I microrganismi che possono provocare diarrea acuta sono molteplici; tra essi vanno ricordati: "Staphylococcus aureus", "Escherichia coli", "Vibrio cholerae", "Clostridium difficile", "Campylobacter jejuni", "Salmonella spp.", "Shigella spp.", "Giardia lamblia" (o "intestinalis"), "Entamoeba histolytica", Rotavirus, Adenovirus, alcune specie di elminti. La lista, comunque, è estremamente lunga.