Un approccio alternativo nella prevenzione dell'emicrania è rappresentato dalla somministrazione intramuscolare locale, a livello della muscolatura pericranica, della tossina botulinica di tipo A. La tossina botulinica determina una paralisi muscolare transitoria mediante il blocco del rilascio di acetilcolina. I meccanismi d'azione per cui la tossina botulinica è efficace nella profilassi dell'emicrania, non sono ancora ben noti, il rilassamento dei muscoli corrugatori non sembra essere l'unica possibile spiegazione (Smuts, 2004).