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  本項賽事總共有35支來自13個不同國家的球隊參賽(包括外圍賽及分組賽),以下為本年度入選國家

  外圍賽(5隊) 小組賽(32隊)  雖然獲得2008年越南職業足球聯賽冠軍的平陽、2008年亞洲足協盃冠軍及亞軍的慕哈瑞克及薩法合資格參與外圍賽,但由於其所屬的聯賽均未能符合改革要求,3隊因而被除去參賽資格。

  外圍賽於2月18日及2月25日舉行。

  小組賽將於2009年1月7日舉行抽籤儀式。小組賽於3月11日、3月18日、4月8日、4月22日、5月6日及5月20日舉行。

  沙迦表示需要集中精力面對本國聯賽之護級戰,因此決定退出亞冠聯賽剩下兩輪的比賽。沙迦在亞冠聯賽中的所有戰績(積分、入球、失球)將被取消,他們的成績在小組排名中不被考慮。

  

  十六強賽事採取單場淘汰制,各小組冠軍隊伍會在其主場與另一小組次名隊伍對壘,以爭奪八強席位。

  首回合將於2009年9月23日舉行,而次回合亦安排於9月30日上演。

  首回合將於2009年10月21日舉行,而次回合亦安排於10月28日上演。

  2009年亞洲聯賽冠軍盃決賽將於日本東京國立霞丘陸上競技場舉行。

  預選賽進球沒有被計算在內。
2009年亞足聯冠軍聯賽(AFC Champions League 2009)是第 28 屆亞足聯冠軍聯賽。本項比賽由亞洲足球聯合總會所舉辦。2009年賽事參賽隊伍首次增加至 32 隊,亦會加上十六強的賽事,衛冕冠軍不再可以直接進入淘汰賽。賽程還新增兩回合的外圍賽階段,舉行日期為2月18日和2月25日,其中新加坡武裝部隊從東亞區出線成為首支參加亞冠的新加坡球隊。小組賽有六個比賽日(三月至五月)加上一天的十六強比賽日(東亞和西亞分別作賽)。其後於九月便開始八強賽事。本屆決賽亦不再舉行主客兩回合的比賽,會重新以一場的決賽定勝負,並且定於11月7日舉行。