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  1898年,美西戰爭接近尾聲時,美國從西班牙帝國手中奪走全部古巴,將其納為保護國,並在關塔那摩灣建立了美國海軍關塔那摩基地(U.S. Naval Station Guantanamo Bay)。1901年2月,美國總統威廉·麥金萊簽署《普拉特修正案》,法案規定美國有權對古巴實行軍事幹涉,並要求古巴讓岀部分領土給美國建立軍事基地和開採煤礦等。《普拉特修正案》作為附錄寫入了古巴憲法。根據這一法案,美國在1903年從第一任古巴總統托馬斯·埃斯特拉達·帕爾馬手中獲得一份租借關塔那摩灣部分土地的永久性租契,起始日期為1903年2月23日,這成為了今日租約的依據。  然而好景不長,1905年,帕爾馬再次當選總統後,反對人士質疑選舉程式合法性,進而發動起義。為支援當時政府,1906年美國再次岀兵佔領古巴,直到1909年才結束。古巴人認為《普拉特修正案》允許美國入侵其領土,因此1934年巴蒂斯塔上臺後此法案便告廢棄。同年兩國簽署一項新的條約,保留了美軍對關塔那摩灣的租契,並允許古巴和其貿易伙伴免費使用此灣。租金原來為一年2000美元,以金幣形式支付;1934年改成相當於1934年4085美元的等值通貨。除此之外還加入一項條件,規定只有當美國和古巴政府均同意後才能廢止這項租契,或美國放棄基地財產,當初並沒有想到古巴革命變成社會主義國家,導致後來極為特殊的現象,美軍可「合理」的聲稱自己有權駐紮在社會主義國家古巴。而為了保護領地,關塔那摩灣海軍基地目前駐紥1000名美軍,是美國唯一設在敵對社會主義國家領土上的軍事基地,也是實際上軍事佔領有關土地。  自然古巴人對美國佔領自己的領土一直極為不滿。1969年的《維也納條約法公約》第52條規定,如果一款條約是在一方威脅或強行施加的情況下籤署的(在這裡就是指1903年美國將普拉特修正案寫入古巴憲法),則此條約無效。古巴政府以此公約為據,強烈譴責這款條約和關塔那摩美軍基地的存在。卡斯特羅上臺後,除唯一一次外,一直堅決拒絕從美國政府那裡兌現租金支票,原因在於他認為這個基地是非法的。不過古巴礙於美國的威脅能量,只能屈從於政治現實,保持約定好的這種緊張平衡,儘管美國和古巴之間沒有外交關係直到2015年,美國的條件是同意將古巴的通緝犯遣返,古巴也同意將在關塔那摩灣犯罪的嫌犯押送至美國。  1964年古巴政府切斷了通向基地的水源供給,迫使美國首先從牙買加運水,後來又建立了海水淡化裝置。時至今日,此基地能夠在水電方面自給自足。美國在冷戰期間岀於擔心古巴襲擊基地,在周圍佈滿地雷,地雷帶長達幾十公里,是世界上最恐怖的雷區之一。  20世紀後期,基地的主要作用是收留在公海上攔截的古巴和海地難民,不過從2002年起,基地的一小部分設為關塔那摩灣拘留營,被用來關押在阿富汗和其他地區捕獲的基地組織和塔利班嫌犯。2006年3月3日,美國五角大樓公佈了被關押在關塔那摩監獄的數百名恐怖活動嫌疑犯的姓名和國籍等身份資訊,是美軍方首次公佈該監獄囚犯身份。  2009年1月21日,美國總統巴拉克·奧巴馬剛上任後曾計劃於一年內關閉關塔那摩灣拘留營,但被國會反對,加上現實不可行的情況下(多數美國人反對囚禁中的恐怖分子轉至美國本土),因而到現在該拘留營仍繼續運作。
關塔那摩灣(西班牙文:Bahía de Guantánamo;英文:Guantanamo Bay)位於古巴東南端關塔那摩省。北緯19.54度,西經75.9度。灣中設有一屬於美國海軍的關塔那摩灣海軍基地,佔地116平方公里。近年來該基地被美軍用於拘留和審訊在阿富汗與伊拉克等地區的戰事中捕獲的恐怖活動嫌疑人、戰俘。此地因為算是租借的古巴領土,法理上受刑人的權利不受聯邦法律保護與監管,美國政府便可以為所欲為向受刑人迫供,因而再度受到媒體與民間人權團體的關注。