La chirurgia è un'opzione terapeutica per il trattamento della colite fulminante o di quei pazienti che non rispondono alla terapia medica. Nei pazienti che non rispondono a una terapia medica ottimale o che presentano sintomi di megacolon o sepsi, si consiglia pertanto di effettuare prima un consulto chirurgico. Nei casi di colite fulminante, qualsiasi ritardo nella chirurgia può provocare la morte. La tomografia dell'addome può fornire dati preziosi per valutare la gravità della malattia e la necessità di un intervento chirurgico. 