Le notizie biografiche su Fortunato Fedele sono molto scarse. Non sono conosciute né notizie riguardanti la sua famiglia né quelle relative ai suoi studi e alla sua formazione culturale. Si laureò in medicina all'Università di Palermo dove ebbe come maestro Giovanni Filippo Ingrassia. Esercitò la professione di medico in Sicilia, probabilmente soprattutto a Palermo, e acquistò grande fama. Lo si ricorda soprattutto per la sua opera "De relationibus medicorum libri quatuor. In quibus ea omnia, quae in forensibus, ac publicis causis medici referre solent, plenissime traduntur", pubblicata a Palermo nel 1602, di notevole importanza nella storia della medicina legale.