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  T.巴託林的父親,是出生在斯科訥馬爾默的老C.巴託林,母親是安妮·芬克(Anne Fincke)。T.巴託林是他們六個兒子中的第二個。老巴託林在1611年出版了第一部解剖學著作全集。後來T.巴託林擴充、說明並修訂了這部著作,成為解剖學的標準參考。兒子還特別增加了哈維的血液迴圈理論和淋巴系統。  T.巴託林於1644年在墨西拿拜訪了義大利植物學家彼得羅·卡斯特利。1663年,T.巴託林買下了,但在1670年(包括他的圖書館)被燒燬,遺失了許多手稿。丹麥國王克里斯蒂安五世任命T.巴託林為他的醫生,薪水相當豐厚,並且免除了他農場的稅收,作為他損失的補償。1680年巴託林的健康惡化,農場被變賣,他搬回了哥本哈根,然後在那裡去世。他死後被埋葬在Vor Frue Kirke(聖母教堂)。  哥本哈根有一條以他們家命名的街道:Bartholinsgade,附近是。奧胡斯大學的一棟建築也是以他的名字命名的。

  1652年12月,T.巴託林發表了第一個關於人類淋巴系統的完整描述。曾在此前的1651年,注意到過動物的淋巴系統。佩奎特還發現了胸導管和它進入靜脈的入口,是第一個描述淋巴液正確進入血液途徑的人。 在佩奎特和T.巴託林的發現後不久,1653年,奧洛夫·魯德貝克出版了類似的人類淋巴系統。儘管魯德貝克在1652年的四五月份,在瑞典克里斯蒂娜女王的朝廷上就發表了他的發現,但直到1653年(在T.巴託林之後)才寫出來。結果就是是他們開始激烈的爭奪第一發現者的身份。尼古拉斯·斯坦諾是他最有名的的學生。  T.巴託林的著作"De nivis usu medico observationes variae"第二十二章,是已知第一次提及冷凍麻醉,他把這項技術歸功於義大利人馬可·奧雷利奧·塞韋裡諾。 根據T.巴託林的說法,塞韋裡諾是第一個使用冰雪混合物的人(1646年),T.巴託林最早在訪問那不勒斯時,瞭解了他的技術。  T.巴託林同時也是第一個描述13體綜合徵的人。  T.巴託林一家三代,都發現過重要的解剖結構和現象,為現代醫學的實踐做出了貢獻。
托馬斯·巴託林(,1616年-10月20日-1680年-12月4日),是一位丹麥醫師、數學家和神學家。他以發現人類淋巴系統和發展冷凍麻醉理論而聞名,是第一個科學性地描述它的人。