In reazione alle posizioni politiche moderatiste del gran maestro del Grande Oriente d'Italia Ernesto Nathan, che si era distanziato dai repubblicani e aveva vietato alle logge di intervenire in forma ufficiale ai congressi dei liberi pensatori, Malachia De Cristoforis, maestro venerabile della Loggia "Cisalpina" di Milano, fondò con altre logge del nord Italia (milanesi, lombarde, bergamasche) il "Grande Oriente Italiano" di Milano, che arriverà presto a contare una cinquantina di Logge e che il 24 aprile 1898 sarà riconosciuto ufficialmente dal "Grande Oriente di Francia", il quale romperà le relazioni col "Grande Oriente d'Italia". È nelle logge del "Grande Oriente Italiano" che "matureranno gli accordi che permetteranno la nascita di giunte di sinistra e la vittoria elettorale alle elezioni politiche del 1900 e, successivamente, i blocchi popolari." Le logge del "Grande Oriente Italiano" si riunificheranno con quelle del "Grande Oriente d'Italia" nel 1905, sotto il nuovo gran maestro Ettore Ferrari, "spostando tutta la massoneria su posizioni molto più avanzate politicamente, come già si vide l'anno successivo." Ricomposta l'unione, sei anni più tardi fu nominato presidente del Rito simbolico italiano e gran maestro onorario dell'Ordine.