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  「拉昆市核爆案」(病毒洩漏)的三年以後,昔日美麗的地球已面目全非,『T病毒』毀滅拉昆市之後在幾個月內橫掃了全球,地球上的大部分靠近沙漠的城市已再度被沙漠吞噬,而森林與河流也全部燒燬和乾涸。地球大部分人口變成感染者,但也有一小部分人口組織起來繼續在地球上生存,而製造病毒的罪魁禍首『保護傘公司』雖然全面崩盤,但公司在地底下建立的核心基地仍然繼續運作,公司面對這場病毒危機也在繼續他們的病毒實驗,而公司卻企圖利用感染者進行馴化,即將創造一個感染者的世界。  艾莉絲,保護傘公司最為關鍵的實驗物件,在三年前的拉昆市事件後被卡洛斯·奧利維拉等人從『保護傘公司底特律總部』救出,但沒過多久為了不帶來殺生之禍就與眾人分開,也為了躲避保護傘的衛星在居住在內華達沙漠。三年後,艾莉絲在T病毒擴散全球后再度逃離,也騎著摩托車進行逃亡。同時,一組由克萊兒·瑞德菲爾與昔日的卡洛斯組成的倖存者車隊也在沙漠裡,在搜尋城市時順便尋找食物和水源,包括倖存者。有一部分擁有的組員是拉昆市的倖存者,另一部分則是半路得救的人,電腦專家米克不停利用無線電呼喚倖存者,但艾莉絲卻始終不迴應,也在一座加油站裡找到一本關於『阿拉斯加隔離區』的書。  保護傘公司一級科學家山姆·艾薩克為了得到當初與凱恩少校一起研究的艾莉絲而在保護傘公司隱藏在內華達沙漠地下的『北美總部』花費了三年的精力去尋找,也為了以防萬一而利用以艾莉絲的血液培育的複製體進行測試。但因為遲遲沒有任何結果而遭到保護傘公司行政主席阿爾伯特·威斯卡的質疑,甚至籌備已久的「感染者馴化計劃」也以失敗告終,於是在惱羞成怒之下發明瞭另外一個計劃。  克萊兒等人來到一座廢棄的汽車旅館,而L.J.進去旅館搜尋時被一名感染者咬傷,也在最後隱瞞自己的傷勢。眾人在旅館裡住了一晚,卻在第二天遭到被感染的鳥群的猛烈攻擊,幾名留在校車裡進行救援的人全被活活咬死,而卡洛斯為了幫助一個人而即將被火吞噬,但卻被趕到的艾莉絲所救。艾莉絲開啟了超能力磁場殺死所有的鳥,也因為開啟過多而暈倒,但力量卻被艾薩克的衛星接收到。  當艾莉絲醒來後,發現倖存者凱-瑪特坐在自己目前,此時車隊所有人正在為所有死難者哀悼,卡洛斯也再度與艾莉絲相遇,但艾莉絲卻發現保護傘的衛星已經追蹤到她。艾薩克發現追蹤物件與實體有著百分之六十二的相似度,於是立刻將此事彙報給威斯卡,但威斯卡卻打算要百分之百,也命令艾薩克不準私自行動。  沙漠車隊的眾人得到艾莉絲的阿拉斯加隔離區的情報後無法相信,而克萊兒也不打算冒險,但卡洛斯為了提升車隊計程車氣而決定接受。隨著眾人的同意後決定前往阿拉斯加,但也在夜晚發現食物和汽油已經耗盡,因此眾人決定在前往阿拉斯加前先到著名的賭城拉斯維加斯拿取補給品。此時艾薩克利用事先錄下的威斯卡的聲音派出保護傘公司的實驗部隊,也在離開基地時將一個貨箱搬離。  第二天,眾人將校車丟下後離開旅館朝拉斯維加斯進發,到達後發現城市已全被沙漠覆蓋,但進入城市後發現前往汽油的路被貨箱擋住,因此決定利用拖行,但艾薩克卻將貨箱開啟,將封存在貨箱裡的變種感染者放了出來。