Den Garfield Weston Foundation gjorde priset till Mackintosh Campus Appeal, som syftar till att höja £ 32m.
Mackintosh byggnaden skadades svårt av brand den 23 maj 2014.
Entreprenörer som restaurerar den ikoniska art nouveau-byggnaden av årskurs A hoppas ha avslutat sitt arbete i slutet av februari 2019.
Philippa Charles, chef för Garfield Weston Foundation, sade: "Garfield Weston Foundation stöder organisationer och verksamheter som delar ett engagemang för att göra en positiv inverkan på livet i de samhällen där de arbetar, och som drivs av en önskan att uppnå spetskompetens.
"The Glasgow School of Art sitter i hjärtat av Garnethill samhället och folket i Glasgow håller Mackintosh byggnaden kär.
"Vi är glada över att kunna stödja Mackintosh Campus Appeal som kommer att göra det möjligt för GSA att ta tillbaka denna ikoniska byggnad som en del av ett utökat campus och göra det möjligt för den internationellt erkända Glasgow School of Art att återhämta sig helt från effekterna av branden."
Konstskolan tillkännagav tidigare i år planer på att köpa den tidigare Stow College byggnaden i närheten West Campbell Street för sin utvidgade Garnethill campus.
Syftet är att ge extra utrymme för att rymma en 25% ökning av antalet studenter till 2018.
Nyheten om donationen på 500 000 pund kom fram som utrikesminister för Skottland, David Mundell, beredd att vara värd för ett evenemang för Mackintosh Campus Project i Dover House i London.
Mundell sade: "Det är verkligen ett nöje att vara värd för kvällens insamlingsevenemang för Mackintosh Campus, och att stödja återuppbyggnaden av en ikonisk brittisk institution som har producerat så många ledande arkitekter, designers och konstnärer."
Professor Tom Inns, chef för GSA, tillade: "Det är en viktig möjlighet för oss att dela med oss av våra ambitiösa planer för ombyggnad av campus, bland annat att för första gången på många år samla alla vägar till Konsthögskolan i en renoverad Stow-byggnad, och att ge en uppdatering om restaureringen av Mackintosh-byggnaden."
Efter branden i Mackintosh-byggnaden drog en utredning av den skotska brandkåren slutsatsen att den orsakades av brandfarliga gaser från en behållare med expanderande skum.
Enligt rapporten antändes gaserna när de kom i kontakt med en projektors varma yta.
En välgörenhet har donerat £ 500.000 för att hjälpa Glasgow School of Art (GSA) utöka sin Garnethill campus och reparera den brandskadade Mackintosh byggnaden.