Dopo la guerra Pavia non volle riprendere il posto all'ospedale dal quale era stata allontanata, ma preferì dedicarsi con successo a Verona alla libera professione di pediatra, partecipando attivamente alla vita culturale della città, in una dimensione di laicità che non celava l'appartenenza orgogliosa e convinta alla propria identità ebraica. Mafalda Pavia morì il 28 maggio 1985 nella Casa di riposo della Comunità ebraica di Torino. Alcuni giorni dopo, il 6 giugno, il quotidiano «L'Arena» di Verona pubblicava il suo singolare messaggio di commiato alla sua città: «Mafalda Pavia, nel lasciare il giorno 28 maggio 1985 questa vita terrena, saluta quanti la conobbero e le vollero bene».