Czerny apportò dei contributi ad altri campi chirurgici, inclusa una nuova operazione radicale per l'ernia inguinale, una pielolitotomia per la malattia renale, e nel 1879 eseguì la prima isterectomia totale attraverso la vagina. Fu definito il "padre della chirurgia estetica del seno": nel 1895 pubblicò il primo resoconto di una protesi mammaria.