La preparazione magistrale assicura al cittadino la possibilità di ottenere un medicinale non disponibile tra quelli di origine industriale come, ad esempio, i farmaci orfani, i medicinali in via di registrazione, le formulazioni con principi attivi in dosaggi non presenti in medicinali di origine industriale, i medicinali costituiti da principi attivi in associazioni non disponibili commercialmente e, infine, le formulazioni diverse da quelle presenti sul mercato. La prescrizione medica, o ricetta medica, rappresenta lo strumento legale che permette al farmacista di allestire la preparazione. Pertanto, il medico e il farmacista sono i due artefici della preparazione farmaceutica magistrale e insieme ne garantiscono la qualità, l'efficacia e la sicurezza.