Incidenten med en Ford Transit minibuss och en Saab bil inträffade omkring 22:15 BST på onsdag.
Den kvinnliga föraren av minibussen och den manliga föraren av bilen fördes till Bangors Ysbyty Gwynedd.
Vägen öppnades igen under de tidiga timmarna efter en inledande undersökning, sade North Wales Police.
Två personer är på sjukhus med allvarliga skador efter en krasch på A499 nära Pwllheli i Gwynedd.