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  在百科全書編纂中,一直有大小條目主義之分。小條目主義以《布羅克豪斯社交詞典》為代表,突出了百科全書的工具書性質,方便查閱;但是與大條目主義的百科全書相比,則往往喪失了知識的系統性。

  百科全書的條目包括標題、正文內容和圖表等。在百科全書的編纂中,條目的命名非常重要。好的命名應該便於檢索,有學者認為條目應該都是獨立的主題,應以方便讀者的檢索為準則。另外,條目的主題應該是客觀形成的,而不是人為擬定的。例如海灣戰爭是客觀存在的事實,而“狗的神話”則是人為擬定的主題。  條目的命名應該清晰明確,不能含糊不清。例如「新型武器」,很難界定“新型”的劃分。  百科全書條目的選擇有一些共通性的原則:  此外,條目之間還具有組群關係。例如太陽系中的各大行星條目就屬於一個同型別的條目組群。條目組群還包括所謂的“母子條”、“世系條”等具有從屬關係的條目。例如著名的網路百科全書維基百科就有“特色主題”的評選,來挑選出撰寫非常優秀的一組相互有關聯的條目

  百科全書中常常會使用“參見”(See [also])系統,將與主題相關的知識串聯起來。最早使用參見方法的的義大利人班迪尼編寫的《宇宙大事源》。  在《大英百科全書》中,參見用q.v.(拉丁文quod vide的縮寫)或see來表示,《布羅克豪斯百科全書》用→,《邁耶百科詞典》用↑,《劍橋百科全書》用»,中文百科全書則一般用楷體字表示參見。
條目是被分條列寫的專案。在百科全書中,條目是所含內容的基礎分割單位,在詞典中則稱為詞條。有一個單一的主題,用於闡述一件事物、一個人物、或他們具備特定主題的組合,並且對該對條目所描述之事物作出一個客觀的介定。