Mediauppspelning stöds inte på den här enheten
Blues hade 39 insatser på mål, medan besökarna bara lyckades en, efter att ha spenderat det mesta av matchen försvara.
"Detta är inte den bästa ligan i världen, detta är fotboll från 19th Century," sade Mourinho.
"Det enda jag kunde ta med mig var en svart och Decker för att förstöra väggen."
Trots de många försök, Blues lyckades bara nio på mål. Hammerskeeper Adrian gjorde tre bra räddningar från John Terry, Samuel Eto'o och Frank Lampard.
West Ham har nu hållit 10 Premier League rena lakan denna säsong - en statistik de delar med Arsenal
Brasilien midfielder Oscar och ersättare Demba Ba förnekades också av träverket.
West Hams enda insats på mål var när James Tomkins huvud var bekvämt hanteras av Petr Cech. De borde ha fått Blues att arbeta igen några ögonblick senare, men Andy Carroll misslyckades med att få kontakt med Stewart Downings leverans från åtta meter ut.
"Det är mycket svårt att spela en fotbollsmatch där bara ett lag vill spela. Det är mycket svårt, "tillade Mourinho, vars sida är nu tre poäng bakom ligan ledare Manchester City efter att de vann 5-1 på Tottenham.
"En fotbollsmatch handlar om två lag som spelar och denna match var bara ett lag som spelar och ett annat lag som inte spelar.
"Jag berättade för Big Sam [West Ham manager Allaryce] och jag upprepar mina ord: de behöver poäng och, eftersom de behöver poäng, att komma hit och spela som de gjorde, är det acceptabelt? Kanske, ja.
"Jag kan inte vara alltför kritisk, för om jag var i hans position vet jag inte om jag skulle göra detsamma. Kanske."
Mediauppspelning stöds inte på den här enheten
Allardyce, vars sida är kvar i de nedre tre men inspelade bara deras andra rena ark i 11 matcher, slog tillbaka på Mourinhos kommentarer.
"Han klarar inte av det, eller hur? Han kan inte ta det eftersom vi har överlistat honom - han kan bara inte hantera, "sade Hammers chefen.
"Han kan berätta allt han vill, jag bryr mig inte.
"Jag älskar att se Chelsea spelare gnälla på domaren, försöker skrämma honom, Jose hoppar upp och ner säger att vi spelar skräpfotboll.
"Det är lysande när man får ett resultat mot honom. "Lycka till, Jose."
Allaryce också berömde sitt lags defensiva prestanda, med sitt lag har medgett 17 mål i sina tidigare fem fixturer går in i onsdagens match.
"Taktiskt vi fick det rätt i två områden särskilt: en var i stoppa [Eden] Hazard, Oscar och Willian och [Samuel] Eto'o poängmål; och den andra var att stoppa dem poäng från inställda pjäser. Vi gjorde ett fantastiskt jobb."
Jose Mourinho anklagade West Ham för att spela "19th-Century fotboll", efter hans Chelsea sida hölls 0-0 i onsdagens liga möte.