L'agoaspirato del midollo può essere effettuato da diverse ossa. Nei soggetti adulti il punto più utilizzato è la cresta iliaca anteriore o posteriore (medesima sede della biopsia ossea). L'agoaspirato può però essere effettuato anche da ossa più sottili. Un osso molto utilizzato è lo sterno, che per lo spessore minore non è invece adeguato per essere sottoposto a biopsia. Il prelievo dallo sterno è anche conosciuto anche con il nome di "puntura sternale". In età pediatrica si possono utilizzare anche altre ossa. L'agoaspirato si differenzia dalla biopsia del midollo osseo per l'utilizzo di un ago molto più sottile cui è collegata una siringa con cui si effettua il prelievo. Nell'agoaspirato inoltre non si attua l'incisione della cute. Si tratta quindi di un'operazione meno invasiva e meno dolorosa.