L'effetto sulle cellule nervose del cervello porta anche a funzioni cognitive alterate, inclusa la memoria a breve termine. È comune per le persone affette da questa malattia avere difficoltà a trovare e comprendere le parole in una conversazione e iniziare a ripetere parole e frasi (ekolali). Alcuni smettono di parlare completamente (mutismo). Il cambiamento nelle funzioni cognitive a volte può essere oscurato dai sintomi mentali.