L'effetto Wolff-Chaikoff non può essere usato per il trattamento dell'ipertiroidismo, infatti, in pazienti ipertiroidei, la somministrazione di Iodio a dosi terapeutiche induce una prima fase di riduzione della produzione di ormoni tiroidei cui segue la fase di "escape" con incremento degli ormoni tiroidei e ripristino della condizione di ipertiroidismo. La sospensione del trattamento con Iodio può provocare una crisi tireotossica.