I leucociti devono attraversare la barriera di proteine delle giunzioni cellulacellula, che contengono una grande quantità di molecole di adesione, come caderine, molecole calcio-dipendenti e anche proteine delle "tight junction", come le occludine. Ruolo chiave in tale fase di transmigrazione è stato attribuito al PECAM-1.A differenza delle fasi precedenti, che sono potenzialmente reversibili, la diapedesi è un processo definitivo del reclutamento.