Den nordirländska brand- och räddningstjänsten kallades in och upp till 21 patienter flyttades till ett annat område av sjukhuset.
Western Health Trust sade att patienterna togs bort säkert och lades till det hoppades att sjukhuset skulle återgå till det normala senare på torsdagen.
Larmet höjdes klockan 07:00 GMT.
I ett uttalande från Western Trust hette det: "Smoke rapporterades komma från en "bäddspanna" i Ward 5 vid Altnagelvin Hospital i morse.
"Tjugoen patienter förflyttades säkert från avdelningen och har vidarebosatts någon annanstans på sjukhuset.
"Det är tänkt att avdelningen kommer att återgå till normala affärer senare idag.
"Western Trust vill tacka sin personal och räddningstjänsten för deras snabba reaktion på incidenten."
En del av Altnagelvins sjukhus i Londonderry har evakuerats efter att rök upptäcktes på en av avdelningarna.