Den brittiska regeringen har aviserat åtgärder för att påskynda utvecklingen.
Naturresursminister Carl Sargeant har skrivit till råd som påminner dem om det tillfälliga förbudet mot fracking i Wales.
Han sade att fracking teknik var "oproven", säger walesiska ministrar föredrog att titta på förnybar energi.
Fracking är en process för att använda högtrycksvatten för att bryta upp stenar djupt under jord för att frigöra gas och rör den till ytan.
Det är en stor industri i Förenta staterna, men det finns oro för säkerhet, miljö och underjordiskt vatten.
Det har förekommit protester mot ansökningar om testborrning för gas i både Glamorgans och Wrexhams Vale och i England.
Energiminister Amber Rudd har betonat den brittiska regeringens stöd för fracking, och frustration över förseningar i dess utveckling.
Hon har sagt till råden i England att fatta beslut om ansökningar inom 16 veckor, för att förhindra att processen "drabbas ut i månader".
I sitt brev till de walesiska råden sade Sargeant att den nya vägledningen endast gällde England och att moratoriet i Wales fortfarande gällde.
"Den brittiska regeringens allmänna stöd för olje- och gastillämpningar strider mot den walesiska regeringens strategi att främja förnybara och koldioxidsnåla energiformer genom planeringssystemet och andra åtgärder," sade han.
"Vi ser fortfarande förnybar energi som en nyckelfaktor för att säkerställa att Wales uppnår en hållbar utveckling till förmån för kommande generationer.
"Lokala planeringsmyndigheter måste se till att planeringstillämpningar för projekt för förnybar energi fastställs inom lagstadgade tidsramar."
Planer på att delegera kontrollen över fracking bekräftades i drottningens tal i juni efter de konservativas allmänna valseger.
Fracking för skiffergas i Wales bör fortfarande vara emot trots planer på att påskynda sådana system i England, har den walesiska regeringen sagt.