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  術語化學資訊學(Cheminformatics)是1998年被F.K. 布朗定義的: 化學資訊學是這些資訊資源的混合,將資料轉化為資訊和資訊轉化為知識,以便在藥物導向識別和優化領域更快地做出更好的決策。 從那時起,兩種拼寫已被使用,有些已經演變為化學資訊學(英語:Cheminformatics),而歐洲學術研究會於2006年設立為化學資訊學,最近成立的《化學資訊學學報》(Journal of Cheminformatics)是對較短變體的強力推動。

  化學資訊學將化學,電腦科學和資訊科學的科學工作領域結合在化學空間中的拓撲,化學圖論,資訊檢索和資料探勘領域。化學資訊學也可以應用於各種行業,如紙張和紙漿,染料和相關行業的資料分析。

  

  化學資訊學的主要應用是儲存,索引和搜尋與化合物有關的資訊。這種儲存資訊的有效搜尋包括電腦科學中作為資料探勘,資訊檢索,資訊抽取和機器學習的主題。相關研究課題包括:

  化學結構的計算機表示使用專門的格式,例如基於XML的化學標記語言或簡化分子線性輸入規範(SMILES)。 這些表徵通常用於儲存在大型化學資料庫中。 雖然一些格式適用於2或3維的視覺表示,但其他格式更適合於研究物理相互作用,建模和對接研究。

  化學資料可以涉及真實或虛擬分子。可以以各種方式產生化合物的虛擬圖書館以探索化學空間,並假設具有所需性質的全新的化合物。  最近使用FOG(片段優化生長)演算法生成化合物類(藥物,天然產物,多樣性合成產品)的虛擬文庫 。這是通過使用化學資訊工具來訓練馬可夫鏈在真實化合物類別上的轉變概率,然後使用馬爾可夫鏈產生類似於訓練資料庫的全新化合物。

  這是定量結構-活性關係和定量結構性質關係值的計算,用於預測其結構中化合物的活性。在這種情況下,化學計量學也和它有很強的關係。化學專家系統也是相關的,因為它們代表化學知識的一部分,作為計算機(In silico)表示。有一個相對較新的匹配分子對分析或預測驅動的MMPA的概念,它與QSAR模型相結合,以便識別活動懸崖。
化學資訊學(英語:Cheminformatics)是使用計算機和資訊科技應用於化學領域的一系列問題。這些計算機(In silico)技術被用於在製藥公司的藥物發現過程中。這些方法也可以以各種其他形式用於化學和相關行業。