L'importanza di HER2 è soprattutto critica nello sviluppo del sistema cardiovascolare: i topi privati di questo gene vanno incontro a morte intrauterina per il mancato sviluppo delle trabecole ventricolari che danno origine al miocardio [30]; nel cuore adulto la funzione di questo gene è indispensabile per la prevenzione dello sviluppo di cardiomiopatie [31]. In questo modo sono spiegati gli effetti collaterali a danno del sistema cardiaco osservati nei pazienti trattati con Trastuzumab.Anche lo sviluppo del sistema nervoso è gravemente compromesso nei topi privati di questo gene, nei quali non si formano i gangli sensitivi derivati dalla cresta neurale e vi sono gravi difetti dei neuroni motori facciali, che non riescono ad uscire dal neurocranio [30].Lo sviluppo embrionario della mammella è invece soltanto ritardato, con alterazioni nella formazione dei dotti della ghiandola mammaria embrionale, che vengono però recuperati nel corso dello sviluppo [32].