Castiglioni divenne Presidente onorario del Gruppo italiano di "Storia delle Scienze Mediche e Naturali". Il 1º dicembre 1952 tenne al "Teatro Manzoni di Milano" la conferenza "Medicina antica e medicina moderna" che nei giorni precedenti aveva tenuto a Genova e Torino e che avrebbe dovuto ripetere a Roma il giorno successivo se non che, giunto nella capitale, ebbe la notizia della morte improvvisa della sua consorte e decise di rinviare la data. Pochi più di un mese dopo morì anch'egli, nella notte tra il 20 e il 21 gennaio 1953.