Dal punto di vista clinico, le infezioni urinarie si associano ad una varietà di lesioni ostruttive. Sperimentalmente, anche un'ostruzione temporanea aumenta sensibilmente la suscettibilità all'infezione: ad esempio si vede come quasi il 100% dei ratti si infettano dopo la legatura dell'uretere seguita da iniezione endovenosa di E. coli.L'ostruzione a livello della vescica interferisce con i meccanismi attraverso i quali la vescica normale elimina i batteri.Mentre un'ostruzione ureterale completa aumenta notevolmente la suscettibilità del rene all'infezione e dà luogo anche alla riattivazione delle lesioni in via di guarigione, un'ostruzione ureterale graduale o parziale, provocata chirurgicamente o tramite irradiazione degli ureteri, incide scarsamente sulla suscettibilità renale all'infezione ematogena (Guze 1958). È probabile, tuttavia, che l'associazione tra ostruzione parziale e pielonefrite osservabile negli esseri umani sia dovuta ad un effetto sul meccanismo ascendente di infezione tramite l'interferenza con l'urodinamica ureterale o tramite l'accentuazione dell'effetto del reflusso vescico ureterale.