In data 1 Novembre 1998 il Prof. Francesco Montorsi è risultato vincitore di un posto di Professore Universitario di ruolo, fascia degli Associati, nel raggruppamento disciplinare E09A Anatomia Umana. Nel marzo 2002 ha preso servizio come Professore Associato di Urologia presso la Università Vita-Salute San Raffaele, Milano. Dal 2002 al 2011 è stato Segretario della Scuola di Specializzazione in Urologia presso l’Università Vita-Salute San Raffaele di Milano, diretta dal Prof. Patrizio Rigatti. Nell’Ottobre 2008 ha preso servizio come Professore Ordinario di Urologia presso l’Università Vita-Salute San Raffaele di Milano. Dal 2012, a seguito del passaggio del Prof. Patrizio Rigatti all’Istituto Auxologico, diventa Direttore dell’Unità Operativa di Urologia dell’IRCCS Ospedale San Raffaele e Direttore della Scuola di Specializzazione in Urologia dell’Università Vita Salute San Raffaele di Milano.