Il Biandrata abbandonava così il triteismo, per il quale le tre persone sono tutte di natura divina, per quanto le altre due siano subordinate al Padre, per abbracciare un compiuto antitrinitarismo, nel quale Cristo è soltanto uomo. All'attacco del professore di Wittenberg Georg Major, formulato nel suo "De uno Deo et tribus personis adversus F. Davidis et G. Blandratam", Biandrata e Dávid risposero nel 1569 con la "Refutatio scripti Georgii Maioris", mentre nel "De regno Christi et de regno Antichristi", comprendente il "Tractatus de paedobaptismo et circumcisione", dedicato a re Giovanni Sigismondo, i due autori condensavano la "Christianismi restitutio" di Serveto, che il Biandrata aveva fatto tradurre dal suo allievo Pawel. La vicinanza con le teorie degli antitrinitari anabattisti è testimoniata nella "Brevis enarratio disputationis Albanae" nella quale Biandrata si dichiara contrario al battesimo degli infanti: chi infatti vuol farsi cristiano, deve spogliarsi del «vecchio uomo» e diventare una nuova creatura, ma «gli infanti non possono farlo» ed è bene che prima s'insegni e poi si battezzi.