Den förbjudna kulten var ansvarig för en dödlig sarinnervgasattack på Tokyos tunnelbana 1995, som dödade 13 personer och skadade 5 000.
Tio personer fängslades i St Petersburgs räder, säger Itar-Tass nyhetsbyrå. Fyrtiofyra ryssar som fördrivits från Montenegro håller också på att undersökas.
Aum ledare Shoko Asahara och 12 andra kultister fick dödsdomar i Japan.
De ryska räderna riktade in sig på hem och platser för dyrkan av misstänkta Aum-kultister.
Ryska åklagare säger att kulten har pressat folk för donationer. De misstänker att den har upp till 30 000 anhängare i Ryssland.
Aum Shinrikyo började som en andlig grupp som blandade hinduiska och buddistiska trosuppfattningar men blev en paranoid domedagskult besatt av Harmageddon.
Omkring 189 Aum-kultister har ställts inför rätta i Japan. Deras ledare Shoko Asahara dömdes till döden 2004 och står kvar i dödscellen.
Ryska polisen har plundrat 25 lokaler i Moskva och S:t Petersburg kopplade till den japanska Aum Shinrikyo-kulten.