"Second Opinion" è il secondo gioco della serie "Trauma Center" e il primo realizzato per Wii. Dopo l'uscita del primo titolo nel 2005, il produttore originale Katsura Hashino incaricò alcuni membri del team di "Under the Knife" di formare un nuovo team di sviluppo che avrebbe proseguito la serie. Questo gruppo era conosciuto come "CaduceTeam" ed era composto da quelli che il "director" Daisuke Kanada avrebbe descritto come i giocatori più entusiasti di Atlus. Kanada era stato in precedenza "designer" per diversi titoli della serie "Megami Tensei", aveva lavorato con Hashino sin da "Maken X" (1999). La pianificazione del gioco iniziò nel gennaio 2006.