Fino al 90% dei pazienti con SM accusa, durante il corso della malattia, disfunzioni sfinteriche, urinarie o fecali, e disfunzioni sessuali dovute all'interruzione delle vie discendenti encefaliche che conducono ai centri parasimpatici sacrali. Si può generare quindi instabilità o iperreflessia del detrusore: i pazienti riferiscono urgenza minzionale e pollachiuria fino a una vera e propria incontinenza da urgenza. Nelle forme più severe si ha areflessia detrusoriale, con difficoltà di svuotamento; questa condizione facilita le infezioni delle vie urinarie, anche superiori. Un'altra alterazione urologica tipica è la dissinergia vescico-sfinterica che determina la contemporanea contrazione del detrusore e dello sfintere uretrale, con conseguente ritenzione minzionale.Le disfunzioni sessuali sono altrettanto frequenti: nell'uomo si possono verificare disfunzione erettile e disturbi dell'eiaculazione fino all'anorgasmia e all'eiaculazione retrograda. Nella donna si possono riscontrare disestesie del perineo, ipo-anorgasmia e riduzione della libido. I disturbi del tratto intestinale sono in genere rappresentati dalla stipsi, causata dalla diminuzione dell'attività fisica, dalla riduzione del riflesso gastrocolico e dalla minore efficacia del torchio addominale 75 .