La funzione primitiva dei telomeri, filogeneticamente sviluppatasi a partire dagli lieviti, riguarda la protezione delle estremità cromosomiche [94][95][96][97][98] . Attraverso la loro particolare conformazione e il legame con le varie proteine del cap telomerico, i telomeri proteggono infatti le estremità cromosomiche da possibili rotture e da fenomeni di fusione e ricombinazione reciproca. E' stato osservato che la distruzione della struttura telomerica o l'inibizione del suo meccanismo omeostatico di mantenimento conducono al rapido accumularsi di associazioni cromosomali "illegittime", quali traslocazioni e riarrangiamenti [94][95][96][98][99][100] .