La Biblioteca biomedica dell'Università degli studi di Firenze conserva il fondo di archivio Antonio Cocchi. costituito da 149 unità archivistiche. Vi si trovano, tra le altre carte, 103 quaderni di "Effemeridi", il diario privato che Antonio Cocchi scrisse dal maggio 1722 al dicembre 1757 in diverse lingue antiche e moderne.