I portatori sono individui che rilasciano "C. difficile" con le feci ma non hanno diarrea e possono svolgere nel ciclo di trasmissione il ruolo di serbatoi (in inglese: "reservoir") di "C. difficile". Secondo diversi studi, la frequenza dello stadio di portatore negli adulti, nei pazienti ospedalizzati e nei pazienti con lunghe degenze ospedaliere è rispettivamente di circa il 3%, 20-30% e 50%. I pazienti asintomatici infettati da "Clostridium" agirebbero come serbatoi del batterio per mantenere la continua contaminazione da "C. difficile" dell'ambiente ospedaliero. I portatori facilitano la diffusione delle spore nell'ambiente a concentrazioni inferiori rispetto ai pazienti con diarrea o altri sintomi.