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  阿爾薩斯在中世紀長期屬於神聖羅馬帝國的領土。1639年,法國佔領了大部分的阿爾薩斯,以避免落入西班牙哈布斯堡王朝手中。西班牙希望能清除與西屬荷蘭之間的障礙。因此引發了三十年戰爭(1618-1648年)。在被敵國包圍,以及匈牙利給予全權處理的情況下,西班牙在1646年將南郡的領地(大部分位於上阿爾薩斯)以120萬塔勒(1塔勒=3馬克)的價格賣給已佔領該地的法國。因此,當1648年,西發利亞和約結束三十年戰爭之後,除了一些城鎮維持獨立,大部分的阿爾薩斯成為法國領土。條約中認為阿爾薩斯是“拜占庭”且令人困擾。這被認為是蓄意要讓法國國王及神聖羅馬皇帝都無法完全控制該地,並造成雙方對立,讓阿爾薩斯能保有某一程度的自治權。支援這論點的人指出,負責編寫條文的帝國全權大臣伊薩克·佛爾瑪是前阿爾薩斯教區祕書長。之後,阿爾薩斯與洛林成為德法之間爭議不斷的領土。  因為戰爭造成大量人口傷亡(主要在鄉間地區),自1648年至18世紀中期,大量移民前往瑞士、德國、奧地利、洛林、薩伏依和其他地區。1671-1711年,瑞士(特別是伯恩)再洗禮派難民湧入阿爾薩斯。斯特拉斯堡成為早期再洗禮派運動的主要中心。  1679年的奈梅亨條約鞏固了法國的控制權。法國在1681年佔領斯特拉斯堡,1688年開始,法軍因“Brûlez le Palatinat!”政策開始入侵南德。1697年結束大同盟戰爭的里斯維克條約再度鞏固這次的領土變更。然而,阿爾薩斯在法國是個特別的存在。當地政府、學校、教育依然使用德文,德國(路德教派)的斯特拉斯堡大學持續接收德國學生。禁止法國新教的楓丹白露敕令不在阿爾薩斯實行。雖然法國政府大力宣揚天主教,並在1681年要求路德教派的斯特拉斯堡座堂必須交給天主教,但阿爾薩斯與法國其他地區不同的是,當地對於宗教較為寬容。阿爾薩斯有孚日山脈作為與法國的界線,但是與德國並沒有類似的天然界線。因此,阿爾薩斯在法國大革命以前,一直保留德國文化,經濟上也較依賴德國。
阿爾薩斯-洛林 (;)指的是法國和德國在歷史上有過爭議的一處地區。此地區本屬神聖羅馬帝國,自1648年威斯特伐利亞和約後逐漸成為法國領土。1871年普法戰爭後透過法蘭克福條約歸於新成立的德意志帝國。第一次世界大戰結束後曾短暫宣告獨立,後來又再度成為法國的領土。納粹德國1940年恢復主權至1945年,又復歸法國所佔。