Cook gjorde en unbeaten halv-talet mot turisterna för Sydafrika A i en uppvärmning match innan serien.
Den 33-årige är son till före detta Proteas Test Batsman Jimmy Cook.
England har redan vunnit fyra-match serien och leda den 2-0 efter att ha slagit Sydafrika med sju wickets i Johannesburg på lördag.
"Stephen har varit i utmärkt form den här säsongen och ger oss ett annat alternativ i toppen av ordningen," sade chefsväljare Linda Zondi.
Han ser ut att ersätta den out-of-form Stiaan van Zyl, som har gjort bara 69 körningar i fem innings på toppen av ordern.
Cook har gjort mål två århundraden och 76 i sina senaste tre matcher för Highveld Lions.
Dale Steyn behåller sin plats i en 17-mans trupp för matchen, men tros kämpa med axelskadan som har hållit honom borta från de senaste två testerna.
Quinton de Kock är också inställd på att återvända som Wicketkeeper. Han uteslöts från det tredje testet efter att ha skadat knät medan han gick sina hundar, men hans ersättare Dane Vilas har inte inkluderats denna gång.
Sydafrika trupp: AB de Villiers (c), Kyle Abbott, Hashim Amla, Temba Bavuma, Stephen Cook, Quinton de Kock (wkt), JP Duminy, Faf du Plessis, Dean Elgar, Morne Morkel, Chris Morris, Dane Piedt, Kagiso Rabada, Rilee Rossouw, Dale Steyn, Stiaan van Zyl, Hardus Viljoen.
Okapad öppnare Stephen Cook har lagts till i Sydafrika truppen för den slutliga Test mot England, som börjar i Pretoria på fredag.