I pazienti con la malattia di Menkes mostrano anomalie neurologiche, in apparenza dovute alla mancanza di enzimi dipendenti dal rame richiesti per lo sviluppo del cervello, come la ridotta attività della citocromo-c-ossidasi. L'aspetto dei capelli (depigmentati, ruvidi e fragili) è dovuto alla carenza di un cuproenzima non identificato. La ridotta attività della lisil-ossidasi crea una polimerizzazione difettosa del collagene e dell'elastina, con le corrispondenti anomalie dei tessuti connettivi, tra cui l'aneurisma all'aorta, cute lassa e fragilità ossea.