Nel genere umano il gene che codifica per la PAPP-A è localizzato a livello del cromosoma 9q33.1 89 mentre nel topo è localizzato a livello del cromosoma 4 90 .Nella specie umana il gene contiene 22 esoni separati da 21 introni. La sequenza di cDNA della PAPP-A umana codifica per un prodotto di traduzione di base formato da 1626 aminoacidi, che comprende un peptide segnale di 22 residui, una proproteina di 58 residui e una proteina matura di 1546 aminoacidi. Non è ancora stata attribuita una funzione specifica al pro-peptide ma sembra non sia necessario né per la conformazione né per la secrezione della proteasi matura.Le sequenze di aminoacidi della PAPP-A mostrano una notevole conservazione e ciò suggerisce una funzione essenziale della PAPP-A in una numerosa varietà di specie di mammiferi. Le sequenze di aminoacidi tra la specie umana e il topo e tra la specie umana e il ratto sono identiche per il 91% 91 