L'intera uretra spugnosa ha origine dalla parte fallica del seno urogenitale, che contribuisce inoltre a formare parte dei corpi cavernosi e spugnosi, nonché il vestibolo uretrale nel glande; nelle femmine compone invece la vulva. La porzione di seno urogenitale che contribuisce a formare i corpi uretrali è detta stele o placca uretrale. Questo tratto di canale viene ulteriormente diviso in tre segmenti: uretra bulbare (nel pene ventrale, corrispondente all'uretra mediana), uretra pendula (nel pene dorsale) e uretra navicolare (nel glande). Il diametro e l'elasticità di ciascun segmento sono omogenei e generalmente comparabili, escludendo le zone che presentano fosse e recessi di profondità rilevante; è invece soggetta a variazioni la composizione tissutale.