L'aspettativa di vita delle persone affette da miotonia congenita è pari a quella della popolazione generale. Non è infatti una patologia degenerativa. Tra le possibili complicanze descritte (riferite però in generale a tutte le forme di malattia, compresa quella autosomica dominante o malattia di Thomsen), vi sono i frequenti episodi di soffocamento nei bambini, i disturbi della deglutizione (disfagia), e quindi la polmonite ab ingestis, problemi articolari (artrosi, artralgia e anche disturbi alla colonna vertebrale), lesioni da caduta, crampi, strappi muscolari e contratture, e infine la lassità dei muscoli dell'addome (diastasi addominale) che può causare deformazione dell'addome, dolore, difficoltà digestive, disturbi pelvici e leggeri problemi di respirazione bassa diaframmatica..