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  梅爾敦出生在伯明翰 (亞拉巴馬州),是博納姆·埃德加·梅爾敦和伊內茲·帕克的兒子。1964年,他畢業於伯明翰南方學院(Birmingham Southern College),獲得學士學位,隨後進入加勒特神學院(Garrett Theological Seminary,在西北大學校園內)攻讀神學,1968年獲得神學碩士學位。1966年,他與多蘿西亞·達德利結婚,二人育有一女,1979年離婚。  1968年,梅爾敦被按立為聯合衛理公會的長老,1974-1975年擔任伊利諾斯州Wyanet衛理公會教堂的牧師,1975-1980年擔任伊利諾斯州埃文斯頓衛理公會教堂的牧師。  梅爾敦繼續在西北大學進行研究工作,1975年獲宗教歷史與文獻博士學位,其博士論文調查了當時美國的800個宗教團體,並建立了一個後來得到廣泛應用的分類系統。

  梅爾敦的研究著重強調比較宗教團體與宗教運動的原始資料資料,他的研究方法是形態研究、區域性研究、教會史研究,以及宗教的現象學。他模仿歷史學尋找原始文獻資料的方法,通常都與一個教會或宗教團體的領袖或正式代表進行直接的個人接觸。這種接觸的目的是為了獲得該團體主要的宗教文獻,以確定其主要的教義和實踐。他的調查還包括信徒人數統計、團體歷史的詳細資料等等。梅爾敦將這些詳細資料都收集整理在《美國宗教百科全書》中。

  

  梅爾敦相信作為福音派信徒,他能夠同時做到贊成基督是救主,以及為基本權辯護。

  梅爾敦是反邪教運動(anti-cult movement)組織的主要批評者之一,指出自從殖民地時代起,美國許多神學家、牧師、傳教士和護教者都曾被質疑傳播異教教訓。  梅爾敦對於長期反邪教運動的批評包括拒絕對洗腦概念的解釋

  1987年2月10日,梅爾敦和美國心理學會的一群學者一起向加州高等法院遞交了一份涉及統一教懸案的“法院之友”(amicus curiæ)摘要。這份摘要宣告,關於洗腦和強制說服的假定是無知的思索,基於扭曲的資料。這份摘要將洗腦理論描述為未經科學證實

  梅爾敦博士是大英百科全書第二多產的貢獻者,僅次於牛津大學的物理學家克里斯婷·薩頓博士(24個條目)。他貢獻了15個百科條目文章,通常都是關於宗教組織或宗教運動的:奧姆真理教、大衛教派、基督科學教會、普世全勝教會(Church Universal)、Eckankar、福音派教會、上帝之子、Hare Krishna、天堂之門、耶和華見證人、新紀元運動、五旬節運動、人民聖殿教、山達基和威卡教。

  1995年5月,東京地鐵沙林毒氣事件發生後,美國新興宗教學者詹姆斯 R.劉易斯和梅爾敦飛往日本,召開記者招待會,確定地聲稱,根據該團體提供的照片和檔案謀殺案的主要嫌疑犯,宗教團體奧姆真理教,不可能製造襲擊用的沙林毒氣。警察的報告描述他們在奧姆真理教總部發現了祕密的化學武器實驗室,每年能夠生產數千公斤毒藥。後來的調查發現,奧姆真理教不僅製造了用於地鐵襲擊的沙林毒氣,而且還要為此前的化學武器和生物武器襲擊負責,包括造成7人死亡、144人受傷的松本沙林毒氣事件 。
約翰·高登·梅爾敦(John Gordon Melton,1942年9月19日)是一位美國宗教學者,美國宗教研究會會長,目前是聖巴巴拉加州大學宗教學系的宗教和新興宗教領域的研究專家。