Nel 1840 ottenne la cattedra di anatomia e fisiologia all'università di Zurigo, continuando un'intensa attività di ricerca in ambito istologico. Mentre era a Zurigo pubblicò il suo trattato "Allgemeine Anatomie" (Anatomia generale) giudicato la prima opera sistematica dedicata all'istologia. Sempre durante la sua permanenza a Zurigo, fondò col clinico Karl von Pfeufer (1806-1869) "the Zeitschrift für rationelle Medicin", che divenne una delle più importanti riviste mediche di lingua tedesca.