Se la scuola medica padovana - grazie anche alla protezione offerta dalla Repubblica di Venezia - contribuì largamente, tra il XV e il XVI secolo, alla nascita della medicina moderna, ciò si deve a contributi come quello di Giovanni Battista Monte il quale, per primo in Europa, insegnava ai suoi allievi la clinica medica al capezzale del malato; alla fondazione del primo orto botanico universitario e pubblico nel 1545; all'introduzione dell'autopsia come metodo di indagine scientifica e alla nascita del primo teatro anatomico stabile alla fine del XVI secolo; alle scoperte anatomiche di vari studiosi tra i quali Andrea Vesalio, Gabriele Falloppio e Girolamo Fabrici d'Acquapendente. L'università padovana rimase un punto di riferimento anche nei secoli successivi per la formazione di alcuni tra i maggiori medici europei.