La sindrome clinica dell'endocardite infettiva è estremamente variabile (oscillando tra la presentazione acuta e quella subacuta) e può coinvolgere differenti organi.Il periodo di latenza fra l'evento responsabile di batteriemia e l'esordio dei sintomi è, nella maggioranza dei casi, abbastanza breve, prolungandosi non oltre 15 giorni, ma occasionalmente può prolungarsi anche per 5-6 mesi, come si può osservare dopo intervento di cardiochirurgia 114 .Diversamente, il periodo che va dall'esordio dei sintomi al momento della diagnosi, soprattutto nelle forme di endocardite subacuta, è abbastanza lungo e la media si attesta intorno alle 5 settimane 1 .Le manifestazioni cliniche comprendono generalmente la febbre e sintomi e segni cardiaci ed extracardiaci, che dipendono dall'infezione valvolare, dall'embolizzazione di parte delle vegetazioni, dalle complicanze ascessuali dovute alla diffusione del processo infettivo e dalla risposta immunologica all'infezione (che può portare alla formazione di vasculiti da immunocomplessi). 