La principale manifestazione clinica è conseguente all'infiammazione innescata sia da "Proteus" sia dalla presenza di un corpo estraneo rappresentato dal calcolo, con possibile raccolta ascessuale e sepsi. L'ostacolo al deflusso urinario può portare all'insufficienza renale acuta post-renale, soprattutto se il calcolo è di grandi dimensioni e localizzato nelle vie urinarie distali.