La generale lassità del tessuto connettivo favorisce la formazione di ernie, in particolare di ernie inguinali, le quali sarebbero presenti in circa il 32% dei pazienti Marfan di oltre 26 anni di età che si sottopongono ad intervento di sostituzione dell'aorta ascendente. Anche lo sviluppo di ernia iatale, di ernia ombelicale - ancora più frequente nella sindrome di Ehlers-Danlos di tipo vascolare - e di malattia da reflusso gastroesofageo (solo alcune volte correlata alla presenza di un'ernia iatale) sono più frequenti nella popolazione Marfan che nella popolazione sana.