Anche i virus del morbillo e della parotite (paramixovirus) possono causare malattie neurologiche. Il morbillo tipicamente non causa encefalite nella fase acuta, ma 1 caso su 1000 può dare origine a sindrome autoimmune postinfettiva (cioè, SSPE). Il virus Nipah (famiglia Paramyxoviridae) è stato rilevato per la prima volta dopo un'epidemia di encefalite negli allevatori di suini in Malesia. Successivi focolai si sono verificati in diversi paesi dell'Asia meridionale, incluso il Bangladesh (2001 e 2003).