La serotonina esercita un'influenza bifasica sul recupero del midollo spinale dopo un trauma: ha infatti un ruolo sia nella lesione midollare acuta, sia nella lesione cronica (Schmidt e Jordan, 2000). Mentre nella lesione acuta la serotonina (rilasciata in grandi quantità dai neuroni del sito di lesione e incamerata dalle piastrine) accelera alcuni meccanismi di danno secondario come la caduta del flusso ematico e l'edema (Liu et al., 1990;Sharma et al., 1990), sembra invece che, tra la seconda e la quarta settimana dopo la lesione, la serotonina faciliti il recupero motorio (Puniak et al., 1991).Hashimoto e Fukuda (1991) hanno proposto che la responsabile del recupero funzionale non è la neurotrasmissione in senso stretto all'interno del circuito rafe-spinale, ma qualche altra funzione tipica del neurone serotoninergico. La serotonina, infatti, aumenta l'eccitabilità dei motoneuroni α, modula le vie riflesse spinali (Saruhashi et al., 1996) e modula i Central Pattern Generators spinali, ovvero i centri preposti alla coordinazione della locomozione (Kim et al., 1999). La serotonina ha anche un potenziale ruolo neurotrofico sui motoneuroni: il circuito rafe-spinale ventrale contiene probabilmente sostanze neurochimiche, necessarie per la ricostituzione dell'integrità dei motoneuroni caudali dopo un danno alle unità motorie (Van den Bergh et al., 1996). L'ultima incognita è quale sia la funzione all'interno della fisiologia del midollo spinale della rigenerazione da noi osservata. Un'opzione è che abbia garantito un migliore recupero motorio rispetto agli animali di controllo contribuendo alla riorganizzazione del Central Pattern Generator (CPG) omolaterale alla lesione. Il CPG, situato nel midollo lombare, è infatti il centro da cui ha origine il comando per la locomozione di tutti i muscoli degli arti posteriori. Esso regola inoltre il ritmo del ciclo locomotorio e garantisce la coordinazione dei muscoli degli arti e tra gli arti. La sua modulazione avviene ad opera di input sopra-spinali discendenti (rafe-spinali) e di afferenze sensitive (Rossignol et al., 1996;Rossignol, 2000); in seguito alla perdita del controllo sopra-spinale sono apparentemente mantenute delle funzioni residue, più o meno complesse a seconda della specie animale (McDonald et al., 1999). Il potenziamento delle funzioni residue è ciò che è probabilmente avvenuto sia nello studio di Saruhashi et al. (1996), sia nel nostro.  et al., 2002).