Come tutti i farmaci, gli antiaritmici possono svolgere la loro azione non solo sull'attività elettrica del cuore ma anche su altri organi ed apparati dando luogo ai cosiddetti effetti collaterali. Alcuni, sono di scarsa importanza e sono considerati normali durante la terapia antiaritmica; altri, possono essere pericolosi e devono essere tenuti sotto controllo. Per questo motivo è necessario sottoporsi periodicamente, in genere ogni 6 mesi, a dei controlli specifici.