Primo, le coppie più fertili rimangono incinte per prime. Le coppie perciò che restano più a lungo nello studio, mediamente, hanno una fertilità più bassa. Il calcolo dell'Indice di Pearl non tiene conto di questo fattore, anzi considera le coppie che restano più a lungo nello studio (e quindi in cui la donna non resta incinta), come coppie che usano un metodo contraccettivo migliore. Tale problema rende poco accurato e l'Indice di Pearl, e la comparazione di Indici di Pearl ricavati da studi di diversa lunghezza.