Nella primavera del 2009 è emerso un nuovo virus dell'influenza A (H1N1). È stato rilevato per la prima volta negli Stati Uniti e si è diffuso rapidamente negli Stati Uniti e nel mondo. Il 26 aprile 2009, più di un mese dopo la sua prima comparsa, è stato dichiarato il primo PHEIC quando la pandemia di H1N1 (o influenza suina) era ancora in fase tre. Lo stesso giorno, in tre ore il sito web dell'OMS ha ricevuto quasi due milioni di visite, rendendo necessario un sito web dedicato all'influenza pandemica. All'epoca in cui l'H1N1 era stato dichiarato PHEIC, il contagio aveva colpito solo tre Paesi. La dichiarazione di H1N1 come PHEIC è stata quindi considerata come fonte di panico per la popolazione generale. Tuttavia, uno studio del 2013 sponsorizzato dall'OMS ha stimato che, sebbene la pandemia H1N1 fosse di entità simile all'influenza stagionale, ha comportato la perdita di più anni di aspettativa di vita tra le persone di età inferiore ai 65 anni.