Infine, l'informatica biomedica affronta il problema dell'elaborazione delle immagini, spaziando dai problemi di visualizzazione tridimensionale a quelli di analisi quantitativa per l'estrazione automatica o semi-automatica di indici diagnostici. Di grande interesse è il campo della fusione di immagini, in cui immagini provenienti da diverse modalità di acquisizione vengono combinate per fornire al medico le informazioni in modo integrato.