Altra arma terapeutica sono gli agenti alchilanti, quali ciclofosfamide e clorambucile.Sopprimono la risposta immune sia cellulare che umorale, ma con un numerosi effetti avversi, compresi soppressione midollare, infertilità, predisposizione alle infezioni, neoplasie secondarie cutanee ed ematologiche.Tali agenti sono impiegati negli adulti in caso di uveiti ricorrenti, mentre sono sconsigliati in ambito pediatrico, pur essendo la letteratura molto limitata a tale riguardo.