L'eziologia dell'AIG e il meccanismo di automantenimento dell'infiammazione sinoviale non sono ancora completamente chiariti. L'ipotesi più verosimile è che la malattia si sviluppi come conseguenza di un'attivazione anomala del sistema immunitario, presumibilmente in seguito ad esposizione a stimoli ambientali, in individui geneticamente predisposti, il che determinerebbe l'instaurarsi di un meccanismo infiammatorio acuto e, successivamente, il suo mantenimento e la sua cronicizzazione 12 .Nella patogenesi sono implicati sia un'anomala immunoregolazione, sia la produzione di citochine. L'attivazione dei linfociti T è un momento fondamentale nella patogenesi dell'AIG. L'infiltrato infiammatorio della membrana sinoviale è composto da cellule mononucleate, linfociti, plasmacellule, macrofagi e cellule dendritiche, sparse o organizzate in aggregati perivascolari. Nell'ambito dei linfociti risultano prevalenti nell'infiltrato i linfociti T che esprimono marker di attivazione CD25 (IL-2R), CD45RO, CD69, molecole di classe II dell'MHC e recettori delle chemochine CCR5 e CXCR3 13 . Questi linfociti T attivati esprimono un pattern di produzione citochinica di tipo Th1, cioè un' aumentata produzione di INFγ 14 . Viceversa le citochine Th2 sono state ritrovate solo nel liquido sinoviale di una piccola quota di pazienti suggerendo che si tratti di forme di malattia più benigna, oligoarticolare, non erosiva e autolimitantesi 15 .La presenza in circolo di autoanticorpi non organo specifici, quali Anticorpi Antinucleari (ANA), Fattore Reumatoide (FR), Anticorpi anti-peptide citrullinato ciclico (anti-CCP) e di immunocomplessi circolanti suggerisce il possibile ruolo anche di alterazioni dell'immunità umorale.I linfociti T del tessuto sinoviale infiammato sembrano derivare da un'espansione oligoclonale, ma l'antigene o gli antigeni responsabili della risposta immunitaria patogena non sono stati identificati con certezza. Un studio 16 del 2007 ha mostrato che i bambini con AIG presentano una risposta proliferativa linfocitaria elevata contro la heat shock protein (hsp) dnaJ di Escherichia Coli, che fa parte di una famiglia di hps i cui omologhi umani sono intensamente espressi dalle cellule del tessuto sinoviale. Questo antigene potrebbe rappresentare il bersaglio di una risposta immunitaria crociata indotta dall'incontro con la proteina batterica.L'agente eziologico più spesso chiamato in causa, soprattutto come momento scatenante nella forma sistemica, è il Parvovirus B19 17 . Recentemente è stato documentato l'esordio di artrite sistemica anche dopo infezione da Herpes virus-6 18 . Altri virus (Virus della Rosolia, del Morbillo e della Parotite) e batteri sono stati implicati nell'eziologia.La maggior parte degli ipotetici fattori genetici predisponenti sono legati al locus maggiore di istocompatibilità (MHC) e agli alleli HLA di classe II (HLA-DR); tuttavia il significato di tale associazione con la malattia non è ancora del tutto noto. È stato ipotizzato che alcuni HLA potrebbero presentare con maggiore efficienza gli antigeni patogeni.In conclusione è possibile che vi siano differenti fattori eziologici alla base di differenti quadri clinici, oppure che l'AIG derivi da un singolo fattore eziologico che interagendo con ospiti immunogeneticamente diversi dia luogo a differenti sindromi.Qualunque sia il ruolo della risposta immunitaria nell'iniziare il processo patologico, sinoviociti e macrofagi attivati hanno un ruolo fondamentale nel mantenimento della risposta infiammatoria e nella progressione del danno osteocartilagineo.Nell'AIG il tessuto sinoviale è caratterizzato da un aumento del numero dei sinoviociti, sia di tipo A che di tipo B e da una marcata iperplasia del tessuto connettivo sottostante con formazione del cosiddetto panno sinoviale. All'origine del danno tessutale, in particolare della cartilagine d'incrostazione e dell'osso subcondrale, vi è l'elevata produzione, da parte del tessuto infiammatorio di numerosi mediatori quali chemochine, citochine pro-flogistiche (IL1,IL6 e TNF) e enzimi proteolitici, in particolare metallo proteinasi che sono in grado di distruggere la matrice cartilaginea. Le citochine sono anche responsabili della risposta infiammatoria sistemica.