Durante la diagnosi prenatale è possibile analizzare i livelli di trisomia nei tessuti feto-placentari. Questi livelli possono essere predittori dei risultati nelle gravidanze con trisomia 16 a mosaico. In uno studio sui casi di diagnosi prenatale, c'erano il 66% dei nati vivi con un'età gestazionale media di 35,7 settimane. Circa il 45% di loro aveva malformazioni. Le malformazioni più comuni erano spina bifida, difetto interatriale e ipospadia. Tuttavia, la trisomia 16 placentare non sempre provoca anomalie anatomiche.