La tecnica standard per tipizzare i ceppi di molte specie batteriche è la PFGE (Pulsed-field Gel Electrophoresis) (391), che è stata in questo studio applicata per la tipizzazione molecolare degli isolati.Tra i vantaggi della PGFE vi sono il possibile utilizzo per più specie microbiche, la notevole capacità di discriminazione tra i ceppi, la maggiore facilità di esecuzione se paragonata con metodi precedentemente utilizzati (392); inoltre, i risultati della PGFE sono facilmente correlabili con le informazioni cliniche (393 -397). La tecnica presenta un'ampia riproducibilità ed è stato possibile creare mediante una standardizzazione dei protocolli e dell'interpretazione dei risultati un database esteso specifico per i diversi patogeni esaminati (398).Tra gli svantaggi di questa tecnica vi sono i tempi di realizzazione, che variano a seconda del tipo di protocollo scelto dai 2 ai 4 giorni, la necessità di una specifica attrezzatura per realizzarla ed i relativi costi (398).Ci si è posti come primo obiettivo l'analisi dei ceppi di Staphylococcus aureus e di Stafilococchi coagulasi-negativi meticillino-resistenti (previo screeening delle colonie per il gene mec-A), in quanto patogeni associati ad 6.6 Indagine sperimentale: discussione dei risultati preliminari elevata mortalità a causa della resistenza a numerosi beta-lattamici ed altre molecole. Benchè non ancora applicata a tutti i nostri isolamenti, la metodica ha rilevato una identità genotipica tra i ceppi fenotipicamente uguali, isolati in uno stesso paziente dal sangue periferico e dal dispositivo endovasale, solo nel 63% dei casi: tale dato fornisce una importantissima indicazione di cui è necessario tenere conto nell'interpretazione dei risultati. Infatti, anche riferendosi alle batteriemie CVC -correlate, l'identità fenotipica non è in se stessa garanzia di identità genotipica, a fronte di un 37% di casi in cui il microrganismo isolato dal sangue periferico non è dello stesso ceppo di quello isolato dal catetere venoso centrale. Pertanto, studiando tale fenomeno per effettuare una sorveglianza sugli MRSA / MRSE (S. aureus meticillino -resistenti e S. epidermidis meticillinoresistenti), non si può prescindere dall'analisi genotipica almeno su un campione consistente dei ceppi isolati.In futuro, l'analisi dei caratteri genotipici di tutti i ceppi isolati durante lo studio potrà consentire di stabilire una eventuale relazione genetica fra i ceppi isolati da diversi pazienti, in modo tale da individuare potenziali sorgenti comuni di infezione in ambito ospedaliero nelle diverse situazioni. Identificare una sorgente nosocomiale di infezione sarebbe fondamentale al fine di adottare misure di prevenzione mirate a impedire la comparsa di nuovi casi di infezione acquisita in ospedale.