I parametri di ricostruzione modificano il modo nel quale i dati grezzi raccolti vengono elaborati dall'algoritmo di ricostruzione per generare l'immagine. Vengono impostati sulla console assieme ai parametri di scansione prima di iniziare l'acquisizione. Tuttavia finché i dati grezzi rimangono in memoria possono essere reimpostati per generare altre ricostruzioni dette retrospettive.Matrice. Le immagini TC sono immagini digitali, formate righe e colonne di pixel.Questo insieme è definito matrice. La matrice poi è definita dalla sua dimensione, cioè dal numero di righe e colonne da cui è formata. Dimensioni tipiche sono: 256×256, 320×320, 512×512 e 1024×1024. Matrici di dimensioni maggiori richiedono una memoria maggiore del calcolatore. Alcuni apparecchi sono vincolati a una sola matrice, altri permettono una Sarà pertanto più difficile visualizzare particolari a densità simile. Vi sono poi anche dei filtri che amplificano in maniera simile le funzioni a bassa frequenza, mentre limitano l'amplificazione delle funzioni a frequenza elevata. In questo modo si limita il rumore e si esalta la risoluzione a basso contrasto. Tuttavia la risoluzione spaziale risulta diminuita.Negli apparecchi TC sono presenti più filtri, disponibili in base all'applicazione clinica. Il nome del filtro varia in base al costruttore.