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  托馬塞克於19899年6月30日在奧匈帝國捷克東部的城鎮斯圖登卡出生。完成學業和服役後,他在帕拉茨基大學學習。於1922年7月5日晉鐸和在學校中教授宗教。1938年,他在帕拉茨基大學獲得神學博士學位。  在第二次世界大戰期間,納粹德國佔領捷克斯洛伐克共和國導致大學關閉,托馬斯克於是回到學校中教授宗教。戰爭結束後,他獲得了第二個博士學位。  1949年10月13日晉牧,並被時任教宗庇護十二世任命為奧洛穆茨總教區輔理主教。1965年至1977年間擔任布拉格總教區宗座署理。  1977年6月27日,被時任教宗保祿六世冊封為司鐸級樞機和布拉格總教區正權總主教。直到1991年6月1日榮休,由米洛斯拉夫·弗爾克接替擔任布拉格總教區總主教。  於1992年4月8日,托馬塞克在捷克斯洛伐克布拉格去世,享年93歲。
方濟各·托馬塞克(;1899年-6月30日-1992年-4月8日)是捷克籍天主教司鐸級樞機及布拉格總教區榮休總主教。