Brahamdagh Bugti berättade BBC Urdu hans parti kunde släppa samtal för självständighet om "The Baloch folket samtycker".
Mr Bugti, som bor i Schweiz, anklagas för att leda en väpnad kamp.
Balochistan har sett en långvarig konflikt mellan säkerhetsstyrkor och separatister som vill ha en större andel av provinsens naturresurser.
Brahamdagh Bugti, 34, betraktas som en av de mest hårda linjen av Baloch separatistiska ledare och har hittills varit motståndare till något närmande med den pakistanska staten som han har lovat att "strida till döden".
Hans kommentarer betraktas som en olivkvist till militären och kan signalera den första uppmjukningen av attityderna inom separatiströrelsen.
När han talade med BBC från sin bas i Genève sade Bugti att den pakistanska militären redan hade lidit ett moraliskt nederlag.
"Vad har den kumulativa effekten av de senaste 10 eller 15 årens våld, mord, påtvingade försvinnanden, godtyckliga arresteringar och liksäckar varit? Har Baloch folket ändrat sig eller har detta stärkt deras beslutsamhet?"
Han gjorde sina kommentarer i en exklusiv intervju med BBC Urdu tjänsten på nionde årsdagen av dödsfallet av hans farfar Akbar Bugti, en före detta guvernör och senare separatist ledare som dödades i en pakistansk militär operation 2006.
Dödandet utlöste den senaste vågen av upproret i Baloch som har krävt tusentals liv sedan dess.
Frågade om han kunde släppa kraven på en separat Balochistan, som ett villkor för att fredsförhandlingar ska inledas, sade Bugti: "Om våra vänner, allierade, kamrater och Baloch-folket vill ha detta, då kommer vi naturligtvis att vara beredda att tala med Pakistan."
Han förnekade någon kontakt med Pakistans inrikesminister Chaudry Nisar Ali Khan som för närvarande är i London där andra Baloch ledare är baserade.
"Om han vill träffa oss är vi beredda att möta honom. Det skulle vara dumt av vem som helst att vägra en politisk dialog om den erbjuds i rätt anda."
Bugti sade att tidigare försök till dialog inte hade varit allvarliga och tillade: "Om striderna fortsätter kommer det att vara omöjligt att hålla fredsförhandlingar och det är därför vi kräver ett slut på den militära operationen och tillbakadragandet av väpnade styrkor från provinsen.
"Bara om dessa krav uppfylls kan villkoren vara mogna för fredssamtal."
Bugti sade att det var upp till militären att göra eftergifter.
"Vi är den förföljda minoriteten i denna konflikt. Det är upp till dem att tala om för oss vad de är beredda att ge och vad deras dagordning är. Om samtalen inleds kommer vi bara att ta till dem det som är godtagbart för majoriteten i våra led.
"Armén måste sluta tro att den kan lösa alla problem med våld. Vi har inte en stor armé att bekämpa dem, men ingenting kommer att uppnås genom denna typ av blodsutgjutelse."
Pakistan skyller Indien på en kampanj för sabotage och avbrott i Balochistan och har anklagat landet för att driva upproret i provinsen.
Mr Bugti sa att militären gjorde sådana anklagelser för att dölja sina egna misslyckanden.
"Om Indien vill hjälpa oss varför ska vi vägra? Alla har rätt att be om hjälp i självförsvar. Vi kan också be om hjälp från USA och Förenta nationerna. Indien är inte ansvarigt för den militära operationen i Balochistan."
En ledande Baloch separatist har sagt att han är redo att överväga dialog med Pakistan, så länge armén avslutar militära operationer i provinsen.