Nel 1941 a Rio de Janeiro, Bogliolo divenne direttore del Servizio di Anatomia Patologica, della V cattedra di clinica medica della Facoltà di Medicina dell'Università del Brasile dove si occupò delle sessioni dimostrative anatomo-cliniche: Bogliolo eseguiva personalmente gli esami autoptici, discutendo i casi clinici e le ipotesi diagnostiche, che precedevano i reperti anatomo-patologici, con una grande sintesi finale (epicrisi). Nel 1944 si trasferì a Belo Horizonte, invitato dal compatriota Alfredo Balena, che era preside della Facoltà di Medicina dell'Università del Minas Gerais e gli propose la cattedra di Anatomia e Fisiologia Patologica. Ivi ebbe tre figli (il quarto nacque a Rio de Janeiro). Essendo straniero, a dispetto del suo "curriculum", fu costretto a convalidare la sua laurea, sottomettendosi per 4 anni a esami scritti, orali e pratici, in tutte le discipline degli ultimi tre anni del corso di Medicina; pertanto il titolo di dottore gli fu riconosciuto solo nel 1958, con una tesi sull'anatomia patologica della forma acuta tossiemica della schistosomiasi mansonica. Nel 1959 vinse il concorso e ottenne la cattedra ambita. Bogliolo lavorò a Belo Horizonte fino al 1978, creandovi un'eccellente scuola di Anatomia Patologica e compiendo importanti studi nell'ambito della Medicina tropicale, sulla schistosomiasi mansonica, sulla malattia di Chagas, sulla paracoccidioidomicosi (o blastomicosi sudamericana) e sulle leishmaniosi. In particolare studiò in modo preciso il quadro anatomo-patologico della cosiddetta "fibrosi di Symmers" della schistosomiasi epato-splenica, distinguendola dalla cirrosi epatica. Bogliolo fu cofondatore della Società Brasiliana di Patologia e ne fu presidente dal 1960 al 1962. Nel 1972 pubblicò il suo trattato di Patologia medica e nel 1978 il trattato di Patologia Generale. Morì a Belo Horizonte (Minas Gerais) il 6 settembre 1981.