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  聖胡安屬於熱帶海洋性氣候,降雨與日照高,雨季在7月至12月。根據1981至2010年在路易斯·穆尼奧斯·馬林國際機場的資料,日最低氣溫低於或等於的平均日數為9.4天;日最高氣溫超過的日數年均有237天,以上的有1.8天。最冷月(1月)均溫,極端最低氣溫(1957年3月3日)。最熱月(8月)均溫,極端最高氣溫(1981年10月9日)。年均降水量約,年極端最少降雨量為(1991年),最多為(2010年)。

  鐵路:總長50公里。 地鐵和輕軌:地鐵1、2、3、4號線已開通。 BRT:紅線、春寒線、媽紅線開通於2012年;黃線、洋玫瑰紅線、玫瑰紅線、茶線開通於2014年。 公路:總長80公里。 飛機:路易斯·穆尼奧斯·馬林國際機場有直達航線連結美國東部沿岸各個主要城市,包括波士頓、紐約、華盛頓、費城、邁阿密、夏洛特等,飛行時間大概在4個小時以內。連結美國內陸的城市有芝加哥、休士頓、達拉斯和亞特蘭大。歐洲航線連結德國法蘭克福、西班牙馬德里和英國倫敦和北歐。也有航線部分航線連結加勒比海的附近的國家以及墨西哥的坎昆市。

  聖胡安有以下兩個友好城市:
聖胡安()是美國自治領地波多黎各的首府和最大城市,根據美國2000年進行的人口普查,該城人口為433,733,是美國管轄的第42大城市。聖胡安在1521年由西班牙殖民者建立,當時被稱為“波多黎各城”()。該城是歐洲人最早在今天的美國領地上建立的城市,同時也是他們繼聖多明各(位於今天的多明尼加)之後在美洲第二個建立的城市。