Josh Hadfield, 10 år, från Frome i Somerset, utvecklade narkolepsi efter att ha fått Pandemrixvaccinet för sex år sedan.
Han fick pengarna efter att ha vädjat mot regeringen som ursprungligen hade vägrat betala eftersom han inte var "allvarligt handikappad" nog.
Hans mor Caroline Hadfield sa att seger var en "väldig lättnad".
Familjer har rätt till 120 000 pund genom systemet för betalning av vaccinskador, men endast om de kan visa sig vara "allvarliga" funktionshinder.
Joshs narkolepsi utlöstes efter att han fick influensavaccinet H1N1 2009, känt som Pandemrix, tillverkat av GlaxoSmithKline, i januari 2010.
Han lider också av kataplexi, som påverkar muskelkontrollen, men han hade inte visat några symtom på sjukdomen innan han vaccinerades.
Ms Hadfield sade: " Det kommer att bidra till att säkra Joshs framtid. Det är bara synd att vi var tvungna att hoppa igenom denna mängd av hoops för att komma så här långt. "
Hon sa att hennes son var "coping" och var tvungen att ha "en till två sover" under skoldagen.
"Josh har varit tvungen att arbeta otroligt hårt eftersom han missar lektioner på grund av sömn och medicinska möten", sade hon.
Hon tillade att han också hade haft en stor viktökning orsakad av tillståndet och hans medicinering.
Hadfields solicitor Suzanne Williams sade att hon var "otroligt nöjd" för Josh: "För att lyckas i överklagandet, var vi tvungna att tillfredsställa tribunalen att han hade en 60% funktionsnedsättning eller mer och de, i själva verket, drog slutsatsen att han var 72% funktionshindrad baserat på hans nuvarande symptom.
"De var också kritiska mot de medicinska bevis som lämnades av utrikesministern som de ansåg inte hade tagit hänsyn till hela bilden."
Pandemrix användes mest i Storbritannien under influensapandemin 2009-10 och gavs till nästan en miljon brittiska barn mellan sex månader och fem år.
En talesman för GlaxoSmithKline sade: " Vi är fortfarande fast beslutna att bedriva ytterligare forskning om Pandemrix potentiella roll i utvecklingen av narkolepsi.
"Vi stödjer också pågående arbete från andra experter och organisationer som utreder rapporterade fall av tillståndet."
Vaccinet, som inte längre används, har också kopplats till narkolepsi hos barn från Finland, Sverige och Irland.
Matthew Hill, punkter West Health korrespondent
Kopplingen mellan Pandemrix och narkolepsi föreslogs först i studier i Finland och Sverige där en genomgång av 75 barn som utvecklade sjukdomen hade en tiofaldigt ökad risk för sjukdomen inom sex månader efter jabben.
Detta bekräftades av en annan studie 2012 i Irland som visade en 13-faldig ökning av antalet ungdomar mellan fem och 19 år.
Det är ungefär 100 andra fall på gång, så det verkar som att tilldelningen av 120 000 pund till Josh Hadfield bara är början.
Narkolepsifakta
• Narkolepsi är en sällsynt sjukdom, med cirka 10 nya fall per miljon människor varje år
• Huvudsymtomet är plötsligt insomnande
• Orsaken till narkolepsi är fortfarande oklar
• Vissa människor kan vara predisponerade för tillståndet av sin genetik
• Föreslagna initiala utlösare inkluderar infektioner som mässling eller påssjuka, olyckor och hormonella förändringar som äger rum i puberteten
• Den börjar oftast mellan 15 och 30 år.
En pojke med en sällsynt sömnsjukdom orsakad av ett svininfluensavaccin har vunnit 120 000 pund i skador.