Colesevalam causa anche un aumento del colesterolo HDL (+3%) e dei trigliceridi (+10%). Studi sperimentali fanno ritenere che entrambi questi effetti del farmaco possano essere attribuiti alla disattivazione del fattore di trascrizione FXR ("Farnesoid X receptor") conseguente alla deplezione degli acidi biliari. In condizioni fisiologiche infatti gli acidi biliari legano e attivano FXR, per cui la loro carenza prodotta dall'interruzione del circolo entero-epatico ne determina la disattivazione. FXR regola una varietà di geni coinvolti nel metabolismo delle HDL e dei trigliceridi.