Per trattare il neuroma di Morton è importante la precocità della diagnosi; se i sintomi sono presenti entro i sei mesi è possibile tentare interventi di tipo conservativo con farmaci antinfiammatori, infiltrazioni di cortisone a livello locale, terapie di tipo fisico come le onde d'urto radiali. L'uso di plantari (che vanno portati con costanza), se costruiti su misura con un sostegno in grado di allargare il ventaglio metatarsale, possono essere una valida alternativa all'intervento chirurgico, poiché in questo modo viene meno il meccanismo di compressione che causa dolore. (Se la sintomatologia dura da più di sei mesi o da anni è quasi sempre necessario un intervento chirurgico, in cui avviene sostanzialmente l'asportazione del nervo interessato (neurectomia); l'asportazione non provoca problemi nel movimento delle dita, dato che il nervo succitato ha caratteristiche unicamente di tipo sensitivo; può perdurare invece una leggera diminuzione della sensibilità della cute nella zona interessata dall'intervento. L'intervento chirurgico è abbastanza routinario ed eseguito sotto anestesia locale.