L'assenza o perdita di funzione dell'NAD(P)H ossidasi evita la formazione di specie reattive dell'ossigeno e ciò dà come risultato una patologia conosciuta come malattia granulomatosa cronica, la quale si caratterizza per infezioni ricorrenti e per la formazione di granulomi là dove le cellule non sono in grado di uccidere l'agente infettivo.