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  1966年在天文臺現址附近由史密森尼學會出資金進行天文臺道路工程。首座望遠鏡-惠普爾10米伽馬射線望遠鏡於1968年完成。  本天文臺原名是「霍普金斯山天文臺」(The Mount Hopkins Observatory),於1981年改為現名以尊崇史密鬆天體物理臺榮譽退休教授,也是知名行星科學家和太空探測先驅弗雷德·惠普爾,在他的領導下於亞利桑納州完成了這座天文臺。

  惠普爾天文臺設有口徑6.5米的多鏡面望遠鏡,由史密鬆天體物理臺和亞利桑那大學共同操作。該天文臺也有口徑1.5和1.2米的反射望遠鏡,以及命名為PAIRITEL(Peters Automated IR Imaging Telescope,2微米全天巡天)的紅外線望遠鏡。另有尋找太陽系外行星的匈牙利自動望遠鏡網路計劃和MEarth計劃的望遠鏡。  惠普爾天文臺因為是在地面首次進行伽馬射線天文學觀測的先驅而聞名。該臺發展出了大氣層契忍可夫輻射成像技術(Imaging Atmospheric Cherenkov Technique,IACT),並在1980年代早期用於惠普爾10米伽馬射線望遠鏡。該望遠鏡目前已準備在使用40年後停用拆除。  2007年4月,設有一個直徑12米反射鏡、4個IACT望遠鏡的伽馬射線陣列的超高能輻射成像望遠鏡陣列系統(Very Energetic Radiation Imaging Telescope Array System,VERITAS)正式啟用。接著於2009年9月,一個望遠鏡在經過4個月工程後移到新位置使陣列對稱和增加靈敏度。
弗雷德·勞倫斯·惠普爾天文臺(Fred Lawrence Whipple Observatory)是一個由史密鬆天體物理臺擁有並操作的天文臺,是該臺在麻州劍橋總部以外最大的天文臺。位於亞利桑那州阿瑪多霍普金斯山坡上。