Le mani devono essere disinfettate prima di qualsiasi intervento chirurgico lavando le mani con sapone neutro e poi strofinando le mani con un disinfettante. La disinfezione chirurgica richiede una dose maggiore di disinfettante delle mani e un tempo di sfregamento più lungo di quello normalmente utilizzato. Di solito viene eseguita in due applicazioni secondo specifiche tecniche di sfregamento delle mani, EN1499 (lavaggio igienico delle mani) e EN 1500 (disinfezione igienica delle mani) per garantire che l'antisettico venga applicato ovunque sulla superficie della mano.