In seguito si recò India per sei mesi durante i quali assistette il famoso neurochirurgo, il Dr. Victor Horsley, nei suoi esperimenti sulle scimmie che miravano a comprendere come una pressione applicata su diverse zone del cervello, provocava una differente reazione. Fu proprio il Dr. Horsley che convinse la Morton a rimanere in India, una volta terminato il corso di specializzazione durato tre anni, per studiare il terribile morbo che stava devastando la popolazione della suddetta zona: la peste bubbonica. Nel laboratorio del governo britannico ella affiancò il Dr. Waldemar Haffkine nei suoi studi di ricerca che portarono allo sviluppo di un vaccino contro la peste. Dopo aver collaborato, dunque, allo sviluppo del vaccino contro la peste bubbonica, Rosalie si dedicò alla visita di ospedali istituiti da missionari americani in India, tra cui l'ospedale di Madura, Calcutta, Ceylon, Manila e l'Inuvil hospital.