I virus sono tra i più piccoli agenti infettivi, e sono troppo piccoli per essere visti dalla microscopia ottica, la maggior parte di essi può essere vista solo dalla microscopia elettronica. Le loro dimensioni variano da 20 a 300 nanometri; ci vorrebbero da 30 000 a 500 000 di loro, uno accanto all'altro, per allungarsi fino a un centimetro (0,4 in). Per comparazione, i batteri sono tipicamente intorno ai 1 000 nanometri (1 micrometro) di diametro, e le cellule ospiti di organismi superiori sono tipicamente poche decine di micrometri. Alcuni virus come i megavirus e i pandoravirus sono virus relativamente grandi. A circa 1 000 nanometri, questi virus, che infettano le amebe, sono stati scoperti nel 2003 e nel 2013. Sono circa dieci volte più grandi (e quindi mille volte più grandi in volume) dei virus dell'influenza, e la scoperta di questi "giganteschi" virus ha stupito gli scienziati.