La maggior parte dei restanti tipi cutanei degli HPV (genotipi 5, 8, 9, 12, 14, 15,17, 19, 20, 47, 49) è stata ritrovata nelle lesioni dell' epidermodisplasia verruciforme (EV), un'affezione caratterizzata dalla diffusione delle lesioni da Papillomavirus disseminate in gran parte della superficie corporea, con una non infrequente degenerazione in carcinoma a cellule squamose. Tra questi tipi cutanei, i genotipi 5 e 8 ad alto rischio e meno frequentemente il 14, 17, 20 e 47, sono stati isolati nei carcinomi di individui affetti dalla epidermodisplasia verruciforme.Le lesioni mucose benigne da HPV comprendono prevalentemente condilomi acuminati e piani, che sono conseguenti a trasmissione sessuale del virus e insorgono a livello del pene, dei genitali femminili, dell'uretra, dell'area perianale e del retto; si manifestano come masse esofitiche verrucose di consistenza molle (condilomi piani) o modestamente rilevate (condilomi acuminati), di colorito rossastro, da cui si isolano più frequentemente i genotipi 6 e 11. Altre sedi mucose infettate da Papillomavirus con lesioni benigne sono quelle a livello respiratorio, congiuntivale e orale. [La Placa et al., 2003] Le lesioni HPV-correlate evidenziabili a livello del tratto genitale inferiore femminile comprendono le forme cliniche, quelle sub-cliniche e le infezioni latenti.Le infezioni latenti si riferiscono alla presenza nel tessuto di DNA di Papillomavirus senza alcun segno evidenziabile di lesione epiteliale. Tali infezioni sono oggi dimostrabili in maniera estremamente sensibile grazie all'utilizzo di metodiche di ibridizzazione molecolare.Le lesioni cliniche sono quelle evidenziabili e diagnosticabili ad occhio nudo: si identificano sostanzialmente con i condilomi acuminati nelle loro varie tipologie e varianti morfologiche.Le lesioni subcliniche sono quelle infezioni non diagnosticabili ad occhio nudo ma ben evidenziabili impiegando il colposcopio. I sottotipi responsabili di queste lesioni sono molteplici, comprendendo sia gli HPV a basso rischio, come che quelli a rischio oncogeno alto o intermedio, come  A livello genitale le lesioni squamose intraepiteliali (SIL) sono classificate in rapporto alle alterazioni a livello istologico e possono essere di basso grado (LGSIL) o di alto grado (HGSIL) come riportato in figura 5; è possibile poi distinguere tre gradi di neoplasie intraepiteliali cervicali (CIN): CIN-1 (lieve), CIN-2 (moderata) e CIN-3 (severa).