Il problema delle cicatrici è stato più volte affrontato in letteratura: Meyrier, nei suoi due studi del 1990 e 1996, afferma che tali lesioni alla TC sono evidenziate come delle aree di ipodensità il che porta a suggerire un ruolo importante dell'ischemia; ovvero, di una importante vasocostrizione. Meyrier riporta anche numerosi studi sui primati, (Roberts del 1983(Roberts del , 1987(Roberts del e 1989: entro pochi minuti dall'invasione dei batteri nell'interstizio renale si innescano delle cascate che portano ad un quadro di ischemia precoce: le endotossine batteriche inducono l'aggregazione dei granulociti all'interno dei capillari dell'interstizio e l'attivazione dei mediatori dell'infiammazione, tra cui le citochine, il TNF e il TXA2 (trombossano A2); il complemento si attiva entro pochi minuti dopo il contatto tra gli antigeni batterici e le cellule dei tubuli renali, il che facilita un ulteriore richiamo di altri granulociti che vanno ad obliterare lo spazio vascolare. La riperfusione, successivamente, permette la formazione di radicali liberi dell'ossigeno che vanno a perossidare i lipidi delle membrane; non solo, la degranulazione dei fagociti permette il rilascio di alcuni enzimi lisosomiali che aumentano il danno tissutale.L'effetto complessivo è quindi la necrosi delle cellule tubulari, l'invasione dell'interstizio renale, il danno renale, la successiva riparazione con fibrosi e in alcuni casi la diminuzione del volume parenchimale.Al momento non ci sono studi comparabili nell'uomo, tuttavia Meyrier riporta come non ci sia ragione di pensare che il tessuto renale umano possa reagire diversamente da quello delle scimmie studiate da Roberts. (Meyrier, e 1996.Lo stesso meccanismo dello sviluppo delle cicatrici viene anche riportato da Nessuna delle pazienti ha sviluppato delle alterazioni renali severe. Secondo Raz, sebbene il rischio di cicatrici renali post PNA sia alto, nella maggior parte dei casi queste si associano ad un minimo danno renale senza rilevanza clinica e senza incremento della prevalenza.