17-åringen la upp en bild av Thomas Mair på Facebook dagen då MP:n dog och berömde honom för hans handlingar.
Men han sa till domstolen tidigare: "Även om vi ser någon som en fiende, tycker jag inte att de ska mördas."
Pojken, som greps efter att ha lagt ut bilder på en hemmagjord bomb på nätet, förnekar förberedelsen av terroristhandlingar och räknar med att tillverka sprängämnen.
För live-uppdateringar och fler berättelser från hela Yorkshire
Cox mördades av Mair den 16 juni i Birstall i West Yorkshire, bara några dagar före EU:s folkomröstning där hon hade kämpat för att stanna kvar i EU.
Pojken från Bradford postade bilden med bildtexten "Thomas Mair är en HERO".
Han skrev också: "Vi behöver fler som han för att slakta rasförrädarna."
Men frågade av sin advokat Rupert Bowers QC om han stod vid sina kommentarer, sade han: "Nej."
Under korsförhör sade han: "När jag skrev detta höll jag förmodligen med Thomas Mair och uttryckte det på ett skarpt sätt."
Åklagare Barnaby Jameson frågade sedan varför han hade använt termen "race förrädare" i sin post om MP mord.
Han hänvisade till en artikel om Cox humanitära arbete och sade: "Hon var mer intresserad av att föra hit flyktingar och saker utomlands."
Leeds Crown Court har hört svaranden, som inte kan identifieras på grund av sin ålder, är medlem i den nynazistiska ungdomsgruppen National Action.
Han blev tillfrågad om ett annat inlägg i sociala medier från juni 2016 med tyska soldater som försvarade Normandies stränder med orden "låt oss minnas de TRUE hjältar som gav sina liv på D-dagen".
Svaranden svarade: "Jag antar att jag var irriterad."
Domaren, herr Justice Goss, frågade: "Är detta tänkt att förmedla er åsikt att tyskarna var de sanna hjältarna på D-dagen?"
"Nej", svarade han.
Juryn visades videoklipp av den tilltalade klädd i en tysk militäruniform som pratade med människor på nätet via det sociala nätverket Omegle.
Videon visar att andra användare reagerar negativt på svarandens outfit och kommentarer.
Han sa till rätten att han också bar en Donald Trump t-shirt för att förolämpa människor han träffade på nätet.
Han fortsatte med att säga att han inte trodde att Förintelsen hade hänt och att om en kvinna var gravid med ett handikappat barn "skulle det inte födas".
Jameson frågade om hans åsikt om funktionshindrade var "i överensstämmelse med nazisternas politik?".
"Jag antar det", sa pojken.
Rättegången fortsätter.
En terroristmisstänkt tonåring som stämplade Jo Cox mördare som en hjälte har sagt till en jury att han inte längre har den åsikten.