Esistono due principali modalità di approcciare un problema di natura farmacogenetica: l'approccio "candidate-gene" e quello "genome wide association study" (GWAS).La prima tecnica si propone di valutare se un particolare allele sia più frequente in pazienti con risposta migliore (o peggiore) ad un determinato farmaco. 97 Esistono diverse banche dati contenenti i polimorfismi umani conosciuti, in alcuni casi associati a dati fenotipici (Pharmacogenetics and Pharmacogenomics Knowledge Base, PharmGKB).In questo modo è possibile selezionare il polimorfismo da studiare sulla base dell'effetto 34 osservato sul prodotto genico e della frequenza riscontrata nella popolazione, parametro utile in quanto polimorfismi con frequenza inferiore al 5% non conferiscono, in genere, sufficiente potenza allo studio. Il secondo approccio, invece, prende in considerazione contemporaneamente numerosi polimorfismi distribuiti lungo l'intero genoma. 98 Appare evidente come il principale limite dell'approccio "candidate-gene" stia nella necessità di avere a priori una buona conoscenza del ruolo biologico del gene considerato e dei possibili effetti di un dato polimorfismo. Se, invece, si considerano contemporaneamente più alleli, l'importanza della significatività a priori è decisamente ridotta e si possono anche identificare associazioni con alleli dei quali non sia ancora noto il ruolo biologico. 99 