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  偶蹄目動物由古新世的踝節目動物進化而來。基本上從始新世開始分化。中新世和上新世是其進化的重要時期。  外形上,早期的偶蹄動物類似今天的鼷鹿("Tragulidae"):小巧,短腿,以葉子為食。始新世晚期(4600萬年前),三個現代亞目已開始分化:豬形亞目、胼足亞目和反芻亞目。然而偶蹄目並沒有佔據生態主導地位,當時是奇蹄目的繁盛時期。偶蹄動物只能佔據一些邊緣生態位艱難維生。但是同時它們也在這個時候開始了複雜的消化系統的進化,從而能夠以低階食料為生。  始新世開始出現草。中新世的時候全球氣候變乾燥少雨,大量雨林枯亡,草原開始發育,並向全球蔓延開來。草本身是一種非常難以消化的食物,而唯有擁有複雜消化系統的偶蹄動物能有效地利用這種粗糙、低營養的食物。很快偶蹄動物就取代了奇蹄動物的生態位,成為了食草動物的主導。  偶蹄動物分為兩大類,然而各類內部形態差異很大。豬形亞目(豬、西猯)保留四趾,臼齒簡單,腿短。犬齒常常變大成獠牙。它們大多屬於雜食動物,胃構造簡單(器官構造與人類最近)。駱駝類和反芻類則相反,傾向於向長腿、兩趾和複雜頰齒(用於對食草的適應)和複雜胃。伴隨複雜消化系統的出現,它們有了反芻的行為:將半消化狀態的食團吐回嘴裡重新加以咀嚼後下咽以獲得對養分的最大程度利用。  根據分子生物學研究,早期偶蹄動物中與河馬最接近的一支雜食有蹄動物,即鯨下目,在始新世就返回大海,演化為今天的鯨。豬型亞目多數是雜食性。

  偶蹄類動物的分類受到了熱烈的爭論,因為棲息在海洋中的鯨豚類從陸生的偶蹄類動物進化而來。有些有蹄類動物(河馬)與海洋棲息的鯨目動物比其他偶蹄類動物有更密切的關係。  這使得偶蹄動物傳統上被定義為無效的並系群分類,因為它包括來自共同祖先的動物,但不包括其所有後代。系統發育分類只識別單系群分類群; 也就是從一個共同的祖先下降,幷包括其所有後代的群體。為了解決這個問題,傳統的偶蹄目和鯨目有時被歸入更具包容性的鯨偶蹄目(Cetartiodactyla)分類群中。另一種方法是在修訂後的偶蹄目分類單元中包括陸地居住的甚至有蹄類動物和海洋棲息的鯨類動物(鯨目改為鯨下目)。

  

  本目各亞目的演化關係如下:

  

  偶蹄目動物對人類很重要。從史前開始偶蹄目動物就是人類的主要蛋白質來源,是古人類的重要的狩獵物件。在法國和西班牙的巖洞裡留下的克羅馬農人畫的壁畫,裡面就包括了大量的野牛、北山羊等偶蹄動物。幾乎所有的人類文明裡都有偶蹄動物的存在(比如舊大陸諸文明裡的牛、羊、駱駝,南美印第安人文明裡的駱馬、羊駝等)。人類最早馴化的家畜裡就有偶蹄動物。偶蹄動物是構成了人類畜牧業和農業的重要成分,是人類最主要的肉、乳製品來源動物,也是皮革業的重要來源動物。
偶蹄目(學名:Artiodactyla)是哺乳動物中的一個目,約220種,其中包括許多對人類生活很重要的動物。偶蹄目動物是現代進步的繁盛的有蹄類,90%的現存有蹄動物都是偶蹄動物。其中又以牛科最為繁盛。除了陸地上的種類,四足已經高度特化的海洋動物鯨豚類也是屬於這一演化支。