Divenuto ordine religioso militare in seguito alla prima crociata, il 15 febbraio 1113, mediante la bolla papale "Pie postulatio voluntatis" il Papa Pasquale II riconosceva l'ospedale di Gerusalemme come istituzione dipendente direttamente dal Papato con la facoltà di nominare al suo interno il proprio capo (definito Gran Maestro), senza alcuna interferenza da parte di altre autorità secolari o religiose. In virtù di questa stessa bolla papale, l'ospedale venne esentato dal controllo della chiesa locale. Venne però imposto che tutti i cavalieri appartenenti all'ordine fossero necessariamente dei religiosi, legati al rispetto dei tre voti monastici di povertà, castità e obbedienza. È a questo periodo inoltre che si fa risalire l'adozione da parte dell'ordine della croce a otto punte che ancora oggi ne è il simbolo: la croce è il simbolo di Cristo mentre le sue otto punte indicano le otto beatitudini pronunciate da Gesù nel discorso della montagna e ricordate nei Vangeli.