Cesare Frugoni nacque il 4 maggio del 1881 a Brescia da una famiglia abbiente. La madre, Rosa Camotti, morì quando Frugoni aveva da poco compiuto quattordici anni. Questo evento rese la sua adolescenza piuttosto turbolenta: egli era poco propenso allo studio ed insofferente alla severa disciplina impostagli sia dal padre, l'avvocato Pietro, sia dagli insegnanti del Collegio Longone di Milano, allora militarizzato.