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  斗六原為洪雅族斗六社()之所在地,後來移居於此的泉州閩南人將之閩南語音譯為漢字「斗六門」()。

  「斗六」在荷蘭人佔據時期即有「斗六門柴裡」之稱,簡稱為「斗六門」或「柴裡」等。原先洪雅族有一社位於柴裡(現斗六市三光裡)。「斗六門」系其族人在狩獵捕獲山鹿時發出「ㄉㄨ - ㄌㄨ- ㄇㄣ」的咆哮以為慶賀,後來以閩南語之發音譯成漢字,名稱由此而來。

  1683年8月(南明永曆三十七年七月,清康熙二十二年七月),鄭克塽投降清朝,臺灣進入長達212年的清治時期(1683-1895年)。  斗六地方本系平埔族洪雅族於康熙末年移至此地開墾聚成部落。康熙五十六年(1717年),陳孟林修之「諸羅縣誌」已有「斗六門街」、「柴裡斗六社」之記載,由此可見斗六在當時之開拓已頗具基礎。  乾隆初年,泉州人楊仲熹招集漢人在此開店行商而逐漸興盛。奠定街基。乾隆十七年(1752年)街成,二十六年(1761年)置斗六門巡檢,道光十五年(1835年)改為斗六門縣丞。  同治元年(1862年)九月,斗六門為戴潮春所攻陷,戴潮春旋將根據地由四張犁轉移到此處,直至同治二年年末才由清軍奪回。  光緒十三年(1887年)設臺灣三府增至雲林縣、苗栗二縣,雲林縣治雖在林圯埔 ( 今南投縣竹山鎮 ),但每年雨期濁水、清水兩溪氾濫,致使交通時常中斷,而且縣址過於偏東甚為不便,遂於光緒十九年(1893年)遷至斗六。

  1895年4月(清光緒二十一年三月,日本明治二十八年四月),清朝和日本簽訂《馬關條約》,將臺灣割讓予日本。5月底,臺灣軍民起而反抗日軍接管,爆發乙未戰爭,至11月中旬始宣告平定。 在乙未戰爭中,抗日義軍曾於8月27日八卦山之役結束後,撤守雲林縣。在斗六與日軍近衛師團進行遭遇戰。徐驤、簡義、陳文晃、廖琛、黃醜等率部奮勇抵抗,徐驤陣亡。  1895年(明治二十八年)清日甲午戰後臺灣割日,廢縣改置民政支廳,專司民政。翌年頒定臺灣總督府地方官制,為三縣一廳,斗六街置臺灣縣雲林出張所。1897年(明治三十年)又改為六縣三廳,改置嘉義縣斗六辦務所,並設定街莊長,翌年改隸臺中縣。1901年(明治三十四年)改正官制,置斗六廳,至1911年(明治四十四年)廢斗六廳,併入嘉義廳。  至大正九年(1920年)改行政區域為五州三廳,斗六郡役所將原斗六區、林內區及樹子腳、菜公區之部分裁併為斗六街之區域。

  至光復後於民國三十五年(1946年)成立臺南縣政府,改郡為區,街莊變為鄉鎮,併成立斗六鎮公所。民國三十九年(1950年)乃將臺南縣,增設雲林、嘉義兩縣,擇定斗六為雲林縣治所在地。民國七十年(1981年)時改為縣轄市,為雲林縣政治、文化、經濟中心。

  

  斗六市行政轄屬雲林縣,雲林縣地理位置在中臺灣西側濱海地區,而斗六市則在雲林縣之東隅,即嘉南平原北端與中央山脈西麓丘陵之銜接地帶,東鄰南投縣竹山鎮,南接古坑鄉,西連虎尾鎮、斗南鎮,北界莿桐鄉、林內鄉。總面積為93.7151平方公里,全境略呈一橫置之雞腿狀,東西寬15公里,南北長16公里,全市下轄39裡。

  斗六地區溪流圳渠縱橫分佈,溪流多起源於林內鄉、古坑鄉及斗六山區。北部及東部有北環溪、外湖溪與大埔溪匯流成石榴班溪,楓樹湖裡溪、內林溪亦注入石榴班溪。其後在與海豐侖溪集形成(舊)虎尾溪。中部有云林溪貫穿,南部則有石牛溪,兩溪接流入虎尾溪。 水利設施方面,本地區由於位在平原與山坡地接壤處,每逢大雨由山坡地急速流下,至平原區後流速驟減,常因宣洩不及而損至農作物,尤以西南豬母溝大排水道與虎溪裡的小排水道最為嚴重。 斗六大圳位於嘉南平原北端,東與清水溪並列,圳水由北而南;清水溪由南而北,北與濁水溪成約五十度之交叉,東南為山脈起伏之大尖山,西北漸為平原。河川除清水溪外,尚有石龜溪、大湖口溪、侖子溪、石牛溪等。斗六大圳便以上述各溪為主要水源,於境內設有二十八條小型埤圳,但斗六除清水溪外,其餘溪流之溪谷,且因陡急之故,一旦降雨,溪流立刻氾濫成災,而雨停後,各溪流流量即銳減。此外,在每年十月至翌年四月的枯水期,境內河川幾至枯竭,想要取水灌溉,無異緣木求魚,故在斗六大圳興建前,五穀欠收,實為農民最大之痛苦。

  

  斗六市公所是雲林縣斗六市最高層級的地方行政機關,在中華民國政府架構中為縣轄市自治的行政機關,同時負責執行縣政府及中央機關委辦事項,斗六市的自治監督機關為雲林縣政府。市長由全體市民直接選舉產生,任期為四年,可連選連任一次。斗六市公所並置市政會議,為市政最高決策機構,在市長之下,設有6課4室等10個內部單位及5個附屬機關。  斗六市民代表會是斗六市的最高民意機關,代表斗六市全體市民立法和監察市政。市民代表由公民直選選出,任期為四年,可連選連任。共有17位市民代表,第一選區5席市民代表、第二選區5席市民代表、第三選區4席市民代表、第四選區3席市民代表,主席、副主席由17位市民代表互選產生。

  斗六市目前有39裡,768鄰,38265戶,總人口數約10.8萬人。

  

  「雲林科技工業區二期開發區」則是包含尚開發中的石榴班區79公頃、大北勢擴編區10公頃。

  

  早期以臺鐵火車站及斗六市圓環為中心向外輻射,可以畫出兩個同心圓。
斗六市(;客語白話字:Téu-liuk-sṳ;舊稱「斗六門」),位於臺灣雲林縣東部,是雲林縣的縣治及最大城市,也是雲林縣的政治、經濟、文化、教育、醫療等中心以及雲林主要交通中心之一,初為「斗六鎮」,於1981年因屬縣治所在地而改製為縣轄市。面積約93.7平方公里,為雲林縣面積次大的行政區(僅次於古坑鄉),亦為全國面積次大的縣轄市(僅次於臺東縣臺東市);人口約10.8萬人,人口密度約1,159人/km2,為雲林縣人口最多、人口密度最高的行政區。