I soggetti con deficit dell'immunità cellulare sono esposti a infezioni gravi, disseminate e recidivanti da parte di virus. Tra questi, le infezioni più importanti sono sostenute del genere "Herpesviridae", come "Herpes simplex", "Herpes zoster" e "Citomegalovirus". Infezioni fungine sistemiche e croniche da "Candida albicans" sono molto frequenti e hanno esito infausto nella maggior parte dei casi. Analogamente ai pazienti con AIDS, è possibile lo sviluppo di polmonite da "Pneumocystis jirovecii" e di gravi infezioni gastrointestinali sostenute dal genere "Cryptosporidium". Queste ultime possono inoltre evolvere verso colangiti sclerosanti. Il deficit umorale estrinsecato nell'ipogammaglobulinemia è a testimonianza dello stretto rapporto tra linfociti T e linfociti B ed è responsabile di infezioni batteriche gravi e recidivanti.