Medico a Montpellier, Champier è stato il medico personale di Antonio di Lorena, che seguì in Italia con Luigi XII, partecipando a diverse battaglie, stabilendosi poi definitivamente a Lione. Svolse la sua professione a Lione con François Rabelais (che scrisse di lui in maniera satirica in "Gargantua e Pantagruel"), dove fondò il "Collegio dei medici di Lione". Svolse il servizio civico di assessore e contribuì a numerose fondazioni locali, in particolare "L'Ecole des Médecins de Lyon" ("La scuola dei medici di Lione").