De fann länken efter att ha analyserat observationsstudier som omfattade mer än 300 000 personer.
Brittiska experter sade att personer med långvariga sjukdomar och odiagnostiserad diabetes ofta kände sig trötta under dagen.
Men de sade att det inte fanns några bevis för att tupplur orsakade eller ökade risken för diabetes.
Den stora studien, som genomförts av forskare vid University of Tokyo, presenteras vid ett möte i European Association for the Study of Diabetes i München.
Deras forskning fann att det fanns ett samband mellan långa tupplurar på mer än 60 minuter och en 45% ökad risk för typ 2-diabetes, jämfört med ingen dagtid tupplur - men det fanns inget samband med tupplurar på mindre än 40 minuter.
Forskarna sade att långa tupplurar kan vara ett resultat av störd sömn på natten, eventuellt orsakad av sömnapné.
Och denna sömnstörning kan öka risken för hjärtinfarkt, stroke, kardiovaskulära problem och andra metaboliska störningar, inklusive typ 2-diabetes.
Sömnbrist, som orsakas av arbete eller sociala livsmönster, kan också leda till ökad aptit, vilket kan öka risken för typ 2-diabetes.
Men det var också möjligt att personer som var mindre friska eller i början av diabetes var mer benägna att sova längre under dagen.
Kortare tupplurar, däremot, var mer benägna att öka vakenhet och motoriska färdigheter, sade författarna.
Naveed Sattar, professor i metabolisk medicin vid University of Glasgow, sade att det nu fanns en hel del bevis på något slags samband mellan sömnstörningar och diabetes.
– Det är troligt att riskfaktorer som leder till diabetes också orsakar tupplur. Detta kan inkludera något höga sockernivåer, vilket innebär att tupplur kan vara ett tidigt varningstecken på diabetes," sade han.
Men det krävdes ordentliga försök för att avgöra om sömnmönster gjorde skillnad mot "verkliga hälsoeffekter".
Dr Benjamin Cairns, från cancerepidemiologiska enheten vid universitetet i Oxford, sade att resultaten bör behandlas med försiktighet.
"I allmänhet är det inte möjligt att dra slutsatser om orsak och effekt baserat enbart på observationsstudier, eftersom de vanligtvis inte kan utesluta alternativa förklaringar till sina resultat", sade han.
Napping i mer än en timme under dagen kan vara ett varningstecken för typ 2-diabetes, föreslår japanska forskare.