Non è attualmente noto ciò che provoca la PSSD. Essendo generata (sembra) esclusivamente dalle molecole che bloccano il reuptake della serotonina, la sindrome sembra essere meccanismo d'azione specifica. Non sono stati però svolti molti studi per valutare quanto e quali delle numerose modificazioni nella chimica neuronale e nella struttura cerebrale indotta dagli SSRI/SNRI siano reversibili con la sospensione del trattamento.