Bakhtīshūʿ II fu figlio di Jurjīs bin Bakhtīshūʿ e padre di Jibrāʾīl bin Bakhtīshūʿ. Fu nominato direttore dell'ospedale di Gondishapur quando suo padre fu convocato a Baghdad per curare i disturbi di stomaco del califfo al-Mansūr. Per impedire che Bakhtīshūʿ fosse costretto a trasferirsi a sua volta nella capitale, quando Jurjīs tornò a casa, propose al califfo di mandare al suo posto uno dei suoi migliori allievi. Nonostante ciò, Bakhtīshūʿ II fu convocato a Baghdad per curare i disturbi fisici del califfo al-Hadi, che era gravemente ammalato. Dovette ritornare a Baghdad nel 787, quando il califfo Hārūn al-Rashīd subì attacchi violenti di emicrania. Riuscì a guarirlo con successo e questi, in segno di gratitudine, lo nominò archiatra, ruolo che Bakhtīshūʿ mantenne fino alla morte, avvenuta nell'801.