Strejken är över en löneökning på 1 procent som förra året tilldelades alla barnmorskor i England, Skottland och Wales.
Hälsodepartementet sade tjänstemän arbetade för att säkerställa en säker service tillhandahölls under avbrottet.
Det sades att barnmorskor i Nordirland hade samma bosättning som kolleger i England.
"Även om vi skulle vilja vara i en position att ha gjort mer under 2014/15, är det viktigt att erkänna barnmorskor och annan icke-medicinsk personal fick minst 1% extra med den genomsnittliga ökningen genom inkrementell progression är 3,7% och vissa personal som får 6,7% mer", sade en talesman.
Medan de mest seniora barnmorskorna i Nordirland fick ökningen av en engångsbetalning i mars förra året, gjorde de på lägre betalband inte det.
Istället fick de flesta den årliga upplyftningen på cirka 1.500 pund.
Enligt Royal College of Midwives (RCM) bör alla barnmorskor få en ökning på 1 procent, som på andra håll i Storbritannien, oavsett deras band, samt den lönehöjning som är inbyggd i lönesystemet.
Det har visat sig att samtalen återupptogs på tisdagen mellan hälsodepartementet och några av hälsovårdsförbunden.
Även om dessa förhandlingar har beskrivits som positiva planeras ytterligare industriella åtgärder, inklusive krav på all övertid.
Amy Leversidge på RCM sa att avdelningen var "att vara fräck" för att antyda att barnmorskor i Nordirland hade fått samma löneökning som sina engelska kollegor.
Hon sa att personal på högre betalband hade fått en 1% "tillfällig upplyft" till sin grundlön i februari, men i början av räkenskapsåret i april, deras lön gick tillbaka till 2013 nivåer.
Den ökade utvecklingen på grundval av erfarenhet och prestation var en del av NHS lönestruktur snarare än en löneökning, sade fackets rådgivare i arbetsmarknadsrelationer.
"Vi vill inte vänta till februari 2016 för att ta reda på vad som händer - vi vill förhandla fram en lösning nu", sade hon.
Barnmorskan Hazel McAllister sade till BBC: "Vi är inte mindre passionerade, omtänksamma eller hårt arbetande än kolleger i andra delar av Storbritannien som har fått denna lönehöjning på 1 procent.
"Vi känner oss mycket undervärderade av de krafter-den-den-var som har vägrat att betala detta.
"Jag har varit barnmorska i 37 år - det är ett fantastiskt yrke men jag skulle oroa mig för dess framtid."
Barnmorskor i Nordirland iscensatte en fyra timmars strejk från 08:00 BST och 12:00 BST på torsdag i en lönetvist.