* "De Auditus Organis", illustrato con la collaborazione di Pier Matteo Pini, in cui descrisse per la prima volta la tuba auditiva destra, che prese il suo nome. Oltre alla scoperta di questa parte dell'orecchio, all'Eustachio si deve l'individuazione del muscolo stapedio, nonché lo studio della sua funzione, la disposizione della chiocciola e del modiolo e dell'acquedotto, l'origine e il termine della corda del timpano. Questo lavoro fu dedicato a Mons. Francesco Alciati;