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  毖鱷龍的正模標本(編號NHM R 42997)是一塊不完整的右股骨,只有股骨的上半段,長31.2公分,由於化石的裂口完整,可能挖掘過程時的斷裂,而化石發現於荷蘭的馬斯特裡赫特附近。在1883年,被哈利·絲萊(Harry Seeley)命名為斑龍的一個種,佈雷達氏斑龍("Megalosaurus bredai");種名是以荷蘭生物學家兼地質學家Jacob Gijsbertus Samuël van Breda為名,他曾擔任泰勒斯博物館的館長,並在1820年代到1860年代,買下荷蘭St Pietersberg的黏土層採石場所挖掘出的化石。在1867年,van Breda逝世,他所收藏的標本都賣給英國自然歷史博物館。在1892年,古動物學家Johan Casimir Ubaghs將其中一些牙齒歸類於滄龍屬的一種,"Mosasaurus bredai"。  由於化石是透過購買取得,所以無法準確地測定化石的年代,只能知道來自於馬斯特裡赫特階。但根據該地層目前所挖出的恐龍化石,該地層的年代約6600萬到6500萬年前,相當於馬斯特裡赫特階末期。  在1926年,弗雷德裡克·馮·休尼(Friedrich von Huene)重新研究這些化石,並發現它們與斑龍有許多差異;在19世紀到20世紀早期,斑龍是個「未分類物種集中地」,許多無法歸類的大型肉食性恐龍被歸類於斑龍屬。休尼認為這些化石其實是屬於似鳥龍下目,並且暫時命名為「Ornithomimidorum b」。除此種之外,"M. lonzeensis"也被重新歸類於似鳥龍類,暫時命名為「Ornithomimidorum a」,但是"Ornithomimidorum"是個沒有經過正式命名的無資格名稱。直至1932年,休尼才正式將化石命名為毖鱷龍,屬名在古希臘文意為「β鱷魚」。

  由於毖鱷龍的化石是一個不完整的股骨,因此很難確認毖鱷龍在獸腳亞目的演化位置、分類關係。在1972年,戴爾·羅素(Dale Russell)提出毖鱷龍屬於似鳥龍科,與休尼的最初理論相同,但羅素也提出毖鱷龍是個不確學名(Nomen vanum)。某些學者仍將這個化石列名為佈雷達氏斑龍,而非毖鱷龍,例如大衛·諾曼(David Norman),諾曼則認為該種是個疑名。  在1991年,Jean le Loeuff、埃瑞克·比弗託(Eric Buffetaut)提出毖鱷龍是種小型阿貝力龍科恐龍,是塔哈斯克龍的近親,但是化石不夠完整,因此是個疑名。他們發現這個股骨幹相當狹窄,股骨頭前方沒有突起,小粗隆部的下方沒有小孔。此外,股骨的一些特徵,與食肉牛龍的股骨特徵類似,可能是同源演化的結果。由於股骨的第四粗隆部的位置較高,他們排除毖鱷龍屬於似鳥龍類的可能性。  在1997年,肯尼思·卡彭特(Kenneth Carpenter)、戴爾·羅素等人提出毖鱷龍屬於暴龍超科,是傷龍的近親。在2004年,R.S. Tykoski與T. Rowe將毖鱷龍歸類於阿貝力龍超科恐龍。  到目前為止,毖鱷龍、正骨龍是少數發現於荷蘭的恐龍化石,毖鱷龍也是馬斯特裡赫特地層(Maastrichtian Beds)的唯一獸腳類化石。
毖鱷龍屬(學名:,意為「第二隻鱷魚」)是獸腳亞目恐龍的一屬,生存於白堊紀末期的歐洲。