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  關於DNA連線酶的化學反應過程,首先是一條DNA的3'端要先修飾成羥基(OH),而另一條的5'端則是必須帶有磷酸,藉由DNA連線酶的作用促進磷酸雙脂鍵的共價鍵,同時核苷酸序列以嘌呤—嘧啶兩兩對應的方式完成配對,這樣才算完成反應。  用下面這張圖解來說明或許可以更清楚的說明反應過程:以黏性末端為例  反應後  DNA連線酶也可以處理鈍端,即就算沒有嘌呤—嘧啶配對的鹼基對,也是可以進行上述的反應。

  在哺乳類細胞,至少有四種黏合酶被發現與命名:

  前面提到,隨著分子生物學的進展,DNA黏合酶對於研究人員的貢獻也越來越顯得重要,尤其是在進行重組DNA實驗時更是不可或缺。比如說,科學家需要表現某個抗藥基因,首先就事先利用限制酶將這一段基因的兩端修飾成可黏合的末端,另外透過同樣的限制酶將準備用來承接表現一段基因的質體修飾成可與該段基因進行黏合的兩端,這時候透過T4噬菌體所攜帶的DNA連線酶(T4 DNA ligase)將抗藥基因與質體黏合在一起,這整個操作的過程就稱作DNA重組,而在這裡所使用的T4噬菌體DNA連線酶則是最廣為使用的DNA連線酶。
DNA連線酶(),也稱DNA黏合酶,在分子生物學中扮演一個既特殊又關鍵的角色,那就是把兩條DNA黏合成一條。無論是雙股或是單股DNA的黏合,DNA連線酶都可以藉由形成磷酸雙脂鍵將DNA在3'端的尾端與5'端的前端連在一起。雖然在細胞內也有其他的蛋白質,例如像是DNA聚合酶在其中一股DNA為模板的情況下,將另一邊的DNA單股斷裂端,透過聚合反應的過程形成磷酸雙脂鍵來黏合DNA。但是DNA聚合酶的黏合過程卻只是聚合反應一個附帶的功能而已,真正在細胞內扮演DNA黏合反應的工作還是以DNA連線酶為主。