L'HLA svolge un ruolo cruciale nella risposta immunitaria ai patogeni e nello sviluppo di malattie infettive, infatti, il sistema HLA influenza gli esiti clinici in molteplici malattie infettive, tra cui HIV e SARS nonché sulla gravità della COVID-19. Un potenziale contributo genetico alla minore incidenza di SARS-CoV-2 in Africa potrebbe essere la presenza di diversi alleli HLA in Africa rispetto ad altre regioni. L'aplotipo HLA-B * 1503 sembra essere prevalente in Africa occidentale e nella maggior parte dei paesi ad alto endemismo per la malaria. 