Chukwudumeme Onwuamadike, som är mer känd som Evans, säger att han olagligt fängslades och åtalades av media.
Han förklarade att han borde åtalas eller friges.
Polisen har sagt till BBC att de har fått en order från Högsta domstolen att hålla honom kvar i tre månader för att göra det möjligt för dem att genomföra utredningar.
I Nigeria ska misstänkta åtalas inom 48 timmar efter gripandet och Onwuamadike häktades för nästan tre veckor sedan.
Vid den tiden paraderades han inför media med polisen som firade hans tillfångatagande.
De har utsatts för påtryckningar att ta itu med en våg av kidnappningar i och runt Lagos-staten.
Polisens talesman, överintendent Jimoh Moshood sa att stämningen var "mischievous". Och att polisen hade sökt mer tid från domstolarna eftersom den misstänkte anklagas för allvarliga brott, inklusive "mördare och väpnat rån".
BBC: s Haruna Shehu rapporterar att sedan hans arrestering, har Mr Onwuamadike, som har förvärvat ryktbarhet i landet som enligt uppgift är en kidnappare Kingpin, gett flera intervjuer avslöjar några av hans metoder och taktik.
I sin rättegång, Mr Onwuamadike kräver $ 1m (Â £ 780.000) i skadestånd.
En påstådd ledare för en kidnappningsring i Lagos, Nigeria, stämmer polisinspektören.