Dal 17 giugno 1997 Gustavianum divenne un museo universitario. Il museo ospita, tra l'altro, la collezione egizia, una collezione di reperti greco-romani, il gabinetto asburgico, una collezione di reperti dalla nave funeraria di Valsgärde, i privilegi dell'Università, una collezione di dispense dalle lezioni del primo anno accademico (1477), e un'ampia collezione di strumenti scientifici.