Henekh Morgentaler nacque a Łódź, a circa 120 chilometri a sud-ovest di Varsavia, in Polonia, il 19 marzo 1923 da Josef e Golda Morgentaler. Prima della seconda guerra mondiale, il padre di Morgentaler era attivo nel Bund generale ebraico del lavoro in Polonia. Durante l'occupazione tedesca della Polonia fu creato il ghetto di Łódź e agli ebrei venne proibito di lasciarlo. Il padre di Morgentaler fu ucciso dalla Gestapo, mentre Henry visse con sua madre e suo fratello minore nel ghetto con altre 164 000 persone. Sua sorella era partita per Varsavia con suo marito prima dell'inizio della guerra. Fu incarcerata nel ghetto di Varsavia e prese parte alla rivolta di quel ghetto. Fu uccisa nel campo di sterminio di Treblinka.