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  京都大學前身是1869年5月建立的第三高等學校。1897年利用馬關條約的滿清賠款,高校的法學部及工學部組成京都帝國大學,高校改設大學預科。同年設定理工科大學。1899年設定法科大學以及醫科大學。1906年設定文科大學。(帝國大學不設學院,下設分科大學)大約20年後這些分科大學改稱學部(學院之意)。在第二次世界大戰後的學制改革中,第三高等學校剩餘的部分(大學預科)併入京都大學。

  京都大學起源於日本第2所舊制帝國大學「京都帝國大學」,「自由的學風」、「自重自敬」是大學謳歌的精神基礎。京都大學吉田校區則是京都大學總部的所在地。  京大校園位處被稱為「大學生的城市」之京都市區東北部,稍離市中心鬧區一帶,周邊幽雅閒靜,人文氣息濃厚。強調學生的自主權、承襲舊制第三高等學校的「自由的學風」。早年每逢京大年度慶典「11月祭」,設立於原第三高等學校(現京都大學吉田南校區)內的折田先生像(前校長銅像)都會遭到惡搞塗鴉,校方多次勸阻無效,索性將銅像撤去。然每年三月入學考試放榜之後,至新學年度開學後的四月中旬,學長姊會製作新的折田先生像以迎接新生。開學典禮、畢業典禮也充斥者奇裝異服。

  

  

  絕大部分的學部和大學院都被設定在吉田校區。

  有為了學生和教職員而設定的校車在執行。吉田(本部構內)～宇治間(通稱宇治巴士)一日間來回六趟、吉田～桂間一日間來回七趟、宇治～桂間一日間來回三趟、需要時間皆為五十分鐘到一個小時左右。但是因為塞車等原因,很難確保能夠準時,而且末班車的時間相當早,在那之後就只能利用大眾交通運輸公具,因此在學生之間也有不滿的聲音。

  京大相關人物有19人獲得諾貝爾獎。現校友涵蓋若干菲爾茲獎、沃爾夫獎、拉斯克獎、羅伯·柯霍獎、蓋爾德納國際獎以及達爾文獎章得主、五名日本首相以及四名芥川賞得主。

  

  最早這一稱謂用來指代哲學系教授西田幾多郎和田辺元所開創的一種新的哲學思想,後來這一詞語延伸至法學,經濟學等其他領域,京都學派對日本的哲學理論產生了重要影響。

  1933年在京都大學發生的瀧川事件(京大事件),使日本社會開始反思學術界的思想自由和大學存在的意義。戰後黑澤明導演指導的《我於青春無悔》(わが青春に悔なし)就是以這一事件為背景。

  1933年,法學部的瀧川幸辰教授在其著作《刑法講義》、《刑法讀本》中,對於《通姦罪》只適用於妻子一方的法律提出批判。瀧川的這一主張,遭到了貴族院議員菊池武夫和政友會宮澤裕等人的攻擊,被指責為共產主義的學說,因此上述著作被禁止發售。齋藤實內閣的文部大臣鳩山一郎甚至對京大校長小西重直提出罷免瀧川的要求。儘管校長拒絕了這個要求,但根據文官分限令,瀧川仍被迫停職。  面對這個事態,京大法學部全體31位教授提出辭職以表抗議,但是未得到學校當局和其他學部的支援。接著,小西校長也被迫辭職,隨著強硬派的新任校長鬆井元興上任,事件迅速得到了平息。最終導致了瀧川教授被免職,佐佐木惣一(後為立命館大學校長)、宮本英雄、森口繁治、末川博等教授也被免職,其餘14名教官辭職的結果。
京都大學(;英語譯名:英語:Kyoto University),簡稱京大(きょうだい),是一所本部位於日本京都市左京區的國立研究型綜合大學。京大前身是日本第二所舊制帝國大學—京都帝國大學(1897年),亦為京都學派的發祥地。