SFA:s verksamhetschef har gjort en översyn sedan han tog över från Mark Wotte.
I de sju skolor som ingår i Skottland får 374 barn upp till 10 timmar i veckan specialundervisning som en del av sina dagliga studier.
"Det har investerats mycket tid i detta projekt av många människor och vi tittar på hur vi fortsätter att förbättra programmet när vi reser genom åren," McClair berättade BBC Skottland.
Projektet är nu inne på sitt fjärde år, med årets intag av elever det sista av det ursprungliga programmet.
McClair kommer under de kommande månaderna att besluta om det kommer att fortsätta i sitt nuvarande format när en analys av hur det fungerar har slutförts.
Alternativen skulle kunna vara att certifiera programmet för att ge elever en högre examen för att avlägga kursen eller att fokusera på en mindre grupp barn på ett enda bostadsområde snarare än de sju skolor som var inblandade just nu.
Det nuvarande systemet kommer åtminstone att fortsätta tills årets S1-elever har avslutat det fjärde året.
Att mäta dess framgång hittills är svårt, med de äldsta deltagarna fortfarande bara i S4, men McClair anser att det finns några bra indikatorer.
"Jag tror att du kan uppmuntras av antalet unga människor som har varit i performance skolor som har varit i de yngre representativa grupper under de senaste tre och ett-bitars åren och bevisen tyder på att kommer att fortsätta", tillade han.
"Sommartid tror jag att det blir ett halvt anständigt mått på antalet unga pojkar som erbjuds möjligheten att gå in i heltid fotboll, även om jag tror att det förändras lite i den meningen att det är 16 eller 17 att vissa klubbar tittar på att ta dem i heltid.
"Idéen är jättebra. Många klubbar i England har tagit sig an det - att få in barn under dagen, vilket ger dem fler möjligheter att träna de discipliner som är involverade i fotboll.
"Det finns allt som tyder på att de förbättras snabbare än tidigare under ett hybridprogram där all coachning ägde rum på kvällen eller på helgerna."
Det andra viktiga måttet på framgång är den akademiska prestationen.
Examensresultaten kommer inte att vara tillgängliga från SFA-projektet förrän i sommar, men Graeme High School i Falkirk drev ett pilotprojekt - varav Craig Sibbald och Celtic Youngster Paul McMullan är utexaminerade - som möjliggör en viss analys.
"Förra året hade vi en grupp på 14 eller 15 och den stora majoriteten var mycket framgångsrika, duktiga elever, en med fem Högren, två med fyra Högren, tre med tre Högren och en svit av andra akademiska prestationer," rektor Lesley Carroll berättade BBC Skottland.
"De flesta av dem har gått vidare till professionella klubbar men de har fått en reservposition. De har varit några av våra högpresterande akademiska elever också eftersom de inte bara måste vara elitidrottare fotbollare, de måste ha vad SFA skulle kalla ett tillväxttänkande.
"De är inte rädda för mål, hårt arbete, engagemang, drift och självförtroende."
Carroll anser att det finns ett argument för att programmet hjälper eleverna att uppnå bättre resultat i sina andra ämnen, även om hon inte medger att "riktig kriminalteknisk forskning har gjorts i det".
Men det kommer att vara nivån på fotbollsutvecklingen som avgör exakt hur McClair och SFA går till väga när det gäller deras framtida prestationsstrategi.
Brian McClair säger att han är "mycket uppmuntrad" av det arbete som görs i Scottish Football Associations performance skolor som han överväger en framtida strategi för spelet.