I pazienti con esofagite erpetica frequentemente accusano odinofagia, o deglutizione dolorosa e disfagia. Altri sintomi possono includere l'occlusione da cibo, il singhiozzo, la perdita di peso, febbre, e, in rare occasioni, sanguinamento gastrointestinale del tratto superiore, e fistola tracheoesofagea. Spesso si possono vedere lesioni erpetiformi nella bocca e sulle labbra.