Il primo caso della pandemia di coronavirus in El Salvador è stato riportato mercoledì 18 marzo 2020. Secondo il presidente Nayib Bukele riguardava un uomo tra i 20 e i 40 anni entrato nel paese proveniente dall'Italia attraverso un punto cieco che confina con il paese. Il caso è stato identificato nella città di Metapán, nel dipartimento di Santa Ana, mentre un cordone sanitario è stato attivato intorno al comune per 48 ore per cercare di identificare i collegamenti epidemiologici.