Konflikten med Edinburgh är Townsends sista som Glasgows huvudtränare, innan han tar ansvar för landslaget.
Han kommer att namnge sin trupp för Juni fixturer mot Italien, Australien och Fiji på måndag.
"Det här spelet är verkligen viktigt för att slutföra vem vi ska ta," Townsend berättade BBC Skottland.
"Vi tänkte meddela det för ett par veckor sedan, men tänkte att skulle inte ha varit rättvist på de spelare som är inblandade i detta spel.
Mediauppspelning stöds inte på den här enheten
"Det är den sista matchen för säsongen, vi vet vem som är tillgänglig i form av skador efter denna helg, och det är en möjlighet för vissa spelare som kan vara nära valet för att driva sig in i den sista gruppen."
Townsend's Warriors har misslyckats med att tjäna en Pro12 semi-final plats för första gången i fem säsonger, slutar på sjätte plats oavsett lördagens resultat.
Deras inter-city rivaler har uthärdat en hektisk liga kampanj - avslutar en körning av åtta på varandra följande nederlag med fredagens seger över drakarna - och kan avsluta inte högre än nionde.
Den tillträdande Scotland chefen kommer att leda sina nya avgifter på en tre-Test södra halvklotet turné, tar på Italien i Singapore, Australien i Sydney, och slutligen Fiji i skärgårdshuvudstaden Suva.
"Den ena positiva ur ett Skottland perspektiv om varken Glasgow eller Edinburgh göra play-offs är att vi kommer att ha mer tid att arbeta med spelarna," Townsend tillade.
"Vi kommer att ha en tre veckor lång upptrappning till vår turné. Det kommer att bli riktigt spännande, vi ska till en ny miljö, Singapore att spela Italien, sedan Sydney att spela Australien, sedan vidare till Fiji. Så sex veckor att arbeta med den gruppen av spelare är ovärderligt för oss som nya tränare."
Den tidigare Skottland internationella, som vann 82 kapsyler, kommer att ha en nästan full styrka komplimang av spelare till sitt förfogande, med Warriors duo Stuart Hogg och Tommy Seymour den enda skottar att vinna urval för brittiska och irländska Lions turné i Nya Zeeland.
"Vi är ute efter att ta vår starkaste trupp," Townsend sade. "Så efter denna helg de spelare som är tillgängliga, spelare som är på form, spelare som har spelat bra för Skottland, har fått den bästa chansen att gå på den turnén."
Townsend kommer också att ha tidigare Scotland kapten Mike Blair på sin flank, med pensionerade scrum-halva gå den nationella coaching uppsättningen för trio av tester.
Blair tog upp rollen som kompetenscoach med Glasgow efter att ha gått i pension från att spela i april förra året, och kommer att förbli med Warriors personal utanför internationella fönster.
"Mike är en ny tränare, han har bara varit coaching för den här säsongen, men han har visat en riktigt bra engagemang för rollen," Townsend sade.
"Han arbetar mycket hårt, han har varit en stor hjälp för mig när det gäller attacken, han har varit en stor hjälp för spelarna också med den skicklighet arbete han gör och det nära arbete han gör med scrum-halvorna.
"Så att ha honom när vi är på turné och när vi är i testfönster kommer att vara bra, men också för honom att fortsätta [i Glasgow] arbeta med gruppen kommer att vara utmärkt för Glasgow spelarna."
Gregor Townsend säger lördagens 1872 Cup derby ger en sista chans för spelare att tvinga sig in i hans första Skottland trupp.