Rispetto alle varie versioni della trasmissione originaria, Superquark ha una durata, costante nel corso degli anni, di circa 120 minuti. Pur con numerose innovazioni, la trasmissione, tuttora in onda, ha mantenuto negli anni la stessa struttura. Nelľedizione 2014 è andato in onda dagli studi Rai del CPTV di Torino con una nuova scenografia ideata da Emanuela Trixie Zitkowskyne prodotto in HD nativo. Nell'edizione estiva del 2015 la produzione ritorna a Roma nello studio del Nomentano 2 sempre in HD nativo.