Usato in associazione con il warfarin, fondaparinux è efficace anche nel trattamento dell’embolismo polmonare. In uno studio randomizzato sono stati comparati gli effetti di Fondaparinux ed eparine a basso peso molecolare in pazienti affetti da questa patologia: i risultati hanno dimostrato una simile efficacia nella prevenzione di eventi tromboembolici. Circa il 14,5% dei pazienti trattati con fondaparinux sono stati dimessi precocemente dall’ospedale e hanno proseguire la terapia autonomamente a casa.