Il mesangio rappresenta una delle possibili sedi di deposito degli immunocomplessi in alcune glomerulonefriti. In particolare, nella glomerulonefrite a depositi mesangiali di IgA (malattia di Berger), la deposizione nel mesangio di immunocomplessi formati in circolo (o la loro formazione "in situ") provoca inizialmente la lisi delle cellule mesangiali; quindi una aumentata proliferazione delle stesse, indotta da fattori di crescita come il PDGF prodotto in seguito all'infiammazione; infine una sclerosi fibrosa, indotta dal TGF-β prodotto dalle stesse cellule mesangiali.