Försvarsmästare Spieth, 22, hade en fyrdubbla-bogey sju på par-tre 12: e som Danny Willett blev den första engelsmannen sedan Faldo 1996 att vinna.
Amerikanen hade blivit den första mannen som ledde mästarna i sju raka ronder in i den sista dagen.
"Det här kommer att ärra honom. Detta kommer att skada honom ett tag, "sade Faldo, som också vann tre Open Championships.
"Vi är alla i chock med vad som hände Jordan," tillade Faldo, som vann sin tredje och sista Green Jacket under liknande omständigheter till Willett när Greg Norman blåste en sex-shot bly 1996.
"96 fick du känslan av att Greg kämpade, men det var bit för bit. Det som hände Jordan var så plötsligt, bara pang. Det var 10 minuter golf. Det är det hårda i det."
Spieth, som hade kortat fyra på varandra följande fåglar för att öppna en fem-shot bly med nio hål att spela, har sagt att han hoppas att han "aldrig mer upplever" en liknande kollaps av form.
Jordan Spieth kommer att "skäras" av sin kapitulation på mästarna på söndagen, säger trefaldig vinnare Sir Nick Faldo.