Il gene "CagA" trascrive per una delle più importanti proteine dell'"H. pylori", la CagA, molto diffusa tra i batteri del genere Helicobacter. I ceppi batterici che possiedono il gene "CagA" sono dotati della capacità di generare ulcere molto gravi e difficili da curare. La proteina "CagA" è trasportata all'interno delle cellule umane, dove la funzione normale del citoscheletro verrà annullata, alterando le regolari attività della cellula. La patogenica "Cag" contiene circa 30 geni, che collaborano per il quarto sistema di secrezione. Dopo la fissazione dell'"H. pylori" alle cellule epiteliali gastriche, la proteina "CagA" è iniettata in esse passando per il quarto sistema di secrezione. La proteina "CagA" è fosforilata sui residui di tirosina da una cellula collegata alla membrana cellulare che favorisce l'ingresso della sostanza. Nei ceppi patogenici dell'"H. pylori" è stata inoltre evidenziata la capacità di attivare l'EGFR (il recettore del fattore di crescita dell'epidermide), una proteina della membrana dotata di attività tirosina chinasica. L'attivazione dell'EGFR dall'"H. pylori" è associata a trasduzioni del segnale ed espressioni geniche all'interno delle cellule epiteliali che contribuiscono alla patogenesi. È stato inoltre provato che il dominio C-terminale della proteina "CagA" (amminoacidi 873–1002) può regolare la trascrizione genica della cellula ospite indipendentemente dalla fosforilazione delle tirosine.