Den f.d. tyske kaptenen, som har utbildat sig ensam eller med de under 23-åringarna under den nye chefen Jose Mourinho, utsågs till deras 25-mans Premier League-trupp på fredag.
Den 32-åriga VM-vinnaren drog sig tillbaka från den internationella fotbollen denna vecka efter 24 mål och 121 kapsyler.
Artonåriga försvararen Axel Tuanzebe har blivit uppkallad i United's 27-man Europa League trupp.
Endast 21 icke-"klubbutbildade" spelare - de som har tillbringat tre år på klubben mellan 15 och 21 - kan namnges i grupper för den europeiska tävlingen.
United kunde bara räkna framåt Wayne Rooney och Jesse Lingard som "club utbildad" så en maximal trupp på 23 kunde namnges, tillsammans med fyra Under-21 spelare i Marcus Rashford, Luke Shaw, Timothy Fosu-Mensah och Tuanzebe.
Schweinsteiger undertecknade ett treårigt avtal i juli 2015 men fick veta av Mourinho förra månaden att det skulle vara "mycket svårt" för honom att spela igen för klubben.
United börjar sin Europa League kampanj bort till holländska klubben Feyenoord den 15 september. De ingår i grupp A tillsammans med Turkiets Fenerbahce och Zorya i Ukraina.
Manchester United's Europa League trupp för 2016/2017 grupp scen: David de Gea, Sergio Romero, Sam Johnstone, Eric Bailly, Phil Jones, Marcos Rojo, Chris Smalling, Luke Shaw, Timothy Fosu-Mensah, Antonio Valencia, Matteo Darmian, Axel Tuanzebe, Paul Pogba, Juan Mata, Jesse Lingard, Jesse Carrick, Daley Blind, Ashley Young, Ander Herrera, Henrikh Mkhitaryan, Marouane Fellaini, Morgan Schneiderlin, Memphis Depay, Zlatan Ibrahimovic, Wayne Rooney, Anthony Martial, Marcus Rashford.
Prenumerera på BBC Sport nyhetsbrev för att få vårt tips på nyheter, funktioner och video skickas till din inkorg.
Midfielder Bastian Schweinsteiger har lämnats utanför Manchester Uniteds Europa League-trupp.