In campo paleontologico Stenone si pose in un modo sostanzialmente nuovo il problema della classificazione dei fossili, e della ricostruzione della storia geologica in base al modo in cui questi, e altre rocce, sono contenuti all'interno di rocce più grandi; da questa ricerca sistematica prende il titolo il suo "De solido" (ossia "Prodromo a una dissertazione su un solido naturalmente contenuto in un altro solido"). All'inizio di quest'opera, Stenone enuncia il suo problema fondamentale: