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  閩南語維基百科可分為兩個不同的時期,自2004年5月之前的版本位於holopedia.net(名為Holopedia)。5月底開始與維基百科合作一個新版本。閩南語維基百科百科的發起人是戴凱序(Tè Khái-sū),他在2003年4月左右開始構想這個以白話字為載體的百科計劃。同年7月國立清華大學老師Tân Pe̍k-tiong建立了Holopedia.net。  Holopedia.net 是原版,與維基百科使用同一套軟體(MediaWiki),不過與維基百科無組織關係。 Tân Pe̍k-tiong 為holopedia.net的發起人兼行政人員。加入維基百科後,舊有的Holopedia就不再使用。當時一共有140篇文章。發展至2004年5月,向元維基申請以「zh-min-nan」為網域名開頭的維基百科計劃,但依"Ethnologue" 14版語言程式碼,網址開頭被指定為「zh-cfr」,經過溝通後,定為zh-min-nan.  早期使用者在加入維基百科的時候,希望使用zh-min-nan做網路域名。不過一開始時,有相關的技術人員表示異見。曾使用過 zh-cfr,這是ISO 639的zh和SIL的cfr湊成的程式碼;也使用過“minnan”,最後才改成zh-min-nan。後來ISO 639-3標準中的nan(屬於zho大分類)也可以使用,但網址和大多連結程式碼都尚未更改。2015年8月底,經由閩南語維基百科參與者投票,一致通過將zh-min-nan改為nan,但目前尚未變更。

  閩南語維基百科主要由幾十位熱心的維基人蔘與,雖然參與的人數甚少,有些拼寫或文句的錯誤可能短時間內未被發現,但是總體文章走向並未發生立場偏頗的現象。2015年6月初,閩南語維基百科擁有約一萬三千多條目,其時開始使用機器人建立大量條目,以每月逾一萬條目的速度增長,並於8月底超越粵文維基百科,成為第二大漢語族維基百科。同年12月底,成為第二部突破十萬條目的漢語族維基百科。2016年9月,成為第二部突破二十萬條目的漢語族維基百科。2020年3月,成為第二部突破三十萬條目的漢語族維基百科(此時其條目數於漢語族版本中佔比例約20%,而中文版條目數則佔70%)。  截至2020年1月底,閩南語維基百科已至少擁有條目[ 237,024]篇,自成立以來的頁面總編輯數2,003,541次,註冊使用者41,019名,活躍使用者67名左右。在條目數量方面,閩南語版本目前於維基百科所有語言中,排名第36名;在中,閩南語版本在數量上排名第二,僅次於中文版本。基礎條目品質位列96名,在漢語族版本里排名第三。

  此處羅列所有登上維基基金會新聞(Wikimedia News)有關閩南語維基百科的新聞記事:
閩南語維基百科(,原稱)是維基媒體基金會協作計劃的維基百科閩南語版本。閩南語維基百科書寫內容書寫閩南與臺灣文化,除了介紹閩南語文化風情之外,也對於化學領域、生物學相關條目有所著墨,也有漢族語言學相關條目。除了與閩南文化息息相關的風土民情,世界各國與中國大城市的條目也佔有些許的篇幅。