Molti casi di ipotiroidismo sono associati ad un lieve innalzamento nel sangue della creatinchinasi e degli enzimi epatici. Di norma, questi valori, ritornano alla normalità quando l'ipotiroidismo viene completamente trattato. Anche i livelli di colesterolo, della lipoproteine a bassa densità e della lipoproteina (a) possono essere elevati. L'impatto dell'ipotiroidismo subclinico sui parametri lipidici è però meno ben definito.