Esistono 12 regioni del genoma che possono essere collegati alla colite ulcerosa, includendo i cromosomi 16, 12, 6, 14, 5, 19, 1, 16, e 3, per ordine di scoperta , anche se è più probabile che il disordine genetico sia ascrivibile a una combinazione di geni piuttosto che a uno solo di essi.