Il dominio DNA binding è composto da due strutture a dito di zinco. In presenza di DNA danneggiato (escissione di paia di basi),questo dominio si legherà al DNA inducendo un cambiamento conformazionale,ed è stato dimostrato che questo legame è indipendente dagli altri domini. Il dominio di auto modificazione è responsabile del rilascio della proteina dal DNA dopo la catalisi.