Fino alla comparsa dei farmaci antifibrotici e, durante la loro assunzione, in caso di peggioramento evidente delle condizioni respiratorie, l'unico intervento che modifica sostanzialmente la sopravvivenza dei pazienti è il trapianto polmonare [79] [80] [81].Ogni anno negli Stati Uniti vengono eseguiti più di 2000 trapianti di polmone, circa la metà dei quali per malattia polmonare interstiziale: solo una minoranza di pazienti con IPF riceve un trapianto. Tuttavia, il 66% dei pazienti trapiantati con IPF sopravvive per più di 3 anni dopo il trapianto e il 53% sopravvive per più di 5 anni [82].In assenza di contrindicazioni, il trapianto è indicato in ogni paziente con aspettativa di vita media inferiore ai 2 anni [83]: considerando la sopravvivenza media post trapianto e la scarsità di donazioni, il trapianto dovrebbe essere considerato nei pazienti che non rispondano alla terapia medica e che presentino un importante declino funzionale [9]. Far valutare un paziente da un centro trapianti e la sua presa in carico dovrebbe essere prassi al momento della diagnosi, poiché il processo di valutazione richiede tempo e l'attesa in lista puo' durare da mesi ad anni. Le controindicazioni comuni includono il cancro recente, l'insufficienza d'organo non polmonare avanzata e la mancanza di un sistema di supporto sociale affidabile [84].In Italia l'attesa media per i pazienti in lista trapianto è di 2 anni e la mortalità in lista d'attesa di circa il 10% [9]. La scelta della procedura (trapianto bi-o monopolmonare) è di competenza del centro trapianti.È stato ipotizzato che i farmaci antifibrotici possano interferire con la cicatrizzazione delle ferite chirurgiche. Tuttavia, alcuni studi, condotti su pazienti con IPF in terapia antifibrotica sottoposti a trapianto polmonare, non mostrano ne un aumentato rischio di complicanze post-operatorie (in specie le temute conseguenze sulla cicatrizzazione delle ferite chirurgiche) ne della mortalità in genere [85] [86].