När Marion Janner talade med BBC Newsnight i sin första intervju i ämnet sa hon att det var anklagelser mot "ett lik".
I december 2015, strax före sin död, dömdes Lord Janner olämplig att ställas inför rätta på grund av demens.
Goddardutredningen ska hålla offentliga utfrågningar om anklagelserna.
Trettiotre klagande har fått central deltagarstatus i den oberoende undersökningen om sexuella övergrepp mot barn, vilket innebär att de har rätt att göra uttalanden, se dokument och söka tillstånd att ställa frågor när domare Goddard börjar höra Janners anklagelser i mars.
Brotten mot lord Janner påstås ha ägt rum i barnhem och hotell mellan 1955 och 1988.
Hans familj har alltid förnekat anklagelserna.
"Det är en skandal. Det är en ren skandal", berättade Marion Janner för Newsnight.
"Nu är pappa död, det finns ingen möjlighet att den andra sidan av historien blir hörd.
"Det är de som gör anklagelserna mot ett lik, vilket inte fungerar. Det kan inte vara rättvist.
"De andra 12 trådarna är alla institutioner - stora institutioner... Om de hade bestämt sig för att titta på individer kunde de ha valt någon som var levande och dömd - istället har de valt någon som är död och inte dömd."
Goddard-utredningen behandlar för närvarande 13 separata påståenden om tidigare sexuella övergrepp mot barn som inbegriper en påstådd institutionell mörkläggning, av vilken Janners del förväntades bli den första.
Andra områden som är under utredning är katolska och anglikanska kyrkor och övergrepp i barnhemmen i Nottinghamshire och Lambeth och en skola i Rochdale.
Den andre hade varit tjänstledig från överhuset sedan oktober 2014. Han dog i december 2015.
Advokater för de påstådda offren säger att deras klienter har väntat i åratal på rättvisa.
Marion Janner säger att familjen har bevis för att Lord Janner inte kan ha begått de brott han anklagas för, vilket kommer att uppstå i civilmål mot honom.
Hon säger att familjen är särskilt olycklig över att vittnen i Goddardutredningen inte kommer att korsförhöras.
"Pendeln har svängt så långt att människor som anklagar automatiskt tros över detta mest allvarliga brott... Vi befinner oss i den nuvarande situationen att människor kan göra några anklagelser och automatiskt tros... Det är bara knäppt."
Janner sade att hennes fars förhållande till en av de klagande var "inte konstigt för någon av pappas generation".
"Pappa var uppjagad av känslan av social rättvisa... Han var fast besluten att hjälpa folk vars liv var så mycket svårare.
"Och eftersom vi har en sådan kärleksfull familj, tror jag att pappa verkligen kände för människor som inte hade en familj alls, och var fast i ett barnhem."
I slutet av sitt liv säger fru Janner att hennes far var "helt omedveten" om anklagelserna mot honom "eftersom han inte hade den kognitiva förståelsen för att förstå vad som pågick".
"Vi hade en blackout i huset - lika mycket för mitt förstånd som hans."
Men han skulle ha blivit "helt förvirrad" av bilder på sig själv som dyker upp på TV, sade hon.
"Han hade absolut ingen aning - vilket var en av välsignelserna av hans demens."
Marion Janner pratade med BBC Newsnights Evan Davis - du kan titta på hela intervjun på iPlayer
Dottern till Labours framlidne parlamentsledamot och kamrat Lord Janner har kallat en kommande utredning av barnmisshandelsanklagelser mot honom "grotesk och Kafkaesk".