La cappella dell'ospedale è dedicata a san Giovanni di Dio ed è sede della omonima parrocchia, istituita dall'arcivescovo Ernesto Maria Piovella il 4 giugno 1944. La cappella è situata al primo piano dell'ospedale, in corrispondenza dell'atrio al piano terra. La pianta è circolare, con volta a cupola emisferica, decorata da cassettoni dipinti. Il perimetro è scandito da colonne.