Il Ministero della Salute e la Regione Lombardia si costituirono parte civile. Su 247 imputati, il processo di primo grado iniziato nel 2000 si concluse con 178 condanne con pene dai 3 anni ai due mesi di reclusione. Durante il processo di primo grado, un testimone morì nell'aula di tribunale, affollata all'inverosimile.