Best succedette a Macleod come professore di Fisiologia all'università di Toronto nel 1929. Durante la Seconda guerra mondiale fu influente nello stabilire un programma Canadese per mettere in sicurezza e usare il siero del sangue umano. Negli ultimi suoi anni, Best divenne consulente del comitato per la ricerca medica dell'organizzazione per la salute delle Nazioni Unite.