Francesco Montorsi nel 1981 ha ottenuto il diploma di Maturità Scientifica presso l’Istituto Leone XIII di Milano. Nel 1987 si è laureato con lode in Medicina e Chirurgia presso l’Università degli Studi di Milano, discutendo la tesi dal titolo: “"Effetto della ciclosporina sulla funzionalità beta cellulare pancreatica"”, successivamente pubblicata sull’American Journal of Surgery. Nel luglio 1992 ha ottenuto con il massimo dei voti e lode la Specializzazione in Urologia presso la Università di Milano, discutendo la tesi: “"Eco-color doppler ed emodinamica peniena"”. Nel novembre 2001 ha ottenuto con il massimo dei voti e lode la Specializzazione in Endocrinologia indirizzo Andrologia presso l’Università di Pisa, discutendo la tesi “"Disfunzione erettile conseguente a prostatectomia radicale"”. 