L'etinilestradiolo è anche usato come terapia ormonale per la menopausa. Il motivo principale dell'uso della TOS nelle donne in menopausa è quello di alleviare i comuni sintomi vasomotori come vampate di calore, sudorazione notturna e vampate di calore. Gli studi hanno scoperto che la sostituzione degli estrogeni aiuta a migliorare questi sintomi rispetto a un placebo. Altri sintomi comuni della menopausa come secchezza vaginale (che può causare dolore durante i rapporti sessuali), prurito vaginale e umore depresso, possono beneficiare della TOS. Oltre al trattamento dei sintomi della menopausa, l'etinilestradiolo ha utilizzato l'etinilestradioln come componente della terapia ormonale femminizzante per le donne transgender. Tuttavia, non è più comunemente usato né raccomandato per questo scopo, con l'estradiolo che lo ha ampiamente sostituito.