I Rotavirus, che costituiscono la causa più comune di gastroenteriti nel bambino, contengono sequenze peptidiche molto simili ad epitopi T-cellulari negli autoantigeni insulari GAD ed alla tirosin-fosfatasi IA-2; ciò suggerisce che i Rotavirus potrebbero scatenare la reazione T-cellulare autoimmune contro le insule pancreatiche attraverso un meccanismo di mimetismo molecolare (42).Uno studio australiano ha osservato l"associazione tra l"infezione da Rotavirus e la presenza di autoanticorpi anti-insulari, in bambini a rischio di diabete che erano seguiti sin dalla nascita. Si è infatti realizzata un"associazione specifica ed altamente significativa, nella popolazione analizzata, tra la sieroconversione e l"aumento di ciascuno di alcuni anticorpi: l"86% ha sviluppato anticorpi anti IA-2, il 62% anti-insulina e il 50% anti-GAD, contemporaneamente all"incremento delle IgG o IgA anti-RV (42). Da questi dati è stata formulata l"ipotesi che l"infezione da Rotavirus possa scatenare od esacerbare l"autoimmunità contro le insule pancreatiche nei bambini geneticamente suscettibili.Un possibile diverso meccanismo di azione può essere costituito dall"infezione diretta del pancreas da parte del virus; questa ipotesi è resa plausibile dal riscontro di Reovirus (della famiglia delle Reoviridae, come i Rotavirus), infettanti isole del Langherans umane. Inoltre sono riportati casi di pancreatiti associate ad infezioni da Rotavirus, ed è stato osservato che un prodotto del pancreas esocrino, la tripsina, rende il Rotavirus infettivo.