Mediauppspelning stöds inte på den här enheten
Bolt kryssade igenom i Rio på 10.07 sekunder, som amerikansk rival Justin Gatlin kvalificerade snabbast i 10.01.
Storbritanniens CJ Ujah (10.13) och James Dasaolu (10.18) gick igenom som åttonde och 19: e snabbaste kval, men James Ellington (10.29) är ute.
Halvfinalen äger rum måndagen den 17.00 BST, med finalen planerad till 02:25 BST.
"Jag är glad att få ut den första, det kändes bra", sade Bolt. "Det var inte den bästa början. Förhoppningsvis kan jag gå mycket smidigare i morgon, jag mår bra, jag är lycklig.
"Nu handlar det om avrättning och att få det rätt när det gäller finalen."
Christine Ohuruogu bokade sin plats i semifinalen på kvinnornas 400m.
Den 32-årige, mästare i Peking 2008 och silvermedaljör i London för fyra år sedan, såg slät ut när hon klockade 51.40 sekunder för att avsluta andra i sin värme till American Natasha Hastings.
Brittisk mästare Emily Diamond klockade 51.76 att avsluta fjärde och gå igenom som en snabbaste förlorare, men Serena Bundy-Davies slutade sist i sin värme.
Jamaicas försvarare Usain Bolt klarade sig genom 100m värme utan larm för att nå OS semifinaler.