La condizione identificata come Hikikomori è complessa e controversa a causa soprattutto della mancanza di una chiara definizione e del consenso tra i diversi studi sui criteri per accertarla (diagnosticarla). L'esatta posizione della condizione Hikikomori nella classificazione psichiatrica deve ancora essere determinata. Molti dei disturbi (sintomi) che la caratterizzano - come l'isolamento sociale, la perdita di motivazione, la disforia, i disturbi del sonno e la ridotta concentrazione - non sono infatti specifici della condizione Hikikomori ma sono comuni a diversi disturbi del comportamento e psichiatrici. Secondo alcuni autori quindi, distinguere l'Hikikomori dai segni di altri disturbi già presenti all'interno della classificazione psichiatrica può essere molto difficile e non è stata ritenuta necessaria la creazione di una nuova categoria specifica (Hikikomori secondario).