Succedette a Fritz de Quervain come chirurgo-capo all'Università di Basilea, dove fu docente, avendo fra i suoi assistenti Franz Merke e fra i suoi allievi Adrienne von Speyr, la quale dedicò varie pagine a Hotz – fra cui un capitolo intitolato "Morte del professor Hotz", che parla della precoce scomparsa del docente perché malato di perforazione allo stomaco – nella propria autobiografia.