Nel 1907 Mary venne rinchiusa nell'ospedale Riverside, su North Brother Island, costretta ad un isolamento a tempo indeterminato. Alloggiava in una piccola villetta a un piano che in passato era stata la dimora del capo del dipartimento infermieri dell'ospedale. Non l'avevano mai accusata, incriminata, processata o condannata per alcun crimine. La sua faccia però era comparsa sui giornali: un disegnatore era andato al Willard Parker e aveva catturato la sua immagine. La stampa aveva cominciato a chiamarla "Mary la tifoide".