Una sequenza CAP è composta da una successione di cicli CAP. Un ciclo di CAP è costituito da una fase A e da una fase B, ciascuna di una durata tra 2 e 60 secondi.Le sequenze CAP durante il sonno NREM possono estendersi attraverso diversi stadi di sonno senza essere interrotte (fig. 1.7). La fase A, pur appartenendo alla stessa sequenza di CAP, può avere diversi pattern EEG (sincronizzazione o desincronizzazione) a seconda dello stadio in cui si trova, in particolare: ritmo alpha intermittente o con sequenze di onde al vertice (stadio 1), cluster di complessi K, complessi K seguiti da componenti alpha-like, o da ritmi beta (stadio 2), cluster di attività delta, che supera almeno di un terzo, l'attività di background (stadio3) , [Terzano, 2002]. Per meglio comprendere l'attività ritmica del CAP, è necessario precisare che non si tratta semplicemente di una serie di manifestazioni arousal-like (fase A) che emergono da un'attività background inerte (fase B). Lo switch attivatorio che accompagna la fase A del CAP è seguito dal rebound inattivatorio della fase B, che riflette un'attiva inibizione, piuttosto che un passivo ritorno all'attività di base .Applicando separatamente uno stesso stimolo attivatorio durante un ciclo di CAP, si osserva che la fase B assume immediatamente il pattern della fase A, mentre non compare mai uno shift inverso quando lo stimolo è applicato in fase A. Questa reattività stereotipata persiste attraverso successivi cicli CAP a stimoli random ripetuti, senza adattamento. Al contrario, una serie di stimoli attivatori somministrati in modo casuale durante un periodo di non-CAP determina un graduale declino della reattività EEG con chiari segni di adattamento. Ciò indica che, nonostante la loro somiglianza morfologica, la fase B e il non-CAP appartengono a due differenti domini neurofisiologici [Terzano, 1991].