A causa della loro semplicità d'uso e della capacità di fornire valori di saturazione di ossigeno continui e immediati, i pulsossimetri sono di fondamentale importanza nella medicina di emergenza e sono anche molto utili per i pazienti con problemi respiratori o cardiaci, in particolare la BPCO, o per la diagnosi di alcuni disturbi del sonno come apnea e ipopnea. I pulsossimetri portatili a batteria sono utili per i piloti che operano su un aereo non pressurizzato sopra i o negli Stati Uniti dove è richiesto ossigeno supplementare. I pulsossimetri portatili sono utili anche per alpinisti e atleti i cui livelli di ossigeno possono diminuire ad alta quota o con l'esercizio fisico. Alcuni pulsossimetri portatili utilizzano un software che traccia il grafico dell'ossigeno e del polso del paziente, servendo da promemoria per controllare i livelli di ossigeno nel sangue.