EPi Info 7 supporterà i data base MySQL e SQL Server, oltre al tradizionale formato di Microsoft Access. Gli utenti avranno inoltre la possibilità di memorizzare i metadati separatamente dai dati stessi, per esempio, si potrà lasciare il questionario in un file XML, mentre la memorizzazione dei dati raccolti avverrà in un database MySQL. Un programma di utilità e di conversione consentirà la compatibilità dei progetti in Epi 3 con la versione 7.