Whytt si dedicò allo studio dell'anatomia, sotto il primo Monro. Andando a Londra nel 1734, Whytt divenne allievo di William Cheselden, mentre visitò i reparti degli ospedali di Londra. Dopo ciò, frequentò le lezioni di Jacob B. Winslow a Parigi, di Herman Boerhaave e Bernhard Siegfried Albinus a Leida. Prese il grado di M.D. a Reims il 2 aprile 1736. Il 3 giugno 1737 gli venne conferita una laurea simile dall'Università di St Andrews ed il 21 giugno fu abilitato alla professione dal Royal College of Physicians di Edimburgo. Il 27 novembre 1738 gli fu data la borsa di studio, e cominciò la pratica di medico.