Oltre che da origine batterica vi sono malattie gengivali ad origine virale che possono essere causate dall'ampia varietà di virus a DNA e RNA .I microrganismi più importanti sono l'herpes virus simplex di tipo 1e2 e il virus della varicella Zoster. Di solito essi penetrano nell'organismo umano durante l'adolescenza e possono dare origine ad affezioni della mucosa orale seguiti da periodi di latenza, e a volte, di riattivazione. L'herpes virus simplex di tipo 1 provoca comunemente manifestazioni orali, quello di tipo 2 è coinvolto principalmente alle infezioni anogenitali e solo occasionalmente provoca un'infezione orale. Tra le malattie gengivali di origine virale più frequenti vi sono:-Gengivite erpetica primaria -Herpes orale ricorrente -Varicella Zoster -Virus di Epstein-Barr -Gengivite associata a HIV