Loket har också fått sitt British Rail nummer, 60103, ommålat på sin hytt.
Den har restaurerats för Yorks nationella järnvägsmuseum till en kostnad av 4,2 miljoner pund. Testkörningar hölls i Cumbria och Lancashire i januari och februari.
Det kommer att göra sin första körning mellan London och York den 25 februari.
Resan blir den första officiella utflykten med namnplåtar och nya färger.
Andrew McLean, chef intendent på museet, sade: "Att äntligen få Flying Scotsman helt återställd, ser exakt som hon borde, i ånga och levande igen kommer att vara ett riktigt speciellt ögonblick för många människor."
Han sa att skuggan av grönt valt återspeglade hur motorn skulle ha sett ut under 1950-talet och början av 60-talet.
Ian Hewitt, från Lancashire-baserade Heritage Painting, sade att det hade varit en gigantisk uppgift att ta bort den svarta färgen och måla om loket för hand.
"Tjugo liter underrock, 30 liter glans och runt 20 liter lack och det finns cirka 85 liter vit sprit som vi har gått igenom", sade han.
"Det är höjdpunkten i våra karriärer, och att nu se det komma samman på världens mest kända lokomotiv... det blir inte större för oss."
Flygande skotte byggdes ursprungligen för London och North Eastern Railway Company (LNER) 1923 och sprang dagligen mellan London och Edinburgh.
Loket gick ur bruk 1963 och tillbringade 40 år i privat ägo i världen.
Det köptes för nationen av NRM 2004, med hjälp av £ 415 000 i offentliga donationer, en £ 365.000 gåva från Sir Richard Branson och ett £ 1,8 miljoner bidrag från National Heritage Memorial Fund.
Renoveringsarbetet skulle ursprungligen ha slutförts 2011 men försenades efter det att sprickor påträffats i chassit.
Riley och Sons Ltd, Bury, Greater Manchester, utsågs för att slutföra restaureringsarbetet 2013.
Slutet på Flying Scotsmans 10-åriga restaureringsprojekt har markerats med att det målats om i traditionell brittisk järnvägsgrön levery.