ਯੋਹਾਨਾਨ ਬੇਨ ਜ਼ੱਕਾਈ ਸਿਨੇਗੌਗ ਅਸਲ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਵਿੱਚ ਚਾਰ ਪ੍ਰਾਰਥਨਾ ਸਥਾਨ ਹਨ; ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਡਾ ਕਮਰਾ ਕੰਪਲੈਕਸ ਨੂੰ ਇਸਦਾ ਨਾਮ ਦਿੰਦਾ ਹੈ।
ਉਸ ਪ੍ਰਾਰਥਨਾ ਸਥਾਨ ਵਿੱਚ ਸਿਰਫ਼ ਇੱਕ ਛੋਟਾ ਜਿਹਾ ਕਮਰਾ ਹੈ, ਅਤੇ ਇਹ ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ ਪ੍ਰਾਰਥਨਾ ਕਰਨ ਵਾਲੇ ਸ਼ਰਧਾਲੂਆਂ ਨਾਲ ਭਰਿਆ ਹੁੰਦਾ ਹੈ।