Un secondo metodo per la valutazione del rischio tossicologico è il monitoraggio biologico che è molto importante perché la presenza o l'impiego di sostanze tossiche nell'ambiente di lavoro non costituisce necessariamente un rischio per la salute, in quanto esso dipende dalle caratteristiche tossicologiche della sostanza, dalle modalità di contatto e dalla reattività individuale. Quindi è necessario conoscere la quantità di sostanza alla quale un soggetto si trova effettivamente esposto e il periodo di tempo di esposizione tenendo conto delle diverse vie di penetrazione nell'organismo (inalazione, contatto cutaneo e ingestione). Gli indicatori biologici (IB) sono strumenti che consentono di rappresentare le modificazioni in un sistema biologico a seguito alle interazioni con gli xenobiotici. La categoria di IB più utilizzata sono gli indicatori biologici di esposizione e le matrici biologiche in cui vengono testati sono le urine, il sangue, aria espirata, etc. 