Watkins har förbjudits i fyra år efter att han testat positivt för anabola steroider nandrolon och stimulerande metylhexaneamin.
Han går med i lagkamraten Shaun Cleary, som har varit förbjuden i två år som benzoylecgonin, en kokainmetabolit, hittades i hans system.
Båda spelarna testade positivt inför en vänlig mot Bridgend Ravens RFC.
Graham Arthur, chef för UKAD, sade: " Ryan Watkins intadde avsiktligt nandrolon och metylhexaneamin utan hänsyn till sitt ansvar som idrottsman.
"Genom att göra detta medvetna val till knark, Watkins har valt att lura sina lagkamrater, oppositionen och hans sport.
"Jag hoppas att detta fall kommer att agera lika starkt avskräckande för andra unga amatörspelare - riskerna för din spelkarriär, ditt rykte och viktigare för din hälsa, bara inte värt det."
På tal om Cleary sade Arthur: " Även om Mr Cleary använde kokain tre dagar innan han spelade, var kokain fortfarande i hans system när han spelade.
"Kokain är förbjudet från idrott och idrottare är helt ansvariga för vad som finns i deras system, oavsett om det finns en avsikt att fuska eller inte."
Welsh Rugby Unions verkställande direktör Martyn Phillips sade om Cleary: "Detta fall tjänar som en stark varning till alla i spelet att bristande efterlevnad av anti-dopning regler medför allvarliga konsekvenser.
"Oavsett om det är avsiktligt, eller oavsiktligt, har spelarna ett ansvar mot sig själva, mot varandra, mot sina klubbar och mot sporten att agera inom spelets regler och anda.
"Vi har ett nära samarbete med UK Anti-Doping och följer till fullo Världsanti-Doping Code. Det finns inget utrymme i koden för vårdslöshet eller att inte veta.
"Vi kommer att vara obevekliga i att arbeta med UKAD för att följa upp leder att ut spelare som knarkar i Wales rugby."
Maesteg Harlequins är mittbord i Welsh National League Division One West Central och Cleary har förbjudits fram till 10 oktober 2017. Watkins är förbjudet till och med den 11 september 2019.
Maesteg Harlequins lås Ryan Watkins har blivit den 12:e walesiske rugbyspelaren att suspenderas av UK Anti-Doping.