Il sistema immunitario viene influenzato dal sonno e dal riposo, infatti si è dimostrato che la privazione del sonno è dannosa per la funzione immunitaria. Un complesso sistema di feedback e loop che coinvolge citochine, come l'interleuchina 1 e il fattore di necrosi tumorale-α, prodotte in risposta alle infezioni, sembra svolgere un ruolo nella regolazione della fase "non-rapid eye movement" (REM) del sonno. Così la risposta immunitaria alle infezioni può comportare modifiche al ciclo del sonno, tra cui un aumento del sonno a onde lente rispetto al sonno REM.