I fecalomi possono essere rimossi con un clistere evacuativo o, in alcuni casi più semplici, tramite una esplorazione rettale. Nei casi più gravi è necessario operare una rottura meccanica. In quest'ultimo caso attraverso il rettoscopio viene fatta avanzare una sonda di gomma con la quale si rompe il fecaloma, sia per l'azione meccanica, sia per l'iniezione di piccole quantità di acqua all'interno del fecaloma stesso. Successivamente a questa azione di ammorbidimento della massa fecale, si pratica una rettoclisi con soluzione fisiologica o altre soluzioni lubrificanti. Per fecalomi localizzati in zone dell'intestino difficilmente raggiungibili con il rettoscopio è necessario intervenire chirurgicamente.