Nel corso del trattamento con acido nalidixico sono stati segnalati effetti avversi di natura gastrointestinale (dispepsia, nausea, vomito, dolore addominale, diarrea) e a carico del sistema nervoso centrale (SNC), in particolare tendenza all'assopimento, cefalea, debolezza, vertigini, eccitazione psicomotoria, allucinazioni, diversi disturbi di tipo visivo (alterata percezione dei colori e della sensibilità alle luci, difficoltà di accomodamento, diminuzione dell'acuità visiva e diplopia).