È un sistema rapido di difesa e può salvare la vita in molti casi. Come contro si ha la scarsa specificità di obiettivi, cioè il bersaglio specifico potrebbe non essere identificato in un primo momento, ma semplicemente riconosciuto come probabile agente patogeno. Questa carenza di precisione viene definita in due modi: non-specifica, in contrasto con l'alta specificità delle risposte tardive; o immunità innata, per evidenziare che la maggior parte dei meccanismi dell'immunità naturale è presente già alla nascita e non subisce, in grandi linee, variazioni con l'avanzare dell'età.