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  植物病原真菌的大多數屬於子囊菌綱和擔子菌綱  真菌的有性生殖和無性生殖都是經由生產孢子和其它結構的繁殖。 顯著植物病原真菌包括:

  

  卵菌綱不是真正的真菌,而是類似真菌的生物。它們包括一些最具破壞性的植物病原體,包括疫黴屬,其中包括馬鈴薯晚疫病和橡樹猝死的致病因子。卵菌綱的某些特定物種導致根腐病。  顯著卵菌植物病原體:

  Phytomyxea中一些粘菌會引起重大疾病,包括白菜及其親屬的棒狀根,和馬鈴薯粉痂。

  大多數細菌與植物相互相生的,並沒有傷害到植物本身。 然而,少數細菌,大約有100餘種已知的物種,能導致疾病。細菌性疾病在世界的亞熱帶和熱帶地區更為普遍的多。  大多數植物病原細菌是革蘭氏陰性桿狀菌(桿菌)。為了能夠定殖的植物,它們具有特定的致病因素。眾所周知的五種主要型別的細菌致病因素是:使用細胞壁降解酶,毒素,效應蛋白,植物激素,和胞外多糖。

  植物菌質體(phytoplasma)是一種無細胞壁的原核生物。

  有許多型別的植物病毒,有的甚至是無症狀的。  大多數植物病毒具有小的,單鏈RNA基因組。但是,一些植物病毒也是具有雙鏈RNA或單鏈或雙鏈DNA基因組。

  線蟲是小的多細胞蠕蟲狀的動物。許多自由生活於土壤中,但也有一些物種寄生於植物根部。在世界上熱帶和亞熱帶地區,它們是一個問題,在那裡它們可能會感染農作物。

  有由原生動物引起植物病害的的幾個例子(例如,Phytomonas,一種動質體)。  一些無色的寄生藻類(如Cephaleuros)也引起植物病害。

  槲寄生和菟絲子寄生植物如包含在植物病理學研究。 菟絲子,例如,被用來作為一個管道,用於傳輸從一個宿主植物的病毒或病毒樣劑一種植物,通常不是一個主機或代理不是接枝傳播。

  重要的非生物性疾病可引起:
植物病理學,是對於引起植物疾病的病原體(感染性微生物)和環境條件(生理因素)的科學研究 。引起感染性疾病的生物體包括真菌,卵菌,細菌,病毒,類病毒,病毒樣生物,植原體,原生動物,線蟲和寄生植物。不包括體外寄生蟲像昆蟲,蟎類,脊椎動物,或其他害蟲,會通過消費植物組織而影響植物健康。植物病理學主要認識並瞭解植物生病的原因,對人類社會與經濟之關係,病原菌的鑑定,生理和生態特性、疾病的病因、疾病的週期、寄生性、致病性、植物抗病性、病害防治、病害系統遺傳學、和植物病害管理等等的研究。