Se si riscontra un tumore nel paziente, la prognosi a lungo termine è generalmente migliore e il rischio di recidiva inferiore: il tumore può essere rimosso rimuovendo così la fonte dell'autoanticorpo . È generalmente accettato che la diagnosi precoce e il trattamento aggressivo migliorino i risultati dei pazienti, ma questo è impossibile da dire a causa della mancanza di studi clinici randomizzati . Poiché la maggior parte dei pazienti viene inizialmente visitata da uno psichiatra , è essenziale che tutti i medici - e in particolare gli psichiatri - tengano conto dell'encefalite anti-NMDAR nelle loro ipotesi diagnostiche di fronte a una crisi psicotica acuta in un soggetto giovane senza un passato neuropsichiatrico .