Scanzoni era un'autorità importante dell'ostetricia nell'Europa del XIX secolo. È ricordato per la sua procedura di nascita conosciuta come la "manovra Scanzoni". Nel 1849 fu un fattore importante nella nomina di Rudolf Virchow presso l'Università di Würzburg. Era un critico ardente di Ignác Semmelweis. Tuttavia, negli anni successivi, si convinse che il lavoro di Semmelweis fosse corretto, ma non lo disse subito.