L'anomalia strutturale alla base di questa sindrome è la scanalatura longitudinale del fusto del capello, il quale ha una sezione triangolare e non circolare e proprio a tale sezione triangolare si ritiene che sia dovuta la rigidità dei capelli non pettinabili. Tale particolarità è causata dalla mutazione di uno di tre possibili geni: il "PADI3", il "TGM3" o il "TCHH3". Una simile mutazione porterebbe a una cheratinizzazione prematura della guaina della radice interna, che condurrebbe ai sopraccitati risultati. In particolare, l'ultimo di questi tre geni conterrebbe le informazioni utili alla codifica di una proteina importante per la struttura del fusto del capello, fusto in cui tali proteine Tchh sono legate da finissimi filamenti di cheratina. A predisporre tali proteine al legame e ad effettuare il legame vero e proprio sarebbero invece due enzimi le cui informazioni di codifica sono contenute rispettivamente nei geni PADI3 e TGM.