Le cause della sindrome del malato eutiroideo includono numerose condizioni acute e croniche non tiroidee, ed in particolare la polmonite, il digiuno, l'inedia, il ridotto apporto proteico, l'anoressia nervosa, le gravi infezioni sistemiche e la sepsi, i traumi maggiori, il bypass aorto-coronarico, le neoplasie, lo stress, l'insufficienza cardiaca, l'infarto del miocardio, l'ipotermia, l'insufficienza renale cronica, la cirrosi epatica, la chetoacidosi diabetica ed altre patologie.