Le cisti parodontali laterali sono cisti rare, localizzate prevalentemente nella regione canina e in quella premolare. Come le cisti gengivali, anch'esse insorgono più spesso nella mandibola. Le cisti parodontale laterale si sviluppano lateralmente al pardonto e la loro diagnosi richiede l'esclusione dall'origine infiammatoria, che è invece presente nella cheratocisti collaterale. La cisti può presentare un rigonfiamento gengivale, ma di solito è priva di sintomi e si riscontra generalmente durante un'esame radiografico di routine. La cisti parodontale laterale è delimitata da un sottile epitelio pavimentoso stratificato non cheratinizzato, in cui sono presenti a volte ispessimenti epiteliali focali.