarna skulle flyttas till den andra linjen, som producerar 350.000 ton stål per år eller 7 000 ton per vecka.
Shotton är en del av Tata Steel Colors som tillverkar metall- och färgbelagda produkter för byggindustrin och hushållsapparater.
En talesman för ett företag sade: " Vi fortsätter att föra diskussioner med anställda, deras representanter och arbetsgivare för entreprenörer och bemanningsföretag om möjliga konsekvenser för sysselsättningsnivån.
"Varje ansträngning kommer att göras för att omfördela alla berörda anställda inom verksamheten."
En produktionslinje på Deeside's Shotton stålverk håller på att malas, vilket kan påverka 40 arbetstillfällen, har en fackförening sagt.