Il 90% dei neonati con sifilide congenita presenta epatosplenomegalia. Il fegato è duro e può essere lievemente o fortemente ingrossato, a seconda della gravità del coinvolgimento epatico. Ogni epatomegalia inspiegabile richiede un accertamento per una possibile sifilide congenita, dal momento che la malattia si può presentare anche senza splenomegalia. Un ingrossamento della milza, invece, non avviene senza epatomegalia. Le anomalie nel funzionamento epatico sono probabilmente simili a quelle degli altri tipi di epatiti neonatali. L'ittero si presenta in un 33% dei pazienti. Può essere causato dall'epatite sifilitica (aumento della bilirubina diretta ed indiretta) o dalla componente emolitica della malattia. Quindi, la diagnosi differenziale di un ittero che si protrae o inizia dopo la prima settimana di vita deve includere la sifilide congenita 29 .