Dal gennaio 2001 il complesso ospedaliero è interessato dal cantiere relativo alla realizzazione del nuovo polo pediatrico fiorentino. La progettazione affidata al CSPE (Centro studi progettazione edilizia) è stata preceduta e coadiuvata da una ricerca strutturata e innovativa sull'ospedale dei bambini, svolta dalla Fondazione Giovanni Michelucci nel 1998 a seguito di una convenzione stipulata tra l'Azienda ospedaliera Meyer e la Fondazione.