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  1946年9月24日,中共中央東北局批准成立吉林大學的前身東北行政學院。  1946年10月5日,東北行政學院於東北解放區首府哈爾濱成立,由東北行政委員會直接領導。東北行政委員會主席林楓兼任院長,東北行政委員會民政委員會副主任魏震五兼任院務主任。  1946年9月,東北行政委員會接收私立哈爾濱大學(“滿洲國”時期1937年哈爾濱王道書院建立,日本投降後改為哈爾濱國學院,1946年哈爾濱國學院升格為私立哈爾濱大學,校長由東北行政委員會教育委員會主任委員車向忱兼任),改為市立大學,任命東北行政委員會教育委員會主任車向忱為校長,來自延安中央青委的幹部何禮為副校長。

  1948年5月,哈爾濱大學與東北行政學院合併,改稱東北科學院。院長仍由林楓兼任,副院長是車向忱、王一夫。  1948年7月6日,東北科學院開學典禮。東北科學院分設理工系、農林系、教育系、行政系、公安系。

  1948年11月,東北科學院遷往瀋陽,複名為東北行政學院。於12月開學。林楓任院長,王一夫任副院長。分設行政、教育、司法3個系,1個師範部。東北科學院美術系併入東北大學,東北科學院醫學系併入哈爾濱醫科大學,東北科學院農林系併入東北農學院。  1949年5月,原嫩江省民政廳廳長劉靖被任命為東北行政學院第一專職副院長。  1949年8月1日,中共中央東北局和東北行政委員會頒佈了《關於整頓高等教育的決定》。根據此決定,東北行政學院定位為“培養與訓練行政幹部的高等行政學校”。

  1950年3月31日,東北人民政府決定:東北行政學院更名為東北人民大學,任命王一夫為校長,劉靖為副校長。先後設立了行政、教育、司法、財政、銀行、會計、工廠管理7個系,以及俄文、會計兩個專修科和工農幹部文化補習班、地方幹部訓練班、合作幹部訓練班和第一期研究班。  1950年6月,朝鮮戰爭爆發。學校奉命從瀋陽遷至長春。  1950年9月4日,東北人民政府正式下達疏散命令,學校開始搬遷,9月16日最後一批學生到達長春。東北人民大學遷至長春後,佔用瞭解放大路北側的滿炭株式會社大樓及附近的幾處樓舍,並立即復課。  1950年11月3日,中共東北人民大學委員會成立,副校長劉靖兼任黨委書記。  1951年3月開始,增設貿易系、合作系、經濟系。把財政系與銀行系合併為財政信貸系,會計系改為會計統計系,俄文專修科改為俄文系。 1951年8月29日,校長王一夫調任中央內務部副部長,馬克思主義歷史學家、東北文教委員會副主任呂振羽來校,任校長兼黨委書記。 1951年10月15日,經校務委員會通過,由校長髮布實施《東北人民大學章程》,對學校的性質、任務、培養目標、機構設定、職責分工等都作了明確規定。  1952年10月,在中華人民共和國範圍內進行了院系調整。東北人民大學由財經政法性質的大學,改為東北地區第一所綜合性大學。中央高教部將北京大學、清華大學、燕京大學、北京師大、輔仁大學、大連工學院、東北工學院等院校的部分教師,以及大連工學院、東北工學院的數理兩系的部分學生調整到東北人民大學。王湘浩、江澤堅、謝邦傑、徐利治、王柔懷、餘瑞璜、吳式樞、朱光亞、霍秉權、鄭建宣、蔡鎦生、唐敖慶、關實之、陶慰蓀、楊振聲、馮文炳、趙西陸、劉禹昌、丁則良等一批知名學者來東北人民大學任教。 1952年,數學家王湘浩教授建立數學系;物理化學家蔡鎦生教授、理論化學家唐敖慶教授、無機化學家關實之教授、生物化學家陶慰蓀教授創立了化學系;固體物理學家餘瑞璜教授等人建立了物理系。文科在原有基礎上調整為中文、歷史、法律、經濟、俄文5個系。成為文理兼備的綜合性大學。  1953年9月,東北人民大學首次正式招收研究生16人,其中物理、化學系各5人,學制3年;文科6人,2年畢業。  1955年5月,呂振羽、王湘浩、餘瑞璜、唐敖慶教授被評選為中國科學院學部委員。  1955年5月,匡亞明來東北人民大學任校長兼黨委第一書記。  1955年5月28日至6月5日,東北人民大學舉行第一次黨員代表大會。匡亞明任第一書記,江劍秋任副書記。  1955年7月,呂振羽離校,調任中國社會科學院歷史研究所研究員、中央民族事務委員會委員。

