Il flusso unidirezionale di questo circuito è spezzato solo dalle occasionali sinapsi fra i dendriti apicali dei neuroni di CA3 e CA1, e le fibre della via perforante. Sebbene vi siano anche alcuni interneuroni inibitori GABAergici, il principale neurotrasmettitore usato nella formazione dell'ippocampo è il glutammato, e la presenza massiccia di collegamenti eccitatori spiega la vulnerabilità di questa area dell'encefalo agli attacchi epilettici.