Mentre studiava sotto Tegault, cominciò la sua carriera da professore, insegnando anatomia al Collège de Tréguier con un corso esplicativo dei lavori di Ippocrate e Galeno. Il successo delle sue lezioni fu tale che la Facoltà dell'Università di Parigi protestò per il fatto che non avesse ancora conseguito una laurea. Per questo motivo Sylvius si recò a Montpellier, dove, nel novembre del 1529, conseguì la laurea in medicina, all'età di 51 anni, e l'anno successivo conseguì anche un dottorato. Ottenuta la laurea tornò a Parigi, ma fu nuovamente bloccato dalla Facoltà, la quale decretò che l'anatomista avrebbe dovuto conseguire anche una laurea in medicina anche nel locale ateneo, prima di riprendere le sue lezioni. Il 28 giugno 1531 Sylvius ottenne la laurea e poté riprendere il suo corso di anatomia.