  1957年8月27日至30日,召開第二次全校黨員代表大會,匡亞明任黨委第一書記。根據中央關於改變教育領導體制的決定,東北人民大學領導權劃歸吉林省,1958年8月11日,經中共吉林省委和吉林省人民委員會決定東北人民大學正式更名為吉林大學,郭沫若為吉林大學題寫校名。  1958年9月,吉林大學新建原子能系和哲學系。任命唐敖慶教授兼原子能系主任,任命劉丹巖教授為哲學系主任。 1958年秋,鄧小平為吉林大學題詞:“把勞動和教育結合起來,是培養具有共產主義品德和真實本領的年青一代的根本道路”。  1958年11月,召開第三次黨員代表大會,選舉匡亞明為黨委第一書記,陳靜波為第二書記。  1959年2月,吉林大學在中華人民共和國國內率先成立了半導體系和無線電電子學系。高鼎三副教授任半導體系主任,黃振邦副教授任無線電電子學系主任。  1960年9月24日至28日,召開第四次黨員代表大會。匡亞明任黨委第一書記。 1959年9月,根據高教部的要求,吉林大學本科專業學科由四年改為五年。  1960年成立外文系。  1960年10月22日,黨中央正式批准吉林大學為重點綜合性大學。  1962年1月6日至14日,召開第五次黨員代表大會,匡亞明任黨委第一書記。  1963年5月,匡亞明調任南京大學校長,吉林大學由劉靖代校長。  1964年10月27日至11月1日,召開第六次黨員代表大會,陳靜波任黨委第二書記。

  1966年5月至1976年10月的“十年動亂”中,教學和科研均遭到嚴重的破壞。吉林大學更名為“東北人民大學”。1966年6月,東北人民大學師生開始“揭發”前校長兼黨委書記匡亞明問題。6月初,中央廣播電臺播放《人民日報》《打倒匡亞明黑幫》的文章。1966年“文化大革命”開始,匡亞明成為全國範圍內首先被打倒的物件之一。吉林大學學生乘火車南下將已經時任南京大學校長的前校長匡亞明抓捕回長春,進行公開批鬥。  1970年12月22日至24日,召開第七次黨員代表大會,軍宣隊負責人王貴德任黨委書記。

  1976年,建立了電腦科學系。  1977年11月,建立了理論化學研究所。  1977年,吉林大學開始招收四年制本科學生。正式恢復全國統一考試的招生制度。  1978年3月20日舉行了本科新生開學典禮,10月15日研究生開學。  1978年,吉林大學被重新確定為教育部直屬國家重點綜合性大學。  1978年4月,胡紹祖來吉林大學任黨委書記,7月,唐敖慶被任命為校長。  1980年1月,吳式樞教授被評為中國科學院學部委員。 1981年,成立人口所。  1983年4月,成立古籍整理研究所。  1983年9月,建立政治學系,是中國高等院校中第一個恢復、建立的政治學系。  1984年2月,中央批准吉林大學組成新的領導班子,溫希凡任黨委書記,唐敖慶任校長。  1984年6月,國務院批准,中華人民共和國22所重點大學首批試辦研究院,8月8日吉林大學研究生院成立。  1984年8月,成立分子生物學系。  1984年10月19日至22日,召開第八次黨員代表大會,溫希凡任黨委書記。  1985年9月1日,經國家教委黨組批准,吉林大學開始試行校長負責制。10月建立校務委員會,唐敖慶任主任。  1985年10月12日,吉林大學舉行首批博士學位授予大會,授予10位研究生以博士學位。  1986年1月,國家教委任命唐敖慶為吉林大學名譽校長,任命伍卓群為校長。  1986年10月,召開建校40週年慶祝大會。中國國家領導人彭真、李鵬、方毅、胡喬木為學校建校40週年題詞。  1986年,吉林大學決定在雙德鄉建設南校區。  1988年3月,召開第九次黨員代表大會,選舉胡德寶任黨委書記。  1988年7月,吉林大學舉行南校區建設工程開工儀式暨逸夫圖書館奠基典禮。  1989年10月,樊萬清調任吉林大學黨委書記。 1992年1月,孫家鍾教授、江元生教授、徐如人教授、沈家驄教授當選中國科學院學部委員。  1993年4月,吉林大學召開第十次黨員代表大會。劉中樹任黨委書記。  1995年7月,高鼎三教授當選中國工程院院士。  1995年9月,國家教委和吉林省人民政府共同組織了對吉林大學申請進入“211工程”的部門預審,專家一致建議通過吉林大學“211工程”部門預審。  1996年2月,國家教委任命劉中樹為校長、王文金為黨委書記。  1996年3月28日,國家教委批准正式建立吉林大學研究生院。  1996年9月21日、22日,以“振奮精神、凝聚力量、繼往開來、再創輝煌”為主題,舉行了建校50週年慶祝和紀念活動,中國國家領導人江澤民、李鵬、李瑞環、李嵐清、榮毅仁、費孝通、宋健等為吉林大學建校50週年題了詞。  1997年9月1日,國家教委黨組下發《關於吉林大學實行黨委領導下的校長負責制的通知》。  1997年9月2日至5日,召開中國共產黨吉林大學第十一次代表大會。黨委書記王文金代表上屆黨委作了題為《求實創新,勵志圖強,為建設社會主義大學而奮鬥》的工作報告。報告強調,學校由1985年9月開始試行的校長負責制,改為黨委領導下的校長負責制,是學校領導體制上的重要轉變,對加強和改善新形勢下黨委對學校工作的統一領導提出了更高的要求。  1998年,中華人民共和國全面推進以“共建、調整、合作、合併”為方針的高等教育管理體制改革。

