L'acetilcolina è una molecola ad elevata flessibilità; ciò significa che può assumere diverse configurazioni spaziali più o meno stabili che le permettono di interagire con un'ampia gamma di siti recettoriali specifici. La molecola presenta quattro legami che possono assumere differenti angoli di torsione τ (tau) ma la specificità recettoriale dell'acetilcolina è determinata essenzialmente dal valore dell'angolo di torsione τ2: per τ2 = 180° si avrà il conformero "trans" di Ach, mentre per τ2 = 60° si avrà il conformero "cis", differenza importante in quanto il primo ("trans") ha maggiore affinità per il sito attivo dei recettori muscarinici, mentre il secondo ("cis") ha maggiore affinità per il sito attivo dei recettori nicotinici.