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  該聖殿在過去數世紀中從一個基督教的祕密聚會點(公元一世紀)變成一座雄偉的宗座聖殿(公元六世紀),顯示出天主教漸大的合法性及勢力。

  在2世紀,一位拜日教的成員建了一個小寺廟獻給密特拉神。這小寺廟一直都用於入會儀式的用途(直到三世紀)。此外,寺廟的中心安放了一座大理石祭壇,祭壇四面都雕有淺淺的浮雕,分別為克勒蒙斯正在殺一隻公牛,持火炬者們及一條蛇。

  在Fr. Joseph Mullooly於1980年代的多次挖掘中,發現原來該聖殿被遺忘 及古老的建築物位於中世紀那座的下方。在基督教於390年代成為羅馬國教後,建築師們開始擴建原本的小教堂。他們把教堂的房間及庭院建得更復雜一些,並於原本教堂的位置上建了一箇中殿,他們也在之前的太陽式洞上建了一個後殿。  此外,這所建築物曾為會議的舉行地(由教宗佐西於417年及教宗聖西瑪克於499年擔任主席)。而最後一個於這所建築物舉行的重要活動為於1099年舉行的教宗選舉(由教宗巴斯加二世當選)。

  我們現在所見的該聖殿於1099年開始重建,並於1120年完工。直到今天,這所建築物也是眾多羅馬教堂中其中一座最華麗的教堂。它的入口原本為列柱走廊(圖紙上的B點,並由拱廊環繞著),但這些列柱走廊現今用為迴廊(由女修道院建築物包圍)。後面的教堂被拱廊分為三個中殿。而十二世紀建成的詩班席(圖紙上的E點)就結合了舊建築的大理石元素。此外,在聖殿的長老會裡有一座有蓋祭壇(圖紙上的H點)。而聖殿的主教座位位於後殿,座位的正上方鑲有以十字架的勝利(Triumph of the Cross)為主題的馬賽克。  從1667年開始,多明我會成為聖殿的管理人。 教宗烏爾巴諾八世讓他們留在聖殿,假如他們給神職者們住所使他們能在羅馬學習及教學。  在聖殿中庭的其中一幅牆上,有一塊教宗格肋孟十一世加上的匾,讚美聖格肋孟聖殿「這座古老的教堂對抗過歲月的摧殘」。此外,他也定下了對這古老建築的修復工程(他選了Carlo Stefano Fontana作這次工程的建築師,並於1719年完工)。在旁邊的一個小堂裡,安葬了發明格拉哥里字母及傳教給斯拉夫人的聖西里爾。若望·保祿二世有時候也會在這小堂裡為波蘭及斯拉夫國家禱告。
拉特朗聖格肋孟聖殿 ()位於義大利羅馬的聖若望拉特朗街,是天主教的一個宗座聖殿與司鐸級樞機領銜教堂,獻給教宗克肋孟一世。