L'IL-16 è codificata dal gene "IL16" collocato sul cromosoma 15. Il prodotto del gene viene tagliato proteoliticamente dalla caspasi 3. Sembra che la regione N-terminale funga da regolatore del ciclo cellulare, mentre quella C-terminale funga da citochina. È secreta da linfociti e da alcuni tipi di cellule epiteliali.