Lorenzo propone a Marco una soluzione per uscire dalla situazione in cui si trovano, ma quest'ultimo risponde che ci sono persone che antepongono il profitto alla salute di persone e medici come loro due. Le condizioni di Agnese peggiorano rapidamente arrivando a far ipotizzare un tumore, ma Andrea crede che la vera causa sia un'infezione al sangue. Riccardo cerca di convincere la madre di Alba a non far soffrire ancora la figlia e ad accettarla nel reparto di chirurgia, ma la donna gli risponde che non deve mai più permettersi di parlarle in quel modo; Elisa ascolta la loro conversazione e il giorno dopo ne parla con Alba. Discutendo con Giulia, Andrea ha un'intuizione e fa ammettere ad Agnese di aver incontrato Dario, dal quale però non ha ricavato informazioni utili; la donna spiega ad Andrea che l'ha fatto per aiutarlo. Andrea recupera un campione di Dario e scopre che, oltre all'infezione da meningococco, soffriva di un agente patogeno misterioso che si è manifestato solo dopo la sua morte. Il magistrato avvia un'inchiesta nei confronti di Andrea, il quale rischia la radiazione dall'Ordine dei Medici, di dover rimborsare centinaia di migliaia di euro e il carcere per il decesso dei pazienti causato dal Satonal; Marco decide di allontanare Andrea dal reparto, ma lui sceglie di rimanere come parente di Agnese. Viene confermato che Agnese soffre dello stesso agente patogeno che ha ucciso Dario, ovvero il fungo della candida haemulonii. Prima di iniziare la terapia di Agnese, Andrea comunica ai membri del suo reparto che di lì a poco dovrà lasciare l'ospedale a causa dell'indagine aperta su di lui, ringraziandoli di cuore. Alba affronta sua madre, comunicandole la decisione di continuare la specializzazione del reparto di medicina interna perché lo considera come una grande famiglia; le chiede poi di vedersi al di fuori dell'ambito lavorativo, ma sua madre risponde freddamente di non creare "complicazioni". Agnese, la cui terapia non sta funzionando, conforta Andrea dicendogli di non tormentarsi, e che non è colpa sua se Mattia è morto. Giulia intuisce dal gesto di Agnese (che si tocca la parte dolorante portando la mano al livello dell'orecchio) che si tratta di otite, malattia di cui Dario ha sofferto prima di morire: Agnese ha confuso il dolore all'orecchio con quello al dente. In infezioni di questo tipo è normale che vengano coinvolte anche le orecchie, ma in questo caso tutto è cominciato proprio dall'orecchio a causa della candida auris, evoluzione del fungo della candida dovuta all'abuso di antibiotici. Riccardo, liberatosi dalle sue paure, passa la notte insieme ad Alba. Chiara viene dimessa, ringrazia Lorenzo e gli dice di voler riprendere a studiare medicina. Nel frattempo in ospedale cercano di contattare l'autorità sanitaria degli Stati Uniti, dove Dario è stato in vacanza qualche giorno prima, precisamente a Chicago, nello stato dell'Illinois; tramite alcune ricerche, Giulia capisce che Dario è stato contagiato perché in Illinois si trova uno dei pochissimi focolai di infezione di candida auris in Occidente; inoltre, Andrea trova strano questo fatto perché anche la sede centrale dell'azienda farmaceutica SEU, che produce il Satonal, si trova a Chicago. Agnese finalmente si risveglia ed è in via di guarigione. Quando Andrea sta per andarsene dall'ospedale, Lorenzo confessa a tutti la verità: Andrea è innocente, provando che le accuse mosse da Dario erano frutto di un ricatto da parte dalla casa farmaceutica (per cui pochi giorni prima si trovava a Chicago); non l'ha detto subito per via delle minacce subite da Marco riguardo all'assunzione di oppiacei in ospedale. Marco e Irene vengono subito arrestati; prima che Marco venga portato via dall'ospedale, Andrea gli chiede perché ha agito in quel modo dato che era un bravo medico, e Marco risponde che voleva essere come lui.