Sulla base della teoria della coalescenza bayesiana, è inferito che il più probabile tempo dell'evoluzione di "P. knowlesi" è 257.000 anni fa (tra 98.000 e 478.000 anni fa con una confidenza del 95%). Yakob "et al." calcolarono la probabilità di trasferimento del patogeno dal macaco a coda lunga all'uomo utilizzando un'ananlisi di dinamica adattativa, dimostrando che essa fu determinata dalla densità relativa degli ospiti e dalle preferenze individuali da parte delle zanzare "Anopheles".