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  美國海軍屬於國防部海軍部管轄,由一個文職人員擔任美國海軍部長(SECNAV)為實質指揮官。資深海軍武官將領的最高位階為海軍作戰部長(CNO),並且立即擁有四星上將的官階。同時也自動成為參謀首長聯席會成員和美國國安會第二號人物,雖然這些名義上只是總統諮詢機構但其實握有實權。海軍祕書長和執行長可以調動組織、管理招募、規定訓練和裝備海軍以備隨時接收區域聯合作戰司令部的指揮。

  海軍共有九大部門:美國海軍艦隊司令部(前身為大西洋艦隊)、太平洋艦隊、美國海軍中東司令部、美國地中海艦隊、海軍網路戰司令部、海軍預備部、特種作戰部、作戰測試與評估部、海軍運輸司令部。艦隊在海軍中定位成武力提供者;他們不能自己擬定作戰計劃,只能維護和訓練戰鬥單元以備隨時供應區域聯合作戰司令部派遣。非公開的美國海域外軍艦行動都被定為成特遣隊,通常由第二第三艦隊執行。只要進入其他編號艦隊負責的區域,特遣隊就會重新編號。例如一個航母戰鬥群進入地中海西岸就會被命名為特遣隊20.1;進入地中海內就變成特遣隊60.1。 海軍共有七支艦隊—第二、第三、第四、第五、第六、第七,和第十艦隊(海軍網路司令部),都由三星中將指揮,除了第四艦隊由兩星少將指揮。其他六支艦隊由區域司令部指揮分成大西洋艦隊、太平洋艦隊、歐洲艦隊、中央指揮部(只指揮第四艦隊,等於第四艦隊有兩層重複指揮),等任務編組;這四位任務性指揮官全是四星上將。其中第一艦隊的編號早在1947年二戰後就已經存在,但是1973左右改編成現在的第三艦隊。海岸巡防隊在緊急時也會和第一艦隊一起行動;但是此種緊急狀況從未發生過。1790-1798年間美國根本沒有海岸常備海軍,只有單純的一艘艘小艇各自為單位在保護海疆,後來才演變成海岸巡防隊(U.S. Coast Guard)。這也是為何海岸防衛隊多是小艇為主。在2008年,海軍第四艦隊開始加強在美國南方海域活動以保護船隊,並將中南美控制力加以強化。 2010年美國海軍復編第十艦隊,統合指揮網路戰爭指揮部及其他海軍電子作戰部門,成為現役第七支艦隊及海軍網戰中樞首腦,屬於沒有配置任何戰鬥船艦的特殊艦隊編制。

  陸岸設施對於支援海上艦隊進行任務有必要性。尤其是後勤和戰備,它們是海軍完整且持續運作的關鍵。多樣化複雜化裝備的現代美國海軍也需要大量陸岸設施訓練人員。兩大後勤指揮體系是海軍海上司令部和海軍航空司令部。另外還有海軍情報辦公室和美國海軍天文臺,海軍學校則專注於戰略和情諮。訓練單位則以海戰與空戰中心和美國海軍學院為主體。  海軍有許多「海上部隊司令部」負責運作陸岸設施和連絡陸軍與空軍支援。還負責一些對海支援的陸地火力。在戰時,所有司令部部都會擴編並依照任務編組劃歸運用。較大的幾個太平洋司令部有:美國駐韓海軍司令部(CNFK)、美國駐馬里亞那海軍司令部(CNFM)和美國駐日海軍司令部(CNFJ)。

  美國海軍掃雷與反潛戰司令部(NMAWC)

  

  從行政角度上,海軍陸戰隊與美國海軍同屬美國國防部下屬的美國海軍部;但通常情況下,它作為一支單獨的軍種執行訓練作戰任務,陸戰隊的軍銜名稱與陸軍、空軍相同,屬於美國軍隊中的一個獨立兵種。

