Nei pazienti trattati con carbapenemi possono verificarsi reazioni allergiche gravi e occasionalmente fatali. Le convulsioni sono rare e legate alla dose sia nell'imipenem che nel meropenem. Si possono verificare casi di diarrea correlata al "Clostridium difficile". I soggetti con un'allergia alla penicillina possono sviluppare sensibilità crociata ai carbapenemi.