Benché nella letteratura medica mondiale siano stati descritti non più di 600 casi dal 1996 al 2006, la gangrena di Fournier è un evento non rarissimo e si manifesta soprattutto come una complicanza del diabete mellito scompensato in pazienti anziani maschi, ma anche in alcolisti, in individui malnutriti o negli immunodepressi. Tra gli altri fattori predisponenti la malattia sono annoverati anche un intervento chirurgico recente nella sede dell'infezione (per esempio la circoncisione o l'ernioraffia), i traumi locali, la parafimosi, gli stravasi periuretrali di urina e le infezioni perianali e perirettali. Occasionalmente è stata descritta un forma simile di gangrena dei genitali anche in donne.