L'osteomielite cronica può essere dovuta alla presenza di batteri intracellulari (all'interno delle cellule ossee). Questi batteri sono inoltre in grado di sfuggire e invadere le altre cellule ossee. I batteri possono essere resistenti a alcuni antibiotici. Questi elementi combinati possono spiegare la cronicità e la difficoltà nell'eradicazione di questa malattia, con conseguenti costi notevoli e disabilità, che possono condurre fino all'amputazione.