Nel 1827 Hodgkin e Joseph J. Lister (1786-1869) studiarono diversi tessuti al microscopio. Usando le lenti acromatiche migliorate da Lister scoprirono la forma a lente biconcava degli eritrociti e le striature della muscolatura dello scheletro e del cuore, facendo inoltre numerose osservazioni sul pus, sulla struttura delle arterie e delle membrane. Hodgkin studiò poi le funzioni della milza, i carcinomi e la patologia delle strutture sierose, e assieme ad Aston Key (1793-1849) descrisse la retroversione delle valvole aortiche. In seguito si occupò del trattamento del colera e delle sue implicazioni socio-economiche, scrivendo anche un libro al riguardo.