En framställning till församlingen vill att det ska vara obligatoriskt att skanna mikrochips av alla husdjur, döda eller levande.
RSPCA Cymru sade att det backade obligatorisk identifiering av husdjur döda på motorvägar så att ägarna vet vad som hände.
Ett av sex råd som inte skannar sade att det höll på att se över sin politik, men två andra har inga planer på att ändra sig.
Petitionen säger: "Microchip-systemet kan bara vara fullt effektivt om djur som har mikrochipps skannas och detta är viktigt för de ägare som måste uthärda den mentala plågan att aldrig veta och fortsätta söka i veckor / månader när ett husdjur i familjen försvinner."
Framställningen har mer än 160 underskrifter - för närvarande behöver framställningar 10 namn innan de övervägs, men förslag diskuteras för att öka detta till 50.
Katter Skydd vill att det ska vara obligatoriskt för människor microchip sina djur - en lag som täcker hundar trädde i kraft i april 2016.
När den walesiska regeringen utvecklade regler för mikrochipping, fann en undersökning av råd de flesta rutinmässigt skannade döda hundar som hittades på vägarna och informerade ägare när det var möjligt, så obligatorisk skanning ingick inte.
I framställningarna stod det att endast Gwynedd, Anglesey, Cardiff, Newport, Blaenau Gwent och Neath Port Talbots råd inte rutinmässigt skannar djur.
Resten gör "när de anser att djuret i en stat att göra det" men petitionen kräver att detta omfattar alla husdjur, oavsett deras tillstånd, och deras ägare meddelade.
"Whilst anses det olyckligt upprörda eller ångest gatan ren kan uthärda när skanna djur som finns på ett dåligt sätt, faktum är att de kommer att hantera dessa djur oavsett vår föreslagna politik," sade det.
Cardiffrådet sa att döda hundar skannades och fördes till pundet, men inte katter - vilket myndigheten har begärt separat.
Neath Port Talbot sade att det var att se över situationen i ljuset av flera förfrågningar, Blaenau Gwent sade att det inte hade några planer på att skanna, som Anglesey - att säga att det inte var en del av sin gatustädning kontrakt med ett privat företag.
RSPCA Cymru sade att det var "djupt ledsen" ägare av många djur som dödades på vägarna var "omöjlig att hitta dem eller lära sig deras öde".
Välgörenhet vill se obligatorisk identifiering av husdjur och deras ägare meddelas när de dödas på motorvägar.
Djurälskare hoppas att göra det obligatoriskt för husdjur som finns av rådets arbetare att kontrolleras för mikrochips så att de kan returneras till sina ägare.