La vaccinazione contro i vari sierogruppi di meningococco è invece facoltativa, ma fortemente consigliata. Il piano nazionale permette la vaccinazione contro il meningococco B tramite 3 or 4 somministrazioni da effettuarsi nel primo anno di vita. La vaccinazione contro il meningococco C può avvenire nel secondo anno di vita, con somministrazione in singola dose (questa formulazione risulta peraltro la più utilizzata sul territorio nazionale). Il vaccino coniugato tetravalente ACWY135 può invece essere effettuato in età adolescenziale, sempre in singola dose.