  傳承各原單位特有精神,具有多元執行任務,主要負國土防衛、海事法律執行、海上搜救、海上環境汙染、近岸內河道維護、海上導航等事務。且系唯一被國會授權於和平時期扮演執法角色的武裝團隊,也是國家在陸、海、空及陸戰隊以外的第五個武裝力量,肩負國土防衛之責任。2003年移屬國土安全部管理,戰時則移交至美國國防部屬下的美國海軍部。

  龐大、複雜和全球化的美國海軍需要大量的海軍設施、軍港來支援其行動。除了在美國本土西岸和東岸,美國海軍還在本土內陸和海外擁有相當數量的設施。

  

  美國海軍潛艇的主要任務是監視和收集情報、特別行動、精確打擊、聯合作戰和捍衛領海。美國海軍潛艇全部為核動力潛艇,主要分兩種:一種是彈道導彈核潛艇,一種是攻擊核潛艇。彈道導彈核潛艇的唯一任務就是攜帶和發射核彈。攻擊核潛艇的任務較多,包括擊沉艦隻和潛艇、發射巡航導彈、收集情報和協助特別行動。對海作戰潛艇通常以城市命名,而對陸地作戰潛艇則以州命名。早期的攻擊潛艇以深水動物命名,而早期的彈道潛艇則以美國名人命名。

  憲法號(USS Constitution,IX 21)帆船護衛艦  蘭利號(USS Langley,CV-1/AV-3)航空母艦 水上機母艦  企業號(USS Enterprise, CV-6)航空母艦  密蘇里號(USS Missouri, BB-63)戰鬥艦  鸚鵡螺號(USS Nautilus,SSN571)核動力潛艇

  

  美國海軍海豹特種部隊目前人員的編制共有3500名士官和士兵,想要成為海豹部隊的一員,必須通過為期六個多月的測試和挑戰。每一年自願報考的軍人非常多,平均約在1500人,但能夠完成六個月地獄般的訓練,人數通常不超過30人,但高淘汰率並沒有因此讓人卻步,反而激勵了很多原本看似會被淘汰,但在最後卻通過測試的人。  第一個月通常稱為魔鬼地獄周,因為在這四個禮拜,會面臨到體能、壓力、速度、精神、甚至是自己的意志力的考驗。通常每人每天需操練15小時,但睡眠時間不到5小時,體能和壓力皆會逐漸出現問題,根據統計,有25%的人會在第一週就放棄。而通過第一個月魔鬼訓練的人,在之後會開始接受使用槍械和搏擊訓練,慢慢的他們也被訓練泳渡寒冷的水域並實施偷襲。當再通過六個月的訓練之後,掛上老鷹標誌的徽章,就象徵著已是世界特種界的菁英--海豹部隊的一員。  海豹之所以厲害不在因為他們是世界最多人的特種部隊,而是他們講究團隊精神和訓練。海豹總共分為八個隊,每個隊所負責的區域不同,每個隊有70個小隊,一小隊8個人。到目前為止,海豹部隊已經執行超過500個任務,其中有350個任務是在1992年的波斯灣戰爭所執行的。

  美國海軍的成立是基於協助陸軍需求所成立的,在美國革命戰爭時期的大陸會議通過成立美國海軍。1789年由憲法批准,國會被授權設立海軍。第一批美國海軍成軍時,約有六艘大型快艦。這六艘快艦中最知名的是一艘現在仍在服役的「老鋼鐵號(Old Ironsides)」,它的原名是「USS憲法號(USS Constitution)」。
美國海軍(英語:United States Navy,縮寫:USN或U.S. Navy),是一個美軍軍種,負責管理所有與海軍有關的事務。其職責為:“配備、訓練和武裝一支有能力贏得戰爭、阻止入侵和保證海域自由的海軍戰鬥部隊。”美國海軍目前有近500,000現役和預備役海軍軍人、2852艘現役大小軍艦。海軍旗下設有空中部隊,擁有超過3,700架飛機,主要包括F/A-18E/F超級大黃蜂式打擊戰鬥機及SH-60海鷹直升機,使得美國海軍成為全球第四大的空戰部隊,僅次於美國空軍、中國人民解放軍空軍、俄羅斯空軍。