Nel 1945 Carlo Foà, tornato in Italia, riottenne la vecchia cattedra di "Fisiologia umana" a Milano. Nello stesso anno fu reintegrato all'Accademia Nazionale dei Lincei da cui era decaduto nel 1937 in seguito alle leggi razziali; tuttavia il 4 gennaio 1946 la commissione di epurazione, presieduta da Benedetto Croce, lo dichiarò decaduto dall'Accademia assieme ad altri due grandi scienziati israeliti, i fisiologi Mario Camis e Tullio Terni, a causa del sostegno loro dato al regime fascista nel corso del Ventennio.