La prucalopride è una diidrobenzofurancarbossamide dotata di un effetto agonista selettivo ad alta affinità per il recettore della serotonina (5-HT4). L'interazione tra il farmaco e il recettore 5-HT4 stimola la motilità del colon prossimale, migliorando anche la motilità gastroduodenale e accelerando lo svuotamento gastrico. Complessivamente l'effetto del farmaco consiste in un notevole miglioramento della consistenza e della frequenza nonché della forza propulsiva della defecazione.