Il dimeticone è controindicato nei soggetti con ipersensibilità nota. È inoltre in genere controindicato in gravidanza. In letteratura esistono numerosi studi volti a verificare se l'assunzione di dimeticone sia in grado di determinare un alterato assorbimento di alcuni farmaci, tra questi la digossina, il propranololo, la fenitoina. Sebbene sia opportuno agire con cautela e tenendo presenti possibili interazioni con altri farmaci assunti dal paziente, l'eventuale modificato assorbimento non sembra in grado di determinare una alterazione della biodisponibilità.