Negli animali sani lo smegma aiuta a pulire e lubrificare i genitali. In medicina veterinaria, l'analisi dello smegma è talvolta utilizzata per rilevare eventuali agenti patogeni delle vie urogenitali, ad esempio il "Tritrichomonas foetus". L'accumulo di smegma nelle pieghe prepuziali degli equini, nella fossa uretrale e nel diverticolo uretrale può comportare la formazione di grandi granuli e favorire l'infezione da "Taylorella equigenitalis", l'agente eziologico della metrite equina contagiosa. Alcuni veterinari hanno raccomandato la pulizia periodica dei genitali maschili per migliorare la salute degli animali.