Una delle principali motivazioni salutistiche si basa sul fatto che le carni rosse contengono un'elevata quantità di grassi saturi. Introducendo nella dieta il pesce, invece, si incrementa il livello del colesterolo HDL e degli acidi grassi omega-3. Una seconda motivazione salutistica è legata al fatto che mediamente il pesce è più facilmente digeribile rispetto alla carne e questo può orientare coloro che soffrono di problemi di salute legati alla digestione ad adottare una dieta pescetariana. Un'altra scelta di tipo salutistica è dettata più semplicemente dall'idea che si deve pur mangiare "qualche tipo di carne" come necessità pratica per ottenere sostanze nutritive assenti o non facilmente reperibili nelle piante, tra cui la vitamina B12, e il pescato fra tutte le fonti carnee viene identificato come la fonte meno immorale. Alimentandosi con il pesce si rischia però di assumere anche inquinanti tossici molto pericolosi come i metalli pesanti (tra cui il mercurio), le diossine e i policlorobifenili. Poiché gli inquinanti vanno in concentrazione risalendo i gradini della catena alimentare i loro valori più alti si trovano nei predatori in cima alla catena alimentare, mentre quelli più bassi si trovano nei pesci che, alimentandosi di alghe e plancton, ne occupano invece la base. Ecco perché nella dieta pescetariana per motivi di salute si utilizzano solo pesci classificati come "pesce azzurro", come l'acciuga ad esempio, mentre vengono esclusi anche molluschi e crostacei perché ricchi di colesterolo.