Leggendo la commemorazione scritta da Giovanni Martinotti su Luigi Calori, è significativa la critica a lui mossa per non aver promosso lo studio dell'istologia a Bologna. Per smentire questa accusa, è sufficiente considerare le pubblicazioni di Calori sull'anatomia comparata. Circa trent'anni della sua vita sono caratterizzati da studi sulla morfologia di tutte le specie animali. Importante, infatti, è la sua pubblicazione del 1851 sull'axolotl, in cui, con l'utilizzo del microscopio, documentò la struttura dell'apparato olfattivo, della mucosa orale, delle branchie, dei polmoni, della vescica urinaria e delle ovaie di questo anfibio. Egli riuscì a dimostrare che l'axolotl subisce una metamorfosi in cui, con la scomparsa delle branchie, rimangono solo i polmoni, come avviene per le salamandre, le rane ed i rospi. La conferma della sua teoria giunse a Parigi nel 1865, quando alcuni axolotl improvvisamente si trasformarono in salamandre adulte. Calori, però, non si limitò solamente alle osservazioni sull'apparato branchiale, sul polmone e sull'apparato cardiovascolare ed uro-genitale dell'axolotl ma esaminò tutta l'anatomia dell'anfibio, di cui è interessante anche la struttura dell'encefalo. Oltre a questo importante studio morfologico, Calori ne effettuò molti altri su anfibi e rettili, caratterizzati dall'utilizzo del microscopio e della microdissezione, ancora una volta a smentita delle critiche di Martinotti.