Procedo come nel caso precedente, ovvero caricando la struttura monometrica e riconoscendo AMP-PNP e magnesio come ligandi.Come prima, il programma suggerisce dieci tasche. Anche in questo caso, la tasca numero 1 corrisponde a quella ATPasica (Fig. 52.a). Essa occupa un volume di 333Å 3 su un totale di 33567Å   Si tratta di risultati significativi, in quanto l'eventuale individuazione di inibitori in grado di interagire con i residui di tali cavità potrebbe ostacolare l'attività dei loop e di conseguenza la catalisi. Inoltre, si può notare una certa ripetibilità dei risultati ottenuti con i vari programmi, soprattutto per quanto riguarda la tasca ATPasica e quella in relazione all'A loop.Per concludere, un rapido giudizio sui programmi testati: Cast-p: permette l'ottenimento di risultati dettagliati ed esaustivi. Da segnalare la possibilità di migliorare la visualizzazione delle strutture tramite il plug-in per PyMOL. Pocket Finder e Q-site Finder: molto simili, semplici ed immediati, forniscono risultati soddisfacenti. Ligsite: più complicato e impreciso, in quanto si limita ad individuare il centro della cavità ricostruendola come se fosse sferica.  Per analizzare in maniera più esaustiva i canali, decido quindi di utilizzare il plugin di CAVER per PyMOL.