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  1992年反貪公署初設立之時,該署的首長為政務司級。該公署營運的方針不受當時的澳門總督及立法會指揮,義務上則只須向總督報告。迴歸後,廉政公署承襲以往的傳統,繼續獨立運作,首長只須對行政長官負政治責任。  廉政公署透過廉政公署部門而運作,該部門的首長為廉政專員,其下設有專員辦公室、兩名助理專員、反貪局及行政申訴局等。專員辦公室及助理專員主要輔助廉政專員的日常工作、宣傳教育及公署的財政、公關工作等。澳門廉署除擔當反貪汙工作之外(反貪局),還負責處理對政府部門行政失當的申訴(行政申訴局)。

  

  廉政公署前身為“反貪汙暨反行政違法性高階專員公署”(簡稱為“反貪公署”),於1992年3月15日成立。其實早於1975年,澳門總督李安道當時眼見香港的反貪工作已開始起步,故提議成立一個專責肅貪部門,以對付日益嚴重的貪汙問題。但是由於亦未有完善的相關法規,故一直未能成立。1983年的立法會將成立“肅貪委員會”一事提交議程,並開始於會議上討論成立的可行性。直至1987年,立法會通過制定針對賄賂處分制度及刑責的專門法律,並於1990年通過將成立的反貪公署的權力法規,制定有關該署之行政地位以及職能等。  及後於1991年,澳門總督韋奇立將軍委任葡萄牙的薛克法官為公署的首任反貪專員,意味著公署步入了成立階段。翌年,反貪公署的組織法正式於立法會通過,並開始招請人員及培訓人才,成立過程歷經17年之久。

  1999年12月20日澳門主權移交中華人民共和國之後,按《基本法》規定成立廉政的部門,成立廉政公署,即取代了葡屬澳門的反貪公署的職責。  2009年8月17日,隨著第19/2009號法律《預防及遏止私營部門賄賂》頒佈,澳門的反貪工作終在2010年3月1日正式延伸至私人層面,並於2011年3月將首名涉貪私營機構職員拘捕 。
廉政公署(簡稱廉署,)為澳門特別行政區設立的一個獨立運作的公共機關,其根據澳門特別行政區《基本法》第59條的規定而設立。廉政公署獨立工作,廉政專員只須對行政長官負責(僅限於政治責任)。 廉政公署的職責為預防及打擊貪汙行為,以及處理行政申訴等,現任廉政專員為陳子勁,總部設於澳門新口岸新填海區冼星海大馬路105號金龍中心16-17樓,投訴接待中心則設於同區的皇朝廣場14樓,並於黑沙環、氹仔設有社群辦事處。