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  城市始建可以追溯到612年,傳說愛爾蘭傳教士Gallus在河畔建立了隱修院。聖加侖修道院建立於719年,可從Otmar得到證實。 這座修道院在晚些時候發展成為歐洲最大的聖本篤修道院之一。之後的幾百年內,這座修道院院長一直同時統治這座城市及周邊地區。1415年,聖加侖從教會的統治下獨立出來。15世紀中期,聖加侖城市及教會同時加入了瑞士聯盟。聖加侖州則於1803年才加入了瑞士聯盟。

  1526年,當地的市長、學者瓦迪安(Joachim Vadian)開啟了宗教改革。城市轉信新教,但教會仍歸羅馬天主教管轄。破壞聖像運動期間,許多僧侶被迫逃離城市,一些教堂的圖繪也被移除,但修道院整體未受影響。

  15世紀起,聖加侖逐漸以生產高質量的紡織品聞名。1714年,年產衣物達3.8萬件。18世紀中葉,由於國外競爭和棉花生產的變革,當地經濟受到強烈衝擊,但很快恢復。到19世紀初,當地發明了刺繡機,一百年後,刺繡品成為最重要的出口產品。當時,世界市場的半數刺繡品都產自聖加侖,瑞士東部五分之一的人口都與紡織工業有關。當地工業在一戰和大蕭條中再次遭遇危機,直到1950年以後才緩慢復甦。今天,僅有少量的刺繡廠家尚存,但刺繡設計仍然在巴黎時裝展大受歡迎。
聖加侖(,瑞士德語:,,)位於瑞士東北部,是聖加侖州的首府,人口約7萬4千人,海拔約700米,施泰納赫河(Steinach)穿越其中,最後匯入博登湖。歐洲四家最頂尖的商學院之一、有歐洲的哈佛大學美譽的聖加侖大學就是位於聖加侖市。