L'encefalite associata all'influenza (IAE) è una complicanza rara ma ben nota dell'infezione da virus influenzale inoltre il potenziale di neuroinvasione è ben documentato nella maggior parte dei coronavirus umani (OC-43, 229E, HKU1, MERS, SARS-CoV-1, SARS-CoV-2) e sono riportati vari casi di encefalite associata all'infezione virale anche con esito fatale.