L'etozolina è controindicata negli stati gravi di insufficienza epatica e renale oppure quando sussistano condizioni di grave squilibrio idrosalino ed osmotico (es. in caso di vomito frequente, diarrea persistente, coma diabetico). Nei trattamenti prolungati, anche se l'escrezione di potassio è di scarsa entità, è consigliata la determinazione periodica del quadro elettrolitico sia plasmatico che urinario. Il farmaco può causare iperuricemia e iperazotemia.