Grazie ai meriti e all'indiscussa fama acquisita negli anni, George Huntington continuò a praticare l'attività di medico fino all'età di sessantacinque anni, quando il secondogenito Edwin lo convinse a ritirarsi nella città di Cairo, New York per godersi in tranquillità gli ultimi anni di vita. Morì l'anno successivo, il 3 marzo 1916, in seguito ad un forte attacco di bronco-polmonite.