Ciò che maggiormente colpisce osservando la bibliografia di Giovanni Mingazzini è la sua intensa operosità scientifica. L'interesse del Mingazzini investe i più disparati campi del sapere, si pensi ai lavori del primo periodo quasi interamente dedicati a temi anatomici, agli studi sul "nucleus arciformis" e sulle fibre arciformi esterne, le ricerche sul peduncolo cerebellare medio e sui corpi restiformi, quelli sul nucleo dell'ipoglosso, sulla "substantia nigra", ma soprattutto, a giudizio di Gioacchino Fumarola, i lavori sul nucleo lenticolare e i suoi rapporti con le strutture cerebrali e la capsula interna.