Sektorn för högre utbildning stödde till stor del att stanna kvar i Förenade kungariket och har sedan omröstningen uttryckt oro över de ekonomiska konsekvenserna av att lämna landet.
Universiteten fruktar att förlora forskningsfinansiering, studenter och personal i händelse av en "hård" Brexit.
Men vissa universitet överväger att expandera till Europa som en väg runt problemet.
Universitetet i Kent har haft ett centrum i Bryssel i nästan 20 år, för mer än 200 doktorander från 60 länder, och driver också filialer i Paris, Aten och Rom.
Dessa webbplatser är erkända av relevanta juridiska och pedagogiska myndigheter i varje land och tillåter universitetet "att utveckla och främja förbindelser som gör det möjligt för våra studenter att få viktig tillgång till professionella nätverk", säger ett universitet i Kent talesman.
Andra universitet skulle kunna följa efter när Brexit-förhandlingarna går allt snabbare.
"Man kan föreställa sig en situation efter Brexit där brittiska universitet arbetar lika aggressivt i Europa som de är i Kina och Indien och på andra håll, berättade Chris Mans, rektor för Sheffield Hallam University, Guardian tidningen.
Det finns belägg för att brittiska universitet redan förlorar på forskningssamarbete med europeiska partner.
Brittiska universitet får i samarbete med småföretag 850 miljoner pund i forskningsanslag varje år från Europeiska unionen.
Universiteten oroar sig också för att det skulle bli svårare för dem att rekrytera studenter och personal från EU-länderna om restriktionerna för fri rörlighet infördes och reglerna för avgifter för EU-studenter ändrades inom ramen för Storbritanniens nya förbindelser med EU.
EU-studenter betalar för närvarande samma avgifter och har samma tillgång till lån som brittiska studenter - och universitetens president Dame Julia Goodfellow har redan krävt försäkringar för dem som redan har påbörjat examina vid brittiska universitet om att dessa arrangemang kommer att pågå under hela deras kurser.
Filialer inom EU skulle kunna göra det möjligt för brittiska universitet att behålla forskningslänkar och europeisk finansiering och samtidigt göra det möjligt för dem att fortsätta att attrahera personal och studenter.
Guardian citerar en rektor som säger att institutionerna var "fönstershopping" för de EU-länder som har de mest kooperativa regelverken.
Tyskland, Finland, Irland och de baltiska staterna sägs vara de bästa alternativen för vissa universitet.
Alistair Jarvis, vice verkställande direktör för universiteten Storbritannien, sade brittiska universitet stod inför "betydande utmaningar".
"Brittiska universitet kan frodas efter utträdet med rätt stöd från regeringen", säger Jarvis.
"För att frodas efter utresan måste regeringen vidta åtgärder för att göra Storbritannien till en ännu mer attraktiv destination för begåvad universitetspersonal och studenter från hela världen och utveckla nya strategier och finansiering för att förbättra det internationella forskningssamarbetet."
Oxford University säger att det inte har några planer på att expandera utomlands, även om rektor Louise Richardson har uttryckt oro över att förlora personal till andra länder.
– Våra akademiker kanske beslutar sig för att ge sig av om de är oroliga för att de kanske inte kan få sin forskning finansierad i framtiden.
"Det finns många universitet i världen som skulle vara glada över att ha dem och som närmar sig dem", berättade hon BBC Radio 4's Today Programme.
Utrikesminister Boris Johnson har sagt till BBC att formella förhandlingar om att lämna EU troligen kommer att inledas i början av 2017.
Förenade kungarikets universitet skulle kunna öppna campus i Europa för att motverka effekterna av Brexit, har vissa rektorer föreslagit.