Moderbolaget Mondelez säger att man planerar att låta alla Cadbury-linjer omfattas av det befintliga egna systemet för rättvis handel, Cocoa Life.
Som ett resultat, säger det att det kommer att erbjuda fem gånger mer hållbar choklad i Storbritannien senast 2019.
Men kritiker varnar för att detta skulle kunna förvirra konsumenterna.
De fruktar också att gemensamma normer för etisk handel kommer att gå förlorade om fler företag släpper Fairtrade.
Vad var det då som fick Mondelez att ändra inställning, och lämnar det Fairtrade-märkets framtid i tvivelsmål?
Fairtrade fungerar i stora drag som ett frivilligt certifieringssystem som håller fast vid stränga normer, särskilt när det gäller att betala ett minimipris för råvaror som kakao, socker och kaffe.
Men Glenn Caton, norra Europas president på Mondelez, berättar för BBC att medan hans firma och Fairtrade har samma mål, "hållbarhet handlar om mycket mer för oss än pris".
– Nästa generation jordbrukare tar inte på sig kakaoodling som de brukade för att den är så olönsam, så vi måste se till att deras samhällen frodas och det innebär att investera mer i deras samhällen, säger han.
Mondelez vill därför leda sina egna hållbarhetsinsatser - investera mer i områden som försörjningskedjan, bonusar för jordbrukare, utbildning och förebyggande av klimatförändringar.
Fairtrade-stiftelsen har också välkomnat flytten, som enligt den kommer att lämna jordbrukare i utvecklingsländer som Ghana minst lika bra, om inte bättre.
– Förhållandet håller inte på att ta slut, det håller på att förändras, säger Barbara Crowther, policy- och PR-chef och påpekar att Fairtrade Foundation kommer att förbli partner till Cocoa Life - oberoende bedöma dess framsteg och rapportera sina resultat.
Den stora frågan nu är om andra företag också kommer att välja att överge Fairtrade-certifieringen och anta sina egna system för självreglering.
Kritiken mot Fairtrade-systemet ökar i kakaoindustrin, säger dr Steve Davies vid Institute of Economic Affairs.
Den stora frågan är att de flesta kakaoproducenter är småbrukare som inte kan uppnå stordriftsfördelar i större jordbruk, och det gör många sårbara för risker som torka och kämpar för att överleva.
"Fairtrade medför fördelar för vissa producenter, men det kommer inte att vara ett sätt att förändra världshandelssystemet som vissa människor verkar se det", säger han.
"Det enda sättet att förbättra villkoren för människor som arbetar längst ner i leveranskedjan - de som odlar råvaror som kakao - är genom att investera i leveranskedjan. Prisgolv kan hjälpa men kommer bara att gå så långt."
En annan fråga, säger Tobias Webb, som är konsult för leverantörskedjan Innovation Forum, är att företag kan hitta nätet av överlappande etiska handelscertifieringar där ute komplexa att hantera.
Dessa omfattar inte bara Fairtrades, utan även Rainforest Alliance - som är tillägnad bevarandet av tropiska skogar - och UTZ, världens mest utbredda märkning för hållbart jordbruk.
"Producerare kan sluta med att sätta fyra eller fem etiketter på sina produkter, och att uppnå var och en kräver en kostsam och tidskrävande granskning.
"Så många företag som Mondelez går nu mot interna system där de arbetar i partnerskap med de icke-statliga organisationerna som oberoende observatörer.
Men det är inte alla som vill se Fairtrade dra sig tillbaka från sin roll som en ledande förespråkare av etisk handel.
Anna Taylor, verkställande direktör för tankesmedjan Food Foundation, säger att Storbritannien har sett en "snabb ökning" av Fairtrade försäljningen under de senaste två decennierna som har varit till stor nytta för jordbrukare i utvecklingsländerna.
Fairtrade kakaoprodukter ökade volymmässigt med 6 % i Storbritannien 2015, och cirka 4 500 produkter i 74 länder har Fairtrade-märket över hela världen.
Hon tillägger att risken är att vi kan förlora en uppsättning allmänna standarder som konsumenterna "tror, ser och erkänner".
"Konsumenter mer än någonsin vill kunna lita på var deras mat kommer ifrån och oroar sig för "svarta lådor" försörjningskedjor."
Webb ser en annan potentiell risk i att stora företag drar sig undan från Fairtrade-systemet.
"Kommer icke-statliga organisationer fortfarande att kunna skaffa sig resurser för att spela den kritiska vännens roll? Det finns en risk där att det inte finns någon oberoende observatör - men företagen förstår att de behöver den trovärdigheten."
Evelyne Crowther säger att Fairtrade Foundation inte ser Mondelez agerande som ett hot mot sin framtid och välkomnar att företagen "äger" sina hållbarhetsutmaningar.
Hon tillägger att hennes organisation också utvecklas för att möta kakaoindustrins förändrade behov och gå bortom sitt historiska fokus på prisreglering.
"Om det finns en möjlighet att förnya sig på olika sätt så välkomnar vi det. Det är också värt att nämna att Mondelez kommer att fortsätta att köpa samma mängd Fairtrade-certifierat socker för sina produkter.
"Vi är fortfarande det mest igenkännliga etiska varumärket globalt och det kommer inte att förändras", tillägger hon.
Nyheter om att Storbritanniens mest kända chokladvarumärke, Cadbury, överger sin Fairtrade-certifiering har orsakat viss oro inom livsmedelsindustrin.