* i metodi classici ancora continuano ad essere i più efficienti (oltre economici) nel diagnosticare alcune infezioni patologiche importanti (infezioni urinarie, del tratto gastrointestinale, tubercolosi, malaria, babesiosi, ecc.). Tra loro troviamo la microscopia, le coltivazioni in vitro (emocoltura, urocoltura, coprocultura, coltivazione di funghi, ecc.), la colorazione chimica (colorazione di Gram, Giemsa e Wright, impregnazione argentica, reazione PAS, ecc.) o i test biochimici o immunitari (test immunoenzimatico ELISA, immunofluorescenza diretta (IFD), inmunofluorescenza indiretta (IFI). Questi ultimi sono metodi indiretti (non rilevano il materiale genetico del patogeno ma la risposta immunitaria verso di esso) e sono i più utilizzati per la caratterizzazione morfologica e fisiologica dell'agente infettivo. Questi metodi richiedono di una corretta risposta immune da parte dell'individuo.