Nel 1832 fu nominato all'Hospice de la Salpétrière e per i successivi cinque anni tenne un corso di lezioni di clinica medica che ebbe grande successo; al tempo stesso insegnò anatomia patologica presso l'École pratique. La sua fama crebbe e finalmente nel 1837, all'età di quarantatré anni, ottenne la cattedra di medicina all'Ospedale Pitié di Parigi. Dalla cattedra di medicina al La Pitié, nel 1840 Piorry si spostò alla cattedra di patologia interna, fino a quella di clinica medica al Le Charité nel 1850, e successivamente prese il posto di Armand Trousseau come professore di medicina all'Hôtel-Dieu nel 1864.