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  牙菌斑由食物殘渣、脫落的口腔上皮細胞、唾液和細菌構成。牙菌斑中的細菌主要是正常口腔記憶體在的鏈球菌、厭氧菌等。牙菌斑堆積到一定厚度之後,其內部緊挨牙齒表面的細菌因為與空氣隔絕開始轉入無氧呼吸。無氧呼吸在此處產生的酸不能及時被唾液沖走,因此會腐蝕琺琅質中的礦物成分,並進一步造成齲齒。

  牙菌斑在牙齒上會形成蛀牙,在牙根處堆積的牙菌斑也會刺激牙齦導致牙齦炎,當發展到牙齒周圍骨頭時就稱為牙周炎等牙周疾病。  如果有以下情形,可能有牙齦方面的疾病:

  牙菌斑對牙齒的危害隨其沉積時間而增強,所以應該定期清除。牙菌斑的質地很軟,可以用牙刷、牙膏來有效清除,刷牙重點在於牙齒本身清潔、牙齦與牙齒之間的淺溝以及牙齒與牙齒之間的牙齦縫隙(齦乳頭),將口腔內、特別是以上三個區域刷乾淨,確定沒有食物殘渣。一般每天早晚刷牙2次即可達到較好的效果。在牙齒之間等不容易刷到的地方可以使用牙線。洗牙可以進一步保證牙菌斑的徹底清除,洗牙有手動洗牙跟超音波洗牙兩種,手動洗牙取決於醫生技術,超音波洗牙可以提高洗牙速度降低醫生勞動。  長期沉積的牙菌斑如果磷含量超過一般牙菌斑3倍、鈣含量也較高,在結合了唾液中可溶性的碳酸鹽與磷酸鹽礦物質等成分後,會鈣化形成硬質的牙結石,牙結石表面粗糙無比,更容易產生牙菌斑。牙石令牙齒與牙肉交界處的清潔變得困難,容易造成細菌聚積,導致牙肉長期發炎,繼而演變為牙周病。牙結石一般緊密附著在牙齒表面,其去除需要由牙醫等專業人士進行。
牙菌斑是在牙齒表面逐漸沉積的生物薄膜,薄的牙菌斑顏色通常是透明無色,但變厚時會呈現黃色或棕黃色,如果使用牙菌斑顯示劑可以很容易看到牙菌斑在口腔內的分佈。