La sua opera più prolifica è un libro sulla psicopatologia generale intitolata" Allgemeine Psychopathologie zur Einführung in das Studium der Geistesstörungen" e un'altra sulla malattia mentale infantile intitolata "Die psychischen Störungen des Kindesalters". Dal 1984 vi è un premio chiamato "Hermann Emminghaus" che viene assegnato ogni due anni per insignire i lavori scientifici svoltasi nei settori della psichiatria infantile e adolescenziale.