La riduzione dell'energia di attivazione può essere invece spiegata dal fatto che tutte le interazioni tra enzima e substrato sono possibili solo quando il substrato si trova nello stato di transizione. Tale stato è dunque stabilizzato (in un certo senso esso viene "forzato") dal legame tra enzima e substrato. Il substrato nello stato di transizione può essere considerato un vero e proprio "nuovo" substrato di una "nuova" reazione, avente una energia di attivazione inferiore a quella "originale". La riduzione della ΔG‡ può dunque essere intesa come conseguenza della creazione di una sorta di "nuova" reazione, impossibile senza la presenza dell'enzima corretto.