Ciarán Maxwell, 30 år, har anklagats för ett brott mot terrorism, ett bedrägeri och ett missbruk av cannabis.
Han greps i Somerset förra veckan efter sökningar i Larne och Devon.
Marinens gripande var kopplat till två vapendumpar som hittades i Antrim i år.
Maxwell häktades efter ett förhör i Westminster Magistrates' Court i tre minuter.
Han kommer att infinna sig igen i rätten måndagen den 5 september.
Han är anklagad för att tillverka sprängämnen, tillverka anordningar och lagra dem i tunnor i hudar i England och Nordirland.
Ciarán Maxwell dök upp i Westminster Magistrates domstol flankerade i hamnen mellan två civilklädda poliser.
Med en grå tröja, ett stubbskägg och kort hår stod han inför domaren och bekräftade hans namn, ålder och adress i Devon.
Förhöret varade bara tre minuter. Domaren häktade honom tills han är tillbaka i rätten på måndag.
I anklagelserna ingår att skaffa artiklar för användning i terrorism - särskilt kemikalier och komponenter för att tillverka bomber - och att ha en bild av ett anpassat poliskort.
Anklagelserna kommer som en del av den långvariga utredningen av säkerhetstjänsten (MI5), polisen i Nordirland och enheten för bekämpning av terrorism i Sydväst, samt Scotland Yards enhet för bekämpning av terrorism, säger BBC Home Affairs Correspondent Danny Shaw, som var vid domstolen.
Maxwell anklagas för att bedriva forskning som resulterar i "skapandet av ett bibliotek med dokument" som kan vara till nytta för terrorister.
Brotten påstås ha ägt rum mellan den 1 januari 2011 och dagen för gripandet i Somerset den 24 augusti 2016.
Ciarán Maxwell: Fullständig förteckning över avgifter
En separat avgift säger att Maxwell den 24 augusti hade en mängd cannabis i sin ägo med avsikt att leverera.
Han har också åtalats för bedrägeri och anklagas för att ha bilder på bankkort och tillhörande CVC-nummer för användning i samband med bedrägeri.
Maxwell greps den 24 augusti av poliser från Metropolitan Police Services kommando mot terrorism, med stöd av Avon, Somerset, Devon och Cornwall-polisen.
Marinsoldaten, ursprungligen från Larne i County Antrim, fördes till en polisstation i West Country i Somerset innan han flyttades till en polisstation i London i torsdags.
Han ifrågasattes på grund av misstanke om att ha deltagit i förberedelserna för terroristhandlingar enligt avsnitt fem i terroristlagen.
Fastighetssökningar i Exminster är nu klara, medan sökningar på New Powderham Plantation i Devon kommer att fortsätta in i nästa vecka.
Polisen i Nordirland söker i Larne, County Antrim, pågår.
En kunglig marinsoldat från Nordirland har framträtt i domstol anklagad för brott med anknytning till oliktänkande republikanism, inklusive bombtillverkning och lagring av vapen.