Molte malattie autoimmuni sono state spiegate, negli ultimi dieci anni, utilizzando il modello teorico dell'aggressione mediata da linfociti. Anche nella patogenesi della SM potrebbero essere coinvolti meccanismi autoimmunitari: fino a qualche anno fa sono sempre stati considerati responsabili dell'azione verso gli antigeni self i linfociti Th1. Le prove a sostegno di quest'ipotesi sono state numerose, ma alcuni esperimenti portano a dubitare dell'effettivo ruolo dei Th1 nella SM (ruolo paradosso dell'IFNγ).