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  經濟學中一個簡單的收入迴圈流程圖,來到生態經濟學就被取代為一個較複雜的流程圖,指出陽光作為能源輸入到生態系統,維持著自然界的投入和環境所提供的「服務」,並最終成為生產單位。被消耗之後,自然界的投入離開經濟體系,成為汙染和廢棄物。當資源被消耗掉,或者遭受到汙染無法使用,環境提供服務和資源的潛力和功能便會耗盡。而「洗滌槽功能」(英語:Sink function)就是指環境把廢物和汙染吸引並無害化的能力:當廢物的輸出超過洗滌槽功能的上限,長遠的損害便會發生。一些具永續性的汙染物,例如某些有機汙染物和核廢料,環境只能極之緩慢地甚至完全不能吸收;生態經濟學家強調把「累積性汙染物」儘可能減到最少。汙染物會影響人類和氣候的健康。  主流環境經濟學同意自然資本和生態系統服務具有經濟價值,但生態經濟學特別強調它們的重要性。生態經濟學家可能會在衡量成本的金錢價值之前,首先評估要如何去維持環境的穩定。
生態經濟學是一個跨學科的學術研究領域,旨在瞭解在不同時間和空間下,人類經濟與自然生態間的共同演化和互相依存的關係。有別於環境經濟學,環境經濟學是對環境的主流經濟分析,生態經濟學則把經濟視作為生態系統下的子系統,並強調儲存天然資本。一個由德國經濟學家所作的調查發現,生態經濟學和環境經濟學是不同的經濟學派,因為生態經濟學家強調強而有力的可持續性,並且否定人造資本可以取代天然資本的看法。