I studien Public Health Wales studeras negativa erfarenheter i barndomen (ACEs), som omfattar föräldrar som separerar.
Barn med fyra eller fler ACE, omkring 14%, löper tre gånger större risk att få lung - eller hjärtsjukdomar senare i livet.
En äldre hälsogestalt sade att man i stället för att "låta på brutna vuxna" behövde fokusera på att "bygga starkare barn".
Resultaten offentliggörs för att sammanfalla med en stor internationell folkhälsokonferens, som hålls av PHW i Cardiff.
Det är den sista av tre PHW studier tittar på de första 1000 dagarna i livet. Mer än 2.000 vuxna i Wales intervjuades.
Vikten av att ge barnen den bästa starten i livet har länge uppskattats.
Men denna forskning tittar på den långsiktiga effekten av dåliga erfarenheter under dessa avgörande tidiga år och hur det kan innebära mer kronisk sjukdom och mer tryck på frontline tjänster längre ner i linjen.
De som har haft fyra eller fler ACE:er är också:
Prof Mark Bellis, chef för policy och forskning på Public Health Wales sade: "De flesta av oss har den udda chocken i barndomen och efter det slappnar vi av och vi är tröstade av föräldrar och våra kroppar utvecklas på den lägre, mer avslappnad nivå.
"Men om du får konstant exponering för negativa barndomsupplevelser, din kropp utvecklas i ett högre tillstånd av spänning, det är alltid ser ut för fler hot.
"Det betyder att när din kropp utvecklas, är den van vid att vara redo att skadas eller skadas på något sätt och den slits ut snabbare.
"Du är också mer sjuk i lugn och ro, du kan utveckla sämre metall hälsa, du är mer benägna att använda alkohol och droger - och de ökar dina risker för dålig hälsa senare i livet. Allt som bidrar till att du utvecklar dålig hälsa, tidigare."
Men ett barn kan uppleva negativa händelser även inifrån livmodern.
NSPCC barnmorska Nikki Rhys-Jones sade: "Under den andra trimestern [perioden från 13 till 27 veckor] av en kvinnas graviditet, barnet kan höra - så barnet kommer att vara medveten om ljuden runt henne.
"Så barnet kan börja relatera och ansluta till föräldrar, men saker som misshandel i hemmet, våld i hemmet, skrika - ett barn kommer att uppleva att och dessa saker kommer att orsaka stress för ett barn och påverka dess utveckling."
Ny forskning tyder på att effekterna också kan överföras från en generation till nästa.
Genomic expert Dr Tom Connor, konsult för folkhälsa Wales och universitetslektor vid Cardiff University, sade: " Som individer, vi är nästan en symfoni av gener, avfyrar vid olika tidpunkter.
"Epigenetik [som ser på förändringar i gener] kontrollerar faktiskt uttryck av gener - och så saker som rökning och drickande kan faktiskt påverka uttrycket av gener, som kan överföras till våra barn.
"Det finns växande bevis för att de livsstilsval vi gör själva påverkar våra barn. Det är en omedelbar effekt när de föds och potentiellt om vi gör saker, till exempel rökning som kan skada våra barns DNA, som kan vara en långsiktig effekt under hela deras livstid."
Men detta är inte bara en utmaning för NHS.
Barn som har haft fyra eller fler negativa händelser löper också 15 gånger större risk att bli våldsförövare och 14 gånger större risk att bli offer.
Om alla krymper in i sitt huvudansvar, sprickorna blir större och fler och fler människor faller ner i sprickorna
Alun Michael, polis- och brottskommissionär i södra Wales sade att polisen blev mer medveten om konsekvenserna av incidenter i hemmet för barn i bakgrunden - och det kan bara förbättras med alla myndigheter som arbetar bättre tillsammans.
"Det har tenderat att vara ett försök att ta itu med dessa saker genom att göra remisser - bitar av papper som går från en organisation till en annan. Du är aldrig riktigt säker på vart de går, sa han.
Men ett samordnat tillvägagångssätt är inte alltid lätt att uppnå, menar han, i en tid då de offentliga utgifterna pressas.
"Om alla krymper in i sitt huvudansvar, sprickorna blir större och fler och fler människor faller ner sprickorna och konsekvenserna är mer komplexa och farliga längre ner i linjen," sade Mr Michael.
"Det har funnits en allmän känsla inom Wales vi måste krympa tillsammans och inte krympa isär. Det är viktigare att vi inte tillåter dessa luckor, att vi inte låter människor falla ner i sprickorna; vi arbetar tillsammans för en gemensam strategi."
Den walesiska regeringen sade att bevisen på ACE:s negativa effekter var "överväldigande" och att det var "att arbeta obevekligt" för att förhindra och minska den långsiktiga påverkan på barn som har upplevt dem.
En talesman pekade på programmen Flying Start, Families First och Supporting People, samt investera direkt i programmen för barns hälsa och välbefinnande.
För Prof Bellis är det avgörande för framtiden att få det rätt.
"De långsiktiga kostnaderna för att lämna dessa saker obehandlade är enorma", sade han. "Det vi måste fokusera på är att istället för att laga trasiga vuxna måste vi bygga starkare barn."
Barn som utsätts för övergrepp, våld i hemmet eller andra påfrestningar är mycket mer benägna att utveckla långsiktiga hälsoproblem, säger ny forskning.