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  於孤兒院生活的莉可,其願望是成為白笛,前往母親十年前前往的的深淵底層。某天莉可發現一個疑似來自深淵深處的機器人,將他取名為雷古,並發現不知因何原因而沒有記憶。為了收留雷古,莉可與好友替雷古編造孤兒身世,使他加入孤兒院。  不久後,之前下潛的黑笛探窟家哈勃返回,並帶回殲滅卿萊莎的白笛與書信。在書信中莉可看到疑似關於雷古的介紹與一句留言「在奈落之底等待」,同時由於雷古想了解自己的來歷,雷古和莉可在西奇等朋友的協助下潛入了深淵。  於深界二層莉可遭遇泣屍鳥襲擊,所幸雷古覺醒,發射火葬砲後救回莉可,之後抵達監視基地。莉可見到駐守於監視基地的白笛「不動卿奧森」後得知身世,兩人被奧森測試後認為太過弱小而給與了讓他們培養默契的「生存訓練」。訓練完成後奧森將殲滅卿的武器、遺物"無盡錘"贈與莉可,最後繼續下潛。  到了深界四層之時,莉可受到穿彈獸攻擊而中毒,為了逃離,雷古將莉可垂直往上帶,造成莉可又受詛咒陷入昏迷。此時娜娜奇現身,協助治療莉可並將其帶回娜娜奇的基地。在基地遇到了娜娜奇的生骸朋友米蒂。治療莉可後娜娜奇告知深淵詛咒的運作狀況,並引導雷古達成對穿彈獸的復仇戰。在復仇戰中娜娜奇得知雷古的武器「火葬砲」,並請求雷古殺死米蒂。娜娜奇告知雷古自身與米蒂的過往,敘述米蒂因上升負荷實驗而成為沒有意識卻死不了的怪物一事,唯有以高功率的武器一次性燒燬才不會復原。雷古殺死米蒂後莉可清醒,邀請娜娜奇加入隊伍後繼續往下探險。  之後來到了深界五層的前線基地,但其旅程因為缺乏啟動下潛用遺物的“生命迴響之石”(即白笛)而中斷,一行人於是決定在前線基地中留宿。半夜莉可醒來,發現娜娜奇與雷古均離開。因此與黎明卿的「女兒」普魯修卡兩人一起尋找同時成為朋友。於此同時娜娜奇欲與黎明卿談判卻得知因為雷古乃是稀有的個體因此被當作實驗品。雷古清醒後發現自己被脫光捆綁固定,隨後右手被切下。娜娜奇得知訊息後趕到實驗室卻被祈手們阻擋,最後莉可與普魯修卡到達,吸引祈手注意力使雷古能成功逃出。在逃出後設下陷阱重創前來追捕的祈手一行後與黎明卿對決併成功將其擊殺,然而卻被普魯修卡見到黎明卿的屍體。此時其中一名祈手戴上黎明卿面具後自稱黎明卿,輕鬆將雷古擊倒,對莉可發射「詛咒針」後帶著普魯修卡離去,並將普魯修卡製成彈藥包。一番討論後決議雷古潛入前線基地底部偷取能源,同時兩人趁機去取回雷古手臂並拖延時間,歷經一番波折後成功擊敗黎明卿並使其放棄阻撓莉可一行下潛。另外在普魯修卡彈藥包耗盡後因為普魯修卡衷心期盼能與莉可一起在深淵中探險,而轉化為屬於莉可的生命迴響之石。  莉可一行人最後在黎明卿的送行之下啟動了前往深界六層的祭壇,並開始了繼續往下探險的旅程並前往第六層來回無去之都的生駭村時普魯修卡被偷走,找回並交給寶石工匠珀利永將氆氌修卡雕琢後,得知娜娜奇將自己賣掉而買下了米蒂(與雷古殺死的米蒂擁有相同靈魂的完美複製品),換回娜娜奇必須是人類小孩或是“更高的價值”法普塔身體的一部分去換回,於是雷古前去在和法普塔對話時知道自己在未見到莉可時就已經叫雷古了,而法普塔拔下自己的一隻手和耳朵交給雷古,而莉可在生駭村的“目之深”遇見並且救出的為前三賢的維克進而瞭解了生駭村成立時的壯烈過去......。

