Le infezioni batteriche possono essere curate con antibiotici di diverse classi. La scelta dipende dal tipo di infezione, dalle caratteristiche del batterio responsabile e dalla sua sensibilità agli antibiotici che può essere evidenziata da un esame chiamato antibiogramma.Nel corso degli ultimi anni sono notevolmente aumentati i casi di resistenza agli antibiotici (antibiotico-resistenza) da parte di diversi tipi di batteri, fenomeno che rende difficile curare infezioni anche gravi.Gli antibiotici non hanno alcun effetto sulle infezioni causate da virus. La comparsa dell'antibiotico-resistenza è stata facilitata negli anni da un abuso dell'utilizzo di antibiotici impiegati, spesso, per curare infezioni virali, come l'influenza, su cui non sono efficaci.