L'analisi di polimorfismi (variante genica presente nella popolazione con una frequenza >1%) presenti in geni coinvolti nella spermatogenesi rappresenta uno degli ambiti di ricerca più interessanti nello studio genetico dell'infertilità maschile.I polimorfismi o le varianti geniche presenti in questi geni sono considerati potenziali fattori di rischio che potrebbero influenzare la gravità delle alterazioni spermatogeniche.Le varianti polimorfiche descritte in associazione con la sterilità maschile sono numerose [42,[135][136]. Comunque, questi studi di associazione spesso non portano a risultati univoci. Ciò è dovuto principalmente a diversi aspetti: la dimensione e la composizione della popolazione allo studio, il tipo di polimorfismo analizzato e le tecniche utilizzate per analizzarlo, la condivisione multifattoriale e l'eterogeneità del fenotipo dell'infertilità maschile, la variabilità interindividuale che si riscontra nell'effetto fenotipico di cause che agiscono a livello testicolare, le differenze etniche e geografiche che contribuiscono ad incrementare la variabilità genetica [137].Gli effetti fenotipici dei polimorfismi genici sono modulati da altri fattori genetici oppure da un background genetico e da fattori ambientali, fornendo così un importante esempio di interazione geniambiente nello sviluppo di un fenotipo [138]. Inoltre, bisogna sempre ricordare che i polimorfismi genici possono causare alterazioni della spermatogenesi o disfunzioni testicolari solo in associazione con uno specifico background genetico e/o con fattori ambientali [42].Sono stati analizzati polimorfismi in geni diversi per mettere in evidenza una possibile associazione con l'infertilità maschile, ma molti di questi studi non sono stati confermati e quindi non sono disponibili dati definitivi. Solo per alcuni polimorfismi sono stati ritenuti dei risultati soddisfacenti, sebbene non conclusivi; tra questi spiccano i polimorfismi nel gene codificante il recettore degli androgeni [42].Il recettore degli androgeni presenta due siti polimorfici Quest'osservazione ha permesso di ipotizzare che tratti più lunghi di poliglutammine potrebbero essere considerati un fattore di rischio per la sterilità maschile [140]. Questo risultato è in accordo con la scoperta che i polimorfismi riscontrati nelle triplette CAG sono correlati con la concentrazione di spermatozoi nei soggetti normali [141].Studi recenti che hanno esaminato il numero di ripetizioni CAG negli uomini infertili hanno riportato risultati contrastanti. Alcuni non riportano l'espansione di queste triplette, mentre altri riportano un incremento della lunghezza di queste ripetizioni (sempre all'interno del range della normalità) rispetto ai soggetti fertili. In particolare, gli studi in cui sono stati reclutati soggetti australiani, giapponesi, di Singapore e del Nord America, hanno rilevato un'associazione tra la lunghezza delle triplette CAG e l'infertilità maschile, mentre quest'associazione non è così evidente negli studi condotti sulla popolazione europea. Questi risultati discordanti potrebbero riflettere la diversa selezione etnica dei pazienti. Infatti, la distribuzione del numero delle triplette CAG è più bassa nei soggetti afro-amercani, intermedio nei soggetti bianchi e più elevato negli asiatici. Altri fattori che potrebbero influire su questi risultati variabili e contrastanti sono: la dimensione della popolazione analizzata, la scelta del gruppo di controllo e di criteri di inclusione utilizzati per la scelta dei pazienti [142].Solo due studi hanno analizzato la distribuzione della lunghezza delle triplette GGN in soggetti infertili, però, non sono state riscontrate differenze rispetto alla popolazione generale.Recentemente, uno studio ha esaminato gli effetti combinati della variazione della lunghezza delle triplette CAG e GGN, dimostrando che alcuni aplotipi potrebbero modulare la funzione del recettore degli androgeni e potrebbero incrementare una suscettibilità individuale all'infertilità. Uno studio simile ha concluso che la combinazione di un numero di triplette CAG inferiore a 21 e un numero di triplette GGN inferiore a 23 è associata ad un inferiore rischio di infertilità, mentre i soggetti che presentano più di 21 triplette CAG e più di 23 triplette GGN sono esposti ad un rischio maggiore [140,142,143].In più, diversi studi [142][143] dimostrano che il polimorfismo 995G>A (SNP: Single Nucleotide Polymorphism),sia associato ad un aumentato rischio di infertilità. Infatti tale variante è presente nell'8% circa della popolazione generale, mentre si riscontra nel 17,8% cica degli uomini infertili [143].Comunque, non sono ancora disponibili dati definitivi sul ruolo che i polimorfismi dell'esone 1 di AR esercitano sull'infertilità maschile, ed ulteriori studi dovranno essere allestiti utilizzando popolazioni ben definite di uomini infertili e di diverse origini etniche.Infine, alcuni studi hanno dimostrato che alleli corti sono associati a tumori androgeno-dipendenti, come per esempio il cancro della prostata. Corte ripetizioni CAG aumentano l'androgenità dell'AR e sfociano in stimolazioni aumentate anormali del tessuto prostatico, il che porta a un incremento del rischio [144],abbassamento dell'età di comparsa, aumento del grado tumorale e estensione extra-prostatica del cancro della prostata [145].