Mediauppspelning stöds inte på den här enheten
Muir berättade BBC Skottland hennes veterinärmedicin studier kommer att innebära att hon inte kommer att vara med Skottland laget vid nästa års evenemang på Australiens Gold Coast.
Den 24-årige slutade fjärde och sjätte på 1500m och 5000m på World Athletics Championships.
"Mina tentor är inte förrän maj så Samvälden är i april, det kommer bara inte att fungera tyvärr," sade mellanavstånd löpare.
"Jag går tillbaka till universitetet nästa vecka. Jag har en vecka ledigt och sedan tillbaka till mina studier för att slutföra mitt sista år.
Mediauppspelning stöds inte på den här enheten
"Jag älskar att springa för Skottland när jag kan och samväldet är en av de få möjligheter du kan göra det så, ja, jag är utsliten jag kommer att missa det.
"Men du måste tänka på att få min examen och det var verkligen viktigt för mig. Jag är säker på att laget kommer att göra det, så bra. De kommer att klara sig bra.
"Jag tror att jag har minst två, till och med tre OS till i mig. Vilka händelser? Jag vet inte. Visst, så mycket utrymme för framtiden."
Muir säger dock att VM i inomhus-mästerskap i mars är "potentiellt ett mål".
"De kommande månaderna kommer att bli mycket fulla av mina studier", förklarade hon.
"Det känns som om jag är i resonabel form. Jag skulle vilja springa i Birmingham."
Hellen Obiri upprörd försvarar världsmästare Almaz Ayana för att vinna 5000 miljoner guld i London, med Sifan Hassan tredje.
Muirs tid på 14 minuter 52.07 sekunder var hennes nya utomhus personliga bästa.
"Jag är jätteglad", sa hon efter söndagens lopp.
"Det var riktigt hård konkurrens där ute. Det gläder mig. Jag är verkligen nöjd med hur jag sprang.
"Min femte tävling på 10 dagar - det är en hel del löpning och att fortfarande komma undan med att jag tror att det finns en hel del potential för framtiden."
Laura Muir säger att hon kommer att "fallas" att missa April's Commonwealth Games.