Hans 1965 spår Tårar var den tredje största säljande singeln av årtiondet, enligt en nyligen sammanställt diagram.
The Beatles upptar de två översta platserna i diagrammet och har ytterligare tre poster i Top 10.
DJ Tony Blackburn räknade ner de 60 mest sålda skivorna från 1960-talet i ett speciellt program på BBC Radio 2, som sändes på Bank Holiday Monday.
Enligt försäljningsuppgifter som sammanställts av det officiella Charts Company, den största säljande singeln på 1960-talet var She Loves You by The Beatles.
Jag vill hålla din hand, inspelad av Fab Four 1963, kom tvåa.
Sextiotalet som håller på att brytas
De andra Beatles skivorna i Top 10 är Can't Buy Me Love vid fyra, I Feel Fine vid fem och den dubbla A-sidan We Can Work It Out/Day Tripper vid sju.
Ändå Dodds spår - som toppade Storbritannien singlar diagram för fem veckor och var den mest säljande singeln av 1965 - överträffade dem alla.
"Det kommer inte som någon överraskning att se Fab Four på nummer ett, men andra aspekter av diagrammet är kanske lite oväntade," sade Blackburn.
Jeff Smith, Radio 2s musikchef, kallade diagrammet "en nostalgisk återspegling av den bestående dragningskraften hos 60-talets musik och artisterna som definierade årtiondet".
Dodd, nu 82, har varit i showbusiness i mer än 50 år.
Född i Liverpool 1927, han är mest känd för sina buck tänder och frissigt hår, kittlande pinne och hans skapande av Diddymen.
Excentrisk komiker Ken Dodd var en av 1960-talets största skivkonstnärer, ny forskning har avslöjat.