La consulenza genetica deve essere sempre offerta ai genitori dei bambini con diagnosi di glicogenosi di tipo II; è importante redigere un albero genealogico di tre generazioni a partire dal probando.Poiché si tratta di una malattia a trasmissione autosomica recessiva e le mutazioni de novo risultano piuttosto rare, i genitori del probando sono portatori sani obbligati. Il rischio di ricorrenza nelle gravidanze successive è pari al 25% 28 .Per identificare gli altri membri della famiglia portatori di un allele mutato è necessario eseguire l'analisi genetica, ricercando le specifiche mutazioni riscontrate nel paziente affetto.Proprio per il rischio di ricorrenza, negli ultimi anni sono state sviluppate diverse tecniche per eseguire una corretta diagnosi prenatale.È possibile effettuare un'amniocentesi (tra la XIV e la XVIII settimana) ed analizzare l'attività catalitica della GAA sul fluido prelevato; la valutazione al microscopio elettronico delle cellule disperse nel liquido amniotico rileva i lisosomi rigonfi e il glicogeno al loro interno 122 .Attualmente, il metodo più efficace per la diagnosi prenatale è l'analisi dell'attività enzimatica direttamente su cellule di villi coriali non coltivate; la misurazione avviene a pH 4.0 e utilizza come substrato il 4-MUG. Questa tecnica è estremamente vantaggiosa, poiché permette una diagnosi veloce (1 giorno) durante le prime fasi della gravidanza (XII settimana); inoltre, la maggiore attività dell'alfa-glucosidasi a livello dei villi coriali, rispetto agli amniociti, facilita l'interpretazione di casi dubbi.Se sono state identificate le mutazioni dei genitori, soprattutto nei casi dubbi, è possibile confermare la diagnosi enzimatica tramite l'analisi del DNA.