Nel 1913, alla morte del professor Francesco Fede, la Facoltà Medica di Napoli chiamò lo Jemma a ricoprire la cattedra di pediatria. A Palermo gli succedette per incarico Giovanni Di Cristina che già frequentava la Clinica fin dal 1909. Nell'Università di Napoli fu preside di facoltà negli anni accademici dal 1920-21 al 1929-30, a eccezione del 1921-22, 1925-26 e 1926-27. Il 1º dicembre 1922 si iscrisse al Partito Nazionale Fascista e fu uno dei primi professori universitari a farlo, perciò tale adesione fu molto propagandata. Nel 1924 fu eletto presidente della Società italiana di pediatria e lo rimase fino al 1929. L'8 gennaio 1929 fonda una nuova clinica pediatrica a Napoli, alla cui inaugurazione parteciparono Umberto di Savoia e la moglie Maria José. Assunto il nuovo incarico, provvide anzitutto a riorganizzare e a rendere più efficienti i locali della clinica, quindi si dedicò interamente all'attività didattica. Nel 1934 pubblicò, insieme a Carlo Comba, il più grande trattato di Pediatria italiana, un'opera che raccoglieva i contributi dei Maestri della pediatria italiana. Nel 1936, dopo trent'anni di insegnamento, viene nominato professore