Ytterligare 111 tros ha skadats i strejkerna.
Försvarsminister Mike Penning avslöjade siffrorna efter en skriftlig parlamentsfråga från Lib Dem-ledaren Tim Farron.
Han sade att de var en uppskattning eftersom strejkplatser inte kan besökas och bedömas av Förenade kungariket.
Farron hade frågat försvarsministeriet hur många militanter från terroristgruppen som hade dödats av brittiska styrkor i Irak från den 2 december 2015 till den 2 december 2016.
Penning svarade: "Under den aktuella perioden bedöms det att 111 fiender skadades i strid och totalt 1 306 fiender dödades i strid till följd av brittiska flyganfall.
"Storbritannien kan inte besöka strejkplatser och genomföra detaljerade undersökningar på plats i Irak. Därför är antalet soldater som dödats och/eller skadat endast en uppskattad siffra."
Förenade kungarikets parlament stödde Storbritanniens deltagande i flygstrejker mot IS i Irak redan i september 2014. Drygt ett år senare 2015 godkände parlamentsledamöter flyganfall mot IS i Syrien.
Storbritannien har genomfört mer än 1 200 flygresor i Irak och Syrien sedan landet blev involverat - mer än något annat koalitionsland bar USA.
BBC-analys har visat att under 2017 släppte brittiska styrkor bomber i Irak och Syrien på 69 av årets första 99 dagar.
RAF Tyfoner och Reaper drönare har under de senaste månaderna stött irakiska och kurdiska styrkor som försökt befria Mosul i norra Irak.
Mer än 1.300 militanter från den så kallade islamiska staten dödades av brittiska flyganfall i Irak under en tolvmånadersperiod, enligt nya siffror.