I vaccini sono stato spesso accusati di contenere sostanze potenzialmente nocive, che tuttavia risultano presenti in quantità innocue, come alluminio, formaldeide (generalmente assente, o presente in quantità comunque inferiori a quelle ambientali), lattice, tungsteno; altre (come lo squalene, l'albumina umana, il glicole propilenico, il fenossietanolo e glutammato monosodico, la gentamicina solfato e la neomicina solfato, il polisorbato e il sorbitolo, l'amfotericina B e il beta-propiolattone) non sono intrinsecamente pericolose per la salute umana.