Samuel Armstrong, 23 år, av Copt Hill, Danbury, Essex, anklagas för två våldtäkter och ett sexuellt övergrepp.
Han har blivit avstängd från sin tjänst som stabschef till South Thanet's Tory MP Craig Mackinlay.
Åtalet följer på en påstådd händelse i parlamentet i oktober.
Mr Armstrong frigavs för att inställa sig inför Southwark Crown Court den 28 april.
Han beordrades att inte gå in i Westminsters palats och inte kontakta det påstådda offret.
En medhjälpare till en konservativ riksdagsledamot i Kent har framträtt inför domare i Westminster som anklagats för våldtäkt efter en påstådd attack i parlamentets hus.