Le complicanze più frequenti della biopsia renale sono le raccolte ematiche perirenali, che nella maggior parte dei casi sono asintomatiche, diagnosticabili solo al controllo ecografico; a volte possono manifestarsi con dolore lombare, ipotensione ed anemizzazione. Altre complicanze possibili sono la macroematuria e la formazione di una fistola artero-venosa intrarenale.