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  有胚植物是在古生代時期從複雜的綠藻發展而來的。有胚植物現存的最緊密的親戚是輪藻。 這些藻類經歷單倍體世代(配子體)和雙倍體世代(孢子體)的世代交替。  顯微鏡下,有胚植物的細胞結構類似於綠藻,區別在於細胞分裂時有成膜體形成細胞壁。有胚植物的另一個不同點是有一個較大的中央液泡,其膨壓提供植物細胞的支援力,使它能維持形狀。  多細胞藻類雖然也有世代交替,但是有胚植物的名稱來自於在母本的配子體組織中養育受精卵——孢子體胚胎這一共有衍徵。  最早的有胚植物的孢子體在結構和功能上差別很大,仍舊很小並在短暫的生命週期中依賴於母體。這種植物被稱為苔蘚植物,現存的有:  所有苔蘚植物都相對小並侷限於潮溼環境中,依賴水來散播它們的孢子。有一些植物在志留紀更好地適應了新出現的陸地環境,並在泥盆紀變得多樣化,同時傳播到不同的陸地環境。這些植物被稱為維管植物或導管植物。維管植物具有維管組織或管胞,水分通過維管在植物體內輸送,外面還有防止乾燥的表皮。大部分維管植物的孢子體已經發展成獨立的植株,已經進化出真正的葉,莖和根,但配子體仍然很小。  但有的維管植物依然依靠孢子繁殖,現存有:  其他種類的維管植物是在古生代後期出現的,已經不用孢子繁殖,進化出可以抵禦乾燥的種子,所以叫做種子植物。種子植物的有受精卵發育的整個幼年孢子體都包含在種子之中,有的種子即使它們的母體是生長在多水的環境之下,也可以抵禦極度乾旱的環境。種子植物現存有:  前四類被稱之為裸子植物的多系群,因為它們的胚珠是裸露的,不被心皮包裹。相對地,被子植物的胚珠是被心皮包裹,形成果肉。被子植物是在侏羅紀才最後出現的一類植物,在白堊紀時迅速繁殖,成為現代地球陸地上最大的生物量組成部分。  目前植物分類學上意見並不統一,有的分類學家認為植物界只包括有胚植物,但也有些分類學家認為有胚植物單獨應該算做一門,他們將陸生植物和輪藻一起劃為一個亞門。

  植物高層的分類變動得非常地大。一些學者認為植物界只包括有胚植物,而其他學者則有不同的命名和規範。此處列出的類群通常被視為門,但有時也會被視為綱,且偶爾會被縮至只剩兩個門。一些分類學則將有胚植物放在總門上,並將其和部分輪藻一起歸為一個亞界,稱之為鍊形植物亞界。  從分子生物學角度看,有胚植物和綠藻形似,它們都具有真核,有由兩層原生質分泌形成的,有葉綠體可以進行光合作用生成澱粉,主要葉綠體都是由葉綠體a和葉綠體b組成的,兩者都有大液泡,沒有中心質,除了配子以外也都沒有鞭毛。  傳統上高等植物包括四個門:苔蘚植物門、蕨類植物門、裸子植物門和被子植物門。苔蘚和蕨類又合稱頸卵器植物;蕨類植物、裸子植物和被子植物又合稱維管植物,裸子植物和被子植物合稱種子植物,顯花植物。
有胚植物,又稱為高等植物,是那些最熟悉的植物,包括苔蘚植物門、地錢綱、角苔綱、蕨類、石松、裸子植物、開花植物等,但不包括綠藻。有胚植物都是具有專門的生殖器官的複雜多細胞真核生物,除極少例外,都通過光合作用獲取能量,如吸收光,從二氧化碳中生成養料。有胚植物具有的特化的生殖器官中有非生殖性的組織,這一點可以與多細胞藻類相區分。有胚植物主要是適應陸地的生活環境,雖然有些再一次進入水中生活,這樣,有胚植物也被稱為陸生植物。