Summan uppgår till mer än 1,2 miljarder pund som avsatts i tidigare års avsättningar.
Moderbolaget National Australian Bank (NAB) sade mellan £ 350m och £ 500m mer skulle avsättas i år, men tillade att den slutliga kostnaden förblev osäker.
Flytten tillkännagavs i sitt tredje kvartal resultat på måndag.
Fram till slutet av mars hade NAB avsatt 806 miljoner pund för att kompensera kunderna för felaktig försäljning av betalningsskyddsförsäkring (PPI). Totalt 325 miljoner pund har redan betalats ut.
NAB:s kumulativa avsättningar avseende räntesäkringsprodukter uppgick till 431 miljoner pund, varav ungefär hälften har betalats ut.
Årets extra finansiering kommer att komma från en fond på 1,7 miljarder pund som de brittiska tillsynsmyndigheterna kräver av banken för att göra tillgänglig efter att Clydesdale har flugit.
NAB är i färd med att bryta och flytta Glasgow-baserade Clydesdale, vilket inkluderar Yorkshire Bank.
Den har för avsikt att slutföra uppbrottet i slutet av detta år.
I ett uttalande, NAB sade "väsentliga framsteg" hade gjorts på uppdelning och börsförsäljning. Den kommer att ge mer detaljerade resultat under hela året i slutet av oktober.
Den australiska bankgruppen har arbetat hårt för att lasta av Clydesdale, som samlade en stor portfölj av dåliga fastighetslån.
Den har också stått inför höga kostnader för gottgörelse när det gäller betalningsskyddsförsäkring och komplexa system för företagskunder för att skydda sig mot ränteförändringar.
Clydesdale Bank ska avsätta så mycket som 500 miljoner pund i extra finansiering i år för att kompensera kunderna för felaktig försäljning av finansiella produkter.