Clemens von Pirquet attribuì al meccanismo dell'allergia anche la comparsa precoce del nodulo nel fenomeno di Koch in una cavia che fosse già stata infettata col bacillo di Koch 4-6 settimana prima, attribuendola ad «allergia batterica» (con linguaggio moderno: ipersensibilità ai componenti del "Mycobacterium tuberculosis"). Nel 1907 sviluppò la prima prova diagnostica della tubercolosi (la cosiddetta «cutireazione di von Pirquet») consistente nell'applicazione di una goccia di tubercolina vecchia su di una scarificazione praticata sulla cute. Nel 1911 pubblicò i risultati di una serie di test con la tuberculina da cui si inferiva che il 70 percento dei bambini viennesi di dieci anni erano stati già esposti al micobatterio della tubercolosi; la percentuale saliva a 90 negli adolescenti di 14 anni di età.