En 30ft (9m) förmultnad val spolades upp på stranden vid Felixstowe på söndagen och kroppen av en minke val sågs nära Orford på lördagen.
Forskare från Cetaceans Strandings Investigation Programme (CSIP) säger att det nu finns en tredje död val utanför kusten.
De tror inte att dödsfallen hänger ihop.
Den tredje val som flyter utanför Suffolkkusten tros vara en spermieval, sade Rob Deaville, från CSIP.
Mer om detta och andra nyheter från Suffolk
Han tror att valen på stranden vid Felixstowe är en fenval och en stor skada på dess kropp är resultatet av att den träffas av ett fartyg "för en tid sedan, kanske hundratals kilometer bort".
CSIP - som deltar i valar, tumlare och delfiner som blir strandsatta vid Storbritanniens kust - undersöker för närvarande Felixstowevalen.
Det är alltför nedbrutet för att genomföra ett fullständigt obduktionstest, men prover har tagits för att hjälpa till med analys av valpopulationen, sade Deaville.
Orford val strandade på lera lägenheter på tidvatten floden Ore kommer att vara "tricky att komma till", sade Mr Deaville.
Men han tror inte att dödsfallen på något sätt är relaterade.
"Tre mycket olika arter, och enligt min åsikt, de är inte kopplade," sade han.
"Det är en serie av tillfälligheter.
"Vi ser hundratals strandningar om året, det händer bara att dessa tre är i närheten."
En taleskvinna för Suffolk Coastal och Waveney Councils sade att entreprenörer förväntades ta bort valen från stranden på Felixstowe på onsdag.
Det är ännu inte känt när Orfordvalens kropp kommer att flyttas.
En tredje död val har hittats av experter som utreder två andras dödsfall längs Suffolkkusten.