L'esame vero e proprio deve sempre essere preceduto dalla quotidiana taratura dell'apparecchio [118].Durante la misurazione, il soggetto è collegato attraverso un boccaglio al dispositivo, che utilizza un altoparlante per emettere le oscillazioni forzate (onde sonore). La pressione e il flusso sono misurati da uno pneumotacografo, posizionato all'interno del dispositivo stesso (Fig. 11). Può essere calcolato il volume, mentre l'Z ad ogni frequenza oscillatoria può essere calcolata tramite analisi di Fourier (analisi spettrale) [177] [178].Per consentire la respirazione spontanea del soggetto, parallelamente all'altoparlante, è posizionato un tubo (con bassa resistenza), creando uno shunt con l'ambiente circostante. Eventualmente, possono essere aggiunti un bias flow, tra l'altoparlante e il pneumotacografo per eliminare lo spazio morto, e un filtro antibatterico, per questioni igieniche, tra il dispositivo e la bocca del paziente [161].  La misurazione viene eseguita con il soggetto seduto, con la testa in posizione neutra o lievemente estesa [179]. Per evitare la presenza di artefatti, le labbra devono aderire al boccaglio e il naso deve essere chiuso con un'apposita pinza [180]. Il soggetto, o l'esaminatore deve tenere ferme, con una lieve pressione, le guance con entrambe le mani e supportare il pavimento della bocca con i pollici, riducendo la perdita di una parte di flusso, a causa del movimento oscillatorio della parete delle vie aeree superiori (Fig. 12) [181] [182]. Inoltre, così come l'impedenza delle vie aeree superiori (Zuaw) cade rapidamente all'aumentare della frequenza delle oscillazioni, lo shunt delle vie aeree superiori è minimo alle basse frequenze e diventa progressivamente più importante all'aumentare della frequenza. Il fenomeno si può osservare sia negli adulti sia nei bambini, ma è nei bambini che raggiunge la sua massima importanza, in quanto Z aumenta con l'età (Fig. 13) [183].Normalmente, la misura è molto rapida, essendo sufficienti pochi respiri, per una durata di circa 2 minuti [118], limitando la comparsa di fenomeni, quali la deglutizione o l'iperventilazione. e richiede una collaborazione minima, al punto che può essere effettuata nei bambini, nei pazienti ventilati e durante il sonno.Generalmente, dovrebbero essere selezionate da 3 a 5 misure accettabili e i valori definitivi dovrebbero derivare dalla media dei valori rilevati in queste misure. Un recente articolo mostra come la durata della misurazione FOT, valutata su pazienti sani, asmatici e BPCO, possa avere un effetto statisticamente significativo, osservando un declino significativo dei parametri FOT all'aumentare della durata della misurazione, ma clinicamente risulta insignificante; per permettere di avere dati sufficienti, ottenere risultati precisi, minimizzando la variabilità, si suggerisce che la durata della prova debba tenere conto di almeno tre respiri, liberi da artefatto, ottenibili in 30 s, in soggetti sani, asmatici o COPD [184].Tra una prova e l'altra il soggetto deve staccarsi dal boccaglio, in modo da definire la variabilità della Zrs nel breve periodo in modo univoco. Un'ulteriore indicazione della variabilità basale può essere ottenuta ripetendo la misurazione dopo 10-20 minuti [161].Figura 12 -Esempio di come devono essere supportate le guance durante la misurazione.