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  這是一篇與原作RPG主角一樣從真新鎮出發的少年小智,和他的神奇寶貝與皮卡丘,刻畫友情與成長的故事。沿襲原作故事節奏展開第一集的冒險故事。  設定中自然有登場人物與反派角色等,就因為初期這種獨特的表達方式,將遊戲中的世界觀毫不保留的完整呈現在動畫中。這可以說是擔任系列構成的首藤剛志先生最擅長的方式。首藤也構想出火箭隊登場時「既然你誠心誠意的發問了──」的臺詞。  創造了跟隨小智一起旅行的道館訓練家好友小剛與小霞,也創造出了「老梗新用」的反派角色,敵對組織火箭隊的隊員武藏與小次郎,更賦予他們有一隻能夠說人話的罕見神奇寶貝喵喵。  假如小智沒有選擇皮卡丘作為最初的神奇寶貝,反而選擇最初3只的其中之一的話,或許會讓人大失所望。不僅遊戲受歡迎,再加上最初的神奇寶貝使用光的三原色,但是如果沒有皮卡丘可以選擇也一定會遜色許多。  主角小智與大木博士的孫子、小智的對手──小茂的命名,是源自原作RPG《神奇寶貝 紅·綠》提供的名字之一,是以該遊戲開發者田尻智及任天堂董事宮本茂的名字作為基礎。  小智得到皮卡丘後以神奇寶貝大師為目標,踏上訓練員之路。  在旅程的開端,有個小智與皮卡丘的動人故事: 由於小智的皮卡丘不肯服從小智,小智惟有靠自己捉神奇寶貝,連續捉2只失敗,就在小智以擲石作攻擊命中目標時,驚覺那不是波波,而是烈雀。小智及皮卡丘遭受襲擊,慌忙逃走。其間一個女子在釣魚期間拯救了他們,小智按她的指示,向常槃市衝去,但被烈雀群追上,此時皮卡丘已受重傷,為了救牠,小智不惜犧牲自己,抵擋烈雀群。皮卡丘眼見小智捨身相救,終於明白小智對牠的愛護及好意,就在烈雀群即將擊中小智的千鈞一髮之際,牠衝到小智面前,並使出強烈的「電擊」絕招! 終於成功把烈雀群趕走了,小智和皮卡丘亦終於成為好友。此時小智及皮卡丘遇見了一隻神祕的神奇寶貝(大木博士也不敢相信小智遇上牠),是後來小智估計的鳳王(由於當時金銀版還未推出,其名字最初是透過漫畫版的資料公佈的)。  之後小智和拯救他及皮卡丘的女子──小霞結伴同行,其後認識小剛,尼比市道館賽後小剛加入成為新的同伴。  小智在石英聯盟由初賽出線至淘汰賽,於16強止步。  回到真新鎮後,小智為了替大木博士拿GS球而前往橘子群島,在一時興起下決定挑戰橘子聯盟,到最後奪得勝利者杯。  在從橘子群島回來後,與一直以來視為勁敵的小茂首度交鋒,雙方派出自己最自豪的神奇寶貝,皮卡丘對抗伊布,一番苦戰後小智戰敗,對小茂誓言下次絕不會再輸,也決定要挑戰城都聯盟,往城都地方出發。  而在城都聯盟白銀大會決勝錦標賽的第一回戰(16強)中再度與小茂對碰,6對6的全面對戰,雙方都以最強的陣容來應戰,最後一戰,小智的噴火龍戰勝小茂最強的水箭龜,小智晉級。但是到了第二回戰(8強)與來自豐緣地區的葉越交手時,葉越充滿特性的神奇寶貝使小智陷入危機,小智和葉越激戰後派出最後僅餘仍能作戰的神奇寶貝-噴火龍和火焰雞作最終對決,最後噴火龍失去戰鬥能力,小智戰敗,8強止步。  白銀大會結束後小智與必須回家的小霞和小剛告別,重回真新鎮的小智想著自己從未到過的豐緣地區,決定為了重新出發,於是只帶著皮卡丘前往豐緣地區挑戰豐緣聯盟。

  

  注:以下集數排序並不包括髮生3D龍事件的第38集

  以下時間以當地時間(日本時間)為準
,是1997年4月1日至2002年11月14日期間在東京電視臺系播出的任天堂軟體「神奇寶貝系列」原作電視動畫。因為沒有副標題,為了方便稱呼並與後續作品如「超世代」區分,而有「無印」這個代稱(「沒有副標題」的意思),又有平成版以對應「新無印」的「令和版」,臺灣是由中視訊道於1998年11月28日至2003年12月6日於每星期六下午18:30~19:00播出。