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  上海地鐵現時有16條路線,運營總長約676公里,有413座車站。  大部分地鐵路線服務時間由早上五時到晚上23:00左右(在世博會期間,世博專線運營時間與世博園區同步,為9點至24點)。當到一些大型節日,如春節,在上海火車站、人民廣場站等大型車站都會派出更多員工去疏導乘客及協助乘客之乘車問題,或者在鐵路樞紐站點增投夜班或者備用列車。但是,如遇客流超過車站自身的接待能力或遇重大節日時,就會採取一些限流措施,諸如只出站不進站或者列車過站、跳站等等(例如國慶節期間南京東路站實行下午起封站至運營結束)。自2017年起,部分線路、區間在週五、週六和節假日延長運營時間至次日00:00前後。

  上海地鐵現有換乘站60個,其中四線換乘1座,三線換乘16座,兩線換乘43座。  現在仍需出站換乘的站點: 關於上海火車站站、虹橋2號航站樓站、南京西路站和長清路站的出站里程連續計算的換乘情形,見換乘和累計里程出站轉乘章節。  曾只能出站換乘的站點:  另外,在上海南站可換乘金山鐵路。張江站可換乘張江有軌電車。龍陽路站和浦東機場站可換乘上海磁懸浮。松江大學城站和松江體育中心站可換乘松江有軌電車。花橋站可換乘蘇州軌道交通S1線。

  目前上海地鐵的票價標準自2005年底起實行,採里程單價遞遠遞減制度。除5號線首通段按乘坐站點數計價外。0-6公里3元,6-16公里4元,16-26公里5元,以後每10公里加收一元,上不封頂,任意兩站間票價按最短路徑計算。乘客可使用單程票、交通卡、二維碼、日票、磁浮地鐵一票通等票種進站。

  上海地鐵每天流量超過一千萬人次,為保證通行效率大多數車站均採用三杆式閘機,但逃票現象每日仍有發生,且平均一分鐘就有18到25人逃票。在上海地鐵系統(1-13/16、17號線、浦江線)逃票會最高處以6倍票款的罰款。  上海地鐵目前一直與派出所(包括公安民警、保安、協警)合作嚴厲打擊地鐵逃票行為。2012年,上海地鐵查獲逃票總人數202,457人次,補票及加收金額472,898元。2013年6月3日起地鐵運營方宣佈所有逃票者將被記入個人信用資訊系統,可能導致其今後在貸款申請、求職等方面遇阻。但實際執行中地鐵執法人員僅對拒不補票者採取上述措施;而在部分常發生逃票現象的車站也將驗票閘機由原先的三杆式換為門式閘機。

  凡是有上海地鐵車站的道路均有相應線路地鐵站指路牌。

  乘客進站後到自動售票機購票,部分車站(如人民廣場站、上海火車站站等)有人工售票。乘客可利用自動售票機購票,在觸控式螢幕上點選要到達的線路,然後點選該線路的目的地車站,然後根據提示選擇要購票的張數,放入相應金額,足額後將吐出相應數量單程票卡。部分裝置有找零功能。(自動售票機分為「只收硬幣」和「硬幣紙幣均收」兩種機器,只收硬幣機收取1元和5角人民幣,硬幣紙幣均收機收取 5、10、20、50元紙幣 1、0.5元硬幣,會找零。)  所有車站配有上海公共交通卡自助充值機,其中部分支援售卡和退卡操作。乘客同樣可以選擇購買公共交通卡出行。

  僅限乘客持有當日當站未使用車票,可在服務中心退票。遇列車故障15分鐘以上也可以辦理退票,並可在官網、微信(WeChat)公眾號及大都會app上下載致歉信。

  上海地鐵大部分使用三杆閘機,部分車站使用門式閘機,一些車站在普通閘機旁邊配有大型翼式閘機。閘機採用右手持票原則(有時推杆活動部分在左側),進站時,乘客右手持單程票卡、一日票及交通卡或使用"metro大都會"app二維碼在閘機感應器上檢票方可推杆進站(或等待開門),出站時單程票卡插入閘機由投票口回收後方可推杆(或等待開門)出站,交通卡和一日票在感應器上讀卡確認螢幕顯示金額後推杆(或等待開門)出站,紀念票和二維碼為刷進刷出。進出站不成功的需在服務中心辦理充值或人工服務。

