Flyttningen beror på en minskning på 8 miljoner pund i det bidrag som erhållits från ministeriet för sysselsättning och lärande (DEL).
Nedskärningen på grundnivå kommer att träda i kraft från och med september 2015.
Arbetsförluster kommer att finnas bland både akademisk och icke-akademisk personal och Queens säger att inga obligatoriska uppsägningar bör krävas.
Det finns för närvarande cirka 17 000 heltidsstuderande och doktorander vid universitetet och cirka 3800 anställda.
Drottningen har ett nuvarande intag på cirka 4 500 studenter per år.
Universitetet strävar efter att minska antalet studentplatser med 1,010 under de kommande tre åren.
BBC förstår att det inte finns några omedelbara planer på att stänga institutioner eller kurser, men att nedskärningarna i finansieringen kan äventyra vissa avdelningar och kurser.
Utbildningsministern Stephen Farry sade att han erkände att vissa studenter nu skulle kunna välja att studera på andra områden i Storbritannien på grund av nedskärningarna i Nordirlands universitet.
"En del människor kommer nu att tvingas se till möjligheter i andra delar av Storbritannien och kanske inte återvända till vår ekonomi", sade han.
"Definansiering av våra investeringar i kompetens, särskilt i en tid då vi försöker växa ekonomin är inte mycket vettigt. Det som händer är att vi går baklänges.
"Förlusten av någon plats skadar vår ekonomi, alla ämnen lär våra ungdomar kritisk kompetens."
Drottningens rektor Patrick Johnston sa att nedskärningarna kunde skada universitetets rykte.
"Den potentiella negativa effekten, inte bara på universitetet utan på den lokala ekonomin är mycket betydande", sade han.
– Det är det sista vi vill göra, men vi måste börja fokusera på de områden där vi kan odla organisationen och utveckla den - det är tydligt att vi inte längre kan vara beroende av den offentliga plånboken för att finansiera undervisningen.
"Om vi inte är konkurrenskraftiga kommer vi inte att attrahera de bästa studenterna, och vi kommer inte att attrahera den bästa personalen."
Knappt 100 miljoner pund, en tredjedel av universitetets inkomster, kommer från Nordirlands verkställande organ.
DEL:s budget minskades med 62 miljoner pund tidigare i år, och dess budget för högskolor sjönk från 203 miljoner pund till 186 miljoner pund, en minskning med 8,2 procent.
Ulster University meddelade i februari att den släppte 53 kurser.
Det kommer att minska arbetstillfällen och studieplatser, men det har ännu inte avslöjat hur många.
Queen's University Belfast minskar 236 jobb och 290 studentplatser på grund av en finansieringsminskning.