Den 22-årige hjälpte Southend vinna befordran av League 2 förra säsongen, poäng en sen equalizer i play-off finalen mot Wycombe.
Han tillbringade första halvan av den här säsongen tillbaka på lån på Shrimpers, poäng fem mål i 28 matcher.
Pigott återförenas med Luton boss Nathan Jones, som var hans under 21 chef på Addicks.
Hitta alla de senaste fotbollsöverföringarna på vår dedikerade sida.
Liga Två sida Luton Town har undertecknat Charlton Athletic strejker Joe Pigott på lån fram till slutet av säsongen.