Data la virulenza e la tendenza alla cronicizzazione di questo patogeno, risulta di estrema importanza lo sviluppo di un sistema di controllo e, dove possibile, di prevenzione nei confronti dell'infezione.La distinzione tra persistenza dell'infezione dovuta ad uno stesso ceppo di PA e una reinfezione da parte di uno nuovo assume una rilevanza tale da far sì che la caratterizzazione fenotipica e genotipica di PA ricoprano un ruolo di rilievo dal punto di vista epidemiologico nello studio di questa malattia.La caratterizzazione, infatti, ci permette di disegnare una mappa che riporta frequenza e luogo di insorgenza delle infezioni, di valutarne la diffusione e potrebbe, quindi, essere utile al fine di identificare la presenza di ceppi più virulenti o di un ceppo dominante(3).Per lungo tempo si è ritenuto che la fonte di infezione di PA fosse esclusivamente ambientale, ma nel corso degli anni sono stati riportati in letteratura vari casi di pazienti colonizzati dal medesimo ceppo di PA , originariamente soprattutto del clone C, il quale, però, è ampiamente diffuso nell'ambiente, soprattutto nelle acque (47).L'infezione da parte di ceppi condivisi, identificata già nel 1980 in uno studio danese, veniva dunque ascritta completamente alla presenza più abbondante di questi particolari ceppi di PA in natura oppure ad una sorgente d'infezione condivisa (48).Per lungo tempo l'infezione crociata tra pazienti FC non è stata considerata un problema di grande importanza (49). Solo negli anni '90 i clinici hanno iniziato a valutare più seriamente questa condizione e nel corso degli ultimi 15 anni la distribuzione di alcuni ceppi di PA multi-resistente è stata studiata più diffusamente.Da questi studi emerge che, nonostante molti dei pazienti FC sviluppino un'infezione sostenuta da ceppi di PA ambientali, esistono ceppi particolari di questo patogeno in grado di trasmettersi da paziente a paziente (52;35). Per quanto, però, siano stati compiuti dei passi in avanti nelle metodiche di comparazione tra campioni di PA prelevati dall'ambiente e dai pazienti, non è ancora stato possibile identificare marker precisi che permettano di distinguere inequivocabilmente la provenienza del batterio.La selezione di un particolare ceppo a livello delle vie aeree del paziente, infatti, è determinata dalle condizioni di pressione ambientale, le quali causano delle modificazioni al patogeno tali da renderlo "unico" e rendendo dunque difficoltosa la determinazione della fonte dell'infezione.Nonostante ciò nel 1996, utilizzando tecniche molecolari quali l'elettroforesi in gel a campo pulsato (PGFE) e la genotipizzazione delle flagelline, è stato isolato per la prima volta un ceppo di PA francamente epidemico, il quale aveva infettato 55 pazienti afferenti al medesimo reparto pediatrico di Liverpool. Uno studio successivo condotto sugli adulti FC, afferenti al centro Fibrosi Cistica degli adulti della medesima città, ha dimostrato che su 80 di essi positivi per l'infezione da PA, 63 erano colonizzati dallo stesso ceppo che aveva causato l'epidemia nel centro pediatrico, ora noto come Liverpool Epidemic Strain (LES) (50).Le cause alla base della virulenza di PA sono ancora in gran parte sconosciute e vengono comunque attribuite all'acquisizione di diverse combinazioni di fattori specifiche per ogni ceppo epidemico. Il sequenziamento del genoma di tali ceppi, per ora pubblicato solo per pochi di loro tra i quali il LES nel 2009, permetterà di approfondire questa ipotesi (51).Nella figura 3 sono riassunti ed ordinati cronologicamente dal 1986 ad oggi i momenti salienti delll'identificazione e successiva genotipizzazione dei ceppi trasmissibili di PA. FIGURA 3. Linea temporale degli eventi che hanno portato all'identificazione e genotipizzazione dei ceppi trasmissibili di Pseudomonas aeruginosa. LES: Liverpool epidemic strain; MES: Manchester epidemic strain; AES: Australian epidemic strain; Mid1: Midlands strain. Da: Fothergill J et al. 2012 (52) Per il momento non sono state rilevate correlazioni genotipo/fenotipo tali da permetterne la distinzione clinica delle forme epidemiche da quelle non epidemiche. Questa distinzione risulta, però, di grande importanza per il clinico al fine di prevenire la diffusione del patogeno.La letteratura tende, quindi, a suggerire l'esecuzione della genotipizzazione dei campioni di PA prelevati dalle vie aeree dei pazienti FC a tempi definiti, al fine di identificare precocemente la colonizzazione da parte di un ceppo epidemico e mettere in atto le dovute misure precauzionali (53).