Le patologie legate alla congiuntiva sono difficilmente classificabili in quanto, spesso, le infiammazioni congiuntivali rappresentano epifenomeni di patologie di strutture annesse, come ad esempio la cornea; una prima divisione viene fatta dunque fra "forme patologiche pure", malattie proprie della congiuntiva, e "forme patologiche miste", cioè fenomeni di reazione agli annessi.