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  某些NTFS功能在ReFS的初始版本中已移除或不支援。這包括備用資料流、物件ID、8.3檔名、NTFS壓縮、加密檔案系統(EFS)、事務性NTFS、硬連結、擴充套件屬性和磁碟配額。ReFS最初不提供重複資料刪除,在隨後的v3.2版本中實現。此外,Windows目前不能從ReFS卷引導啟動。映象或條帶化卷的動態磁碟已被“儲存空間”提供的映象或條帶化儲存池取代;自動糾錯僅在映象空間支援。  在後續實現的Windows 8.1 64位和Server 2012 R2的ReFS中,檔案系統開始支援備用資料流,最大長度128K,以及完整性流在奇偶效驗空間上自動糾正損壞資料。ReFS在缺乏備用資料流的支援時不適合Microsoft SQL Server例項分配。

  一些ReFS與“儲存空間”共同執行時的出現問題已被提出或建議,包括:

  2014年,一篇對ReFS的評論與準備在生產中使用的評估顯示,ReFS在與它的兩個主要競爭對手(檔案系統)的比較中具有關鍵優勢。ZFS(在Solaris和FreeBSD中使用)被廣泛批評為使用數GB的記憶體用於聯機重複資料消除,這影響了它在大量中小型系統上的使用。但是,在關閉ZFS的聯機重複資料消除後(因為ReFS不支援此功能),ZFS只佔用幾百兆記憶體,與另外兩個系統相對持平。Drobo等方案使用專有方法,這意味著如果故障且廠商也無法解決,沒有其他解決方案。  2012年,Phoronix撰寫了一篇ReFS對戰Btrfs的分析(Btrfs是適用於Linux的一個寫時複製檔案系統)。兩者具有類似的特性,都支援校驗和、類RAID使用多塊磁碟,以及錯誤檢測與糾正。但是,當時的ReFS缺乏重複資料刪除、寫時快照和壓縮,而Btrfs和ZFS支援上述技術。
彈性檔案系統(英語:Resilient File System,簡稱ReFS),代號“Protogon”。這是一個微軟在Windows Server 2012中引入的專有檔案系統,目的是成為NTFS之後的“下一代”檔案系統。