In seguito a somministrazione orale la muzolimina viene bene assorbita e rapidamente distribuita nei diversi tessuti. Con una singola dose da 30 mg si raggiunge il picco delle concentrazioni plasmatiche di 0,29-0,51 µg/ml nel giro di 1-3 ore. La muzolimina presenta un'emivita plasmatica di 10-17 ore. Circa il 5% della dose viene escreta in forma immodificata nelle urine nell'arco di 10 ore.