Nyhetsbyrån AFP sa att 10 personer har drabbats av E. coli i Bordeaux.
Man tror att ett antal av dem hade ätit raket- och senapsgroddar, som tros ha odlats av frön som sålts av Thompson och Morgan.
Det Ipswich-baserade företaget sa till BBC att det inte hade några bevis på en länk. Food Standards Agency (FSA) sade att inga E. coli fall hade rapporterats i Storbritannien.
Men den har reviderat sin vägledning och råder människor att inte äta råa grodda frön, inklusive alfalfa, mungbönor (eller bönorprouts) och bockhornsklöver.
Byrån sa att de bara skulle ätas om de tillagades tills ångorna var varma hela tiden.
En talesman för Thompson och Morgan sade att företaget sålde "hundratusentals paket av dessa frön" i hela Frankrike, Storbritannien och andra delar av Europa varje år.
"Vi är mycket övertygade om att problemet inte är med våra frön. Människor kan fortfarande odla dessa frön och använda dessa frön med absolut förtroende, sade hon.
"För att ett så litet antal människor ska ha påverkats, tyder det på att problemet kanske är i det lokala området, hur fröna har hanterats eller hur de har odlats, snarare än själva fröna."
Företaget samarbetade fullt ut med utredningar, tillade hon.
Paul Hansord, företagets verkställande direktör, sade: "Vi ser till att allt vi gör är till en hög standard."
Han sa att företaget köpte sina frön i bulk från leverantörer runt om i världen. De drabbade fröna kan ha kommit från Italien.
Thompson och Morgan sa också att de inte tog upp några frön, istället sålde de paket via postorder till trädgårdsmästare.
Sju av dem som drabbades av utbrottet av E. coli, som åt groddarna på en country mässa i Begres nära Bordeaux, behövde sjukhusvård.
Nära kontakt
FSA säger att det ber företaget om mer information om fröna.
Det finns inget som tyder på en koppling till det tyska utbrottet av E. coli, som kom från böngroddar som odlats på en ekologisk gård, men två personer sägs vara smittade med en liknande stam.
Frederic Lefebvre, Frankrikes utrikesminister för konsumentfrågor, citerades av AFP och rekommenderade att "konsumenter som köpt samma produkter inte använder dem".
Lefebvre tillade: "Anknytningen mellan symptomen och ätandet av groddarna hittills har inte slutgiltigt fastställts."
Försäljningen av de tre frösorterna - senap, raket och bockhornsklöver - har stoppats i Frankrike.
Thompson och Morgan har lämnat prover av dessa frön till utredare i Storbritannien.
En talesman för FSA sade till BBC: "Vi har varit i kontakt med de franska myndigheterna om detta utbrott och är medvetna om att ett brittiskt företag har namngetts i samband med det.
– Inga fall av matförgiftning har rapporterats i Storbritannien i samband med utbrottet i Frankrike, men vi har nära kontakt med Health Protection Agency.
"Vi har bett om ytterligare information från de franska myndigheterna om den tre namngivna typen av utsäde för att hjälpa oss att genomföra undersökningar i Storbritannien."
Tjänstemän undersöker en möjlig koppling mellan frön som säljs av ett brittiskt företag och ett utbrott av E. coli i Frankrike.