Osborn indicò la causa di morte di Cope come avvelenamento uremico associato ad una grande prostata ma la vera causa di morte è sconosciuta. Molti credevano che Cope fosse morto di sifilide contratta dalle donne con cui aveva fraternizzato durante i suoi viaggi. Nel 1995 Davidson ottenne il permesso di far esaminare lo scheletro da un medico dell'università. Il dottor Morrie Kricun, professore di radiologia, ha concluso che non sono state trovate tracce di sifilide ossea sullo scheletro di Cope. Le notizie pubbliche sulla morte di Cope sono state relativamente modeste. "Naturalist" pubblico quattro fotografie, un necrologio di sei pagine del redattore J. S. Kingsley e un ricordo di due pagine di Frazer. La memoria ufficiale dell'Accademia Nazionale delle Scienze è stata presentata anni dopo e scritta da Osborn. L'"American Journal of Science" dedicò sei paragrafi alla scomparsa di Cope e gli diede erroneamente l'età di 46 anni.