Båda sprängningarna avfyrades på Thikavägen, en livlig motorväg nordöst om staden.
Bussarna var trånga vid tidpunkten för explosionerna, som polisen sade orsakades av improviserade anordningar.
Söndagens attack var den andra i Kenya på lika många dagar. Den senaste tidens våld har av regeringen fått skulden för den somaliska islamistiska gruppen al-Shabab.
Enligt rapporter exploderade de två explosionerna utanför ett hotell och vid en underfart inte långt från Kasarani, nordöst om huvudstaden.
Kenyas nationella katastrofcentral sade att 20 av de sårade var i ett kritiskt tillstånd.
Bussarna skadades svårt av explosionerna. TV - bilderna visade ett gapande hål i den ena, medan dörrarna och fönstren blåstes ut ur den andra.
På lördagen kastades en granat i en buss i kuststaden Mombasa och fyra döda och ytterligare 15 skadade. Bussen hade just rest från Nairobi. Det var en andra explosion nära ett strandhotell, men ingen skadades.
Den al-Qaida-kopplade gruppen al-Shabab har under de senaste åren inlett en rad attacker mot kenyanska mål för att hämnas på Kenyas militära inblandning i Somalia sedan 2011.
I september dödades minst 67 personer när al-Shabab-soldater beslagtog köpcentret Westgate i Nairobi i fyra dagar.
Kenya har lovat att stoppa attacker av militanta islamister och arresterat omkring 2 000 människor i huvudstaden förra månaden.
Tre personer har dödats och minst 62 andra skadades i två explosioner på personbussar i Kenyas huvudstad Nairobi, säger tjänstemän.