Ruge era un pioniere della diagnosi microscopica nel campo della ginecologia. Con il suo socio Johann Veit (1852-1917), nel 1870, hanno introdotto la biopsia chirurgica come uno strumento di diagnostica necessaria. Dalle loro biopsie, hanno dimostrato che ci sono stati troppi casi di interventi chirurgici non necessari per il cancro del collo dell'utero, dimostrando che i medici non erano spesso in grado di rilevare il cancro senza l'aiuto di una biopsia.