Andrea riferisce a Marco e Irene delle sue ricerche sul Satonal, la cui sperimentazione era stata chiusa proprio da lui: dato che la mortalità del Satonal legata agli effetti indesiderati è superiore rispetto a quella presente nella pubblicazione, propone di allertare l'agenzia del farmaco per far ripetere la sperimentazione. Gabriel annuncia alla sua comunità etiope di voler rimanere in Italia, dov'è riuscito finalmente a costruirsi una propria identità. Chiara viene ricoverata per quella che apparentemente sembra essere un'overdose da cocaina; una volta rimasta sola con Lorenzo, la donna gli confessa che per necessità economiche, pur non consumando cocaina, ne trasporta degli ovuli per conto di due narcotrafficanti. Chiara, spaventata dalla possibilità di essere rintracciata da questi ultimi, accetta l'invito di Andrea di stare a casa sua per un paio di giorni. Intanto il giovane Tommaso Vitali, insegnante di chitarra per bambini, viene seguito per quella che sembra meningite meningococcica (probabilmente trasmessagli da un suo allievo, ora guarito, che aveva contratto il meningococco di sottotipo B). Giulia ipotizza che Tommaso sia stato contagiato da un altro batterio; dopo che Riccardo esegue un'emocoltura in base alla quale si scopre che non c'è crescita, e dopo aver ordinato ad Alba un'RX-torace e la somministrazione di un antibiotico ad ampio spettro, Giulia ritiene che la malattia sia di origine virale, perciò decide di ricominciare da capo volendo testare per primi herpes ed enterovirus, per poi fare una lista di tutti i virus compatibili con i sintomi. La madre di Tommaso racconta a Riccardo di avere col figlio un rapporto molto burrascoso tanto che da un anno, dopo un acceso litigio, non sono più in contatto. Chiara viene riportata in ospedale a causa delle ennesime convulsioni; Andrea, tastandole l'addome dopo che Chiara specifica di soffrire di mal di pancia e crampi, nota che il fegato ha una consistenza fibrosa e crede che ci sia danno epatico, quindi propone un'ecografia addominale, a cui Gabriel vi aggiunge transaminasi, bilirubina e tempo di protrombina. Lorenzo comunica a Chiara che lei soffre di epatite cronica e che questa è l'ultima possibilità che le rimane per curarsi e, quando Andrea rileva che Chiara ha la malattia di Wilson, le dice che fortunatamente è curabile ma bisogna comunque fare una biopsia per valutare le effettive condizioni del fegato. Alba scopre sulle braccia di Tommaso una porpora molto estesa, e Giulia pensa che la cosa non sia né batterica né virale, ma amebica: forse la causa è un parassita, e propone di mandare Tommaso in ipotermia durante il coma farmacologico. La madre di Tommaso acconsente alla rischiosa operazione per salvare la vita del figlio aggredito dalla naegleria fowleri, detta anche "ameba mangia-cervello". Marco ammette a Irene di non capacitarsi di come siano arrivati a quel punto; tuttavia, quando Irene gli propone di incastrare Andrea con una falsa testimonianza, Marco si ricorda di Dario Corolla, uno specializzando cacciato da Andrea ma che aveva terminato il percorso grazie a lui. La madre di Tommaso racconta a Giulia e Andrea il difficile rapporto col figlio (avuto da un musicista che la abbandonò subito dopo il parto) e li ringrazia, riflettendo su quanto sia importante dire alle persone quanto siano amate. Dopo aver ascoltato la conversazione, Alba corre da Riccardo e gli confessa di amarlo, venendo ricambiata. La diagnosi finale di Chiara si rivela peggiore del previsto, ovvero cirrosi epatica, e Lorenzo preferisce che sia Andrea a comunicargliela. L'operazione di Tommaso ha successo. Nel frattempo, Irene incontra Dario Corolla.