Indagato è anche il ruolo delle trombofilie nel favorire la genesi di trombosi venose.Alcuni studi hanno mostrato che i disordini della coagulazione possono essere la causa di stroke solo in una minoranza di casi (1-4%) 28 ma che tuttavia essi posso rivestire un ruolo significativo nella genesi di eventi cardioembolici soprattutto in alcune categorie di pazienti, come ad esempio i giovani adulti. 135 In contrasto, Hankey può addirittura essere dannoso sia in termini di costi che in termini di salute perchè espone il paziente al rischio di avviare una terapia anticoagulante con i rischi che da essa derivano senza benefici certi.Neppure tra i soggetti di età inferiore ai 50 anni, colpiti da un primo ictus e senza storia familiare o clinica di coagulopatie ereditarie, è giustificato tale screening. 137 Tuttavia Pezzini 138 ha mostrato in uno studio caso-controllo che la mutazione G20210A della trombina e, in misura minore, la mutazione V G1691A del fattore V della coagulazione, possono rappresentare fattori di rischio per gli stroke FOP correlati.Gli stessi risultati sono confermati anche dagli studi di Karttunen 139 e Lichy 140 sebbene quest'ultimo riconosca solo la mutazione della trombina e non il fattore V Leiden come fattore di rischio.