Il medico fa una diagnosi di endocardite in base all'anamnesi, ai sintomi che sta riscontrando e ai risultati dei test diagnostici. La diagnosi si basa solitamente su diversi fattori piuttosto che su un singolo test risultato positivo. Oltre all'analisi dei sintomi generici e all'auscultazione del cuore, il medico richiederà i seguenti test diagnostici: