FBI har beordrat teknikjätten att hjälpa den med att låsa upp en iPhone som används av San Bernadino revolvermannen Syed Farook.
Prins Al Hussein sa att polisen "behöver allas fulla stöd" i sin utredning.
Men krypteringen var nödvändig för frihetens skull, tillade han.
"Det finns många sätt att undersöka om dessa mördare hade medbrottslingar förutom att tvinga Apple att skapa programvara för att undergräva säkerhetsfunktioner i sina egna telefoner," sade han i ett uttalande.
"Det är potentiellt en gåva till auktoritära regimer, liksom till kriminella hackare.
"Det krävs kryptering och anonymitet som möjliggör både yttrandefrihet och åsiktsfrihet och rätten till privatliv. Utan krypteringsverktyg kan liv hotas."
Syed Rizwan Farok och hans fru Tashfeen Malik dödade 14 personer och lämnade 22 skadade när de öppnade eld på hans arbetsplats i Kalifornien i december 2015.
FBI har bett Apple att inaktivera en funktion som innebär att data på en iPhone raderas efter 10 felaktiga försök med det fyrsiffriga lösenordet. Den vill också kunna köra programvara som kan gå igenom 10 000 möjliga kombinationer för att låsa upp revolvermannens telefonlur snabbt.
Apple säger att gå med på begäran skulle sätta "ett farligt prejudikat".
Ett antal stora tech-företag har också lovat sitt stöd för Apples vägran att kringgå sin egen säkerhet.
Två grupper av tekniska jättar har nu lämnat in en amicus brief, som tillåter parter som inte är direkt involverade i ett domstolsmål, men som känner att de påverkas av det, att ge sin åsikt.
De inkluderar Twitter, AirBnB, eBay, LinkedIn, Reddit, Amazon, Microsoft, Snapchat och Yahoo.
Men en advokat som representerar en grupp av Farooks överlevande offer sa att han skulle lämna in liknande juridiska papper för deras räkning till stöd för FBI.
"De var riktade mot terrorister, och de behöver veta varför, hur detta kunde hända", sade Stephen Larson, en före detta domare.
Han vägrade att säga hur många av offren han representerade, men tillade att han inte skulle ta ut någon avgift av dem.
Zeid Ra'ad Al Hussein, FN:s högkommissarie för mänskliga rättigheter, har varnat för att en "pandoras låda" kommer att öppnas om Apple samarbetar med FBI.