Nel caso della Corea di Sydenham è ormai accettata l'ipotesi eziopatogenetica secondo cui il disturbo è il risultato di una risposta immunitaria anomala che coinvolge i linfociti T e B tramite meccanismi di mimetismo molecolare e quindi produzione di autoanticorpi (Kirvan , Swedo et al, 2006).Questa risposta autoimmune innescata da meccanismi di mimetismo molecolare porterebbe le cellule infiammatorie a sorpassare la barriera emato-encefalica e a cross-reagire con cellule neuronali, in particolare quelle presenti a livello dei gangli della base. Nel caso dei PANDAS è stato proposto un simile ruolo degli autoanticorpi nell'eziopatogenesi, ma vi sono ancora controversie e dibattiti a questo merito.Tra i vari studi effettuati, un lavoro ha confrontato 22 bambini con diagnosi di PANDAS con 22 bambini che avevano contratto l'infezione con SBEGA ma non avevano manifestato i sintomi tipici dei PANDAS, riportando che vi era positività nel tramite immunofluorescenza degli autoanticorpi nel 64% dei casi e nel 9% dei casi rispettivamente (Pavone et al, 2004).Il danno mediato da anticorpi, se presente in pazienti con PANDAS, potrebbe essere causato dall'infiammazione a livello neuronale con il risultato di una compromissione del funzionamento cerebrale (Kirvan, Swedo et al, 2003).Studi sperimentali su animali da laboratorio (Hoffman, Hornig et al, 2004) hanno mostrato che nei topi immunizzati con antigeni dello SBEGA si manifestava un aumento dei depositi di IgG a livello dei nuclei cerebellari, evento correlato con il comportamento motorio e con l'immunoreattività del siero alle proteine del patogeno.Concludendo, vi è un importante quantità di dati che presentano l'eziologia dei PANDAS come correlata a fattori autoimmunitari e tuttavia sono ancora necessari ulteriori studi per confermare la presenza di anticorpi anti-antigeni Disturbo ossessivo-compulsivo e disturbi ticcosi: differenze e sovrapposizione in esordio precoce neuronali nei pazienti con PANDAS e per dimostrare l'efficacia della terapia basata sulla rimozione degli anticorpi dal circolo.Recenti studi hanno documentato il cambiamento dell'immunità cellulo-mediata in pazienti in età pediatrica con Disturbo di Tourette e/o DOC, documentando in particolare un aumento dei livelli di citochine pro infiammatorie e un aumento dell'espressione di geni correlati con il controllo del funzionamento e della proliferazione di linfociti NK e T citotossici (Lit , Gilbert et al, 2007).Nello studio di Singer et al (Singer, Gause et al, 2008)  Come esposto nei precedenti capitoli, nella letteratura sono presenti numerosi studi che approfondiscono l'argomento, sottolineando la possibilità di un legame tra i due disturbi con riferimento alla probabile sottostante patofisiologia comune.Questo studio contribuisce, insieme agli studi compiuti finora ed agli studi che sarà necessario compiere in futuro, alla costruzione di una teoria unitaria che descriva entrambi i disturbi. 