Il primo caso di COVID-19 a San Pietroburgo è stato confermato il 6 marzo, cittadino russo rientrato da Yichang, ed è stata la terza città russa a registrare casi di Coronavirus, dopo Čita, Tjumen' e Mosca. Successivamente, a fine marzo, scoppia un focolaio, tra contagi locali (probabilmente importati precedentemente dalla Cina) e contagi importati da Mosca. Il 20 aprile i contagiati totali a San Pietroburgo (insieme alla sua oblast) oltrepassano i mille casi, nel giro di un mese la cifra aumenta drasticamente. Attualmente è il terzo soggetto federale piú colpito dalla pandemia dopo Mosca e omonima oblast.