Quando il reticolo endoplasmatico (RE) è sottoposto a stress, la cellula risponde attivando la risposta UPR (Unfolded Protein Response) che consiste nell'attivazione di alcuni pathways molecolari al fine di interrompere la sintesi proteica e di incrementare la produzione di chaperones molecolari. Nei casi in cui non venga ripristinata l'omeostasi cellulare in un determinato lasso di tempo, viene attivata la risposta UPR terminale che avvia la cellula verso l'apoptosi. Alcuni studi hanno dimostrato che alcuni marcatori di attivazione UPR sono elevati a livello delle cellule alveolari di tipo II in pazienti affetti da IPF [12].