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  用系統生物學的方法可以更好地幫助我們去理解參與訊號通路之間交流的那些組成成分、複雜的配體和受體之間的結合以及動態的訊號網路。計算模型通常會將發表了文章中報道的某些訊號通路中的元件之間的相互作用整合起來,然後將不同的元件聚到壹個大類中,以及刻畫這些元件之間存在的相互作用。計算模型的發展能夠讓我們從全域性,更加深入地探究細胞內的訊號通路,比如操縱不同的變數和系統地對響應的結果進行評估。  使用分析模型來學習訊號轉導已經被廣泛地應用到了藥物學、新藥的發現(評估配體和受體間的相互作用)、藥物代謝動力學以及代謝產物在大尺度網路下的流動。目前被廣泛應用於細胞內訊號通路建模的策略是使用常微分方程(ordinary differential equation, ODE)進行建模,比如,在時間尺度上,用公式來表示某壹個訊號分子的濃度是訊號通路內上游或者(和)下游其它的分子的函式。常微分方程模型也已經被廣泛地應用於分裂素啟用的蛋白激酶、雌激素受體α和mTOR等訊號通路的動力學研究。
細胞資訊傳遞(英語:cell signaling)是一個主管細胞基本活動並協調細胞行為的複雜溝通系統。細胞對周遭微環境進行感知與正確迴應的能力是其發展、修復組織、免疫以及體內正常動態平衡的基礎。癌症、自體免疫疾病與糖尿病等病症均可歸咎於細胞在資訊處理上的錯誤。瞭解細胞資訊傳遞幫助人們能研究治療疾病的途徑,並使製造人工組織成為可能。