Tutti i pazienti che accusino una CIS tipica devono essere sottoposti a rachicentesi per l'esame del liquor cefalo-rachidiano (LCR). Reperti come una modesta pleiocitosi linfo-monocitaria, soprattutto in fasi molto attive di malattia, e iperproteinorrachia non sono infrequenti, ma l'esame più specifico per la SM è la  