Le IST, di natura batterica (sifilide, gonorrea, clamidia) ma anche alcune forme di natura virale (herpes, papilloma) causano generalmente lesioni e disturbi a carico degli organi genitali (pene-uretra, testicoli, vulva, vagina, area perianale), dell'ano o della bocca, che compaiono da pochi giorni a varie settimane dopo il contagio, e possono presentarsi come vescicole, ulcere, rigonfiamenti ed arrossamenti locali accompagnati, in alcuni casi, da dolore locale, bruciore urinario e ingrossamento delle linfoghiandole vicine.