Dopo la pandemia del XIV secolo, i medici d'Europa avevano dovuto confrontarsi in diverse occasioni con la peste. Seppur il progresso medico dei tre secoli intercorsi tra la peste nera e la peste manzoniana non fosse stato poi molto significativo, il morbo, quanto meno da un punto di vista terapeutico, era stato approfondito. A Milano, era ancora attivo al tempo dell'epidemia il medico Ludovico Settala (1550-1633), autore (1622) del "De peste, & pestiferis affectibus. Libri quinque", vero e proprio sunto delle pratiche mediche del tempo in materia di cura degli appestati. La profilassi del morbo era invece ancora oggetto di forte dibattito: i benefici della quarantena era riconosciuti da alcuni fisici ma rigorosamente negati da altri, come il sopracitato luminare Settala. Parimenti, le cause naturali della malattia erano ancora ignote e la sua propagazione legata a fenomeni metafisici: Tadino interpretò astrologicamente il diffondersi della peste come causato dalla Congiunzione Giove-Saturno, presagio del castigo divino giunto a punire i peccati dei contemporanei. In generale, l'Italia, rispetto alle altre nazioni d'Europa, primeggiava nella gestione politica dell'epidemia, avendo istituito in ogni grande città, sin dal Trecento, Tribunali di Sanità cui erano rimessi i pieni poteri in caso d'emergenza (Tadino operava appunto come medico per conto del Tribunale di Sanità di Milano, insieme al luminare Settala).