Il trattamento con la terapia adronica non è doloroso e non causa effetti collaterali visibili, anche se possono verificarsi disturbi secondari a causa della tossicità delle radiazioni. Essi dipendono dalla quantità di radiazioni (dose), dalla zona irradiata, ma anche da eventuali trattamenti effettuati in precedenza (come altri cicli di radioterapia tradizionale).