In quella che fu la scuola clinica fondata a Napoli da Magrassi importante fu il nuovo chiaro indirizzo fisiopatologico multidisciplinare in cui le varie competenze si integravano nell’applicazione razionale al singolo malato. Questa nuova impostazione portò a una organizzazione dipartimentale delle istituzioni universitarie con una confluenza tra la ricerca sperimentale e quella clinica. Essa trovò coerente espressione didattica nei corsi di fisiopatologia che Magrassi affidò ai suoi allievi, stimolandoli a un'attività didattica integrata cui ciascuno partecipava secondo le proprie attitudini e competenze. Il clinico bresciano riuscì infatti a trasmettere ai suoi studenti le trame essenziali della professione medica, per cercare di arrivare a una visione unitaria di come la natura si trasforma e si altera nella malattia, approccio clinico capace di abbracciare i problemi in una visione di sintesi olistica della ricerca scientifica e della realtà clinico-diagnostica del malato. Così come viene descritta dal professor Ugo Carcassi, suo allievo a Sassari, e da Mario Coltorti, suo allievo a Napoli, la giornata di Magrassi era caratterizzata da ore dedicate alla visita di un reparto, consuetudine tramandata dalla scuola Frugoniana e da sedute al microscopio. Tutto ciò però non lo sottraeva al suo compito di maestro e di guida in corsia. 