A parte le controindicazioni comuni ad ogni esame RM (portatori di Inoltre, i più comuni errori che possono compromettere l'accuratezza della misura di flusso con questa tecnica sono: un errato valore di VENC, con risultante eccesso di "rumore" (riduzione del rapporto segnale/rumore, con compromissione soprattutto della misura della velocità massima di flusso) se la VENC è troppo alta, o con "aliasing"  