Campioni di progenitori (CD34+CD38+) e dalla controparte staminale (CD34+ CD38-) di 5 pazienti affetti da Leucemia Mieloide Cronica all'esordio, derivati dal dataset Gene Expression Ominbus GSE43754, sono stati messi a confronto utilizzando il software GEO2R al fine di ottenere dati di espressione genica differenziale. GEO2R è un software in grado di mettere a confronto i dati di espressione ottenuti utilizzando i pacchetti R GEOquery e limma [155,156]. Gli identificativi (ID) delle sonde sono stati annotati usando il software Ensembl Biomart e GRCh38.p12 come genoma umano di riferimento. In caso di annotazione multipla di sonde diverse sullo stesso gene, è stato mantenuto il valore corrispondente alla sonda con un p value inferiore.     