L'immunità attiva accade per via naturale quando l'individuo o l'animale vengono in contatto con un microrganismo patogeno. Il sistema immunitario crea di conseguenza gli anticorpi e altre difese. Al prossimo contatto con l'agente patogeno, il corpo sarà più forte; il caso tipico sono le patologie infettive sviluppate nell'età pediatrica, che vengono manifestate conclamate una sola volta e mai più per il resto della vita.