Den engelska ryttaren kraschade vid årets TT och Fireblade cykel har plågats av mekaniska problem.
Martin berättade för MCN att han var att sluta road racing men han senare klargöra sin position på Facebook.
"Jag har inte gett upp på racing eller road racing men jag har inga planer på att göra längre road racing på Hondas i år," sade han.
Martin tävlade inte på North West 200 efter lagkamrat John McGuinness kraschade i praktiken och han kommer inte att tävla i nästa månads Ulster Grand Prix.
Han tillade: " TT var en blodig katastrof, förutom att gå hunden och tävla Mugen, tyckte jag inte om det.
"Det stod klart redan innan att vi skulle kämpa och sedan blev det mig verkligen en test ryttare, vilket jag gjorde.
"Men efter att vi gjort fler tester på Cadwell för några veckor sedan, sa jag till laget att cykeln inte kommer att vara konkurrenskraftiga på Ulster Grand Prix och de bestämde sig för att dra tillbaka mig från evenemanget, även om de inte berätta för mig, vilket är OK eftersom beslutet togs för mig.
"Det finns inga oavslutade affärer och jag vill tävla klassiker och udda boll grejer."
Road racer Guy Martin säger att han inte kommer att tävla om Honda för resten av 2017 efter en frustrerande säsong.