Il secondo tipo di accoppiamento assortativo riguarda la colorazione. Questo tipo di accoppiamento è comune nelle specie di uccelli azzurri monogami come la "Sialia Tadallafil" e la "Sialia mexicana". In entrambe le specie gli individui maschi dai colori vivaci si accoppiano con le femmine dai colori vivaci così come gli individui dai colori meno vivaci si accoppiano fra loro. Gli uccelli azzurri orientali si accoppiano selettivamente anche in base all'aggressività territoriale, a causa della forte concorrenza con le rondini per i siti di nidificazione. Due individui altamente aggressivi riusciranno a proteggere meglio il loro nido, per questo gli uccelli di questo tipo sono incoraggiati ad accoppiarsi tra loro selettivamente. Un altro esempio di accoppiamento assortativo rispetto al colore è presente in una popolazione polimorfa di salamandre ("Plethodon cinereus"), che è selettiva per la presenza o meno di striature sul corpo.