Fino all'agosto 2009, l'ospedale faceva parte dell'"Azienda ospedaliera civile e ospedale "Maria Paternò Arezzo"", comprendente anche l'Ospedale civile di Ragusa superiore (oggi, Ospedale Giovanni Paolo II), ma il 1º settembre 2009 avvenne la fusione con l'Azienda unità sanitaria locale n° 7 di Ragusa per creare la nuova Azienda sanitaria provinciale di Ragusa.