Die Agentur, eine Einrichtung der Gemeinschaft mit Rechtspersönlichkeit,besitzt einen Verwaltungsrat und arbeitet unter der Leitung eines Direktors,der sie verwaltet und vertritt. Außerdem verfügt sie über einen Beirat, dersich aus Vertretern der regionalen Beratungsgremien zusammensetzt, demalle am Management der Fischereien interessierten Parteien angehören.
Organisme de la Communauté doté de la personnalité juridique, l’Agence dispose d’un conseil d’administration et fonctionne sous la responsabilité d’un directeur exécutif pour la gérer et la représenter.Elle comprend également un conseil consultatif composé de représentantsdes conseils consultatifs régionaux qui réunissent l’ensemble des partiesintéressées à la gestion des pêches.