L'esatto meccanismo d'azione degli anestetici generali non è ancora conosciuto. L'enflurano agisce come un modulatore allosterico positivo del recettore GABAA, del recettore della glicina e dei recettori 5-HT3; e come un modulatore allosterico negativo dei recettori AMPA, recettore del kainato, del recettore NMDA, e dei recettori nicotinici dell'acetilcolina.