Pakistans militära talesman säger att linjen just har använts för första gången när de två länderna arbetar för att förbättra samordningen längs gränsen.
Flytten var överenskommen när Pakistansk armé chef Raheel Sharif besökte Kabul.
Säkerhetssamarbetet mellan de två länderna anses vara avgörande för att motverka det växande hotet från talibanerna.
Tidigare denna månad anklagade Afghanistans president Ashraf Ghani pakistanska militanta grupper för det eskalerande våldet.
Afghanska tjänstemän anklagar ofta Pakistan för att kontrollera de afghanska talibanerna.
Det sägs att Islamabad tillåter de högsta afghanska talibanledarna att verka fritt där. Pakistan förnekar detta även om man medger att man har kontakter med militanterna.
Nyheten om telejouren kommer i och med att Afghanistan nästa vecka kommer att vara värd för diskussioner med Pakistan, USA och Kina för att bereda vägen för eventuella afghanska fredssamtal med talibanerna.
Afghanistan anser att Pakistans stöd är avgörande för att förhandlingarna med talibanerna ska bli framgångsrika.
President Ghani har nyligen gått mot att stärka banden med Pakistan - talibanernas historiska anhängare - i det som korrespondenterna säger är ett desperat försök att återuppta fredsförhandlingarna när upproret sprider sig.
Presidenten varnade för att närvaron av internationella militanta grupper - däribland al-Qaida, Islamiska staten och militanta grupper från Kina, Ryssland, Uzbekistan, Tadzjikistan och Mellanöstern - växte i Afghanistan.
Pakistans premiärminister Nawaz Sharif sade i början av denna månad att "arbeta för att uppnå ett fredligt grannskap är en huvudman för Pakistans utrikespolitik".
"Vi bör planera kollektiva och samordnade åtgärder på den regionala säkerhetsfronten för att se till att vinsterna och kampen mot terrorismen är varaktiga och oåterkalleliga", sade han.
Pakistan och Afghanistan har upprättat en jourlinje mellan sina respektive militära befälhavare för att minska de ofta förekommande gränsöverskridande spänningarna.