Il caso di appello, "R v. Morgentaler" del 1988, venne dibattuto alla Corte suprema del Canada. Per Morgentaler fu una vittoria. La corte confermò l'assoluzione originale della giuria. Inoltre, dichiarò che la legge sull'aborto del 1969 violava la Carta canadese dei diritti e delle libertà e quindi era incostituzionale nel caso "R. v. Morgentaler 1988" (1 SCR 30). La corte giudicò per 5 a 2 che le procedure amministrative erano ingombranti e ingiustificatamente interferivano con l'integrità corporale delle donne". Il 28 gennaio, la legge risultò in violazione della sezione 7 della Carta dei diritti e delle libertà perché violava il diritto di una donna alla "vita, alla libertà e alla sicurezza della persona".