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  2016年5月31日,葡萄牙田徑聯合會公佈了該國第一批入選奧運陣容的田徑運動員,所有第一批入選名單的選手都是馬拉松和競走選手。2016年7月12日,葡萄牙公佈了剩下的名單。8天后,Yazaldes Nascimento因為受傷放棄奧運資格。

  根據羽毛球世界聯合會於2016年5月5日公佈的奧運排名,葡萄牙有兩名羽毛球運動員(1男1女)獲得奧運資格。

  

  葡萄牙在皮划艇激流專案上獲得一個未分配席位。

  葡萄牙在2015年世界皮劃艇靜水錦標賽上共獲得5個小項的奧運席位,之後該國又在歐洲預選賽上獲得一個女子單人皮艇200米的資格。

  

  根據2015年UCI世界巡迴賽的成績,葡萄牙在公路自行車專案上獲得以下席位。2016年7月4日,葡萄牙自行車隊公佈了出戰奧運公路自行車賽的四人名單。

  根據2016年5月25日的山地自行車奧運排名,葡萄牙在山地自行車專案上獲得兩個男子席位。2016年6月9日,葡萄牙自行車隊宣佈Tiago Ferreira和David Rosa將代表該國參加奧運山地自行車比賽。

  葡萄牙有一名馬術運動員憑藉歐洲排名獲得奧運參賽資格。

  

  葡萄牙男子足球隊在2015年歐洲U-21足球錦標賽上獲得亞軍,取得奧運參賽資格。  2016年7月14日,葡萄牙公佈了男子奧運足球隊參賽名單。7月17日,Nuno Santos被Pité替代。21日,Fábio Sturgeon因傷退出陣容,空出的位置由Fernando Ferreira Fonseca頂替。  <nowiki>*</nowiki> 超齡球員。

  根據2016年7月11日的高爾夫奧運排名,葡萄牙隊有兩名男選手獲得奧運資格。

  

  葡萄牙原本有兩名競技體操運動員在奧運體操測試賽上獲得奧運資格。然而7月22日,其中一人因為腳部受傷無緣奧運。

  葡萄牙有一男一女共兩名蹦床運動員在奧運體操測試賽上獲得資格。

  葡萄牙共有六名柔道運動員獲得奧運資格。其中5人憑藉世界排名獲得參賽資格,另一人則是憑藉歐洲排名獲得資格。

  葡萄牙在2014年世界帆船錦標賽、2015年各單項帆船錦標賽以及歐洲預選賽上獲得4個席位。2015年12月17日,該國有三人成為第一批入選奧運陣容的帆船選手。索菲亞公主杯結束後,該國又有兩人入選奧運帆船陣容。

  射擊方面,葡萄牙隊僅有一人獲得奧運資格。

  葡萄牙在游泳專案上獲得以下資格(每個代表團在每個個人專案最多派2名達到A標或者1名達到B標的運動員參賽):

  葡萄牙共有5名乒乓球運動員獲得奧運資格。其中三人在奧運乒乓球歐洲區預選賽上獲得資格。之後,該國有一名女選手憑藉奧運排名直接獲得參賽資格。與此同時葡萄牙還獲得了男子團體的奧運資格。

  葡萄牙有一名跆拳道運動員在奧運排名中名列前6名,直接獲得奧運資格。

  葡萄牙有兩名網球運動員同時獲得單打和雙打的資格。

  葡萄牙有三名男子鐵人三項運動員直接獲得奧運資格。
2016年夏季奧林匹克運動會葡萄牙代表團派出91名運動員參加2016年8月5日至8月21日在巴西里約熱內盧舉行的第三十一屆奧林匹克運動會。