In medicina, il laser Doppler è in pratica un "Doppler del microcircolo", che consente di valutare la funzionalità del distretto microcircolatorio. La tradizionale e più diffusa ecografia Doppler consente di valutare la velocità di flusso intravascolare nel distretto macrocircolatorio, ma non fornisce alcuna informazione sul microcircolo. La lunghezza d'onda della luce laser utilizzata varia, a seconda del produttore, da 620 a 820 nanometri (tra rosso e infrarosso). Sperimentalmente si utilizzano talvolta lunghezze d'onda inferiori.