Essendo ancora in una fase di studio iniziale, le applicazioni cliniche sull'uomo delle cellule staminali amniotiche sono attualmente di tipo sperimentale; tuttavia sono in corso numerosi trials clinici sull'uomo, tendenti a curare patologie quali l'ernia diaframmatica o la ricostruzione della trachea, mentre si attende l'esito di studi riguardo al diabete, alle malattie degenerative neurali, alla retinite pigmentosa e ad altre applicazioni nella medicina rigenerativa.