Finansdepartementet har gått med på att göra pengarna tillgängliga under en femårsperiod för en föreslagen ny enhet för historiska utredningar och andra organ.
Men Stormontpolitikernas misslyckande med att nå en överenskommelse om hur man bäst ska hantera det förflutna innebär att dessa institutioner, och pengarna, nu står på spel.
Justitieminister David Ford berättade för Nordirlands församling i tisdags att fram till dess att överenskommelse har nåtts kommer polisen i Nordirland (PSNI) och polisombudsmannen att förbli ansvariga för tidigare utredningar.
De har dock inte fått någon ytterligare finansiering för uppgiften.
Ministern sade att han har blivit försäkrad om att regeringen har för avsikt att infria sitt ekonomiska löfte, men först när de nya organen har inrättats.
Ford sade att han har träffat utrikesministern Theresa Villiers och att regeringen har ett ansvar att hjälpa till att ta itu med det förflutna.
"Det måste finnas ett arrangemang för att tillhandahålla ytterligare pengar för institutioner som krävs för att hantera det förflutna", sade han.
Ministern sade också att misslyckandet med Stormonts senaste Fresh Start-avtal att bestämma hur man bäst ska hantera äldre frågor var "potentiellt kasta bort den bästa möjligheten för en generation att ta itu med vårt oroliga förflutna".
Han tillade att misslyckandet också hade gjort framsteg i fråga om arvsanspråk "mycket svårare".
Han avslöjade att han har bemyndigat Nordirlands domstolar och personaldomstoler att rekrytera "undersökt stöd" till rättsläkare för att ta itu med dessa utredningar, som inbegriper några av de mest kontroversiella morden på problemen.
Tillsättningarna av ytterligare personal förväntas ske till våren nästa år.
Regeringen har uppmanats att ställa en del av en särskild fond på 150 miljoner pund till PSNI:s och polisombudsmannens förfogande för att undersöka det förflutna.