-L'Istituto svolge controlli nell'ambito dei compiti istituzionali ed a fronte di specifiche richieste del Ministro della salute o delle Regioni. Tali controlli riguardano medicinali, vaccini, dispositivi medici, prodotti destinati all'alimentazione e presidi diagnostici.-L'Istituto esegue, inoltre, accertamenti ispettivi, controlli di Stato ed analitici, accertamenti ed indagini igienico-sanitarie in relazione all'ambiente. Si occupa di misurare e vigilare sulla prevalenza, incidenza e mortalità delle principali patologie.-Esercita vigilanza sui laboratori preposti al controllo sanitario sull'attività sportiva e sugli Istituti zooprofilattici. Vigila in materia di attività trasfusionale e di produzione di plasma coordinando le attività tecnico-scientifiche.