Il trattamento si effettua con apparati a microonde o radiofrequenza che generano onde elettromagnetiche a potenze e frequenze adeguate al raggiungimento dell'ipertermia nel volume bersaglio. I tumori profondi ovvero posti in organi o parti anatomiche come la Pelvi (carcinoma dell'Utero o del Retto) necessitano di apparecchiature per Ipertermia Profonda che lavorano con array di antenne a frequenze tra i 70 MHz ed i 144 MHz o con sistema capacitivo alla frequenza di 13,56 MHz garantendo una penetrazione efficace nel corpo umano, un riscaldamento controllato e concentrato nella regione d'interesse e preservando il sovrariscaldamento dei tessuti posti in superficie. I tumori superficiali come i melanomi, le recidive dei tumori del seno o i tumori del Testa/Collo sono invece trattati con apparati a microonde con frequenze tra i 434Mhz ed i 915Mhz che producono un riscaldamento eccellente delle lesioni poste in superficie raddoppiando l'effetto terapeutico della radioterapia.