Det kommer att stänga för all trafik på 20:00 GMT och öppna 48 timmar senare, varje helg till 19 December.
Under arbetet kommer cirka 50.000 ton material att läggas på den 2,9 kilometer långa banan.
Traditionellt sett har flygplatserna stängt i upp till 14 dagar för att utföra detta arbete.
Flygplatschefer sade att slutföra renoveringen under flera helger snarare än alla på en gång var "det bästa sättet att undvika större störningar".
Avvecklingarna beslutades efter två års diskussioner med detaljhandlare och flygbolag, tillade flygplatsledningen.
"Några av våra återförsäljare renoverar sina butiker som de inte skulle kunna göra när flygplatsen är öppen", säger Jack Kelly från EMA.
"Vi har sett till att flygningar kan komma in före stängningen och fler flygningar kan gå ut efter det, så vi begränsar mängden störningar."
Banan renoverades senast 1999 och har en livslängd mellan 12 och 17 år.
Ingenjörer kommer också att byta ut 1.200 lampor runt banan mot lysdioder.
Banan kommer att delas upp i sju sektioner, med en bit repareras och stängs av varje helg.
East Midlands Airport (EMA) kommer att stänga senare under den första av sju på varandra följande helger för att återupptäcka banan - en första för en brittisk flygplats, har chefer sagt.