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  1832年聯邦方案的草案中就提出瑞士應有一個容納各種聯邦機構的中央首都。 因此1849年的瑞士憲法中對瑞士的首都做了如下規定:第108條稱之為“聯邦機構所在地”,包括聯邦委員會,聯邦大會及聯邦政府,這一規定由聯邦大會作出。  1803年起,瑞士輪轉其政府和議會的所在地,起初是一年一換,後來則是兩年一換。1848年11月年決定廢除輪換制度,這時的引起熱烈討論的問題是哪座城市應當成為聯邦首都,它是否可以同時是某個聯邦州的首府。甚至新建一座如美國的華盛頓一樣的計劃城市作為聯邦首都的方案也曾為考慮。1848年11月28日的選舉中被看好的主要是三座此前的輪換城市:蘇黎世,伯爾尼和盧塞恩。

  1848年11月28日的選舉第一輪中伯爾尼就已經以79票的優勢勝出,而只有48票支援蘇黎世,9票支援盧塞恩。作為補償,蘇黎世成為了蘇黎世聯邦理工學院的所在地而盧塞恩成為了瑞士聯邦保障法庭的所在地。

  目前還沒有任何一部一部聯邦法律確定伯爾尼的聯邦城市的地位,同時瑞士聯邦憲法中也沒有表明聯邦城市的內容的條款。

  1850年,在伯爾尼州的地方選舉中產生了保守性轉變,結果為瑞士聯邦要求的對聯邦機構的保護規定,並於1851年頒佈的所謂保障法。在1874年修訂聯邦憲法第115條時,採用了1848年憲法108條。在1875年聯邦議會和伯爾尼州議會的協議《伯爾尼市作為聯邦城市的功能》中以書面形式確定下來。在安全方面,包含1997年3月通過的兩個內務安全保障措施的協議。

  1997年3月21日頒佈的政府管理組織法()第58條確定伯爾尼是聯邦委員會及其7個部會和聯邦祕書長的辦公地。2002年12月頒佈的議會法第32條確定伯爾尼是瑞士聯邦大會的所在地。

  在區域化的原則下,1990年代以來多個瑞士聯邦政府機構從伯爾尼遷往瑞士其他城市,如聯邦統計局遷往納沙泰爾,聯邦通訊局遷往比爾,聯邦住房局遷往格倫興。  同樣司法機構也在去中央化,聯邦最高行政法院2012年起遷往聖加侖,在此之前自2007年成立起由伯爾尼臨時代理。聯邦刑事法院2007年起由位於德欣州的貝林佐納承擔,聯邦保險法院自1917年位於盧塞恩,聯邦最高法院——聯邦法院(瑞士)則位於洛桑。

  2002年伯爾尼州議會和伯爾尼市議會向聯邦提出將目前的聯邦和城市的合作關係制度化的要求。由此成立了確認聯邦城市相關規定的「聯邦城市地位」三方工作小組。工作小組最後確認新的聯邦城市規定的必要性,並應根據新的聯邦城市法來執行。但是在2004年10月草擬聯邦城市法的過程中,聯邦議會否決了聯邦與伯爾尼市的關係新規定的必要性,現行的規定完全適用。於是聯邦城市法的擬定沒有得以繼續進行。
瑞士在建立聯邦制時,產生了一個問題,即瑞士是否應該有首都,如果有,應當是哪座城市。這一問題在1848年11月28日瑞士聯邦議會得出了一個妥協方案,將伯爾尼作為瑞士聯邦的所在地,但是不被稱為首都(),而是稱為聯邦城市(),因此伯爾尼只是瑞士實際上的(De facto),而非法律上的(De jure)首都。