Le cause della cupololitiasi sono varie e in larga parte ignote, ma come per una infezione auricolare, sia probabilmente dovuta al consumo di latticini . La si riconduce per lo più a idrope sacculare, traumi cranici, incidenti sportivi o di altro genere, forti stress prolungati, ereditarietà, fisiologico ricambio periodico degli otoconi e altro.