Le ciglia presenti nella trachea, dette ciglia vibratili, si muovono in senso caudo craniale, insieme al muco filtrano le sostanze introdotte attraverso la respirazione; il muco intrappola il pulviscolo atmosferico (polvere, polline, batteri, ecc...) in modo che le vie aeree vengano tenute pulite. Il muco prodotto deve essere eliminato, quindi portato verso l'alto; questo processo avviene spingendo il muco verso la laringe e poi verso l'epiglottide quindi caricato nell'esofago e spinto verso lo stomaco. Quest'organo contiene i succhi gastrici che eliminano il muco.