Femton år senare är hon fortfarande den enda svarta kvinnan som har vunnit priset - och hon är inte glad över det.
På tal i Cannes förra veckan sa skådespelerskan att hon hade blivit "väldigt sårad" när inga svarta stjärnor nominerades till stora skådespelarpriser på 2015 års Oscarsgalor.
Hennes kommentarer har följts av att Akademien tillkännager att den bjuder in 774 nya medlemmar från 57 länder i ett försök att öka mångfalden.
Skådespelare Naomie Harris, Riz Ahmed och Warwick Davis är bland dem som är inbjudna att gå med, med Oscarsarrangörerna säger 39% av den nya klassen är kvinnor, öka det totala kvinnliga medlemskapet till 28%, upp tre poäng från 2015.
Det tillade att det nya medlemskapet också är nästan en tredje icke-vit, med antalet icke-vita väljare nu på 13 procent, en ökning från 8 procent för två år sedan.
Men Berry sa om sin Oscar vinna: "Det var förmodligen en av mina lägsta professionella ögonblick."
50-åringen berättade för Teen Vogues Elaine Welteroth att hon hade tänkt tillbaka på kvällen hon vann sin Oscar och tänkte: "Wow, det ögonblicket betydde verkligen ingenting."
"Jag blev djupt sårad av det och ledsen över det och det inspirerade mig att försöka engagera mig på andra sätt", fortsatte hon.
"Därför vill jag börja regissera, jag vill börja producera mer [och] jag vill börja vara en del av att skapa fler möjligheter för människor med färg."
På natten i fråga, Berry ägnade sin seger åt "varje namnlös, ansiktslös kvinna av färg som nu har en chans eftersom denna dörr har öppnats".
Men sedan hon vann har bara fyra svarta skådespelerskor nominerats till den bästa skådespelerskan Oscar.
De inkluderar Viola Davis - vinnare av årets bästa understödjande skådespelerska Oscar - och Ruth Negga, som nominerades i år till Loving.
Precious star Gabourey Sidibe och Quvenzhane Wallis, den unga huvudrollen i Beasts of the Southern Wild, var också nominerade till den bästa skådespelerska utmärkelsen 2010 respektive 2013.
Fyra nomineringar på 15 år är knappast något att skriva hem om. Ändå är det värt att komma ihåg att under de 72 åren av Oscarsceremonier före Berrys seger hade bara sex svarta skådespelerskor någonsin varit med om sitt pris.
Två av dessa nomineringar kom 1973, då Diana Ross och Cicely Tyson - nominerade till Lady Sings the Blues och Sounder - förlorade till Cabarets Liza Minnelli.
Dessförinnan var Dorothy Dandridge, den enda svarta skådespelerska som kom inom räckhåll för statyetten, nominerad 1955 i Carmen Jones.
Fyra svarta män har vunnit den bästa skådespelaren Oscar sedan den första ceremonin hölls 1929, medan ytterligare nio har nominerats.
Frågan om svart representation på Oscarsgalan blev en fråga av allmänt intresse 2015 och 2016, år då ingen person av färg nominerades till någon av skådespelarpriserna.
Detta ledde till "OscarsSoWhite" kampanj och flyttar av akademin för att göra både sitt medlemskap och nomineringar mer varierande.
Har Berry rätt att känna sig förnärmad? Vi ställde den frågan till Sarita Malik, professor i media, kultur och kommunikation vid Bruneluniversitetet i London, som är specialiserad på mångfald och skärmmedier.
"Vad Halle Berry säger avslöjar den börda av representation som historiskt har placerats på svarta skådespelare, filmer och representationer mer allmänt - idén dessa måste ta itu med det ihållande problemet med underrepresentation," berättade hon BBC.
"Hennes besvikelse har kommit att prägla våra förväntningar, där vi leds till att tro att fler och bättre olika typer av representation kommer att följa dessa sällsynta framgångar.
"Oscars är en stor sak på grund av sin internationella profil, sitt arv och som en barometer av den kulturella stämningen", fortsatte hon.
– Om Oscarsgalan är praktiskt taget helvit, vilket den historiskt sett har tenderat att vara, så säger det något om den kultur vi firar och stöder. Men det avslöjar också vilka typer av filmer som beställas, finansieras och synliggörs genom marknadsföring och distribution.
– De senaste åren har med fördel fört viktiga offentliga debatter om mångfald inom filmindustrin och det är ett positivt steg att Akademins medlemskap breddas.
"Det är viktigt att det finns större mångfald i ledarskapet, men också att frågan om varför sådan ojämlikhet existerar hanteras direkt, snarare än att allt fler mångfaldsinitiativ tas upp."
Gaylene Gould, författare och chef för biografer och evenemang på BFI Southbank, anser att Berry gör rätt i att tala ut.
"Hon är den enda svarta skådespelerskan som någonsin fått en bästa skådespelerska pris i hela Oscars historia så naturligtvis är hon berättigad", berättade hon BBC. "Jag förstår varför hon är deprimerad."
Gould tycker också att det är viktigt att medan Berry fortfarande är den enda bästa skådespelerskan vinnare, sju svarta skådespelerskor har utsetts till bäst stödjande skådespelerska.
"Om en svart kvinna kommer att få något det kommer att vara bäst att stödja skådespelerska", sade hon. "Det går sällan högre än så."
Hattie McDaniel var den första svarta skådespelerskan som utsågs till bäst stödjande skådespelerska och vann för Gone with the Wind 1940.
Nästa var Whoopi Goldberg, som vann priset för Ghost mer än ett halvt sekel senare.
"Det finns en fråga där om var vi positionerar kvinnor, var vi placerar svarta kvinnor och hur allvarligt de tas på bio," Gould fortsatte.
"En hel del av det vi gör på British Film Institute handlar om hur man skapar möjligheter och systematiskt förändrar de grundläggande trenderna inom sektorn."
Förra året lanserade BFI sin Black Star säsongen, en tre månader lång, Storbritannien-omfattande firande av svart skärm talang.
Följ oss på Facebook, på Twitter @BBCNewsEnts, eller på Instagram på bbcnewsents. Om du har en berättelse förslag e-post underhållning.news@bbc.co.uk.
Halle Berry var den första svarta kvinnan som vann den bästa skådespelerskan Oscar när hon vann Monster's Ball 2002.