I veckor har han utsatts för påtryckningar att avgå när undersökningar fortsätter med anklagelser om att hans fru fick stora summor offentliga pengar för ett arbete som hon inte gjorde.
Men efter att ha vunnit en strid med hans center-höger parti, vad är nu Mr Fillons chanser i kampen för Elysee Palace?
Han kommer att få sitt arbete klippt om han ska ta tillbaka ledningen han en gång höll i Frankrikes president ras. Den senaste opinionsundersökningen på tisdagen placerade honom tredje, på 19%, flera punkter bakom centristen Emmanuel Macron och Marine Le Pen vid den längst till höger nationella fronten.
Mr Fillon har hållit fast vid sin bas under de senaste sex veckorna, då en utredning av hans frus anställning piskade upp en storm runt hans kampanj.
När centristiska anhängare övergav honom i massor blinkade han knappt.
När hans kampanjledare och talesman slutade, tog mr Fillon bort det.
När dussintals parlamentsledamöter övergav honom, svarade han att han skulle klara sig utan dem alla.
När opinionsundersökningarna tydde på att han skulle kämpa för att nå den andra avrinningen, plöjde John Fillon på, fast besluten att visa att han behöll stödet från sina mest lojala anhängare.
I den meningen verkar hans hantering av skandalen ha varit en framgång.
Tiotusentals människor visade sig i regnet för att samlas runt honom på söndagen. Men hans hantering av anklagelserna mot honom, och medias uppmärksamhet kring dem, har också markerat en skarp förändring i tonen för Frankrikes mest etablissemang presidentkandidat, med ny taktik lånad från populistiska spelboken.
Söndagens möte beskrevs inledningsvis av John Fillon som en protest mot politisk inblandning i rättsväsendet. Han har klagat över en "institutionell statskupp", vilket antyder att den socialistiska regeringen ligger bakom de anklagelser som för närvarande utreds.
Vid presskonferenser nyligen har han presenterat sig som offret ett "politiskt mord", av en "lynching" av media, och han har anklagat utredare för att läcka endast en sida av bevisen i hans fall.
John Fillon har sagt att han kommer att lämna det till väljarna att döma honom, inte en "grundläggande [rättslig] process".
Men det har inte gått så bra att attackera landets institutioner medan man ställer upp i val med vissa partikolleger. Tidigare premiärminister Dominique de Villepin, på fransk radio, kallade det "farligt" och "oansvarigt".
Mannen Fillon slog till för att bli republikansk kandidat, Alain Juppe, anklagade honom för att leda kampanjen in i en återvändsgränd. "Han hade en bred öppen väg framför sig", sade han. "Vilket slöseri."
Det fanns också ett skeptiskt svar på påståendet från Mr Fillons team att söndagens rally hade lockat 200 000 människor till Trocadero i Paris.
Flera journalister påpekade att torget bara höll omkring 35.000 människor när det var fullt. Påståendet om 200 000 är fortfarande framträdande på Mr Fillons kampanjwebbplats.
Det talas nu om en "Trumpisation" av center-högerkandidaten, med flera kommentatorer och nyhetskanaler som jämför honom med USA:s president.
Det är en helt annan sida av en politiker som många såg som lugn, oberörd och ganska flegmatisk; "ogenomtränglig för demagogi och överdrift", som Le Monde uttryckte det.
Men kommer samma taktik att fungera för att vinna tillbaka de bredare röster han behöver i själva valet?
Mr Fillon kan kräva legitimitet från folket, men han är fortfarande en risk för sitt parti. Han ska inställa sig inför en domare den 15 mars och säger att han förväntar sig att bli föremål för en formell utredning.
Att angripa medierna, regeringen och rättsväsendet kan samarbeta med hans mest lojala anhängare, men det har drivit många andra väljare bort.
Om detta är Francois Fillons nya ansikte, kan somliga undra vad det säger om den franska politikens framtid.
Den franske presidentkandidaten Francois Fillon har undvikit ett abrupt slut på sin kampanj genom att säkra stödet från sitt delade republikanska parti.