Küstner si è specializzato in ginecologia e nel parto. Ci sono una serie di eponimi medici a lui collegate, tra cui un gancio di estrazione ostetrica conosciuta come ""Steißhaken di Küstner". Fu autore di un libro di testo, sulla ginecologia, intitolato "Kurzes Lehrbuch der Gynäkologie"" (1901, 9ª edizione 1922).