I rischi associati alla procedura di raccolta degli ovociti riguardano il sanguinamento e l'infezione. La procedura di raccolta prevede il passaggio di un ago attraverso la parete della vagina nelle ovaie stimolate vascolari. Una piccola quantità di sanguinamento è inevitabile. In rari casi, c'è un'emorragia eccessiva nell'addome che richiede un intervento chirurgico. È importante che le donne sottoposte alla procedura informino il proprio specialista di tutti i farmaci, compresi gli integratori a base di erbe, che stanno utilizzando in modo che lo specialista possa valutare se qualcuno di questi farmaci influirà sulla capacità del sangue di coagulare. In relazione all'infezione, a condizione che la donna non abbia fattori di rischio aggiuntivi per l'infezione (sistema immunitario soppresso, uso di farmaci immunosoppressori o endometriomi ovarici di grandi dimensioni) il rischio di infezione è molto basso.