Si tratta di una lipasi acidica secreta dalle cellule principali delle ghiandole del fondo dello stomaco e funziona a un pH ottimale compreso tra 3 e 6. Insieme alla lipasi linguale è una delle due lipasi acidiche che, a differenza delle lipasi alcaline come quella pancreatica, non necessitano di acidi biliari o di colipasi per un'attività enzimatica ottimale. Insieme sono responsabili del 30% dell'idrolisi dei lipidi che avviene durante la digestione negli adulti, con la lipasi gastrica che apporta il maggior contributo. Nei neonati sono molto più importanti, dal momento che provvedono alla metà della totale attività lipolitica.