La causa principale dell'appendicite è la presenza di materiale intrappolato all'interno della piccola cavità presente all'interno dell’appendice. Si tratta per lo più di muco denso, feci piccole (coproliti), parassiti intestinali (nei bambini, la presenza di ossiuri), batteri, residui di cibo o altri corpi estranei. Tali sostanze, dunque, non potendo fuoriuscire dall'appendice, con il passare del tempo provocano la moltiplicazione di batteri, la formazione di pus, il rigonfiamento ed arrossamento delle pareti e la diminuzione del flusso di sangue ai tessuti.