Si presenta come una singola chiazza o placca eritematosa, di piccole dimensioni, persistente, desquamante (soprattutto ai margini), talvolta crostosa, di forma solitamente lenticolare e dai margini ben definiti. Le lesioni meno frequentemente possono essere multiple. L'ulcerazione è spesso segno di evoluzione in carcinoma spinocellulare. La malattia di Bowen è generalmente asintomatica ma possono essere riferiti dolore o prurito. Sebbene si possa verificare su tutte la cute, le sedi più comuni sono gli arti inferiori, seguita da quella di capo e collo, meno frequente sulla cute periungueale, palmo-plantare, in sede anale ("anal intraepithelial neoplasia", AIN), sul pene ("penile intraepithelial neoplasia", PIN) o sulla vulva ("vulval intraepithelial neoplasia", VIN); rara alla mucosa orale. Le forme sulla cute e sulle mucose genitali hanno un maggior rischio evolutivo e una maggiore probabilità di recidiva. Le forme pigmentate sono rare. La lesione tende ad accrescersi e a distanza di anni può evolvere nel 3-5% dei casi in carcinoma spinocellulare ma in alcuni casi si risolve spontaneamente.