I primi volumi anatomici che si diffusero in Giappone erano trattati di ispirazione europea con tavole anatomiche, con disegni sovrapposti per raffigurare meglio i piani anatomici e con xilografie in nero e colorate. Questi trattati furono influenzati anche dalle dottrine di molti medici tedeschi che nel corso del Settecento fecero viaggi nel Paese. Tra questi vi è Philipp Franz von Siebold, “lo scrutatore del Giappone”, professore di medicina nell'università di Berlino. Siebold introdusse la botanica e le nuove scoperte di oftalmologia e chirurgia. Egli studiò a lungo la flora e la fauna nipponica (in particolar modo il tè) e sposò una donna del luogo, di nome Sonogi. Introdusse, inoltre, la pratica della vaccinazione, il forcipe e nuovi medicamenti. Infine fondò una scuola di medicina a Nagasaki, che raggruppava numerosi clinici e chirurghi sia europei che giapponesi. In questi anni alcuni giovani medici redassero il primo trattato completo di anatomia di nome "Kaitai Shinsho" (1774). L'innovazione di quest'opera sta nel fatto che si nutre sia delle conoscenze occidentali sia di quelle cinesi, per raggiungere un livello scientifico più conforme alla realtà. Altri medici prussiani giunti in Giappone furono Gottlieb Mohnike, che introdusse lo stetoscopio, e J. L. C. Pompe van Meerdervoort, che contribuì allo sviluppo della scuola imperiale di medicina di Nagasaki e fece costruire, nella stessa città, il primo ospedale di stampo europeo (1861). Nel frattempo erano stati introdotti il primo trattato di psichiatria (1818) e il primo termometro clinico (1826).