Flyttningen tillkännagavs av president Thein Sein, som tidigare avvisade FN:s krav på en oberoende undersökning.
Konflikterna mellan Rakhine Buddhister och Rohingya Muslims också fördrivit tusentals människor.
FN välkomnade undersökningen och sade att den skulle kunna ge "viktiga bidrag" till att återställa freden.
Generalsekreteraren Ban Ki-moons talesman sade att det kunde skapa en "konduktiv miljö för en mer inkluderande väg framåt för att ta itu med de underliggande orsakerna till våldet, inklusive tillståndet för de muslimska samhällena i Rakhine".
Vad utlöste våldet i juni?
Våldtäkten och mordet på en ung buddistisk kvinna i Rakhine i maj satte i gång en kedja av dödliga religiösa sammandrabbningar
Varför förklarades ett undantagstillstånd?
Att göra det möjligt för militären att ta över den administrativa kontrollen över regionen
Vilka är Rohingyas?
FN beskriver dem som en förföljd religiös och språklig minoritet från västra Burma. Den burmesiska regeringen säger att de är relativt nya invandrare från den indiska subkontinenten. Bangladesh är redan värd flera hundra tusen flyktingar från Burma och säger att det inte kan ta längre
Q & A: Oro för Rakhine
Rohingyas berättar om terror
Burma profil
Ett uttalande på Thein Seins hemsida sade på fredag 27-medlemskommissionen skulle innehålla representanter från olika politiska partier och även religiösa organisationer.
Kommissionen skulle lägga fram sina slutsatser nästa månad.
Våldet i Rakhine-staten började i slutet av maj när en buddhistisk kvinna våldtogs och mördades av tre muslimer. En pöbelhop dödade senare 10 muslimer i vedergällning, även om de inte hade något samband med den tidigare händelsen.
Sekteristiska sammandrabbningar spreds över hela staten, och hus av både buddhister och muslimer brändes ner.
UNHCR har sagt att omkring 80.000 människor har fördrivits i och runt Sittwe och Maungdaw av våldet.
Det finns långvariga spänningar mellan Rakhine-folket, som är buddhister och utgör majoriteten av statens befolkning, och muslimer.
De flesta av dessa muslimer identifierar sig som Rohingya, en grupp som hade sitt ursprung i en del av Bengalen, som nu kallas Bangladesh.
Burma har inrättat en kommission för att undersöka den senaste tidens våld mellan buddhister och muslimer i västra delen av landet, där dussintals dog.