Men nyheterna hittills har varit större - och värre - än de någonsin kunnat föreställa sig.
Den amerikanska utredningen av korruption på de högsta nivåerna av världens mest populära spel kommer att få långtgående konsekvenser för hur spelet körs - och vem som driver det.
När nyheten om gripanden på toppen av Fifa började sjunka in, sade organisationen att den planerade att gå vidare som planerat med valet av sin president - vilket förväntades än en gång resultera i ett slags kröning för Sepp Blatter, den stora överlevande av världens idrottsadministration.
Men det finns en annan punkt på dagordningen också - en som fortfarande kan vara oroande delegater långt in i framtiden när Mr Blatter så småningom är borta och korruption historien har spelat ut sig själv.
Den palestinska delegationen vill att Fifa ska stänga av Israel från världsfotbollen.
Detta handlar naturligtvis inte bara om idrott.
Palestinierna följer en strategi som de kallar "internationalisering" - vilket innebär att föra in sina klagomål mot Israel på så många internationella arenor som möjligt. Och arenor kommer inte större än Fifa.
Frågan har tagits upp under tidigare år, men någon form av överenskommelse har utarbetats för att förhindra att frågan kommer till omröstning.
Den här gången säger chefen för Palestinska fotbollsförbundet (PFA), Jibril Rajoub, ingenting som kan få honom att ta bort begäran från Fifas formella dagordning. Det kommer inte att bli några överenskommelser - det kommer att bli en omröstning.
"Jag kommer att göra slut på lidandet och förödmjukelsen av de palestinska fotbollsspelarna", sade han till mig. "Det är vår rättighet."
Palestinierna anser att deras fall är starkt.
De klagar över hur polis- och armékontroller som begränsar den fria rörligheten runt det ockuperade palestinska territoriet på Västbanken hämmar spelarnas och tjänstemännens möjligheter att komma till spel.
Poängen illustreras i en videopresentation där en medelålders palestinsk som heter Farouq Assi fångas på kamerorna till en människorättsaktivist med ögonbindel, handbojor och i förvar vid en israelisk kontrollstation på Västbanken.
Det är ingen ovanlig händelse. Det är i presentationen eftersom Mr Assi är en fotbollsdomare och han var på väg att ta ansvar för en match i Jericho när han fängslades. Matchen övergavs.
Palestinska territoriet är uppdelat i två delar - Gaza och Västbanken. Israel kontrollerar all förflyttning till och från Västbanken genom en rad vägspärrar och upprätthåller stränga kontroller vid gränsövergången till Gaza genom vilka spelare och tjänstemän måste resa för att spela i West Bank-lag.
Israeliska idrottstjänstemän hävdar att de inte har någon kontroll över den politik som tillämpas vid dessa kontrollstationer av israeliska säkerhets- och underrättelsemyndigheter.
Peter Blatter gjorde en resa till Israel och de palestinska territorierna före Fifa-kongressen i det som verkar ha varit ett misslyckat försök att stoppa frågan från att skjutas till omröstning.
Inte långt efter det att han lämnat en incident vid en israelisk kontrollerad gränsövergång till Jordanien belyste han problemet.
Palestinska landslaget gick genom vägspärren på väg att spela en fixtur utomlands - det flyger genom Amman i Jordanien, en kort bilresa genom öknen snarare än från Israels huvudflygplats i Tel Aviv.
När de lämnade fanns det rapporter om att en av deras spelare, Sameh Maarabe, hade arresterats av israeliska tjänstemän.
Israel förklarade senare att Maarabe hade dömts förra året för att ha använt en utlandsresa för att smuggla pengar och meddelanden tillbaka till Västbanken för den militanta gruppen Hamas räkning.
För palestinierna är det en historia om trakasserierna av en fotbollsspelare - till israeler handlar det om att utfärda en varning om att ge igen till någon som har ett kriminellt förflutet och som råkar vara fotbollsspelare.
Det finns också andra klagomål - däribland närvaron på ockuperat palestinskt territorium av lag från judiska bosättningar som tillåts spela i den israeliska ligan.
Men Israel tycker att det har en positiv historia att berätta om idrott.
Det finns arabiska spelare i det israeliska landslaget och på de flesta toppflygklubbar - även om det finns ett undantag i att Beitar Jerusalem ofta har dragit till sig kritik för rasismen hos sina nationalistiska fans.
Tidigare engelska Premier League stjärna Yossi Benayun, som är utan tvekan Israels bästa någonsin spelare, berättade för mig: "Sport är en av de enda saker som för människor samman. Enligt min erfarenhet spelade jag med muslimer, kristna och alla andra religioner och det är samma sak i Israel - under min tid i landslaget spelade vi alltid med arabiska spelare och det var samma sak för dem.
"Jag hoppas att det inte kommer till det här beslutet, för det har inget med sport att göra."
För närvarande har de israeliska idrottsmyndigheterna lämnat sitt argument om detta, men inte alla i Israel har varit så diplomatiska.
Den välanslutna israeliska rättsliga kampanjgruppen Shurat HaDin har till exempel uppmärksammat Jibril Rajoubs medlemskap i centralkommittén för Fatah-rörelsen, som har en beväpnad flygel.
Man har funnit flera militaristiska citat från Rajoub som talar om den palestinska konflikten med Israel och har skrivit till Fifa och krävt att han ska utvisas i stället för Israel Football Association (IFA).
Deras brev är en illustration av rädslan inom fotbollen att ge efter för en utvisningsbegäran kommer att utlösa andra - tänk om Ukraina skulle kräva att Ryssland skjuts upp för annekteringen av Krim till exempel, när ryssarna är planerade att vara värd för nästa VM?
Inom idrottens värld finns det alltid en tendens att hålla svåra frågor i schack genom att hävda att idrott och politik inte blandas - men naturligtvis i extrema fall gör de det.
Både Apartheid-era Sydafrika och det nu övergivna Jugoslavien under ledning av Slobodan Milosevic uteslöts från internationella organ - de palestinska chanserna till framgång i Fifa kommer att vara beroende av att övertyga tillräckligt många delegater om att deras fall stämmer överens med dessa prejudikat.
Israel för närvarande verkar säker - delvis eftersom Sepp Blatter har klargjort att reglerna för upphävande kräver 75 procent majoritet, och delvis eftersom, enligt den israeliska experten på internationell rätt Alan Baker, detta är "ett välkänt klagomål i ett nytt forum".
De dramatiska arresteringarna som överskuggade början på Fifa-kongressen kan ha förskjutit strålkastarljuset från det palestinska fallet för tillfället, men detta är en fråga som inte kommer att försvinna.
Vad som än händer med förslaget under 2015 finns det inget som hindrar palestinierna från att sätta tillbaka det på fotbollens dagordning i framtiden.
Fotbollsbyråkraterna i världen förväntade sig förmodligen att göra globala rubriker när de samlades för Fifa-kongressen i Zürich.