Il carcinoma a cellule chiare è un istotipo raro (<5%) di carcinoma endometriale 167 .Come il carcinoma sieroso, anche questo tumore è sempre di alto grado e spesso alla diagnosi presenta già uno stadio già avanzato. È così chiamato per il caratteristico alone chiaro perinucleare dovuto alla ricchezza in glicogeno delle cellule tumorali, che presentano anche un abbondante citoplasma. Le cellule si organizzano in diversi patterns di crescita: papillare, ghiandolare, tubolocistico e solido 226 .I grandi nuclei abnormi possono estroflettersi nel lume delle ghiandole dando un aspetto "a chiodo". Lo stroma delle papille in questo istotipo ha un caratteristico aspetto a vetro smerigliato ("hyalinized glassy appearance"). Anche questo istotipo è per definizione sempre G3. Viene trattato alla stregua di un carcinoma sieroso, anche se la sua espressione genetica è più simile a quella del carcinoma a cellule chiare in altri organi (es. carcinoma a cellule chiare del rene) 233 .Il carcinoma a cellule chiare presenta mutazioni a carico di PTEN e TP53 nel 30-40% dei casi, del gene PIK3CA nel ≈20%, e infine ha una bassa frequenza di mutazioni sul KRAS (10-15%). L'instabilità dei microsatelliti è presente nel 10-15%. Bisogna notare che il 26% dei carcinomi a cellule chiare smette di esprimere ARID1A pur non avendo mutazioni a carico del gene ARID1A 167 .Il carcinoma a cellule chiare all'ICC risulta tipicamente negativo per il recettore degli estrogeni e per la proteina p53, invece può essere positivo per la Naspina. Questi marker immunoistochimici risultano essere utili per distinguerlo dal carcinoma sieroso e dal carcinoma endometrioide secernente, istotipi con cui potrebbe essere confuso 226 .