Le infezioni più comuni nel primo mese sono quelle nosocomiali di origine batterica (infezioni urinarie, della ferita chirurgica, del tratto respiratorio, e degli accessi venosi centrali).Dal 2° al 6° mese sono assai frequenti le infezioni opportunistiche soprattutto virali, trale quali le più comuni sono quella rappresentate da Herpes Virus (specie HSV-1, HSV-2, VZV, EBV, CMV, ed HHV-8) e da Poliomavirus (BK e JC).Le infezioni da CMV possono verificarsi in seguito al primo contatto con il virus o alla riattivazione endogena dopo contatti pregressi.Le infezioni sintomatiche da EBV nel trapianto renale possono manifestarsi come attivazione linfocitaria policlonale tipo mononucleosi infettiva, o sottoforma di veri e propri linfomi.HHV-8 ha un'alta prevalenza nel bacino del mediterraneo e, nel paziente immunodepresso è associato al Sarcoma di Kaposi, tumore endoteliale a localizzazione cutaneo-mucosa ed occasionalmente viscerale. Dopo i 6 mesi possono verificarsi le complicanze tardive di infezioni acquisite nel periodo precedente, come nel caso della retinite da CMV, le malattie linfoproliferative post-trapianto (PTLD), oltre alle infezioni acquisite in comunità, con maggiore incidenza rispetto alla popolazione generale.La profilassi delle infezioni da CMV viene effettuata a tutti i donatori con IgG anti-CMV negative che ricevono un organo IgG anti-CMV positivo, e a quelli a cui viene somministrata una terapia immunosoppressiva maggiore (OKT3, timoglobuline).La terapia delle complicanze infettive si basa sull'uso di farmaci antivirali quali Gancyclovir, Valgancyclovir, o Valacyclovir e prevede la riduzione dell'immunosoppressione o l'utilizzo di farmaci immunosoppressori con maggiore capacità antiproliferativa.