In molti casi l'infezione non provoca disturbi (è asintomatica); le persone infette, quindi, non accusano alcun segnale della presenza di helicobacter pylori. In altri casi, pur essendo presenti i batteri, i disturbi non sono specifici. Possono variare da difficoltà digestive, nausea, eruttazioni (dispepsia), ai disturbi propri delle malattie del tratto digerente che l'infezione potrebbe determinare (ulcera duodenale).