Nell'anno accademico 1898-1899 Antigono Raggi abbandonò la cattedra di psichiatria all'Università di Pavia e Golgi fece in modo che la ottenesse Mondino. Quest'ultimo, divenuto altresì direttore della clinica psichiatrica pavese, propose di creare un istituto nevrapatologico; Golgi, in veste di senatore del Regno d'Italia, sostenne l'idea nel luglio 1900 con Nicolò Gallo, allora ministro della pubblica istruzione. All'istituto venne così dato il nome, con delibera ministeriale, dello stesso Mondino, che divenne professore emerito dell'Università di Palermo nell'anno accademico 1902-1903.