Nonostante si tratti di un disturbo abbastanza frequente, l'eziologia delle coliche infantili non è ancora completamente chiarita ed è verosimilmente da considerare multifattoriale.Le ipotesi eziologiche formulate sono riconducibili a due teorie principali:quella organicistica e quella psico-relazionale. Recentemente alcuni autori hanno ipotizzato il ruolo di altri fattori quali la dieta, il fumo dei genitori, gli eventuali farmaci assunti durante il parto o i livelli anomali di alcuni ormoni.Negli ultimi anni si è focalizzata l'attenzione sulla flora microbica intestinale: l'ambiente microbico e l'assunzione di probiotici durante l'infanzia sono in grado di modificare la risposta immunitaria, che sembra giocare un ruolo importante nello sviluppo delle coliche infantili (Tab.4).