È posto nel diencefalo tra i corpi mammillari e il chiasma ottico. Da esso si diparte l'infundibolo che si continua nella parte posteriore dell'ipofisi (neuroipofisi). Intorno alla base l'infundibolo è localizzata l'eminenza mediana, implicata nel controllo dell'ipofisi anteriore (attraverso proiezioni provenienti dall'ipotalamo).