Nel giugno 1898, replicò un intervento chirurgico al cuore, effettuato due anni prima da Guido Farina, ed ebbe il primato a Napoli di aver suturato un'ampia ferita penetrante nel ventricolo sinistro. Fu autore anche di diverse opere chirurgiche, la più nota venne pubblicata nel 1888, dal titolo "Compendio di medicina operatoria". Accanto alla professione medica, esercitò incarichi politici nel Consiglio Provinciale, dal 1896 al 1910. Ninni morì accidentalmente nel 1922, a causa di un'infezione contratta durante un'operazione. Su iniziativa del comune di Napoli, fu sepolto al cimitero di Poggioreale, nel quadrato degli uomini illustri.