Crisanti è noto per le sue attività di ricerca sulle zanzare, con l'obiettivo di studiarne il tasso riproduttivo e la capacità di veicolare malattie infettive quali la malaria. Presso l'Imperial College di Londra ha condotto degli studi sulla specie "Anopheles gambiae" allo scopo di ridurre la trasmissione della malaria umana; dato che il parassita responsabile della malattia viene trasmesso dalle zanzare femmine, Crisanti ha prodotto zanzare geneticamente modificate che generassero una prole esclusivamente maschile. Questo studio è stato uno dei primi casi in cui è stato possibile bloccare la capacità riproduttiva di un organismo complesso in laboratorio.