Il coinvolgimento vascolare è predominante anche nel sistema nervoso; infatti, le anomalie riscontrabili all'elettroencefalogramma e all'elettromiografia sono poco evidenti. Inoltre, l'ischemia vascolare e il deposito di lipidi nel perinervio possono provocare alterazioni della conduzione nei nervi periferici con diminuzione della velocità di conduzione e aumento della latenza, rispettivamente 62 .Sia negli eterozigoti che negli emizigoti affetti, i depositi di glicosfingolipidi sono limitati alle cellule della guaina perineurale dei nervi periferici, ai neuroni periferici e centrali del sistema nervoso autonomo, ad alcuni neuroni delle vie somatiche afferenti e alle cellule di Schwann 63,64,65,66 .Studi sui neuroni sensitivi nei nervi surali e nei gangli spinali hanno dimostrato una perdita preferenziale di piccole fibre mieliniche e amieliniche e di cellule dei gangli spinali 64 . Per quanto riguarda il sistema nervoso centrale, i centri nervosi in cui sono stati osservati depositi di lipidi sono il nucleo gracile, i nuclei vagali dorsali del sistema autonomo, i nuclei salivari, il nucleo ambiguo, il talamo, la sostanza reticolare, il nucleo mesencefalico del nervo trigemino, la substantia nigra, il quinto e il sesto strato della corteccia del giro temporale inferiore, il nucleo di Edinger-Westphal, le cellule della catena parasimpatica, i nuclei della linea mediana, il lobo anteriore e posteriore dell'ipofisi, il midollo spinale e i suoi gangli, l'encefalo, l'amigdala, l'ipotalamo, l'ippocampo 65 .L'interessamento leptomeningeo è diffuso, ma è limitato alla parte più esterna dell'aracnoide.Il coinvolgimento delle cellule del sistema nervoso autonomo, centrale e periferico può essere responsabile di parestesie, dolore, ipoidrosi, sintomi gastrointestinali come nausea e diarrea, e altri sintomi e segni neurologici vaghi.L'ipoidrosi è probabilmente dovuta al deposito dei lipidi che provoca una marcata degenerazione delle cellule secretorie e mioepiteliali delle ghiandole sudoripare, piuttosto che ad un coinvolgimento del sistema nervoso autonomo, che in ogni caso è sempre presente 67 . Gli episodi di febbre possono essere correlati a lesioni dell'ipotalamo 68 . L'osservazione della diminuzione selettiva nel numero di fibre amieliniche e delle piccole fibre mielinizzate dei nervi periferici 64 ha suggerito l'importanza della distruzione di queste fibre nell'insorgenza di dolore e dell'ipoidrosi. È stato dimostrato che la disfunzione nervosa cutanea riguarda sia il sistema parasimpatico sia quello ortosimpatico 69 .Il deposito di lipidi nei vasa nervorum può provocare acroparestesie insieme al coinvolgimento del sistema nervoso autonomo 66 . Negli stadi terminali si possono ritrovare depositi di materiale fibrinoide nelle arteriole, che probabilmente derivano dalla necrosi delle cellule muscolari marcatamente coinvolte 72 , ma anche severa sclerosi arteriolare, atrofia e fibrosi glomerulare, atrofia tubulare, diffusa fibrosi interstiziale e altre alterazioni non specifiche.