Nel 1763, Gatti aveva effettuato più di cento inoculazioni, quando la pratica si trovò al centro di un acceso dibattito: alcuni medici parigini, infatti, avevano definito le inoculazioni “fonti di contagio” e causa delle più recenti epidemie che avevano colpito la capitale francese. Questa contesa portò ad un'inchiesta del Parlamento di Parigi, che incaricò la facoltà di Medicina di determinare la pericolosità delle inoculazioni, pratica che fu dichiarata “ammissibile” nel gennaio del 1768.