I due punti di controversia principali erano il fatto che, al posto di terapie mirate solo a problemi respiratori, un appropriato trattamento medico per immunodepressione avrebbe potuto evitare il decesso di Eliza Jane, e che l'uso degli antiretrovirali durante la gravidanza o l'allattamento avrebbero potuto evitare anche la trasmissione dell'HIV a Eliza Jane.