Il complesso ospedaliero fu costruito nel rione Celio fra il 1885 e il 1891, su progetto di Salvatore Bianchi e del colonnello del Genio Luigi Durand de la Penne, al centro di una vasta zona espropriata dal demanio militare sull'area precedentemente occupata dalla villa Casali, in prossimità del sito medioevale di Santo Stefano Rotondo, che aveva anch'esso un ospedale annesso al monastero. Durante gli scavi per la costruzione furono ritrovate un gruppo di ricche dimore romane, tra le quali quella dei "Simmachi", e i resti della Basilica Ilariana.