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  早期的植物以真蕨、種子蕨為主。晚期有較大變化,鱗木類、蘆木類、柯達樹等趨於衰微、滅絕,代之以較耐寒耐旱的種子蕨和裸子植物,尤其是松柏類大為增加。蘇鐵類和銀杏類的早期種類在這時期出現。植物已經出現了地理區系的分化。  另外在彼爾姆-昆古爾地區化石群發現了一類全新的植物化石,在二疊紀結束時滅絕,該化石種類具有類似花朵型態和種子帶翅的特徵,但幼苗形態更類似於針葉樹。

  

  軟骨魚類繼續繁盛;腕足類繼續繁盛,長身貝類佔優勢;<unk>類、海百合和軟體動物也是重要部分,菊石類有明顯分異;四射珊瑚和橫板珊瑚繁盛;苔蘚蟲逐漸衰退;三葉蟲趨於滅絕。

  二疊紀-三疊紀滅絕事件是有史以來最大的滅絕事件,其導致當中96%的海洋生物消失,其詳細原因目前尚不明確。
二疊紀(英語:Permian,符號P)是古生代的最後一個地質時代,時間處於石炭紀、三疊紀之間(2.99-2.51億年前)。定義二疊紀的岩石層是比較分明的,但開始、結束的精確年代卻有爭議。其不精確度可達數百萬年。以往,二疊紀為二分,目前二疊紀使用三分法:烏拉爾世(Cisuralian)、瓜德魯普世(Guadalupian)、樂平世(Lopingian)。Permian源自俄羅斯的彼爾姆州。中文譯為二疊紀一說是在德國的同年代地層的上層是鎂質灰巖,下層是紅色砂岩之故。