Sempre in esperimenti condotti su animali, il Favipiravir ha dimostrato attività contro i virus influenzali, virus del Nilo occidentale, virus della febbre gialla, virus dell'afta epizootica, nonché altri flavivirus, arenavirus, bunyavirus e alphavirus. Ne è stata anche dimostrata l'attività contro gli enterovirus e il virus della febbre della Rift Valley. Favipiravir ha mostrato una certa efficacia contro il virus Zika negli studi sugli animali, pur essendo stato meno efficace di altri antivirali come MK-608 della Merck & Co. Nel 2013, uno studio in vitro ha mostrato la capacità di favipiravir di indurre in H1N1 delle mutagenesi che ne riducono l'infettività.