La Biblioteca Biomedica dell'Università degli studi di Firenze conserva il fondo di archivio Pietro Vannoni consistente in quattro faldoni di carte riguardanti soprattutto l'attività di medico, appunti, elenchi di strumenti chirurgici, il catalogo di libri e di opuscoli donati alla Biblioteca dell'Arcispedale, nonché carteggi vari con Giovanni Battista Mazzoni ed altri.