Tuttavia nel XV secolo, la Francia proibì ufficialmente ai barbieri di praticare la chirurgia. In Germania e in Francia, in un periodo che va dal 1530 al 1575, vennero realizzate le prime pubblicazioni interamente dedicate all'odontoiatria. Ambroise Paré, spesso ricordato come il padre della chirurgia, fu tra i primi a pubblicare trattati sul corretto trattamento chirurgico delle patologie dei denti. Paré era un barbiere-chirurgo francese, e fu chirurgo regale al cospetto di diversi monarchi dell'epoca. Nel XIV secolo, Guy de Chauliac inventò il "pellicano dentale", simile al becco di un pellicano, usato per eseguire estrazioni dentali. Il pellicano fu poi sostituito dalla chiave dentale che, a sua volta, venne sostituita dalle moderne pinze nel XX secolo. Il primo libro in assoluto dedicato esclusivamente all'odontoiatria fu l'"Artzney Buchlein" nel 1530, mentre il primo testo scritto in inglese fu chiamato "Operator for the Teeth", ad opera di Charles Allen nel 1685. L'odontoiatria moderna cominciò a svilupparsi solo tra il 1650 e il 1800. La paternità di essa viene infatti attribuita al chirurgo francese Pierre Fauchard. Nonostante i limiti dello strumentario chirurgico tra la fine del XVII e l'inizio del XVIII secolo, Fauchard riuscì, con molta abilità e inventiva, a realizzare particolari strumenti odontoiatrici, modificando spesso strumenti da orologiai, gioiellieri e persino barbieri, utilizzandoli con successo nelle sue terapie. Introdusse inoltre le otturazioni come trattamento conservativo per le carie dentali, ed affermò che gli acidi derivati dal glucosio, come l'acido tartarico, erano responsabili delle lesioni cariose. Fauchard fu anche il pioniere della protesi dentaria e ideò diversi metodi per rimpiazzare i denti mancanti. Suggerì che gli elementi sostitutivi potevano essere realizzati a partire da blocchi intagliati di avorio o di osso. Introdusse anche gli apparecchi ortodontici, inizialmente realizzati in oro, scoprì che la posizione dei denti poteva essere corretta facendo assumere alle arcate dentarie la forma del filo metallico. Di solito venivano utilizzati lacci cerati in seta per fissare gli attacchi. Il suo contributo al mondo delle scienze odontostomatologiche consiste principalmente nella pubblicazione, nel 1728, del suo "Le Chirurgien Dentiste". Il testo, in francese, comprendeva argomenti quali l'anatomia e le funzioni orali di base, la realizzazione di protesi e varie tecniche operative e restaurative, conferendo all'odontoiatria una precisa identità all'interno della chirurgia. Dopo Fauchard, lo studio dell'odontoiatria crebbe rapidamente. Due libri importanti, "Natural History of Human Teeth" (1771) e "Practical Treatise on the Diseases of the Teeth" (1778), furono pubblicati dal chirurgo britannico John Hunter. Egli ipotizzò per primo la possibilità di trapiantare denti da una persona ad un'altra. Si rese conto che le probabilità di un trapianto dentale sarebbero aumentate se il dente del donatore fosse stato il più fresco possibile e le sue dimensioni idonee al sito ricevente. Sebbene i denti non si legassero mai correttamente con il parodonto dei riceventi, uno dei pazienti di Hunter dichiarò che tre dei denti trapiantati avevano avuto una durata di sei anni. Claude Mouton descrisse nel 1746 la realizzazione di una corona con perno in oro da agganciare alla radice di un dente. Egli inoltre raccomandò di ricoprire l'oro con uno smalto per una migliore resa estetica. Nel 1764 James Rae tenne le prime lezioni sui denti al "Royal College of Surgeon" di Edimburgo. William Addis, nel 1780, realizzò il primo spazzolino da denti moderno. Nel 1790 John Greenwood, dentista di George Washington, creò il primo motore dentale a pedali, per alimentare la rotazione di un trapano. Nello stesso anno, Josiah Flagg, un dentista americano, costruì la prima poltrona specifica per i pazienti odontoiatrici.