In seguito all"assorbimento del complesso cobalamina-TCII, la TCII và incontro a digestione lisosomiale, permettendo così la separazione della cobalamina dalla TCII e il suo trasferimento nel citoplasma.La cobalamina libera fà da cofattore a tre importanti reazioni enzimatiche:1. catalizza il catabolismo dell"omocisteina in metionina mediato dall"enzima metionina sintasi (meth)2. sotto forma di metilcobalamina, viene trasferita ai mitocondri, dove è trasformata in adenosilcobalamina, un importante cofattore nella sintesi di succinil-CoA a partire dal metilmalonil-CoA (il prodotto del catabolismo delle catene libere degli acidi grassi e di alcuni amminoacidi), mediata dalla metilmalonil-coenzima A mutasi.3. sotto forma di deossiadenosilcobalamina, catalizza la formazione della forma attiva della vitamina B9, il tetraidrofolato, mediata dall"enzima metiltetraidrofolatoreduttasi (MTHFR) 103 .