Per uso rettale il flucinolone acetato può essere utilizzato sia sotto forma di crema rettale che di supposte. Tale utilizzo è previsto per la cura di emorroidi, sia interne che esterne, eczemi ed eritemi anali e perianali, ragadi anali, prurito e bruciore anale e perianale nonché nel trattamento pre e post operatorio in interventi chirurgici che hanno riguardato la zona perianale.