Trendelenburg si interessò della storia della medicina. Fondò nel 1872 la "Deutsche Gesellschaft für Chirurgie" ("Società tedesca di chirurgia"). Si interessò inoltre delle rimozioni chirurgiche di emboli polmonari. Un suo studente, Martin Kirschner, eseguì con successo nel 1924 la prima embolectomia polmonare poco prima della morte di Trendelenburg. Morì all'età di 80 anni nel 1924 di cancro alla mandibola.