Lo studio del ceppo dell'"H. pylori" è incentrato nel tentativo di comprenderne la patogenicità. Possiede sessantadue geni coinvolti nella genesi del danno; entrambi i ceppi possiedono un'isola patogenicità di 40 kB che da sola ne contiene più di quaranta. Questa isola di patogenicità è assente negli "H. pylori" non patogeni per l'essere umano rimanendo quindi asintomatici.