  1954年建立長春汽車拖拉機學院, 1958年更名為吉林工業大學。

  1939年建立晉察冀軍區白求恩衛生學校和第十八集團軍衛生學校。  1948年與北方大學醫學院合編為華北醫科大學。  1951年命名為中國人民解放軍第一軍醫大學。  1959年更名為吉林醫科大學。  1978年更名為白求恩醫科大學。

  1951年建立長春地質專科學校。  1952年成立東北地質學院。  1958年更名為長春地質學院。  1997年更名為長春科技大學。

  1947年建立於黑龍江省佳木斯市。  1955年更名為長春電信學校。  1960年更名為長春郵電學院。

  1953年建立中國人民解放軍獸醫大學。  1992年更名為農牧大學。  1999年更名為軍需大學。

  2000年6月12日,根據國務院關於高教管理體制改革和區域性結構調整的決定,經教育部批准,原吉林大學與吉林工業大學、白求恩醫科大學、長春科技大學、長春郵電學院合併組建新的吉林大學。合併之後,由於規模龐大,又分佈在長春各處,有“美麗的長春市坐落在吉林大學校園當中”的美稱。  2002年1月13日,珠海市與吉林大學簽訂《珠海市人民政府、吉林大學合作建設吉林大學珠海校區協議書》,建立吉林大學珠海校區。  2004年5月20日,根據中華人民共和國教育部《教育部關於同意吉林大學與珠海興國教育投資有限公司合作試辦吉林大學珠海學院的批覆》,試辦吉林大學珠海學院。吉林大學珠海學院為獨立學院。  2004年8月29日,中國人民解放軍軍需大學番號撤銷。吉林大學與中國人民解放軍軍需大學合併,中國人民解放軍軍需大學更名為吉林大學和平分校,相對獨立辦學,具有獨立法人資格。  2005年1月7日,根據《關於軍需大學併入吉林大學後管理模式的若干意見》,明確了“軍需大學併入吉林大學後,成為吉林大學的一個校區(和平校區),改稱農學部。學校對學部實行統一領導和管理,按學校授權,學部相對獨立管理校區事務”。軍需大學軍校時代正式結束。  2006年9月,舉行了隆重的合校六週年暨建校六十週年校慶。  2007年3月19日,吉林大學財務處在校內網站公佈《關於召開徵集解決學校財務困難建議座談會的通知》(校財字[2007]9號)。通知中表示,從2005年起,每年貸款利息支出1.5億至1.7億元,大學財務出現困難,“向廣大師生徵集具有建設性、操作性強的合理化建議”。  2009年3月吉林大學艾滋病疫苗國家工程實驗室成立,依託生命科學學院。

  

  吉林大學擁有學科門類齊全的大學專業設定。現有9個學部,下設44個學院,另有4個直屬學院,共有16個專科專業,129個本科專業。

  

  根據各高校校友統計慣例以及吉林大學自身的發展歷史,凡曾在東北行政學院、東北科學院、東北人民大學、吉林大學(包括整體併入的吉林工業大學、白求恩醫科大學、長春科技大學、長春郵電學院、中國人民解放軍軍需大學)學習過的學生(包括肄業生、轉校生、畢業生、研究生、留學生)和工作過的教職工,均為吉林大學校友。
吉林大學(英語:Jilin University,縮寫為JLU),簡稱「吉大」,位於中國吉林省長春市,是中國共產黨親手建立的第一所綜合性高等學府,是中華人民共和國教育部直屬的全國重點大學,中國東北地區重點建設的一所綜合性大學,中國211工程、985工程高校之一,位列中國“雙一流”大學計劃世界一流大學(A類),同時也是國家首批“珠峰計劃”、“111計劃”、“卓越計劃”和“2011計劃”重點建設的名牌大學。多年來,吉大為國家培養了大批優秀的高素質人才,取得了許多重大的高水準科研成果,是中國基礎科學研究和高層次人才培養的重要基地之一。主要院系有法學院,考古學院,車輛工程學院,數學學院和化學學院等。