La chirurgia, mediante l'asportazione "en-bloc" dell'organo, permette un'accurata valutazione anatomopatologica dell'estensione della malattia e dell'eventuale invasione delle strutture adiacenti. La definizione dei margini chirurgici, consente di definire la prognosi e di porre l'indicazione ad eventuali terapie adiuvanti. In casi selezionati, l'intervento chirurgico permette anche di risparmiare uno o entrambi i fasci vascolo-nervosi, offrendo una maggiore probabilità di conservare la potenza sessuale. Occorre, inoltre, considerare che in una parte dei casi la stadiazione anatomopatologica (che non è possibile con l'approccio radioterapico) rivela una sottostadiazione clinica della malattia, con modificazione della prognosi del paziente.In seguito a prostatectomia il PSA, in assenza di tessuto prostatico persistente (localmente e/o a distanza), diventa indosabile. In queste condizioni, ogni aumento del PSA (per convenzione al di sopra di 0,2 ng/ml) diventa sospetto per una ripresa di malattia. Al contrario, l'approccio terapeutico che lascia la prostata nella sua sede, risente del PSA prodotto dalla ghiandola residua e quindi patologie benigne, come prostatiti o manovre cruente sulla prostata, possono portare ad aumenti del PSA che non possono essere riferiti a ripresa di malattia se non dopo un adeguato periodo di osservazione.Un altro vantaggio è la possibilità di sottoporre il paziente a radioterapia di salvataggio dopo prostatectomia radicale, con scarsi effetti collaterali. Questa è stata usata con successo 68,69 sia come trattamento adiuvante immediato per pazienti ad elevato rischio o con margini positivi, sia dopo ripresa biochimica di malattia. Al contrario, l'approccio chirurgico eseguito dopo fallimento della radioterapia è seguito da importanti complicanze, a causa dell'intensa reazione fibrotica determinata dalla radioterapia stessa.