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  帕木竹巴政權由元代烏思藏“十三萬戶”之一的伯木古魯萬戶演變而來,但“帕木竹巴”之名可追溯到宋代吐蕃佛教的“後弘期”。  南宋紹興年閒,噶舉派(白教)的支系達布噶舉派僧人多吉傑布在帕木竹(在今西藏山南地區桑日縣)建立了丹薩替寺,創立了帕竹噶舉派,為達布噶舉派的四大支系之一。多吉傑布獲得了“帕木竹巴”的稱號。帕竹噶舉派以丹薩替寺為祖寺,勢力迅速發展,後來又分化出八個小流派。帕木竹當地的豪族朗林色氏(རླངས་ལྷ་གཟིགས།,簡稱朗氏,རླངས།)與帕竹噶舉派共同統治此地。宋嘉定元年(1208年),出身朗氏家族的僧人扎巴迥乃成為丹薩替寺的座主(藏語尊稱為“京俄”),此後該寺座主為朗氏家族成員世代承襲。  元代在西藏地區設立了烏思藏納裡速古魯孫等三路宣慰使司都元帥府,將烏思藏劃分為十三個萬戶,在今乃東縣、桑日縣一帶設立了伯木古魯萬戶。各萬戶從屬於薩斯迦(今薩迦縣)的烏思藏軍民萬戶,也就是世襲此職的薩迦派(花教)款氏家族。起初,朗氏家族效倣款氏家族與薩迦派本欽的關係,通過控制伯木古魯萬戶長進行統治。萬戶長的人選須由丹薩替寺座主舉薦,而丹薩替寺一直由朗氏家族把持。因此萬戶長代表朗氏家族的利益。至元二十六年(1289年),朗氏家族的扎巴仁欽得到鎮西王鐵木耳不花與元朝帝師的許可,首次以丹薩替寺座主的身份出任伯木古魯萬戶長,被稱為喇本,以喇嘛身份擔任萬戶長,開創了西藏歷史上政教合一的先例。但是在扎巴仁欽之後,萬戶長又由俗人擔任。

  朗氏家族中第二次以丹薩替寺座主兼任萬戶長的是絳曲堅贊。絳曲堅贊是扎巴仁欽之侄,幼年時曾前往薩斯迦學習,返回帕木竹後出任丹薩替寺座主。元至治二年(1322年),絳曲堅贊廢黜了萬戶長堅贊夾卜,自任伯木古魯萬戶長,並得到了宣政院和薩迦巴的認可。這標誌著政教合一的帕竹政權初步形成。  八思巴去世後,薩斯迦內部紛爭不斷,實力逐漸衰落。元順帝初年,因爭奪土地和人口,伯木古魯萬戶與雅桑巴萬戶(《元史》作牙裡不藏思巴)多次發生衝突,絳曲堅贊派兵攻佔了雅桑巴的一些地方,並要求接管旭烈兀在西藏的封地。雅桑巴要求薩斯迦出面裁決。薩斯迦企圖扶持雅桑巴,以遏制絳曲堅讚的擴張。薩迦派帝師貢噶洛追堅贊向朝廷請求革除絳曲堅讚的職位。  至正六年(1346年),薩斯迦本欽甲哇桑布率領雅桑巴萬戶、搽裡八(今譯作蔡巴)萬戶、迷兒軍(今譯作止貢)萬戶聯軍,進抵伯木古魯萬戶的治所烈伍棟城。絳曲堅贊在甲哇桑布面前與雅桑巴萬戶長對質時被拘捕。但薩斯迦軍隊沒有攻下烈伍棟城,暫時退兵。不久薩斯迦發生內訌,甲哇桑布考慮到自己的長遠利益釋放了絳曲堅贊。至正八年(1348年),薩斯迦本欽旺秋貝再次率軍進攻伯木古魯,被絳曲堅贊擊敗。絳曲堅贊進而控制了雅桑巴、蔡巴萬戶的領地。  至正十年(1350年),絳曲堅贊遣使入京進貢,得到元廷的正式冊封。此後薩斯迦的內部爭闘愈演愈烈,貢噶洛追堅讚的兩個兒子拘禁了甲哇桑布,甲哇桑布之子向絳曲堅贊求援。至正十四年(1354年),絳曲堅贊以營救甲哇桑布為名,發兵攻入薩斯迦。在甲哇桑布的協助下,絳曲堅贊接管了出蜜(曲彌)、仁蚌(仁布)等地,分兵駐守薩斯迦大寺,然後返回烈伍棟。至正十八年(1358年),在拉孜的薩斯迦本欽集合藏地軍隊反攻,被絳曲堅贊徹底擊敗,本欽也被俘獲。此時的帕竹政權已經控制了烏思藏的主要地區。同年,元順帝封絳曲堅贊為大司徒,帕竹政權正式取代了薩迦派在西藏的領導地位。此後,絳曲堅贊在藏文史籍中被稱為“大司徒絳曲堅贊”。  絳曲堅贊在位時期,在領地內設定了多個宗,將元代以來烏思藏的宗谿制度固定下來。至正十一年(1351年)建立了節塘寺(今名澤當寺),其座主成為帕竹政權體系內的重要人物。至正二十四年(1364年),絳曲堅贊去世,其侄釋迦堅贊繼任,始稱第悉。四年後,明朝建立,取代了元朝在全國的統治。

