Il nucleo del nervo oculomotore presenta sia una componente motrice somatica che una effetrice viscerale: la prima è deputata all'innervazione di tutti i muscoli estrinseci dell'occhio a parte il retto laterale (di competenza del nervo abducente) e obliquo superiore (di competenza del nervo trocleare); la seconda innerva i muscolo intrinseci dell'occhio coinvolti nei processi di contrazione o dilatazione della pupilla e dell'accomodazione.