Aveva finalmente risolto l'enigma della più grossa epidemia popolare di allora. Gli venne conferito il titolo di consigliere di fiducia imperiale (Kaiserlicher Geheimer Regierungsrat) da parte di Guglielmo I e firmato da Bismarck. Koch però non si accontentò della sola scoperta degli agenti patogeni e si interessò soprattutto alla lotta di circoscrivere e di eliminare con mezzi adeguati queste malattie. Si trasferì nel corso della sua vita nelle regioni ad alto rischio della terra, come India, Nuova Guinea e Africa e cercò di combattere malattie infettive come il colera, la peste, la malattia del sonno e la malaria.