Sebbene i dati a lungo termine derivati dall'estensione degli studi CARE-MS I e CARE-MS II non siano ancora disponibili, molti sono i dati raccolti in questi 4 anni nei pazienti in studio nel CARE-MS extension ed in 7 anni nei pazienti arruolati nel CAMMS223 extension.Gli effetti avversi più comuni sono rappresentati da: Reazioni all'infusione → circa il 90 % dei pazienti trattati sviluppa reazioni infusionali, che sembrano essere associate al rilascio di citochine. [160] In questo caso si è definita reazione all'infusione un qualsiasi effetto avverso che si è sviluppato durante l'infusione o nelle prime 24 ore. Reazioni gravi si sono verificate solo in un 1 -3 % di soggetti. I più comuni sono: cefalea (43−56%); rash Attraverso un eccessivo turn-over dei linfociti T, l'IL-21 aumenta la probabilità che le cellule T incontrino l'antigene self, con conseguente autoimmunità.Circa un terzo dei soggetti trattati con Alemtuzumab sviluppa disordini autoimmuni clinicamente evidenti. I più frequenti sono rappresentati da patologie autoimmuni tiroidee (sia Morbo di Graves si tiroidite di Hashimoto), che a seconda delle casistiche, oscillano tra il 20% ed il 30%. [76] Più rara, ma più pericolosa, è la porpora trombocitopenica autoimmune (PTI) [94],che è stata riportata in un 1 -3 % dei soggetti trattati. Infine sono stati descritti rari casi di glomerulonefrite membranosa autoimmune e di sindrome di Goodpasture [76]. Questi dati indicano, quindi, che la proliferazione omeostatica conduce ad un'autoimmunità associata a linfocitopenia. Disturbi nella fertilità → si sa che il CD52 è espresso sulle cellule del sistema riproduttivo maschile [179] e per questo l'Alemtuzumab potrebbe provocare un danno a carico di tali cellule, ma ad oggi non esistono prove di evidenza di ridotta motilità nè di alterazioni degli spermatozoi e neppure di riduzione numerica degli stessi nel liquido spermatico. 