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  2006年,義大利球壇爆出當時最轟動的假波案,應屆冠軍尤文圖斯、AC米蘭、佛羅倫薩以及拉齊奧涉嫌安排球證操縱比賽結果。該四間球會被義大利法院及義大利足總作出判決,原定可以參加下屆歐聯及歐洲足協盃的他們被判禁止參加來屆所有歐洲賽事,但AC米蘭在7月25日進行的上訴裁決獲得減刑,並且得以參加來屆歐聯第三圈外圍賽。  經最後裁決後,歐洲賽參賽資格由以下球隊取代:

  國際足協基於希臘政府嚴重干預足球組織運作,因此2006年7月3日開始禁止希臘參加所有國際足球賽事,不過希臘議會就事件批准修訂有關體育管理方面的條例後,國際足協於7月12日取消對希臘足協的禁賽令。

  

  首回合於2006年7月11日至12日進行,次回合則於同年7月18日至19日進行。

  首回合於2006年7月25日至26日進行,次回合則於同年8月1日至2日進行。

  首回合於2006年8月8日至9日進行,次回合則於同年8月22日至23日進行。

  總數 32 球隊會被分成 8 組,每組 4 隊參加分組賽。每組首名及次名均晉級十六強淘汰賽,第三名則轉戰歐洲足協盃三十二強淘汰賽繼續參與歐洲賽事。  如在小組中兩隊得分相同則順次序根據以下準則定出勝方:

  除決賽外,所有淘汰賽均以主客兩回合形式進行,兩回合計勝出的球隊可獲晉級資格。當兩回合計賽和時,取得較多作客入球者可獲晉級資格;但若雙方作客入球數字相同時,就需要加時作賽。若在加時依然賽和,次回合作客一方若取得入球,可獲晉級資格。假如依然未能分出勝負,則以互射點球形式決定勝負。

  本輪抽籤儀式於2006年12月15日在希臘雅典進行,首回合於2007年2月20日至21日進行,次回合則於同年3月6日至7日進行,根據賽制,十六支出線球隊如屬同一個國家或分組賽階段處於同組則不會碰頭。

  本輪抽籤儀式於2007年3月9日在希臘雅典進行,首回合於2007年4月3日至4日進行,次回合則於2007年4月10日至11日進行。八支出線球隊沒有抽籤限制,因此同一個國家或分組賽階段處於同組的球隊將有機會碰頭。最後的抽籤結果顯示半準決賽中,英格蘭球隊和義大利球隊沒有抽到同一國家的球隊,但利物浦則會對他們在分組賽中的對手PSV燕豪芬。

  本輪抽籤儀式於2007年3月9日在希臘雅典進行,首回合於2007年4月24日至25日進行,次回合則於2007年5月1日至2日進行。

  決賽於2007年5月23日在希臘雅典奧林匹克體育場舉行。AC米蘭在常規時間內2比1戰勝了利物浦隊。
2006–07年歐洲冠軍聯賽(UEFA Champions League)為第 52 屆歐洲冠軍聯賽,來自 49 個歐洲國家所屬球會進行爭奪冠軍,決賽階段於2007年5月23日在希臘雅典奧林匹克體育場舉行,由義大利的AC米蘭迎戰英格蘭的利物浦,這是兩隊繼2004–05年歐聯決賽後再度對碰。最終AC米蘭在常規時間內 2–1 戰勝了利物浦,歷史上第七次捧起冠軍獎盃。