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  早在1803年,就有人提議在西伯利亞建立大學。然而,這一設想直到75年後才得以實現。1878年5月28日,沙皇亞歷山大二世批准在託木斯克興建西伯利亞帝國大學。西伯利亞帝國大學是當時俄羅斯帝國的第九所國立大學、西伯利亞的第一所大學。當時西伯利亞的多座城市都在爭取將大學設在市內,最終託木斯克勝出。1888年9月1日,託木斯克帝國大學開學。當時學校只有醫學系一個系,學生72名,教授8名,助理、實驗室技術人員7名。建校初期,託大就建成了圖書館大樓、會議廳、博物館、植物園和標本室。1898年,學校開設了第二個系,即法律系。1917年,託木斯克帝國大學增設數學物理系和歷史文學系兩個系。  1928年,託大成立西伯利亞物理技術研究所,這是西伯利亞首個物理學研究中心。1967年,因科研和教學成績優秀,託大被授予勞動紅旗勳章。1968年,託大開辦應用數學和力學研究所、生物學和生物物理學研究所。1980年,學校獲得十月革命勳章。

  託木斯克國立大學設6個學院、14個系,有學生近1.6萬人。學校的教師中,有約500位博士、約1000位副博士,俄羅斯科學院、、、院士(會士)13位,俄羅斯科學院、、俄羅斯醫學科學院通訊會士16位。託木斯克國立大學的物理、數學、化學、力學、控制學、地質科學、生物學等學科教學實力突出。  託木斯克國立大學校友包括一百餘位俄羅斯科學院院士、超過250位俄羅斯國家獎得主。伊萬·彼得羅維奇·巴甫洛夫、尼古拉·尼古拉耶維奇·謝苗諾夫兩位諾貝爾獎得主都曾是託大教師。  2019年QS世界大學排名將託木斯克國立大學排在金磚國家榜第19位,新興歐洲與中亞地區第13位,全球第277位。

  託木斯克國立大學沒有校牆,校園與城市連為一體。主樓是託大的標誌性建築,建成於1880年。主樓二層設有教授走廊,懸掛已故託大知名教授的畫像。主樓的禮堂原為教堂,學校常在此舉辦重要活動,畢業典禮也在此舉行。託大科學圖書館藏書約400萬冊,在西伯利亞各大學圖書館中排名第一。學校的植物園始建於1880年,是西伯利亞的第一個植物園。植物園佔地面積128公頃,園中植物有六千餘種,設有面積6,500平方米的溫室。學校設有九座博物館,包括瓦西里-福羅林斯克西伯利亞考古學民族學博物館、動物博物館、波爾菲裡-克雷洛夫植物標本館、霍赫洛夫古生物學博物館、巴熱諾夫礦物學博物館、物理發展史博物館、珍貴書籍文獻館等。校內的大學樹林既是休閒場所,也是舉辦活動、開設講座、研究植物學的地方。文化中心可承辦音樂會、舞蹈、戲劇演出,音樂廳設有800個座位,是託木斯克最大的音樂廳之一。學校中還有健身房、露天運動場、游泳池等體育設施。
託木斯克國立大學(,),簡稱託大、託國立,是一所位於俄羅斯聯邦託木斯克州託木斯克的研究性大學。