Quelli ad aria compressa hanno il vantaggio di somministrare più farmaci contemporaneamente e lo svantaggio di tempi più lunghi di erogazione. I nebulizzatori ad ultrasuoni hanno una maggiore rapidità di nebulizzazione rispetto a quelli ad aria compressa, ma non possono essere utilizzati per la somministrazione di farmaci in sospensione (steroidi), di preparati viscosi, di principi attivi con un diametro di particelle >6μm; inoltre presentano il rischio di alterare alcune sostanze.