Nyheten var väntad efter att Cobblers nya ägare Kelvin Thomas betalade HM Revenue & Customs obetald skatt den skulle betalas när han köpte klubben förra veckan.
"Detta är ett mycket positivt steg när vi går framåt", säger Thomas.
"Vi kan nu fokusera på vår översyn av klubben och utveckla framtidens planer."
På fredag ajournerades Cobblers administrativa framställning från Northampton Borough Council till den 11 december för att ett avtal skulle ingås mellan Thomas och rådet.
Thomas köpte klubben av David Cardoza på torsdag och blev verkställande ordförande för Cobblers.
Thomas och rådet har ett samförståndsavtal på plats över ett 10.25 miljoner pund lån till klubben för ombyggnadsarbete på Sixfields Stadium, som skulle se skulden utplånas, med rådet förvärva mark nära Sixfields för utveckling i gengäld.
Trots osäkerheten utanför planen, Cobblers är för närvarande i League Två automatiska befordran platser.
Upplösningsansökan mot League Two Side Northampton Town har dragits tillbaka efter en domstolsförhandling på måndag.