Den före detta Doctor Who skådespelerskan, från Inverness, ansluter sig till amerikanska stjärnor Kevin Hart, Jack Black och Dwayne Johnson, alias The Rock, i den nya produktionen.
Hennes gjutning följer hennes säkra en större roll i Guardians of the Galaxy.
Med den sena Robin Williams, Jumanji innebär ett magiskt brädspel och betraktas av fans som en klassiker.
I inlägg på Instagram välkomnade Hart och Johnson Gillan, som studerade drama vid Eden Court i Inverness, till "Jumanjifamiljen".
Johnson skrev: " Jag är stolt över att kunna tillkännage en flicka som spelar den viktigaste rollen i vår film - den begåvade, vackra och nere i en skotsk kamp när som helst, Karen Gillan.
"Och ja, detta är flickan som är så dålig röv hon rakade sitt jävla huvud för Guardians of The Galaxy.
"Vi startar produktionen nästa månad på Hawaii och som många av er redan vet är detta inte en remake eller reboot, utan en fortsättning på den fantastiska Jumanji historia vi älskar."
Gillan rakade huvudet för att spela blåhudad rymd pirat Nebula i 2014's Guardians of the Galaxy.
Hon har återvänt till rollen för nästa års Guardians of the Galaxy, Volym två. Dess regissör James Gunn sa att Gillan kommer att ha mer skärmtid i uppföljaren.
Den skotska skådespelerskan Karen Gillan har spelats in i en ny film som har beskrivits som en uppföljning till 90-talets biljettkontor hit, Jumanji.