Diversi protocolli terapeutici possono essere impiegati per i pazienti con una terza o successiva recidiva di CDI, comprese le seguenti opzioni: vancomicina orale, 125 mg 4 volte al giorno per 14 giorni, seguita da rifaximina, 400 mg due volte al giorno per 14 giorni, o immunoglobulina endovenosa, 400 mg / kg, ripetuto fino a 3 volte a intervalli di 3 settimane, o terapia combinata con vancomicina orale, rifaximina orale e trapianto fecale di microbiota (FMT).