Durante la prima guerra mondiale Alport prestò servizio presso il Royal Army Medical Corps nell'Africa sud occidentale, in Macedonia e Salonicco. Dopo la guerra, Alport ha conseguito il dottorato di ricerca con la sua tesi nel 1919 presso la facoltà di medicina dell'Università di Edimburgo. Alport ha lavorato come specialista in medicina tropicale presso il Ministero delle Pensioni, a Londra. Dal 1922 ha lavorato per quattordici anni sotto la guida del professor Frederick Samuel Langmead (1879-1969) come assistente direttore della nuova unità medica al St. Mary's Hospital di Paddington.