Amoxicillina è una penicillina semisintetica, un antibiotico beta-lattamico, che inibisce uno o più enzimi appartenenti alla via metabolica biosintetica di un componente strutturale della parete cellulare batterica, il peptidoglicano. L'inibizione della produzione di peptidoglicano comporta un indebolimento della struttura della parete cellulare con conseguente lisi e morte batterica.