Även om programvaran meddelar att signaturen är giltig när du tar emot ett signerat dokument, kan du inte vara helt säker på att dokumentet är detsamma som det som avsändaren har skickat. Att signera dokument med programvarucertifikat är inte en helt igenom säker metod. Det finns ett flertal sätt att kringgå säkerhetsfunktionerna på. Exempel:
如果您收到一个签名文档，并且软件报告该签名为有效签名，这并不能保证文档就是该发件人所发送的文档。使用软件证书对文档进行签名并不是绝对安全的方法。有许多方法可以规避掉安全功能的保护。