L'USAMRIID adotta elevati standard di sicurezza e rigorosi controlli volti a evitare contaminazioni di qualunque genere. È disponibile un archivio (pubblicato sul sito dell'USAMRIID) di tutti gli incidenti o gli errori di laboratorio e dal 2010 non sono stati riscontrati sintomi o segni di alcuna malattia uscita dai laborati né tantomeno dal centro di ricerca.Il 5 agosto 2019 il New York Times riporta la notizia di un incidente che ha portato alla chiusura per alcuni mesi delle ricerche sui virus pericolosi, come per esempio Ebola.