Le farmacie gestite dalle cooperative rappresentano una categoria residuale il cui esercizio era consentito con esplicita esclusione di ogni facoltà di trasferimento della titolarità (vendita) a meno che non fosse motivato da cause non imputabili alla cooperativa stessa (Legge n. 475/78 art. 20). La Legge 248/06 ha invece ridato valore alle società cooperative riservando anche alle stesse la titolarità dell'esercizio della farmacia.Ciascuna farmacia deve essere diretta in modo continuativo da un farmacista responsabile iscritto all'Ordine professionale. Le disposizioni che disciplinano l'esercizio delle farmacie cooperative sono uguali a quelle dettate per le farmacie in generale.