Studente in medicina all'Università di Vienna, Ferdinand Hebra subì l'influenza di Karl Rokitansky, uno dei fondatori della moderna anatomia patologica. Laureatosi nel 1841, si interessò di malattie della pelle di molte delle quali (per esempio, la scabbia) stabilì l'origine parassitaria. Il suo titolo di merito è stato l'aver messo in relazione le malattie della pelle con le lesioni anatomo patologiche. Medico al Wiener Allgemeinen Krankenhaus (Ospedale Generale di Vienna), da "Privatdozent" nel 1842 tenne un corso intitolato "Systemen und Theorien in der Dermatologie" (I sistemi e le teorie in dermatologia) e nel 1845 divenne professore ordinario all'Università di Vienna e caposcuola della moderna dermatologia. Fra i suoi allievi anche gli italiani Vincenzo Tanturri e Tommaso De Amicis. Sposatosi, ebbe sette figli, uno dei quali, Hans divenne anch'egli professore di dermatologia a Vienna, e Martha che sposò Moritz Kaposi.