L'ernia di Bochdalek è molto più frequente rispetto a quella di Morgagni. Occasionalmente la patologia viene già intravista con un'ecografia prenatale del secondo trimestre. Alla nascita, il neonato si presenta tipicamente con una sindrome da distress respiratorio e una mancanza sia di movimenti toracici che di rumori respiratori all'auscultazione. La diagnosi viene poi confermata con un esame radiologico del torace, il quale mostra la presenza intratoracica di organi addominali quali lo stomaco e l'intestino. A livello terapeutico si stabilizza inizialmente il neonato con un'intubazione, una sonda gastrica e lo si posiziona sulla fianco patologico (in maniera da proteggere la parte sana dalla pressione esercitata dagli organi erniati). La correzione chirurgica deve avvenire il prima possibile. 