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  耶穌所愛的門徒,在《約翰福音》中提到六次:  在《約翰福音》中,提到一位曾經是施洗約翰的門徒,跟安德烈一同成為耶穌最早的門徒。耶穌遭逮捕之後,彼得曾與一位門徒進大祭司的家中,探察耶穌的訊息。這兩個段落,提到的另一位無名門徒,可能也是指這位耶穌所愛的門徒。

  

  從二世紀開始,基督教會相信,耶穌所愛的門徒,即是指十二使徒中,年紀最小的使徒,約翰,也就是福音書作者約翰。

  根據《約翰福音》,這個門徒可能是指拉撒路。

  根據偽經《馬利亞福音》與《腓力福音》,在其門徒中,耶穌給與抹大拉的馬利亞特別的地位。  這個說法的支持者指出,《約翰福音》的兩個章節,是在公元2世紀才出現的,目的可能是為了把抹大拉的馬利亞,與耶穌所愛的門徒分開。

  學者詹姆斯·泰伯(James D. Tabor)認為,耶穌所愛的門徒,可能是指馬利亞的兒子,耶穌的最大的弟弟,公義者雅各。
耶穌所愛的門徒(, "o mathētēs on ēgapa o Iēsous",英語:disciple whom Jesus loved),或是門徒、愛徒(, "on ephilei o Iēsous",英語:Beloved Disciple),出現於《約翰福音》之中,但是在約翰福音中,並沒有明確寫出這位門徒的身份。這是約翰福音獨有的內容,在《新約》其他的部分,不曾記載耶穌曾經使用過這樣的話。