Thanet District Council (TDC) dömdes att häva förbudet mot export av levande djur genom Ramsgates hamn.
Den betalade mer än £ 5m i ersättning till handlare men har inte lämnat in ett försäkringskrav för att hämta några pengar.
Campaigners sa att skattebetalarna hade lämnats att betala räkningen när rådet missade tidsfristen.
Ian Driver, en kampanjledare och före detta fullmäktigeledamot, sade att siffrorna bara hade kommit fram efter en begäran om informationsfrihet.
Mr Driver, sade: "Så där har ni det: en stor administrativ upptrappning av TDC innebär att skattebetalarna har tvingats betala 5,1 miljoner pund, varav en del, om inte alla, skulle ha täckts av försäkringsbetalningar om anspråket hade lämnats in i tid. Men det var det inte."
TDC sade att den maximala betalningen enligt politiken var 1 miljon pund.
En talesman sade: "De rättsliga anspråken mot rådet har alla avgjorts och redovisats i föregående års budgetar."
TDC förbjöd export av levande djur 2012 efter att mer än 40 får dött.
Beslutet upphävdes av Högsta domstolen 2014 efter en lång rättslig strid.
Herr Justice Birss sade att rådet var skyldig att betala skadestånd till tre företag som drabbats av förbudet.
Två får drunknade vid Ramsgate i september 2012 och 44 måste förstöras eftersom de var sjuka och halta.
Djuren avlivades efter det att den lastbil som bar dem stoppades vid Ramsgate av djurhälsoinspektörer.
Vid en separat incident kollapsade också ett lastområdesgolv medan får togs av en lastbil med 548 djur.
Sex föll i vattnet, med fyra räddade av RSPCA officerare medan två djur drunknade.
Handeln med levande djur återupptogs genom Ramsgate i juli 2015.
Ett råd har anklagats för en "stor administrativ tuppuppupp" efter att ha underlåtit att göra ett försäkringsanspråk på upp till 1 miljon pund.