Le cause che provocano la colite ulcerosa non sono ancora chiare. Sicuramente un ruolo importante è svolto dai fattori genetici ed immunitari ma ci sono anche altri elementi che potrebbero agire in una persona già predisposta come, ad esempio, la dieta ricca in zuccheri raffinati e povera in fibre e la sedentarietà. Il loro ruolo nel determinare la malattia, però, non è stato ancora dimostrato con certezza. Al momento, quindi, non esiste una effettiva prevenzione per evitare la comparsa della colite ulcerosa.