Den 29-årige före detta Manchester United spelaren kommer nu att flyga till London för att slutföra personliga villkor och ha en medicinsk med Hammers.
Under tiden, Österrike framåt Marko Arnautovic kommer att ha en medicinsk inom 48 timmar efter West Ham kommit överens om ett avtal med Stoke City.
Det är förstått att Stoke har accepterat en avgift i regionen £24m.
I maj blev Hernandez - allmänt känd av smeknamnet Chicharito, som betyder "liten ärta" - Mexikos ledande målskytt genom tiderna med sitt 47:e internationella mål.
Hernandez gjorde 59 mål i 156 framträdanden för United efter anländer till Old Trafford 2010, innan du går med i Leverkusen för £ 7,3m i augusti 2015.
Han har netts 39 gånger i 76 matcher för den tyska klubben.
Arnautovic, 28, anslöt sig till Stoke från Werder Bremen för fyra år sedan och är bara 12 månader in i ett fyraårigt kontrakt med Potters.
Han gjorde sju gånger på 35 matcher i alla tävlingar förra säsongen.
West Ham undertecknade Manchester City och England målvakt Joe Hart på en säsong lång låneavtal på tisdag.
Mediauppspelning stöds inte på den här enheten
Hitta alla de senaste fotbollsöverföringarna på vår dedikerade sida.
West Ham har kommit överens om ett avtal med den tyska klubben Bayer Leverkusen om att underteckna den mexikanska anfallaren Javier Hernandez för 16 miljoner pund.