Passata la Toscana sotto il governo francese, ovvero annessa alla Francia, Palloni fu insignito del titolo di Medico dell'epidemie, e venne nominato membro del Giurì di Medicina nel dipartimento del Mediterraneo. Da Gioacchino Murat fu creato Cavaliere dell'Ordine reale delle Due Sicilie; ed quando la Toscana tornò sotto i Lorena gli venne conferito l'Ordine del Merito sotto il titolo di S. Giuseppe. Oltre a ciò, nel gennaio del 1818, fu dichiarato medico di Camera della Duchessa di Lucca, già Regina d'Etruria; e nel maggio del 1826 fu ascritto dal Gran Duca alla Nobiltà Livornese, per grazia richiesta spontaneamente dal Civico Magistrato di Livorno. E Carlo Botta, nella sua Storia d'Italia, parlando della febbre gialla di Livorno, dedicò a Palloni un elogio spontaneo ove riconobbe a lui la gloria di averne domato l'impeto e impedita la diffusione.