Nel 1856 viene nominata preside a Brantford, diventando la prima donna a ricoprire tale carica in Ontario. Il 22 novembre dello stesso anno si sposa con John Stowe, e da questa unione nasceranno tre figli fra cui la più famosa è Augusta Stowe-Gullen, prima donna a diplomarsi in medicina in una università canadese. Nel 1863, il marito John si ammala di tubercolosi, ed è proprio la malattia che la stimolerà a voler studiare medicina. Nel 1865 presenta la sua candidatura all'Università di Toronto, ma avendo ricevuto un rifiuto si trasferisce a studiare presso il "New York Medical College for Women" dove ottiene il diploma nel 1867. Rientrata in Canada apre un gabinetto a Toronto diventando così la prima donna in Canada ad esercitare la medicina. Il permesso ufficiale arriverà solo nel 1880. Motivata dal suo desiderio di offrire alle donne gli stessi diritti degli uomini, apre nel 1876 il Women's Literary Club, primo gruppo di suffragette in Canada e nel 1883 il Woman's Medical College.