Il meccanismo di attivazione del dominio catalitico tramite l'inattivazione di PARP si basa sulla separazione della regione DNA-binding e del dominio di auto modificazione. In questo modo il dominio DNA-binding si leghera ad un sito danneggiato e non sarà in grado di effettuare la riparazione, in quanto non ha più il dominio catalitico. Il dominio DNA-binding in questo modo impedisce alle PARP non scisse di accedere a i siti danneggiati.