Se i metodi non farmacologici sono inefficaci, potrebbero essere necessari dei farmaci. I farmaci usati possono includere beta-bloccanti, piridostigmina, midodrina o fludrocortisone. A partire dal 2013, nessun farmaco è stato approvato dalla Food and Drug Administration statunitense per il trattamento di POTS, ma una varietà viene utilizzata off-label. La loro efficacia non è stata ancora esaminata in studi controllati randomizzati a lungo termine.