Ferruccio Fazio è sposato con Margherita Colnaghi e ha due figli, Alessandro e Arianna. Si è laureato in Medicina e Chirurgia presso l'Università di Pisa nel 1968, nel 1970 ha ottenuto la specializzazione con lode in Medicina Nucleare e nel 1975 in Malattie dell'Apparato Respiratorio e Tisiologia.