La sua carriera di psichiatra e neurologo indipendente iniziò quando sua moglie Eva, figlia di Johannes Gad, accettò di ospitare pazienti depressivi nella sua casa, pazienti dei quali ella curava i figli e si occupava di lavori domestici. In seguito, Kohnstamm e la moglie decisero di costruire un piccolo sanatorio per trattare questi pazienti. La casa, costruita in stile Jugendstil, fu inaugurata nel 1905 e fu ampliata nel 1912. Kohnstamm utilizzò spesso l'ipnosi come metodo di cura dei suoi pazienti, pur non essendo fervido sostenitore di Sigmund Freud.