Hayat Sindi è nata alla Mecca, in Arabia Saudita. Nel 1991, ha convinto la sua famiglia a permetterle di viaggiare da sola nel Regno Unito per proseguire gli studi superiori. Dopo un anno trascorso a studiare inglese e studiare per i suoi Advanced Level, è stata ammessa al King's College di Londra, dove si è laureata in Farmacologia nel 1995. Mentre frequentava il King's College, ha ricevuto il premio Princess Anne per la sua tesi di laurea sulle allergie.