Il 7 dicembre 2008 il Comune di Milano ha assegnato a Gaspare Jean l'Ambrogino d'oro con la seguente motivazione: "Prof. Gaspare Jean Un medico al servizio dell’uomo. Ricercatore di livello assoluto, con i suoi studi ha contribuito al raggiungimento di traguardi importanti nell'ematologia clinica e di laboratorio. Fin dai primi anni di attività ha focalizzato i suoi studi sugli aspetti sociali della medicina e, in particolare, sui rischi per la salute derivanti dagli ambienti di lavoro, sulle dipendenze e sull'alcolismo. La sua attività medica e scientifica è da sempre caratterizzata da una profonda attenzione ai valori della persona. Un rigore professionale e una coerenza etica che ne fanno un esempio per le nuove generazioni di medici e ricercatori"