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  在1888年,奧塞內爾·查利斯·馬什(Othniel Charles Marsh)將編號USNM 2135的標本命名為孔牙龍,這是一顆從波多馬克組發現、已磨損的大型牙齒。由於當時對甲龍亞目所知甚少,馬什將它與"Diracodon"的牙齒(後來證實是劍龍)來比較。在1978年Walter P. Coombs將牠納入結節龍科之前,牠都未曾被認為是屬於甲龍亞目的。  由於只有牙齒,孔牙龍並不引起太大的注意。在1998年,肯尼思·卡彭特(Kenneth Carpenter)及詹姆士·柯克蘭(James Kirkland)在重新評估北美洲的下白堊紀的甲龍亞目時,暫時認為孔牙龍是種異常大型的結節龍科,比所有已描述的還要大。卡彭特於2001年維持孔牙龍是結節龍科的有效屬,但卻不將牠納入其親緣分支分類法中。在2004年,Vickaryous等人在評估裝甲恐龍時,則認為孔牙龍是可疑名稱,但沒有論述。但是在此之後,West及Tibert進行了孔牙龍的形態度量學分析,發現牠是一個獨立的屬。

  肯尼思·卡彭特及詹姆士·柯克蘭列出了12顆在同一地區發現的額外牙齒,作為正模標本的牙齒,並暫時加入了一個粗壯的脛骨(編號USNM 9154)於孔牙龍中。他們對於阿倫德爾地層沒有發現此種恐龍的鱗甲,感到非常奇怪,卻指也注意到在此地層中很少發現化石。

  作為結節龍科的一員,孔牙龍可能是行動緩慢、有裝甲的四足草食性恐龍。牠有可能是大型的結節龍科,但由唯一的化石只有牙齒,其體型的估計仍未進行。
孔牙龍屬(屬名:)是結節龍科下的一屬恐龍,其化石只有很大的牙齒。牠的骨骸是在美國馬里蘭州喬治王子縣的阿倫德爾地層發現,年代為下白堊紀的阿普第階至阿爾布階。