Attraverso la netta distinzione dei due percorsi di presentazione dell'antigene (Figura 5.12) il sistema immune è in grado di rispondere ai microrganismi intracellulari e a quelli extracellulari in modi diversi e diversamente efficaci nel combattere questi due tipi di aggressione.   In conclusione, la natura della risposta immune è ottimizzata utilizzando diverse caratteristiche del processo di presentazione e riconoscimento dell'antigene.