Ibrox outfit minskade gapet till nio poäng med söndagens seger.
"Vi har sex mycket viktiga ligaspel och det är viktigt att vi går rakt igenom linjen denna säsong," Dons manager McInnes berättade BBC Skottland.
"Förhoppningsvis en Hampden kopp final och slut på andra plats - jag är övertygad om att vi kommer att göra det."
Den Pittodrie sidan, som möter Hibernian i den skotska Cup semifinalen den 22 april, gick in i söndagens match efter att ha vunnit 10 hemmamatcher i rad.
Rangers skuggade första hälften chanserna men värdarna var bra på den främre foten när Kenny Miller gjorde besökarnas öppnare efter 79 minuter. Strikern la till en andra två minuter senare och ersätta Joe Dodoo gjorde det 3-0 på 83 minuter.
McInnes erkänner att han togs tillbaka av den plötsliga omsvängningen och blev besviken över hur hans trupper reagerade.
"Jag tror att vi hade verklig kontroll över spelet," tillade han. "Jag tyckte att vi var bättre lag, säkert i andra halvlek. Vi började båda halvorna riktigt bra men vi tillät den första halvan att bli lite otålig och vi klarade inte bollen som vi brukar göra hemma.
"Vi startade den andra halvan starkt och spelet spelades i deras defensiva tredje. Deras väktare gjorde ett par mycket bra räddningar, särskilt från (Adam) Rooney - Jag trodde att det var förbi honom att vara ärlig.
"När jag funderade på förändringar på 0-0 kände jag inte ett hot och jag trodde att målet var på väg men tyvärr för oss spelade vi en roll i vårt eget fall genom att ge bort ett dåligt mål och vi hade en galen fem minuter efter det.
"Vår reaktion på att förlora det första målet var vad jag är mest besviken på. Från att vara ansvarig för spelet och ser mest troligt att vi har gett Kenny Miller möjlighet att visa sin kvalitet, och han visade det.
"Men vi måste vara bättre än så. Vi brukar svara bra på att gå bakom - det händer inte alltför ofta men vi måste reagera bättre än så och om det finns en lektion från idag, det är det.
"Det är en öm en för oss, ingen tvekan om det. I våra anhängares ögon är det en stor besvikelse idag och vi förstår det.
"Vi förlorade kampen idag men det är viktigt att vi fortfarande vinner kampen för andra plats, och förhoppningsvis få oss in i en kopp final
"Vi har varit på en mycket bra körning men det ger dig inga garantier, och det är en påminnelse om att det fortfarande finns arbete att göra. När du förlorar ett spel som idag och den enorma känslan av besvikelse, önskar att vi kunde spela om allt igen, måste vi kanalisera det på rätt sätt. Vi har mycket att se fram emot."
Derek McInnes är övertygad om att hans Aberdeen sida kommer att avsluta andra i Premiership, trots deras 3-0 hem nederlag till tredje-placerade Rangers.