Un'altra eccellenza dell'ospedale di Legnano fu il centro di cura per l'encefalite letargica e del parkinsonismo postencefalico, che venne fondato nel 1937 sotto il patrocinio della regina Elena e che fu tra i primi ad essere aperti in Italia. Questi centri, che vennero principalmente aperti nella grandi città, fu un fiore all'occhiello del nosocomio legnanese; in questo centro fu tra l'altro perfezionato il farmaco più comune utilizzato all'epoca per curare questa malattia. Tale centro, che venne intitolato nel 1941 alla regina Elena, era situato nel padiglione Vignati e poteva ospitare fino a 40 pazienti.