Tra le possibili complicanze della nefropatia da analgesici vi sono la pielonefrite e l'insufficienza renale cronica. Tra i fattori che condizionano una prognosi sfavorevole si ricordano le infezioni ricorrenti delle vie urinarie e i valori pressori persistentemente elevati. Inoltre la nefroptia da analgesici sembra legata ad un aumento del rischio di tumori maligni delle vie urinarie.