In Sudafrica una variante genomica, chiamata "variante 501.V2", è stata scoperta i primi di ottobre 2020; ed essa si è diffusa per circa il 90% dei genomi sudafricani testati dal laboratorio sudafricano "Kwazulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform" (Krisp). Sembra che questa variante colpisca, rispetto ad altri ceppi virali di SARS-CoV-2, maggiormente i giovani, provocando una malattia più grave. Il 4 dicembre 2020 il Sud Africa ha allertato l'OMS. 