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  深圳證券市場在1986年起步,《深圳經濟特區國營企業股份化試點暫行規定》出臺,國有企業為擺脫經營困境進行了股份制改造。1988年4月1日,深圳發展銀行在特區證券公司的櫃檯上開始了最早的證券交易。隨後深圳市國投證券部和中行證券部相繼開業,萬科、金田、安達、原野(世紀星源的前身)等也陸續發行了股票並上櫃交易,構成了深圳證券市場的雛形。  1988年6月,深圳市政府成立了證券市場領導小組,研究籌建證券市場。1989年11月,深圳市政府作出了建立深圳證券交易所的決定。

  1990年12月1日,深交所試營業。王健、禹國剛先後被深圳市政府任命為主持工作的副總經理。由於六四事件的影響,中國改革開放受阻,證券市場受到波及。1992年1月,鄧小平南巡,拯救了中國的資本市場,以及上海證券交易所和深圳證券交易所。  1992年8月9、10、11日深圳發售1992年新股認購抽籤表,發生風波。11日受發售新股抽籤表影響,深圳證券市場領導小組決定深圳證券交易所停市半天。深交所成立初期歸屬中國人民銀行深圳市分行管理,1993年4月1日深圳證券管理委員會成立以後歸屬由人民銀行變為深圳證券管理委員會。

  1995年2月23日,上海證券交易所出現了著名的327國債事件,導致了管金生帶領的上海萬國證券倒閉,國債期貨市場上鉅額資金不斷互相廝殺,1995年5月18日根據中國證監會緊急通知,國債期貨交易暫停試點,各交易所組織會員協議平倉。此後一段時間深圳股市發生劇烈震盪,22日股市成交47.4億元,創本年最高紀錄;綜指收報169.65,成指收報1415點,為本年最高點,三日累計升幅44.78%,其後一週跌幅19.32%。30日國債期貨平倉順利結束,22日-30日共平倉68萬口。  隨著深交所的交易逐步活躍,上市公司數量逐漸擴大,導致所影響的範圍不斷擴大,再加上1996年牛市行情中深圳市與上海市為維護深交所、上證所爆發的競爭,1997年8月15日起,國務院決定,將深圳證券交易所劃歸中國證監會直接管理,證券交易所的總經理和副總經理由中國證監會任命,理事長、副理事長由中國證監會提名,理事會選舉產生。  1999年5月19日深滬股市爆發井噴式行情,稱為“5·19”行情,當天滬深指數分別上漲超過4%和5%,之後兩個多月間兩市指數上漲超過60%,日均交易量達到近300億元。

  2000年2月15日,上市公司億安科技報收於104.39元,成為自1992年國內股票面值拆細為一元之後,第一隻市價超過百元的股票。  2000年10月,為配合創業版籌建,深交所A股新股發行及上市被全部停止(除了深滬兩交易所外,包括北京在內的多個城市也迅速展開了圍繞創業板市場地點的激烈競爭。2000年8月,深交所公佈創業板的相關規則,標誌深圳在這場角逐中最終勝出)。直到2004年5月17日設立中小企業板(簡稱中小板)後,2004年6月25日新和成等八家公司掛牌上市,才標誌著深交所又重新恢復了新企業上市。2008年,國際金融危機波及全球經濟。為實現中國經濟持續健康發展,各界均呼籲儘快推出創業板。2008年12月8日,國務院辦公廳釋出《關於當前金融促進經濟發展的若干意見》,明確提出“適時推出創業板”。2009年10月23日,深交所創業板正式啟動。10月30日,首批28家創業板上市公司在深交所集中上市。創業板啟動標誌著多層次資本市場體系架構初步確立。  2004年9月6日,聯合上海證券交易所和中國證券登記結算公司釋出並實施《上市公司股權分置改革業務操作指引》。

  

  2005年1月14日釋出的《深圳證券交易所證券程式碼、證券簡稱編制管理辦法(修訂稿)》規定,深證所證券程式碼採用六位數的數字型編制方法。首位程式碼為證券品種區別程式碼。其中0字開頭的程式碼為A股證券及其衍生品種的證券程式碼;1字開頭的程式碼為基金、債券及其衍生品種的證券程式碼;2字開頭的程式碼為B股股票及其衍生品種的證券程式碼;3字開頭的程式碼為創業板股票及其衍生品種、指數、統計指標、網路投票的證券程式碼;4字開頭的程式碼為代辦轉讓股票等的證券程式碼。
深圳證券交易所(簡稱深交所;英語:Shenzhen Stock Exchange,縮寫為英語:SZSE)成立於1990年12月1日,是中國大陸兩所證券交易所之一,位於廣東省深圳市福田區深圳證券交易所運營中心。深圳證券交易所於1989年11月15日籌建,1990年12月1日開始集中交易(試營業)。深交所是為證券集中交易提供場所和設施,組織和監督證券交易,履行國家有關法律、法規、規章、政策規定的職責,實行自律管理的法人,由中國證券監督管理委員會監督管理。深交所的主要職能包括:提供證券交易的場所和設施;制定業務規則;稽核證券上市申請、安排證券上市;組織、監督證券交易;對會員進行監管;對上市公司進行監管;管理和公佈市場資訊。其主要指數為深證指數。