Anche alcuni estratti di origine naturale, spesso classificati come integratore alimentare, mostrano un effetto antidepressivo (anche se la portata del loro effetto è stata a volte messa in discussione): ad esempio l'estratto dell'erba di San Giovanni è comunemente utilizzato come antidepressivo specialmente in Europa; alcuni probiotici hanno mostrato di migliorare sintomi di ansia e depressione in trial clinici e modelli animali, mettendo in luce il collegamento tra salute intestinale e mentale; l'Acetil-L-carnitina ha mostrato in uno studio un rapido effetto nel trattamento della distimia; l'inositolo ha mostrato in uno studio un effetto ansiolitico paragonabile a quello della fluoxetina; l'Adenosil Metionina (SAMe) è ampiamente pubblicizzata come alternativa naturale agli antidepressivi; la nicotina agisce come antidepressivo, tramite la stimolazione del rilascio di dopamina e norepinefrina e la desensibilizzazione dei recettori della nicotina a seguito della tolleranza.