Era ormai giunto alla fine della vita, ma prima riuscì a vedere i due figli laureati in medicina e pronti a prendersi carico della sua importante eredità. Inoltre, vide Reginald sposarsi e incontrò la fidanzata di Percival. Nel 1896, il 7 ottobre, un mercoledì, si svegliò presto e fece colazione al Normansfield, ma nel tragitto verso il padiglione dell'ospedale ebbe un collasso e morì improvvisamente. Il figlio Reginald tentò di prendersi cura di lui, chiamando un medico, il quale però dichiarò la morte e certificò che si era trattato di un infarto. La morte di Langdon Down fece ombra sul Normansfield, poiché egli era una figura rispettata e apprezzata per la sua bravura, competenza, generosità e cortesia. Durante il funerale, tutti i negozi rimasero chiusi, le persiane furono serrate e le tende abbassate in segno di lutto. Mary partecipò al trasporto della bara di prima mattina, insieme al figlio Percival con la fidanzata. Tuttavia non riuscì a partecipare alla cerimonia pubblica, poiché la sofferenza era talmente grande che volle restare da sola, devastata dall’intensità della sua perdita.