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  據《日本書紀》卷第一所載,開天闢地後緊接著便是眾神的誕生。天裡化生了天御中主尊(男性,或稱天常立尊、國常立尊、國狹槌尊、豐斟渟尊)・可美葦牙彥舅尊(男性),這二尊神皆是未結婚。天御中主尊位於天庭中央,主宰萬物。  次化生埿土煑尊(男性)・沙土煑尊(女性)・大戸之道尊(男性,或稱角樴尊)・大苫邊尊(女性,或稱活樴尊),次面足尊(男性,或稱青橿城根尊、沫蕩尊)・惶根尊(女性),次伊奘諾尊(男性)・伊奘冉尊(女性)・高皇產靈尊(男性)・神皇產靈尊(女性)。

  二神為夫婦而生日本列島,與生自然神祇們。二神生日神(天照大神),次生月神(月讀尊),次生蛭兒,次生素戔嗚尊,次生火神(軻遇突智)。直到火神誕生,伊奘冉尊被燒傷而死。伊奘諾尊下黃泉尋找伊奘冉尊,但最後仍是絕裂。伊奘諾尊返回地面後,再洗濯身上的穢物,過程中再產生一些神祇。
日本神話是日本人對自然界、人類世界的種種現象以及倭王權的起源的神格化。後來由於中國文字的傳入,各氏族便藉由漢字,將神話、傳說等故事記載下來。至公元8世紀,由於已確立了律令國家的基礎,日本天皇遂下令編纂《古事記》(公元712年成書)、《日本書紀》(公元720年成書)等書籍,以統合各氏族的神話、傳說。這些神話反映了當時日本人的生活,和他們的宇宙觀、生死觀、宗教觀等的多種思維方式。大多數學者認為日本神話的文書系統以及組織形式都深受中國和印度的影響,這與中國的儒家與印度的佛教傳入有關,另外,統治階級選擇將中國的道教思想及印度的佛教融和進日本的神話中是出於政治利益考慮的。公元5世紀後,佛教傳入日本,一部分皈依佛教的大臣與堅守傳統神道的大臣以各自的信仰為幌子作權力的爭鬥。