La vit B12 è il coenzima necessario per la donazione del gruppo metilico dal 5 metiltetraidrofolato all"omocisteina, necessaria per la sintesi de novo della metionina.La metionina è richiesta per la sintesi di S-adenosilmetionina (SAM), l"unico donatore in numerose reazioni di metilazione che coinvolgono il metabolismo di proteine, fosfolipidi, DNA e amine biogene. Così SAM viene convertito in S-adenosilomocisteina (SAH), rapidamente idrolizzata in omocisteina e adenosina. Questa idrolisi è reversibile e favorisce la sintesi di SAH.inibitore di tutte le reazioni di metilazione, competendo con SAM per il sito attivo sull"enzima metiltransferasi 103 .La base biochimica della relazione fra vit B12 e folati è il mantenimento di 2 funzioni: la sintesi degli acidi nucleici e le reazioni di metilazione. Quest"ultima è particolarmente importante nel sistema nervoso centrale, in quanto l"inibizione di questa funzione è considerata la causa della neuropatia associata al deficit di vit B12.Inoltre è stato ipotizzato che l"ossidazione dell"omocisteina a acido omocisteico sia una possibile spiegazione dell"effetto dannoso dell"omocisteina. Infatti l"acido omocisteico lega il recettore N-Metil-D-Aspartato (NMDA), con conseguente rilascio intracellulare di calcio, rilascio di proteasi intracellulari ed eventuale apoptosi.