Viene invece sottoposto ad una α-ossidazione nei perossisomi, dove viene convertito in acido pristanico con la rimozione di un atomo di carbonio. L'acido pristanico subisce poi vari cicli di β-ossidazione nel perossisomi a formare acidi grassi a catena media, a loro volta convertiti in anidride carbonica e acqua nei mitocondri.