Le sequenze "in-phase" e "out-of-phase" corrispondono alle sequenze a eco del gradiente accoppiate utilizzando lo stesso tempo di ripetizione (TR) ma con due tempi di eco differenti (TE). Questo può rilevare anche quantità microscopiche di grasso, che ha un calo del segnale su "out-of-phase" rispetto a "in-phase". Tra i tumori renali che non mostrano grasso macroscopico, tale calo del segnale è osservato nell'80% di carcinoma a cellule renali e nell'angiomiolipoma a grasso minimo.