L'ipotesi che SV40 potesse causare il cancro negli esseri umani è stata un campo di ricerca particolarmente discusso. Vari metodi sono stati usati per rilevare SV40 in una varietà di tumori umani, anche se rimane poco chiaro quale sia il ruolo effettivo di SV40. L'opinione degli scienziati rimane divisa, alcuni ritengono che questa ipotesi non è sostenuta da dati certi ed altri che sostengono che solo alcuni tumori possono coinvolgere SV40.