Attualmente Sharp sta lavorando su piccoli RNA ed altri tipi di RNA non codificanti; in particolare, il suo laboratorio di ricerca lavora per identificare gli mRNa bersaglio dei microRNA (miRNA), ed ha scoperto una tipologia di miRNA che viene prodotta da sequenze adiacenti al sito d'inizio della trascrizione. Il suo laboratorio, inoltre, studia anche come i miRNA abbiano una funzione regolatrice nell'angiogenesi e nella risposta allo stress cellulare.