Branden blåste ut fönstren i fastigheten på Lewes Road, till en början ledde till rapporter om att det hade skett en explosion.
Räddningstjänst deltog i scenen kl 02:50 BST och kroppen upptäcktes i övervåningen av huset, som hade blivit svårt skadad.
Polisen och brandkåren utreder orsaken till branden.
Invånare från flera närliggande bostäder, som evakuerades, har nu tillåtits tillbaka till sina fastigheter.
Gatan, strax utanför Neasham Road, är avspärrad.
En mans kropp har hittats efter en brand i ett hus i Darlington.