Dzjokhar Tsarnaev, 21, anklagas för 30 fall i samband med bombningarna, som dödade tre personer och skadade mer än 260 i april 2013.
Som en del av åklagarens sammanfattning gav rättsläkarna detaljerade uppgifter om de skador som drabbade dem som dog i attacken.
Mr Tsarnaev kan få dödsstraff om han befinns skyldig.
Massachusetts chefsläkare Henry Nields vittnade om att det yngsta offret av attackerna, åttaårige Martin Richard, fick skador på varje del av hans kropp.
Vittnesbördet illustrerades med obduktionsbilder och barnets blodiga, sönderrivna kläder.
Mr Nields sa att en bit splitter verkade ha gått rakt igenom Richards kropp.
"Det skulle vara svårt att säga exakt plats på grund av storleken på öppningarna i buken", vittnade han, enligt Reuters.
Försvaret började kalla sina egna vittnen senare på måndagen.
Tidigare i rättegången erkände försvaret att Tsarnaev hade deltagit i attackerna.
Men försvarsadvokater hävdar att hans 26-årige bror, Tamerlan, hade varit den drivande kraften bakom attackerna. Genom att göra det hoppas de kunna bespara sin klient dödsstraff.
Mr Tsarnaev är anklagad för 30 fall i samband med bombningarna. Bröderna satte igång ett par hemgjorda tryckkokare bomber vid loppets trånga mållinjen.
Tsarnaev anklagas också för att ha skjutit en polis tre dagar senare.
Åklagarsidan säger att Tsarnaev, som emigrerade med sin familj från Tjetjenien, hade extremistiska åsikter och ville slå tillbaka mot USA som hämnd för militära aktioner i muslimska länder.
Åklagaren har vilat sitt fall i rättegången mot en man anklagad för att ha utfört bombdåden i Boston 2013 Marathon.