  在側式車站中,乘客需要在站廳層通過標識進入相應方向的站臺層。 部分側式車站雙向站臺不在付費區內聯通(如外環路站、蓮花路站、錦江樂園站、石龍路站、嘉定北站),進入錯誤方向的站臺可能需要重複支付車費或前往相鄰車站更換方向。  在換乘車站中,乘客需要先行確認需要乘坐的線路。各線路均有倒計時顯示候車時間。多數線路以大小交路、大站車或Y字交路運營,乘客需要確認該列車是否到達所需目的地。同時除每日少量特定從淞虹路/徐涇東-浦東國際機場的直通班次外,對於需要往返於2號線東延伸及2號線主線的乘客需要在廣蘭路站或唐鎮站換乘(唐鎮站換乘限工作日7:30-9:30及17:30-19:30)。  於虹橋路站-寶山路站段3、4號線共線段乘車需要注意所乘坐的線路(以及大小交路)。三號線列車以黑紅黃為主色,車身色帶上貼有“3”字樣;四號線列車以白紫為主色,車身色帶上貼有“4”字樣,相當容易區分。對於兩線路新增的共享列車,則可通過檢視車外LED顯示屏(三、四號線明確寫明)、車門旁貼紙(車窗上貼有“3號線”“4號線”字樣)、車內線路圖(三號線則在共線段寫明換乘四號線,四號線則反之)、車頭車號(三號線以03開頭,四號線以04開頭)。不論在任何情況下(包括緊急調車等情況),車站的廣播告示均能反應實際情況。

  乘客須站在安全線內候車,嚴禁跳下站臺、進入軌道。在遮蔽門車站不可緊貼遮蔽門。蜂鳴器響,門燈閃爍時嚴禁強行上下車,嚴禁攜帶易燃易爆、危險品及寵物上車(導盲犬除外)。嚴禁隨意觸碰緊急把手。乘客亦須遵守上海軌道交通運營條例坐車(在車廂內有《乘客須知》)。

  服務中心是進行諮詢及業務辦理的服務崗位。辦理交通卡充值,索取單程票發票等及出行問題查詢。服務中心在雨天提供免費雨傘出租。10號線的服務中心將遮蔽門控制器等等以站為單位的控制檯搬遷至服務中心內。

  

  下表以預定通車時間或階段排序。

  注:3號線為高架線路,由於早年部分媒體的宣傳及現存的部分錯誤標識(如上海南站中的“輕軌三號線”),導致上海市民習慣稱其為輕軌。

  注:在2001年上海軌道交通實行四分開之前,軌道交通建設由上海地鐵總公司負責,沒有單獨的負責建設和專案投資的專案公司。上文未標出崑山市軌道交通投資發展有限公司投資建設的11號線北段延伸段(安亭站-花橋站)的資訊。

  上海地鐵目前的車輛主要由長春軌道客車、長客龐巴迪、南京浦鎮車輛、株洲電力機車、上海電氣集團、西門子、安達、龐巴迪、阿爾斯通等中資和外資企業製造。1、2號線的車輛為8節編組,3、4、5、7、9、10、11、12、13、17號線的車輛為6節編組,5號線支線、6號線、浦江線的車輛為4節編組,16號線的車輛為3節編組或3節編組重聯。8號線的車輛為6節或7節編組。  有所不同的是,除5號線支線外所有地鐵列車車廂之間相互連通,乘客可在不同車廂間自由行動;而5號線支線則是每節車廂獨立載客,每節車廂前後均有列車門,但在運營中均不能由乘客開啟。

  

  在兩種軌道交通供電方式(接觸網供電、第三軌供電)中,上海地鐵大多采用接觸網供電(除16號線、17號線、浦江線為第三軌供電)。有接觸網的線路均為DC1500V觸網。接觸網分為柔性接觸網和剛性接觸網。除建設較早的 1、2、3、4 號線外,所有地下段均採用剛性接觸網供電,其餘區段均為柔性接觸網供電。  上海地鐵設立110kV總變壓站,下屬AC33～35kV牽引變壓站,AC10kV車站變壓站(輸出三相四線AC400V),新線車站使用AC35kV降壓變電站(輸出三相四線AC400V)。牽引變壓站下屬AC33kV轉AC1250V變壓站,AC1250V整流站,整流後電壓升至DC1500V到DC1800V,上輸至接觸網。車站使用AC220V供照明,AC400V供大型裝置。上海軌道交通通常使用區間雙向供電模式。

  新建的上海地鐵線路(如6號線、7號線、8號線、9號線、11號線等)採用基於移動閉塞的CBTC訊號系統,能使列車運營間隔縮短至90秒。目前全功能使用基於移動閉塞的CBTC訊號系統,就是在上海地鐵6號線,7號線,8號線,9號線和11號線上使用的泰雷茲的Seltrac系統,上海軌道交通17號線採用卡斯柯(中國通號-阿爾斯通)的iCMTC型CBTC訊號系統,成為中國首條使用本土企業提供CBTC系統的線路。

  

