Graham Dwyer, 42, från Foxrocks förort i södra Dublin, erkände sig inte skyldig till mordet på Elaine O'Hara.
Kvarlevorna av Anna O'Hara, 36 år, hittades i Dublinbergen den 13 september 2013.
Hon sågs senast den 22 augusti 2012, dagen för hennes påstådda mord, nära Shanganagh kyrkogård i södra Dublin.
Domaren sa att 40 dagars bevis, som sträcker sig tillbaka över fem år, handlar om vad som hände under de tre timmarna efter att Ms O'Hara försvann.
Han berättade för de sju männen och fem kvinnorna att de kunde ta så lång eller så kort tid som de behövde för att nå "en samvetsgrann och korrekt genomtänkt dom".
Juryn i rättegången mot en arkitekt som anklagats för att ha mördat en barnavårdsarbetare i Republiken Irland har dragit sig tillbaka för att överväga dess dom.