Bath spelare Ford, 23, missade sex av sju sparkar på mål under 27-13 seger över Wales för 11 dagar sedan.
Det - kombinerat med 24-åriga Farrells form för titelvinnande Saracens - har övertygat tränare Eddie Jones att göra förändringen.
Luther Burrell kommer troligen att ta den roll som Farrell har i centrum.
Harlequins ytter Marland Yarde är i linje att börja i stället för Exeters Jack Nowell, med England för att bekräfta sitt team klockan 10:00 BST på torsdag.
England har aldrig vunnit en serie i Australien, men är fast beslutna att störta 33-13 "dölja" de gavs av Wallabies vid 2015 års VM.
"Vi kom ut ur det spelet tror att vi hade tänkt för mycket av oss själva", sade löst huvud prop Mako Vunipola av Englands tyngsta nederlag på hemmaplan.
"Den största lärdomen vi tog var att vad som helst kan hända varje dag. Vi går in i helgen och vet det också.
"Det finns ingen tanke på hämnd eller rättande fel i VM och, även om det är svårt att glömma, det måste gå till baka i våra sinnen."
George Ford förväntas ge plats för Owen Farrell på flyghalva för Englands inledande test mot Australien i Brisbane på lördag.