Ruge era il nipote del patologo Rudolf Virchow (1821-1902). Per un certo numero di anni ha servito come direttore del laboratorio per la ricerca microscopica e clinica nel "Frauenklinik" presso il Charité-Berlino. A Berlino ha lavorato a stretto contatto con il ginecologo Ernst Ludwig Karl Schroeder (1838-1887). Dal 1882 al 1912 è stato direttore dell'istituto patologico per ginecologia all'università "Frauenklinik". Nel 1896 è stato nominato professore.