Nel 1548, senza alcun titolo di studio valido, parte da Bologna alla volta del porto di Genova per assistere allo sbarco di Filippo II, figlio dell'imperatore spagnolo Carlo V. Subito dopo decide di trasferirsi in Sicilia con l'intenzione di: Un'altra motivazione che lo spinse a cercare fortuna in Sicilia fu sicuramente il fatto che nell'isola c'erano pochi medici laureati, quindi per un giovane come lui, senza una laurea e senza esperienza, sarebbe stato più facile affermarsi. La sua previsione si rivelò per molti aspetti corretta; infatti arrivato nell'isola si trovò subito a contatto con dei malati che avevano stima e fiducia in lui per il sol fatto di essere un forestiero. Il primo suo paziente fu un uomo affetto da febbre quartana che, dato oramai per spacciato, fu affidatogli da alcuni colleghi siciliani. Fioravanti, che all'epoca aveva ancora pochissime conoscenze mediche, decise di applicare la teoria umorale riuscendo così a curare il paziente. Il suo secondo paziente fu un famoso soprintendente spagnolo affetto da sifilide, di fronte a questo male Fioravanti all'inizio non seppe come comportarsi dunque decise di consultare tutti i più famosi manuali di medicina del tempo e alla fine si risolse ad adottare una terapia a base di purghe e sciroppi per la sudorazione che, contro ogni aspettativa, funzionò. La sua fama di medico e chirurgo però si consolidò solo nell'aprile 1549 quando gli fu proposto di asportare la milza ad una donna greca. Fioravanti non aveva mai eseguito un'operazione del genere e per poter operare al meglio chiama, appositamente da Napoli come suo assistente, un vecchio barbiere molto esperto. L'intervento ha successo ed è il primo che si registra su suolo italiano.