Celtic skeppare Scott Brown har lett Gordon Strachans landslag nyligen men fit-agen Fletcher är tillbaka spelar på West Bromwich Albion.
"Scott har blomstrat under den när Darren har skadats," Wilson berättade BBC Radio Skottland.
"Men Darren är mer landets ledare och har varit det i många år."
Wilson, som vann sin enda internationella cap mot Nordirland 2011, tillade: "Vi har tur att vi har två inspirerande spelare i mitten av parken som kan ta den rollen.
"Det är förmodligen den största ära du kan få i fotboll, så jag tycker att det spelar en stor roll, särskilt för de inblandade spelarna - Scott och Darren.
"Det kommer att vara av stor betydelse för dem båda, men jag tror inte att någon av dem kommer att bli alltför besviken eller låta det påverka deras spel om de inte väljs som kapten."
Onsdagens vänliga mot Michael O'Neills sida vid Hampden kommer före Skottlands nästa Euro 2016 kval mot Gibraltar på söndag.
"Detta spel har valts väl av båda sidor," sade Wilson, som nu spelar för Dumbarton efter trollformler på Dundee United och Celtic.
"Mycket ofta kan man ha dessa internationella vänner som typ av peter ut i ingenting - en typ av tråkig affär.
"Men med två konkurrerande lag och spelare som har spelat mot varandra på högsta nivå i England och Skottland kommer mot varandra, det ger det att extra lite nål som du behöver."
Darren Fletchers tidigare erfarenhet som leder Skottland skulle kunna vinna honom som kapten mot Nordirland, säger den tidigare internationella Mark Wilson.