Domaren i Brooklyn avslog ett förslag från det amerikanska justitiedepartementet att få Apple att låsa upp en telefon i ett drogfall.
I ett orelaterat fall vill FBI att Apple ska låsa upp iPhone Syed Rizwan Farook, som dödade 14 personer i San Bernardino, Kalifornien i december.
Men Apple har gjort motstånd och kallat det "farligt" och "oförutsett".
Domen i Brooklyn på måndagen centrerar på samma punkt som San Bernardino-fallet.
Domstolen i San Bernardino behöver inte bry sig om domen och uttalandena från New York-domaren.
Men Apple anser att beslutet i New York ger ytterligare styrka till sin position. En högt uppsatt talesman för Apple berättade för reportrar i ett konferenssamtal att han var övertygad om att San Bernardino-domaren noggrant skulle analysera New York-domen.
Mest lovande för Apple är anledningen till att domare Orenstein kastade ut New York-fallet.
Han sade att han inte alls var övertygad om att All Writs Act, en lag mer än två århundraden gammal, kunde användas för att tvinga Apple att följa. Samma lag används i San Bernardino.
All Writs Act är utformad för att ge brottsbekämpande befogenheter som inte specifikt behandlas i andra lagar - men att använda det kräver att uppfylla vissa stränga kriterier, för betungande för detaljer här.
Inget rättsligt prejudikat har fastställts här - men som domaren i San Bernardino anser att hennes styre, verkar farten vara med dator jätten.
Apple v FBI - en enkel engelsk guide
Apples chef slår tillbaka på FBI uppförande
Bill Gates efterlyser debatt om terrordata
Fjorton människor dödades och 22 skadades när revolvermannen Farok och hans fru Tashfeen Malik öppnade eld i Kalifornien i december.
Ett domstolsbeslut i Kalifornien krävde Apple hjälp kringgå säkerhetsprogram på Farook iPhone, som FBI sade innehåller viktig information.
Apples VD Tim Cook sade att begäran var "en overreach av den amerikanska regeringen" och riskerade att ge myndigheterna "makt att nå in i någons enhet för att fånga sina data". Förra veckan bad företaget en domstol att upphäva domen.
Samma lag från 1789 som användes av FBI i San Bernardinos begäran tillämpades i Brooklyn-fallet. Men domare James Orenstein sade att lagen inte var tillämplig i detta fall, tillägger att det inte var rätt att införa "på Apple skyldigheten att bistå regeringens utredning mot sin vilja".
Det amerikanska justitiedepartementet sa att det hade för avsikt att överklaga domen i Brooklyn.
En domare i USA har beslutat att Apple inte kan tvingas ge FBI tillgång till en låst iPhone i ett fall som ekar en pågående rättslig strid.