L'appropriata pulizia, sterilizzazione o disinfezione di tutti i macchinari per la terapia respiratoria sono essenziali per ridurre la trasmissione di patogeni nosocomiali. I nebulizzatori inseriti "in linea" con i circuiti della ventilazione meccanica, sono velocemente colonizzati dal condensato colonizzato e permette agli aerosol batterici diretto accesso alle vie aeree inferiori, scavalcando le difese naturali dell'ospite [80].I nebulizzatori dovrebbero essere sterilizzati e il loro uso limitato. Gli spirometri, i reservoir, sensori di temperatura e gli analizzatori di ossigeno, se non sterilizzati correttamente, possono essere una fonte di crossinfezione. I cateteri di aspirazione tracheali possono inoculare batteri direttamente nelle vie aeree e tecniche di aspirazione devono essere fatte in asepsi. Un sistema chiuso di aspirazione è più conveniente ma non riduce il rischio di VAP.