Gran parte della comunità di ricerca sulla ME/CFS considera l'infiammazione come un dato di fatto. Il nome stesso assunto dai CDC, "encefalomielite mialgica", significa essenzialmente "dolore muscolare correlato all'infiammazione del sistema nervoso centrale" e molti sforzi per trovare biomarcatori diagnostici si sono concentrati su uno o più aspetti della neuroinfiammazione, dalla periferia al cervello. 