Han sade att Torykonferensens tillkännagivanden om invandring hade varit "oroliga, ondskefulla och under förakt".
Inrikesminister Amber Rudd har sagt att nya hinder för utländska arbetstagare och studenter kan behövas för att "ändra strömmen" av den allmänna opinionen om invandring.
Jones uppmanade walesiska labour att "strida för själen efter Brexit Britannien".
I ett e-postmeddelande till partimedlemmarna fördömde den förste ministern de konservativa och sade: "Det här är inte bara hundvisslans politik, det är rännstenens politik."
Han sade att walesiska labourmedlemmar bör sträva efter att vara en "vägspärr" för Tory planer på att begränsa invandringen, och visa att det fanns "ett bättre sätt".
"När senior Tories sa igår att utländska läkare och deras familjer bara var välkomna här medan de behövdes, sa jag att de är välkomna, full stopp," skrev han.
"Vi måste avvisa Tories hemska förolämpning mot människor som arbetar dag ut, dag ut för att rädda och förbättra liv över hela Wales."
Jones beskrev Brexit som "en seismisk och oroande händelse i vårt lands historia, och hur vi reagerar på den kommer att bli måttet på denna generation av politiker och politiska partier".
"Jag har gjort helt klart att jag tror att Wales måste acceptera folkomröstningsresultatet, vi kan inte kämpa om den striden, men vi kan kämpa för vår framtidsvision", sade han.
"En ljus framtid för våra barn och barnbarn, baserad på våra värderingar rättvisa, internationalism och välstånd för alla."
Walesisk konservativ ledare Andrew RT Davies beskrev Jones kommentarer som "löjeväckande".
"Ultimat, om det finns en giftig atmosfär som omger invandringspolitiken beror det på att på varandra följande Labourregeringar under 13 år skoningslöst kvävde måttliga diskussioner och lämnade miljoner människor som kände sig frustrerade och ignorerade", sade han.
Samtidigt har SNP-ledaren Nicola Sturgeon och Plaid Cymru-ledaren Leanne Wood gått samman med Green Party-ledarna över hela Storbritannien för att fördöma "den mest giftiga retoriken om invandring som setts från någon regering i levande minne".
Utländska läkare i Wales kommer inte att uppmanas att "gå hem", walesisk labourledare Carwyn Jones har sagt, anklaga de konservativa för "gutter" politik.