La regione può essere interessata da lesioni estrinseche che si estendono in direzione del cavo quali metastasi ossee, cordomi, condrosarcomi o cisti epidermoidi. Le lesioni di tipo primitivo riguardano in massima parte schwannomi del trigemino e meningiomi. Il cavo di Meckel può essere interessato anche da processi infettivi come complicanzione della sindrome di Gradenigo.