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  車站為2面4線島式月臺地下車站,外側線路由目黑線使用,內側線路由大井町線使用。日吉方向與溝之口方向、大井町方向與目黑方向可在同月臺轉乘。另外,奧澤、綠丘方向有轉乘用地面連絡通道。目黑線月臺設有防止乘客跌落軌道的月臺門。  大井町線的北千束方向設有一條拖上線,東橫線、目黑線、東急多摩川線、池上線車輛可利用此線轉向進入,或是東京地下鐵日比谷線03系線轉向進入。另外也可作為臨時列車等的留置線。2007年11月16日自由丘車庫廢止後至2008年3月28日大井町線改點為止,平日早晨、傍晚有大井町線車輛留置本站。  車站地下化以前,本站是3面4線地面車站,大井町線為側式月臺(上、下行皆使用南側月臺)、目蒲線為島式月臺。

  1997年本站地下化時,距離車站五分鐘的就有移至本站上方的計劃,因此在地下化工程時,軌道下方增設彈簧以降低列車的振動。  2006年醫院正是興建,2007年11月3日開業。出正面剪票口後左側便是醫院入口。另外,本站也是第一座上方是醫院的車站。

  2016年度1日平均上下車人次如下。  目黑線的使用人數比急行通過站西小山站還少。由於本站使用者主要以目黑線與大井町線轉乘為主,因此不會進出車站

  近年1日平均上下車人次推移如下表。 近年1日平均上車人次如下表。

  站名取自地名「大岡山」。  地名「大岡山」則是取自明治時代的荏原郡碑衾村大字衾字平南大岡山、平北大岡山。  「大岡山」的由來眾說紛紜,一是取自此地大地主岡田家擁有的山的姓氏說,另一是周邊多小丘、小山的「大岡」、「山」組合的地理說。
大岡山站()是一個位於東京都大田區北千束三丁目,屬於東急電鐵的鐵路車站。此站有目黑線與大井町線停靠,是兩條路線的轉乘站。目黑線的車站編號是MG06、大井町線是OM08。