Hazrat Mirza Masroor Ahmad, kalifen i Ahmadiyya Muslim Community (AMC), sade hans "hjärtade sympatier" var med offren.
Han talade på ett fredssymposium som hölls på Baitul Futuh moskén i Morden i södra London på lördag.
Fem personer dog och 50 skadades utanför parlamentet i onsdags.
I ett meddelande berömde premiärminister Theresa May konferensen, som hon kallade "en årlig påminnelse om ert samhälles engagemang för att främja fred".
Parlamentsledamöterna Paul Scully och Siobhan McDonagh var bland de hundratals som deltog i evenemanget i Storbritanniens största moské.
Kalifen beskrev attacken i centrala London som en "barbarisk illdåd".
"Oavsett vad terrorister kan hävda, under inga omständigheter är urskillningslösa handlingar, eller mord någonsin berättigade," sade han.
Han tillade att muslimer och icke-muslimer "måste stå upp mot alla former av förtryck, hat och använda alla våra förmågor för att försöka främja fred i världen."
Tre personer dödades i onsdagens attack när Khalid Masood körde sin bil in i fotgängare på Westminster Bridge, innan knivhuggning till döds obeväpnad PC Keith Palmer.
Masood sköts sedan ihjäl av polisen.
Världsledaren av miljontals Muslims har fördömt Westminster terror attack kallar det en "front till lära av Islam".