Prodotte durante la fase effettrice sia dell'immunità naturale che di quella specifica da una varietà di tipi cellulari, la loro secrezione è un fenomeno di breve durata ed autolimitato.Esse sono dotate di proprietà pleiotropiche, agiscono cioè su numerosi tipi cellulari differenti ed inoltre hanno azioni che in larga misura si sovrappongono. Esse iniziano la loro attività legandosi a recettori specifici presenti sulla superficie delle cellule bersaglio, la quale può essere la stessa che secerne la citochina (effetto autocrino), una cellula vicina  Nel caso dell'infezione da HCV, questa reazione anticorpale potrebbe essere utile sia per eradicare l'infezione sia per prevenirne di ulteriori ma nella stragrande maggioranza dei casi il virus riesce a sfuggire a questo meccanismo difensivo grazie alla sua grande variabilità genetica che si ripercuote soprattutto sulla variabilità delle proteine dell'envelope. E' noto infatti che durante l'infezione da HCV, venga montata una risposta anticorpale contro il virus e che tale risposta sia molto utile a fini diagnostici mediante la misurazione nel siero delle immunoglobuline anti-HCV. Tali anticorpi tuttavia non risultano essere utili nè nell'eradicazione dell'infezione nè nella prevenzione della stessa, come messo in luce dalla mancanza, ad oggi, di un vaccino contro l'HCV.La reazione anticorpale risulta inoltre essere importante durante questa malattia poiché, sebbene non costantemente, sembra rivolgere il suo potere offensivo verso antigeni dell'organismo ospite, configurarandosi quindi un quadro di malattia autoimmunitaria.Il secondo braccio dell'immunità acquisita è quello cellulare, al quale sarebbero più probabilmente imputati i danni nell'infezione da HCV.I protagonisti principali di questa parte dell'immunità sono i linfociti T, cellule che originano da precursori nel midollo osseo e che maturano all'interno del timo.Caratteristica peculiare di tutti i linfociti T è la presenza di un recettore costituito da un  Prima però accenneremo ai meccanismi mediante i quali l'HCV riesce ad eludere, a sabotare ed a contrastare il sistema di difesa dell'organismo umano.