Negli ultimi anni è emerso un ruolo sempre più significativo del Papillomavirus Umano (HPV) nell'eziopatogenesi del carcinoma squamocellulare dell'orofaringe e del cavo orale. Questo dato ha permesso di suddividere i pazienti in due grossi gruppi, con diversa prognosi e approccio terapeutico:1) uomini sopra i 60 anni, fumatori e bevitori, con tumore squamocellulare cheratinizzante, HPV-16 negativo, TP53 mutato e p53 positivo, a decorso aggressivo;2) uomini tra i 40 e i 60 anni, non fumatori né bevitori, con tumore squamocellulare non cheratinizzante, TP53 non mutato e p53 negativo, HPV-16 positivo, a prognosi migliore.I fattori di rischio per il secondo gruppo sembrano essere correlati ad alto numero di partner sessuali, sesso orale e uso di marijuana. Sono già stati riconosciuti i genotipi ad alto potenziale oncogeno per la cervice uterina e anche in questa sede sono più frequenti HPV 16 e 18. Tuttavia mentre il genoma virale si riscontra in una piccola percentuale di carcinomi del cavo orale, nell'orofaringe si arriva fino ad un 50% di positività. (Jarboe et al. 2012, Cardesa e Nadal 2011).[7]