Si aggiungono all'RNA le beads e la miscela di reazione viene incubata in ruota per 12 ore a 4°C al buio. Durante questo periodo le molecole di RNA si legano alle beads di agarosio. Le beads legate all'RNA poi vengono lavate per tre volte con 1ml di una soluzione 2 M NaCl, poi per altre tre volte con 1 ml di Washing buffer.I lavaggi vengono eseguiti centrifugando a 3'000 rpm per 5 minuti e servono per eliminare l'RNA che non si è legato alle beads. 