Con il desiderio di frequentare l'Università Johns Hopkins, la Sabin insegnò matematica a Denver per due anni e zoologia presso lo Smith College per un anno, con il fine di guadagnare abbastanza denaro da permettersi il primo anno di lezioni. Nel 1896 fu ammessa presso l'Università Johns Hopkins e quattro anni dopo, nel 1900, divenne una delle prime donne laureate dell'università.