Nel caso di alterazioni nei vasi sanguigni (vascolari), il fattore V di Leiden, vale a dire la mutazione del fattore V (fattore anticoagulante che, se alterato, porta a ipercoagulabilità), può aumentare la probabilità di sviluppare coaguli di sangue, soprattutto a livello venoso (trombofilia) e, quindi, a tromboembolia.