Baltimore è stato sia criticato che difeso per le sue azioni nella questione. Nel 1993, il matematico Serge Lang criticò pesantemente il comportamento di Baltimore. Lo storico scientifico Daniel Kevles, dopo aver scritto l'assoluzione di Imanishi-Kari, raccontò l'accaduto nel suo libro nel 1998, The Baltimore Case. Horace Freeland Judson inoltre diede il proprio giudizio personale sulle azioni di Baltimore nel “The Great Betrayal: Fraud in Science”. Baltimore ha anche scritto la propria analisi dei fatti.