Numerose segnalazioni riguardano casi di ischemia intestinale e trombosi del circolo epatico. Frequenti i casi di Sindrome di Budd-Chiari. Meno comuni i casi di trombosi della mesenterica superiore .Sono stati inoltre riportati casi di ulcerazioni intestinali ricorrenti in pazienti con LES che presentavano valori elevati di anticorpi aPL; é interessante sottolineare come in alcuni dei casi pubblicati fossero presenti studi istologici che dimostravano la presenza di trombosi nelle lesioni [166]. Le complicazioni tromboemboliche sono di relativamente frequente osservazione in corso di malattie infiammatorie croniche intestinali (Crohn e colite Ulcerosa); in alcuni case tali complicanze sono state correlate alla presenza di anticorpi aPL [167] 