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  該軍區的前身,羅馬帝國的馬其頓行省在六世紀初始就遭到了斯拉夫部落的劫掠,以致於到7世紀為止使得當地的人口及主流文化都發生了劇變。南下的斯拉夫人聚集起來形成“Sclaveni”(即進入巴爾幹地區的古斯拉夫人部落,之後與當地的伊利里亞人土著結合成為南斯拉夫人),在七世紀時或單獨或在保加爾人和阿瓦爾人的援助下持續襲擊拜占庭帝國的領土。在七世紀晚期拜占庭組織過大規模的遠征,降伏了大批的斯拉夫人部落並在塞薩洛尼基的腹地設立了色雷斯軍區,而短暫的勝利遠不能使當地的局勢穩定下來。於是帝國將防線向南後撤至愛琴海沿岸,直到8世紀晚期。  在伊琳娜女皇對外擴張,收復了色雷斯絕大多數的領土後,或許認定派遣兩位將軍,比單獨一人可以更有效的掌管擴張後的色雷斯地區,於789年或801/802年前後從色雷斯軍區剝離了一部分領土,設立了新的馬其頓軍區(之後有紋章顯示,在這之前馬其頓軍區便已存在,不過實質是色雷斯軍區將軍下屬的Tourma,即分軍區)。最早姓名留於後世的馬其頓軍區將軍大概是813年在任的約安尼斯·阿普拉基斯(不過在懺悔者提奧法諾斯的筆下,卻是大宦官阿埃提奧斯的兄弟列奧,列奧被任命為monostrategos,即領有多個軍區的將軍,同時掌管色雷斯和馬其頓軍區)。  即使在10世紀60年代這個軍區被證為真實存在,但在尼古拉斯·依科諾米狄斯所著的《拜占庭百官志》內卻顯示975年該軍區被撤編,當時的皇帝約安尼斯一世在那派遣了亞德里安堡駐防長官,在十世紀晚期約安尼斯一世和瓦西里二世擊潰保加利亞帝國,在1006/7年馬其頓軍區再次被設立,卻不再繼續擴大面積,皇帝們在外疆又設立了菲利普波利斯(今保加利亞普羅夫迪夫)和貝羅埃(今保加利亞舊扎戈拉)兩個軍區,而11世紀初又在南部的奈斯托斯河西岸地區也設立了波列綸軍區。  12世紀時軍區的大致範圍已無從得知,但在1198年對威尼斯人所下的金璽詔書顯示,色雷斯和馬其頓已成為色雷斯地區的統稱,僅下轄數個主要城市,過去馬其頓軍區的主要區域已被命名為“亞德里安堡和迪狄莫提霍省”。

  軍區的首府通常是亞德里安堡(今埃迪爾內),但軍區地跨現今的三國(希臘的西色雷斯地區,土耳其的歐洲地區,以及保加利亞的北色雷斯地區)。在阿拉伯地理學家胡爾達茲比赫和阿爾法齊赫筆下,提及馬其頓地區從“長城”,即君士坦丁堡的安納斯塔修斯城牆處開始延伸,一路插入西部的斯拉夫人領地。南面愛琴海和馬爾馬拉海,北抵保加利亞的邊疆,西鄰塞撒洛尼卡和之後設立的斯特里蒙與波列綸軍區。10-12世紀馬其頓地區一直都指西色雷斯地區,因此,馬其頓人瓦西里一世的“馬其頓”的來源,多半來源於馬其頓的軍區。  由於是從色雷斯軍區裡剝離出來,馬其頓軍區歸屬於東部軍區,在地位上要高於西部軍區。在9到10世紀,馬其頓軍區將軍的在所有將軍裡位列第二級,甚至比色雷斯將軍要高。如被任命為當地的將軍,年俸可達2592諾米司馬(即36磅重的黃金)。根據法齊赫文中的說法,馬其頓軍區的將軍在9世紀處掌管多達5000名軍人。  和其他軍區一樣,馬其頓軍區的部分會和色雷斯軍區一起管理,尤其在11世紀,色雷斯與馬其頓通常合併管理,許多將軍及法官都同時管轄這兩個軍區。
馬其頓軍區()為拜占庭帝國8或9世紀在巴爾幹半島東南部的一個軍區,馬其頓軍區有時也會和色雷斯軍區一起管理,首府在阿德里安堡。