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  烏干達鐵路是十九世紀末列強瓜分非洲狂潮中,英國在東非殖民地修建的一條戰略鐵路。此前不列顛東非公司於1890年修建了一條麥金農-斯克萊特道路,長,從蒙巴薩到肯亞與烏干達邊界的布西亞。再通過蒸汽動力,英國可以運送軍隊控制大湖地區。  烏干達鐵路以其目的地命名。在肯亞境內長。1896年初從英屬東非的港口城市蒙巴薩開始修建,1901年底在維多利亞湖東岸的港口城市基蘇木完成鐵路建築。  烏干達鐵路為單線米軌,車站設避讓發線]]。鋪設20多萬根長鋼軌,120萬根枕木,20多萬魚尾板,40多萬魚尾螺栓,480萬顆鉚釘及用於高架橋與路堤的鋼質桁架,都必須從印度進口,因而在蒙巴薩建設了基林迪尼港。鐵路建成後,減少了運輸的人力需求,從而抑制了奴隸制。

  1895年,英國國會開始撥款建設此鐵路。經驗豐富的工程師George Whitehouse於1895-1903年任總工程師,1901年兼任鐵路經理。

  幾乎所有築路工人來自英屬印度。一家在卡拉奇的人口公司被指定負責招募工匠、苦力、工頭。在拉合爾的一家分公司是招募中心。民工來自旁遮普農村,派到卡拉奇乘坐從英屬印度汽輪公司租來的輪船赴蒙巴薩。 民工招募開始不久,印度爆發了一場大瘟疫,嚴重延誤了鐵路建設。英印政府要求烏干達鐵路公司在Budapore設立一家隔離營,出境民工必須先隔離14天才可以繼續徵募民工。  總計招募了35,729苦力與工匠,1,082工頭,總計36,811人。每名苦力簽署(或按指紋)的勞動合同規定每月工薪12盧比,吃住免費,歸國返回招募地免旅費,住院期間工薪減半,治療免費。民工招募從1895年12月至1901年3月。第一名完成工作合同回國的苦力是在1899年。從1895年至1903年死亡2,493民工,年均死亡357人。 大部分民工回到印度,但有6,724人決定留在東非,產生了肯亞印度裔人社群。

  為維持工程的法律與秩序,鐵路公司設有警察部,著裝、裝備並訓練使用馬提尼-亨利步槍。警務人員有400人,來自英屬印度政府。鐵路完工後移交給英屬東非政府。

  在蘇格蘭的船廠造好的鐵路輪渡大部件運抵蒙巴薩後,鐵路運輸到基蘇木組裝成船。用於到貝爾港的維多利亞湖的鐵路輪渡航線。從貝爾港到坎帕拉建設了一條鐵路。  建成的支線鐵路有:  1929年,烏干達鐵路公司改稱肯亞與烏干達鐵路港口公司(KURH)。1931年幹線從納庫魯延伸到坎帕拉。  1948年,肯亞與烏干達鐵路港口公司(KURH)改稱東非鐵路港口公司。1956年鐵路從坎帕拉延伸到西烏干達的卡塞塞。1964年,北烏干達的支線鐵路延伸到扎伊爾邊界的阿魯阿。

  從最開始,烏干達鐵路公司就規劃了在維多利亞湖的鐵路輪渡。1898年第一條110噸級的渡船在基蘇木組裝。後續有662噸、1134噸、1300噸的多艘渡船被組裝。  烏干達鐵路公司擴充套件了其汽輪服務,在基奧加湖順維多利亞尼羅河而下到位於艾伯特尼羅河起源的帕誇奇。由於維多利亞湖的鐵路輪渡船不適合在內河航行,為此引入了幾條明輪船。

  肯亞與烏干達獨立後,這條鐵路逐漸破舊。2016年夏,《經濟學人》雜誌的記者乘坐“瘋狂特快”(Lunatic Express)從內羅畢到蒙巴薩,結果是晚點七小時抵達,旅行時間24小時。蒙巴薩與內羅畢之間的旅客列車在2017年4月28日後停運。而內羅畢與基蘇木之間的米軌客運已經於2012年停運。
烏干達鐵路是英屬東非的一條米軌鐵路,位於今肯亞與烏干達,連線海港蒙巴薩到尼羅河流域的維多利亞湖。現在分別有肯亞鐵路公司烏干達鐵路公司。