  

  自深淵向上返回超過10米高時,探窟家會遭遇因深淵「力場」而對人體(集中在大腦、心臟、脊髓等維持生命的關鍵部位)造成的作用現象,下潛越深,上升負荷越大,可藉由遊走力場較弱處或是彈藥包來回避。通常來說,離縱穴越遠力場越弱。

  探窟家的笛是通行證,也是身份的證明,一般也常以笛的顏色代指探險者的級別。

  深淵內發現,以當今人類的科技所無法制作的特殊物品。

  指承受了自深界六層返回的詛咒而未死亡,喪失人性、不成人形,永遠不能恢復原樣的悲慘者。本意為「窮途末路者」,如果被探窟家發現,會將其殺死,只拿走身上的遺物。

  在轉移詛咒實驗成功後發明的產物,將人類多餘的器官移除,只留下大腦,脊髓,以及部分腸道,並且用面板包裹住後放入代替骨骼的一個盒子中,並且灌注藥液來維持生命以及降低神經的反應讓詛咒對彈藥包有較小的影響。  彈藥包為行動式詛咒轉移器,裝備在波多爾多背後的暗箱,基於波多爾多已經不被判定為人所以不能用祈手製作彈藥包。

  由漫畫家創作的漫畫,最初於漫畫網站《》刊載。2013年7月31日推出單行本,至今共有8卷。竹書房授權布卡漫畫刊載簡體中文電子版。

  2016年12月21日,《MADE IN ABYSS》開設動畫官方網站與Twitter賬號,並宣佈將會動畫化。2017年3月20日,於「AnimeJapan 2017」的KADOKAWA攤位公佈將於2017年7月於電視上播放。  動畫公司Kinema Citrus將負責動畫製作,並由小島正幸擔任導演,倉田英之負責劇本統籌,人物設定由黃瀨和哉負責。

  臺灣分級(依照巴哈姆特分級)10、11、13集為限制級;其餘為輔15級。

  到目前為止,已經制作了電視動畫第一季的劇場版總集篇兩部,與一部全新篇章的劇場版。

  2019年1月4日,將第1集到第8集的內容重新剪接並加入了新畫面的《來自深淵 劇場版總集篇 前編:啟程的黎明》()於日本上映。同年1月18日,將第9集到第13集內容重新剪接並加入了新畫面的《來自深淵 劇場版總集篇 後編:流浪之黃昏》()也於日本上映。  《來自深淵 劇場版總集篇 前編:啟程的黎明》除了刪剪部分分鏡和支節外,情節上與電視動畫的分別有三處:(一)開場時加入旁白對深淵歷史的簡述,以及妮可父母(十二年前)在深淵中的場景;(二)電影約1小時44分鐘處,不動卿奧森對成年萊莎的回憶之前加入了對萊莎童年拜師的回憶片段;(三)完場時,主角二人攜手望向大斷層時,加入了旁白以及微量新分鏡......最後讓娜娜奇提前亮相(一個鏡頭)作結。  《來自深淵 劇場版總集篇 後編:流浪之黃昏》相對較少新畫面,除了開場的旁白內容不同(畫面維持與電視動畫不變),只有兩處新畫面:(一)完場時,緊接地讓普魯修卡(黎明卿波多爾多的養女)提前亮相作結;(二)這個「新」埸景比較有趣,在開場不久與「血口大蛇」之戰中,為了縮減時間,把原本雷古使用了一次「火葬炮」和昏迷期間的情節全部跳過,但為了情節能連線得上,改動了劇情,加入了少量新分鏡(其實「後編」總長比「前編」還短了十多分鐘,根本不必為縮減時間而作此改動)。

  2020年1月17日電影《來自深淵 深沉靈魂的黎明》於日本上映。同時上映短篇動畫《瑪魯魯庫的日常》()。每週於本片開始前上映1話總共4話。臺灣於2020年4月10日上映,短篇動畫於片尾一次放映。
是奇幻題材的日本漫畫作品,由創作,並於竹書房旗下漫畫網站《》上刊載。