La sala operatoria in cui si effettua la biopsia deve essere equipaggiata con uno strumento per la somministrazione di ossigeno, aspiratore per mantenere la pervietà delle vie aeree, un AMBU, un kit per la toracentesi e device per il BLS. Il paziente è disposto sul lettino della TC nella postura più stabile e comoda possibile che permetta un facile accesso alla lesione da parte dell'operatore.Il posizionamento è una delle parti più importanti dell'intera procedura ed è necessario pianificarlo ed eseguirlo nella maniera più minuziosa possibile.Le tre posizioni principali sono supina, prona o in decubito laterale.La posizione prona è la più vantaggiosa per l'operatore perchè si hanno meno movimenti della parete toracica, dal momento che le coste non si muovono verticalmente durante la respirazione. Inoltre impedisce al paziente di vedere lo svolgimento della procedura che spesso può provocare situazioni ansiogene e risposte vaso-vagali. [67] Viceversa la posizione supina è sicuramente più confortevole per il paziente, che può più facilmente rimanere immobile senza accusare disagio. I tempi di operazione possono essere quindi vantaggiosamente più lunghi, mentre i movimenti associati alla respirazione possono essere controllati invitando il paziente a trattenere il respiro durante la penetrazione dell'ago.La posizione in decubito laterale è la meno confortevole, la più soggetta a movimenti respiratori, ma è l'unica che molte volte permette l'accesso a zone parenchimali spesso coperte da altre strutture come la scapola o i grossi vasi. In questa posizione ponendo il braccio del paziente all'esterno e ruotando internamente la spalla, la scapola si muove lateralmente permettendo un più facile accesso alle strutture sottostanti. [25] Si procede quindi alla centratura del gantry sulla lesione, e si posiziona un repere metallico sulla cute che indicherà il punto di accesso dell'ago. Successivamente si procederà alla disinfezione della cute e alla preparazione del campo chirurgico con telini sterili. La cute, il sottocute e la zona intercostale saranno, poi, anestetizzati mediante un'iniezione di lidocaina cloridrato al 2% + sodio bicarbonato in egual quantità.A questo punto si inviterà il paziente a limitare i movimenti e le escursioni respiratorie e lo si pregherà di non tossire.