Il collicolo è un importante punto di riferimento anatomico per la patologia del difetto congenito delle valvole uretrali posteriori, caratterizzato da un'interruzione dello sviluppo dell'uretra nei neonati maschi. Sono stati riportati casi di tumori carcinoidi uretrali nel collicolo. La struttura tende a migrare caudalmente, o verso il basso, in un disturbo noto come ipospadia e diviene quindi visibile dal bulbo, o nella porzione uretrale del pene. L'utricolo prostatico, un residuo del condotto paramesonefrico, nasce dall'uretra a livello del collicolo e prosegue posteriormente. Tale struttura a fondo cieco può essere associata all'ipospadia.