Storbritannien och Irland är bland de länder som nu kan sälja nötkött till Kanada. Frankrike och Tyskland - EU:s största producenter - ingår också.
EU-kommissionen sade att det var ett välkommet steg, eftersom EU:s jordbrukare "går igenom en särskilt svår period".
Ett ryskt importförbud och en svagare kinesisk efterfrågan har drabbat Europas jordbruksexport.
Förra månaden tillkännagav EU ett stödpaket på 500 miljoner euro (365 miljoner pund, 567 miljoner euro) efter många gatuprotester från jordbrukarna.
Mjölksektorn har drabbats särskilt hårt, och många producenter säger att de nuvarande priserna knappt räcker till för att täcka sina kostnader.
Kommissionen, EU:s högsta tillsynsmyndighet, sade att Kanadas åtgärd var "en del av en växande tendens att erkänna de kraftfulla, omfattande och framgångsrika åtgärder som EU har infört för att utrota BSE".
Spridningen av bovin spongiform encefalopati (BSE) på 1990-talet - kopplad till en dödlig neurodegenerativ sjukdom hos människor - ledde till masslakt av nötkreatur och stora förluster för nötköttsuppfödare.
USA har också återupptagit importen av nötkött från EU under strikt övervakning, en process som inleddes med Irland i januari.
Kanada har undertecknat ett långtgående frihandelsavtal med EU, som nu genomgår ratificeringsprocessen.
Kanada återöppnar sin marknad för nötköttsexport från 19 EU-medlemsstater och upphäver ett förbud som infördes 1996 på grund av BSE-sjukan.