Dopo somministrazione orale il farmaco viene assorbito dal tratto gastrointestinale. Lopinavir viene metabolizzato pressoché completamente dal fegato, ad opera dell'isoenzima CYP3A. Il ritonavir rallenta il metabolismo del lopinavir, inibendo il citocromo P450 isoenzima 3A4 e pertanto ne aumenta i livelli plasmatici. Il legame di lopinavir con le proteine plasmatiche è estremamente elevato e pari a circa il 98-99%.