Tale pratica non è rilevabile dai controlli antidoping, in quanto non impatta sui parametri di ematocrito ed emoglobina ma la WADA, l'Agenzia mondiale antidoping, l'ha dichiarata illegale e perseguita come tale poiché aumenterebbe il livello di ossigeno nel sangue, infliggendo quindi squalifiche fino a 24 mesi agli atleti che si è scoperto essersi sottoposti a ozonoterapia. Nonostante ciò l'argomento è ancora controverso e alcune sentenze vanno in direzione diversa non ritenendo che l'ozonoterapia abbia effetto dopante.