Ci sono due principali metodi che vengono utilizzati per calcolare i costi : il topdown e il bottom-up [81].L" approccio top-down utilizza i dati finanziari e ripartisce i costi ospedalieri totali tra i vari dipartimenti. Dipendendo da quanto approfonditi siano i dati, questa ripartizione può essere più o meno precisa ed utile. Principalmente,può essere utilizzata solo per una valutazione retrospettiva. Essa mostra soltanto il riassunto delle spese precedenti del dipartimento . Non è possibile assegnare i costi per paziente, per malattia o per procedura [82].Il metodo bottom-up è quello utilizzato per la maggior parte delle valutazioni economiche, poiché i costi sono raccolti al livello del costo oggettivo (es., il paziente) tenendo conto di ogni attività svolta e convertendola in unità monetaria. Questo metodo può essere utilizzato sia per lavori retrospettivi che prospettici. Esso fornisce i dati dei costi a livello peculiare, rendendo possibile la ripartizione del consumo delle risorse per pazienti, malattie o procedure [82].Questo metodo facilita le valutazioni economiche ma allo stesso tempo richiede più tempo e costi, perché bisogna raccogliere dettagliatamente i dati dalle cartelle e convertirli in unità monetarie [75].