Överstelöjtnant Benedict Tomkins, 49 år, från försvaret, utrustning och stöd, baserad vid Abbey Wood, nära Bristol, står inför rätta i USA.
Han påstås attackera kvinnan på hennes hotellrum där han gick under falska förevändningar efter en drink mottagning.
Kvinnan sa till domstolen att Mr Tomkins var "mycket aggressiv" och "tog kontroll".
Rättegången hörs på den gemensamma basen Andrews i Maryland. Det är den första krigsrätt som kommer att hållas i USA och Storbritannien för att låta fler vittnen vittna.
Domstolen hörde att Tomkins sade att han hade haft sexuell aktivitet med kvinnan, som "inte var rosenblad eller Amors pilar, det var ganska djuriskt".
Händelsen påstås ha inträffat efter en middag och en drinkmottagning på Sheraton Hotel i Kampala den 7 januari 2015.
I slutet av kvällen sa den unga kvinnan att hon var "mycket berusad" när Tomkins gick till sitt hotellrum.
"Det fanns inget prat, ingen romantisk ledning upp till något som jag minns. Han fick mycket mer aggressiv och använde en viss nivå av kraft för att ta saker och ting vidare, sade hon.
"Rummet snurrade, det var ett mycket kort minne."
De utbytte senare meddelanden och han tackade henne för en "underbar kväll" som hon samtyckte till. Hon sa till utredarna att hon var rädd för att rapportera händelsen ifall det skulle skada hennes karriär.
Fallet förväntas återupptas i Bulford i Wiltshire på måndag.
En gift brittisk officer förnekar att han våldtagit en ung kvinnlig kollega vid ett FN - evenemang i Uganda, en krigsrättsdomstol har hört.