Solo nei casi non responsivi al trattamento psicosessuologico e che comportano notevole stress per il paziente, si può ricorrere alla terapia farmacologica. I trattamenti farmacologici possono essere anche molto efficaci ma non offrono una soluzione definitiva e devono perciò essere somministrati o cronicamente o in alcuni casi al momento del rapporto. Questi prevedono l'uso di anestetici locali (come quelli a base di lidocaina), farmaci che agiscono a livello centrale come gli SSRI in particolare la dapoxetina (approvata specificatamente per il trattamento di questo disturbo) e la paroxetina, la clomipramina e la sulpiride (utilizzati comunemente come antidepressivi) e gli inibitori PDE5, come il sildenafil.