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  甲巰咪唑是治療甲狀腺功能亢進症(像是瀰漫性毒性甲狀腺腫)的藥物,在進行甲狀腺手術前,也會讓患者服用甲巰咪唑來降低甲狀腺激素濃度,也減少甲狀腺激素調整過程中的的副作用。在獸醫學中,也會用甲巰咪唑來治療貓的甲狀腺功能亢進症。

  在服用甲巰咪唑時,需注意是否有像是發燒或是喉嚨痛的症狀,這些症狀表示可能有出現粒細胞缺乏症,粒細胞缺乏症是一種罕見但是嚴重的副作用,是因為白血球數量低下(更具體的說法,是缺少中性粒細胞的嗜中性白血球低下)。其鑑別診斷方式是暫停用藥,並且進行全血球計數。若使用重組的人粒細胞集落刺激因子可以幫助其復原。  其他已知的副作用有:

  若是有以下情形的患者,服用甲巰咪唑會有不良影響::

  甲巰咪唑會抑制甲狀腺過氧化物酶的作用。正常情形下甲狀腺過氧化物酶會將碘離子(I)氧化成碘(I)、次碘酸(HOI)、酶聯低碘酸鹽(EOI),這些可以在激素前體甲狀腺球蛋白中的酪氨酸殘基中加入碘,這是合成三碘甲狀腺原氨酸(T)及甲狀腺素(T)的重要步驟。  甲巰咪唑不會抑制卵泡細胞基底膜上鈉依賴性碘轉運蛋白的作用,要有像高氯酸鹽或是硫氰酸鹽等競爭性的抑制劑才能抑制該作用。  甲巰咪唑會作用在CXCL10。
甲巰咪唑(methimazole、thiamazole),是抗甲狀腺藥,屬於硫代醯胺類藥物。甲巰咪唑的主要副作用和丙硫氧嘧啶類似,包括有粒細胞缺乏症及肝炎等。