Ri Jong Chol sa att hans häktning var en "plot" för att "skadliggöra republikens heder", rapporterar Reuters nyhetsbyrå.
Han gjorde kommentarerna utanför Nordkoreas ambassad i Peking efter att han deporterats från Malaysia på fredag.
Ri Jong Chol släpptes från polisen på grund av otillräckliga bevis.
Han talade med reportrar tidigt på lördagen och anklagade Malaysia för att använda tvång i ett försök att få fram ett erkännande.
Malaysias myndigheter fortsätter sin utredning om Kims död, den bortreste halvbror till Nordkoreas ledare Kim Jong-un, som dödades på en flygplats i landets huvudstad, Kuala Lumpur för nästan tre veckor sedan.
Ri Jong Chol, som sade att han inte var på flygplatsen samma dag som händelsen inträffade, var den enda nordkorean som hölls i samband med dödsfallet.
Malaysia försöker förhöra flera nordkoreaner, däribland en ambassadtjänsteman.
Två kvinnor, Doan Thi Huong från Vietnam och Siti Aisyah från Indonesien, anklagades på torsdag för att ha dödat Kim genom att smutskasta hans ansikte med VX, ett förbjudet kemiskt vapen.
Båda kvinnorna sa att de trodde att de deltog i ett TV-skämt. De har ännu inte gjort någon formell framställning i sitt fall.
Malaysia, som har fördömt användningen av den mäktiga nervagenten i attacken den 13 februari, undersöker också en bestämd tanke att användas av Nordkorea för att undvika sanktioner mot militär export.
Ri Jong Chol hade bott i Malaysia i tre år, men enligt Reuters upphörde hans arbetstillstånd den 6 februari.
Invandringschef Mustafar Ali sa att Ri Jong Chol, som eskorterades ut ur Malaysia av två nordkoreanska ambassadtjänstemän, var svartlistad från återinträdet i landet.
Samtidigt sade regeringen att den hade inlett en undersökning av ett företag som heter Glocom, som har varit verksamt i Malaysia i flera år.
Enligt en konfidentiell FN-rapport drivs Glocom av Nordkoreas högsta underrättelsetjänst för att sälja militär kommunikationsutrustning, i strid med FN:s sanktioner.
Polisen sa i fredags att en arresteringsorder hade utfärdats för 37-årige Kim Uk-il, som arbetar för Nordkoreas nationella flygbolag Air Koryo. Han tros vara kvar i Malaysia.
Reuters nyhetsbyrå rapporterade att säkerhetskontrollerna av nordkoreaner hade intensifierats vid alla gränsövergångar för att hindra dem från att lämna landet.
På torsdag, Malaysia meddelade att det var avbeställa visumfria resor för att besöka nordkoreaner, med hänvisning till säkerhetsskäl.
Den har inte direkt anklagat Nordkorea för attacken, men det finns en utbredd misstanke om att Pyongyang var ansvarig.
Nordkorea har kraftigt förkastat anklagelserna. Den förkastade också resultaten av obduktionsundersökningen, eftersom den över huvud taget hade invänt mot att den skulle genomföras, och krävde att kroppen skulle överlämnas till dem.
Det har ännu inte bekräftat att kroppen är Kim Jong-nams kropp och bara erkänner honom som nordkoreansk medborgare. Kim reste med ett annat namn.
Den nordkoreanska misstänkte förhördes i samband med Kim Jong-nams död har sagt att han var offer för en konspiration av de malaysiska myndigheterna.