  釋迦堅贊(《明史》作章陽沙加監藏),是絳曲堅贊弟弟索南桑波之子。明代立國伊始,明太祖力圖通過烏思藏“攝帝師”喃加巴藏卜和元朝帝室鎮西王卜納剌等招撫烏思藏各部頭領,並在藏內各地設定都司、萬戶,多封眾建,羈<unk>而治。洪武五年(1372年),河州衛上奏:“烏思藏怕木竹巴故元灌頂國師章陽沙加,人所信服。今朵甘賞竺監藏與管兀兒相仇殺,朝廷若以章陽沙加招撫之,則朵甘必內附矣。”朝廷於是封釋迦堅贊為“灌頂國師”。次年,釋迦堅贊遣鎖南藏卜赴南京朝貢,同年釋迦堅贊去世,丹薩替寺座主扎巴絳曲繼任第悉。洪武八年(1375年),置怕木竹巴萬戶府,以帕竹首領為萬戶長。洪武十四年(1381年)扎巴絳曲讓位於索南扎巴(《明史》作鎖南扎思巴噫監藏卜)。洪武十八年(1385年),索南扎巴讓位於扎巴堅贊(《明史》作吉剌思巴監藏巴藏卜),自己出任丹薩替寺座主。扎巴堅贊繼任後,平定了帕竹內部的動亂,在其後的大部分時間裡,各地相安無事,於是他將各宗的宗本由流任改為世襲,為帕竹政權後來的衰落留下了隱患。扎巴堅贊在位的四十餘年閒,帕竹政權臻於極盛。  明成祖即位後,對帕木竹巴在烏思藏地區的實力有了更多瞭解,於是在永樂四年(1406年)遣使封扎巴堅贊為灌頂國師闡化王。以後的歷任帕竹第悉,多使用漢語“王”的封號。帕竹政權下各宗(漢文史書稱為“寨”)的宗本也被朝廷封為都指揮僉事,如牛兒宗(即內鄔宗,在今堆龍德慶縣)、領司奔(今仁布縣)、公哥兒(今貢嘎縣)、答噶爾(今達孜縣)等。同時,朝廷也大量冊封各派僧人領袖,使其互相牽制,避免帕竹政權一家獨大。永樂五年,封噶瑪噶舉派上師哈立麻(今作得銀協巴)為“大寶法王”。永樂十一年(1413年),薩迦派上師貢噶扎西(《明太宗實錄》作昆澤思巴)入京朝覲,被封為“大乘法王”。貢噶扎西返藏時,明成祖令帕竹第悉將其佔領了五十餘年的薩迦寺歸還薩迦派,並派漢官到薩迦舉行隆重的交接儀式。

  仁蚌家族原是大司徒絳曲堅讚的家臣,本姓格爾。後因駐守薩迦寺有功,被扎巴堅贊封為仁蚌宗(今日喀則仁布縣)的宗本,世襲此職,被稱為仁蚌巴。扎巴堅贊有一弟,名為桑結堅贊(《明史》作桑兒結堅昝巴藏卜)。桑結堅贊有兩個位妻子,都出於仁蚌家族,其中一位是仁蚌巴諾布桑波的女兒。她們各生有一子:扎巴迥乃(《明史》作吉剌思巴永耐堅藏巴藏卜)和貢噶勒巴(《明史》作公葛列思巴中柰領佔堅參巴兒藏卜)。扎巴堅贊去世後,桑結堅贊與扎巴迥乃爭奪王位(第悉)的繼承權。在仁蚌巴和丹薩替寺座主索南堅讚的支援下,正統五年(1440年),扎巴迥乃承襲闡化王位。索南堅贊死後,桑結堅贊企圖奪取兒子的王位,失敗後避居外地。但在正統十一年(1446年)扎巴迥乃死後,桑結堅贊要求“借襲”闡化王位,卻也得到朝廷的批准,出現了父承子位的局面。此後帕竹政權陷入內部紛爭之中,父子交替上臺執政,仁蚌巴的勢力則不斷髮展,逐步架空了帕竹政權的統治。 成化五年(1469年)扎巴迥乃之弟貢噶勒巴承襲父位後,帕竹政權分裂為支援貢噶勒巴與支援貢噶勒巴妻子曲貝桑姆(仁蚌氏之女)的兩派。貢噶勒巴在位時期,仁蚌家族用武力兼併了後藏一帶,前藏的貴族也紛紛倒向仁蚌巴。諾布桑波之子錯傑多吉執政時,仁蚌巴控制了帕竹的統治中心澤當,甚至可以操縱闡化王的廢立。