Nel 1799, fu proclamata la Repubblica Napoletana; durante questo periodo, si hanno poche notizie sull'attività scientifica di Pitaro. Alcune fonti riportano che la sua consulenza fu richiesta per esaminare una palla incendiaria inglese ritrovata da truppe francesi; in questa stessa occasione, viene elogiato per le sue competenze e per l'acume delle sue analisi sulla composizione dell'ordigno; viene inoltre acclamato per essere stato in grado di ottenere, tramite esperimenti, un modello con capacità incendiarie e distruttive superiori. L'importanza di questo episodio è testimoniata dal fatto che l'ammiraglio Francesco Caracciolo si servì dell'ordigno ricostruito e migliorato da Pitaro nei combattimenti contro gli inglesi.