All'inizio del 1847 egli si trasferì a Venzone con la sua famiglia, sempre in qualità di medico condotto e ben presto la sua natura espansiva e la sua innata generosità gli valsero la stima ed il ben volere di tutta la popolazione. Il carteggio con il Dalmata proseguì fino al 1848, quando i noti eventi storici fecero tacere la voce del Tommaseo ed impedirono allo Zecchini, che più volte aveva tentato nell'impresa, di vincere gli ostacoli posti alla sua corrispondenza dalla censura austriaca a Venezia. Quest'ultimo dovette temere seriamente per l'incolumità fisica dell'amico ed una lettera del 25 gennaio 1848, pubblicata in parte nella "Vita di Niccolo Tommaseo" a cura del Ciampini, ne è chiara testimonianza. La lettera dello Zecchini al Tommaseo del 7 settembre 1856 ci dà notizia invece delle vicende succedutesi negli anni trascorsi dal '49 fino a quel giorno: il 1852 lo vide medico a Dignano d'Istria, da dove, “per le calunnie di un collega”, dovette andarsene per tornare a San Vito, senza il conforto della famiglia, costretta a Dignano per la rigidezza dell'inverno e le gravi malattie che infierivano allora nella zona. Tre anni dopo, nel 1855, morì suo padre, nello stesso anno gli nacque un figlio, che perdette improvvisamente pochi mesi dopo.