Non viene più utilizzato per via orale (era usato come amebicida) a causa della sua marcata neurotossicità (mielo-otticoneuropatia). L’applicazione locale può causare occasionalmente gravi irritazioni nei soggetti sensibili; può manifestarsi sensibilità crociata con altri idrossichinolinici alogenati. Il cliochinolo macchia di giallo i tessuti e decolora i capelli.