Nell'aprile 2020, in occasione di un'intervista rilasciata ad un "podcast" francese che tratta tematiche mediche, Montagnier ha dichiarato che il virus SARS-CoV-2 - responsabile della pandemia da COVID-19 iniziata alla fine dell'anno precedente - sarebbe originato in un laboratorio di ricerca della città cinese di Wuhan durante alcuni studi sulla possibile creazione di un vaccino contro il virus HIV. 