Iniziò i suoi studi di medicina a Bordeaux, in seguito lavorò come medico interno negli ospedali di Parigi (dal 1872). Nel 1877 difese la sua tesi di dottorato, e durante l'anno successivo ricevette la sua agrégation con una tesi dal titolo ""Les ipertrofie et les dilatations cardiaques indépendante des lésions valvulaires"". Alla fine degli anni '70, con Charles-Émile François-Franck, eseguì studi sull'eccitazione della corteccia cerebrale e sulla localizzazione della funzione cerebrale. In seguito, tornò a Bordeaux, dove dal 1881 al 1919, fu "maitre" di patologia. Pitres morì nel 1928 all'età di 79 anni dopo essere caduto dalle scale.