ਸੈਨ ਜੁਆਨ ਕੈਥੋਲਿਕ ਚਰਚ ਦੇ ਨਿਊ ਵਰਲਡ ਦੇ ਪ੍ਰਚਾਰ ਦਾ ਕੇਂਦਰ ਵੀ ਬਣ ਗਿਆ; ਇਸ ਯਤਨ ਵਿੱਚ ਸਹਾਇਤਾ ਕਰਨ ਲਈ ਪੂਰੇ ਟਾਪੂ ਵਿੱਚ ਬਹੁਤ ਸਾਰੇ ਚਰਚਾਂ, ਕਾਨਵੈਂਟਾਂ ਅਤੇ ਮੱਠਾਂ ਦੀ ਸਥਾਪਨਾ ਕੀਤੀ ਗਈ ਸੀ।
ਕੈਥੋਲਿਕ ਧਰਮ ਅਜੇ ਪੋਰਟੋ ਰੀਕੋ ਤੱਕ ਨਹੀਂ ਪਹੁੰਚਿਆ ਹੈ।