De två ledande parisiska klubbarna planerar att samlas för säsongen 2017-18.
"Det är en enorm chock, det finns en stor rivalitet i derby spel," Phillips berättade BBC Wales Sport.
Nya Zeeland legend Dan Carter leder Racings lista över stjärnor medan Italiens Sergio Parisse är på Stade böcker.
Stade Francais vann den franska topp 14 titeln 2014-15 medan Racing tog över som mästare året därpå, men båda är för närvarande i den nedre halvan av divisionen.
Racings nya arena med 30 000 kapacitet kommer att slutföras senare under 2017 medan deras rivaler har uppdaterat och utökat sina Stade Jean-Bouin hem för att ta 20 000 fans under de senaste åren.
Phillips, nu med Sale Sharks, spelade för Racing för två och en halv säsonger och sade att han inte trodde de första rapporterna från Paris.
"Jag är enormt förvånad", sa han.
"Killarna (på Sale) pratade om det under träningen och först sa jag "Det är inte sant, det är bara de franska medierna" men det var på riktigt."
Phillips vann 94 kapsyler för Wales och gjorde fem Test framträdanden för de brittiska och irländska Lions innan partner Carter i den blå och vita Racing färger.
Wales kollegor Jamie Roberts, Luke Charteris och Dan Lydiate har också spelat för Racing.
"Stade vann ligan för två år sedan, de slog oss två eller tre gånger, sedan året därpå lyckades vi vinna ligan och vår president Jacky Lorenzetti var glada," tillade Phillips.
"Båda klubbarna har en enorm historia i franska rugby och Stade Francais har vunnit titeln många gånger, de har en massiv tradition precis som Racing."
Han säger att rivaliteten till och med sträckte sig till där spelarna var avsedda att leva.
"Du fick inte leva i ett visst område eftersom det är där majoriteten av Stade Francais spelare bodde och det drevs av Jacky Lorenzetti, han var i kontroll över det," sade han.
Den föreslagna sammanslagningen har ännu inte godkänts av de franska myndigheterna, LNR.
Tidigare Wales scrum-halv Mike Phillips chockas av en planerad sammanslagning mellan hans tidigare klubb Racing 92 och deras rivaler Stade Francais.