Grazie alla sinergia attivata tra l'Università degli Studi, che sostenne l'intera spesa della costruzione, l'Opera Pia generale dei Poveri, cui era affidata la gestione dell'Ospedale di Sant'Agostino e che realizzò le infrastrutture, e la Comunità di Modena, che fece ricostruire l’adiacente cappella di San Nicolò in cui venivano officiati i riti funebri, in poco più di un anno, dal dicembre 1773 al gennaio 1775, il teatro anatomico fu terminato e inaugurato da Scarpa il 25 gennaio 1775.