La frequenza della cistotrigonite è più elevata nel sesso femminile rispetto al sesso maschile. La prevalenza del disturbo nella donna presenta un primo picco tra i 30 ed i 50 anni, quindi può aumentare nel periodo post menopausa, verosimilmente in relazione ai disturbi genito-urinari più frequenti in questo periodo della vita, forse causati dalla alterazione degli estrogeni circolanti.