Akpan, 25, avskedades i 87:e minuten av Rovers 2-1 Championship nederlag av Sheffield onsdag tisdagen den 14 februari.
Nigerias internationella regering avslog anklagelsen, som bibehölls av en oberoende regleringskommission.
Rovers bötfälldes $ 5000 för sina spelares svar på händelsen.
Han har redan missat ett spel som en del av förbudet, med fredagens match mot Burton ingår också, lämnar honom med ytterligare två spel att tjäna.
Blackburn Rovers midfielder Hope Akpan har fått sitt trematchsförbud för våldsamt beteende utökat till fyra, efter en fotbollsförening anklagelse.