Il 25 novembre 1610 il cardinale Pompeo Arrigoni aggiunse all'ospedale alcune sue donazioni, e con rendite di tre confraternite, riuscì a trasformare in ospedale l'antico monastero femminile di San Diodato che si trovava nei pressi di Porta Rettore e il 22 aprile 1614 affidò la gestione di tale edificio ai Fatebenefratelli venuti da Napoli. Il cardinale Orsini donò sia suoi beni che una farmacia, mentre il 31 ottobre 1849 venne in visita Pio IX e lo stesso fece Gioacchino Pecci, futuro Leone XIII.