Nel 1875 Hitzig divenne direttore dell'ospedale psichiatrico Burghölzli e professore ordinario di psichiatria presso l'Università di Zurigo. Nel 1879 fu nominato direttore della Clinica Neuropsichiatrica e Professore di Psichiatria a Halle, dove aprì nel 1891, il primo ospedale psichiatrico indipendente in Prussia.