Bundesliga klubben gav 28-åriga en 2,250 euro (1,768) böter - 50 euro för varje minut.
"Jag hörde inte mitt larm", berättade Danmark International för Tysklands Bild tidning. "Det är mitt misstag."
Den strejkande straffades också förra månaden efter att ha lagt ut ett foto av sig själv tillsammans med sin Mercedes bil, när Wolfsburgs policy bara tillåter anställda att dyka upp till utbildning i en Volkswagen.
Nicknamed 'Lord Bendtner' av den tyska pressen, var spelaren en gång bötfälld £ 80.000 och förbjöds för ett spel av Uefa för att avslöja sponsrade underkläder efter poäng mot Portugal i Euro 2012.
Och han bötfälldes också av före detta klubben Arsenal 2014 för en otillåten resa till Köpenhamn.
Wolfsburg framåt Nicklas Bendtner har bötfällts för att ha kommit 45 minuter för sent för träning efter att ha sovit genom hans larm.