Il gel di agarosio viene preparato come descritto in precedenza; in questo caso però non viene aggiunto l'etidio di bromuro in quanto il metodo di rilevazione si basa sul tempo di decadimento della radioattività in seguito ad impressionamento di una lastra fotografica.E' fondamentale utilizzare solo composti RNAsi free, quali acqua DEPC, TBE per RNA.