Le tensioni raggiungono il picco nel 1907. Kellogg viene espulso dalla chiesa avventista e la cui sede viene trasferita a Washington DC. Il Sanatorio continua a prosperare per tutto il 1920 e a ospitare circa 1.200 pazienti durante il suo picco. Tuttavia le finanze dell'istituto sono state sovra estese da un progetto di costruzione nel 1927. Con l'inizio della Grande Depressione, della crisi del '29, il numero degli ospiti presso la struttura del Sanatorio si riduce notevolmente e nel 1942 Kellogg chiude le porte del Sanatorio, con 3 milioni di dollari di debito. Tuttavia, l'inesauribile Kellogg continua a perseguire nuovi progetti.