A seguito di applicazione cutanea l'assorbimento di clotrimazolo nel circolo ematico nell'uomo attraverso la cute intatta o infiammata avviene in misura insignificante. Le concentrazioni plasmatiche di picco ottenibili dopo applicazione topica sono sempre risultate al di sotto del limite di rilevamento. È perciò improbabile che clotrimazolo applicato localmente sulla pelle possa dar luogo a effetti indesiderati di tipo sistemico.