Il fattore P assolve il ruolo di stabilizzare il complesso C3bBb, pertanto è in grado di consentire l'attivazione diretta dell'ultima tappa della "via alternativa di attivazione del complemento" per questo motivo tale attivazione prende anche il nome di "attivazione properdinica", tale tappa non dipende da anticorpi, in quanto alcuni prodotti virali o batterici sono in grado di interagire con il C3, questa interazione causa un cambiamento conformazionale che destabilizza la molecola, le molecole trovandosi in stati conformazionali differenti saranno libere di interagire con altre molecole, l'interazione causerà un nuovo cambiamento conformazionale e la liberazione di nuove molecole in grado, a loro volta, di interagire con altre molecole, da tale processo risulterà un'attivazione in maniera sequenziale, la quale infine porterà alla liberazione di una serie di fattori che, a loro volta, andranno ad attivare la risposta immunitaria.