  上海日益完善的地鐵系統催生出一些比較另類的想法,例如有人提出“一次走完全部地鐵站重複最少的走法”、“一次走完全部地鐵站用時最少的走法”等一系列奇異的想法。隨著上海地鐵網路不斷擴張,此類命題也越來越具有挑戰性和趣味性。  2010年12月26日,數學教師王喆瑋用時18小時09分鐘乘完了除4號線南浦大橋站和西藏南路-南浦大橋、南浦大橋-塘橋兩個區間外的所有車站及區間。2011年1月3日,網友YOYOGI耗時18小時26分11秒乘遍包括7號線新開通的北延伸段在內的上海地鐵全網所有區間、所有車站。

  10號線各站的站名大字壁採用王羲之等歷代書法家字型,上海動物園站的站臺以各種動物形象佈置。11號線龍華站因其特別的地理位置裝修結合了佛教文化,採用仿古式設計,站名大字壁由龍華寺方丈題寫,而交通大學站2號口因直通錢學森圖書館,出口牆面採用錢學森的手稿公式組成設計元素。迪士尼站五顏六色的氛圍彷彿帶領乘客進入了童話世界。

  隨著上海地鐵線路不斷增多,在新浪微博等社交網站上,許多網友按照各線的一些特點將它們擬人化並繪製成漫畫,如4號線經常被描述為一個迷糊而經常迷路、依戀“三哥”(3號線的擬人形象)的小男生,原因是該線是一條兜圈的環狀線,並且有很長的一段與3號線共線執行;而10號線則因為該線各站的站名大字壁採用歷代書法家字型等特點而被擬人化為一個喜歡收集書法作品和塗鴉的男孩。上海地鐵官方微博也對這些漫畫和故事表示了支援和欣賞。2012年,兩種票面為“地鐵擬人化”形象的一日票投入使用。

  許多行為藝術或cosplay愛好者曾在上海地鐵搞怪,扮演超人、奧特曼、高達等形象乘坐地鐵,或是利用地鐵站為Cosplay化妝以參加展會等。這些照片在網路上也被廣泛傳播。  此類現象一般出現在以下車站的特定時間:

  

  上海地鐵車廂內廣播現時使用兩種語言,先後依次為普通話和英語,部分路線會加入上海話(如:16號線)。廣播內容包括到站提醒、車門開啟側提醒、換乘提醒等。  播報下一站  “本次列車終點站金海路。下一站,南京西路,開左邊門,使用公交卡的乘客可在出站後30分鐘內換乘2號線、13號線,請注意換乘列車的首末班車時間。請把愛心專座留給有需要的乘客。”  “Next station, West Nanjing Road. Doors will open on the left. Passengers holding Public Transportation Card may transfer to Line 2 and Line 13 within 30 minutes after getting out of the station. ”  此外,部分線路在播報下一站時的中文報站末尾新增如下語句:  到站提醒  普通話到站提醒通常為:  英語到站提醒通常為: 另外,如列車已到達該線路的終點站時,普通話部分則在到站提醒之後補充:“請全體乘客下車”;部分線路在報終點站到之後,則會播放純音樂《Going Home》的前小半部分。

  

  2003年7月1日凌晨4時,4號線浦東南路-南浦大橋區間在進行上下行隧道聯絡通道施工時突然出現滲水,之後大量流沙湧入隧道導致內外壓力失衡進而引起隧道部分塌陷,地面隨之出現漏斗型沉降。上午9時許,附近中山南路一幢樓房裙房坍塌;2日凌晨開始,董家渡外馬路段防汛牆受沉降影響開始沉陷開裂,之後江邊防汛牆倒塌,是為新中國成立以來第一次江堤倒塌嚴重事故;現場附近的臨江花園大樓也出現沉降,最嚴重時1小時沉降超過7毫米,最大累積沉降量達到15.6毫米。這次事件影響4號線全線通車計劃,直到2007年三線兩段開通後才全線貫通。

  2009年12月22日早間,1號線陝西南路-黃陂南路區間隧道上方碳纖維板脫落致該區間供電跳閘,地鐵方被迫採取莘莊-徐家彙及富錦路-上海火車站兩端小交路執行。上午6時54分,上海火車站站一列載客列車與另一列空載列車發生側面碰撞導致1號線全線停運;時逢早高峰當天又為冬至,上海市區大部地面交通癱瘓。晚間再次發生事故,衡山路-上海火車站區間受影響再次停運。20時40分許陝西南路站發生火警,該站及常熟路站受影響關閉進站直至21時30分左右。

  2011年7月27日晚,10號線一列車自龍溪路站發出後,本應發往航中路站(支線),但是卻錯誤發往虹橋火車站站(主線),發現後執行至上海動物園站停車供往航中路站的乘客下車折返。地鐵方面稱事件系“訊號除錯故障”所致。

