A seconda dell'entità del rischio di ictus, possono essere prescritti dei farmaci anticoagulanti: i TAO, Terapia Anticoagulante Orale, (warfarin e altri anti-vitamina K), che inibiscono la sintesi epatica dei fattori di coagulazione mediante l'inibizione dell'assorbimento della vitamina K; questi farmaci sono molto efficaci, ma il profilo di efficacia può essere influenzato dall'interazione con altri farmaci o con alimenti ricchi di vitamina K); richiedono monitoraggio frequente dell'anticoagulazione; i NAO, nuovi anticoagulanti orali (rivaroxaban, apixaban, dabigatran), inibitori diretti della trombina, che consentono di mantenere il sangue scoagulato senza la necessità di controlli frequenti sull'anticoagulazione, ma presentano controindicazioni importanti, come l’età anziana, l'insufficienza renale, le patologie valvolari di grado severo.In questi casi è necessario valutare il pericolo che possano verificarsi emorragie sia prima di prendere il medicinale, sia durante la sua assunzione.