Quando i glucocortidoidi sono presi per periodi prolungati (più di due mesi) e ad alte dosi si possono verificare effetti indesiderati legati alla loro attività endocrino/metabolica: aumento della glicemia, diabete, aumento di peso. Possono comparire anche effetti a livello del sistema cardio-vascolare (aumento della pressione del sangue o ipertensione), del sistema muscolo-scheletrico (riduzione della massa muscolare, osteoporosi e aumento del rischio di fratture), della cute (acne), dell'occhio (cataratta, glaucoma). A livello neuropsichiatrico possono comparire depressione, euforia, instabilità dell'umore e insonnia. Nelle cure prolungate si osserva anche una maggiore facilità a contrarre le infezioni (ad esempio, infezioni causate da un fungo chiamato candida albicans).