Al taglio del DNA da parte degli enzimi coinvolti nella morte cellulare(come le caspasi), PARP può esaurire l'ATP di una cellula nel tentativo di riparare il DNA danneggiato. L'esaurimento dell'ATP in una cellula porta alla lisi e morte cellulare. PARP ha anche l'abilità di indurre direttamente apoptosi, tramite la produzione di PAR, che stimola I mitocondri a rilasciare i fattori di induzione dell'apoptosi(AIF). Questo meccanismo sembra essere caspasi indipendente.