Forskare vid University College i London fann att bara 51 procent av de 6 500 barn som de övervakade uppnådde den rekommenderade timmen av fysisk aktivitet varje dag.
För flickor var siffran bara 38 %, jämfört med 63 % för pojkar.
Hälften av gruppen tillbringade också mer än sex timmar var stillasittande varje dag, även om en del av detta skulle spenderas i klassen, erkände forskarna.
Studien, som publicerades i nättidskriften BMJ Open, visade att aktivitetsnivåerna varierade mellan olika grupper.
Barn av indiskt ursprung och barn som bor i Nordirland var bland de minst fysiskt aktiva och 43 % nådde de rekommenderade nivåerna, jämfört med 53 % i Skottland.
Men den största skillnaden var mellan flickor och pojkar.
Forskare sade att detta tyder på att det behövs ett fokus på att göra idrott och andra aktiviteter mer attraktiva för flickor.
Professor Carol Dezateux, en av huvudförfattarna, sade: " Det finns en stor gapande klyfta mellan flickor och pojkar. Vi måste verkligen tänka på hur vi når ut till flickor.
"Skollekparken är en viktig utgångspunkt. Ofta hittar du den domineras av pojkar som spelar fotboll."
Men hon sade att det fortfarande bör finnas oro över aktivitetsnivåerna över hela linjen.
"Fynden är särskilt oroande eftersom sjuåringar sannolikt kommer att bli mindre aktiva när de blir äldre, inte mer."
För att uppnå en timmes rekommendationen måste barnen delta i måttlig eller kraftfull aktivitet, vilket inkluderar allt från snabb promenad och cykling till att spela fotboll och löpning.
UCL-forskningen är inte den första som antyder att barn inte är tillräckligt aktiva, men de flesta tidigare studier har förlitat sig på självrapportering av barn eller föräldrar som uppskattar träningsnivåer, medan den senaste omfattade realtidsövervakning.
Under studien, som ägde rum under 2008 och 2009, bar ungdomar en accelerometer för att mäta träningsnivåer som fästes på ett elastiskt bälte runt midjan. Den togs bort först när barnen badade eller när de gick och lade sig.
Totalt kunde experterna registrera mer än 36.000 dagars data baserat på de barn som använde accelerometern under minst 10 timmar per dag under loppet av en vecka.
Doktor John Middleton vid folkhälsofakulteten sade att det behövdes mer forskning om varför vissa grupper var mindre aktiva.
"Vi behöver våra barn för att växa upp och bli friska vuxna, inte bara för att det är vad alla civiliserade samhällen skulle vilja för sina barn, men det är också bäst för vår ekonomi också", tillade han.
Dr Ann Hoskins, från Folkhälsan i England, instämde.
Hon sade: " Den här studien visar att det fortfarande finns mycket att göra för att hålla barn och ungdomar aktiva när de blir äldre, i synnerhet flickor.
"Det nya skolåret är den perfekta tiden för att göra hälsosamma förändringar, byta kort bil eller buss resor med promenader eller scooting till skolan."
Hälften av alla sjuåringar i Storbritannien motionerar inte tillräckligt, med flickor som är mycket mindre aktiva än pojkar, föreslår en undersökning.