Forskare hoppas få veta hur mycket den vägde, hur den rörde sig och vad den använde sina ikoniska ryggplåtar till.
Ett brittiskt team har skannat var och en av sina 360 ben till en dator och har digitalt rekonstruerat dinosaurien.
Exemplet, kallat "Sophie", har förvärvats av Natural History Museum i London.
Även om Stegosauruser är en av de mest kända dinosaurierna, är de bland dem som forskare vet minst om. Det finns bara sex partiella skelett av varelsen, som levde omkring 150 miljoner år sedan.
Den kunde växa till samma storlek som en minibuss och de gigantiska plattor som sprang längs ryggen var dess mest utmärkande drag.
Förvånansvärt nog var det för 100 år sedan som dinosauriens skelett bedömdes korrekt och beskrevs vetenskapligt. Nu, med hjälp av medicinsk bildteknik och 3D-modellering, hoppas forskare på Naturhistoriska museet att lära sig mycket mer om denna ikoniska varelse.
Professor Paul Barrett, som leder forskningen, sade att de var särskilt intresserade av att ta reda på vad stegosauruser använde sina tallrikar till.
"Vi vill ta reda på om de användes för försvar eller om de användes som en radiator för att hjälpa djuret plocka upp eller förlora värme", berättade han BBC News.
Sophie är 80% komplett och tros vara det mest kompletta exemplaret i världen. Dr Charlotte Brassey, som arbetar med Prof Barrett, hjälpte till att skanna i sina 360 ben och digitalt återskapa det på sin dator som en detaljerad 3D-modell.
"Jag rekonstruerade skelettet för att se hur det kan ha sett ut och sedan började rekonstruera musklerna och hur de kopplade till skelettet. Från det kan vi börja säga hur effektiva dess muskler var och så småningom i framtiden skulle vi vilja rekonstruera hur det rörde sig," berättade hon BBC News.
Bland de mysterier som forskarna skulle vilja lösa är hur arten kunde gå med så små framben och så stora bakben.
Följ Pallab på Twitter
Forskare har påbörjat den mest detaljerade analys som någonsin gjorts på ett Stegosaurus skelett.