Per scoprire l'intolleranza al lattosio, invece, esiste un esame validato scientificamente e considerato ad oggi l’esame di riferimento (gold standard) conosciuto con il nome di breath test (test del respiro). Il test consente di accertare l'intolleranza al lattosio attraverso la presenza di idrogeno (H2) nell'aria emessa dalla bocca (espirata). L'esecuzione è semplice e prevede l'assunzione di una dose prestabilita di lattosio seguita dall'analisi, dopo un certo periodo di tempo, dell'aria espirata. La presenza del picco di idrogeno nell'aria espirata è indice della fermentazione del lattosio non assorbito ad opera della flora batterica intestinale, i cosiddetti batteri buoni presenti normalmente nell'intestino.