I linfociti T γδ circolanti costituiscono circa l'1-5% delle cellule T del sangue periferico.Il fenotipo di più del 70% di questi linfociti esprime il medesimo TCR Vγ9-Vδ2 ed esprimono il CD3 ma né il CD4 né il CD8.Questo TCR rende queste cellule capaci di riconoscere famiglie di composti non peptidici non processati purché di basso peso molecolare (100-600 Da) e con un pattern conservato; questi composti includono metaboliti microbici come ad esempio pirofosfomonoesteri (come l'IPP, isopentenile pirofosfato) e alchilamine.Questi composti sono in grado di attivare i linfociti T γδ e di indurne la proliferazione e la produzione di citochine tra cui l'IFN-γ e il TNF-α. La luce diffusa e la fluorescenza emessa da ciascuna particella sono raccolte da specifici dispositivi opto-elettronici, che le convertono in segnali analogico-digitali, ed inviate ad un computer, ove la distribuzione del segnale viene rappresentata con istogrammi di frequenza o citogrammi, facendo riferimento a differenti parametri.