A Bologna il chirurgo perfezionò e descrisse in dettaglio il cosiddetto "metodo italiano" per intervenire chirurgicamente sul viso. Con questo metodo si poteva riuscire a ricostruire nasi, labbra e orecchi mutilati utilizzando lembi epidermici prelevati dagli arti superiori. La tecnica fu descritta dal Tagliacozzi con notevole dettaglio nell'opera "De curtorum chirurgia per insitionem" ("Chirurgia delle mutilazioni per mezzo di innesti"), pubblicata a Venezia nel 1597, ma precedentemente egli aveva già esposto in sintesi il suo metodo in una famosa lettera del 22 febbraio 1586 indirizzata al medico Girolamo Mercuriali, il quale poi la pubblicò nel suo libro "De Decoratione". Oltre che per l'esposizione del metodo chirurgico, la lettera al Mercuriali è altresì importante dal punto di vista storiografico, in quanto in essa si trovano citati i nomi di quattro persone alle quali il Tagliacozzi aveva praticato la ricostruzione del naso. Il chirurgo ci riferisce pure che tali pazienti erano talmente soddisfatti dell'operazione che preferivano i loro nuovi nasi, rispetto a quelli donati loro dalla natura.