Dopo aver raccolto nello step precedente qualche informazione generale sulla proteina e sulla sua struttura, è giunto il momento di concentrare l'attenzione sul sito attivo dell'enzima.Il primo passo è quello di andare ad individuare quali sono gli amminoacidi che lo costituiscono e cioè selezionare quelli che interagiscono con il ligando.Partendo dal sito RCSB PDB e cliccando sul link all'Electron Density Server presente nella tabella "Experimental Details", si apre una pagina dalla quale è possibile accedere, attraverso la funzione "Significant Regions", all'applicazione AstexViewer.AstexViewer è un applet di Java per la visualizzazione tridimensionale di strutture molecolari, progettato in particolar modo per mostrare i complessi proteina-ligando.Una volta caricata la proteina, utilizzando la funzione "Chemistry" presente nell'interfaccia, ottengo un'interessante rappresentazione bidimensionale dei ligandi in cui sono evidenziati, oltre ai due atomi di magnesio, gli amminoacidi coinvolti nell'interazione di legame. Osservando con attenzione l'immagine, riportata in figura 38, e muovendosi con il puntatore, è possibile risalire ai singoli atomi coinvolti nelle varie interazioni.Anche in questo caso, volendo per sicurezza controllare la catena B, il sito attivo risulta essere costituito dagli stessi residui.