Nel 1798 Napoleone nel corso della Campagna d'Egitto, occupò l'isola di Malta, su cui l'Ordine cavalleresco governava dal 1530 con diritti feudali concessi dal Regno di Sicilia: i cavalieri ospitalieri, secondo la loro legge che proibiva di opporsi con le armi ad altri cristiani, non opposero resistenza. Tale episodio è generalmente considerato quale epilogo della funzione militare dell'Ordine.