Nel 1976, si trasferì a nord per unirsi alla Scuola Medica dell'Università di Dundee, come professore di chirurgia e presidente del Dipartimento di chirurgia e oncologia molecolare. Fu mentre lavorava al Ninewells Hospital in città che assieme al suo team iniziarono a ricercare le basi mediche e tecnologiche per un intervento chirurgico ad accesso minimo. Il team di Cuschieri sfruttò, tra gli altri, strumenti ergonomici e telecamere più piccole che consentono di essere inserite nell'incisione praticata nella pelle; a seguito delle loro ricerche, eseguirono la prima chirurgia mini-invasiva nel Regno Unito a Ninewells nel 1987.