Den brittiska regeringen gav Nordirland befogenhet att sänka skattenivån eftersom det sades att det hade ett särskilt ekonomiskt fall.
Detta föranledde samtal från skotska och walesiska flygplatser om liknande behandling.
Förenade kungarikets finansdepartement sade att det inte hade uteslutit att APD skulle flyttas till Skottland och Wales i framtiden.
I en rapport som offentliggjordes efter ett samråd om reformen av APD sade regeringen i Westminster att "fortsätta att undersöka genomförbarheten och de sannolika effekterna av delegeringen till Skottland och Wales".
Tidigare i år meddelade förbundskansler George Osborne att skatten skulle sänkas för direkta långdistansrutter från Nordirlands flygplatser, och han skulle överlåta kontrollen över skatten till den nordirländska församlingen.
Flytten kom som svar på farhågorna om att vissa rutter skulle kunna skrotas på grund av konkurrensen från irländska flygplatser där APD är mycket lägre.
I en kommentar till den brittiska regeringens beslut att inte bevilja den skotska regeringen liknande befogenheter för närvarande sade Jim O'Sullivan, verkställande direktör för Edinburgh Airport: "APD kostar redan Skottlands passagerare och påverkar turistintäkterna.
"Vi vet från diskussioner med våra flygbolagspartners att det är en viktig faktor i deras beslut att ansluta ytterligare rutter till Skottland.
"Vi vill uppmana Westminsterregeringen att se Skottland som det gör i Nordirland och förstå behovet av att både minska och decentralisera denna orättvisa och skadliga skatt."
Amanda McMillan, verkställande direktör för Glasgow Airport, sade: "På frågan om delegering av APD, Glasgow Airport har alltid stött detta förslag med tanke på den skotska regeringens mer progressiva inställning till luftfarten och dess större uppskattning av den roll branschen spelar för att stödja tillväxten i den skotska ekonomin."
Scottish Transport Minister, Keith Brown sade att fallet med att devolvera APD var "kompletterande" och hade backats upp av alla fyra av Skottlands största flygplatser, och rekommenderades av Calman Commission.
Han tillade: "Vi måste kunna hantera de konkurrens- och konnektivitetsnackdelar som Skottland står inför, och om APD nu blev decentraliserat skulle vi kunna tillhandahålla medel för att uppmuntra flygbolag att tillhandahålla nya direkta internationella förbindelser till Skottland, vilket gynnar vår flygindustri och våra passagerare och stöder tillväxten i den skotska ekonomin.
"Den brittiska regeringen måste lyssna på de många röster i Skottland som tydligt vill se en fullständig delegering av politiken för APD."
De skotska flygplatsoperatörerna har sagt att de är bestörta och besvikna över att kontrollen av passagerarskatten inte kommer att delegeras till Skottland.