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  涉事飛機的型號為空中客車A320-232,機身編號為SU-GCC,使用IAE V2527-A5引擎,於2003年7月25日進行試飛並於同年11月3日交由埃及航空營運。截止至事故發生前,該客機機齡12年,飛行時數為6275小時。失事當天之前該飛機已執行五次航班飛行任務,分別飛到三個曾經受到恐怖攻擊或曾受到恐怖攻擊威脅的城市,第一趟是從厄利垂亞阿斯馬拉國際機場,飛往開羅;第二趟是從開羅飛往突尼西亞-迦太基國際機場,然後執行回程航班任務;第四次則是由開羅飛往巴黎。

  804號班機機組人員尚不明確,已知的訊息包括:機長有6275小時飛行經驗,其中A320為2101小時。副駕駛也有2766小時的飛行經驗。其他機組成員包括三名安全員與五名其他機組成員。乘客一共有56名,其中包括一名小孩與兩名嬰兒。

  機上有10名機組人員,其中3名是機上安全員,5名是乘務員,另有兩名飛行員。據埃及航空的官方資料,執飛當次航班的機長有6,275個小時的飛行經驗,其中駕駛A320機型的有2,101個小時,而副機師也有4,000小時的經驗。

  機上共有來自12個國家的56名乘客,其中有1名兒童和2名嬰兒。  埃及航空官方Twitter顯示,該航班上共有56名旅客、7名機組人員和3名安全人員。其國籍如下表所示:

  這班空客A320-232R客機(註冊編號:SU-GCC)原定於2016年5月18日20時45分在巴黎夏爾·戴高樂機場起飛,並於第二日03時05分到達開羅國際機場。實際在當晚09時11分離港,並於次日02時45分從雷達上消失,飛機最後一次與控制塔聯絡僅在十分鐘之前。但飛機並未按照規定在進入埃及領空時向控制塔彙報。該飛機回傳的最後一次ADS-B資料如下: 高度:11277.6米,速度:976.004公里/小時,航跡角:119度,經緯度:28.297447967517,33.959762573242,當地時間:2016/05/19 上午08:27:06,更新時間:2016/05/19 上午08:28:42。  該機預定在3:05著陸。埃及軍方最初說,他們在4:26,即飛機從雷達上消失2小時後,收到了求救訊號。但隨後他們的官員又否認了這個說法。  希臘國防部部長曾宣稱,根據希臘軍方的雷達資料,804號班機在進入埃及飛行情報區後不久就轉彎了。在高度37000英尺處,飛機先後向左轉90度並右轉360度。在此期間,飛機高度從37000英尺迅速下降至15000英尺。當飛機高度降至10000英尺後,飛機就從雷達上消失了。5月23日,一名來自埃及國家空中導航服務公司(National Air Navigation Services Company)的埃及民航局官員又否認了這一說法。他同時宣稱,該機在墜毀前並沒有改變高度,也沒有做出反常動作。不過,埃及方面的雷達資料準確度可能不及希臘。  飛機製造商空中客車公司,在其Facebook頁面上發表宣告:“空中客車公司遺憾地證實,由埃及航空公司運營的A320飛機於02:30左右(埃及當地時間)在地中海失去聯絡。”

  

  埃及和希臘方面都參與了搜救行動。埃及民航部表示,埃及海軍和希臘空軍正在地中海上空的希臘空域搜尋埃及航空的失聯客機。另一方面,埃及空軍亦配合搜救隊從雷達螢幕上搜尋失聯客機。 希臘派出了一架C-130運輸機,一架EMB-145-H預警機以及一艘埃利級護衛艦參與搜尋。 英國和法國也都派出艦船和飛機參與搜尋。 美國海軍則派出一架P-3獵戶座海上巡邏機。 5月19日,埃及官方釋出訊息稱,距離飛機消失位置以南80公里處,喀帕蘇斯島附近,發現疑似失事飛機的殘骸。但埃及調查組隨後確認表明,該碎片並非來自804航班。埃及航空隨後收回飛機殘骸被找到的宣告。  5月20日,埃及空軍和海軍在距離亞歷山大港290公里的海面發現殘骸,乘客遺體以及行李等私人物品。  歐洲航天局聲稱其在航班最後發出訊號位置的東南方約40公里處(33°32′N 29°13′E)探測到一條2公里長的浮油帶。該浮油於5月19日被該局的型衛星探測到。  5月22日,派出一艘遙控潛水器參加搜尋行動。埃及總統稱這艘遙控潛水器可於水下3000米深的地方展開工作。根據埃及民航部首席調查員Ayman al-Moqadem的說法,這艘遙控潛水器不能探測黑匣子發出訊號。  5月26日,據CNN報導,衛星探測到了發自機上(Emergency Locator Transmitter,下稱ELT)的訊號,這個發現使調查人員將飛機主要殘骸可能分佈範圍縮小為海床上一個直徑5公里的圓形區域,也為黑盒子的搜尋工作提供了更具體的地點。ELT可以在飛機墜海(或觸地)後啟動併傳送緊急訊號。 美國國家海洋和大氣管理局稱衛星在飛機失事後幾分鐘內接受到了這個訊號。 埃方19日報道中提到的那個在失事2小時後接收到的緊急訊號,指的可能就是ELT發出的訊號,不過,這條訊息已經被埃及航空否認了。

