Come in altre neoplasie mieloidi, anche nelle MPN sono alcune mutazioni somatiche le responsabili dell'espansione clonale della cellula ematopoietica totipotente. L'analisi genomica, utilizzando microarray e next-generation sequencing (NGS), ha portato alla scoperta di numerose mutazioni presenti in tutte le neoplasie mieloidi, comprese le MPN. Le mutazioni "drivers" nelle MPN coinvolgono tre geni: JAK2 (5) (6) (7) (8), MPL (9) (recettore della trombopoietina) e CALR (10) (11) (Figura 1 e Figura 2). Queste mutazioni sono mutualmente esclusive.  