La stomatite aftosa è stata classificata come un tipo di stomatite non infettiva. Si manifesta con l'insorgenza, spesso ricorrente, di erosioni dolorose singole o multiple e ulcere che compaiono principalmente sulla mucosa orale. Il tipo di lesioni la caratterizzano in diverse varianti o sottotipi, in passato attribuiti a specifiche malattie con molti eponimi: malattia di Sutton, malattia di Von Zahorsky, afta di von Mikulicz, afta di Bednar. Un metodo più comune per classificare la stomatite aftosa ricorrente è in tre varianti, distinte per la dimensione, il numero e la posizione delle lesioni, il tempo di guarigione delle singole ulcere e se una cicatrice è rimasta dopo la guarigione.