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  2001年9月11日星期二美國東部時間大約8點45分一架民航客機撞入紐約世貿中心北樓。在第一時間裡事件的嚴重程度,人員傷亡,和撞擊的原因都不為人知。當日9點過後不久,第二架飛機撞入了世貿中心的南樓。  大約10點左右,又有一架飛機撞入了位於華盛頓特區的美國國防部所在地五角大樓,第四架民航客機則墜毀在距匹茲堡東南80英里的薩默塞特縣。10點後不久,世貿中心北樓倒塌,半個小時後,南樓也塌陷。晚上17點30分左右,世貿中心7號樓也倒塌。9月12日星期三世貿中心旁邊的又一幢大樓崩倒。在911事件後美國開始了全球反恐的軍事行動。美國凍結了恐怖分子在美國的資產和獲得資金的網路,和許多以前衝突的不同之處,此次的反恐戰爭在國內和國際兩條戰線上同時展開。美軍很快在恐怖襲擊後在西南亞和阿富汗鄰國展開軍事部署合圍阿富汗。  針對911恐怖襲擊的軍事反擊行動代號為“持久自由”,但此行動在剛開始規劃時原稱“無限正義”行動(英語:Operation Infinite Justice)。只是考量到穆斯林認為只有真主阿拉才能賦予無限的正義,此名字有可能讓佔阿富汗大部分人口的穆斯林產生反感,美方因而決定改用較為無爭議的「持久自由」作為行動代號。

  “持久自由”行動於2001年10月7日正式展開。起初的軍事打擊是一系列的戰鬥組合,既有由空軍基地起飛的B-1,B-2和B-52同溫層堡壘轟炸機進行的戰略轟炸,由航空母艦上起飛的F-14雄貓式戰鬥機和F/A-18黃蜂式戰鬥攻擊機進行的戰術空襲,又包括由美國和英國軍艦及潛艇發射的戰斧巡航導彈所進行的遠端突襲。開始時的軍事目標,正如美國總統小布什在9月20日的國會演說中和10月7日對全國的演說中提到的,包括恐怖分子訓練營和阿富汗境內的基礎設施,抓捕阿爾卡伊達的首領和停止阿富汗境內的恐怖活動。  美國國防部長唐納德·拉姆斯菲爾德在10月7日的戰事簡報中提到美國的目的是要讓阿富汗的塔利班政權清楚的明白容忍恐怖分子是不被接受的,美國的目的是為了得到有關阿爾卡伊達和塔利班的情報,為了同反塔利班組織建立聯絡,為了防止阿富汗成為恐怖分子的避風港,為了摧毀塔利班的軍事力量從而保證反塔利班組織在殘酷的鬥爭中存活下來。最後,軍事力量可以幫助向阿富汗人民提供人道主義援助。  在此次的軍事行動中英國在10月16日發表的“女王陛下政府戰鬥目的”中同樣確定了其軍事目的。軍事行動的短期目的是抓捕奧薩馬·本·拉登及其他阿爾卡伊達首領,防止阿爾卡伊達進行其他的恐怖攻擊,結束阿富汗成為庇護恐怖分子避風港,摧毀恐怖分子的訓練營和基礎設施,解除毛拉·奧馬爾和他的塔利班政權。長期的軍事目的是結束恐怖主義,阻止個別國家對恐怖主義的支援和使阿富汗重歸國際社會。

