La validazione delle previsioni ottenute da GRID suggerisce l'utilizzo dei MIFs per validare i metodi omologici, infatti se il canale è ben costruito deve possedere delle zone di minima energia relative al probe K + all'interno del poro dove si può prevedere che si collochino gli ioni potassio nel corso del loro passaggio attraverso il poro. Le posizioni degli ioni potassio si possono dedurre sfruttando l'elevato grado di conservazione esistente fra il template e i modelli omologici nella regione dove si localizza il poro.Andando a valutare i risultati quali e quantitativi riportati nei paragrafi precedenti si trova che la diminuzione della soglia energetica porta ad una riduzione delle superfici isoenergetiche e del numero di cubi all'interno del poro dei canali modellati. Tale variazione è particolarmente accentuata nel canale ottenuto dalla subunità 8: alla soglia energetica di -7.000 kcal/mol è presente un unico cubo, localizzato in una regione adiacente al poro, mentre alla soglia di -9.000 kcal/mol non sono più presenti cubi, indice di scarsa affinità per il probe potassio a tali livelli energetici. Il canale 8-fixed, invece, è caratterizzato dalla presenza di cubi esattamente nella sua porzione centrale anche a bassi valori energetici.Il confronto con gli ioni potassio sperimentali tratti dal file PDB del template (sferette viola) con i cubi calcolati e visualizzati alla soglia energetica di -5.000 kcal/mol mi ha permesso di notare la loro perfetta sovrapposizione nel caso del canale 8-fixed, situazione non verificatasi nel caso del canale 8. favorevoli con il probe sodio relativi al poro del canale template a determinati valori energetici.Ho scelto di analizzare le interazioni favorevoli con il sodio agli stessi livelli energetici scelti per il probe potassio ( -3.000, -5.000, -7.000, -9.000 kcal/mol). Il confronto con il template e il parallelismo dei risultati calcolati dimostrano una netta aspecificità di legame relativa al binding site. Non è possibile infatti, attraverso queste tecniche computazionali, giustificare la specificità di tale canale nei confronti degli ioni potassio: questi ultimi e gli ioni sodio sono descritti in GRID in modo molto simile e sono praticamente interscambiabili. 