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  T細胞抗原表位出現在抗原呈現細胞上,這種抗原將會和主要組織相容性複合體(MHC)相結合。由I型主要組織相容性複合體所呈現的T細胞抗原表位通常是由8至11個氨基酸長度的多肽,而II型主要組織相容性複合體所呈現的T細胞抗原表位相對更長,由13-17個氨基酸組成,而非經典主要組織相容性複合體則呈現非多肽類的抗原表位,例如糖脂。

  抗原表位有時候會發生交叉反應,這一特點通過抗獨特型抗體的調控,被免疫系統所利用。這一理論最初是由諾貝爾獎獲得者尼爾斯·傑尼所提出的。如果抗體和某個抗原的表位結合,這一互補區會變成抗原表位被另一個抗體所捕獲。如果第二個抗體是一個IgM型別的抗體,則這一結合會提升免疫系統的響應;而如果第二個抗體是IgG型別的抗體,則這一結合會降低免疫系統的響應。

  抗原表位可以通過蛋白質陣列文庫等技術進行繪製。同時,目前正在大力開發一些可靠的工具,用於預測蛋白質的抗原表位。

  抗原表位通常會被用於蛋白質組學以及其它基因產品的研究當中,是指通過DNA重組技術,能夠被普通抗體所識別的編碼抗原表位的基因序列。抗原標記可以被融合到某段基因當中,其後該表位被合成為蛋白質或者其它基因產品的一部分,上面的抗原表位標記會被抗體或者其它基因產品所識別,使得定位、提純以及進一步的分子鑑定等實驗室技術變得可行。用於該目的的抗原表位通常為Myc標記、HA標記、FLAG標記、GST標記、6xHis標記以及OLLAS標記。
抗原表位(英語:antigenic epitope),簡稱“表位”,也稱為「抗原決定位」或「抗原決定簇」(antigenic determinant),是指抗原表面上決定抗原特異性的化學官能基。抗原表位可被免疫系統(尤其是抗體、B細胞或者T細胞)識別。抗體中能識別抗原表位的區域叫做“互補位”或“抗體決定簇”。儘管通常抗原表位是指外來蛋白質等物質的其中一部分,但只要能被自體免疫系統所識別的表位,也被歸為抗原表位。