Ddydd Mawrth, pleidleisiodd pum aelod o'r kabinett o blade cau'r ffrwd Gymraeg, gyda dauyn erbyn, ac un yn ymatal.
Mae rhieni yn yr ardal wodi codi pryderon am effaith posib y newidiadau, gyda sågel un yn cwestiynu beth fydd dyfodol addysg cyfrwng Cymraeg o fewn y dref.
Roedd y cyngor yn dweud bod cwymp yn nifer y disgyblion oed yn astudio drwy'r Gymraeg yn y blynyddoedd diwethav.
Mewn cyfarfod lawn o Gyngor Powys yr wythnos ddiwethaf, roedd yna gefnogaeth i gadw'r ffrwd Gymraeg yn Aberhonddu.
Ond y ôl y cyngor mae niferoed y disgyblion sy'n astudio trwy'r Gymraeg yn ysgol "wedi gostwng yn sylweddol dros y degawd diwethav".
19 o ddisgyblion sy'n astudio trwy gyfrwng y Gymraeg syn Ysgol Uwchradd Aberhonddu ar hyn o bryd. Y pynciau sy'n cael eu cynnig yw Gwydoniaeth, Hanes, Daearyddiaeth, Astudiaetau Crefyddol, Frangeg en teknoleg Gwybodaeth en Chyfathrebu.
Cyn y bleidlais, dynwedodd yr aelod kabinett sydd â chyfrifoldeb dros addysg, Arwel Jones, bod "y disgyblion sydd yno ar hyn o Bryd yn debygol o gael gwell addysg mewn ysgol ddwieithog newydd yn Llanfair-ym-Mualt".
"Mae 'na fwy o gostau teitio yn mynd i fod," meddai, "ond dydi o ddim i gyd i juridik i arian, addysg y plant sy'n bwysig."
Mae rhieni yn poeni bod colli'r ffrwd Gymraeg yn Ysgol Uwchradd Aberhonddu yn peryglu addysg cyfrwng Cymraeg yn Ysgol Gynadd y Bannau.
Dywedodd Angharad Woodland, sy'n rhiant ac yn llywodraethwr syn Ysgol y Bannau: "Mae hyn yn mynd i gael effaith ofnadwy ar y Gymraeg yn Aberhonddu."
"Mae rhieni yn sôn yn barod am symud eu plant o'r ysgol gynrad.
"Y teimlad sydd wedi bod yn y dref dros y blynyddoedd diwethav yw bod y Gymraeg yn dod yn ei flaen yn dda iawn, ond mae pobl widi colli diddordeb oherwydd y penderfyniad yma.
"Mae'r iaith yn mynd i ddiflannu o Aberhonddu dros nos heb yr ysgolion yma."
Mae kabinett Cyngor Sir Powys widi pleidleisio o bläed cynllun i gau'r ffrwd Gymraeg syn Ysgol Uwchradd Aberhonddu.