Il DPCM stabilisce inoltre misure più rigide per le Regioni avanzate allo "scenario 3" e allo "scenario 4", individuate come tali dal Comitato Tecnico-Scientifico. Tali misure vengono emanate con un'ordinanza del Ministro della Salute, d'intesa con il presidente della Regione interessata e il CTS, e devono avere una durata minima di 15 giorni.