Nato in Spagna, era il figlio del noto chirurgo oculista Ignacio Barraquer, fondatore della Clinica Barraquer, e nipote di José Antonio Barraquer-Roviralta, titolare della prima cattedra di oftalmologia di Barcellona. Laureato in Medicina e specializzato in oftalmologia, Barraquer cominciò immediatamente a studiare i vizi refrattivi, le cause e i possibili trattamenti. Fu inventore di nuovi strumenti chirurgici e ideatore di nuove tecniche chirurgiche.