Croydon NHS chefer har beslutat att dra tillbaka NHS recept för formel foder för att bidra till att minska budgetunderskott.
Croydon Clinical Commissioning Group (CCG) sade att planen kunde rädda NHS tusentals pounds per år.
Mor Sarah Rose sade dock att det var "som att ta mjölk från ett barn" som hennes sju månader gamla son Sam var beroende av det.
Richmond Clinical Commissioning Group samråder om att dra tillbaka recept för recept och samrådet pågår till den 3 februari.
Det sade: "Det föreslås att GPs inte längre ger sojabaserade modersmjölksersättning mjölk, förtjockade modersmjölksersättningar eller formler för laktosintolerans på recept eftersom dessa nu är allmänt tillgängliga att köpa från lokala apotek och stormarknader till en liknande kostnad som standard modersmjölksersättning."
Människor som kan vara drabbade inkluderar de med komjölk proteinallergi och gastro-esofageal reflux sjukdom, varnade, men det beräknade detta skulle ge en besparing på £ 386 000 per år.
Standard formel mjölk kostar cirka £ 10 för en veckas försörjning och finns i stormarknader och kemister.
Miss Rose, en 33-årig skolassistent och mor-av-två, sade Sam hade ett recept för specialist formel som annars skulle kosta £40 på nätet för en burk som skulle mata honom i cirka två och en halv dag.
Hon sa: "Plåtarna är ungefär hälften så stora som den normala mjölkersättningen så det fungerar till åtta gånger priset."
"Vi har inte mycket pengar. Det är inte jag som är petig, men det är som att ta mjölk från ett barn, sa hon.
"Vi åkte till A&E två gånger innan han [Sam] fick diagnosen denna allergi i ungefär fyra månader. Han skrek av smärta hela tiden. Han böjde ryggen och började vägra mjölk. Nu är han en normal bebis. Jag vill aldrig gå tillbaka till det igen."
En petition online som uppmanar CCG att upphäva sitt beslut har lockat mer än 6.000 underskrifter och välgörenhetsorganisationer, såsom Allergi UK och Anafylaxis Campaign, uttryckte sin besvikelse och uppmanade till en omprövning.
Dr Tony Brzezicki, klinisk ordförande för NHS Croydon CCG sade: "Vi delar allmänhetens oro och vi kommer att göra vad vi kan för att minska påverkan på de mest utsatta i våra samhällen och se till att finansiering finns där för dem med störst kliniskt behov."
Han sade att recepten skulle upphöra under de kommande månaderna och att familjerna skulle underrättas om planerna innan ändringen trädde i kraft.
– Det är mycket svåra beslut men vi måste fokusera våra begränsade resurser där vi kan ha störst inverkan på människors hälsa och välbefinnande, tillade han.
Föräldrar till barn med mjölk- och sojaallergier kan drabbas av avgifter på upp till 121 pund per vecka för att mata sina barn i London, har man hävdat.