Gino Fornaciari si è laureato nel 1971 in Medicina e Chirurgia all'Università di Pisa. Entra nell'Istituto di anatomia patologica dell'università di Pisa nel 1969 come studente ed allievo di Francesco Squartini, oltre che di Antonio Mario Radmilli e di Raffaello Parenti dell'istituto di antropologia e paleontologia umana, e qui completa la sua carriera accademica sino a Professore ordinario di Storia della Medicina e Paleopatologia, ruolo che ricopre fino al pensionamento avvenuto nell’ottobre 2015, continuando tuttavia a tenere gli insegnamenti di Paleopatologia e di Archeologia funeraria fino al 2021. Attualmente tiene il corso di Archeologia Funeraria nella scuola di Specializzazione in Beni Archeologici, presso il Dipartimento di Civiltà e Forme del Sapere dell'università di Pisa.