La degranulazione dei mastociti indotta dagli anticorpi IgE tipica dell'anafilassi, non è evidente nella FDEIA dove la sola ingestione del cibo allergizzante non scatena reazioni allergiche. Varie ipotesi sul concorso di più fattori cercano di spiegare l'eziopatogenesi della FDEIA. Molti cibi diversi sembrano correlati alla FDEIA con una prevalenza di casi riportati associati al grano e ai crostacei. Anche il tipo di esercizio fisico non è determinante, la maggioranza dei casi riportati riguardano il jogging e le camminate. I meccanismi per cui il concorso di fattori diversi caratterizza la FDEIA non sono chiari.