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  CD格式中存在的最小實體稱為幀,包含24位元組。資料在CD-ROM中被組織為幀和扇區。一個CD-ROM扇區包含98幀,共2352位元組。  CD-ROM Mode 1,通常用於計算機資料,根據紅皮書標準把2352位元組資料區分為12位元組的同步資訊、4位元組的頭資料、2048位元組的使用者資料和288位元組的錯誤校驗碼。這些編碼可以防止資料異常導致的執行資料錯誤。  CD-ROM Mode 2 Form 1,通常用於計算機資料,與Mode 1使用相同的使用者資料和錯誤修正,但是佈局有一些小差別。不建議用於有相容性要求的場合。  CD-ROM Mode 2 Form 2,傾向用於儲存容錯資料,如音訊和視訊,2352位元組被分為12位元組的同步資訊、4位元組的頭資料、2336位元組的使用者資料。Mode 2通過省略錯誤修正,提供了比Mode 1多出14%的使用者資料空間;因為音訊或視訊資料的讀取錯誤只會導致很小的缺陷,而人類很難察覺到。VCD被歸類於Mode 2 Form 2。

  最開始的32768位元組沒有被ISO 9660資料結構使用,因此可以有其他用處,例如:CD-ROM可以在此區包含一個替代檔案系統描述資訊塊,通常被混合光碟(Hybrid CD)用於提供Mac OS特定的內容。此未用塊後面跟著一連串卷描述符,詳細記錄了該磁碟上的內容和型別資訊(類似被FAT和NTFS格式磁碟使用的BIOS引數塊)。  卷描述符描述了一個給定的CD-ROM或捲上存在的檔案系統資訊的特徵。它被分為兩部分:卷描述符的型別和描述符的特徵。這樣做的目的是:當一個程式無法解釋特定的描述符的時候,它可以跳過此描述符而找到它可以識別的其他描述符,這樣就允許在一個捲上使用多種不同型別的資訊。另外,如果一個描述符發生錯誤而無法讀取,那麼緊接著的一個該描述符的冗餘副本可以用來進行錯誤恢復。
ISO 9660,也被一些硬體和軟體供應商稱作CDFS(光碟檔案系統),是一個由國際標準化組織(ISO)為光碟媒介釋出的檔案系統。其目標是能夠在不同的作業系統如Windows、Mac OS以及類Unix系統上交換資料。