La sezione rettale passa al disotto della cerniera rettosigmoidea. Il retto viene liberato dal tessuto cellulare che lo circonda ed il mesoretto viene circoscritto e quindi sezionato dopo emostasi con punti o coagulando.In caso di anastomosi manuale il retto viene sezionato con le forbici dopo aver disposto un enterostato sul colon a monte e dopo avervi passato due-tre punti di repere e di trazione che ne garantiranno l'esposizione. Il retto, non appena aperto, viene lavato sul letto operatorio con soluzione di Betadine®.In caso di anastomosi meccanica il retto viene sezionato dopo averlo chiuso con applicazione di suturatrice lineare. Viene afferrato dal chirurgo con la mano sinistra e la suturatrice viene passata intorno al viscere da destra verso sinistra prima di essere chiusa. È importante controllare che l'estremità della pinza non comprenda strutture vascolari o nervose della pelvi. Il retto viene sezionato con il bisturi tagliente.La sezione del colon viene eseguita differentemente a seconda che si voglia confezionare un'anastomosi latero-terminale o termino-terminale.