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  傑克·卡弗(Jack Carver)退役後來到了南太平洋地區進行租船業務,他被瓦萊麗·康斯坦丁(Valerie Constantine)僱傭,偷偷前往一個在密克羅尼西亞地區未知小島。在瓦萊麗帶著她自己的噴氣式滑水車離開後,傑克的船被一個僱傭兵發射火箭彈炸得粉碎。傑克設法逃走但擱淺在離家數千英里外的地方。他的朋友迷失在叢林深處,他現在必須自己找到回家的道路。僱傭軍的指揮官,上校理查德·克洛(Richard Crowe)命令他的部下尋找傑克,因為沒找到他的屍體。  在一個自稱哈蘭·多伊爾(Harlan Doyle)的神祕男子的幫助下,傑克在群島的某處與僱傭軍戰鬥的同時開始尋找瓦萊麗,搜尋擱淺的日本航空母艦,破壞僱傭軍營地的衛星通訊和彈藥倉庫。  通過接觸Trigens(一種轉基因靈長類動物)和多伊爾提供的資訊,傑克很快發現,島內的一個部分涉及轉基因實驗。隨著遊戲進行,明顯的證據表明Trigens變成了難以處理的大問題,它開始衝破安全防線並殺害警衛和工人。此外,該實驗不僅限於非人類的靈長類動物,也涉及到人類的變異,為了建立終極戰士。  當傑克找到瓦萊麗時,她正被直升飛機送往另一個地區,傑克試圖阻止直升機,瓦萊麗趁機逃跑。游到岸邊後,她表示她是中央情報局的特工,正在調查克里格爾(Krieger)的業務,瓦萊麗然後建議他們二人分開,以便更好地探索群島。  經過進一步的探索,傑克必須再次搜尋和營救瓦萊麗。這很難因為有更多的Trigens逃脫了,它們中的一些擁有強大的武器。Trigens已經開始反抗在島上的僱傭兵,造成了混亂,克里格爾不得不叫來他的個人精銳特種部隊來控制局勢。傑克找到瓦萊麗後不久,殺死了僱傭軍的指揮官理查德·克洛。克洛的資訊表明克里格爾在島嶼上擁有戰術核武器。瓦萊麗進一步透露,多伊爾是中央情報局特工,以實驗室技術員的身份滲透到克里格爾研究室。  美國國防部進行了分析之後,傑克和瓦萊麗竊取了克里格爾用來銷燬轉基因實驗罪行的戰術核彈。傑克對使用核武器表示不安,不過瓦萊麗向他保證:“這種戰術核彈,剛好能夠摧毀工廠和基地。在爆炸之前,我們將沿逆風方向離開山脈”。在進入工廠之前,多伊爾警告說爆炸時誘導有機體突變的物質可能汙染他們,建議他們在設定核彈之前使用解毒藥,在工廠裡, 他指導他們從一個有生物危害標誌的紅色盒子中取出免疫血清並注射。他們這樣做了。設定核彈之後瓦萊麗和傑克離開工廠,核彈爆炸,他們失去了意識。  在傑克和瓦萊麗還無意識時,克里格爾劫持了他們。傑克醒來發現與克里格爾和瓦萊麗在一架直升機上, 傑克被一個精英守衛拋下直升機,克里格爾挖苦道:“適者生存,祝你好運!”在地面上,傑克發現一個被丟擲的步槍,只有10發子彈。他需要第三次救出瓦萊麗,他的需要像Trigens那樣穿越安全防線。在到達一個僱傭兵武器庫時,傑克發現他的手臂變綠了,多伊爾表示解毒劑應該能夠處理它,但是爆炸可能使空氣中充滿了突變物質,博士克里格爾開發的血清應該有辦法處理。傑克決定直接去找克里格爾進行治療。  由於僱傭軍正與Trigen戰鬥,傑克從火山斜坡攀登到總部沒有多大麻煩,克里格爾顯然發現了一種用來阻止火山爆發並利用火山熔岩的流動進行發電的方法。傑克向受傷後變異的克里格爾要求解毒藥。克里格爾表示沒有時間來準備血清,傑克會在一個小時變成標本,更不用說瓦萊麗。然後多伊爾出現在附近暗示仍有剩餘的血清。傑克決定不會在多伊爾沒有找到解藥之前離開該島,他帶著虛弱的瓦萊麗來到碼頭,然後,他返回了工廠。  在火山口,克里格爾的熔岩利用系統被損壞,火山爆發在即,傑克在火山爆發前就逃了出來,用防爆門保護自己免受傷害。他和瓦萊麗利用一艘帆船離開了孤島,火山爆發摧毀了剩下的克里格爾的實驗室。傑克用已經找到的解藥治療瓦萊麗。在結尾動畫上,瓦萊麗看著一本厚厚的資料夾的檔案和兩個光碟綁在一起標記著“孤島驚魂計劃”(Project Far Cry)。  在Xbox版《孤島驚魂:本能》的劇情中,主角傑克擁有獸化能力。

  多人遊戲有共有三種模式。

  

  Crytek為孤島驚魂開發了新的遊戲引擎“CryENGINE”。該引擎擅長類似於閃點行動的超遠視距渲染,但擁有更先進的植被渲染系統。此外,玩家在遊戲關卡中不需要暫停來載入附近的地形。對於室內和室外的地形,遊戲引擎也可無縫過渡(照明和渲染模式可能稍有不同)。  遊戲大量使用畫素著色器,例如水面的視覺效果。藉助Crytek的PolyBump法線貼圖技術,遊戲中室內和室外的水平特徵細節也有提高。  在隨後釋出的1.3補丁中,《孤島驚魂》引進了HDR(高動態範圍)特效。它只能在單顯示卡上啟用,支援Shader Model 3.0和64位技術。  在1.4補丁中,《孤島驚魂》可以同時實現HDR和反鋸齒效果(HDR+AA)。

  遊戲引擎內建的沙盤編輯器(Sandbox Editor)可以讓玩家很容易的建立大型戶外關卡,載入測試自定義的遊戲關卡,或看到遊戲中特效的任何變化。
是一個2004年3月23日釋出的第一人稱射擊遊戲,由德國Crytek工作室開發,育碧軟體發行,在微軟Windows平臺上執行。《孤島驚魂》釋出後4個月內售出730000份,目前在全球已累計售出超過100萬份。本遊戲改編的真人電影於2008年上映。