La prima attività di un gruppo di professionisti operanti nel settore dell'oncologia ed ematologia pediatrica avvenne con la stesura di un protocollo per la cura delle leucemie acute nel 1971. Nel 1973 a Parma venne costituito il Gruppo italiano di ematologia pediatrica (GIEP) che creò dei protocolli per il trattamento delle malattie ematologiche in età pediatrica. Nell'aprile 1974, a Santa Margherita Ligure, si riunirono i membri del GIEP e presero la decisione di dar vita ad un'associazione, che avesse il fine di individuare e standardizzare le diagnostiche per la cura delle diverse malattie ematologiche ed oncologiche, l'uso di protocolli terapeutici comuni e valutare in maniera critica i risultati ottenuti. L'associazione, a cui venne dato il nome di Associazione italiana di immunologia e oncologia pediatrica (AIEIP), venne costituita il 6 marzo 1975 a Genova ed ha la sua sede in Roma. Essa è affiliata alla Società italiana di pediatria (SIP). L'AIEOP nasce il 22 ottobre 1981 a Bologna come evoluzione dell'AIEIP.