La daptomicina è attiva unicamente contro i batteri Gram-positivi. Ha dimostrato attività "in vitro" contro gli enterococchi (inclusi gli enterococchi glicopeptide-resistenti - GRE), stafilococchi (incluso lo "Staphylococcus aureus" meticillino-resistente), streptococchi e corinebatteri. Importante soprattutto l'azione su enterococco faecium ed enterococco faecalis anche vancomicina resistenti