La nefrolitotrissia o nefrolitotomia percutanea (in sigla PNL o PCNL) è invece una procedura endoscopica percutanea che permette di raggiungere le cavità renali mediante un tramite creato tra la cute ed il parenchima renale e consente di rimuovere i calcoli renali di dimensioni superiori ai 2 cm senza la necessità di eseguire interventi chirurgici a cielo aperto. Viene eseguita previa anestesia generale, utilizzando posizioni specifiche del paziente (es. la Posizione di Valdivia), inserendo un nefroscopio , uno strumento che consente di esplorare le cavità pielocaliciali del rene. Dopo aver individuato i calcoli si procede alla loro estrazione tramite cestelli o pinze (se di piccole dimensioni) o alla loro frammentazione con litotritori (in caso di calcoli di maggiori dimensioni) e alla successiva asportazione dei frammenti.