Frequentemente ci sono degli ostacoli alla risoluzione del caso: condizioni particolari della salute del paziente che impediscono di eseguire esami (ad esempio "Tutto torna"), dilemmi etici ("Un cane è per sempre") o il paziente stesso, che ostacola una diagnosi, mentendo per nascondere un proprio segreto ("Emancipazione"); House deve perciò riuscire ad aggirare questi problemi per poter formulare una diagnosi.