Himly era un pioniere nel campo dell'oftalmologia. Inoltre, svolse delle indagini precoci che coinvolgono le possibilità di innesto corneale. Nel 1802, con Johann Adam Schmidt (1759-1809), iniziò la pubblicazione di ""Ophthalmologische Bibliothek", una rivista che divenne la prima rivista dedicata alla medicina oftalmica in Germania. Dal 1809 al 1814 pubblicò il "Journal für praktische Heilkunde"" con Christoph Hufeland.