Nel 1889 fondò il Saint Marys Hospital, che in seguito fu gestito e ampliato dai figli. Dedicò gli ultimi anni della sua vita principalmente alla politica. Fece un viaggio in Oriente di cinque mesi, visitando la Cina ed il Giappone, era il regalo per il suo ottantottesimo compleanno. Nonostante tutto continuò a fare ricerche in ambito medico. Durante un esperimento si ferì gravemente la mano e l'avambraccio. Furono necessari tre interventi, ma alla fine si dovette amputare. Soffrì per diversi anni e la sua salute peggiorò. Mori il 6 marzo 1911, poco prima del suo novantaduesimo compleanno. Il funerale fu celebrato il giorno successivo, un elogio senza musica proprio come aveva richiesto il dr. Mayo. Si disse di lui che fu un uomo vigile, molto abile e degno della gloria che i figli aggiunsero al suo nome. Fu eretta una statua di bronzo a suo nome.