Gli eventi avversi più spesso segnalati in corso di trattamento con darunavir sono di tipo gastrointestinale: comune il dolore addominale, la nausea e il vomito, la dispepsia, la flatulenza e diarrea. Meno comuni stomatite, secchezza delle fauci, "lingua impaniata", eruttazione, malattia da reflusso gastroesofageo, gastrite, pancreatite, stipsi.