La misura della attività del G6PD va prescritta solo dopo il superamento della fase acuta della malattia e a distanza di tempo da una eventuale trasfusione. Non dovrebbe essere effettuata durante una crisi emolitica perché il risultato potrebbe essere falsato e mostrare un livello di attività dell'enzima più alto di quanto sia in realtà. Durante la crisi emolitica, infatti, i globuli rossi più vecchi e più carenti di G6PD sono distrutti e rimangono visibili solo quelli più giovani e con una attività enzimatica di G6PD più elevata. Il test dovrebbe essere effettuato dopo alcune settimane per dare tempo ai globuli rossi di ripopolarsi e di maturare.