En rad har brutit ut efter att Gill attackerat Neil Hamilton för att han erbjöd stöd på den avlösningsvägen på 1,1 miljarder pund.
Gill förnekar att det var gruppens åsikt, men Hamilton sade att hans kollega var sen till mötet där man kom överens.
Parlamentsledamöterna sade att han är fullt engagerad i alla sina arbeten.
Under tiden har UKIP delat ut speakspeaceroller till alla sina AMs - med undantag för Gill.
Hamilton blev ledare för UKIP-gruppen i maj trots att Gill var och fortfarande var partiledare i Wales.
"UKIP medlemmar förväntar sig att alla UKIP AMs att vara fullt engagerade i sin roll i Senedd och att vara lagspelare," sade Hamilton.
"Om Nathan inte kan acceptera detta bör han uppfylla sitt åtagande till UKIP NEC (nationell verkställande kommitté) och Nigel Farage i januari förra året att han inte skulle "dubbeljobba".
I AM for Mid and West Wales tillade man: "Nathan Gill är deltidsanställd på AM just nu eftersom han inte har avgått från sitt arbete som parlamentsledamot i Bryssel och Strasbourg.
"Han kom sent till vårt gruppmöte igår, när det nästan var över, så han missade vår diskussion om M4.
"Han har aldrig uttryckt några betänkligheter mot mig."
Hamilton berättade för plenarförsamlingen i onsdags att UKIP var berett att stödja första minister Carwyn Jones, en ny motorväg på 1,1 miljarder pund, känd som den svarta vägen.
Han sade: "Vi tror att den svarta vägen är bättre än ingen väg, och så om detta är nödvändigt för att bryta blocket logjam vi är beredda att spela vår roll i det."
Hamilton sade att hans anförande i plenarförsamlingen hade fått stöd av alla som var närvarande vid gruppmötet, där frågan "fullt diskuterades" och fick stöd av UKIP South Wales East AM David Rowlands, som kommer att tala för transportpartiet.
UKIP: s valmanifesto sade att det inte gick med på den svarta rutten planen "på grund av dess överdrivna £ 1 miljard plus kostnad" - backa istället "blå rutt" för att uppgradera Newport vägar.
På torsdag sa Gill till BBC Wales: "Att ge Carwyn falska förhoppningar om att han ska få igenom den svarta vägen är inte rätt sak att göra."
Han tillade: " Vi backar den blå vägen. Det är vårt manifest."
Gill frågade om Hamiltons kommentarer representerade en grupps ståndpunkt och sade: "Nej".
Han har tidigare sagt att han skulle ta avstånd från EU:s roll, men han kommer fortfarande att göra det, med förslag som han skulle vänta till efter EU-undersökningen den 23 juni.
Gill, som är den enda AM som är ledamot av Europaparlamentet, sade senare som svar till Hamilton: "Vilka bevis har han för att jag är AM på deltid?
"Jag är helt involverad i alla mina jobb och jag gör allt jag ska göra."
Han sade att de andra två AM på UKIP:s lista över europeiska val, som kunde ta jobbet efter att han avstod, nu är AM:s själva.
"Vi har alltid sagt hela tiden att vi inte skulle göra något förrän efter folkomröstningen", sade han.
En talesman för Gill sade: "Nathan har deltagit i varje större funktion som har pågått i församlingen sedan han valdes.
"Hans kommentarer om M4-rutten uppfyllde helt enkelt hans manifestlöfte och hans engagemang för A55 i norra Wales."
Mark Reckless, AM för South Wales East, sade att frågan hade diskuterats vid ett UKIP-gruppmöte.
"Vi fortsätter att stödja den blå rutten - vi föredrar det framför den svarta rutten", sade Reckless.
Men han tillade: "Som Neil sade i går, det är viktigt att vi får M4 relief vägen och vi skulle vara glada för förhandlingar med regeringen i fråga om den svarta vägen.
"Om de var villiga att avskaffa Severn Bridge-tullarna, känner jag att det är en affär som kan vara attraktiv."
Under tiden har UKIP meddelat följande:
Frågat varför Gill utelämnades från listan över talespersoner i UKIP-församlingen sade Hamilton: "När han slutligen har fattat sitt beslut om vilket arbete han föredrar, och om han förblir en AM, kommer jag gladeligen att titta på utnämningen av honom som talesman.
"Han är naturligtvis beredd att ta sitt kollektiva ansvar."
Ledaren för UKIP Welsh Assembly-gruppen säger att Nathan Gill inte bör "dubbelt arbete" som både parlamentsledamot och AM om han inte fullt ut kan engagera sig i Cardiff Bay.