Molte malattie del seno derivano dai dotti galattofori o sono strettamente correlate ad essi. Molti tumori al seno derivano dall'epitelio duttale, come il carcinoma duttale in situ, il tumore filloide e papilloma intraduttale della mammella. La mastalgia è spesso causata da uno squilibrio della secrezione mammaria nei lobuli e dal riassorbimento nei dotti. La mastite non ventrale può essere causata da un meccanismo simile in combinazione con un'infezione. Anche l'ectasia del condotto è simile alle precedenti. Altre patologie legate ai dotti galattofori sono gli ascessi subareolari e la metaplasia squamosa dei dotti galattofori. Infine si pensa che la maggior parte delle forme di cambiamenti al seno e di cisti fibrocistiche provengano dai dotti galattofori.