Tra le cause principali dell'ipocondria vi sono l'ansia e la depressione e da un punto di vista psicologico essa è definibile come un meccanismo di difesa da un pericolo interno o esterno, associato alla vita relazionale e sociale oppure all'identità personale. Ha inoltre una base genetica, dato che i bambini nati in una famiglia in cui è presente un membro che soffre di ipocondria sono più soggetti a soffrirne a loro volta.