Ponfick è ricordato per la sua ricerca pionieristica dell'Actinomicosi, causato dal batterio "Actinomyces". Nel 1882 pubblica "Die Actinomykose des Menschen, eine neue Infectionskrankheit". Contribuì anche nella sua ricerca del mixedema, scrivendo due articoli sul disturbo, "Myxoedem und Hypophysis" (Mixedema e ipofisi) e "Zur Lehre vom Myxoedem" (La dottrina del mixedema).