L'assorbimento, inoltre, avvenendo attraverso la mucosa rettale può essere non ottimale per la limitatezza dell'area deputata all'assorbimento (circa 200 cm²) e talvolta la presenza di fattori locali, quali ad esempio la presenza di un muco abbondante e denso, che ostacolano dissoluzione, diffusione ed assimilazione del farmaco (specie se somministrato nella forma farmaceutica di supposte).