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  1927年艾根出生於德國波鴻。完成了在高中的物理學和化學學習後,1944年他來到哥廷根,進入哥廷根大學學習。1951年他獲得物理學博士學位之後,在該校的物理化學研究所從事科學研究工作。1953年進入卡爾·弗雷德里希·彭霍費爾研究所從事物理化學研究工作。1957年他成為研究所主任。1958年他當選為馬克斯·普朗克學會的會員,1964年成為馬普所首席科學家。1967年獲得諾貝爾化學獎,同年任馬普學會會長至1970年。1971年彭霍費爾研究所擴建並更名為馬克斯·普朗克生物物理化學研究所。  艾根由於對極快化學反應研究的突出成就,與英國的羅納德·喬治·雷福德·諾里奇和喬治·波特共獲1967年的諾貝爾化學獎。艾根的主要貢獻是他和合作者發展了研究溶液中半壽期在毫秒以下的極快反應動力學的弛豫技術。這種方法可以對在10秒內完成的極快反應進行觀測和研究。此後,艾根將研究興趣轉入自組織系統和生物進化研究。1979年他和彼得·舒斯特闡述了超迴圈(化學)理論。
曼弗雷德·艾根(,1927年-5月9日-2019年-2月6日),德國化學家及生物物理學家,曾任位於哥廷根的馬克斯·普朗克生物物理化學所主任。