Gli effetti citotossici e biologici dati da un accumulo di nanoparticelle nel tempo, a seguito di una somministrazione, sono di difficile valutazione; infatti le tecniche utilizzate "in vitro" sono poco efficacemente replicabili "in vivo" (microscopia elettronica o a forza atomica) e questo vale anche per le tecniche di marcatura (radioattiva, fluorescente o chimica) se le particelle penetrate non sono superficialmente modificate.