L'agenesia è la più frequente malformazione dell'encefalo, la sua incidenza si attesta intorno al 0,7 - 1% (quindi meno di una persona ogni 100 individui, ma il dato è sicuramente sottostimato per la presenza di individui asintomatici, soprattutto nella forma parziale), non mostra preferenza per quanto riguarda i sessi.