58-åringen flyttade från sin befattning som verkställande direktör till fotbollschef tidigare i år.
Spireites regissör Ashley Carson sa att rollen nu var "redundant".
Turner, som gick Chesterfield 2011, berättade klubbens hemsida: "Jag är mycket besviken över att lämna Chesterfield, men jag kan förstå situationen och jag lämnar på bra villkor."
Chesterfield chef för fotboll Chris Turner har lämnat den kämpande League One klubb.