Negli ultimi anni, Dubos esplorò l'interconnessione dei fattori ambientali con la salute e con lo sviluppo fisico, mentale e spirituale dell'umanità e divenne uno dei più significativi pensatori nell'ambito dell'ambientalismo. I principi fondamentali della sua filosofia umanistica sono i seguenti: i problemi globali sono condizionati da eventi e scelte effettuati a livello locale (Dubos coniò il famoso motto ambientalista: ""Think globally, act locally"" - Pensa globalmente, agisci localmente), l'evoluzione sociale ci consente di ripensare alle azioni sociali in modo da poter cambiare direzione per avere un ambiente ecologicamente più equilibrato, si può guardare al futuro con ottimismo perché la vita e la natura umana sono flessibili e gli uomini sono diventati più consapevoli dei pericoli insiti nelle forze naturali e nelle attività umane, e possono trarre beneficio dai successi applicando ciò che hanno imparato per risolvere gli altri problemi ambientali che si presentano. Inoltre l'elemento fondamentale delle malattie non sono tanto le infezioni, quanto gli stress, endogeni o esogeni, che mutano la resistenza dell'organismo. In sintesi, scoprì una serie di sostanze presenti nei tessuti che si rivelarono decisive per lo sviluppo e la diffusione dei bacilli, e notò che il microambiente circostante un'infiammazione può incidere sul decorso dell'infezione; Dubos intuì che anche elementi ambientali, quali la dieta, il clima, le tossine, hanno un peso sull'infezione e sulla malattia; infine, proprio nell'ultimo periodo della sua ricerca, coniò la definizione di "freudismo biologico", con la quale correlò le influenze ambientali precoci e la resistenza a diversi stress.