La cheratoplastica perforante è la forma di trapianto più frequente e può portare all'insorgenza di un astigmatismo irregolare. Si effettua asportando con l'ausilio di particolari trapani cilindrici cavi di varie dimensioni in base alle esigenze del momento la porzione di cornea da sostituire dall'occhio del donatore (un cadavere). Generalmente si asporta un tessuto del diametro di 8,25 mm, sebbene nel ricevente si sia creato lo spazio per tessuto corneale del diametro di 8 mm poiché si tiene conto dei processi di cicatrizzazione e di retrazione cicatriziale della cornea del donatore.