La prevalenza globale di AAD, con l'inclusione degli attacchi da lievi a moderati senza ulteriore valutazione diagnostica clinica, non è ben stabilita. I tassi di attacco variano a seconda dell'antibiotico utilizzato, del contesto epidemiologico e dell'ospite. Frequenze aumentate si trovano nei bambini e nell'età avanzata. Inoltre, la malattia sottostante, i recenti interventi chirurgici e i farmaci che alterano la motilità intestinale sono fattori che aumentano il rischio di sviluppo di AAD La prevalenza riportata da vari studi varia dal 3,2 al 29,0%. Sulla base di una meta-analisi che studia il valore dei probiotici per la prevenzione dell'AAD, è stata stimata una prevalenza ponderata dell'AAD del 14% nelle popolazioni di controllo. Tra tutti i casi di AAD, il 10-20% è correlato con l'infezione da "Clostridium difficile" determinando un'incidenza media stimata negli ospedali belgi di 0,91 per 1000 ricoveri ospedalieri nel 2011.