Durante la seconda guerra mondiale, l'ospedale fu afflitto da un'importante crisi causata da problemi economici e la mancanza di personale. Negli anni a seguire il 1943 la situazione si fece critica, arrivando a contare un solo medico e pochissimi infermieri per tutta la struttura. L'apice della crisi si ebbe nel Giugno 1945, quando il tasso di mortalità raggiunse il 12,54%, dovuto alle situazioni mediche precarie e a problemi generali dell'istituto (mancanze alimentari e mancanza di apparecchi sanitari).