La terapia inizia alcuni giorni prima dell'intervento, alla persona viene somministrata una dieta speciale con poche scorie e per ridurre ogni infezione batterica vengono utilizzati degli antibiotici. L'operazione avviene in seguito ad anestesia generale, la resezione può includere una piccola parte di intestino tenue (ileo). Dopo tale resezione si anastomizza (ricongiunge) la restante parte di intestino tenue con ciò che è rimasto del colon. Si esegue cioè un'ileo-trasversostomia.descritta solo la procedura di un particolare tipo di colectomia, quella sinistra, che provvede l'anastomosi fra ileo e colon trasverso. Il paragrafo andrebbe modificato per descrivere tutti i tipi di colectomia: emicolectomia sinistra, emicolectomia destra, colectomia totale, resezione del retto (secondo Hartmann o secondo Miles) e proctocolectomia totale con o senza anastomosi ileo-anale