Агенциите подлежат и на оценка от Сметната палата във връзка с годишната процедура по освобождаване от отговорност във връзка с изпълнението на бюджета, резултатите от която се обсъждат в комисията по бюджетен контрол.
Agentury jsou hodnoceny také Účetním dvorem v souvislosti s každoročním postupem udělování absolutoria a výsledky jsou projednávány ve Výboru pro rozpočtovou kontrolu.