Gli effetti indesiderati (effetti collaterali) di una dieta chetogenica possono includere: disidratazione, costipazione, rallentamento della crescita a causa di carenze nutrizionali e accumulo di acido urico nel sangue, che può causare calcoli renali. Questi effetti indesiderati non sono comuni se la dieta è corretta e supervisionata da medici con esperienza.