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  抗原可分為二種:1.免疫性2.抗原性,其中免疫性指能誘導體液性與細胞性媒介免疫反應發生之抗原(免疫原)。

  不同免疫原的免疫性強弱不同。致病原通常為蛋白質或多糖類,以蛋白質為最強的免疫原,其次為多糖類。脂質與核酸並不能成為免疫原,除非與蛋白質結合才能活化免疫反應。就蛋白質而言,經過特定的抗原呈現細胞處理後,形成小分子的肽(peptide)片段,再與細胞表面之主要組織相容性複合物(MHC)結合,才能被辨識而活化免疫系統。

  大分子較容易被吞噬和處理,不可溶的巨大分子通常比可溶性的小分子較具有免疫性。無法被分解或被主要組織相容性複合體(MHC)呈現的大分子,則歸類為劣質免疫原。抗原呈現細胞內的分解酵素僅能對L-氨基酸作用,由D-氨基酸構成的聚合物並無法被處理分解,而這些聚合物即劣質免疫原。D-氨基酸通常存在於抗生素和細菌細胞壁中,在動植物中也有發現。  就是疫苗內的一種成分,它可以加強疫苗內抗原所引發的免疫反應,達到比較好的效果。

  利用佐劑的新增,可以降低疫苗內抗原的需要量。 佐劑本身可以有反應原性,沒有免疫原性。 應用時可與抗原同時或預先注射於機體。 佐劑之功能: 1.延長抗原持續性 2.加強共同刺激訊號 3.增加區域性發炎反應 4.刺激非專一性淋巴球增生的功能 佐劑的副作用: 佐劑常混有微量的其他物質,這些物質進入有機體後也可引起抗體的產生,影響抗體的特異性。注射完全佐劑可引起區域性炎症反應,使區域性組織壞死。 用佐劑的目的是為了提高抗原對有機體的免疫原性,從而提高抗體的效價。 顆粒性抗原(細菌、細胞 )具有較強的免疫原性,不使用佐劑即可取得較好的免疫效果。 可溶性大分子量的蛋白質免疫原、人工抗原,初次免疫時必須使用佐劑才能取得較好的免疫效果。 個體的基因型會影響個體免疫反應的型別和強度。 處理抗原並呈現給T 細胞的功能。 在個體對免疫原所產生的免疫反應中扮演重要的角色。 免疫原之劑量與途徑

  B 細胞抗原決定位的作用能力,取決於表現在B 細胞表面的抗體及其抗原結合位(互補決定區 )。 抗原-抗體的結合是以非共價鍵結的方式結合。 在非常短的距離才具效用。 當形成鍵結時,抗體的結合點與抗原決定位必須形成互補的形狀來讓兩者的作用區相互接近。

  大區域的蛋白質抗原是與抗體上的抗原結合位進行嵌合。 小型的肽(peptide)則會摺疊成緊密不佔空間的結構,能納入抗原結合位的溝槽內。 原始蛋白質 (native protein) 產生體液性免疫反應。 原始蛋白質和變性蛋白質能誘導再次細胞媒介免疫反應。 變性的蛋白質抗原能誘發T細胞媒介的免疫反應主要原因為: 蛋白質表面的凸出部位最可能被辨認為抗原決定位。 由親水性氨基酸所組成。 隱藏在蛋白質內側的氨基酸序列通常是厭水性氨基酸,除非是蛋白質變性,否則這些內側氨基酸是無法作為抗原決定位的功能。 當抗原變性時(denature),改變抗原決定位的結構型態,因而導致抗體無法結合至變性蛋白質。 原始蛋白質和變性蛋白質均能誘導再次細胞媒介免疫反應。
抗原(antigen,縮寫Ag)為任何可誘發免疫反應的物質,不只是從病原體那裡取得,一般來說體內發現分子夠大的有機物就有可能作為一個適合的抗原,這樣也就會導致例如過敏等問題。外來分子可經過B細胞上免疫球蛋白的辨識或經抗原呈現細胞的處理並與主要組織相容性複合體結合成複合物再活化T細胞,引發連續的免疫反應。