Scoppiata la guerra la BNA partecipa al finanziamento bellico con un cospicuo assorbimento in proprio dei buoni del tesoro ed il rastrellamento di prestiti presso la clientela. Questa operazione consente una doppia ricapitalizzazione dell'istituto, la prima da 30 a 50 milioni e la seconda da 50 a 60, entrambe attraverso l'emissione di azioni privilegiate ai sottoscrittori. Il 4 dicembre 1940, dando conto di un incontro tra Armenise e Mussolini, il Messaggero scrive in proposito: