La rifampicina viene utilizzata normalmente per curare le infezioni dovute ai "Mycobacterium", incluse la tubercolosi e la lebbra; ha inoltre un ruolo nella cura dello "Staphylococcus aureus" meticillina-resistente insieme all'acido fusidico, lo streptococco β-emolitico del gruppo A e, soprattutto, clamidie. 