Kester David, 53, från Wood Green, hittades svårt bränd under en bro i Palmers Green 2010.
Polisen vädjade om information om hans död förra året.
I måndags sade polisen att de hade avslutat den nya undersökningen och att Mets kommissionär hade träffat David's familj för att be om ursäkt personligen.
Sir Bernard Hogan-Howe sade: "Det fanns uppenbarligen vissa saker som borde ha gjorts av dessa officerare, vilket helt enkelt inte var det.
"Det är också helt oacceptabelt att en sörjande familj behandlades så okänsligt."
Hans familj har alltid hävdat att han dödades för att ha arbetat som polisinformant och har hävdat att polisen inte har tittat på övervakningskameror eller talat med vittnen utan dröjsmål.
Den första utredningen från Scotland Yard om mr Kesters död ledde till att han begick självmord.
Ett år senare fann en intern utredning, som leddes av inspektör Brian Casson, en "katalog av fel" och en "fel i tjänsten" eftersom fullständig CCTV och mobiltelefonregister inte kontrollerades och vittnen inte intervjuades.
Sir Bernard insisterade på att den nya undersökningen, som nu avslutats av Met, var "t nog och utforskade varje enskild undersökningslinje som var öppen för oss".
Inspektörer kom fram till att det inte fanns några bevis eller uppgifter om att en tredje part var inblandad i hans död.
Trots ett antal överklaganden under den nya undersökningen till lokala och nationella medier och på BBC Crimewatch, inga arresteringar någonsin gjorts i samband med hans död.
Scotland Yard har bett familjen till en polisinformatör om ursäkt för "brister" i den ursprungliga utredningen av hans död.