Eduard Bloch nacque a Frauenburg, un piccolo villaggio nel Sud della Boemia, in una famiglia di origine ebraica. Studiò medicina a Praga e successivamente si arruolò nell'esercito austriaco come medico militare. Nel 1901 al termine del suo servizio decise di rimanere a Linz, città in cui ebbe il suo ultimo incarico, ove aprì uno studio medico privato e visse con sua moglie Emilie Kafka (donna ebrea lontana parente di Franz Kafka) e la sua unica figlia Gertrude Bloch fino al 1940. In questa città egli entrò in contatto per la prima volta con la famiglia di Adolf Hitler.