Questi contaminanti possono essere facilmente rilevati nei grandi predatori come squali, pesce spada, tonni che, a causa della loro posizione in cima alla catena alimentare, possono accumulare sostanze tossiche per biomagnificazione. Nei normali processi di raffinazione i produttori di olio di pesce possono ridurre la concentrazione di questi contaminanti ma una raffinazione e purificazione molto accurata può ridurre anche il tenore di EPA e DHA.