Durante un giro sulle montagne russe insieme ai figli, Roberto Lotti perde i sensi. Una volta ricoverato, e dopo aver rischiato il soffocamento, Roberto chiede alla compagna Manuela di sposarlo lì in ospedale. I parametri di Roberto peggiorano e da un suo discorso Andrea intuisce che è abituato ad assumere troppo sale: questo, come scopre dopo aver fatto analizzare un lenzuolo, è dovuto al suo sudore molto salato e per questo sente l'esigenza di integrarlo con un'alimentazione ricca di sali, che tra le altre cose gli ha causato la fibrosi cistica, la quale nella maggior parte dei casi comporta l'infertilità; Roberto non può essere guarito ma con la terapia giusta può guadagnare anni di vita. Andrea, Giulia e Agnese spiegano a Manuela il quadro clinico del compagno: quando le viene fatto presente il dato sull'infertilità, Manuela è costretta ad ammettere che, in un periodo in cui lei e Roberto erano in continuo litigio, lo aveva tradito con un altro uomo e che da quell'unico rapporto erano nati i due gemelli, che in realtà non credeva fossero nati da lui. Agnese la rassicura sul fatto che non è obbligata a dire la verità al compagno, ma Manuela decide di farlo comunque e, sebbene inizialmente Roberto voglia annullare il matrimonio, grazie a un discorso di Andrea si convince a sposarla lo stesso. Intanto, Lorenzo e gli specializzandi si occupano della giovane novizia Cecilia, che soffre di dolori addominali da cinque anni, esattamente da quando è entrata in convento: come scopriranno, i dolori sono causati da un embrione calcificato dovuto a una gravidanza extrauterina, cosa che aveva impedito a Cecilia di accorgersene. La sera prima dell'operazione Cecilia confessa alla compagna di stanza Silvia (malata di un cancro che rischia al 50% di paralizzarla dalla vita in giù) che se avesse saputo di aspettare un figlio non si sarebbe fatta suora e sarebbe rimasta insieme al suo fidanzato; gli interventi di entrambe hanno successo. Gabriel e Alba passano una serata alla Scala come ringraziamento da parte di lui per averlo coperto con Marco, mentre Lorenzo e Giulia finiscono a letto insieme sebbene poi lui le dica di non voler complicare il loro rapporto. Agnese fa capire ad Andrea che, nonostante una parte di lei ancora lo ami, adesso al suo fianco ha il compagno Davide, con il quale intende firmare per l'affidamento di un bambino.