Parlamentsledamöterna trotsade regeringen genom att stödja uppmaningar om att inrätta ett gemensamt parlamentariskt utskott för att titta på förslagen.
Lord Lawson och Lord Forsyth var bland konservativa kamrater att göra uppror som regeringen förlorade med 320 röster till 139.
Ministrarna har varit tvungna att omarbeta planerna för att ge engelska parlamentsledamöter ett effektivt veto mot lagar som endast anses vara tillämpliga på England och för att fördröja en omröstning mitt i oppositionen.
De konservativa gjorde ett manifest för att ge engelska parlamentsledamöter ett avgörande inflytande över lagstiftning som uteslutande påverkar England men har stött på problem med detaljerna i planen och hur den kommer att införas.
Planen är att ett nytt Commons-stadium ska införas för lagar som passerar genom parlamentet med Englands parlamentsledamöter ombads att acceptera eller lägga in veto mot lagstiftning som endast påverkar England innan den övergår till en omröstning av alla brittiska parlamentsledamöter vid tredje behandlingen.
Ministrarna säger att detta kommer att ta upp den långvariga anomali genom vilken skotska parlamentsledamöter kan rösta om frågor som hälsa och utbildning som påverkar England, men engelska parlamentsledamöter har inget att säga till om i liknande frågor som rör Skottland, där sådan politik är decentraliserad.
En liknande process skulle användas, inklusive walesiska parlamentsledamöter, där ärendena endast omfattade England och Wales.
Men SNP har sagt att de kommer att utestängas från omröstningar i frågor som berör Skottland och skapa två klasser av parlamentsledamöter i undergruppen medan Labour har sagt att förslagen förhastats och behöver mer detaljerad granskning.
Peers har nu stött uppmaningar av Lord Butler, den tidigare kabinett sekreterare och crossbench kamrat, för en särskild kommitté av parlamentsledamöter och kamrater att undersöka förslagen i detalj.
Lord Butler sa att han stödde principen att kräva lagar som påverkar England för att ha samtycke av en majoritet av engelska parlamentsledamöter, men det fanns bättre sätt att närma sig vad som länge har varit känt som "West Lothian frågan"
"Säkert är det viktigare att få förslagen rätt än att rusa igenom dem", sade han.
Omröstningen är inte bindande för regeringen om inte underhuset också går med på en sådan åtgärd.
Ledaren för Lords, Lady Stowell, hävdade att kamrater skulle få en debatt om planerna i höst, men efter 30 år av att försöka hitta en lösning på problemet med engelska-bara lagar var det dags att vidta åtgärder.
"Det kommer en punkt där vi måste sluta prata och gå vidare med att vidta några åtgärder", sade hon.
Regeringen har besegrats i överhuset över planer för så kallade "engelska röster för engelska lagar".