Prima degli studi degli anni 1960 di Almeida e Anthony Peter Waterson, erano stati apportati pochissimi miglioramenti all'iniziale "prova dell'aggregazione di virus da parte di anticorpi specifici per virus osservabili con il microscopio elettronico (EI)". Nel 1963 la Almeida aprì la strada a una tecnica di microscopia a elettroni immuni (IEM) per visualizzare meglio i virus usando anticorpi per aggregarli. Negli anni 1960, la Almeida e Waterson utilizzavano una colorazione negativa per l'EM dei virus, una tecnica rapida e semplice, che forniva eccellenti osservazioni dettagliate sulla morfologia virale e che aveva rivoluzionato la microscopia elettronica dei virus.