L'ultimo padiglione costruito è quello delle patologie complesse, inaugurato nel 2000, dove sono ospitati i reparti malattie infettive, oncologia medica ed ematologia. A partire dal 2004 sono state progettate e realizzate le modifiche al vecchio Padiglione Operatorio Centrale (padiglione 40) per adattare l'esistente struttura, la cui realizzazione risale al 1912, alla nuova destinazione. Si è resa necessaria una totale ristrutturazione che, partendo dalle opere murarie, ha interessato ogni aspetto tecnico-funzionale dell'edificio esistente. Il padiglione 40 ospita due sale dedicate alla clinica Ortopedica.