Nato a Londra, vi esercitò la propria carriera medica. Il padre, William Gee, era un uomo di affari, ma la famiglia non era ricca. Dopo i primi due anni a scuola proseguì la scuola primaria in casa e continuò gli studi presso la University College School di Londra. Studiò quindi medicina presso l'University College Hospital e si laureò nel 1861, ottenendo il dottorato nel 1865.