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  皇帝企鵝是群居性動物。每當惡劣的氣候來臨,牠們會擠在一起防風禦寒。皇帝企鵝活動時間固定,夜晚出現,皇帝企鵝的活動區域主要有兩處,一處為飲食區,一處為繁殖區,它們常年往來於這兩個區域。僅在每年的1月到3月,皇帝企鵝會分散到大洋中,分成小群進行捕食  皇帝企鵝可以潛入水底150至500米,最深的潛水記錄甚至可達565米。在水下,它們最長能屏住呼吸1小時。它們的遊行速度為時速6到9千米,爆發速度可達到時速20千米。它們常用的一種捕食方法是潛入水底50米左右,然後在那裡的浮冰下表面捕食貼近冰面遊行的南極魚("Pagothenioa borchgrevinki"),一般捕食六次後再浮出水面進行呼吸。  在陸地上,皇帝企鵝是靠雙腳搖搖擺擺行走或用腹部緊貼冰面滑行,在南極的冬季來臨之前,一般每年的4月至5月間,成年皇帝企鵝要在南極浮冰區走出50至120千米,搬至繁殖區生活。為了抵抗寒冷,皇帝企鵝群經常要緩慢前行。  皇帝企鵝主要以甲殼類動物為食,偶爾也捕食小魚和烏賊。它是唯一一種在南極洲的冬季進行繁殖的企鵝。在野生環境,皇帝企鵝壽命一般在10年左右,個別壽命可達20年。  在野外,皇帝企鵝的主要天敵包括南極巨海燕、豹海豹、逆戟鯨、賊鷗和鯊魚。此外雪地流浪犬和它們的後代在被清除出南極之前,也是帝企鵝的一大天敵。

  皇帝企鵝一般在5歲時達到性成熟,成熟後的皇帝企鵝需要行進90千米到達繁殖地。每年3至4月,皇帝企鵝開始求愛,此時的氣溫一般都已降至零下40攝氏度。皇帝企鵝每年僅有一個伴侶,相互保持忠誠,共同繁育小企鵝。但是一年過後,多數皇帝企鵝都會更換伴侶。在5至6月,雌企鵝會產下一枚重0.45千克的蛋,此時它們身體儲存的能量消耗殆盡,必須返回大海捕食。在此期間,雄企鵝把蛋放在腳掌上,以孵卵斑保溫,孵化時間大約65天。這期間,雄企鵝不進食,多數時間在睡眠中度過,依靠體中儲存的脂肪度日。為了抵禦低溫和大風(可達200km/h),雄企鵝會擠在一起,並且輪流換到外圍。小企鵝出生後,如果雌企鵝仍沒有回來,企鵝爸爸就會將小帝企鵝坐在身下,以孵卵斑協助小企鵝保溫,再從食道的一個分泌腺中分泌出乳白色的乳狀物質來餵食小企鵝。 雌性企鵝大約出海2個月後,便會返回。它能在數以百計的新爸爸中,通過叫聲找到自己的丈夫,並吐出儲存在胃裡的食物來餵食小企鵝。雄企鵝這時便會離開,去大海覓食,但他離開的時間將會比雌企鵝離開的時間短一些,因為漸暖的天氣將會使大量的冰層融化,在陸地上行走的時間也會相對短暫。從此雙方輪流照看小企鵝和覓食。隨著天氣逐漸變暖,小企鵝出生大約兩個月後也可以單獨活動,會聚在一起取暖,但它們仍需要父母的餵食。 在南極的夏季即將結束時,小企鵝和企鵝父母將會一起返回大海的捕食區,在夏季結束後,未達到性成熟的企鵝將繼續留在捕食區,而那些成年的企鵝將重新開始返回繁殖區的旅程。

  在19世紀末20世紀初,為了獲取皇帝企鵝身上的油脂,曾有大量皇帝企鵝遭到人類屠殺,其數量不斷下減,到20世紀20年代前後,由於受公眾輿論強烈譴責,這種野蠻的屠殺才被迫停止。至1964年南極條約協商國制訂《保護南極動植物區系議定措施》之後,皇帝企鵝及其他許多南極物種已受到普遍的保護。  皇帝企鵝的現存數量估計在15萬至20萬對左右,其種群數量相對穩定,從2001年起,世界自然保護聯盟瀕危物種紅色名錄中,皇帝企鵝的保護狀況為近危。自2009至2012年,由澳洲南極事務局、英國南極勘測(BAS)、明尼蘇達大學、美國國家科學基金會(National Science Foundation),以及斯克里普斯海洋研究所(Scripps Institution of Oceanography)共組的研究團隊透過空照圖,使原先從地面取得的企鵝數量分析更為準確。調查結果顯示現存於南極之數量將近60萬。
皇帝企鵝(學名:')常簡稱為帝企鵝或皇企鵝,是企鵝家族中體型最大的屬種,成年皇帝企鵝身高可達120釐米,體重可達46公斤。在皇帝企鵝發現之前,有一種企鵝被認為是最大的企鵝,取名為國王企鵝。後來,在南極大陸沿海皇帝企鵝被發現,由於它比國王企鵝還高大,因此命名為皇帝企鵝。