BBC avslöjade i januari förstod att Adidas skulle avsluta affären som ett direkt resultat av doping skandal svepa sporten.
I ett IAAF uttalande på fredag sade: "Vår affärsrelation avslutas i slutet av 2016."
Det ursprungliga 11-åriga avtalet inleddes 2008.
Källor berättade BBC tidigare i år var det värt, i form av kontanter och produkt, så mycket som $ 8m (6,3 miljoner pund) per år.
Adidas sade att beslutet var ömsesidigt och tillade "vi vill tacka IAAF för ett framgångsrikt och professionellt samarbete".
Adidas, IAAF:s största sponsor, har meddelat att den avslutar sitt sponsoravtal med idrottsvärldens styrande organ tre år tidigare.