Il "L. reuteri" è stato studiato anche per il trattamento della diarrea, specialmente nei bambini. Il "L. reuteri" riduce significativamente il numero di evacuazioni e la durata della diarrea rispetto ad un placebo, in bambini dai 6 ai 36 mesi. È stato dimostrato che il L. reuteri svolge anche un'azione preventiva nei confronti della diarrea e delle più comuni infezioni intestinali in età pediatrica.