Terminati gli studi iniziò ad esercitare la professione assistendo il padre. In quei mesi prese ad analizzare scrupolosamente caso per caso tutti gli effetti, i sintomi e l'evoluzione della corea ereditaria, annotando in maniera sistematica tutti i particolari. Dopo un anno di osservazioni scrisse un articolo intitolato "On Chorea", pubblicato il 13 aprile 1872 dalla rivista "Medical and Surgical Reporter of Philadelphia". Huntington descrisse le caratteristiche di quella malattia degenerativa del sistema nervoso che chiamò "corea ereditaria", delineandone tre aspetti peculiari: