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  古為吐蕃孫波如屬地。元朝歸吐蕃等路宣慰司管轄,明末清初蒙古和碩特部入青海,控制玉樹藏族各部頭人,贈爵為諸臺吉。晚清朝時由西寧辦事大臣直接管轄。民國時期設定玉樹、囊謙、稱多3縣,縣之下千百戶制度因襲如故。  1914年,北洋政府為勘查甘川邊界,派遣以周務學為首,周希武、牛載坤二人為特派員抵達玉樹結古鎮。周希武在玉樹地區,考察九個月,寫出《玉樹土司調查記》。1916年,北洋政府根據周務學團隊調查,玉樹被置於青海管轄範圍之內。  1949年10月,人民解放軍青海省軍政委員會駐玉樹特派員辦公處成立,正式接管玉樹軍政大權,轄玉樹、稱多、囊謙3縣,辦公處駐玉樹縣結古。1950年6月,撤銷青海省軍政委員會駐玉樹特派員辦公處,成立青海省玉樹分割槽人民行政督察專員公署。  1951年1月,玉樹分割槽人民行政督察專員公署改稱玉樹專區專員公署。  1951年7月,玉樹藏族自治區籌備委員會成立。1951年12月25日玉樹藏族自治區召開第一屆各族各界人民代表大會,會議決議:撤銷玉樹專區,成立玉樹藏族自治區(專區級)。自治區轄稱多、囊謙2縣。玉樹縣地域由自治區直轄  1955年6月,玉樹藏族自治區改稱玉樹藏族自治州,轄玉樹(未成立縣級機構)、稱多、囊謙、治多、雜多、曲麻萊6縣。

  北與海西蒙古族藏族自治州為鄰,東與果洛藏族自治州相通,東南與四川省甘孜藏族自治州毗連,南及西南同西藏自治區的昌都市和那曲地區交界,西北角與新疆維吾爾自治區的巴音郭楞蒙古自治州接壤。東西長738公里,南北寬406公里。  平均海撥4000米以上,最高點6621米,唐古拉山綿延南境,可可西里山、巴顏喀拉山橫貫北境,多雪峰冰川。黃河、瀾滄江導源境內,長江上游通天河斜貫。氣候高寒。

  

  玉樹州下轄1個縣級市、5個縣。

  根據2010年第六次全國人口普查,全州常住人口為378439人。同第五次全國人口普查相比,十年共增加了109614人,增長40.78%。年平均增長率為3.48%。其中,男性人口為194762人,佔51.46%;女性人口為183677人,佔48.54%。總人口性別比(以女性為100)為106.04。0-14歲的人口為120574人,佔31.86%;15-64歲的人口為238453人,佔63.01%;65歲及以上的人口為19412人,佔5.13%。

  常住人口中,漢族人口為11685人,佔3.09%;各少數民族人口為366754人,佔96.91%。其中:藏族365169人,佔96.49%;回族827人,佔0.22%;土族281人,佔0.07%;撒拉族301人,佔0.08%;蒙古族62人,佔0.02%;其它少數民族114人,佔0.03%。

  1999年全州實現國民生產總值5.96億元,其中,第一產業完成4.0億元。玉樹州是青海省主要畜產品生產基地,畜產品產量約佔全省總產量的1/4。

  2010年4月14日上午7時起,玉樹縣發生里氏7.1級地震,玉樹州政府、玉樹市政府所在地結古鎮有9成以上民房倒塌,導致2,698到10,000人死亡、270人失蹤、12135人受傷。
玉樹藏族自治州(),簡稱玉樹州,是中華人民共和國青海省下轄的自治州,位於青海省西南部,總面積為20.49萬平方公里(不含由格爾木市代管的唐古拉山鎮),總人口為40.17萬人,其中藏族佔97%,農牧業人口21.7萬人,自治州首府駐玉樹市結古鎮。2010年4月14日上午7時起,玉樹縣(現玉樹市)發生里氏7.1級地震(參見:2010年玉樹地震)。