Diversi lavori mostrano come l'attività del VDR possa essere compromessa per la presenza di determinati polimorfismi a singolo nucleotide (SNP). È stato dimostrato che l'omozigosi per l'allele B del SNP BsmI e l'allele t del SNP TaqI è associata con livelli più bassi della proteina VDR [17]. Inoltre una variante genetica del VDR (Cdx2) è stata associata a ridotti livelli della relativa proteina nel tumore alla mammella [18] e questo sembra correlare con un fenotipo tumorale più aggressivo. In modo simile, si è visto che i polimorfismi TaqI e Fok del gene del VDR sono associati ad un aumento del rischio di sviluppare il melanoma cutaneo [19] e i ridotti livelli di VDR correlano con un fenotipo tumorale maligno [20]. Inoltre, la presenza di polimorfismi del VDR è stata poi analizzata negli studi di caso-controllo in moltissime patologie, dal diabete mellito di tipo 2 [21] al morbo di Crohn [22], per citarne alcune; anche in queste malattie alcune varianti genetiche del VDR sono correlate ad una ridotta quantità di VDR in grado di svolgere le sue funzioni.