Planerna för utvecklingen av egendomen Hatchfield Farm i Newmarket, Suffolk, hade godkänts av Forest Heath District Council.
Men förra året vägrade kommunalminister Sajiv Javid att acceptera beslutet.
Planeringsdomaren Justice Gilbart slog fast att Javids beslut var ödesdigert inkonsekvent och "tydligen bristfälligt".
Fallet måste nu omprövas.
Justitieminister Gilbart, som satt i London, upphävde vägran och sade: "Statssekreteraren har utfört ett fullständigt och oförklarligt volte-ansikte i sin bedömning av motorvägarnas konsekvenser av två förslag till utveckling på samma plats i Newmarket och har också misslyckats med att tillämpa sin egen nationella planeringspolitiska ram."
Domaren sade: "Det finns på något sätt ett krav på mer mark för bostäder och annan ekonomisk utveckling i Forest Heath District."
Edward Stanley, den 19:e Earlen av Derby, förde den rättsliga utmaningen med Moulton Parish Council och Rural Parishes Alliance.
Domaren sade att de lokala församlingsråden under en tid hade hävdat att tillväxten i området inte borde spridas mellan de lokala församlingarna utan koncentreras till Newmarket.
Newmarket Horsemen's Group och några andra var oroade över att utvecklingen i staden "kan ha en negativ inverkan på hästkapplöpningsindustrin som är baserad där" och leda till ökad trafik.
En talesman för lord Derby sade: " Utrikesministern har nu en andra chans att avgöra ansökan. Han bör ta full hänsyn till de betydande fördelar som planeringsansökan kommer att medföra för Newmarket när han fattar ett beslut."
Department for Communities and Local Government sa: "Vi har fått denna dom och kommer nu att överväga vårt svar."
Lord Derby har vunnit en viktig etapp i sin kamp för att bygga 400 hem på sin mark.