Anche se un suo potenziale metabolita, lo steviolo, è un mutageno riconosciuto, il rebaudioside A di per sé non mostra nessun effetto carcinogeno. Non è nemmeno noto se tale metabolita venga effettivamente assorbito durante la metabolizzazione "in vivo". È solitamente presente insieme al suo isomero, il rebaudioside C (CAS 63550-99-2).