La fidaxomicina è un nuovo macrociclico che potrebbe essere favorito rispetto alla vancomicina orale nei pazienti con recidive multiple. Il basso tasso di resistenza agli antibiotici e l'effetto minimo sul microbiota fecale e la prevenzione delle ricadute hanno indotto la FDA ad approvare la fidaxomicina per il trattamento della CDI. La fidaxomicina può essere applicata per il trattamento di pazienti ad alto rischio di recidiva di CDI, pazienti infettati dal ceppo non ipervirulento, pazienti con più episodi di recidiva e pazienti che non sono in grado di tollerare la vancomicina orale. Altri antibiotici che possono essere usati contro "C. difficile" includono acido fusidico, teicoplanina, rifaximina, ramoplanina, nitazoxanide e tigeciclina.