Per tutti gli HPV la trasmissione avviene per contatto diretto, da persona a persona, nei rapporti stretti o per autoinoculazione. È possibile, ma non comune, la trasmissione da parte di oggetti contaminati. Le verruche cutanee (non genitali) si contraggono attraverso piccole lesioni cutanee.L'incidenza aumenta con la frequentazione di piscine pubbliche. I soggetti con alterazioni immunitarie sono predisposti alla riattivazione di infezioni latenti e a una maggiore diffusione e gravità. Le verruche ano-genitali sono trasmesse principalmente con contatti sessuali. L'HPV si trasmette attraverso i rapporti sessuali con partner portatori del virus, durante contatti stretti tra pelle e pelle.Per il trasporto del virus è necessario che vi siano cellule vive, questo spiega perché è rara la trasmissione tramite oggetti a meno che su di essi non siano rimaste secrezioni mucose contenenti cellule vive ed infette dal virus.