Hanno il compito di far convergere gli elettroni sul preparato e sono anche dette "condensatori". Nei moderni SEM troviamo un sistema di focalizzazione costituito da due o tre lenti elettromagnetiche poste in serie; quella inferiore, immediatamente vicina al campione, viene convenzionalmente denominata "obiettivo".Le lenti elettromagnetiche sono costituite da un nucleo cilindrico di ferro dolce contenente un avvolgimento di spire di rame: quando una corrente viene fatta passare attraverso l'avvolgimento, si forma un campo magnetico con direzione parallela all'asse della lente.