All'esame macroscopico si osservano livelli variabili di meningite, edema cerebrale, congestione ed emorragia nel cervello. L'esame microscopico conferma una leptomeningite con infiltrazione di cellule rotonde, piccole emorragie con cuffia perivascolare e noduli di leucociti o cellule microgliali. La demielinizzazione può seguire la distruzione degli oligodendroglia e il coinvolgimento delle cellule ependimali può portare all'idranencefalia.