I batteri producono e consumano una grande quantità di gas all'interno del lume intestinale. La microflora svolge un ruolo fondamentale nel mantenimento dell'omeostasi di questi gas, sebbene le conoscenze a proposito siano ancora piuttosto scarse. Si tratta probabilmente di un processo finemente regolato come hanno dimostrato vari studi effettuati con tecniche differenti e su popolazioni diverse: nonostante la grande estensione del tratto intestinale, il volume totale di gas si aggira soltanto intorno ai 100-200 ml 309,310 .