Ogni anno, il virus dell'epatite E (HEV) provoca circa 20 milioni di infezioni da cui scaturiscono circa tre milioni di malattie acute che, nel 2015, hanno a loro volta portato a decessi. La mortalità incide molto sui soggetti che contraggono tale epatite, ad esempio è molto pericolosa nelle donne in gravidanza, in quanto possono sviluppare una forma particolarmente acuta della condizione, dove la percentuale si attesta su un 20% dei casi manifestati, soprattutto durante il secondo e terzo trimestre di gravidanza. L'epatite E rappresenta una delle principali cause di malattia e di morte nei paesi in via di sviluppo. È endemica in Asia centrale, mentre nell'America centrale e nel Medio Oriente vi sono alcuni focolai. È anche diffusa in India; l'età di maggiore incidenza si attesta fra i 15 e i 34 anni. Sempre più frequentemente, l'epatite E viene osservata nelle nazioni sviluppate; ad esempio, nel 2015 sono stati segnalati 848 casi di infezione in Inghilterra e nel Galles.