Le modificazioni post trascrizionali mediate da PARP di proteine come CTCF possono influenzare la quantità di metilazioni nei dinucleotidi CpG. È stato proposto che PARP possa influenzare la quantità del DNA metilato tramite legame diretto con la DNA metiltransferasi(DNMT-1) dopo il legame con le catene di ADP-ribosio e l'interazione con CTCF.