Diplomatosi nel 1833, all'età di soli sedici anni, iniziò gli studi di medicina presso l'università di Tubinga Eberhard-Karls. La sua personalità inquieta gli mosse, sin dal principio, i primi scacchi. Coinvolto in scherzi goliardici venne ripetutamente convocato dal rettore dell'università. A causa dei suoi ideali politici entrò spesso in collisione con i professori e gli amministratori di Eberhard-Karls. Griesinger criticò la medicina romantica insegnata a Tubinga, poiché la considerva speculativa. Si impegnò pubblicamente per una Germania libera ed unita; fu coinvolto nei Corps Guestphalia, una frazione del Burschenschaft.