Per accertare (diagnosticare) la gluten sensitivity non esistono esami specifici; ci si basa sui disturbi presenti e sul loro miglioramento dopo una dieta di privazione, oltre che sulla mancanza degli anticorpi specifici per la celiachia e sull'assenza di lesioni intestinali alla biopsia. La certezza della presenza di intolleranza al glutine, quindi, si basa per lo più sull'esclusione di altre malattie.