Tra gli aspetti molecolari, che si prendono in esame per determinare la possibile evoluzione maligna di una PML, vi sono:• Markers genetici ( Ploidia, aberrazioni cromosomiche, alterata espressione di oncogeni e oncosoppressori )• Markers di proliferazione• Markers di differenziazione ( cheratine, carboidrati disuperficie cellulare, ecc. ) 16 Un marker genetico preso in considerazione è la perdita di eterozigosità ( LOH ), cioè la perdita di materiale genomico in uno dei due cromosomi omologhi; se la LOH si ha in una regione cromosomica contenente geni oncosoppressori, questo può contribuire allo sviluppo della neoplasia, sebbene è noto come il processo di carcinogenesi richieda multiple alterazioni genetiche. 52 Tra le mutazioni di geni oncosoppressori, quella del gene della p53 rappresenta la più comune nelle neoplasie umane; 53 la funzione fisiologica di p53 è quella di prevenire l'accumulo di danni genetici cellulari o riparando il danno prima della divisione cellulare, o inducendo l'apoptosi. 16 Le mutazioni del gene che codifica per la p53 non sono, però, sempre presenti in tutti i processi di carcinogenesi. 54 Nella ricerca di altri strumenti prognostici alternativi da applicarsi alle lesioni precancerose orali, negli ultimi anni ha suscitato un discreto interesse l'analisi citometrica della ploidia cellulare. 16,37,38,49 Il contenuto di DNA di una cellula ci fornisce informazioni sull'instabilità genetica; 16  2. citometria statica: l'elemento cellulare viene analizzato su un vetrino al microscopio ottico, dal patologo. Ha il vantaggio di poter visualizzare la geometria della cellula, ma è comunque meno precisa, in quanto l'analisi è ristretta ad un numero di cellule molto inferiore, presenti sul vetrino e perchè è operatoredipendente. 61 Nonostante l' aneuploidia, nelle lesioni neoplastiche, sia un marcatore di aggressività, non è un parametro di malignità indipendente; esistono infatti tumori maligni diploidi e lesioni benigne aneuploidi.In passato l'analisi della ploidia si applicava alle lesioni neoplastiche, con il significato di fattore prognostico: diversi studi si sono occupati della correlazione tra ploidia e sopravvivenza, tra ploidia e presenza di metastasi linfonodali, 62,63 tra ploidia e caratteristiche istologiche di malignità del carcinoma orale. 64 Nuova è, invece, l'applicazione di questa metodica per le lesioni precancerose orali, quale strumento per valutare il rischio di evoluzione neoplastica. 16,37,38,49 In questi anni, nella ricerca di un parametro prognostico aggiuntivo, l'analisi del DNA tramite citometria a flusso, è stata introdotta nella pratica clinica prima che fosse completato il processo di standardizzazione metodologica; sono stati pubblicati molti lavori a riguardo, dai quali è difficile trarre conclusioni definitive sul valore prognostico del dato citometrico. 