Aspetto istologico simile alla glomerulosclerosi focale e segmentaria, con alcune peculiarità: collasso glomerulare; minima ialinosi glomerulare ed aumento relativamente scarso della matrice; importante ipertofia e degenerazione delle cellule epiteliali; diffusa ed evidente dilatazione microcistica dei tubuli, con ampi cilindri, degenerazione tubulare ed edema interstiziale; il quadro interstiziale può essere anche più evidente di quello glomerulare; alla microscopia elettronica: presenza di strutture tubuloreticolari, verosimilmente indicatrici di infezioni virali (possibili, ma rare, nella nefropatia da eroina); identificazione di proteina virale P24 a livello glomerulare e, con tecniche di DNA ricombinante, di genoma virale nella stessa sede. Nessuna di queste lesioni è di per sé patognomonica della nefropatia associata all'AIDS, ma il ritrovarle insieme è considerato indicativo e tipico per questa forma. Ha un decorso rapido verso l'uremia (poche settimane, 3-4 mesi contro i 2-4 anni della nefropatia associata all'eroina); ipotesi patogenetiche di questo decorso accelerato sarebbero: invasione diretta delle strutture renali da parte del virus, effetto emodinamico, eventualmente analogo a quanto osservato nella sindrome epatorenale.