La procedura è controindicata in pazienti in cui l'anestesia può portare ad possibili reazioni fatali, per problematiche cardiache come scompenso non trattabile o shock cardiogeno infine non è possibile effettuarla su coloro che hanno già avuto un ictus su di un intero emisfero cerebrale. La procedura viene considerata ad alto rischio su persone con età > 80 anni, prossimità di interventi cardiochirurgici, attacchi cardiaci recenti, BPCO, insufficienza renale, lesioni del rachide cervicale, radioterapia al rachide, danno al nervo laringeo controlaterale, tracheostomia e occlusione completa dell'arteria controlaterale