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  倭寇一詞的由來,是從高句麗廣開土王碑(公元414年)碑文上所記載「倭,寇○○(地名)」而來,在此「寇」當動詞,即「倭人侵略(某地)」之意,而之後「倭寇」二字作為名詞獨立,用以稱呼來自日本的侵略者。另一方面,在16世紀壬辰倭亂以及20世紀第二次中日戰爭中,兩國的人民都稱呼日本侵略軍為“倭寇”或“日寇”。而在往後的排日風潮中,倭寇和日寇更成為敵視日本人的用語。

  雖然同被稱為倭寇,但兩者的成分分別很大。根據年代大致可以分為「前期倭寇」及「後期倭寇」。後期倭寇基本上是中日混編隊,起因為明朝的閉關鎖國(海禁)政策。

  前期倭寇是以日本海盜為主,目的是為了報復蒙朝聯軍的侵略和女真海盜的擄掠。在元日戰爭之前,高麗史已經有“倭寇金州”的記載。  元日戰爭時,倭寇主要攻擊範圍為當時臣服於元朝的高麗。由於先前臣服於元軍的高麗軍,在忽必烈兩次進攻日本的軍事行動中,侵略日本,因此前期倭寇對於朝鮮沿海進行含有報復式的海盜行為。朝鮮史取對馬島、壹岐島、平戶島三地之名,稱為「三島倭寇」(以平戶藩松浦家為核心)。元史和新元史中都有倭寇騷擾元朝杭州的記載。  後來日本進入南北朝的分裂狀態,倭寇的活動也由於政府管制力減弱而加劇。由於前期倭寇對於日本與明朝、高麗貿易造成破壞,初成立的明朝政府對日本南朝發出討伐倭寇的要求,隨後敕封討寇有功的南朝徵西將軍宮懷良親王「日本國王」(後醍醐天皇之子)的稱號。之後北朝(室町幕府擁立)統一南朝後,幕府將軍足利義滿再度進行討伐,隨後受封為新的「日本國王」。  朝鮮王朝的開國君主李成桂因為討伐倭寇有功得到很大的聲望和勢力,後來進行政變取代高麗王朝建立朝鮮王朝。之後隨著明朝與日本間勘合貿易的盛行,以及對馬島與朝鮮之間的貿易開放,前期倭寇也逐漸式微。前期的日本人為主體倭寇,被稱為「真倭」;戚繼光《紀效新書》倭寇的盔甲、武器、劍術戰法描述的非常清楚。

  後期倭寇基本上是中日混編隊,因明朝太祖皇帝朱元璋的海禁政策,從而沿海地區之民眾不得從事海上經商,故而大部分的晚期倭寇都是些走私行商不成,最後被朝廷逼成倭寇的南方漢族商人。故此,明晚後期的倭寇亦可分成兩方面:

  東京大學教授田中健夫提出一種說法,1370年到1390年初早期倭寇襲擊的大幅增加是因為新加入的高麗賤民群體。田中還提出還有純由朝鮮人組成的倭寇集團。另外,他還提出李氏朝鮮當時藉著倭寇的外患為由整頓內部,確立了國家體制。朝鮮《世宗實錄》(二十八年十月壬戌)亦記載「然其間倭人不過一二而本國民假著倭服成黨作亂」。

  明朝與高麗、朝鮮王朝都曾經對室町幕府要求取締海盜行為。明朝甚至於與日本發展了勘合貿易,日本足利幕府對明朝稱臣受封為日本國王。而朝鮮王朝以倭寇根據地名義進攻對馬島也是受到倭寇的影響。

  日本室町時代到江戶時代的海盜船通稱為「八幡船」,這是由於倭寇多半信奉武神八幡大菩薩,並繪製旗幟,上書「南無八幡大菩薩」七字,代表神明庇佑的香火與船舶的號記。

  倭寇的根據地包括日本的對馬島、壹岐、平戶島、五島列島,以及中國、朝鮮半島的沿海島嶼。荷蘭人未到臺灣之前,臺灣也是倭寇的活動據點。
倭寇是指13至16世紀期間活躍於朝鮮半島及中國沿岸的海盜,這些海盜主力多為日本人,故此冠以對日本之蔑稱「倭」稱。歷史上倭寇來源眾多,成分複雜。元明朝早期以日本人為主,明朝中晚期有出現東南沿海地區華人為主體、以及來自朝鮮、中南半島、南洋地區的水手混編的海商集團與少數日裔合作,被稱為「假倭」。全盛時期的倭寇活動範圍遠至東亞各地、甚至是內陸地區,甚至有部分隊伍將基地設於九州,成為日本大名的海軍傭兵。此詞後期(特別於十九至二十世紀大日本帝國向外擴張侵略時)開始引申成為遠東地區對日本人的貶稱。