Il Canale atrioventricolare comune può inoltre essere associato ad ipoplasia di uno dei due ventricoli: in tal caso viene definito Canale atrioventricolare comune sbilanciato. Un severo grado di ipoplasia ventricolare preclude la possibilità di una correzione biventricolare. Quando invece i due ventricoli sono adeguatamente sviluppati, si parla di Canale atrioventricolare comune bilanciato, e la correzione è preferenzialmente biventricolare.