Nel 1873, a meno di 30 anni, fu chiamato a Roma da Costanzo Mazzoni che gli affidò il compito di svolgere il corso di Patologia chirurgica e nel 1877, alla morte dello stesso Mazzoni, Francesco Durante divenne direttore della Clinica chirurgica allora alloggiata presso il vecchio "Ospedale S. Giacomo".