La contaminazione del cibo può avvenire in diversi modi. Uno dei più frequenti è il seguente: le feci finiscono nell'ambiente, contaminando campi sui quali vengono coltivati vegetali (o mandati al pascolo animali) che verranno poi mangiati dall'uomo, oppure contaminando l'acqua che verrà successivamente ingerita. Per "contaminazione" si intende la diffusione degli agenti patogeni (batteri, virus o le larve del parassita).