Sir Bernard Hogan-Howe har bett Sir Richard Henriques att ge rekommendationer om huruvida det finns sätt att förbättra förfarandena.
Operation Midland-utredningen av en pedofilring från 1970- och 1980-talen är en av de undersökningar som kommer att undersökas.
Kraften har blivit beskjuten bland hävdar att den är överreagerad på anklagelser.
Tidigare chef för armén Lord Bramall, 92, som förra månaden fick reda på att han inte skulle ställas inför några ytterligare åtgärder i samband med Operation Midland, hade begärt en översyn.
Hans advokat Drew Pettifer sa att Lord Bramall välkomnade varje översyn som skulle göra "processen rättvisare och mindre smärtsam".
Paret förnekade starkt påståenden som gjorts av en man som gett namnet "Nick", och sade detektiver hade tagit 10 månader innan tala med vittnen som kastat tvivel på fallet.
Man har också undersökt Metpolisens hantering av en utredning av en våldtäktsanklagelse mot den framlidne lord Brittan, en före detta inrikesminister. Han dog i januari 2015 utan att få veta att fallet hade lagts ner.
Kritiker har frågat om sir Bernards kontrakt, i september i år, bör förnyas.
Inrikes frågor Välj utskottsordförande Keith Vaz har bett att han dyker upp inför parlamentsledamöter för att svara på frågor om Mets handläggning av ärendena.
Analys: Press vänder båda faten på Met Police
Sir Peter Fahy, en före detta chefskonstapel för större Manchesterpolisen, berättade för BBC Newsnight att han kände en del av kritiken Sir Bernard fick var orättvis och att han var en "märkvärdig polisledare".
Han sade emellertid att han i samma situation skulle be lord Brittens hustru om ursäkt för att han inte hade informerat honom om att hans fall hade lagts ned.
"Det finns uppenbarligen en viss fråga om en försening... det är ett tydligt misstag, ett misstag. Det är inte hur förfarandet ska fungera, sade han.
"Men jag tror verkligen att ingen polismästare skulle be om ursäkt för att ha undersökt någon."
Tidigare konservativ barnminister Tim Loughton sade att anklagelser behövde utredas snabbt och ett beslut fattas snabbt så att människor "inte kvar i det offentliga området hängde ut för att torka och inte ges naturlig rättvisa".
Domarens granskning kommer att innehålla konfidentiell och känslig information och kommer att vara en privat rapport för Sir Bernard, men dess viktigaste slutsatser och rekommendationer kommer att offentliggöras senare i år.
Den kommer att titta på polisförfarandet snarare än på bevis.
Sir Bernard sade: " Vi är inte rädda för att lära oss hur vi kan göra dessa saker bättre.
"Sir Richard ger ett oberoende juridiskt sinne för att ge oss råd om huruvida vi kan skapa en bättre balans mellan vår skyldighet att utreda och de misstänktas, klagandenas och offrens intressen."
Han sade att domare Lowell Goddard, som leder den omfattande oberoende utredningen om sexuella övergrepp mot barn, hade underrättats om översynen.
Tillkännagivandet av Henriques-granskningen är ett viktigt ögonblick.  Polisens polischef sir Bernard Hogan-Howe frågar domaren: "Fick vi det rätt eller missuppfattade vi det?" när man svarar på anklagelser om sexuella övergrepp mot barn.
Tanken är att denna granskning kommer att kunna besvara frågan fullständigt och rättvist eftersom den kommer att ha tillgång till konfidentiell information som inte är tillgänglig för Mets kritiker, särskilt dem i pressen.
Sir Richard Henriques har redan beslutat polisen utreda Lord Janner i Leicester gjorde inte tillräckligt - nu måste han besluta om Met gick för långt, särskilt dess mest känsliga utredning, Operation Midland.
Det faktum att Sir Bernard inte har väntat tills Operation Midland är komplett för att beställa denna översyn, kommer att ses som ett tecken på att det har misslyckats.  Han kommer att hoppas på ett mer positivt utslag.
Operation Midland, som grundades i november 2014, undersöker påståenden om att pojkar misshandlades av en grupp mäktiga män från politik, militär och brottsbekämpande myndigheter på platser i södra England och i London under 1970- och 1980-talen.
Man undersöker också påståenden om att tre pojkar mördades. Operation Midland har fokuserat på Dolphin Squares egendom i Pimlico, sydvästra London.
Sir Richard gjorde nyligen en granskning av anklagelserna om sexuella övergrepp mot den tidigare labouriske parlamentsledamoten Lord Janner, som drog slutsatsen att åklagarna hade gjort fel när de inte hade åtalat den avlidne för 25 år sedan.
Lord Janners familj har förnekat anklagelserna.
En talesman för barn välgörenhet NSPCC sade att det var avgörande översynen i Met polisen utredningar inte "oavsiktligt avskräcka" offer för övergrepp från att träda fram.
Gabrielle Shaw, från National Association for People Abused in Childhood (Napac), sade om polisen kunde lära sig av tidigare misstag och bli bättre på sitt jobb, som bara kunde gagna samhället.
En före detta domare i högsta domstolen är att granska Metropolitan Polices handläggning av mål som gäller anspråk på historiska övergrepp mot barn av offentliga personer.