Läkemedlet innehåller inte den ingrediens som producerar den höga mängden som förknippas med rekreations cannabis.
Behandlingen, som kallas Epidiolex, är baserad på en av de icke-psykoaktiva komponenterna i cannabisväxten, CBD.
Tidiga studier i USA har visat att behandling med CBD kan minska frekvensen och svårighetsgraden av kramper hos barn med svåra former av epilepsi.
Den nya prövningen markerar första gången behandlingen har testats i Storbritannien.
Patienter är inskrivna för en prövning av behandlingen vid Edinburgh Universitys Muir Maxwell Epilepsy Centre, baserat på Royal Hospital for Sick Children i Edinburgh, och Great Ormond Street Hospital.
Royal Hospital for Sick Children i Glasgow och Alder Hey Children's Hospital i Liverpool driver också studien.
Det finns ytterligare centrum i USA, Frankrike och Polen.
Deras första fokus kommer att ligga på barn med Dravets syndrom, en sällsynt men allvarlig typ av epilepsi som är svår att behandla. Vissa barn kommer att få behandlingen medan andra kommer att få placebo.
I ytterligare en fas kommer forskarna också att studera effekten på barn med Lennox-Gastauts syndrom.
Endast barn vars anfall inte kan kontrolleras med befintliga läkemedel kommer att delta i rättegången.
Dravets syndrom får vanligtvis fäste under det första levnadsåret. Det orsakar anfall som ofta är långvariga, varar längre än fem minuter.
De utvecklar sedan andra anfallstyper. Detta har en betydande inverkan på barnets utveckling och kan i vissa fall vara dödligt.
Epidiolex har utvecklats av det brittiska bioteknikföretaget GW Pharmaceuticals, som sponsrar och finansierar rättegången.
Doktor Richard Chin, chef för Muir Maxwell Epilepsy Centre, sade: " Många barn med allvarliga former av epilepsi reagerar inte på de mediciner som vi för närvarande har tillgängliga.
"Vi behöver nya sätt att behandla dessa tillstånd så att vi kan ge tillbaka lite livskvalitet till dessa barn och deras familjer."
Barn med svår epilepsi kan få hjälp av en ny behandling som härrör från cannabisplantan.