Ha condotto esperimenti medici su esseri umani ad Auschwitz, insieme a Helmut Vetter e Eduard Wirths, dove ha operato nel "Blocco 21" ed è stato pagato dalla filiale farmaceutica Bayer di IG Farben per testare farmaci sperimentali contro il tifo e la tubercolosi. Ha introdotto la pratica di uccidere i prigionieri iniettando dosi letali di fenolo direttamente nel cuore, consentendo fino a 100 persone di essere uccise ogni giorno, ed è stato descritto come un attore chiave nell'organizzazione e nella somministrazione di fenolo. La pratica potrebbe essere stata usata per coprire i risultati di procedure mediche sperimentali, incluso un intervento chirurgico, che lui e altri medici del campo hanno eseguito pur non avendo qualifiche chirurgiche.