Il papilloma a cellule transizionali invertito è un'altra rara neoplasia, spesso localizzata a livello del trigono o del collo vescicale, dove si presenta come un polipo solitario con superficie lobulata o liscia, abitualmente di dimensioni non superiori ai 3 cm, ricoperto da urotelio per lo più normale dal quale si dipartono file e isole di cellule che si approfondano nella lamina propria del polipo. Le cellule più periferiche di queste isole sono perpendicolari rispetto alla circostante membrana basale, che è la diretta continuazione di quella epiteliale; le cellule più centrali, invece, giacciono in una posizione più orizzontale. Non c'è attività mitotica, ma è possibile riscontrare piccoli focolai di atipia cellulare di basso grado. Il papilloma invertito è considerato una lesione che presenta un basso rischio di ricorrenza quando sia stato correttamente diagnosticato e completamente escisso.