Laguna ebbe problemi con l'Inquisizione, come Michel de Villeneuve, perché era ebreo-converso, fatto che avrebbe potuto fargli limitare i commenti al fine di evitare rischi. Tuttavia egli era il medico di Carlo V e Papa Giulio III, cosa che contribuì a fare del suo lavoro l'ultima parola in "Materia Medica" e come base per la botanica spagnola.