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  「GNU/Linux」,在口語時,經常省略掉當中的斜線「/」,理查德·斯托曼建議把斜線(slash)或加(plus)念出來,因為Linux核心並不屬於GNU計劃軟體。

  GNU計劃始於1984年,它的最終的目標是完成一套完全自由的作業系統。到1991年,Linux核心的第一個版本公開發行時,GNU計劃已經完成了除作業系統核心之外的大部分軟體,其中包括了Shell程式(Bash),C語言程式庫(Glibc)以及一個C語言編譯器(Gcc)等等。林納斯·託瓦茲和其他早期的Linux開發人員使用了這些軟體,而完成了Linux作業系統。正是由於Linux使用了很多的GNU程式,理查德·斯托曼認為將該作業系統稱為「GNU/Linux」比較恰當。  Linux核心是在GNU通用公共許可證下發行的。它並不是GNU計劃的一部分。一些人拒絕使用「GNU/Linux」作為作業系統名稱的人認為Linux朗朗上口,短而好記,而且斯托曼直到1990年代中期Linux開始流行後才要求更名。  有部分Linux發行版,例如Debian,採用了「GNU/Linux」的稱呼。但大多數Linux發行版製作團隊依然將作業系統稱為Linux。有些人認為「作業系統」一詞指的只是系統的核心,而其他程式都只能算是應用軟體,這麼一來,該作業系統的核心應叫Linux。  在這兩個主要名稱之外,也有其他名稱的提議。1992年,Yggdrasil Linux主張命名為Linux/GNU/X,因為除了GNU計劃軟體之外,Linux還採用了X視窗。

  1992年,Yggdrasil Linux提出「GNU/Linux/X」這個名稱。  1992年,在Usenet及郵件列表討論中,首次有人使用「GNU/Linux」這個名稱。「GNU+Linux」這個名稱,則可以追溯到1993年 。  1994年,Debian專案開始使用「GNU/Linux」來稱呼它們自己。

  理查德·斯托曼認為:  並且他強調,Linux的成功,是建立在GNU計劃的基礎上:  他一再強調GNU計劃的貢獻,認為不應該過度強調Linux:  理查德·斯托曼認為:「GNU/Linux這個名字,承認我們的理想,在建立我們社群上所扮演的角色,而且幫助大眾認知到這些理想的實際上的重要性。」,這與Linux核心開發者,關心「技術優勢」超過「自由」,可以形成對比。

  埃裡克·雷蒙曾說:  林納斯·託瓦茲個人傾向於使用Linux這個名稱,但並不強烈反對GNU/Linux這個名字。他在訪談中表示: 在接受記錄片《作業系統革命》(Revolution OS)訪談時,林納斯·託瓦茲表達對GNU/Linux這個名稱的想法,他表示: 許多使用者支援使用Linux這個名稱來稱呼這整個作業系統,因為這可以概括作業系中其他非核心元件、也非GNU的軟體,例如Apache HTTP Server、KDE與X Window系統。X Window系統的創始者之一,吉姆·傑提斯(Jim Gettys)認為:「」
GNU/Linux命名爭議,是在自由及開放原始碼軟體社群成員內的,關於是應該把使用GNU軟體與Linux核心組合之作業系統稱為「GNU/Linux」還是「Linux」的爭議。