Men analytiker säger att höga europeiska gaslager kommer att begränsa turbulensen.
Gasterminerna steg med upp till 10 % i den tidiga handeln, medan riktpriset på olja steg med mer än 2 %.
Handlarna är oroade över stabiliteten i försörjningen från Ryssland, som tillhandahåller en fjärdedel av Europas naturgas, hälften genom Ukraina.
En relativt mild vinter har dock minskat efterfrågan på bränsle för uppvärmning, och lagringen vid de viktigaste gascentralerna är cirka 20 % större än förra året.
I Tyskland, Europas största gaskonsument och Rysslands största kund, har lagren mer än 60 % av kapaciteten och kan tillgodose 60 dagars efterfrågan.
Ryssland är Europas största leverantör av naturgas, men kontinenten har under det senaste årtiondet avvänjt sig från beroendet av sin granne.
Den importerar nu mindre än 30 % av sin naturgas från Ryssland, jämfört med 45 % 2003, enligt EU:s statistik.
Europa är också mindre beroende av Ukraina länken, med förbättrad gasinfrastruktur nu vilket innebär att leveranser kan gå via alternativa vägar i händelse av avbrott.
Nord Stream-ledningen, som går genom Östersjön till Tyskland, eller en annan väg till Tyskland via Vitryssland och Polen, är två alternativ.
Den ryska statliga gasproducenten Gazprom planerar också att bygga en ny undervattensledning - South Stream - för att kringgå Ukraina senast 2016.
"Låg användning innebär Ukrainas gasnät är av mindre betydelse idag än tidigare," sade amerikanska marknadsanalytiker, Bernstein Research, i en not till kunder.
Det råder också tvivel om att Ryssland skulle ha råd att störa eller skära ned en del av sin gasförsörjning till Europa, vilket är värt nästan 100 miljoner pund om dagen. Analyser uppskattar att den står för cirka 3 % av den ryska ekonomiska produktionen.
Rysslands ekonomi visade en nedslående tillväxt på 1,3 % förra året, och dess centralbank har sänkt sina egna prognoser och förutsett en tillväxt på under 2 % fram till åtminstone 2016.
Gazprom sade i måndags att leveranser till Europa via Ukraina var opåverkade, men en tidigare rysk leveransminskning till Ukraina orsakade stora störningar över hela kontinenten och pressade upp priserna avsevärt.
I januari 2009 stängde Ryssland av kranarna till sin granne i en rad över kontraktspriser och anklagelser om att Ukraina hade puttra bort gas som var avsedd för europeiska kunder.
Den två veckor långa avstängningen, under en mycket kall period, resulterade i allvarliga störningar över hela kontinenten, med mer än ett dussin länder utan deras förväntade leveranser av rysk gas.
Från Andrew WalkerBBC World Service Economics korrespondent
Energi står i centrum för de kommersiella förbindelserna mellan Ryssland och Europeiska unionen.
Ryssland är EU:s största externa leverantör av olja, kol och gas, som är viktiga bränslen för både el och uppvärmning.
Det är otillåtet för båda sidor att göra sig av med denna handel. Ryssland behöver inkomsterna från sin största exportmarknad, och Europa behöver energin - även om tidpunkten gör den mindre sårbar än den kan vara. En relativt mild vinter närmar sig sitt slut, och Europa har sunda gaslager.
Men energi är ett slagfält där varken EU eller Ryssland vill kämpa.
Särskild rapport: Energi
Bulgarien, Serbien och Bosnien, som var nästan helt beroende av leveranser via Ukraina, hade stora brister.
Delar av Europa var tvungna att stänga industrianläggningar och hushållsvärmesystem, hitta alternativa gaskällor eller byta ut energianläggningar mot olja. Slovakien och Bulgarien övervägde att starta om malblockerade kärnreaktorer.
Även om handlarna säger att sunda europeiska gaslager skulle begränsa effekterna av ytterligare en nedläggning, skulle alla störningar i den nuvarande krisen med största sannolikhet leda till en kraftig ökning av gaspriserna.
"Shifts på den globala energimarknaden har lämnat Ryssland med mindre grepp, men detta är ändå viktigt", säger Michala Marcussen, ekonom på Societe Generale, i ett forskningsmeddelande.
Gazprom har redan varnat Ukraina att det kan öka gaspriset i Kiev efter det första kvartalet.
"Situationen med betalningar är oroande", sade Andrei Kruglov, Gazproms ekonomichef.
"Ukraina betalar, men inte så bra som vi skulle vilja. Vi funderar fortfarande på om vi ska förlänga prisavtalet till nästa kvartal baserat på löpande priser."
Oron över en av Europas viktigaste gasförsörjningsvägar har fått en dominoeffekt på andra råvaror, särskilt olja, i takt med att efterfrågan på alternativa bränslen ökade.
Benchmark oljepriset, Brent Rå, steg till en topp på $112.10 per fat i tidig handel, dess högsta sedan 30 December.
Ökningen beror också på oron för oljeförsörjningen från Ryssland, en av världens största oljeproducenter, samt på effekterna av eventuella störningar på gasmarknaden.
"Oljemarknaderna reagerar på potentialen att situationen kan förvärras", säger Ben Le Brun, marknadsanalytiker på OptionsXpress.
"Jag misstänker definitivt att olja kommer att röra sig mycket högre, om det faktiskt kommer till krig."
Samtidigt steg de brittiska priserna på gasmarknaden för leverans nästa månad så mycket som 10 %, och de tyska och nederländska priserna steg med liknande belopp, enligt ICE Futures Europe exchange.
Oroligheterna i Ukraina ledde också till rekordlåga ryska rubel mot US-dollarn, vilket fick Rysslands centralbank att höja sin centrala utlåningsränta med 1,5 %.
Till följd av detta minskade huvudindexet för ryska aktier, MICEX, med 11 % och Gazpromandelarna sjönk med 13 %.
Gas- och oljepriserna har stigit med oro för att krisen i Ukraina skulle kunna ha en skadlig inverkan på en av Europas viktigaste energiförsörjningsvägar.