La malattia di Fabry è panetnica, ma data la sua rarità è difficile stabilire con precisione la reale frequenza. Le incidenze riportate variano da 1:476000 15 a 1:117000 16 casi nella popolazione generale, sebbene screening neonatali abbiano evidenziato un'incidenza di 1:3100 maschi nati vivi in Italia 17 e 1:250 maschi nati vivi a Taiwan, l'86% dei quali presenta la mutazione intronica IVS4+919G>A, precedentemente riscontrata nei pazienti con fenotipo "cardiaco" late-onset 18 . Per la maggiore frequenza riscontrata allo screening, per la natura non specifica delle complicanze della malattia e per la frequente insorgenza di singole complicanze è verosimile che esistano molti pazienti non diagnosticati.La riduzione dell'aspettativa di vita, in assenza di terapia enzimatica sostitutiva, è superiore ai 20 anni negli uomini e attorno ai 15 anni nelle donne 19,20 .L'età media al momento del decesso è intorno ai 45 anni per gli uomini e ai 55 anni per le donne. La prima causa di morte è il decadimento della funzione renale, significativamente più comune nei maschi, mentre nelle donne la causa più comune di decesso è la malattia cardiaca (scompenso, aritmie).