Andato in pensione nel 1941, durante la Resistenza fu tra i fondatori del Comitato di Liberazione Nazionale di Mirandola, prodigandosi per curare molti partigiani feriti, organizzandone la fuga dall'ospedale di Mirandola, di cui era il direttore e primario della divisione di medicina. Il 21 aprile 1945 ricevette l'ordine sgombrare l'ospedale cittadino, riservandolo ai soldati nazisti in ritirata, ma Merighi prese tempo in attesa della liberazione della città (avvenuta la sera del giorno dopo).