Barts Health NHS Trust placerades i särskilda åtgärder i mars, men har genomgått ytterligare inspektioner av kommissionen för vårdkvalitet.
Det sades att "för lite uppmärksamhet" ägnades åt säkerhet och pekade på brister i ledarskapet i organisationen.
Tilliten sa att den var "mycket ledsen" och att den stod inför en "stor utmaning".
Barts Health NHS Trust ansvarar för vården av cirka 2,5 miljoner människor.
Det sattes in i speciella åtgärder när en kultur av mobbning och låg moral upptäcktes bland personalen på ett av sjukhusen den driver, Whipps Cross i Leytonstone, östra London.
Nya farhågor har nu väckts vid Royal London Hospital och Newham University Hospital.
CQC sade patientsäkerhet inte ges tillräcklig prioritet, personal avskräcktes från att ta upp sina problem mitt i en kultur av skuld.
Det tillade att bemanningen var betydligt lägre än de rekommenderade nivåerna och sjukhusen var så fulla att patienterna inte alltid sköttes på lämpliga avdelningar.
Vissa fick förseningar på mer än 18 veckor från remiss till behandling och vissa patienter fick sin operation inställd vid flera tillfällen på grund av brist på sängar.
Professor Sir Mike Richards, chefsinspektör på sjukhus, sade: " Det är tydligt att de ledarskapsfrågor vi fann på Whipps Cross kopierades på de andra sjukhusen.
"Det finns fortfarande en brist på engagemang med personalen, låg moral, hög stressnivå, även förvirring bland arbetskraften om vem som är ansvarig.
"I hela förtroendet ägnas för lite uppmärksamhet åt säkerhet, med misslyckanden i rapportering och granskning av tillbud, och i att hantera eller lära sig av klagomål.
"Om förtroendet ska vända måste det först fokusera på kulturen och på ledarskapsfrågor så att det effektivt kan hantera alla de individuella problem som vi har identifierat vid denna inspektion."
CQC har identifierat 65 områden där förtroendet måste förbättras.
Steve Ryan, chefsläkare vid Barts Health NHS Trust, sade: " Vi är mycket ledsna över de brister som CQC har identifierat i några av våra tjänster vid Newham och de kungliga sjukhusen i London.
"Vi vet att vi har en stor utmaning framför oss men vi är fast beslutna att ta itu med den utmaningen.
– Vi gör redan snabba och dramatiska förbättringar inom nyckelområden. Vi välkomnar den riktade hjälp som systemet med särskilda åtgärder ger för att stödja vår förbättringsresa.  Alla våra sjukhus kommer att vara en del av förtroendets förbättringsplan som svar på särskilda åtgärder, vilket säkerställer en konsekvent strategi för tillhandahållande och leverans av högkvalitativ vård.  Vi kommer att arbeta med vart och ett av våra sjukhus med samma grad av brådska och engagemang."
Tjänster som drivs av det största NHS-förtroendet, inklusive ytterligare två av dess sjukhus, har märkts "otillräckligt" av inspektörer.