Boi tenne lezioni a Cagliari per tre anni ma gli studenti iscritti alla sua facoltà erano pochi. Nel 1801 chiese quindi il permesso di visitare altre università italiane per continuare i suoi studi in anatomia. Visitò l'Università di Pavia, dove era professore in anatomia Antonio Scarpa, l'Università di Pisa e successivamente Firenze dove iniziò a studiare anatomia con Paolo Mascagni. Il soggiorno in Toscana del Boi fu finanziato da Carlo Felice, fratello di re Vittorio Emanuele I.