Gli agenti alchilanti esercitano effetti citotossici attraverso il trasferimento dei loro gruppi alchilici al DNA. Fanno parte di questa categoria il Pipobromano e il Busulfano.Il Pipobromano è un derivato bromidrico della piperazina ed ha un meccanismo d'azione simile agli agenti alchilanti ma agisce anche come competitore dei nucleotidi pirimidinici: inibisce infatti l'attività delle DNA e RNA polimerasi. E' stato usato estesamente in Europa per il trattamento sia della TE che della PV (124), ( 125), ( 126), (127) .Il Busulfano è un agente alchilante, viene usato nella terapia della TE, soprattutto per i pazienti non responsivi ai trattamenti di prima scelta. Può indurre grave mielosoppressione, tossicità gonadica e polmonare ed aumento dell'incidenza di seconde neoplasie (80) .