Nel 1927 il ministro prussiano della cultura gli propose di insegnare chirurgia a Berlino. Sauerbruch accettò e nella primavera del 1928 si congedò da Monaco di Baviera ed entrò nel nuovo incarico a Berlino. Fu invitato in Egitto nella Facoltà di medicina e nella Egyptian Medical Association per esporre, in una serie di conferenze, lo sviluppo della chirurgia generale, polmonare e ortopedica.