Il Comune di Ferrara individuò l'area del nuovo ospedale a Cona, partì la gara d'appalto per l'aggiudicazione dei lavori e il cantiere venne aperto il 21 aprile 1995 con il rilascio della concessione edilizia e gli espropri dei terreni operati dal Comune. L'11 maggio 1996 vi fu la consegna del progetto del primo stralcio il cui primo lotto prevedeva la realizzazione della struttura sanitaria a supporto del già presente Sant'Anna. A giugno del 1998 terminarono i lavori del primo stralcio del progetto del "Cona 1" ma contestualmente avanzò l'idea di un "Grande Cona" quindi non più di una semplice struttura a sostegno del vecchio Sant'Anna ma di nuovo ospedale completo, destinato a sostituire quello già presente.