L'asse HPA ha profondi effetti sulla risposta immune infiammatoria, principalmente grazie all'azione del prodotto finale della sua attivazione, i GC, che inibiscono la mobilizzazione di ogni componente del sistema immunitario.Il cortisolo agisce come potente fattore anti-infiammatorio ed immunosoppressivo influenzando la circolazione dei leucociti e bloccando le funzioni vitali nelle cellule immunitarie.Inoltre riduce la produzione citochinica e di altri mediatori della flogosi (PAF, NO, prostanoidi), induce resistenza all'azione delle citochine e inibisce l'espressione di molecole di adesione e dei loro recettori sulla superficie delle cellule immunitarie.In particolare il cortisolo sopprime la sintesi delle citochine che inducono il sistema immunitario verso una risposta Th1 (citochine tipo1: TNF-α, IL-2, IL-12) mentre stimola quelle promuoventi l'immunità umorale e la risposta Th2(citochine tipo2: IL-10, IL-4, IL-13).Questo effetto porta ad un shift del sistema immunitario verso una risposta umorale (da Th1 a Th2) che funziona quale "valvola omeostatica di sicurezza" contro una potenziale attivazione prolungata dei macrofagi, i quali potrebbero avere effetto destruente.Tale shift tuttavia, sebbene sia un effetto voluto temporaneamente, potrebbe complicare la risposta immune, soprattutto in condizioni croniche in cui l'azione immunitaria è protettiva (infezione, carcinogenesi) o in cui l'induzione dell'immunità umorale è deleteria (allergie, malattie autoimmuni).