扎巴迥乃之子阿格旺波(《明孝宗實錄》作阿吉汪束<unk>巴,《明史》作班阿吉江東<unk>巴)在位時,各處衝突迭起,帕竹第悉僅能勉強維持局面。阿格旺波死後,第悉之位空出,仁蚌巴掌握了帕竹的實權,後來擁立年僅十二歲的阿旺扎西扎巴(《明史》作阿往<unk>失<unk>巴堅參)為第悉,並讓他娶仁蚌氏之女為妻。阿旺扎西扎巴時期,帕竹第悉的權威有所恢復,但帕竹與仁蚌巴的衝突公開化,多次兵戎相見。在宗教上,原本信奉帕竹噶舉派的帕竹第悉與不同宗的格魯派(黃教)結盟,仁蚌巴則支援同一派系內的噶瑪噶舉派,政權衝突又導致了教派衝突。帕竹第悉與格魯派、仁蚌巴、止貢派、達隆派之間發生混戰。仁蚌巴一度禁止拉薩的格魯派參加祈願法會,改由噶瑪噶舉派和薩迦派主持。帕竹第悉則恢復格魯派的權力,並延請格魯派僧人根敦嘉措(後來被追認為二世達賴喇嘛)主持拉薩的祈願法會。根敦嘉措還接受了帕竹第悉贈予的住所,即今哲蚌寺內之甘丹頗章。嘉靖四十三年(1565年),阿旺扎西扎巴才遣使向朝廷請封闡化王之位。

  大約在嘉靖末年,阿旺扎西扎巴之子夏仲阿旺扎巴繼任第悉。萬曆七年(1579年),札釋藏卜入貢請封,仍襲闡化王號。札釋藏卜死後,其子請求襲職,明神宗採納沈一貫之言,加稱其為“烏思藏怕木竹巴灌頂國師闡化王”。“其後奉貢不替。”之後的帕竹第悉的事蹟幾乎湮沒無聞。帕竹政權雖然名存實亡,但仍是經明朝冊封的前藏地區名義上的統治者。此時仁蚌巴的統治也開始衰落。仁蚌巴的屬臣辛廈巴·才旦多吉,趁仁蚌巴阿旺吉扎領兵外出時,在三竹節(今譯作桑珠孜,即日喀則市)發動兵變,殺死了阿旺吉扎之子,隨後成功抵擋住了阿旺吉扎的反攻。才旦多吉死後,其子袞巴拉旺多吉進而控制了後藏的大部分地區,取代了仁蚌巴阿旺吉扎的統治。  仁蚌巴一度架空了帕竹政權,但在名義上仍從屬於帕木竹巴第悉。而辛廈巴家族並不滿足於臣屬地位。萬曆三十九年(1611年),袞巴拉旺多吉的侄子彭措南傑自稱第悉,號為第悉藏巴,漢文稱之為藏巴汗。兩年後(1613年),彭措南傑進軍前藏,攻佔了澤當等地,企圖控制前藏。由於辛廈巴家族同樣尊奉噶瑪噶舉派,引起了格魯派的不滿。萬曆四十五年(1617年),格魯派引青海喀爾喀蒙古軍隊入藏,聯同色拉寺、哲蚌寺僧兵攻打駐守拉薩的藏巴汗軍隊。次年(1618年),彭措南傑平定了動亂,使前藏大部分地區也臣服於藏巴汗。現代藏學一般將1618年定為藏巴汗取代帕竹政權統治西藏地區的開始。但此時的帕木竹巴世系並未消亡,闡化王(帕竹第悉)的名號仍具有號召力。  清崇德八年(崇禎十六年、1643年),“闡化王及河州弘化、顯慶二寺僧、天全六番、烏斯藏董卜......先後入貢,獻前明敕印,請內附矣”。順治、康熙之際,統治後藏的和碩特顧實汗已死,五世達賴年邁,執掌權柄的第巴桑結嘉措多次冒用闡化王的名義遣使入貢,請賜敕印,被清廷察覺。此時,帕木竹巴闡化王已“久經殘破,廢為喇嘛”。
帕木竹巴政權(),簡稱帕竹政權,是14—16世紀統治今西藏中南部地區的政權。帕木竹巴興起於中國元、明之際,元代譯作“伯木古魯”,明代作“怕木竹巴”。今譯作帕木竹巴,又稱“帕竹第悉”。元朝和明朝朝廷曾分別封其頭目為大司徒、灌頂國師闡化王,故又稱“帕木竹巴闡化王”。帕木竹巴之名來源於藏傳佛教噶舉派僧人多吉傑布,因其在帕木竹建寺傳教,被稱為帕木竹巴·多吉傑布(1100-1170;phag mo gru pa rdo rje rgyal po;Phagmo Drupa Dorje Gyalpo)。後來“帕木竹巴”名號被當地的朗氏家族繼承,以烈伍棟(今乃東縣澤當鎮)為統治中心,建立了西藏第一個政教合一的政權,末代貢瑪卓尾貢波死後名存實亡,一直延續到明末清初。