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  弗朗西斯科出生在西班牙阿蘭胡埃斯,弗朗西斯科的父親是卡洛斯四世的小兒子,母親是那不勒斯和西西里公主;夫妻兩人是舅甥關係。而弗朗西斯科是兩人的次子(成年中最長者),他的名字Francisco de Asís起源於13世紀聖人亞西西的方濟各。

  為避免卡洛斯派再度威脅女王伊莎貝拉二世的地位,在卡斯提亞貴族的施壓下,當年16歲的女王在1846年10月10日和堂兄成婚,同一天伊莎貝拉的妹妹路易莎·費爾南達和法國國王路易-菲利普一世的小兒子安託萬成婚;法國國王希望藉由這樣的安排讓自己的後代入主西班牙,儘管引來了英國的抗議,因為恐有違反烏特勒支條約的可能。婚後,弗朗西斯科和女王有一子四女活至成年。  歷史傳聞記載,由於他有同性戀傾向,因此盛傳包含國王阿方索十二世在內的(一部分或全部)伊莎貝拉二世的子女,皆非弗朗西斯科的親生骨肉;這個謠言尤其被伊莎貝拉叔父莫利納伯爵唐·卡洛斯親王的支持者卡洛斯派用來攻擊阿方索十二世的血統。
弗朗西斯科·德·阿西西·瑪利亞·費爾南多·德·波旁·波旁-兩西西里,(Francisco de Asís María Fernando de Borbón y Borbón-Dos Sicilias,1822年-5月13日-1902年-4月17日)是西班牙女王伊莎貝拉二世的丈夫,從而在1846年到1868年成為配國王稱弗朗西斯科一世。最初,弗朗西斯科被封為加的斯公爵,這個頭銜基本上在他婚後王室便不再使用,不過這是他日後最常見的稱謂。弗朗西斯科是西班牙國王卡洛斯四世的孫子。