De små kräftdjuren är en naturligt förekommande parasit som kan orsaka sjukdomar och som orsakar många förluster för vilda och odlade fiskbestånd.
Med ökande motståndskraft mot kemiska behandlingar har Glasgows team tittat på avelsresistens.
Det har nu kommit fram till ett nytt protokoll för att föda upp resistenta fiskar och utvecklat en matematisk modell för att förutsäga utfall.
Havslöss kan orsaka hudskador och ökad känslighet för infektioner genom att undertrycka värdens immunsystem.
Parasiten beräknas kosta den globala fiskodlingsindustrin hundratals miljoner pund om året.
Professor Michael Stear sade: "Sjölössinfektion är ett stort hot mot hälsan hos odlad lax och mot fiskodlingens ekonomi.
– Vår forskning har tagit fram ett praktiskt verktyg för att kvantifiera resistens mot havslöss och visat att urvalet avsevärt kan minska behovet av läkemedelsbehandlingar.
"Särskild avel för havslössresistens bör minska havslössens inverkan på fiskhälsan och därmed avsevärt förbättra hållbarheten i laxproduktionen i Atlanten."
Studien som beskriver Glasgow University-modellen publiceras i Royal Society journal Interface.
WWF Scotland Director Lang Banks sade: " Det råder ingen tvekan om att havslöss är ett stort problem för Skottlands laxodlingsindustri och att stora mängder kemikalier för närvarande används för att bekämpa problemet.
– Om vi ska kunna skydda miljön i stort är det välkommet att hitta sätt att minska industrins beroende av kemikalier.
"Eftersom kemisk användning bara är en av ett antal miljöeffekter från laxodlingen måste vi dock se fler gårdar ansluta sig till vattenbruksrådets märkningssystem för ansvarsfullt jordbruk och förbinda sig att verka mer hållbart i alla aspekter av sin verksamhet."
Forskare vid Glasgow University har utvecklat ett nytt sätt att skydda odlad lax från löss.