Gli istoni svolgono un ruolo critico nella regolazione trascrizionale, progressione del ciclo cellulare. L'acetilazione degli istoni e la deacetilazione altera la struttura cromosomica e colpisce i fattori di accesso alla trascrizione del DNA. La proteina codificata da questo gene appartiene alla famiglia di classe"II" dell'istone "ACUC / apha" deacetilasi. Ha l'attività deacetilasi dell'istone e reprime la trascrizione quando legato ad un promotore. Questa proteina non si lega al DNA direttamente, ma attraverso i fattori di trascrizione "MEF2C" e "MEF2D". Sembra interagire in un complesso multiproteico con "RbAp48" e "HDAC3". Inoltre, l'HDAC4 è necessaria per la differenziazione dei miofibroblasti TGFbeta1-indotta.