Reclutato da Bob Swanson nel 1978, fu il primo scienziato non universitario, ad essere assunto presso la Genentech, un'azienda biotecnologica. Goeddel è diventato leggendario nella biotecnologia e nei campi della biologia molecolare per la clonazione di prodotti utili per la salute dell'uomo, spesso battendo i laboratori più grandi e più affermati nel processo. 