Francesco Crucitti è morto a Roma il 26 agosto 1998 all'età di 67 anni: i funerali sono stati celebrati dal cardinale Sodano nella chiesa dell'Università Cattolica e Giovanni Paolo II si è recato nella sua abitazione per impartirgli l'ultima benedizione e ringraziare i suoi familiari. In occasione della sua morte i cittadini di Reggio Calabria gli hanno porto l'estremo saluto sfilando in silenzio nella sala consiliare e nella cattedrale.