MOTV är en betald video på begäran app om jakt, skytte och fiske, och lanserades i USA 2016.
Den lanserades denna vecka i Storbritannien, men lockade omedelbart kritik för att ha med sig video av jägare med döda lejon och andra djur.
Kroenke äger företaget bakom MOTV.
Det är en liten del av hans enorma Colorado-baserade sportimperium, Kroenke Sports & Entertainment, som driver TV-stationer inklusive The Outdoor Channel och World Fishing Network.
Programutbudet är inte tillgängligt i alla länder, delvis på grund av äganderätt, men också i vissa fall på grund av lokal smak.
Dess webbplats illustrerar detta och påpekar att vissa TV-program som är populära hos medlemmar i USA kanske inte är önskvärda för medlemmar i Kanada, även om de båda är engelskspråkiga regioner.
Företaget sade: "Det har varit betydande offentlig uppmärksamhet på en liten del av programmering på vår MyOutdoorTV app som innehåller innehåll i samband med jakt på vissa stora spel djur," sade Jim Liberatore, chef för Outdoor Sportsman Group.
"Stan Kroenke har instruerat oss att ta bort allt innehåll som rör dessa djur mot bakgrund av allmänintresset", sade han i ett uttalande.
Jakt-TV-appen väcker protester
Företaget ville gärna understryka att det verkar oberoende av Arsenal Football Club.
"Arsenal Football Club har inget att göra med något av våra medier. Det har inget att göra med vårt innehåll eller de redaktionella beslut vi fattar, sade uttalandet.
"Vi förtjänar ingen ära när en Arsenal strejkare gör mål. Arsenal förtjänar ingen kritik när vi erbjuder ett program som vissa inte håller med om."
Ledare för Labouroppositionen och lokal riksdagsledamot Jeremy Corbyn sade att han var "äcklad" av kanalen: "Som Arsenalfan är jag äcklad över att Stan Kroenke är inblandad i en så brutal, oetisk och onödig verksamhet."
Robert Peston, ITV:s politiska redaktör och en av Arsenals mest kända fans, uttryckte sin avsky för Kroenkes koppling till kanalen.
I en tweet tidigare i veckan sa han: "Jag mår illa jag måste betala pengar till denna person."
Philippa King, från League Against Cruel Sports, välkomnade dagens drag: " Att göra reklam för en TV - kanal som förhärligar blodsporter skulle aldrig bli någon bra idé i en nation av djurälskare. Vi bad mr Kroenke att ställa in sin plan att visa troféjakt och det är vad han har gjort, så vi tackar honom för det.
"Oavsett om beslutet fattades för att hans ögon öppnades för lidandet hos djur som var inblandade i troféjakt, eller för att han insåg att det var en PR-katastrof för Arsenal fotbollsklubb, vet jag inte. Förhoppningsvis var det det förra."
Stan Kroenke, ägare till Arsenal Football Club, har beställt stora spel jaktvideor som ska tas bort från appen MyOutdoorTV (MOTV).