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  巴伊蘭大學的校名是為了紀念猶太宗教復國主義領袖和美國米茲臘希運動前主席梅厄·巴伊蘭,梅厄雖然出生在傳統的猶太教拉比家庭並在幼年接受了猶太宗教學校的教育,但是青年時代德國的遊學經歷也讓他接觸到了世俗教育的影響。他在美國從事米茲臘希運動期間,曾經提議建立一所結合了世俗的學術研究和猶太宗教律法研究的學府。1950年,時任美國米茲臘希運動主席、美國葉史瓦大學領導人之一的Pinkhos Churgin教授繼承了他的思想,提出致力於建立一所融合猶太教學術價值觀的大學。

  1955年,巴伊蘭大學在拉馬特甘成立,Pinkhos Churgin教授出任學校第一任校長。創始伊始,巴伊蘭大學只有8間教室和2所實驗室,教職員工23人,學校開設了猶太研究、自然科學和數學、社會科學、語言學和文學4個系,共有學生90人。  1956年,學校的第一棟教學樓建成,學校學生總人數達到了175人。在當年爆發的第二次中東戰爭中,許多師生參與了前線的戰鬥,或成為了學校附近的舍巴醫院的義工。1959年第一屆本科生畢業,1961年第一屆碩士研究生畢業,1963年第一屆博士研究生畢業。  1965年,學校成立10週年,在校學生總人數超過了2,000人,教師總數超過300名,校園內建築達到22棟。學校在阿什克倫建立了教學點,以幫助周邊地區居民獲得更好的教育。  1967年,學校推出了首個猶太律法解釋計劃(Responsa Project),成為了當時世界上最大的希伯來文電子資料庫。阿什克倫教學點發展成為了巴伊蘭大學的分校,拉馬特甘校區的中心圖書館建成。六日戰爭爆發後,學校師生積極為作戰部隊提供協助,參與了民防和醫院的志願者服務。1968年,學校在Zemach和採法特建立了教學點。1969年,巴伊蘭大學得到了以色列高等教育委員會的承認。1972年,耶西森研究所成立,該研究所從事猶太教經典的高階研究。  1977年,學校接納首批44名女性學生參與猶太教經典的高階研究。1979年,巴伊蘭大學進行了學科模式的改革。例如,在藥物化學和人類生物學領域開設學士學位,在教育學、法學、犯罪學、經濟學工商管理專業、地理學和古典學開設碩士學位,在社會科學、音樂學、新聞通訊以及其他跨部門的學科領域開設博士學位。還建立起了一批新的研究所和學會,如大屠殺研究所、社群服務學會、猶太教律法學會、意第緒語學會等等。  1985年至1995年期間,學校擁有5所學院,分別是猶太研究學院、人文學院、社會科學院、自然科學學院和法學院,學生人數達到10,640人,吸引了來自世界各地的約100名優秀教師加入學校,提升了學校的教學和研究水平。擁有阿什克倫、採法特、約旦河谷、阿里埃勒、西加利利5個分校和教學點。  1995年至2005年期間,拉馬特甘校區建築總數達到了70棟,擁有150個實驗室、190間教室,在校學生達到31,400人。學校擁有世界上最大的一支猶太學師資隊伍,啟動了校外拓展專案,成立了諸如貝內貝拉克和耶路撒冷的學術中心。1998年,生命科學學院成立。 2005年,學校迎來了建校50週年慶典,啟動了科學家迴歸計劃(the Returning Scientists program),帶動了數十名外海猶太科學家回到以色列。當年,學校弗萊德和芭芭拉·柯爾特語言研究大樓、沃爾會議中心在北校區落成。2009年,萊斯利和蘇珊大腦研究大樓在北校區落成。2010年,Churgin教育學院搬遷到北校區的吉姆·約瑟夫教育大樓,計劃為唐氏綜合徵和其他智力殘疾學生提供高等教育服務。2011年,工程學院和位於加利利的醫學院成立,巴伊蘭大學學員總數達到8個。  2015年,學校迎來建校60週年。今天的巴伊蘭大學共擁有8個學院,超過120,00名校友,32,000多名學生。擁有高階教師690人,青年教師1000多人。超過8000個學術課程,52個部門,69個研究中心和研究所,77個學會,60個活躍的國際合作研究專案。拉馬特甘校區分佈有超過300個實驗室和建築物、24個圖書館(室),藏書超100萬本。

  巴伊蘭大學的標識是在1955年建校時,由英國設計師亞伯蘭·蓋姆斯設計,標識主體圖案由兩個希伯來字母Bet()和Aleph()組成,抽象為顯微鏡和猶太律法書本,象徵了巴伊蘭大學建校初衷所倡導的學術卓越和猶太遺產研究。
巴伊蘭大學(),又譯作巴爾-伊蘭大學,縮寫BIU,建立於1955年,位於以色列拉馬特甘,是一所公立大學,也是目前以色列規模第二大的學術研究機構。