Per le forme maligne di SM è stato sperimentato, in un numero limitato di pazienti e come trattamento di salvataggio, il trapianto di cellule staminali ematopoietiche autologhe (autologous haematopoietic stem cell transplant, AHSCT), preceduto da una fase d'intensa immunosoppressione ed eradicazione del sistema immunitario autoreattivo. Alcuni studi immunologici 179 hanno evidenziato, a seguito di AHSCT, un marcato incremento dei linfociti CD4+CD25+ (cellule dotate di potenziale immunoregolatore), una riduzione degli autoanticorpi e una persistente riduzione delle cellule CD4+ memoria, in favore di cellule CD4+ naϊve. Tutte queste evidenze suggeriscono come il trapianto autologo possa essere in grado di modulare il sistema immunitario, ripristinando i sistemi di autoregolazione e tolleranza in modo da controllare l'autoimmunità 180 .A partire dal 1995 più di 500 pazienti affetti da SM sono stati trattati con intensa immunosoppressione seguita da AHSCT, seguendo protocolli diversi, distinguibili in schemi ad alta, intermedia o bassa intensità. I primi sembrano correlati ad un più alto tasso di mortalità e, per questo, la maggioranza dei trial ha utilizzato schemi ad intermedia intensità. Altri, mirando alla riduzione degli effetti collaterali, hanno considerato schemi di terapia a bassa intensità, con risultato linfoablativo più che mieloablativo, ma con una minor efficacia nello spegnere l'attività infiammatoria a livello del SNC, come dimostrato dall'attività di RMN 181 . Un'analisi di 74 pazienti trattati con AHSCT dal 1996 al 2008 in Italia, dopo un follow-up medio di quattro anni, ha dimostrato una sopravvivenza libera da progressione di malattia (PFS) del 66%, con migliori risultati clinici nei pazienti di età inferiore a 40 anni e nei casi di SM-RR (PFS 71%), rispetto alle forme SP (PFS 46%) 182 . Gli effetti collaterali, secondari all'immunosoppressione (febbre neutropenica, rischio di sepsi, complicanze infettive, riattivazione di CMV o VZV), e il rischio di mortalità correlata al trapianto rappresentano gli anelli deboli della terapia e ne limitano l'utilizzo nella pratica cinica. La maggior esperienza in campo trapiantologico, l'esclusione di regimi di condizionamento ad alta intensità e la miglior selezione dei pazienti ha permesso di passare da un tasso di mortalità del 7.3% prima del 2000, all'1,3% nel periodo 2001-2007 182 .