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  鸛形目在2014年的鳥類分類系統中是鳥綱中僅一個科的目。  1980年代,Sibley和Monroe根據DNA分析的結果對當時的傳統鳥類分類作出重大調整。在鳥類DNA分類系統中,將傳統分類系統中獨立存在的潛鳥目、鷿鷈目、隼形目、鷗形目以及鴴形目合併到一個巨大的鸛形目名下,一度形成了一個堪與雀形目比肩的大目,但後來又發現這並非一個單系群,之前的目又被獨立出去,到了2014年,只剩一個鸛科。

  本目是水鳥類的演化支之一,為鰹鳥目及鵜形目的旁系群,與其它水鳥類的演化關係如下:

  鸛科動物的化石在北美、南美、歐洲、非洲、亞洲等許多國家都有發現,而且大量化石證據表明,這個物種十分古老而且分佈廣泛。鸛科的形成至少可以追溯到第三紀早期或白堊紀晚期,現代鸛類(包括鸛屬"Ciconia"、"Ephippiorhynchus"、"Leptoptilos"等)的化石約出現在中新世(2350萬年~520萬年)。
鸛科(學名:)在鳥類全基因組測序分類系統中是鳥綱鸛形目()的唯一一個科。在西方又俗稱送子鳥,因為在當地童話中,鸛常會帶來新生兒。