Inoltre, il rafano contiene i polifenoli luteolina (0,90 milligrammi  per 100 grammi di rafano fresco), kempferolo (1,58 milligrammi per 100 grammi di rafano fresco) e quercetina (0,28 milligrammi per 100 grammi di rafano fresco), appartenenti tutti alla classe dei flavonoidi, molecole con attività benefiche per la salute.