Nella descrizione delle piante, Dioscoride utilizza una classificazione elementare, anche se non si può dire che abbia usato una tassonomia botanica. Il primo libro descrive gli usi degli oli aromatici, pomate e unguenti, alberi e arbusti e frutti carnosi, anche se non aromatici. Il secondo libro tratta l'uso di animali, parti di animali, prodotti di origine animale, cereali e legumi, malvacee, verdure crocifere e altre erbe del giardino. IL terzo libro tratta in maniera dettagliata le proprietà di radici, succhi di frutta, erbe e semi, utilizzati per il cibo o per le medicine. Il quarto libro continua la descrizione degli usi delle radici e delle erbe, in particolare dei narcotici e delle piante medicinali velenose. Il quinto libro affronta gli usi medicinali del vino e dei minerali metallici. Esso è un precursore della moderna farmacopea ed è considerato uno dei più influenti libri sulle erbe medicinali della storia, rimanendo in uso fino a tutto il 1600