L'MRT dovrebbe essere un allenamento in modalità "Total body", ovvero che impone la stimolazione di tutti i muscoli principali ad ogni sessione. Poiché il costo metabolico di un esercizio è direttamente proporzionale alla quantità di muscoli coinvolti, non solo è indicato allenare più gruppi muscolari in un allenamento, ma anche prediligere gli esercizi base/poliarticolari. Gli esercizi poliarticolari (che coinvolgono più articolazioni), e polimuscolari (che coinvolgono più muscoli) possono essere meglio adatti ad essere introdotti nel programma, in quanto richiedono un maggiore dispendio energetico, creano una maggiore risposta degli ormoni anabolici e lipolitici, producono una maggiore forza e resistenza muscolare generale, se paragonati agli esercizi monoarticolari e monomuscolari. L'allenamento dei gruppi muscolari o dei muscoli grandi induce anche un maggiore EPOC (dipendio energetico in eccesso post-allenamento) rispetto ai muscoli o gruppi muscolari piccoli, e l'esecuzione di esercizi base (poliarticolari), induce un EPOC maggiore degli esercizi complementari (monoarticolari). È interessante notare che l'EPOC è stato riconosciuto come un importante fattore in grado di incidere sul dimagrimento, poiché in questa fase post-esercizio il metabolismo si sposta su un utilizzo preferenziale dei lipidi piuttosto che dei glucidi. In altre parole, coinvolgendo più muscoli si consuma più energia. L'MRT quindi promuove i movimenti composti come squat, rematori, presse, bilancieri. Gli esercizi mono-articolari o di isolamento muscolare vengono in questo caso riservati ai muscoli delle braccia e dei polpacci.