South Wales Fire and Rescue Service släckte branden vid Alexandra Docks som kom efter att 20 000 ton trä fångades den 5 december.
I tjänsten sades det att fyra apparater, en flygplattform, två vattentankfartyg och en pump måste skickas på måndagen efter det att den brast i en ny flamma.
Branden kom så småningom under kontroll omkring 17:30 GMT.
Sex besättningar är kvar på platsen och dämpar sig.
Branden hade varit rökande sedan det började för 16 dagar sedan, med Natural Resources Wales säger den 10 december kan det fortsätta att smoulder för "veckor".
En träfliseld som först tändes på en Newport- dockgård för mer än två veckor sedan har blossat upp igen.