Nel 1992 un articolo pubblicato sulla rivista Rolling Stone indicò il vaccino sviluppato da Koprowski e sperimentato negli anni cinquanta nell'allora Congo Belga, come il veicolo che permise il "salto" (spillover) del virus HIV da alcuni primati all'uomo. Tale teoria è stata smentita nel 2013 da numerosi studi, effettuati anche analizzando campioni dei vaccini usati da Koprowski in Congo. È morto nel 2013 all'età di 96 anni a seguito di una polmonite.