Pavlov fu uno dei pochi scienziati pre-rivoluzionari apprezzati dal potere dei Soviet e poté quindi continuare a fare ricerca in patria sino a tarda età. In quegli anni il suo interesse era concentrato sull'induzione delle nevrosi; per questo motivo gli fu permesso di visitare e studiare regolarmente casi di malattie psichiatriche in un ospedale psichiatrico. Inoltre il governo sovietico gli concesse numerosi finanziamenti, con cui poté attrezzare un importante laboratorio a Koltushing, presso Leningrado, nonché fondare l'istituto di Fisiologia dell'Accademia delle scienze russa. Il motivo dell'apprezzamento di Pavlov da parte della leadership russa è che le sue teorie sui processi mentali e di apprendimento ben si sposavano con l'ideologia materialista russa, basata su un forte darwinismo. Il potere sovietico riteneva infatti che, indipendentemente dall'atteggiamento politico dello scienziato (che non nascondeva la sua ostilità verso il nuovo regime), i suoi studi potessero essere di grandissimo interesse per il proletariato e che fossero di forte sostentamento all'ideologia marxista. La posizione di scienziati come Pavlov era privilegiata, non solo in termini economici ma anche in termini di libertà: infatti Pavlov, oltre a manifestare pubblicamente la sua ideologia politica antimarxista, rifiutò addirittura l'ammissione all'Accademia delle Scienze a tre noti marxisti (il filosofo Deborin, lo storico Lukin e il critico letterario Friče), poiché considerati semplici lacchè di Stalin.