Holmes conservava il desiderio di avventura e nel 1901 partecipò alla spedizione Discovery al Polo Sud di Robert Falcon Scott (1868-1912). Una rottura del tendine d'Achille rese necessario l'abbandono della spedizione e Holmes durante il periodo di convalescenza continuò i suoi studi di approfondimento, ottenendo un ulteriore titolo specialistico. Nel 1910, dopo la morte improvvisa di un suo anziano collega, Holmes fu inserito nel personale del "National Hospital". Da quel momento in poi si dedicò all'attività clinica e didattica come volontario in questo ospedale e contemporaneamente esercitò l'attività medica nel suo studio privato.