Bohn, rangordnad nummer 71, hade bröstsmärtor efter den andra omgången och krävde en läkare.
"Han fördes med ambulans till Palm Beach Gardens Medical Center, där tester avslöjade en mild hjärtattack," en PGA Tour uttalande sade.
"Jason vilar bekvämt och på gott humör", tillade hans agent.
"Han är planerad att ha fler tester i helgen," Justin Richmond sade.
"Vi vet att han uppskattar oron från så många människor i PGA Tour familjen som har kontaktat."
PGA Tour uttalandet tillade Bohn fru var på "hemma i Atlanta men hans svärföräldrar gick med honom på sjukhuset, liksom medspelare George McNeill, som sade Bohn var på gott humör".
Bohn kortade 72 i den andra omgången, vilket skulle ha sett honom göra snittet på PGA National.
Lördagens tredje runda fortsatte utan Bohn, och slutade med Spaniens Sergio Garcia och Australien Adam Scott dela en befallande fyra-shot ledning över USA: s Blayne Barber.
Nordirlands Rory McIlroy missade snittet för ett andra år.
Amerikanska tvåfaldiga PGA Tour vinnare Jason Bohn har drabbats av en hjärtattack vid 42 års ålder under Honda Classic i Florida.