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  NCBI自1992年開始負責維護DNA生物資料庫GenBank。GenBank資料庫每日都會實時更新並和另外兩家資料庫(歐洲的EMBL與日本的DDBJ)交換資料,以確保三家資料庫的序列資料的一致性。 自1992開始,NCBI陸續將其它資料庫與GenBank整合起來,包括Gene (資料庫)、線上人類孟德爾遺傳資料庫、 分子模型資料庫(一個蛋白質三維結構資料庫)、dbSNP(一個單核苷酸多型性資料庫)、Reference Sequence Collection(一個人類基因組圖譜)以及分類學瀏覽方式和美國國家癌症研究所提供的癌症基因組計劃資料。NCBI也對每一個物種都設立了一個分類編號(taxonomy ID number)。  NCBI提供的一些線上軟體可供FTP或WWW瀏覽,比如BLAST序列相似性比對程式,可在15秒內完成與GenBank資料庫的序列比較。

  NCBI書架是一個集合了可以自由獲取、下載的線上精選生物醫學書籍資料庫。截至2011年4月,書架有845本書籍,涵蓋廣泛的主題包括分子生物學、生物化學、細胞生物學、遺傳學,和微生物學。從分子和細胞從角度分析的疾病狀態、研究方法,和病毒學。一些書是以前出版的圖書的線上版本,而其他如Coffee Break(書)是由NCBI的工作人員編寫和編輯。書架是同行評審的Entrez PubMed庫的期刊摘要的補充,因為它能提供前沿領域的已確立的的觀點,並整理許多不同的零散的研究報告。

  BLAST是用於計算生物序列之間的序列相似性的演算法,例如DNA的核苷酸序列和蛋白質的氨基酸序列。BLAST是查詢與同一生物體內或不同生物體中的查詢序列相似的序列的有力工具。 它搜尋NCBI資料庫和伺服器上的查詢序列,並將結果以選定的格式釋出回該人員的瀏覽器。BLAST的輸入序列大部分採用FASTA或Genbank格式,而輸出可以以各種格式(如HTML,XML格式和純文字)傳送。 HTML是NCBI網頁的預設輸出格式。 NCBI-BLAST的結果以圖形格式顯示,找到所有命中結果,具有具有得分相關資料的命中結果的序列識別符號的表格,以及感興趣序列的比對以及用於這些的類似BLAST得分的命中結果。

  Entrez全球查詢跨資料庫搜尋系統在NCBI中用於所有主要資料庫,如核苷酸和蛋白質序列,蛋白質結構,PubMed,分類學,完整基因組,OMIM等。Entrez是既具有生物醫學研究來源的資料的索引和檢索系統。NCBI於1991年分發了第一版Entrez,由蛋白質資料庫(PDB)和GenBank的核苷酸序列,SWISS-PROT,翻譯的GenBank,PIR,PRF和PDB的蛋白質序列組成,PubMed的相關摘要和引文。 Entrez專門設計用於將來自不同來源,資料庫和格式的資料整合到統一的資訊模型和檢索系統中,可以有效地檢索相關的參考文獻,序列和結構。
國家生物技術資訊中心(National Center for Biotechnology Information,簡稱NCBI)是美國國家醫學圖書館(NLM)的一部分(該圖書館是美國國家衛生研究所的一部分)。NCBI位於美國馬里蘭州的貝塞斯達,建立於1988年。