L'esame condotto dal patologo sul pezzo operatorio fornisce una serie di caratteristiche della neoplasia, che sono di grande importanza nella definizione della prognosi del paziente. Per quanto riguarda il tumore del colon retto i principali fattori prognostici, ovvero che influenzano la probabilità di guarigione, sono rappresentati dall'istotipo, dallo stadio della neoplasia, dai margini chirurgici, dalla presenza di invasione vascolare e perineurale, dal grading del tumore, dal numero di linfonodi coinvolti e dalla presenza di infiltrato linfocitario.Relativamente all'istotipo, sia l'adenocarcinoma mucinoso che quello con cellule ad anello con castone sono associati ad una prognosi più infausta rispetto agli adenocarcinomi NAS. Lo stadio costituisce uno dei fattori più importanti da tenere in considerazione (TAB.1, FIG. 7), in quanto non solo indica se la malattia è localizzata, localmente avanzata o sistemica, ma influenza anche le scelte terapeutiche dopo la chirurgia. Il sistema di stadiazione a cui oggi si fa riferimento è il TNM, dove la lettera T definisce la profondità di invasione della parete intestinale da parte del tumore, N il coinvolgimento linfonodale e M la presenza di metastasi a distanza. I margini di resezione vengono sempre analizzati attentamente dal patologo, per valutare l'eventuale presenza di cellule neoplastiche, condizione che indica la persistenza di malattia oltre l'area della resezione e quindi un aumentato rischio di recidiva tumorale. La presenza di invasione vascolare e/o perineurale sono associate a prognosi infausta, dal momento che indicano una malattia sconfinata oltre la sede del tumore primitivo.Altro parametro valutato è il grading (G) della neoplasia, che esprime il grado di differenziazione del tessuto: si riconoscono, quindi, tumori ben differenziati (G1), moderatamente differenziati (G2) e indifferenziati (G3) e tanto più il tumore è indifferenziato, tanto peggiore è la prognosi. Il grading viene valutato sulla base dell'aspetto più o meno ghiandolare della neoplasia, ad esempio un adenocarcinoma con cellule disposte in modo irregolare e disorganizzato ma che mantiene una configurazione ghiandolare corrisponde ad un grading medio, mentre, se l'aspetto ghiandolare è del tutto irriconoscibile, si tratta di una neoplasia indifferenziata. In sede di esame istologico viene valutata la presenza e il numero di linfonodi positivi per cellule tumorali, anche in questo caso fattore che va ad incidere sulle decisioni terapeutiche post-chirurgia. E' necessario che sul pezzo anatomico venga effettuata la ricerca macroscopica di almeno 12 linfonodi affinchè la stadiazione sia più precisa e, in caso di neoplasia del retto, venga analizzato attentamente il margine radiale (mesoretto). In ultimo la presenza di infiltrato linfocitario rappresenta un fattore prognostico positivo, in quanto indica la reattività del sistema immunitario nei confronti della malattia (Le basi patologiche delle malattie di Robbins e Cotran cap.17). 