The Welsh Amatör Boxing Association (WABA) säger att revisionen inte fann några bevis för bedräglig verksamhet,
Men dess ordförande sade att den skulle vidta alla de åtgärder som rekommenderades för att ställa saker och ting till rätta.
Sport Wales sade att det skulle fortsätta att finansiera föreningen, men det hade infört särskilda åtgärder.
Rapporten om verksamheten i Wales Amatör Boxing Association (WABA) beställdes av föreningen, tillsammans med den walesiska regeringen och Sport Wales som övervakar och främjar idrott och ger råd till regeringen.
Revisionen utfördes av revisionsbolaget KTS Owens Thomas.
I sin rapport, som har publicerats i redigerad form på WABA:s webbplats, sade revisorerna: "Vi anser att WABA i sitt nuvarande skick inte är ändamålsenligt och inte kvalificerar sig för att ta emot offentliga medel.
"Sport Wales måste överväga konsekvenserna av detta konstaterande.
"Vi anser att WABA i och med genomförandet av rekommendationerna i denna rapport kommer att bli lämpligt för ändamålet och kvalificera sig för att ta emot offentliga medel."
Under 2012 fick WABA bidrag från Sports Wales på drygt 190 000 pund - mer än dubbelt så mycket som dess 89 000 pund under 2006.
I revisionsrapporten anges en rad ekonomiska aspekter:
Rapporten tar också upp frågor om hur föreningen har drivits sedan den blev aktiebolag 2003.
Det framhölls: " Vissa medlemmar har uttryckt oro över att WABA inte är öppet för konstruktiva utmaningar och att det tycks finnas splittringar i medlemskapet.
– Sammantaget har vi funnit att bolagsstyrningen är dålig och dysfunktionell. Vi anser att den håller på att förbättras, men att den inte har nått en acceptabel nivå."
Revisorerna ger 38 rekommendationer för idrottsorganets framtid, bland annat åtgärder för att skärpa den finansiella kontrollen, banksystemen och utgiftsförvaltningen.
I deras rapport uppmanas också styrelsen att "förbättra kulturen i WABA" och att samarbeta med Sports Wales för att se till att den följer en handlingsplan för att genomföra rekommendationerna.
"Oacceptabelt"
Som svar på rapporten sade WABA:s ordförande Terry Smith till BBC Wales: "Vi är uppenbarligen mycket besvikna, men vi kommer att vidta alla de åtgärder som rekommenderas för att ställa saker och ting till rätta så snabbt som möjligt."
Han sade att mycket av organisationen drevs av oavlönade volontärer som inte hade formell ekonomisk utbildning.
Men han ifrågasatte några av rapportens resultat, bland annat frågan om icke-stödda utgifter.
Sport Wales sa att WABA: s misslyckanden var "enkelt inte acceptabelt".
Verkställande direktören, Sarah Powell, sade att det nu fanns en handlingsplan för att lösa problemen vid WABA.
Hon tillade: "I idrottens gräsrotsaktörers och elitkonkurrenters intresse har Sport Wales beslutat att fortsätta finansiera WABA, men har infört särskilda åtgärder för att skydda offentliga medel, tills tillfredsställande framsteg har gjorts med rekommendationerna."
Det organ som ansvarar för amatörboxning i Wales är "inte lämpligt för ändamål" och "kan inte få offentlig finansiering", säger en oberoende revisionsrapport.