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  中華民國建國後,國民政府將中央政府各機關設於南京,並在國家基本法《中華民國訓政時期約法》第五條明定南京為中華民國首都。行憲後,憲法雖無首都條文(由於首都的相關條文在制憲時有極大的爭議,《中華民國憲法》中並無首都的條文,以『中央政府所在地』來表示。),但中央政府仍設立於南京;而在第二次國共內戰期間由於軍事上不斷的失利導致中央政府屢次被迫遷移,經廣州、重慶和成都,最後遷播至中華民國臺灣省臺北市,並於1949年12月10日開始辦公,一直持續到今日。由於《中華民國憲法》中並無首都的條文,僅在行政命令內提到「中央政府所在地之首都」,及遷臺後的地理教科書中仍長期採用政府遷臺前的歷史地理,教育人民「中華民國首都在南京」。  但中華民國中央政府遷臺後,已在不少法律、命令、公報、報告、外交檔案內有「首都」之表述(參見中華民國首都#官方對於臺北之首都地位的宣示),而其指涉與臺北市之聯結或等同也越來越明確。相關紀錄顯示在1975年官方文書,政府便已於正式重要檔案中將臺北市視為、稱為首都。2000年政黨輪替後,民主進步黨執政的中央政府更加正視臺北市作為首都的事實,而甚少使用「中央政府所在地」等詞彙,中國國民黨再次執政後亦然。國民黨或民進黨黨籍的臺北市市長亦均以首都市長自居。2002年,中華民國教育部決議將教科書中的相關文字改為「中華民國中央政府位於臺北」或「中華民國部會在臺北」,2013年,中華民國教育部發函通知各級中小學,文中寫明:「依據中華民國憲法,目前我國首都應為南京;惟中央政府所在地為臺北。」。在引起爭議後,教育部部長蔣偉寧表示:「中華民國首都就是臺北」,發函是同仁引用舊公文造成的疏漏。
中央政府所在地,又稱中央部會所在地,是指一個國家的中央政府(包括管理全國事務的國家機構)所位於的地方。中央政府所在的首要城市往往具有首都的地位,世界上多數國家亦會將該城市定為首都,例如中華人民共和國憲法即規定該國中央人民政府所在地是首都北京。然而一國的中央政府所在地與首都亦可能處於不同的城市,例如荷蘭的中央政府所在地為海牙,但該國的法定首都卻為阿姆斯特丹。或馬來西亞的中央政府所在地為布城,但該國的法定首都卻為吉隆坡。