Nel febbraio del 1664, durante la stesura del Trattato di Pisa a seguito dei dissapori creatisi tra lo stato pontificio e la Francia di Luigi XIV, il Santo Padre, che già da un paio di anni accusava forti dolori dovuti al “male della pietra”, cioè da calcolosi renale e biliare (malattia all'epoca difficilmente curabile), peggiorò le proprie condizioni e si ammalò gravemente. Parisio, affiancato da altri medici, alcuni cardinali e diversi nipoti, assistette Alessandro VII sul letto di morte dove, ancora lucido, soleva lamentarsi con il Duca di Chaulnes del cattivo trattamento riservato al nunzio apostolico a Parigi. Tenuto poi ai 37 cardinali raccolti attorno al suo letto il discorso di congedo, il pontefice si spense il 29 maggio del 1667.