Creare nuove connessioni a livello del sito di lesione è dunque una vera e propria sfida, se si considera anche il fenomeno della retrazione assonale, per degenerazione retrograda, dal sito di lesione: le terminazioni assonali lesionate si ritraggono infatti dal punto della sezione, a distanze variabili e non prevedibili (non proporzionali al tempo trascorso dalla lesione); ne consegue che gli assoni lesi potrebbero difficilmente prendere contatto con un trapianto posto sul sito di lesione. Esisterebbero però notevoli differenze tra le retrazioni degli assoni dei tratti cortico-spinale (da 1 a 5 mm) e quelli dei tratti vestibolo-, reticolo-e rubro-spinale. La retrazione massima degli assoni bulbo-spinali sarebbe infatti veloce e misurabile nell'ordine dei micron, si manterrebbe stabile nel tempo e sembrerebbe rispondere positivamente al trattamento con cortisone o altri fattori neuroprotettivi; questo potrebbe far convergere su di essi maggiori aspettative nello studio della rigenerazione assonale (Houle e Tessler, 2003).