Alla presentazione della domanda segue la fase istruttoria, dove l'AIFA verifica la conformità della domanda e della documentazione presentata, sottopone inoltre il medicinale e le materie prime al controllo dell'Istituto Superiore di Sanità. Redige poi un rapporto di valutazione della domanda, che può essere aggiornato ogniqualvolta ~ 78 ~ si rendano disponibili nuove informazioni rilevanti ai fini della valutazione di qualità, efficacia e sicurezza del medicinale. Il rapporto viene pubblicato sul sito internet dell'AIFA, la quale effettua tutte le valutazioni entro 210 giorni dalla presentazione della domanda.Una volta rilasciata, l'AIC, è valida per 5 anni, dopo il rinnovo avrà una durata illimitata. Qualsiasi AIC decade automaticamente se non è seguita dalla commercializzazione del medicinale o se questo non è commercializzato per 3 anni consecutivi.