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  波斯帝國經過三十年的征戰,岡比西斯二世時,國境東達印度邊境、西至愛琴海、北抵黑海、南及努比亞和印度洋。岡比西斯二世時,遭到兄弟巴爾狄亞兵變,岡比西斯二世在回師征討時神祕死亡。波斯宗室大流士一世起兵,宣稱巴爾狄亞先前已被岡比西斯二世處死,這個「巴爾狄亞」是僧人高莫達冒充。大流士結合實力派軍人,殺死「高莫達」,自立為帝。  大流士登基時,整個波斯帝國已經處於一種極為動盪不安的危險局面,國內叛亂四起,國外一些大國則虎視眈眈,帝國懸於分崩離析的邊緣。為了避免這種結果,為了鞏固自己的統治政權,大流士開始以嚴酷的手段鎮壓內亂、恢復帝國秩序、組織規模更加龐大的艦隊。在所有舉措中,大流士最偉大的一個策略是建立起一個覆蓋整個帝國的大交通網,如此一來,帝國的軍隊就有了可怕的機動性。  內部叛亂平定後,大流士即開始拓展帝國疆域。國界向東越過了印度河後,大流士便著手西擴的計劃,他打算拿下希臘,以完成所謂的“人種的西界”(波斯人和希臘人同為雅利安人的後代)。  希臘和波斯之間戰爭爆發的直接起因是愛奧尼亞叛亂。當時愛奧尼亞的米利都是波斯的殖民地,其叛亂時,雅典和埃雷特里亞曾經派出約30艘艦船援助米利都。叛亂失敗後,大流士決定攻佔雅典。

  前528年,雅典城的僭主庇西特拉圖逝世,他的兩個兒子希庇亞斯(Hippias)和西帕庫斯(Hipparchus)繼承了他。前510年,雅典人在斯巴達國王的幫助下驅逐了暴政的希庇亞斯,由另一位貴族克利斯提尼獲得政權,實行民主的統治。  希庇亞斯被放逐後逃亡到波斯宮廷中,愛奧尼亞叛亂一結束,希庇亞斯就慫恿大流士攻佔雅典,他保證雅典將歸順於大流士,只要大流士答應幫助他復辟。大流士接受了希庇亞斯的提議,實際上,大流士的野心更大,他打算扶植起希庇亞斯在雅典的傀儡政權,以便孤立繼而併吞斯巴達,最終侵佔整個希臘。  希庇亞斯還告訴大流士,在雅典城內有一個家族阿爾克邁翁,這個家族是站在希庇亞斯這邊的,他們會幫助希庇亞斯在雅典復辟。另外,雅典在愛奧尼亞叛亂時曾援助過米利都,由於害怕波斯可怕的報復,因此一些主和分子此時主張與波斯人合作。

  馬拉松戰役可以說是雅典,也可以說是整個希臘第一次靠自己的力量擊退波斯的一場會戰,對於希臘文明在之後三個世紀中所達到的光輝無比的成就而言,馬拉松戰役無疑是這一成就的最初的臺階。然而,對於希臘和波斯之間的戰爭而言,馬拉松戰役的勝敗並不具有決定性意義,因為,希波戰爭一直到前449年方始結束。

  雅典軍之所以能夠在馬拉松戰役中打敗波斯軍,主要歸功於雅典軍當時所排列的那種戰鬥序列。在這場會戰中,雅典軍擺出的是一種在簡單平行戰鬥序列的基礎上,加強兩翼兵力的戰鬥序列;而波斯軍只是擺出了簡單平行戰鬥序列。隨著戰事的行進,雅典軍的這種重兩翼的平行戰鬥序列的中央部分開始向內凹入,最後呈現出近於垂直的戰鬥序列,對深入敵陣的波斯軍形成兩面夾擊。  實際上,從重兩翼的平行戰鬥序列到垂直戰鬥序列的應用,並非出於雅典軍的預謀,而是隨著戰局的發展而自然形成的,雅典軍在戰鬥之初會強固兩翼只是出於一種防止被在兵力方面勝出三分之一的波斯軍包圍的考慮。兩百多年後,漢尼拔在坎尼會戰時,又一次採取了這種戰鬥序列,並且大獲全勝。不過,漢尼拔對於這一戰鬥序列的運用是出於精心計算的,他在戰鬥之初便擺開了一種中央部分凹入的戰鬥序列,誘使敵軍深入,最後將之包圍殲滅。

  

  據說,當雅典軍在馬拉松平原打敗波斯軍後,使者費裡皮德斯由馬拉松平原跑回雅典報捷,全程約42.195公里(此處可能280餘碼,42.195出現於英國的一次奧運會,運動員們到達終點後再接著跑到了女王所在處,將這一數字變為小數),途中從未停頓。當費裡皮德斯回到雅典,將勝利的訊息轉告雅典人後,當即死去。為了紀念他,希臘人在1896年舉行了第一次馬拉松賽跑大會。
馬拉松戰役(希臘語, "Machē tou Marathōnos")發生在公元前490年的一場戰役,古希臘城邦聯軍對抗波斯帝國,最終由雅典與斯巴達領導的希臘聯軍獲勝。