Una volta ottenuta l'autorizzazione del Tribunale, il soggetto che lo desidera può proseguire con l'intervento di RCS, che prevede la rimozione del carattere sessuale primario e successivamente la ricostruzione degli organi genitali appartenenti al genere esperito espresso. L'equipe chirurgica deve essere a conoscenza delle aspettative del paziente e al tempo stesso renderlo edotto circa le possibilità di realizzazione dei risultati desiderati. L'aspetto funzionale dei nuovi organi è quello privilegiato rispetto all'aspetto estetico che, almeno inizialmente, viene posto in secondo piano.