Jacob McIntyres kropp återfanns vid floden Ericht vid Cally Bridge, nära Blairgowrie, omkring klockan 12.35 på söndagen.
Han hade rapporterats saknad från en fastighet i det närbelägna Milton av Drimmie området vid 11:15.
En polisutredning av omständigheterna kring hans död fortsätter.
Polisen, brandmän, en vattenräddningsenhet och flygambulans var inblandade i sökandet.
Polisen Skottland sa att Jacobs familj var "förståeligt upprörd över deras tragiska förlust" och ville inte göra några ytterligare uttalanden vid denna tidpunkt.
Det Chf Insp Iain Wales sade: " Detta är en mycket tragisk händelse som ledde till att en ung pojke sorgligt nog förlorade livet.
"Händelserna kommer utan tvekan att ge chock och sorg till detta lilla samhälle och vidare bort.
"Vi vill tacka våra skotska brandkårskolleger för deras mod och hjälp under söndagens svåra förhållanden.
"Våra tankar och djupaste kondoleanser är med Jacobs familj i denna svåra tid."
En tvåårig pojke som hittades död i en flod efter att ha rapporterats saknad i Perthshire har namngetts av polisen.