Processi immunologici sono alla base dell'uveite associata all'AIG, ciò nonostante rimane il problema in che misura tali processi siano la causa e in che misura la conseguenza della malattia. Inoltre, può essere arduo distinguere i fenomeni legati all'artrite da quelli specifici per l'uveite.Per quanto concerne l'AIG, l'eziologia è sconosciuta, ma alcuni studi sospettano l'eccessiva risposta immune, messa in opera da numerosi tipi cellulari, in bambini Uno dei principali ostacoli nella definizione del preciso meccanismo di danno, responsabile dell'uveite, è la difficoltà di ottenere campioni caratterizzanti la fase precoce della malattia. L'esame dei tessuti oculari comporta lo studio di tessuti asportati dopo anni di malattia cronica, con il riscontro, a livello dell'iride e dei corpi ciliari, di un infiltrato costituito per lo più da linfociti e plasmacellule.L'anormalità sierica più comune nei bambini affetti da AIG è la positività degli ANA, con un pattern omogeneo o granulare. La frequenza di elevati livelli degli ANA dipende dal tipo di tecnica impiegata per l'esecuzione del test. Gli ANA sono stati identificati, grazie all'immunofluorescenza, in circa il 30% dei bambini affetti da AIG, soprattutto AIG pauciarticolare. I soggetti con elevati livelli di tali anticorpi hanno un rischio maggiore di sviluppare uveite. 73 Altri possibili riscontri nei pazienti colpiti da AIG sono gli anticorpi identificabili grazie alla reazione con la proteina bovina retinica S, che sembrano correlarsi al danno oculare.Esistono, infatti, segnalazioni del fatto che i bambini con uveite associata ad AIG ne mostrino livelli elevati, sia rispetto sia ai pazienti con AIG sia ai controlli sani.Il collagene di tipo II ha una distribuzione relativamente confinata alla cartilagine ialina e al corpo vitreo dell'occhio. Esso induce artrite e occasionalmente uveite negli animali.Nei bambini con artrite e uveite, tuttavia, l'immunità cellulare e anticorpale nei confronti del collagene umano denaturato o bovino non sono più accentuate rispetto ai bambini con sola artrite.