Sei aule magne sono ospitate all'interno di altrettanti padiglioni (aula "Viola" nella Clinica Medica, aula di Dermatologia, aula "M. T. Chiantore" nel padiglione di Ematologia, aula di Ostetricia e Ginecologia, aula di Pediatria, aula di Nuove Patologie); le ulteriori cinque aule magne della facoltà sono all'esterno dell'ospedale. Completano il quadro decine di aule più piccole e biblioteche distribuite in tutto il nosocomio: la più fornita ed importante è la "Biblioteca Centralizzata Clinica" con sede presso il Padiglione Nuove Patologie.