Terminato il periodo di studio previsto a Berlino la Morton si spostò a Vienna, dove entrambi i suoi fratelli, laureati in medicina al Virginia Medical School, seguirono il corso di specializzazione. Qui assistette a numerosi interventi ed autopsie, imparò a formulare diagnosi appropriate, e dopo aver familiarizzato con numerose tecniche chirurgiche, decise di dedicarsi alla ginecologia affiancandosi al Dr. Adolf Gusserow, chirurgo ginecologo.