Polisen sa att angriparna kom in på egendomen på Craigmillar Castle Road omkring 20:15 på fredag. Polisen tror att attacken kan ha blivit riktad.
En 38-årig man led av allvarliga men icke-livshotande ansiktsskador och fördes till sjukhus för behandling.
Det andra offret, 49 år, behövde inte läkarvård.
Det är Alan O'Brien. i Police Scotland, sade: " Vi tror att detta kan ha varit en riktad attack och arbetar för att fastställa de fullständiga omständigheterna.
"Jag skulle uppmana alla som kan ha sett misstänkta beteende av tre män i området vid denna tid att träda fram.
"Vi är också ivriga att spåra alla misstänkta fordon som setts på gatan runt den här gången, och jag skulle återigen fråga alla som kan ha information om detta komma i kontakt."
Två män har blivit överfallna av tre maskerade angripare på en adress i Craigmillar-området i Edinburgh.