Dato che la malattia è molto contagiosa ed è trasmessa attraverso secrezioni oro-faringee, come saliva o muco nasale, attraverso il contatto diretto o attraverso la via oro-fecale, le misure preventive principali consistono nell'evitare il contatto diretto con individui infetti, nella corretta igiene degli utensili condivisi, nella disinfezione delle superfici contaminate e nel lavaggio accurato delle mani. Queste misure si sono dimostrate efficaci nel ridurre la trasmissione del virus responsabile della malattia mani-piedi-bocca.