La diagnosi è principalmente clinica e basata su test sierologici quali il Sabin-Feldman dye test, l'IFA, l'ELISA e i test di agglutinazione.Il dye test costituisce il gold standard ma risulta scarsamente utilizzabile in quanto richiede l'utilizzo di tachizoiti viventi.L'IFA ha una sensibilità e specificità comparabili ma è più semplice, meno costoso e meno rischioso.La metodica ELISA non può escludere la possibilità sia di falsi negativi, per competizione tra IgM e IgG, sia di falsi positivi, per la presenza di fattore reumatoide o di IgM naturali preesistenti nel soggetto. Inoltre, la sensibilità e la specificità dell'ELISA variano a seconda del kit impiegato.Nei casi atipici la diagnosi può essere confermata mediante l'isolamento del Toxoplasma I test finora citati possono essere eseguiti dal pediatra, al contrario i test di pertinenza prettamente oculistica sono la biomicroscopia con lampada a fessura, l'angiografia con indocianina o con verde di fluoresceina.L'angiografia con fluoresceina è particolarmente utile sia nella valutazione delle complicanze vascolari associate alle lesioni acute sia nella diagnosi di edema maculare cistoide. L'angiografia con indocianina è stata impiegata di recente nello studio della retinocoroidite, mettendo in evidenza anormalità dei vasi coroidei molto maggiori di quanto sospettato a livello clinico.