Den 25-årige framåt har undertecknats för andra halvan av Womens Super League säsongen, som kommer att återupptas för Blues den 29 juni hemma till Arsenal.
"Det beskriver ytterligare våra intentioner och visioner om vad vi vill uppnå på klubben", säger chef David Parker.
Blues kämpade mot konkurrens från några stora europeiska sidor för att underteckna Linden.
"Det är en signal om den utveckling klubben gör inte bara i England utan också i Europa att vi nu lockar de bästa europeiska spelarna", tillade Parker.
Hon är tredje tysken att delta denna säsong efter undertecknandet av Corina Schroder från Liverpool och ankomsten i april av försvarare Marisa Ewers från Bayer Leverkusen.
På baksidan av två segrar i tre matcher, Blues har klättrat till tredje i WSL 1, sju poäng bakom ledare Manchester City.
Linden sade: " Samtalen med David, (medhjälpare) Marcus Bignot och (huvudchef) Tim Andrews övertygade mig om projektet och ambitionerna på klubben.
"Jag ser fram emot den nya utmaningen att spela i ett annat land. Jag har alltid velat spela i England."
Linden, som spelade på SGS Essen och Bayer Leverkusen innan han gick med i Frankfurt för säsongen 2015-16, har representerat Tyskland på alla nivåer.
Birmingham City Ladies har tecknat Tyskland internationella Isabelle Linden från Champions League innehavare FFC Frankfurt.