Tuttavia, il progetto di Wakley era destinato a fallire, poiché privo delle necessarie fondamenta giuridiche. Per cominciare, l'associazione per la fondazione del College era inutile, in quanto necessitava della Royal Charter, un'autorizzazione da parte dello Stato che, invece, era stata precedentemente assegnata al Royal College of Surgeons insieme ad un'ingente somma di denaro. Inoltre, se lo Stato non avesse acconsentito a riconoscere i diplomi elargiti dal nuovo College, non ci sarebbero state garanzie per i futuri studenti che quindi non avrebbero avuto alcun motivo di iscriversi al London College of Medicine. A causa di queste limitazioni, Wakley non fu mai in grado di dare vita alla sua idea, nonostante i suoi numerosi sforzi da giornalista. Egli rimase comunque dell'idea che l'istruzione medica avesse bisogno di un miglioramento, e quindi di essere riformata, in favore degli studenti stessi.