De viktigaste rummen på bottenvåningen i det ståtliga hemmet ska restaureras, medan de övre våningarna ska användas till utställningar och evenemang.
De viktigaste rummen ska återskapas som de var på 1700-talet.
Den 8:e e Earlen av Onslow, vars familj återuppbyggde huset på 1720-talet, har sagt att det bör förbli en ruin.
Den Palladiska herrgården nära Guildford testamenterades till NT 1956 av familjen Onslow.
Omkring 95% av grad I-listade huset, som fanns med i 2008 års film The Duchess med Keira Knightley, skadades.
Trusten sade att det var säker på att ett antal huvudrum på bottenvåningen, inklusive Marble Hall, Talarnas Parlour och Saloon, kunde återställas.
En talesman sade: " Det faktum att så många detaljer överlevde och föremål från rummen håller på att återvinnas ur askan gjorde att det var nödvändigt att återställa dem.
"Den bestående betydelsen av arkitekt Leonis ursprungliga design innebär att det kommer att gå tillbaka i stället för att titta på 18th Century dekorativa planer och layout av huset."
Trusten sade att de övre våningarna var "mindre arkitektoniskt betydelsefulla" och hade redan ändrats sedan huset först byggdes.
Helen Ghosh, generaldirektör för National Trust, sade: " Elden vid Clandon var chockerande, men ger oss möjlighet att inte bara visa vår respekt för det förflutnas arv, utan också att skapa ett nytt arv för framtiden.
"Förlusten av så många av innehållet i huset innebär att vi inte kan återlämna det till hur det såg ut dagen före branden.
"Men nu vet vi mer om den ursprungliga layouten och inser att husets bestående betydelse är dess arkitektur."
Trusten sa att den hade tittat på ett antal alternativ för huset för att se till att Clandon Park förblev öppen och tillgänglig för allmänheten.
En talesman sade att kostnaden för arbetet förväntades till stor del tillgodoses genom trustens försäkring, även om man också skulle be supportrar om donationer.
Källa: Nationellt förtroende
Delar av Clandon Park House, som reducerades till ett skal av en brand i april, kommer att återställas till sin "ursprungliga ära", säger National Trust (NT).