Quando tornò a Manchester dopo la guerra, le strutture disponibili non erano all'altezza delle sue aspettative. Allora Charnley iniziò a prendere in considerazione l'idea di continuare la propria ricerca altrove. Dunque, nel 1958 informò il comitato dei chirurghi del Manchester Royal Infirmary di voler concludere tre delle quattro sue ricerche, per stabilirsi al centro di chirurgia dell'anca al Wrightington Hospital nel Lancashire. La commissione accettò questa sua proposta dopo aver analizzato il suo brillante profilo professionale..