Schmorl è ricordato per il suo lavoro nel campo dell'istologia e negli studi dello scheletro umano. Ha creato una macchia istologica appositamente progettata per mostrare i canalicoli e le lamelle del tessuto osseo. Egli ha anche descritto le sporgenze del disco intervertebrale e nel corpo vertebrale. Queste sporgenze sono ormai note come ernia di Schmorl. Poco prima di morire, Schmorl ha pubblicato "Die Gesunde und Kranke Wirbelsäule". È morto a causa di una sepsi dovuta a un'infezione a un dito.