Fuchs è annoverato tra i padri fondatori della botanica tedesca ed è uno dei principali rappresentanti del neo-galenismo. Scrisse oltre 50 volumi, tra libri e trattati. La sua grande fama fu acquisita con i libri sulle piante. Nel 1542 pubblicò in latino "De Historia Stirpium commentarii insignes", il suo primo libro su questo argomento, nel 1543 il "New Kreüterbuch" (Nuovo libro sulle erbe), che pochi mesi dopo fu tradotto in olandese. In quest'opera vengono descritte oltre 400 piante europee e più di 100 piante esotiche, corredate da 511 xilografie. Il suo monumentale lavoro "Histori" non trovò editori. Il manoscritto, con oltre 1500 immagini di essenze, venne trovato dopo la sua morte e oggi è conservato intatto a Vienna presso la Biblioteca nazionale austriaca. Delle tavole del suo libro sulle piante invece rimangono solo pochi fogli.