Incidenten började på tisdagsmorgonen när gränsagenter stötte på två män som bar ryggsäckar åtta kilometer öster om Sumas i Washington i USA.
Myndigheterna säger att agenter avbröt ett försök att smuggla en massa MDMA, eller ecstasy, från Kanada till San Francisco.
Två andra arresterades och anklagades för att ha planerat att transportera drogerna.
På tisdag morgon beordrade amerikanska gränsagenter de två män de mötte nära gränsen att stanna, sade tjänstemän.
En av männen tappade sin ryggsäck, avfyrade ett vapen mot agenterna, och sprang, enligt ett brott klagomål in i amerikanska federala domstolen i Washington på onsdag.
Officerarna tog den andra mannen, identifierad som Jeffrey Laviolette, i förvar omedelbart.
Kanadensisk och amerikansk polis sökte efter rymlingen till fots och med helikopter och satte upp vägspärrar.
Nathan Hall, en kanadensisk medborgare, arresterades av Abbotsfordpolisen i British Columbia tidigt på onsdagsmorgonen.
Enligt gränspoliserna innehöll ryggsäckarna Hall och Laviolette sammanlagt 58lb (26kg) ecstasy.
I en ryggsäck fanns också ett körkort från Kalifornien med namnet William Nickerson men en bild av Nathan Hall, klagomålet hävdar.
Utredare grep senare en Bellingham, kvinna i Washington, Kali Henifin, som de säger planerade att hämta de två männen vid gränsen. De arresterade också hennes pojkvän, Ryan Lambert, som påstås ha sagt till officerarna att han skulle få 11.000 dollar (7.270) för att köra drogerna till San Francisco.
Anne-Marie Henifin berättade för agenter att de hade övervakat polisens radiokommunikation på en mobiltelefon när de hörde en rapport om en skottlossning och lämnade området, enligt klagomålet.
De tre svarande i amerikansk förvar ställs inför konspiration samt åtal för innehav och distribution av narkotika.
Det skogbevuxna området några kilometer öster om en motorvägsövergång är en välkänd smugglingsväg för narkotika och skjutvapen, och en talesman för den amerikanska advokaten för västra distriktet i Washington sade att BBC smuggling åtal är "en stor del av vår praxis".
Fyra personer är i förvar i USA och Kanada efter att en misstänkt knarksmugglare avfyrat mot amerikanska gränsagenter och flytt, med en dagslång jakt.