La terapia genica rappresenterebbe nel futuro la cura definitiva delle malattie lisosomiali, perché fornirebbe una fonte endogena di enzima, apportando una copia normale del gene per la proteina deficitaria negli organi target.Le LSDs sono ottime candidate per la terapia genica in quanto sono determinate da disordini coinvolgenti un solo gene in molti casi ed è necessaria un'attività enzimatica pari a solamente il 15%-20% del normale.Più di 4000 pazienti sono stati arruolati in 300 protocolli di terapia genica per patologie monogeniche, come ad esempio la malattia di Gaucher, la SCID (X-linked severe combined immunodeficiency), il deficit di ornitinatranscarbamilasi e la fibrosi cistica, oppure patologie acquisite come il cancro, l'AIDS, alcune malattie reumatologiche e cardiovascolari 195 .Sebbene siano stati raggiunti alcuni risultati, l'applicabilità di questa metodica su vasta scala clinica non è ancora possibile. Per le LSDs sono stati studiati due diversi approcci: il primo si fonda sul trasferimento diretto di geni in organi specifici, come ad esempio il SNC, facendo uso di vettori virali (adenovirus o lentivirus) 196,197 ; la seconda metodica prevede il prelievo di cellule staminali emopoietiche dal paziente, la loro modificazione ex vivo affinchè producano l'enzima deficitario e il loro reimpianto attraverso il trapianto di midollo osseo autologo. La tecnica in vivo ha permesso di ottenere buoni risultati in diversi modelli animali e la sua applicazione su un gruppo di pazienti affetti da lipofuscinosi ceroide neuronale ha determinato un miglioramento dei parametri cerebrali misurati con la risonanza magnetica 198 . La tecnica ex vivo invece, impiegata a livello animale per aumentare la produzione di arylsulfatasi A, attualmente ha dato buoni risultati ottenendo anche il miglioramento del difetto neurologico 199 . Permangono tuttora irrisolti i problemi connessi con le interazioni trascrizionali osservate nelle cellule trattate con vettori, soprattutto se di grosse dimensioni.