Il pensiero filosofico di Troxler è ispirato al Romanticismo e si inserisce nella tradizione neoplatonica, mediata anche da studiosi rinascimentali alchimisti come Paracelso o Jakob Böhme. Il fondamento della filosofia deve essere cercato secondo Troxler nell'antropologia, in quanto la comprensione della natura profonda dell'uomo (fra cui anche quella delle attività pre-coscienti come i sogni) porta a comprendere l'intero universo e a scoprirvi le tracce dell'operato divino (cfr, l'idea esoterica ed ermetica di macrocosmo e microcosmo). L'antropologia, poi, deve elevarsi in una "antroposofia", che conduce a Dio. La filosofia di Troxler, quindi, si avvicina alla teosofia e probabilmente il termine rinascimentale di antroposofia fu ripreso da Rudolf Steiner proprio tramite le opere di Troxler.