Nel 1860 l'intera famiglia ritorna a New Orleans, ma con la caduta della città sotto l'Unione nel 1862 il padre riparte per l'Italia dove resterà definitivamente a Pinerolo fino alla morte nel 1888. Felix Jr. intanto dal giugno 1862 per tutta la durata della Guerra Civile serve come capo chirurgo al Louisiana Hospital a Richmond in Virginia. Rientrato a New Orleans nel 1864 continua a praticarvi la professione medica di chirurgo, divenendo membro del Louisiana Board of Health. Considerato uno dei più brillanti chirurghi degli Stati Uniti per la sua opera sia in tempo di guerra che in tempo di pace, nel 1892 serve come presidente dell'American Public Health Association. Si distingue anche per la sua azione umanitaria a favore dei malati, con particolare attenzione ai bisogni dei numerosi immigrati italiani di New Orleans; per tale opera riceve riconoscimento e onorificenze (Cavaliere di Gran Croce dell'Ordine dei Santi Maurizio e Lazzaro) anche da parte del governo italiano. Muore a New Orleans nel 1907.