Daremberg insegnò storia della medicina all'Università di Parigi ed eseguì numerosi viaggi nei principali paesi europei, tra cui l'Italia che visitò in compagnia di Ernest Renan (i due furono a Roma e in altre città d'Italia (tra cui Napoli, Montecassino, Firenze) nel 1849-50) alla ricerca di antichi manoscritti. Tra i suoi lavori sulla storia della medicina, oltre la nota "Histoire des sciences medicales" pubblicata nel 1870, sono da ricordare la raccolta, in collaborazione con Salvatore De Renzi e August Wilhelm Henschel, di documenti e trattati della Scuola medica salernitana, la prima e più importante istituzione medica d'Europa nel Medioevo e la pubblicazione, a cura di Daremberg, corredata con una traduzione in lingua francese, del "Corpus Hippocraticum", raccolta di circa settanta opere, attribuibili in parte a Ippocrate, che trattano vari temi, tra cui prevalente la medicina, scritte in greco antico.