De transaktioner som genomfördes på de europeiska marknaderna registrerades tidigare i Luxemburg, med vilket Amazon hade ett lågskatteavtal.
Nu kommer försäljningen via dotterbolag i Storbritannien, Tyskland, Spanien och Italien att registreras i dessa länder, har återförsäljaren sagt.
Amazon hade fått stor kritik för sin skatteflyktspolitik.
"För mer än två år sedan, började vi processen att etablera lokala land filialer till Amazon EU Sarl, vårt primära detaljhandelsföretag i Europa," sade företaget i ett uttalande.
"Från och med den 1 maj registrerar Amazon EU Sarl detaljhandelsförsäljning till kunder genom dessa filialer i Storbritannien, Tyskland, Spanien och Italien.
"Tidigare registrerades denna detaljhandelsförsäljning i Luxemburg."
Amazon tillade att det var "arbetar på att öppna en filial för Frankrike".
Under de senaste åren har Europeiska unionen intensifierat sina undersökningar av de skatteavtal som förhandlats fram av globala företag med länder som Irland, Luxemburg och Nederländerna.
Kommissionen misstänker att sådana avtal utgör olagligt statligt stöd och snedvrider konkurrensen.
Förra året inledde Europeiska kommissionen - EU:s verkställande arm - en formell granskning av Amazons skatteavtal med Luxemburg.
Och EU tittar också på teknikjätten Apples skatteaffärer i Irland, kaffebutikskedjan Starbucks affärer i Nederländerna och den italienska biltillverkaren Fiats avtal med Luxemburg.
Amazon, den globala online-återförsäljaren, ändrar hur det registrerar försäljningen i ett drag som skulle kunna se det betala mer skatt.