ll "L. reuteri" per parecchio tempo è stato, erroneamente, classificato come una sottospecie del "L. fermentum".. Solo negli anni ‘60, il microbiologo tedesco Gerhard Reuter riuscì a distinguerne i caratteri distintivi. Nel 1980, infine, è stato riconosciuto come una specie separata all'interno del genere Lactobacillus.. Il nome di "L. reuteri" è stato attribuito proprio in onore di G. Reuter che per primo lo aveva identificato.