L'efficacia dei disinfettanti senza alcol dipende fortemente dagli ingredienti e dalla composizione, e storicamente è stata minore di quella dell'alcol e dei disinfettanti a sfregamento a base d'alcol. Più di recente, si è mostrato che composizioni che usano cloruro di benzalconio hanno attività antimicrobica persistente e cumulativa dopo l'applicazione a differenza dell'alcol, che si è mostrato che diminuisce di efficacia dopo un uso ripetuto, probabilmente a causa di progressive reazioni avverse della pelle.