Nel 1924, questo tipo di neoplasia è stata chiamata tumore della tasca di Rathke. Il fondatore della neurochirurgia, lo statunitense Harvey Cushing, suggerì il termine di "craniofaringioma", il quale fu poi adottato a livello mondiale. I primi tentativi di eliminare tale patologia, sono stati accompagnati da un alto tasso di mortalità (40%) e una bassa percentuale di rimozione totale (15%). A questo proposito, nel 1960, la scelta primaria era la puntura del craniofaringioma, al fine di ridurne il volume, seguita dalla radioterapia, piuttosto che i tentativi di resezione chirurgica radicale. A seguito dei progressi tecnologici della fine del XX secolo, tale procedura è stata rivista a favore dell'intervento chirurgico radicale, eventualmente seguito da radioterapia.