En vecka av protester för att sammanfalla med loppet började på fredag, organiseras av oppositionen mot den styrande kungliga familjen.
New York Times rapporterade att myndigheterna i Bahrain ökade säkerheten efter en rad explosioner i landet.
Ecclestone sade till AFP:s nyhetsbyrå: "Det finns ingen anledning till varför [kapplöpningen] inte skulle vara [en framgång]."
Han frågade om demonstrationerna och sade: " Vad har hänt? Ska de demonstrera nu? Det visste jag inte. Det är ingen som demonstrerar."
Explosionerna i Bahrain rapporterades inbegripa en gascylinder som satte en bil i brand i det finansiella distriktet av huvudstaden Manama.
Ecclestone tillade på tisdagen: " Vi vill inte se några problem. Vi vill inte att folk bråkar och bråkar om saker vi inte förstår, för vi förstår verkligen inte. Vissa tycker att det är vårt fel att det finns problem.
"Förra året talade jag med de personer som representerade demonstranterna och jag talade med dem vi har att göra med. Det var verkligen svårt att avgöra vem som har rätt och vem som har fel.
"Jag är glad att tala med någon om detta, som jag gjorde tidigare", sade han och citerade sina möten med Bahrains oppositionsparti al-Wefaq förra året i London och Mellanöstern.
Bahrains myndigheter har lovat "lämpliga säkerhetsåtgärder" för Grand Prix. "Säkerhetsläget är mycket lugnande," en regering taleskvinna berättade statliga nyhetsbyrån BNA.
Hon tillade att Bahrain "kommer att se till att lämpliga säkerhetsåtgärder vidtas under F1-loppet och kommer att vidta tillräckliga åtgärder, som i alla andra länder som är värdar för sådana internationella idrottsevenemang".
Oppositionen och regeringen återupptog försoningssamtalen i februari för första gången sedan 2011, då protesterna krossades och minst 35 personer dog, men få framsteg har rapporterats.
Protektorer har berättat för nyhetsbyrån Reuters att de ser en möjlighet att använda loppet för att belysa vad de säger är orättvisor som fortfarande begås mot dem.
2011 års Grand Prix i Bahrain sköts upp och ställdes senare in efter månader långa prodemokratiska protester krossades.
Ecclestone sade att han var "extremt sympatisk" mot oppositionen i Bahrain och tillade: "Glöm inte att det var jag, när vi hade apartheid i Sydafrika, som drog i loppet."
Förra årets lopp gick vidare efter Ecclestone och styrande organ FIA sade att de hade blivit försäkrade om att riket var säkert för F1-personal.
Före loppet, Force India mekanik fångades upp i en incident där en bensinbomb studsade från taket på sin bil som demonstranter kämpade med polisen på huvudvägen från kretsen till Manama.
Nästa dag hoppade laget över den andra övningen för att se till att deras personal kunde återvända till sitt hotell innan mörkret.
Men vicesheriff Bob Fernley sade: "Lightning slår inte till två gånger på samma ställe. Jag förväntar mig inga problem alls."
Red Bulls Sebastian Vettel vann 2012 års lopp, framför Lotus paret Kimi Raikkonen och Romain Grosjean.
Formel 1 chef Bernie Ecclestone säger att det finns "ingen anledning" varför helgens Bahrain Grand Prix inte bör gå vidare.