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  2007年10月5日,五枚奧運金牌得主、美國選手馬裡恩·瓊斯承認在比賽中服用類固醇類興奮劑,導致她在本屆比賽中獲得的3枚金牌和2枚銅牌都被國際奧委會剝奪。 其中,女子100米金牌沒有補發給其他選手,因為排在成績第二位的希臘選手埃克塔裡妮·塔努在雅典奧運會前未參加規定的藥檢而被處以兩年禁賽。 同時,瓊斯在接力賽中隊友的獎牌在通過上訴後得以保留。  2008年8月2日,由於選手Antonio Pettigrew承認服用了EPO和生長激素,國際奧委會剝奪了美國隊男子4x400米接力專案的金牌。2012年7月21日,國際奧委會將金銀銅牌分別授予尼日利亞、牙買加和巴哈馬(原列第2至4名)。  2010年2月25日,美聯社報道,一名中國體操隊隊員在當時未滿參賽的最低年齡限制16歲。國際體操聯合會證實董芳霄在參賽時的年齡為14歲,因而在4月28日,國際奧委會取消了中國體操隊所獲得的銅牌,改授予排名第4位的美國隊。  2013年1月17日,國際奧委會因藍斯·阿姆斯壯長期使用禁藥的事件確實並認定UCI褫奪他在1998年8月1日之後成績的決定,褫奪他自行車男子公路計時賽的銅牌,而該獎牌沒有補發給其他選手,因當時自行車界普遍使用禁藥,且已無法查出當時其他選手是否使用禁藥。
2000年夏季奧林匹克運動會獎牌榜是一個按照2000年夏季奧林匹克運動會所獲獎牌數排序的國家奧委會列表。該屆奧運會於2000年9月15日到10月1日在澳大利亞悉尼舉行,全球199個國家和地區的10651名運動員(其中有4名東帝汶運動員以個人名義參賽)參加了28個大項、300個小項的角逐。