Förra månaden bad styrelsen för torping om ursäkt för sin hantering av tvisten med torpare.
Man bad också sammankallaren Colin Kennedy att avgå.
Men Kennedy berättade för BBC Scotland Sunday Politics Scotland att han stannade på posten.
Tvisten gäller allmän betesdrift, bland annat vid Mangersta och Upper Coll på Lewis.
Kennedy sade: " Jag har inte för avsikt att avgå.
"Som det ser ut nu, tror jag att kommissionen har agerat helt inom lagens ramar hela tiden och tills vi har juridisk rådgivning om motsatsen, kommer jag att behålla min ståndpunkt."
Förra veckan sade förste minister Nicola Sturgeon att skotska regeringsministrar hade befogenhet att ingripa i den oroliga kommissionens angelägenheter.
Hon sade att ministrarna normalt inte skulle engagera sig i kommissionens interna verksamhet.
Under premiärministerns frågor i Holyrood på torsdag sade hon dock att lagstiftningen gav dem befogenhet att ingripa vid behov.
Sammankallaren av Skottlands Crofting Commission har upprepat att han inte kommer att avgå mitt i en hetsig allmän dispyt om vanligt bete - om han inte tvingas av den skotska regeringen.