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  1930年11月7日,菲律賓共產黨在共產國際的幫助下成立,由菲律賓人民黨和菲律賓社會黨(1932年)的成員組成。1942年,菲律賓共產黨領導虎克軍發動抗日叛亂。1950年,虎克軍改組為“人民解放軍”,繼續反對菲律賓政權。然而到1954年底,武裝鬥爭實際上已經結束。

  1960年代,黨內的毛派組織了愛國青年、Malayang Kilusan ng Kababaihan等群眾組織,並進行馬克思列寧主義毛澤東思想的理論研究。毛派主張黨目前的行動無效、右傾機會主義和冒險主義。1967年毛派被黨開除,1968年12月26日,他們建立了現在的菲律賓共產黨。新人民軍由何塞·馬利亞·西松和貝爾納貝·布斯凱諾組建,作為菲律賓共產黨的武裝部隊。毛派領導人主張毛主義,放棄了改良主義思想。後者使舊菲律賓共產黨與馬科斯政府合作。菲律賓共產黨目的是通過持久人民戰爭、民族民主革命來建立一個社會主義國家。據估計,菲律賓共產黨最初的軍隊擁有約60名游擊隊員,35件武器。在馬科斯政權統治下,其實力迅速增長。 1973年4月24日民族民主陣線成立,以使接受他們「12點綱領」的組織與之團結,並與印度和尼泊爾等地的其他共產黨建立國際關係。  1971年8月21日,在馬尼拉自由黨集會上,新人民軍武裝分子向舞臺投擲了兩枚手榴彈,導致9人死亡,95人受傷。1972年,新人民軍開始全面叛亂,主要依靠基於社群的小型武裝宣傳部隊。1972年9月21日,費迪南德·馬科斯總統宣佈戒嚴。1974年,新人民軍在卡爾比加發動了第一次戰術行動,伏擊了一支陸軍巡邏隊並取得其武器。  中國從1969年至1976年為新人民軍提供支援。此後,中國停止了所有援助,導致活動衰弱了五年。儘管經歷挫折,革命稅、敲詐勒索和大量的外國資助重新點燃了叛亂。菲共和新人民軍試圖爭取來自朝鮮勞動黨、巴勒斯坦解放組織的毛派、日本赤軍、桑地諾民族解放陣線、薩爾瓦多共產黨、祕魯共產黨和阿爾及利亞的支援。上述組織提供了財政援助、培訓和其他形式的資助。據稱,民族民主陣線有在香港、比利時和南斯拉夫設立貿易公司。與此同時,菲律賓共產黨在荷蘭設立了支部,並派代表前往德國、法國、義大利、希臘、愛爾蘭、美國、瑞典以及中東各地。儘管得到了大量的援助,但是隨著1990年代社會主義政府在世界範圍內崩潰,外國的援助最終枯竭。  在20世紀70年代到80年代,成千上萬的志願者,包括來自城市和農村地區的青年和青少年,加入了該組織。1992年,新人民軍分裂為支援西松的重申派和主張組建更強軍隊並發動城市叛亂的反對派。在新人民軍的歷史上,有13個較小的派系分裂出去。 同時進行的摩洛叛亂為新人民軍的發展創造了有利條件。在20世紀70年代,儘管政府和摩洛伊斯蘭解放陣線於1976年達成了和平協議,但是75%的菲律賓武裝部隊仍繼續部署在摩洛島。截至2000年,有40%的菲律賓武裝部隊繼續與摩洛叛軍交戰。  2001年,菲律賓武裝部隊發起了一場有選擇性的法外處決專案,以壓制新人民軍的活動。其目標是摧毀共產黨的政治基礎設施。該專案效仿了鳳凰計劃(美國在越南戰爭期間實施的專案)。卡爾加里大學威廉·諾曼·霍爾頓博士(Dr William Norman Holden)稱,2001年1月至2012年10月期間,安全部隊共進行了1335起法外處決。  2002年8月9日,新人民軍被美國國務院指定為外國恐怖主義組織。反游擊戰行動的增加對叛亂的程序產生了負面影響。  叛亂戰士接受退伍軍人的戰鬥訓練和毛主義意識形態培訓:三大紀律和八項注意,以及《尊重人權和國際人道主義法的全面協定》。 新人民軍部隊的一個單位一般由15至30名戰鬥人員組成。另有由50至60名戰鬥人員組成的特別武裝單位,以特別行動能力服役。 新人民軍還與摩洛民族解放陣線和棉蘭老莫洛回教解放陣線建立了不完全的聯盟,使其部隊能夠通過對方的領土。  日本公司經營的種植園遭到過新人民軍的攻擊。  在杜特爾特總統於2016年7月發表的國情諮文中,杜特爾特宣佈對左翼叛亂分子單方面停火。由於這項宣言,政府與全國民主聯盟之間的和平談判於2016年8月恢復。雙方和平談判於挪威的奧斯陸進行。2017年2月,菲共單方面宣佈,由於政府未履行釋放所有392名政治犯的承諾,2017年2月10日生效的停火協議失效。菲律賓共產黨隨後殺害了3名士兵,激怒了政府,隨後政府宣佈撤銷停火協議。和平談判被終止,菲律賓武裝部隊宣佈全面戰爭。2017年3月,政府宣佈了一項新的停火協議,並宣稱將於4月恢復和平談判,於6月進行第五輪談判。然而,2017年12月5日,杜特爾特總統宣佈人民黨和新人民軍為恐怖組織。菲律賓民族民主陣線不包括在其中。
菲律賓共產主義叛亂是指菲律賓政府與菲律賓共產黨及其新人民軍和菲律賓民族民主陣線之間的武裝衝突。