Agli inizi del 1529 Berengario si trasferì a Ferrara prestando servizio alla corte del duca Alfonso I d'Este in qualità di chirurgo. Gli avvenimenti che portarono il medico a una tale decisione non sono noti, ma è ipotizzabile che sia stata proprio la perdita di Carpi da parte di Alberto III Pio a giocare un ruolo rilevante.