Medlemmar i RMT facket kommer att gå ut kl 11:00 BST den 26 april och samtidigt den 10 och 12 maj.
Fackföreningen motsätter sig planer på en ny klass av arbetsledare ombord och förslag på att förare ska manövrera dörrar.
Govia Thameslink sade att det inte skulle bli någon förlust av arbetstillfällen eller lönesänkningar och förändringarna skulle göra personalen mer synlig.
Unionsmedlemmarna var 306 för frigång och 14 emot. Totalt 320 röster till en stödde andra former av industriella åtgärder.
RMT sa att det var att kämpa för att behålla dirigenten och förändringarna var "inget annat än mobbning och trakasserier".
RMT:s generalsekreterare Mick Cash sa att "lönen" för medlemmarnas "lojala och professionella service" hade minskat deras "roll och ansvar och deras hårda förtjänade villkor attackerade".
"Dessa tåg är desperat överbefolkade och ledarna är ögon och öron som förhindrar en stor tragedi på plattformar och vagnar", sade han.
Han tillade att företaget redan hade yxat cateringtjänster, "hotat" biljettkontor och levererat "påfyllningsnivåer av kundservice i sin körning för att mjölka dessa rutter för varje öre de kan".
En talesman för Southern, som drivs av Govia Thameslink, beskrev alla möjliga strejkaktioner som "onödiga och skadliga".
Han tillade: " De förändringar vi gör i ledarrollen innebär att det inte kommer att bli någon förlust av arbetstillfällen och ingen minskning av lönen för någon personal, medan passagerarna kommer att ha nytta av att ha mer synlig personal på tåg.
"Vi förbereder beredskapsplaner om en strejk skulle fortsätta, men under tiden uppmanar vi RMT att återvända till förhandlingsbordet."
Southern verkar i Sussex, Surrey och delar av Kent och Hampshire.
Ledare på södra järnvägen ska iscensätta tre 24-timmarsstrejker i en tvist om förändringar av deras roll och införandet av endast förartåg.