  2011年9月27日下午2時許,10號線新天地站裝置故障,交通大學-南京東路上下行列車限速執行。14時37分,由於排程失誤豫園站至老西門站下行區間兩列車發生追尾,造成多人受傷,傷者多為骨折、軟組織挫傷、擦傷,無重傷及死亡人員。下午7時左右線路恢復執行。次日10號線中段再次停止運營進行除錯,直到晚8時許才恢復運營。

  2013年3月12日下午16時37分,有網友稱,5號線一列車在閔行開發區站折返中由於擠岔導致第二節車廂脫軌,無人員傷亡,造成5號線晚點48分鐘。晚點期間線路改為金平路-莘莊小交路執行,金平路-閔行開發區區間改由江川一路接駁車接駁。而地鐵方則稱事故系“訊號裝置故障”所致。

  

  1999年,上海電氣與法國阿爾斯通簽署協議,投資2800萬美元成立上海阿爾斯通交通裝置有限公司,在閔行引進一條軌交列車生產線,可達到年組裝300節列車的生產量。當時市政府方面開出條件,上海在未來軌道交通建設的5、6、8號線採購新公司生產的C型車300節,雙方當時即就300節車的採購達成意向,2000年以後分階段簽署供車協議。為此,交通研究所不得不“降低”預測客流量以容納C型小車,同時縮小車站土建規模(6號線只容納4節編組)。在建設5號線、6號線、8號線前,C型車供應均未通過招標完成,而是經上海阿爾斯通與申通集團間的“內部協商和協調”簽署供車協議,違反《中華人民共和國招標投標法》第三條和第四條。  8號線客流預測專案負責人確認,8號線的客流預測報告經過不斷修改到2005年才完成,當時預測在2007至2010年三年間8號線預測客流量在每日50萬人次左右,從未向運營方提供過所謂“初期預測客流量20萬人次”的資料,“初期預測客流量”可能為地鐵運營方自己的預測。8號線開通不久即出現客流擁擠現象,甚至發生乘客間肢體衝突,且6號線預測客流為10.5萬多人次,但開通最初數日最高客流曾達到15萬人次,偏差達50%,引起了爭議。

  上海地鐵所有車站均實施安檢。隨著奧運會、世博會、進博會的召開,安檢的等級逐步提高。2002年7月1日起執行的《上海市軌道交通管理條例》,第二十五條指出軌道交通線路運營單位有權對乘客攜帶的物品進行安全檢查。  2008年4月15日起,部分車站對乘客攜帶的箱包實行開箱檢查,並在客流量較大的上海火車站臨時設定一臺安檢機。5月10日起,所有車站進行開箱安檢。5月27日,上海市公安局釋出《關於嚴禁攜帶易燃易爆危險品乘坐公共交通工具的通告》,指出:市民在乘坐公共交通工具時,應主動配合接受安全檢查。  2009年2月6日,上海市人民政府釋出《關於嚴禁攜帶易燃易爆危險品乘坐公共交通工具的通告》。8月26日,1號線上海火車站新安裝的兩臺X光安檢儀正式投入使用。9月23日,1、2、3、4、8號線的12個重點車站新增30臺X光安檢儀。 2010年1月4日,實施全封閉安檢的車站新增31座,新增了60臺X光檢測儀。3月1日起,《上海市軌道交通運營安全管理辦法》開始實施。3月15日起,全部280座地鐵車站實施進站安檢,其中12座重點車站採取“逢包必檢”,其餘則為“逢疑必檢”,配備X光檢測儀570臺。10月8日,副市長楊雄表示在世博會後安檢將繼續。10月27日,《關於世博後市境道口,軌道交通常態安檢會議紀要》形成,明確2011年1月1日起繼續實施安檢。  2014年1月1日起,修訂後的《上海市軌道交通管理條例》開始執行,增加了“軌道交通企業應當按照有關標準和操作規範,設定安全檢查設施”。2015年10月,部分車站加裝安檢門。2017年4月1日,新型液體智慧識別報警X光安檢儀投入使用。6月28日起,上海地鐵安檢全面升級。 2017年11月,為保障進博會的進行,在徐涇東站啟用首臺太赫茲人體安檢儀。2018年12月22日,太赫茲人體安檢儀在部分車站開始試用。2019年3月20日,太赫茲人體安檢儀在部分車站正式啟用。
上海地鐵,亦稱上海軌道交通,是服務於中國上海市的城市軌道交通系統。截至2018年12月30日,上海地鐵已開通運營16條線路、413座車站,運營里程676公里,是全球範圍內線路總長度第二長的城市軌道交通系統,同時也是世界上客運規模第二大的城市地鐵系統,僅次於北京地鐵,每日客流平均在一千萬人次以上,2018年全路網客運量37.10億人次,歷史最高單日客流1,329.4萬人次。 上海地鐵是上海市民市內交通的主要出行方式。