Ebbe inoltre l’opportunità di frequentare i laboratori di Robert Koch e in un decennio, basandosi anche sulla fiorente letteratura microbiologica tedesca ed europea che aveva avuto un enorme sviluppo proprio sotto l’influenza stimolante di Koch, compì una vasta serie di ricerche sulla microbiologia del cavo orale che lo portarono a formulare la teoria acida chimico-parassitaria, ancora oggi punto di origine della maggior parte delle ricerche di Cariologia. Egli lavorò duramente e i problemi di natura odontoiatrica che dovette affrontare furono risolti con senso critico, completezza e versatilità di metodi.