Tra i batteri aerobi l'agente patogeno più frequente e importante sembra essere "Streptococcus pyogenes" (Streptococco beta-emolitico di gruppo A). Altri agenti patogeni aerobici isolati dagli agoaspirati comprendono "Staphylococcus aureus", "Haemophilus influenzae", "Corynebacterium" e "Neisserie".