A differenza dei difetti del setto interatriale, nel forame ovale pervio si distinguono due componenti: il septum primum, sottile e mobile, e il septum secundum che ha uno spessore maggiore (dai 2.9 mm ai 10.7 mm) ed è più stabile. Quando queste due strutture dopo la nascita non si saldano il forame ovale resta pervio creando il passaggio sopra descritto (Figura 10). La lunghezza del tratto di sovrapposizione tra le due componenti determina l'estensione del forame ovale. La distanza tra septum primum e septum secundum ne determina invece la larghezza. [14] 