Nell'Ottobre del 2005, Baltimore lasciò il posto di presidente di Caltech, affermando: “Questa non è una decisione a cui sono giunto facilmente, ma sono convinto che per l'interesse dell'istituto sia meglio che ci sia una transizione presidenziale in questo particolare periodo…” Subito dopo, su richiesta di Baltimore, l'università iniziò ad investigare il lavoro che Luk van Parijs aveva seguito nel laboratorio di Baltimore. Lo scienziato divenne sospetto al MIT, per via del lavoro fatto dopo aver lasciato il laboratorio di Baltimore. Dopo essere stato licenziato al MIT, il suo supervisore notò dei problemi con i suoi lavori al Brigham and Womem's Hospital, prima di lasciare Harvard per andare al laboratorio di Baltimore. Concluse nel marzo del 2007, le investigazioni rivelarono che van Parijs, da solo, ebbe una cattiva condotta scientifica, falsificando dati, e che quattro trattati, scritti assieme a Baltimore, necessitarono di correzioni.