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  原址的首座聖誕教堂於327年由君士坦丁一世的母親海倫娜修建,於333年完成。但於529年撒瑪利亞起義的暴動中被破壞。  現存的聖誕教堂於565年由查士丁尼一世下令修建。當波斯帝國於614年入侵時,教堂未受破壞,傳說是由於牆上的壁畫中,東方三博士穿著波斯人的服飾向嬰孩耶穌朝拜,當時的司令沙赫巴勒茲(Shahrbaraz)看過壁畫後,下令不破壞這座教堂。至耶路撒冷王國時代,在拜占庭皇帝協助下,十字軍對教堂進行了維修及加建。

  現在,聖誕教堂由羅馬天主教、希臘東正教及亞美尼亞使徒教會共同管理。  教堂的入口於後期改建,變為十分狹窄,人要彎腰才能通過,因此有名為「謙卑之門」。傳說這是奧圖曼時代,基督徒為阻擋穆斯林騎馬進入,因此特意將門改小,以保護教堂。  教堂地底一個地下室,名為Grotto of the Nativity,相傳為耶穌基督誕生之確實位置,該處有一祭壇,並於雲石地臺上鑲有一粒14角銀星為標記。石面上有拉丁文寫著:Hic De Virgine Maria Jesus Christus Natus Est(這是聖母瑪利亞誕下耶穌基督之地)。  教堂所在的伯利恆,於1995年12月起交由巴勒斯坦管治。  2012年6月29日,聖誕教堂被列入世界文化遺產,成為巴勒斯坦的第一處世界遺產。
聖誕教堂(Church of the Nativity,香港慣稱主誕堂),位於巴勒斯坦伯利恆馬槽廣場,是世界上仍在使用的最古老教堂之一。教堂建於耶穌誕生之地馬槽原址之處。公元614年波斯帝國入侵,曾經破壞不少基督教聖地,但這座教堂卻未受破壞並儲存至今。