Järnvägar över hela Storbritannien övervakas för närvarande av British Transport Police.
Den skotska regeringen sade att det skulle vara effektivare att integrera dessa skyldigheter i Skottlands nationella poliskår.
Järnvägsfack har uttalat sig mot flytten, medan polischefer har varnat för att en sammanslagning skulle kunna vara "massivt komplicerad".
De högre polistjänstemännen berättade dock vid ett skotskt parlamentsutskottssammanträde i november att potentiella frågor var "inte oöverstigliga".
Att absorbera transportpolisen i Skottlands enda styrka har varit ett långsiktigt mål för justitieminister Michael Matheson.
BTP ville fortsätta att tillhandahålla tjänsten, men med tillsyn från Holyrood istället för Westminster efter delegering, och tre järnvägsfack kom ut mot planen.
Eftersom lagförslaget om järnvägspolitik (Skottland) lades fram i Holyrood insisterade Matheson på att det skulle "säkerställa att järnvägspolisen har en stark framtid".
Själva lagförslaget är bara det första steget i integrationsprocessen, som syftar till att ge den skotska polismyndigheten och den skotska polismyndigheten extra polisiära befogenheter.
Det kommer att behövas ytterligare lagstiftning både i Holyrood och Westminster för att överföra personal, fastigheter och gränsöverskridande polisfunktioner.
Matheson sade: "Vi har lyssnat noga på de frågor som järnvägsindustrin, polisväsendet och fackföreningarna har tagit upp, och vi har erbjudit en trefaldig garanti för att säkra arbetstillfällen, löner och pensionsvillkor genom integrationen.
– Polisen i Skottland har försäkrat oss om att specialistkunskaper, kompetens och erfarenhet hos BTP-tjänstemän och personal kommer att skyddas och upprätthållas inom Skottlands större poliskår. Som en del av Polis Skottland kommer järnvägspolisen att dra nytta av sitt lokala stöd, sina specialiserade resurser och sin sakkunskap.
"Den gränsöverskridande polisen kommer även i fortsättningen att vara sömlös i båda riktningarna. Polis Skottland har utmärkta förbindelser med sina motsvarigheter och vi arbetar med den brittiska regeringen för att se till att polisen har lämpliga befogenheter under hela den tid som gränsöverskridande resor pågår."
Biträdande chefskonstapel Bernard Higgins, av polisen Skottland, sade att styrkan var "engagerad att arbeta med" regeringen och andra organisationer för att se till att integrationen var "sömlös".
I november sade Higgins i utskottet för rättsliga frågor och medborgarrätt att flytten kunde vara "massivt komplicerad", men att styrkan skulle "respektera parlamentets beslut".
Han sade: " Det skulle vara komplicerat, men inte oöverstigligt. Det skulle finnas stora övergångsfrågor, men i praktiken skulle vi kunna övervaka järnvägsnätet i Skottland."
Men BTP vice polismästare Adrian Hanstock frågade kommittén: "Om den inte är bruten, vad försöker vi fixa?"
Han tillade: " Varför existerar BTP nu om det är så lätt att absorbera det i en geografisk kraft? Det finns en anledning till varför specialiseringen är så uppskattad av branschen och passagerare - det har inte bara dykt upp ur en brist från vissa entusiaster. Det finns ett verkligt behov av att övervaka järnvägen på ett annat sätt."
Vid mötet hördes att personalstyrkan inom järnvägspolisen skulle "brytas" efter en sammanslagning, och antalet tjänstemän skulle garanteras i alla utom "kristider".
Men Nigel Goodband från BTP Federation sade att han kunde "garantera" att expertisen hos BTP skulle "utspäddas", med vissa officerare som vill stanna kvar hos polisen någon annanstans snarare än flytta till polisen Skottland och andra väljer att gå i pension. "Ultimat du kommer att förlora expertis," sade han.
Kommitténs sammankallare Margaret Mitchell, en Tory MSP, sade att det var "klart att det inte finns något samförstånd om vad som är en mycket komplex fråga".
Hennes parti har ställt sig i opposition mot lagförslaget och sagt att Polis Skottland är "redan laddat med problem från topp till botten".
Justitie talesman Douglas Ross sade: " SNP: s planer för BTP har inte stöd av dem som är verksamma i kraft just nu och behöver omprövas.
"Dessa planer på att ändra BTP kommer att lämna människor som tror att SNP är fast besluten att klippa band med allt som händer med namnet Storbritannien."
Scottish Labour uttalade sig också emot lagförslaget och sade att regeringen borde "respektera den brittiska transportpolisens oberoende".
Domarens talesman Claire Baker sade: " Vi har redan ett transportpolissystem i Skottland som fungerar och tjänar oss väl. Men med detta lagförslag riskerar Skottland att förlora sin sakkunskap samtidigt som det urholkar transportpolisens gränsöverskridande karaktär.
"Vi bör inte utsätta transportpolisen och lokalpolisen för ytterligare risker genom fortsatt poliscentralisering."
Ett lagförslag har lagts fram i Holyrood för att låta polisen i Skottland ta över järnvägspolisens uppgifter norr om gränsen.