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  動眼神經的神經核位於中腦的上丘部位的Edinger-Westphal nucleus. 為支配眼肌的主要運動神經,包括運動纖維和副交感纖維兩種成分。動眼神經起自中腦上丘水平的動眼神經核,此核較大,形狀不規則,長約5～6mm。動眼神經核可分為三部分: 1外側核為運動核,位於中腦四疊體上丘水平的導水管周圍腹側灰質中,左右各一。發出的運動纖維走向腹側,穿過紅核組成動眼神經,由中腦腳間窩出腦,在大腦後動脈與小腦上動脈之間穿過,向前與後交通動脈伴行,穿過海綿竇之側壁經眶上裂人眶(лат. fissura orbitalis superior),支配上瞼提肌、上直肌、內直肌、下斜肌、下直肌。 2正中核或稱佩利阿(Perlia)核,位於中線上,兩側E-w核之間,不成對,發出的副交感神經纖維到達兩眼內直肌,主管兩眼的輻輳運動。 3埃一魏(Edinger-Westphal,E-W)核位於正中核的背外側,中腦導水管周圍的灰質中,發出的副交感神經節前纖維人動眼神經,至睫狀神經節交換神經元,其節後纖維支配瞳孔括約肌和睫狀肌,得瞳孔放大及晶體變厚而視近物,參與縮瞳和調節反射。

  動眼神經控制位於眼球外圍能轉動眼球的四條肌肉,另外有兩條肌肉分別由腦神經IV與VI控制。它們分別是: 動眼神經亦控制著眼球內負責調整水晶體厚度的睫狀肌(ciliary muscle)。
動眼神經(oculomotor nerve),是12對腦神經之中的第三對,編號III。負責控制眼球的轉動、眼球內水晶體厚度的調整、瞳孔的縮放。