Oltre ad essere un fervente seguace di Lister, gli studi di Cheyne vennero influenzati da un'altra figura emergente dell'Ottocento, ossia Robert Koch, medico tedesco, fondatore della scuola di batteriologia. Nel 1886 si recò a Berlino per visitarne il laboratorio, potendo così apprendere i suoi risultati sullo studio della tubercolina per curare i malati di tubercolosi. Nel 1891 ottenne la cattedra di chirurgia presso il King's College Hospital, dove introdusse l'uso del microscopio per ottimizzare le ricerche che continuò a sostenere circa la chirurgia antisettica e tra il 1899 ed il 1903 scrisse "Manuale di trattamento chirurgico".