Sugammadex è stato generalmente ben tollerato negli studi clinici su pazienti chirurgici o volontari sani. Nelle analisi congiunte, il profilo di tollerabilità di sugammadex era generalmente simile a quello del placebo o della neostigmina più il glicopirrolato. Sugammadex può teoricamente interferire con i contraccettivi ormonali a causa delle prove di studi di legame in vitro che hanno dimostrato che può legarsi al progestinico.