Il primo fondo (1801 - 1886) comprende: Perizie, Materiale didattico e corrispondenza relativa all'attività medico chirurgica, Studi preparatori a pubblicazioni, Corrispondenza e scritti riguardanti l'attività municipale e militare. Si può supporre che le carte siano state donate a S. Maria Nuova insieme alla biblioteca dagli eredi di Ferdinando poco dopo la sua morte, avvenuta a Firenze il 3 marzo 1881, e che poi siano giunte negli attuali locali della biblioteca di Careggi in seguito al trasferimento del materiale librario appunto da S. Maria Nuova nel 1937. Attualmente è conservato presso la Biblioteca biomedica dell'Università degli studi di Firenze. Fa parte del fondo anche la ricca "libreria" di più di millecinquecento volumi a stampa, in gran parte trattati di medicina dell'Ottocento, ma anche delle cinquecentina e dei pregiati atlanti anatomici. 