Alla sua scomparsa, la città di Firenze gli intitolò una via e pose una lapide commemorativa sulla porta della sua residenza fiorentina che recita: "Qui abitò ed ottuagenario morì il III di' di marzo del MDCCCLXXXI Ferdinando Zannetti, medico chirurgo, senatore del regno e, fra i veterani delle patrie battaglie, presidente. Degno di passare ai posteri per la scienza onorata sulla cattedra esercitata nel popolo con carità e per l'amore all'Italia serbato in ogni tempo eguale, vivo e incorrotto".