  5月20日,法國海軍派出載有聲納裝置的巡邏艇出海尋找MS804航班的黑盒子,該艦於5月23日抵達可能的墜機地點。這艘法國艦艇可釋放一艘可於1000米深的水下探測黑盒子訊號的小型潛艇。  5月26日,埃及政府請求部分擅長開展深水搜尋作業的法國和義大利公司協助搜尋失事客機的黑盒子。  5月27日,據BEA稱,法國海軍又派出一艘海洋探測船拉普拉斯號(Laplace)前往失事海域搜尋。 拉普拉斯號有望於5月30日抵達。  埃及政府已經委託的約翰·萊斯布里奇號(John Lethbridge)參與搜尋。該船裝備的一艘遙控潛水器可以在6000米深的水下探測訊號並勘察海床。 該船於5月28日離開愛爾蘭海域,預計12天后到達,法國及埃及調查員將於亞歷山大港登船。  6月1日,埃及民航部稱拉普拉斯號已經探測到黑匣子座標定位器發出的訊號。BEA也確認了這一訊息,他們的發言人還說,他們已根據推測將一片海域定為優先搜尋區域。  6月16日,埃及政府宣佈約翰·萊斯布里奇號已經於水下13000英尺深處發現了座艙語音記錄儀(CVR)。CVR部分損壞,不過儲存部件依然完好。他們已將CVR送至亞歷山大港。次日,約翰·萊斯布里奇號取回了飛行資料記錄器的一些部件。 埃及民航部於6月19日宣佈,在埃及軍方的協助下,他們已經完成了對尚完好的儲存部件的乾燥並開始進行電子測試。 6月21日,有官員透漏稱CVR和FDR的儲存部件都損壞了。 在下載資料的嘗試失敗後,埃及調查員於23日稱他們將把黑匣子送至BEA。6月27日,BEA將修好的飛行資料記錄儀(FDR)送回開羅進行分析。 隨後,修復完畢的駕駛艙語音記錄也被送至開羅。

  希臘軍方雷達顯示,MS804航班在進入埃及飛行情報區時很快偏離航道,在高度37000英尺處,飛機先是向左轉90度,緊接著又右轉360度。在此期間,飛機高度從37000英尺迅速下降至15000英尺。當飛機高度降至10000英尺後,飛機就從雷達上消失了。5月23日,一名來自埃及國家空中導航服務公司(National Air Navigation Services Company)的埃及民航局官員又否認了這一說法。他同時宣稱,該機在墜毀前並沒有改變高度,也沒有做出反常動作。  與此同時,希臘國防部對一名聲稱在喀帕蘇斯島以南240處看到“有一團火焰從空中墜落”的船長開展調查工作。埃及民航部長稱,相較於機件故障,恐怖襲擊導致飛機失事的可能性更大。  事故發生後不久,法國政府就開始對巴黎夏爾·戴高樂機場的安保是否存在過失展開調查。  5月20日,飛機的ACARS資料公佈,在飛機失聯四分鐘前發出了7條警報。這7條警報均發出於2:26至2:29之間,飛機於4分鐘後的2:33失聯。兩名分別接受過每日電訊報和澳洲人報採訪的飛行員說根據資料來看該起事故可能是炸彈造成的。引述航空專家大衛·利爾指,飛機的航電系統內可能曾經起火, 而飛行員可能因忙於處理其它情況沒有向空管求救。  法國調查分析局指出,在飛機的廁所和電動裝置檢測到了煙霧,機艙響起了煙霧警報,而駕駛艙右邊其中一隻窗曾經被人開啟。該警報也可能是被機艙劇烈失壓產生的水霧觸發的。  5月24日,埃方調查組的一名法醫稱,受害者遺體顯示機上曾發生爆炸。不過他的上級隨後又否認了他的說法。  6月29日,埃及官員宣佈,目前恢復的FDR資料顯示,機上曾經起火。這些資料與飛機自動化系統傳送的資料吻合。官員說,飛機殘骸上有煙燻和暴露在高溫下的痕跡。 資料也顯示,飛行資料記錄器和一個向地面傳送故障資訊的警報系統同時停止工作,FDR於37000英尺停止記錄。  2016年12月,埃及民航部表示在一些遇難者遺體上發現爆炸物殘餘痕跡。  2017年1月,法國《巴黎人》(Le Parisien)報紙援引調查者訊息稱,事件可能是由於飛行員駕駛艙內的iPhone手機起火引致。蘋果公司後對此發表宣告,認為此說法沒有任何證據。
埃及航空804號班機(MS804/MSR804)是埃及航空的定期國際航線班機,是法國巴黎至埃及開羅的航班代號。2016年5月18日執飛的航班在歐洲東部時間2016年5月19日2時45分從雷達上消失。當時,該航班已進入埃及空域約130公里處,飛行高度為37,000英尺(約11,000米)。隨後埃及民航局官員稱目前已經有理由相信在地中海失去聯絡的飛機已經在希臘喀帕蘇斯島附近墜毀。