Il Piano Sanitario Nazionale indica obiettivi di carattere prioritario rilevanti per l'intero territorio italiano, per i quali sono vincolate quote del Fondo Sanitario Nazionale, assegnate alle Regioni per la predisposizione di specifici progetti, "sulla scorta di linee guida proposte dal Ministero della Salute e approvate con Accordo in sede di Conferenza Stato-Regioni". L'Accordo annuale della Conferenza permanente Stato-Regioni in merito alle "linee progettuali per l'utilizzo, da parte delle Regioni, delle risorse vincolate" -(e le eventuali intese)- erano stipulato nella cornice del Patto per la Salute (accordo finanziario e programmatico con orizzonte di riferimento triennale). La valutazione dei progetti e l'erogazione dei fondi alle Regioni in passato sono stati subordinati alla valutazione favorevole del Comitato permanente per la verifica dei Livelli Essenziali di Assistenza.