L'endometriosi è rilevabile in ecografia come impianti solidi o cisti complesse localizzate in zone ove non dovrebbe essere presente endometrio. La RM eseguita mediante sequenze che permettono di evidenziare le aree emorragiche è ancora più accurata nello studio di questa patologia, mostrando le lesioni come iperintense sia nelle sequenze T1 pesate sia in quelle T2 pesate (queste ultime specie se eseguite mediante tecniche di soppressione del grasso).