Il ciclo delle rappresentazioni che ricordano l'origine dell'ospedale e pochi episodi relativi ad Innocenzo III inizia sulla parete orientale e prosegue fino alla parete di mezzogiorno; da qui parte la raffigurazione sulla vita e sulle gesta di Sisto IV. Tra gli episodi più importanti sono da ricordare quelli inerenti all'uccisione dei bambini gettati nel Tevere, "“il sogno di Innocenzo III”" o come "“ i pescatori presentano cadaveri di bambini a Innocenzo III”", forse uno dei quadri più significativi dell'intero ciclo. Fu proprio questo sogno che spinse Innocenzo III a fondare la "Schola dei Sassoni", come detto sopra, luogo originario dell'ospedale Santo Spirito. La Corsia Sistina fa capo a tutto il complesso di Santo Spirito in Saxia, che comprende anche i "Chiostri dei Frati", "delle Monache e del Pozzo" e il "Palazzo del commendatore". Tutto il complesso è situato nell'area occupata in epoca romana dalla villa di "Agrippina Major" (moglie di Germanico e madre di Caligola), di cui ancora oggi, nei locali sottostanti la Corsia Sistina, sono visibili resti di muri "“ad opus reticulatum”", pavimenti in mosaico, frammenti di marmi scolpiti e resti di affreschi.