Non esiste una terapia risolutiva per la disfunzione cronica del trapianto una volta che si è instaurata. Tra le misure di prevenzione più efficaci vi sono la scelta del trapianto da donatore vivente e con compatibilità HLA ottimale, la diagnosi precoce e relativo trattamento tempestivo del rigetto acuto, l'uso di biopsie renali di routine per il riconoscimento precoce del rigetto acuto subclinico. Una volta dimostrata istologicamente la presenza di danno renale, la maggior parte degli autori è concorde nel consigliare la sospensione degli inibitori della calcineurina e la sostituzione di questi con micofenolato mofetile o sirolimus.