Manuset har skrivits av Eric Roth - som vann en Oscar för Forrest Gump.
Leakey är tidigare chef för Kenya Wildlife Service och var nyckeln till att stoppa handeln med olagligt elfenben.
"Jag har känt en djup koppling till Afrika och dess kultur för en stor del av mitt liv", säger Jolie.
Leakeys extrema åtgärder för att ta itu med tjuvskyttar, däribland att skicka helikoptergevär till nationalparken, har hjälpt Kenyas elefant- och noshörningspopulationer att återhämta sig från katastrofens rand.
Han gjorde internationella rubriker 1989, då ett lager på 12 ton elfenben brändes i Nairobi National Park.
Jolie sa att Afrika handlar om "en man som dras in i den våldsamma konflikten med elefant tjuvskyttar, som dök upp med en djupare förståelse av människans fotavtryck och en djup känsla av ansvar för världen omkring honom".
Producent David Ellison - vars företag Skydance samproducerade filmer inklusive True Grit och Jack Reacher - kallade Leakey "inspirerande", tillägger, "Afrika är en historia som förtjänar att berättas".
Jolies nästa film, Obruten, med den brittiska skådespelaren Jack O'Connell ska till biograferna senare i år.
Hon regisserar och står mittemot sin man Brad Pitt i filmen By The Sea, baserad på sitt eget manus.
Angelina Jolie har skrivit på för att regissera Afrika, en film om den hyllade naturvårdaren Richard Leakeys strider med tjuvskyttar.