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  臺灣的原生種,分佈於由海平面至海拔三千米以下的地區。在日本則為外來種,分佈於伊豆大島(伊豆群島),大根島(靜岡縣南伊豆町),和歌山縣北部。從1940年起陸陸續續從動物園等觀光設施逃脫,成為日本的外來種。

  臺灣獼猴的前肢比後肢短,各肢具有五趾。頭圓,臉扁,額裸出,顏面呈淡紫色,或深或淡,隨個體的不同而有差異,所以臺灣原住民將其分為白臉與紅臉,臉頰上並長有粗雜的長鬚,尾粗狀多毛,全身被厚而軟的毛,冬季呈棕灰色,夏季呈棕綠色,四肢較黑故有黑肢猿之稱。股間有顯著的紅棕色的大斑。一般而言,雌猴體型較雄猴小,顏色也較淡。

  種小名cyclopis來自希臘神話的獨眼巨人。 獨眼巨人英文為「Cyclops」(希臘文:;複數:),語意是圓眼。

  臺灣獼猴屬於晝行性活動且群體生活的動物。分佈地區遍及3000米以下之低至高海拔,如高雄壽山,彰化縣二水鄉設有二水臺灣獼猴生態教育館(原名二水彌猴自然保護區)。另外,在新北福山、恆春墾丁有臺灣獼猴做為過夜地域。  根據記錄,臺灣獼猴食用的植物包含85科300種,以果實為主,其他還有昆蟲、甲殼類和軟體動物等。對於食用植物的部位,會因季節月份和乾溼季變化而有所不同,以十至五十隻一群。  臺灣獼猴雖然是保育類動物,原有的天敵為臺灣雲豹及大型猛禽,但臺灣雲豹早已絕跡大型猛禽也漸稀少,加上臺灣獼猴適應力強,在立法保育之下族群數量大幅回升,在高雄、屏東等地區的臺灣獼猴,因棲息地與人類接壤而不會怕人,經常發生搶奪遊客食物、入侵民宅房舍取食以及破壞農作物等事件,造成居民及遊客困擾。因受歸類為保育類動物,目前尚未有統一且有效的解決方針。  人類於其居住範圍應避免將食物外露,即可避免人猴衝突。唯露食被取事件層出不窮,積怨已久,以至使用毒餌,登山杖,彈弓、捕獸夾等凶器等事件發生,致獼猴死傷。目前於高雄柴山仍可見到彈弓與BB槍等制猴器具以及使用民眾。2015年11月,僅兩週間於高雄地區便有十來只死傷之獼猴,皆明顯外傷。  2014年行政院農委會依據「野生動物保育法」第21條的緊急條款內容,認為特定狀況下獵殺獼猴具法律正當性;然而,此條款之適用,僅限於農民在生命財產受到緊急威脅之情況下,主張「正當防衛」獵殺野生動物,以保障生命、財產作物安全。但衡量法律保護利益與野生動物保育,其限定以「人道方式」為之,在最短時間內給予最小痛苦。。

  已公告除名正式離開保育類名錄。

  美國食品藥品監督管理局(Food and Drug Administration;FDA)於2013年8月發表臺灣獼猴具有「猴泡沫病毒」(Simian Foamy Virus, SFVmcy-2),是反轉錄病毒(retrovirus)的一種 。  臺灣獼猴亦有第四類法定傳染病「皰疹B病毒」(Herpes B virus,正式學名,猴皰疹病毒), 玉山塔塔加首起猴群主動攻擊, 抓咬傷10遊客。皰疹B病毒感染症是一種會造成中樞神經系統疾病的人畜共通傳染病,主要是經由罹患猴皰疹的猿猴抓咬傷而感染,人若被感染的猿猴抓咬傷,通常在3天至3星期的潛伏期後,會出現急性發燒、頭痛、水泡病灶、淋巴性腦脊髓液內細胞增多和不同型態的神經症狀等。人類罕見皰疹B病毒感染個案,目前全球約僅有40名報告病例。皰疹B病毒一旦感染髮病,死亡率非常高,病患如未接受妥適醫療,死亡率超過70%,存活者常會伴隨有嚴重的後遺症。
臺灣獼猴,又稱黑肢猴,臺灣特有種,珍稀野生動物,屬舊世界猴。也是除了智人外臺灣唯一的靈長類動物,和日本獼猴、普通獼猴有血緣關係。