In corso di trattamento sono stati descritti alcuni possibili effetti collaterali, fra questi la granulocitopenia (con recupero nel giro di 3-4 settimane), raramente trombocitopenia, nausea, vomito, stomatite, alopecia reversibile, amenorrea ed azoospermia. Durante l'iniezione endovenosa va prestata attenzione ad evitare lo stravaso della soluzione che può causare necrosi tissutale.