Linfociti T CD4 + : L'HLA-G sembra avere un ruolo importante nello shift della risposta immune T helper da Th1 a Th2 che caratterizza la gravidanza, principalmente mediante la modificazione del pattern di espressione delle citochine da parte delle APC. La presenza di HLA-G, infatti, inibisce la proliferazione dei linfociti T CD4 + , favorisce lo shift verso un fenotipo immunosoppressivo (Th2) 43 e induce la differenziazione delle cellule T CD4+ naive in linfociti T regolatori, che esprimono alti livelli di IL10 e di TGFβ.Linfociti T CD8 + : L'HLA-G sembra interagire con questi linfociti prevalentemente eliminando le cellule T reattive nei confronti degli antigeni paterni. Tale obiettivo viene ottenuto mediante diverse vie: induzione dell'apoptosi (attraverso un'aumentata espressione di Fas Ligando e attivazione di questa via proapoptotica); inibizione dell'attività linfocitaria (tramite l'interazione con il recettore CD8 o con ILT2); down regolazione dell'espressione dell'mRNA e della proteina del recettore CD8.Linfociti B: Ad oggi non vi è evidenza di interazione diretta tra HLA-G e linfociti B.Generalmente la tolleranza da parte della risposta anticorpale nei confronti dell'HLA-G è ottima in quanto la maggior parte delle madri non presenta anticorpi anti HLA-G nel proprio siero; vi è tuttavia un 9-10% di madri in cui si possono riscontrare tali autoanticorpi, che non sembrano comunque avere effetti deleteri sulla gravidanza.