Il 21 novembre 1943, Kornberg sposò Sylvy Ruth Levy, anche lei una nota biochimica. Ha lavorato a stretto contatto con Kornberg e ha contribuito in modo significativo alla scoperta della DNA polimerasi. Secondo il loro secondo figlio, Thomas: "scherzando in famiglia - ed era solo uno scherzo - quando il premio è stato annunciato, lei ha detto 'Sono stato derubata!'" 