Terminata la Seconda Guerra Mondiale Sanguinetti decide di trasferirsi definitivamente a San Giovanni Rotondo per aiutare Padre Pio nella costruzione dell'ospedale Casa Sollievo della Sofferenza. Negli anni precedenti al suo trasferimento, il dottore passava sempre meno tempo a Borgo San Lorenzo, in quanto l'idea del nuovo ospedale nella cittadina garganica cominciava a diventare realtà. Per sette anni e mezzo, il medico parmigiano segue il nascere della “Casa Sollievo della Sofferenza”, dal primo colpo di piccone vibrato il 16 aprile 1947 sulla nuda montagna, fino all'apertura del Poliambulatorio del 26 luglio del 1954. Quale Consigliere Delegato della Società Immobiliare “Casa Sollievo della Sofferenza” costituita per l’erigendo omonimo ospedale egli ha previsto e realizzato la costruzione muraria dell’edificio, gli acquisti delle apparecchiature scientifiche, il rimboschimento della montagna circostante l’ospedale finanche l’apertura di una fattoria per assicurare alimenti sani agli ammalati.