Sono generalmente interventi più invasivi rispetto alle altre metodiche ma offrono al paziente obeso maggiori probabilità di riuscire a mantenere la riduzione del peso corporeo nel lungo periodo. Appartengono a questo tipo le tre varianti di diversione biliopancreatica: classica di Scopinaro, variante con resezione gastrica verticale ("switch" duodenale) e variante con conservazione dello stomaco.