La diagnosi differenziale dovrà prendere in considerazione altre patologie dentali con sintomatolgia sovrapponibile. Il dolore da pulpite acuta ha caratteristiche differenti, ma la sovrapposizione delle due patologie, che in alcuni casi invece di seguirsi potranno coesistere, in alcuni casi renderà difficile la diagnosi del dente di partenza. Nel caso in cui il drenaggio dell'infezione si sia fatto strada lungo il legamento parodontale, simulando una patologia parodontale in fase avanzata, la diagnosi differenziale avrà importanti conseguenze per il trattamento e per la prognosi del dente interessato.