Esistono diverse tecniche per ottenere questo risultato: a disco rotante ("Nipkow disk"), Programmable Array Microscopes (PAM), e laser. Quest'ultimo tipo, il più diffuso e denominato CLSM, acronimo di "Confocal Laser Scanning Microscope", è un evoluto microscopio a fluorescenza che permette di focalizzare con estrema precisione un laser sul preparato, aumentando notevolmente la risoluzione e la profondità di campo.