Företagets moderbolag, GTR, har sagt ett erbjudande, som inkluderar en Â £ 2 000 bonus, "kan inte vara tillgänglig på obestämd tid" om strejker fortsätter.
Men RMT bossar sade att facket redan hade avvisat erbjudandet, och anklagade Southern för att använda "hot och mobbning".
En tvådagarsstrejk är planerad att börja på fredag.
Den senaste twist i tvisten kommer som södra återinförde en full tidtabell efter tre månader av reducerade tjänster.
En allt mer bitter dispyt har orsakat månader av störningar för passagerarna, eftersom RMT-medlemmar iscensatte en rad strejker i protest mot GTR:s planer på att ändra rollen som ledare för sydlig trafik i sydöstra England.
Järnvägscheferna lämnade ett "fullständigt och omfattande erbjudande" till RMT den 3 oktober i ett försök att lösa dödläget i samband med den föreslagna driften av endast förartåg på järnvägsnätet.
Men i ett brev till RMT:s generalsekreterare Mick Cash sade GTR: "Om din nästa planerade åtgärd fortsätter... dras erbjudandet tillbaka i sin helhet och kommer inte längre att vara tillgängligt för RMT att acceptera."
Michael Cash sade i ett uttalande: " Detta är bara fler hot och mobbning från södra järnvägen och gör ingenting alls för att lösa den nuvarande säkerhetskonflikten.
"Det är också helt meningslöst eftersom facket redan har avvisat 2000 pund muta för att sälja ut säkerhet, och företaget är väl medvetna om det."
I juli, när tvisten var som störst, införde södra delen en tillfällig tidsplan för att hjälpa till att hantera personalbrister, vilket förvärrade de problem som strejkerna orsakade.
Standardtjänsten återinfördes på måndagen, även om den fick en svår start på grund av ett trasigt tåg i Crawley, medan tågen mellan Eastbourne och Hastings drabbades av ett signalproblem.
Ytterligare tre block av strejker planeras före jul.
Southern Rails senaste försök att stoppa strejker på nätverket har märkts "meningless" av fackets chefer.