Il rischio di esposizione è elevato per gli operatori ospedalieri e per coloro che si occupano di quelli che sono stati infettati dal virus. In Malesia e Singapore, l'infezione da virus Nipah si è verificata in soggetti a stretto contatto con suini infetti. In Bangladesh e India, la malattia è stata collegata al consumo di linfa di palma da dattero grezza (toddy) e al consumo di frutta parzialmente consumata dai pipistrelli e all'utilizzo di acqua proveniente da pozzi abitati da pipistrelli. 