Pengarna kommer att användas för att skapa 35 nya tjänster över hela Nordirland i ett försök att snabba på diagnosen och skära av väntelistorna.
Sedan 2010 har antalet remisser för autismbedömningar nästan fördubblats på fem år från 1.500 till 2.800.
Mer än 2.800 barn väntar för närvarande på att bli sedda. Hälsominister Simon Hamilton sa att det var "oacceptabelt".
Han berättade för Radio Ulsters Sunday News att de extra pengarna borde hjälpa till att matcha takten med efterfrågan.
"Konsekvensen av de extra pengarna bör kännas mycket snabbt", sade Hamilton.
"Vi kommer att skapa ungefär sju inlägg i var och en av de fem hälsotruster över hela Nordirland för att komplettera de hårt arbetande team som redan finns där gör ett bra jobb och ge dem mycket nödvändiga resurser för att kunna utföra diagnoserna."
Hamilton sade att väntelistorna var ett resultat av "tyst tryck" på systemet.
Autismtjänster i Nordirland kommer att få 2 miljoner pund extra per år.