Aswad Thomas bröt dödläget för värdarna, på väg mot Sam Magris väg hem efter 22 minuter, men därifrån tog besökarna befälet.
Andy Cook tog sina mål stämmer för säsongen till 10 med en tandställning, notching någon sida av halvtid, innan ett eget mål från Mitchell Walker och Ben Tollitt fjärde lagt sent glans till poänglinjen.
Den eftertryckliga segern räckte inte för att Rovers skulle klättra högre i National League-bordet, men de har täppt till klyftan bakom ledare Forest Green Rovers till fyra poäng.
Matchrapport från Pressföreningen.
Matchändar, Dover Athletic 1, Tranmere Rovers 4.
Andra halvlek, Dover Athletic 1, Tranmere Rovers 4.
Substitution, Tranmere Rovers. Ethan Jones ersätter Andy Cook.
Substitution, Tranmere Rovers. Michael Ihiekwe ersätter Lee Vaughan.
Substitution, Tranmere Rovers. Adam Mekki ersätter Darren Stephenson.
Mål!  Dover Athletic 1, Tranmere Rovers 4. Ben Tollitt (Tranmere Rovers).
Darren Stephenson (Tranmere Rovers) visas det gula kortet.
Substitution, Dover Athletic. Moses Emmanuel ersätter Jack Parkinson.
Ett eget mål av Mitchell Walker, Dover Athletic.  Dover Athletic 1, Tranmere Rovers 3.
Mål!  Dover Athletic 1, Tranmere Rovers 2. Andy Cook (Tranmere Rovers).
Andra halvan börjar Dover Athletic 1, Tranmere Rovers 1.
Första halvlek, Dover Athletic 1, Tranmere Rovers 1.
Lois Maynard (Tranmere Rovers) visas det gula kortet.
Mål!  Dover Athletic 1, Tranmere Rovers 1. Andy Cook (Tranmere Rovers).
Mål!  Dover Athletic 1, Tranmere Rovers 0. Aswad Thomas (Dover Athletic).
Första halvan börjar.
Lineups tillkännages och spelarna värms upp.
Tranmere kom bakifrån för att kryssa till en bekväm 4-1 seger över Dover på Crabble Athletic Ground.