På lördagen meddelade British Medical Association (BMA) att det skulle fråga medlemmarna i England om de ville vidta åtgärder.
Tvisten gäller ett nytt avtal som ska införas i augusti 2016.
Kritiker säger att det kan innebära 15% lönesänkningar med "normala timmar" omklassas som att vara från 07:00 till 22:00, måndag till lördag.
Det innebär att extra betalningar för osociabelt arbete endast kommer att ges utanför dessa tider, snarare än de nuvarande arrangemangen från kl. 07.00 till 19.00, måndag till fredag.
Nyheten om hälsovårdssekreterarens ingripande kom den dag då några tusen unga läkare protesterade i centrala London.
Dagens utveckling stoppade inte några tusen unga läkare, några på sjukhus, som samlades för att protestera vid Westminster.
De sjöng "BMA, BMA" med den nya ordföranden för föreningens juniordoktorskommitté Dr Johann Malawana beskriver samlingen som förmodligen aldrig tidigare skådad.
Senare marscherade de med sina plakat uppför Whitehall och blockerade under en tid trottoaren och vägen utanför Hälsodepartementet.
Det råder ingen tvekan om att känslorna är höga över regeringens planerade reformer av yngre läkares kontrakt. Mycket vilar nu på det planerade mötet mellan hälsominister Jeremy Hunt och dr Malawana.
Regeringen har beskrivit de nuvarande kontrakten som "föråldrade" och "orättvisa", och påpekat att de infördes på 1990-talet.
Ministrarna utarbetade planer på att ändra avtalet 2012 men samtalen bröts ned förra året.
Regeringen har antytt att den kommer att införa det nya kontraktet nästa år i England, vilket föranleder BMA att fråga sina 53.000 yngre läkare om industriella åtgärder.
Men Hunt har nu erbjudit BMA-läkarnas ledare möjligheten att träffas denna vecka för att se om de kan hitta en lösning på tvisten - BMA har gått med på att närvara.
Skottland och Wales har sagt att de inte vill införa förändringarna, medan Nordirland ännu inte har fattat något beslut.
Danny Mortimer, chef för NHS Arbetsgivare, som förhandlar kontrakt på uppdrag av regeringen, sade att han hoppades att mötet skulle föra de två sidorna närmare varandra.
"Vår favoritposition har alltid varit att förhandla med BMA."
Johann Malawana, BMA:s yngre doktorskommittéordförande, sade att hans organisation "har varit tydlig med vad den behöver höra från regeringen och NHS Arbetsgivare för att föra oss tillbaka till förhandlingsbordet".
"Vi kommer att fortsätta med våra åtgärder om inte regeringen själv kan ge oss de absoluta garantier vi söker för de läkare vi företräder."
Hälsominister Jeremy Hunt har erbjudit sig att träffa yngre läkares ledare efter beslutet att rösta ut läkare om industriella åtgärder över ett nytt kontrakt.