Il topiramato deve essere somministrato con cautela in persone con problemi a carico dei reni o del fegato.Se impiegato in gravidanza potrebbe nuocere al feto. Poiché riduce l'efficacia dei contraccettivi a base di ormoni (come la pillola), le donne cui è stato prescritto il topiramato dovrebbero consultare il proprio medico, o ginecologo, per scegliere un metodo di contraccezione alternativo.