I ett starkt formulerat brev till alla lärare sade Gavin Boyd också att de fick bättre lön än sina motsvarigheter i England och Wales.
Läroförbunden vägrar att samarbeta med skolinspektionerna i en tvist om lön och arbetsbörda.
En del gör också tillfälliga strejker.
National Association of Schoolmasters and Women Teachers (NASUWT) har ilsket reagerat på Boyds brev och anklagat honom för "falska nyheter".
Boyd är chef för utbildningsmyndigheten och företräder arbetsgivarna i förhandlingarna om den aktuella lönetvisten.
Han skrev att den industriella verksamheten "allvarligt påverkade utbildningen av barn och ungdomar" och "en effektiv skolverksamhet".
Han sade också att lärarna hade "förvirrats av felaktig information" i ett antal frågor.
"Den genomsnittliga lärarlönen i Nordirland är drygt 40 000 pund per år", tillade han.
"Detta jämförs mycket positivt med andra forskaryrken lokalt och är faktiskt högre än den genomsnittliga lärarlönen i England och Wales."
Han sade att lärarfacket hade avvisat ett totalt erbjudande på 2,5 % av lönen 2015-16.
"Det har inte skett någon minskning av lärarlönen", sade han.
Sandy Boyd medgav att de nationella försäkrings- och pensionsavgifterna hade ökat, men sade att dessa var "en del av en bredare regeringsstrategi för att säkerställa att pensionerna inom den offentliga sektorn förblir överkomliga och hållbara".
"Den offentliga sektorns pensioner är fortfarande attraktiva och erbjuder i allmänhet mycket bättre villkor än de som finns i den privata sektorn."
NASUWT: s generalsekreterare Chris Keates sade dock att hans brev skulle reta upp lärare.
"Lärare kommer inte att övertygas eller skrämmas av de falska nyheter som presenteras i brevet", sade hon.
– Lärarnas lön har sjunkit med cirka 20 % sedan 2010.
"Arbetsgivarna bör börja ägna mer tid åt att ta itu med lärarnas genuina problem i stället för att ge dem felaktig information."
Brevet kommer inte att bidra till att lösa tvister mellan lärare och deras arbetsgivare, sade Heather Watson, rektor för Phoenix Integrated Primary School i Cookstown, County Tyrone.
Hon var "chockad, förvirrad och besviken" när hon fick brevet.
"Det har inte gjort något för att försäkra lärarna om att de är respekterade och uppskattade", säger Watson.
"Jag förstår att det finns två sidor av detta, men jag vill verkligen att de två sidorna ska få ordning på sitt agerande och ta itu med frågorna."
Jim Clarke, chef för rådet för katolska skolor, som representerar lärarnas arbetsgivare, sade att informationen i brevet var "faktiskt korrekt".
"Det kanske inte nödvändigtvis överensstämmer med allas perspektiv men allt vi kan göra är att presentera fakta som de är", tillade han.
I en närbesläktad utveckling har Irish National Teachers' Organisation (INTO) anklagat utbildningsdepartementet för "försök till mobbning" genom att skriva till en katolsk ärkebiskop om den pågående industriella aktionen.
I ett brev till medlemmarna sade Into att utbildningsdepartementets ständige sekreterare Derek Baker hade skrivit till ärkebiskop Eamon Martin.
De sade att Baker hade begärt att ärkebiskop Martin skulle se till att skolguvernörerna samarbetar med skolinspektionerna.
"Försök till mobbning, som detta, bör avvisas som ett oseriöst försök att få målet till ett slut", skrev de.
Men i ett uttalande till BBC svarade avdelningen med att beskriva påståendet som "utter nonsens".
"Brevet fokuserar uteslutande på den lagstadgade skyldighet som ställs på guvernörerna när det gäller att skydda och främja elevernas välfärd och söker deras samarbete med ETI särskilt när det gäller skydd och skydd av barn", sade de.
"Förslaget att institutionens brev är mobbning är fullständigt nonsens."
Nordirlands högsta utbildningstjänsteman har anklagat lärare för att skada barnens utbildning genom att vidta industriella åtgärder.