La CDI viene associata anche a volvolo e all'enteropatia proteino-disperdente. Alcuni studi hanno riscontrato che la CDI non è limitata solo al colon. Infatti, sono state segnalate infezioni extracoloniche da "C. difficile" e la manifestazione clinica della malattia comprende malattia del piccolo intestino con formazione di pseudomembrane sulla mucosa ileale, batteriemia, artrite reattiva, ascesso viscerale, appendicite, ascesso intraddominale, osteomielite ed empiema. Nella maggior parte dei casi, le infezioni extracoloniche da "C. difficile" hanno un precedente coinvolgimento con malattie sottostanti come malattie gastrointestinali, colite da "C. difficile" o operazione chirurgica del colon.