Dopo l'accertamento della sindrome, infatti, inizia un percorso di cura nutrizionale volto a reintegrare correttamente le sostanze mancanti nell'organismo tramite l'utilizzo di integratori alimentari, supplementi vitaminici o l'assunzione di enzimi, oppure a evitare o sostituire quelle sostanze nutritive che causano l'intolleranza (ad esempio diete prive di glutine o di lattosio).