A Kölliker va riconosciuto il merito di aver colto l'importanza del metodo della "reazione nera" messo a punto dall'istologo italiano. La provò per la prima volta nel 1885 ma ottenne risultati poco soddisfacenti. Nei primi mesi del 1887, Golgi inviò al collega tedesco alcuni suoi preparati cromoargentici e questi nonostante i suoi settant'anni, si mise al lavoro, dimostrandosi, in questo modo, un protagonista estremamente lucido dell'istologia mondiale. Dunque ebbe inizio un profondo rapporto di stima e di amicizia cementata da molti scambi epistolari e da alcuni incontri personali. Nelle sue memorie Kölliker rivendicò orgogliosamente di aver introdotto il metodo della "reazione nera" in Germania. Così scrisse: «Je vous regarde comme celui, qui a le prémier ouvert la voie pour une compréhension vraie de la structure si compliquée du Cerveau »