Nel 2012 episodi di cattiva gestione portarono all'apertura di indagini giudiziarie per presunti illeciti con il rinvio a giudizio di alcuni esponenti laici e religiosi della Congregazione. L'istituto piombò in una crisi gestionale che costrinse i vertici a richiedere un concordato preventivo presso il Tribunale di Roma. Il 29 marzo 2013, con decreto del MISE, l'istituto entrò in regime di amministrazione straordinaria che si concluse il 14 aprile del 2015 con l'acquisizione dell'istituto da parte della Fondazione Luigi Maria Monti.