La gliadina, il peptide derivato dal glutine, è stata riconosciuta come responsabile del danno estensivo della mucosa intestinale nella Malattia Celiaca; ci sono state alcune evidenze scientifiche che attestavano che i sintomi autistici di molti individui erano esacerbati da una dieta che includeva glutine, forse proprio perché la gliadina produceva un incremento della permeabilità intestinale ("leaky gut hypothesis").I bambini con allergia al latte vaccino presentavano anch'essi un'infiammazione della lamina propria intestinale ed una parziale atrofia dei villi intestinali dopo l'ingestione del latte; tali caratteristiche regredivano quando il latte era escluso dalla dieta 61 .Lo studio di D'Eufemia descritto prima supportava la tesi secondo cui il l'Interferon-γ portava ad un aumento dei livelli citosolici di ossido nitrico nei tessuti bersaglio 63 .Il modo in cui gli antigeni del cibo possono alterare le funzioni intestinali e produrre le patologie intestinali negli individui allergici è stata recentemente discusso. È stato, ad ogni modo, provato, anche in campioni animali, che la gluteo e la caseomorfina, una volta superata la barriera intestinale e raggiunto il Sistema Nervoso Centrale, interferiscono con le sue normali funzioni e causano la sintomatologia comportamentale autistica.In uno studio di Gillberg su 20 pazienti autistici 64 , si è addirittura rilevato, in 6 di essi, un aumento degli oppioidi endogeni (β-endorfina ed encefalina) a livello del liquido cefalorachidiano; tali pazienti presentavano anche un innalzamento della soglia del dolore (caratteristica ricorrente nei pazienti autistici). Altri studi hanno riportato, infine, che la gluteo e la caseomorfina sono in grado di condurre ad alterazioni del tracciato elettroencefalografico di tipo epilettico, soprattutto a livello della corteccia temporale, ed è proprio l'epilessia una delle caratteristiche comuni dei DPS.