La medicina del lavoro è presente anche nelle strutture universitarie e ospedaliere (in particolare, in Lombardia, dove sono previste le UOOML: "Unità Operative Ospedaliere di Medicina del Lavoro") e fornisce prestazioni diagnostiche per le sospette patologie professionali, per la gestione delle idoneità complesse e per la definizione della capacità lavorativa residua nei soggetti affetti da patologie, oltre ad offrire consulenza in ambito di igiene e sicurezza sul lavoro alle aziende del territorio.