Attualmente sono in valutazione altre possibili applicazioni mediche come nel caso dell'emicrania, sintomi prostatici, incontinenza urinaria e vescica iperattiva, asma, obesità e altre possibili indicazioni. Gli usi della tossina botulinica per cui sussiste approvazione variano molto dal tipo di tossina, tipo di prodotto commercializzato e da paese a paese, anche all'interno dell'Unione Europea. Questo fa sì che spesso il suo utilizzo clinico sia di tipo "off-label", anche se supportato dalla letteratura scientifica. In Europa la tossina botulinica A è commercializzata sotto forma di cinque prodotti farmaceutici: Botox, Bocouture, Dysport, Xeomin e Vistabex. La tossina botulinica B è invece commercializzata in Europa con il nome di Neurobloc.