Prima di eseguire questa biopsia il medico deve fare una prognosi della lesione (e possibilmente, una stadiazione di questa in caso di sospetta neoplasia). Deve inoltre prevedere l'andamento della crescita di eventuali cellule tumorali, soprattutto nel caso di sospetto melanoma o carcinoma a cellule squamose. Per queste patologie potrebbe essere preferita una punch-biopsy una biopsia incisionale al fine di evitare falsi negativi. (esempio: diagnosticare una cheratosi attinica o detriti cheratinici al posto di un carcinoma a cellule squamose).