Musgrove Park sjukhus sade orsaken till de "tekniska problemen" i den hyrda anläggningen var utredd.
Kirurgi utfördes på 62 patienter med knappt hälften rapporteringskomplikationer medan omkring 15 personer hade "mer signifikanta" korneala problem.
Användningen av den mobila anläggningen upphörde när problemen upptäcktes.
Alla drabbade patienter har talats till och vårdplaner finns nu på plats för deras pågående behandling, sade en sjukhus talesperson.
Vanguard Healthcare hade anlitats för att tillhandahålla teatern för att hjälpa till att rensa en eftersläpning för vissa oftalmiska tjänster.
Enheten, som består av ett anestesirum, operationssal och tvåbäddsrehabilitering, ligger på sjukhuset fram till årets slut.
Vanguard sade att det var "kooperativt fullt ut" med sjukhuset för undersökningen som skulle fokusera på de droger, utrustning, sterilisering och protokoll som används.
"De flesta operationer var framgångsrika, men ett antal upplevde en ovanlig nivå av obehag efter operation," tillade en talesperson.
"Vi har, med sjukhuset, förmedlat till patienterna vår oro och sympati för det obehag eller den ångest de har upplevt."
Sjukhusets chef, Jo Cubbon, sade att frågorna betydde många patienter som redan hade väntat längre än de borde, kommer nu att behöva vänta på sin operation igen.
"Vi är mycket ledsna att detta har hänt och arbetar för att sätta en lösning på plats så att dessa patienter kommer att få sin behandling så snart som möjligt", sade Cubbon.
Omkring 30 patienter i Somerset som hade kataraktkirurgi i en mobil sjukhusteater har lämnats med dimsyn eller andra komplikationer.