Una preparazione di qualità del colon permette di lavorare su un viscere liberato da ogni residuo fecale, non disteso da gas o edemi della parete. Il tenue deve essere anch'esso vuoto a sufficienza per non ostacolare l'esposizione del campo operatorio.Vanno evitate le preparazioni rapide eseguite solo il giorno precedente l'intervento. Il paziente va sottoposto a dieta senza scorie 8 giorni prima dell'intervento. La preparazione del colon dovrà essere eseguita 48 ore prima dell'operazione. Nessuno studio ha dimostrato la supremazia di un tipo di preparazione su un altro; di solito risulta sufficiente la somministrazione di glicole-polietilenico per 2-3 ore. Le preparazioni che richiedono la minor somministrazione di liquidi per os debbono essere preferite a quelle standard. Inoltre la realizzazione di un clistere con Betadine® il giorno prima dell'intervento riduce il tasso di complicazioni settiche.