  在911事件發生時,湯米·法蘭克斯將軍正在巴基斯坦同巴基斯坦總統穆沙拉夫討論一系列有關安全合作和反恐的事宜。911事件使得他不得不立即提前返回佛羅里達的坦帕,在那裡他的手下已經開始同國防部和其他政府部門考慮軍事指揮和控制的可能性了。  在9月12日國防部長的指示下,美軍開始準備針對反恐可能的軍事選擇了。對於美軍中央司令部來說,這個指示在策劃在阿富汗的軍事行動中起到了非常重要的角色。法蘭克斯將軍在9月21日對總統的彙報中提到的這種戰略思想是美國中央司令部,作為美國全球反恐戰略中的一部分,應當徹底摧毀在阿富汗的阿爾卡伊達恐怖組織及收留並保護他們的塔利班政權。在計劃當中不僅包括對敵人的評估,還包括了在阿富汗所發生的所有軍事行動的歷史和在本地區的政治軍事狀況。在分析完整個任務之後,法蘭克斯將軍提出了軍事行動的建議,並在10月1日得到了國防部長的同意。10月2日法蘭克斯將軍向總統小布什彙報了他的建議,總統指示他美軍的軍事打擊應當在10月7日務必開始,即在紐約和五角大樓受到恐怖襲擊後的26天后。  軍事行動可以使用美國全國的力量,可以得到國際社會的大力支援。到2002年聯軍已經擴大到68個國家,其中27個國家向美國中央司令部派駐了代表。  不僅國際上得到了聯軍的合作和支援,而且在國內幾乎所有的美國政府部門和機構都參與進來,美國中央司令部同時在不同的戰線上展開了多種軍事打擊。此行動一開始就確定了它的目的,那就是抓住戰機擴大戰果,在總結了以前在阿富汗軍事行動的教訓,美軍避免了入侵而選擇了合作。這個戰略的一個重要的因素是就是在開放和使用軍事基地,發動軍事攻擊和允許美軍戰鬥機飛越領空之間的協調。這種政治和軍事上的協調是進行和維持持久的戰鬥的所必需的條件。  在各條戰線上所進行的軍事行動最大特點是對阿爾卡伊達和塔利班的領導權進行直接打擊和對阿富汗人民提供人道主義的援助。還有一條戰線集中在對塔利班武裝的摧毀上,運用非傳統的戰爭手段加強各個反塔利班組織的力量,因為他們的利益同美國是一致的。軍事行動的火力主要是由先期潛入敵方的特種行動部隊所指引,這也被證明是非常別出心裁和成功的。此外,美軍中央司令部部署的特種行動部隊還在偵察和直接行動中扮演了重要的角色,如果需要,他們還可以向聯軍提供常規火力支援。  美軍在各種戰線上同時進行的而非先後進行的軍事行動所取得的成功被認為是一個奇蹟。10月7日前,塔利班還控制著阿富汗80%的領土,反塔利班武裝還在進行著艱苦的鬥爭,阿爾卡伊達的恐怖份子們還自由逍遙地在訓練營裡和全阿富汗活動。阿富汗在當時完全是一個庇護恐怖分子的國家。 到2001年10月21日,美國及其聯軍事實上已經摧毀了塔利班政權的所有空中力量並對塔利班首領穆拉·奧馬爾在首都坎大哈的住所進行了直接打擊。在這段時間了,美軍特種行動先遣部隊同反塔利班武裝的首領取得了聯絡,協調了行動火力和在各條戰線上的後勤支援。20天后馬扎爾·沙里夫陷落,很快黑拉特,喀布林和賈拉拉巴德也相繼陷落。到12月中旬美國海軍陸戰隊已經控制了坎大哈機場,塔利班的首都已經到了反塔利班武裝的手裡。在幾個星期裡塔利班和阿爾卡伊達已經被驅趕到被隔離的山區裡。10月22日法蘭克斯將軍訪問了喀布林並參加了阿富汗臨時政府宣誓就職的儀式,即在戰鬥開始的78天后。  到2002年的3月中旬,塔利班已經失去了對阿富汗的統治,阿爾卡伊達在阿富汗建立的恐怖網路已經被完全摧毀。美軍繼續審問塔利班的俘虜並挖掘對一些敏感地區的情報價值,以防止將來的恐怖襲擊並深入的瞭解他的對手阿爾卡伊達,包括它的計劃,人員,組織結構和目標。美軍徹底清查了每個地點以確保沒有研究和生產生化武器和核武器的存在。聯軍繼續進行清繳塔利班武裝和阿爾卡伊達恐怖組織的殘餘力量和倖存的領導人。

  在911恐怖襲擊後的126天裡,美軍和聯軍在軍事上取得了顯著的成果,以下是幾個例子:

  到2002年3月中旬,美軍中央司令部開始對“持久自由”軍事行動中的教訓進行先期總結。因為戰事沒有完全結束,最後的總結還有點為期過早,不過美軍中央司令部也確實總結了一些教訓:
持久自由行動(英語:Operation Enduring Freedom)是美國及其盟國所組成的聯軍,自2001年起開始執行、一連串針對基地組織和對該組織進行庇護的阿富汗塔利班政權所採取之軍事行動的總稱,也是俗稱反恐戰爭(英語:War on Terror)、因為九一一事件而引起的軍事衝突之一部分。