Dal 1898 al 1901 Simond fu direttore del Pasteur Institute di Saigon, dove organizzò un moderno servizio di vaccinazione. Dal 1901 al 1905 partecipò a una missione per studiare la febbre gialla in Brasile, dove lui e i suoi colleghi confermarono i risultati che la Commissione dell'esercito americano, guidata da Walter Reed, aveva appena ottenuto a Cuba e cioè che il "virus amaril" sia l'agente patogeno presente nel sangue dei pazienti e che questo virus può essere trasmesso all'uomo dalle specie di zanzare, "Stegomyia fasciata" (in seguito ribattezzata "Aedes aegypti"). Tra il 1908 e il 1909 condusse ricerche sulla febbre gialla in Martinica. Dal 1911 al 1913 fu direttore dell'Istituto di ricerca di batteriologia imperiale a Costantinopoli. Dopo la fine della prima guerra mondiale, Simond si trasferì a Valence per studiare la tubercolosi.