Menzies sa att åtgärda "operativa frågor" på flygplatsen skulle kosta en extra Â£6m under andra halvåret 2015.
Den varnade hela året vinster kan vara 2m lägre än tidigare prognos.
Den rapporterade dock en stark vinsttillväxt vid sina amerikanska nav, medan dess distributionsarm "levererades före prognosen".
I en handelsuppdatering för 10 månader till 30 oktober sade Edinburgh-baserade Menzies: "Inom flygdivisionen har servicenivåerna i London Gatwick återställts.
"Men de åtgärder vi har infört för att mildra de operativa frågorna och leverera kundens operativa krav kommer att kosta 6 miljoner pund extra investeringar, främst i arbetskraft, under andra halvåret, och kommer att påverka årets resultat.
"Kontraktsförhandlingar med denna kund fortsätter, och vi arbetar mot en lösning före årets slut."
Menzies sade sin flygdivision fortsatte att prestera bra i alla regioner utanför Storbritannien.
Vändningarna i markhanteringen och lasten ökade med 9 % respektive 4 %, med intäkter under perioden upp till 6 % jämfört med förra året.
Verkställande direktör Jeremy Stafford sade: "Under en hektisk övergångsperiod fortsätter vi att gå vidare med gruppens strategiska mål.
"Vår distributionsverksamhet vinner snabbt dragkraft på den brittiska marknaden för e-logistik, samtidigt som vi fortsätter att leverera kostnads- och kontantförbättringar.
– Flygningen fortsätter att dra nytta av tillväxten i Amerika, samtidigt som vi fortsätter att arbeta genom brittiska operativa frågor.
"Jag är besviken över att kontraktsfrågor på London Gatwick har fått oss att se över våra luftfartsutsikter för i år, även om de till stor del uppvägs av starka framsteg i vår distributionsverksamhet.
"Gruppen är fortfarande väl lämpad att driva resultat."
Logistikgruppen John Menzies har utfärdat en vinstvarning efter problem med sitt marktjänstavtal på London Gatwick Airport.