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  東北鼠疫來源於患有鼠疫的土撥鼠。1910年夏,俄羅斯帝國境內西伯利亞出現由土撥鼠(旱獺屬)引發的鼠疫,而此時有華工前往西伯利亞捕殺土撥鼠製作皮毛。  1910年9月16日,在俄羅斯帝國的達烏里亞發現了首例患者。10月初數名華工染病身亡,俄方於是驅逐染疫華工,其中兩名被逐華工到了滿洲里。  1910年10月25日,滿洲里一家客棧爆發鼠疫並出現死亡案例。而從俄羅斯返回中國的兩名工人曾住在這家客棧。此後隨著闖關東的山東務工者開始乘火車回鄉過年,鼠疫沿著鐵路線蔓延。1910年10月27日,哈爾濱的俄國租界出現了第一例鼠疫患者。11月7日,哈爾濱傅家甸也出現了鼠疫患者。此後,傅家甸在三個月內約有5000人因患鼠疫而死亡。截止至1910年12月初,哈爾濱每日死亡人數達到一百多人。而從哈爾濱返回長春的商人將鼠疫傳染給家人,致使當地約有2000人死亡。1911年1月2日,奉天發現首例鼠疫患者。後來從1月4日至2月1日,大連、北京、天津、保定、旅順、芝罘、濟南先後出現鼠疫患者。  東北鼠疫不僅造成大量人口死亡,還嚴重影響經濟。在奉天出現了擠兌風潮。在鐵嶺、錦州、營口、安東等地,因交通阻斷,市面缺貨,大量商鋪倒閉,商品價格瘋漲。在哈爾濱,因貨物減少,關稅的徵收受到影響。學校和工礦也紛紛停課和停產。

  隆裕太后任命天津陸軍軍醫學堂副監督伍連德擔任全權總醫官,負責東北鼠疫疫區防疫救治。1910年12月27日,伍連德首次對鼠疫死亡患者進行屍檢,並從屍體身上發現鼠疫源頭鼠疫桿菌。伍連德後來又在俄國人加工的皮毛上發現了大量的鼠疫桿菌。伍連德認為此次鼠疫屬於會人際間通過飛沫和空氣傳播的肺鼠疫而非人鼠傳播的腺鼠疫。  1911年1月,隆裕太后指定協和醫學堂為鼠疫防治中心。此外疫情蔓延後東北開展打鼠行動和隔離病人;哈爾濱傅家甸遭封城;同時山海關被封鎖;南滿鐵路、東清鐵路和京津鐵路停止執行;在東北對當地居民廣泛配發口罩;嚴格控制居民串門;醫院根據病人病情劃分為不同區域阻止交叉感染;焚燒帶有鼠疫桿菌的屍體。  經過一系列防疫措施後,1911年3月1日,哈爾濱的死亡人數為零。伍連德宣佈解除對傅家甸的封鎖。4月18日,鼠疫被徹底消滅。4月23日,隆裕太后宣佈東三省鼠疫肅清。
1910-1911年東北鼠疫是發生在1910年10月末至1911年4月中旬的清朝的一場鼠疫,也是中國歷史上最大的一次鼠疫之一,這次鼠疫波及69個縣,共死亡6萬餘人。