"Pichia pastoris" viene frequentemente adoperata come un sistema di espressione per la produzione di proteine. Un buon numero di caratteristiche la rendono particolarmente adatta per questo compito, ad esempio possiede un alto tasso di crescita anche su un terreni semplici ed economici. Inoltre "P. pastoris" riesce a crescere sia in beuta, sia in fermentatore, il che la rende utile sia su piccola che su larga scala.