Dopo somministrazione orale pristinamicina viene bene assorbita dal tratto gastrointestinale. La concentrazione plasmatica di picco, pari a 1 µg/ml viene raggiunta entro 1-2 ore dalla assunzione di una singola dose di 500 mg. L'emivita plasmatica è di 6 ore. Il legame con le proteine plasmatiche è del 40-45% (per pristinamicina I) e del 70-75% (per pristinamicina II).