In numerose condizioni, la manometria ano-rettale contribuisce in maniera significativa all'inquadramento diagnostico delle lesioni neurologiche in quanto ipo/ipertonie anali secondarie a disfunzioni di entrambi gli sfinteri, assenze del riflesso inibitore, anomalie dello "Squeeze" ed altri pattern patologici sono presenti e diversamente combinati in corso di lesioni encefaliche, del tronco e del midollo o della cauda equina, a seconda se queste siano complete anteriori o posteriori, sopra o sotto conali o spinali basse. Inoltre alterazioni manometriche ano-rettali sono descritte in presenza di mielomeningocele, resezioni del sacro, neuropatie del pudendo, sclerodermia e Distrofia Miotonica (Malattia di Steinert).È evidente che in questi casi l'esame manometrico si pone non certo come indagine di prima o seconda scelta, ma comunque può fornire, se utilizzato da mani esperte, utili informazioni a completamento degli esami morfologici e delle altre indagini funzionali. Può essere poi possibile che approfondimenti diagnostici di tipo neurologico vengano intrapresi proprio sulla base delle alterazioni manometriche ano-rettali che non trovano riscontri nella storia clinica o sul piano esclusivamente coloproctologico.