Inoltre, ‘per l'edificazione, occorreva tener conto del predominio dei venti: secondo la teoria umorale delle malattie, queste erano l'effetto di putrefazione degli umori e pertanto il lazzaretto non doveva essere esposto all'azione di venti a provenienza occidentale, perché questi, definiti putridi, potevano facilmente diffondere il contagio'. (anche a Milazzo, durante l'epidemia di peste del 1565 e , poi, dal 1575, venne adattata a lazzaretto la grotta Polifemo, sulla spiaggia di Ponente, per lo stesso motivo). Benché fosse stato proposto di affiancare al lazzaretto di osservazione, un lazzaretto di spurgo, indubbiamente più complesso del primo, il lazzaretto di Messina restò sempre lazzaretto di osservazione. Nel periodo di tempo che va dalla fine del XVII secolo ed il 1743 (anno di persistente epidemia di peste bubbonica, forse l'ultima in ordine di tempo occorsa in Messina), si può ritenere che il lazzaretto abbia contribuito ad evitare il reimpianto di fenomeni epidemici nella città, almeno relativamente al periodo su ricordato.