雖然艾莉絲、卡洛斯和克萊兒都盡全力搶救,但大部分倖存者全部被感染者吃掉,其中包括電腦專家米克及狙擊手切爾西,而L.J.也因為感染時間過久而變成感染者襲擊凱-瑪特,雖然最終被卡洛斯槍殺,但卡洛斯也付出再度被感染的代價(被咬到)。  艾莉絲在殺感染者時被艾薩克利用衛星關閉,但衛星的主機卻因為艾莉絲的反抗訊號而損毀,艾莉絲脫離後立刻跑到艾薩克的藏身處,也將所有的實驗部隊全部殺死,而艾薩克在坐直升機逃跑時被一名變種感染者咬到,因此立刻回基地注射解藥,而艾莉絲也利用藏身處的電腦檢視直升機的路線。艾薩克一回基地立刻注射了所有G病毒,但北美總部負責人卻為了以防萬一而將艾薩克開槍打死,但後來倒在地上的艾薩克的屍體卻重新站了起來,也在病毒副作用發作的情況下將總部裡的人全部屠殺。  幾小時後,艾莉絲等人找到北美總部的所在地,但卻發現總部已被壹大群感染者包圍,而被感染的卡洛斯發現自己已無希望而打算利用自殺式襲擊的方式開一條血路,與眾人分別後開著汽油車直接衝向感染者群體,也在翻車時將炸藥點燃,抽最後一支菸後伴隨所有感染者一起炸成碎片。艾莉絲等人在炸彈爆炸後直接衝進總部大門,也利用保護傘的直升機逃離。但艾莉絲卻選擇留下,也在走時將隔離區的書留給凱-瑪特,而克萊兒與艾莉絲再見後開直升機將所有人帶離。  艾莉絲在總部外圍發現一大堆自己已死的複製體,在憤怒之下衝進房子裡發現空無一物,此時一輛電梯突然從地底升起,而艾莉絲也到達總部內部,但卻意外遇到總部的人工智慧『白皇后』(紅後的妹妹)。白皇后告知艾薩克的變異,但也意外向艾莉絲提到她的血液是拯救這場病毒危機的關鍵,也可以利用總部裡的實驗器材進行研究,但也要面對最終的問題:已變成變種生物的艾薩克。  艾莉絲進入總部的底層去殺死艾薩克,但艾莉絲卻意外發現其中一個自己的複製體,複製體也在艾薩克攻擊時掉落。而艾莉絲隨後發現自己竟然進入自己昔日的拉昆市宅邸裡(蜂巢入口),而艾薩克也利用觸手進行攻擊。艾莉絲即使利用磁場也毫無作用,也被艾薩克打進一條走廊裡。艾薩克進入走廊後對艾莉絲表示自己就是未來,但艾莉絲卻瘋狂大笑地說:你只是另外一個混蛋!艾薩克突然發現自己與艾莉絲一起走進當初蜂巢的鐳射陣走廊,還沒反應過來時就被鐳射削成碎片,而艾莉絲原本即將被削成碎片,但卻被清醒的複製體搭救。  十小時後,保護傘公司的所有負責人在日本東京地底下的『保護傘公司東京總部』裡討論北美總部失聯的問題,但艾莉絲卻親自打過去說明她一定會去找他們,而也會帶上自己的一些朋友。
《生化危機3:滅絕》(英語:Resident Evil: Extinction),2007年首映的科幻動作驚悚電影。本片為2004年電影《生化危機2:啟示錄》的續集,同樣也是改編自Capcom遊戲系列《生化危機》。由拉塞爾·馬爾卡希執導,保羅·安德森製作,由米拉·喬沃維奇繼續主演。並且從系列遊戲《生化危機:聖女密碼》擷取些微情節至電影當中,並且也將遊戲的角色及創意加入到電影當中。與許多恐怖喪屍片拍攝自陰暗詭異的地點不同,本片在沙漠中取景。《生化危機3:滅絕》於2007年9月21日在美國、加拿大、墨西哥、臺灣上映,香港則於2007年10月4日上映。