La distrofia di Meesmann è caratterizzata da minuscole cisti, opache, simili a bolle rotonde-ovali, punteggiate distinte, che si formano nell'epitelio corneale centrale e, in misura minore, nella cornea periferica di entrambi gli occhi. Le cisti sono estremamente difficili da vedere senza biomicroscopia a fessura. Hanno un diametro compreso tra 40 e 150 µm e negli anni crescono di numero e migrano verso la superficie della cornea.