Come risultato del difetto genico, i soggetti affetti da HAE producono una quantità insufficiente di C1-INH e/o un C1-INH non funzionale. Anche se il meccanismo esatto mediante il quale il deficit da C1-INH causa l'angioedema non è stato ancora chiarito, in larga misura esso deriva da una attivazione errata e non inibita del Sistema Chinina Callicreina (SCC).