En bomb gömd inuti en motorcykel exploderade framför kontoren för en Muselman lärda kommitté i Arsal, den officiella National News Agency sade.
Sunni-prästerna tros ha försökt förhandla om frigivningen av libanesiska säkerhetspersonal som innehas av jihadistiska militanter baserade i Syrien.
Arsal var platsen för våldsamma strider mellan de två sidorna förra året.
Sunnistaden, som rymmer många syriska flyktingar, är inbäddad mellan Syriens regeringsägda territorium och främst shia libanesiska områden som sympatiserar med det.
NNA rapporterade att chefen för Qalamoun Clerics Association, Sheikh Othman Mansour, var bland de människor som dödades vid torsdagens explosion i Arsal.
Agenturen sa att bomben placerades på en motorcykel som sprängdes utanför föreningens kontor.
Men en säkerhetskälla berättade för AFP: s nyhetsbyrå att bombaren hade gått in på kontoret under ett möte med prästerskapet och detonerat ett sprängband.
"Explosionen definitivt riktade detta möte... där vanligtvis inte mindre än 15 personer är samlade", Arsal bosatt Abu Ibrahim berättade AFP.
Forskarna var involverade i att försöka förhandla om frisläppandet av mer än två dussin medlemmar av de libanesiska säkerhetsstyrkorna som greps av al-Qaidas affiliate i Syrien, al-Nusra Front och Islamiska statens militanter under en stor attack mot Arsal i augusti 2014.
De jihadistiska grupperna har krävt att de libanesiska myndigheterna friger islamistiska fångar i utbyte och har dödat fyra av fångarna i ett försök att tvinga dem att agera.
Konflikten i Syrien har ökat sekteristiska spänningar i Libanon, med våld som regelbundet sprider sig över gränsen och mer än en miljon flyktingar som anländer.
Minst sex personer uppges ha dödats i en bombattack i en stad nära Libanons gräns till Syrien.