La durata del periodo di incubazione dipende dalla modalità di acquisizione del contagio. In seguito alla puntura della zecca l'incubazione è compresa tra il primo e il terzo giorno, fino ad un massimo di 9 giorni. Il periodo di incubazione successivo ad un contatto con sangue o con tessuti infetti è compreso tra 5 e 6 giorni, fino ad un massimo registrato di 13 giorni.