Schmidt berättade för BBC att företaget gjorde vad som var "lagligt nödvändigt" för att betala rätt skattebelopp.
Google betalade 10 miljoner pund i brittiska bolagsskatter mellan 2006 och 2011.
Schmidt sade att det var upp till regeringen att ändra sitt skattesystem om den ville att företagen skulle betala mer skatt.
På BBC Radio 4's Start the Week sade han: "Det vi gör är lagligt. Jag är ganska förbryllad över denna debatt, som har pågått i Storbritannien under en tid, eftersom jag anser att skatter inte är frivilliga.
"Jag anser att du ska betala de skatter som krävs enligt lag. Det är ingen debatt. Du betalar skatten.
"Om det brittiska systemet ändrar skattelagstiftningen, då kommer vi att följa. Om skatterna stiger kommer vi att betala mer, om de sjunker, kommer vi att betala mindre. Det är ett politiskt beslut för den demokrati som är Förenade kungariket."
Samtidigt har chefen för den parlamentariska kommittén för offentliga räkenskaper, Margaret Hodge, föreslagit att en ny kommitté bör inrättas för att övervaka de stora företagens skattearrangemang.
Hon berättade för den oberoende tidningen att en sådan kommitté kunde höra bevis från företag i hemlighet, vilket innebär att företag inte skulle kunna dölja sina skatteärenden bakom sekretessregler.
Google, vars försäljning i Storbritannien går via Irland, är en av de multinationella företagen som är starkt kritiserade för att de organiserar sina skatteärenden på ett sätt som minimerar de belopp de betalar i Storbritannien.
Förra veckan enades EU:s ledare om att ta itu med skatteflykt genom ett "automatiskt informationsutbyte mellan skattemyndigheterna" för att övervaka situationen.
Googles ordförande har tidigare hävdat att bolagsskatt bör tas ut i det land där den bedriver ekonomisk verksamhet och tar risker, snarare än där produkter konsumeras.
Han har också efterlyst en debatt om internationella skattereformer.
"Politiker - inte företag - [bör] fastställa reglerna...När lagstiftarna gör lobbying och företagen formulerar lagen som den ser ut är det en förvirrande spektakel för alla", skrev han nyligen i Observer.
"Vårt hopp är att föra debatten framåt, med alla engagerade konstruktivt i att utveckla ett tydligare och enklare system - ett system där företag som följer lagen vet att de politiker som utformade reglerna är villiga att försvara och berömma dem."
Googles verkställande ordförande Eric Schmidt har sagt att han är "förvirrad" av den pågående debatten om företagets skatteinbetalningar i Storbritannien.