La diagnosi di blastomicosi si effettua mediante identificazione della forma di lievito di "B. dermatitidis" in campioni di espettorato, liquido cerebrospinale, urina o biopsia polmonare al microscopio e tramite coltura. Il fungo può essere colorato con ematossilina-eosina, Giemsa o PAS. "B. dermatitidis" è un fungo dalla lenta crescita che richiede almeno 1 mese di incubazione. La forma miceliale non è diagnostica, e ciò, unito alla bassa incidenza, può portare ad errori diagnostici.