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  聖殿的前身是一座禮拜堂(chapel,或稱capilla),用粗糙的圓木作架,聶帕棕櫚樹作茅草屋頂,建在Plaza de España周圍。這座教堂被眾多行政機關建築所環繞,成為一個焦點。在迪亞哥·路易斯·德·桑·維多利亞的指導下,並在阿加尼亞的查莫羅人(Chamorro people)幫助下,該教堂於1669年2月2日舉行了落成儀式。女王瑪麗亞·安娜資助了300比索,阿加尼亞的柯普哈酋長提供了土地。1670年,一幢更為永久性的建築樹立起來。該建築是採用毛石工程(mamposteria)技術以珊瑚石構築,自此結構基礎上漸漸構築起整個主教座堂。此種結構內部是用伊菲爾木(ifil wood)構築的牆、天花板和地面。後牆上的溼壁畫(fresco)畫的是聖母昇天(Assumption of the Blessed Virgin Mary)。最初的主教座堂在奪取關島的炮擊中被毀。  根據歷史學家Benigno Palomo的研究,1669年,西班牙士兵和傳教士們的一項主要任務就是提升“天主教信仰”,並且“居住在島嶼和陸地上的此等人民,你將要且必須要使他們皈依天主教”,這來自教宗亞歷山大六世發表的分割法案(Bill of Partition)。  其他地方如離Umatac很近的Funa,Tepungan by Asan,Ritidian,Tarrague,Dededo,Orote也建起了教堂。起初,其中很多教堂都被查莫羅人摧毀了,因為他們想恢復他們的獨立。其他是被自然原因摧毀的。年深日久後,查莫羅人逐漸接受了西班牙人的信仰並將其實為他們自己的信仰。  時光流逝,村莊生活已圍繞教堂展開。儀式包括出生儀式,成年儀式,結婚儀式以及喪葬儀式都是圍繞教堂舉行的。  戰前關島有9座教堂和22座禮拜堂。禮拜堂是村莊之間很小的聖所,在這裡正在外出或還家的長途旅行者可以進行私人祈禱。所有這些都毀於二戰,除了Umatac的San Dionisio教堂,Inarajan的San Jose教堂,以及Yona的San Francisco教堂。

  毀於戰爭的教堂被重建起來,並有新教堂建立。  教堂內有卡瑪倫聖母(西班牙語:Santa Maria del Kamalen;英語:Our Lady of Camarin)的雕像,該像是在17世紀被一位漁民發現漂浮在海上從而撿到的。在教堂的祭壇旁邊是教堂神父們的葬地。在原先阿加尼亞第一座教堂附近埋葬著數位matua,或稱查莫羅人中的高層人士,比如Maga'lahi Ke'puha。如世界其他地方的主教座堂一樣,也擁有宗教文物真十字架的一片。
阿加尼亞聖母瑪利亞聖殿(Dulce Nombre de Maria Cathedral Basilica)是一座天主教教堂,坐落於關島首座天主教堂的基址上。關島的首座天主教堂是在教士迪亞哥·路易斯·德·桑·維多利亞的指導下建於1669年。現在的聖殿建築隱現於棕櫚樹林中,是阿加尼亞眾所周知的地標。