;Seconda stagione: In "Padri e figli" vengono mostrati i genitori di House ed esplicati i rapporti col figlio; a partire da "Vortice" viene ripreso il rapporto fra House e Stacy, che riavvicinandosi sempre più, porta la donna a scegliere di rinunciare a Mark per il medico, ma quest'ultimo rifiuta di intraprendere una nuova relazione ("È meglio sapere"). In "Caccia al topo" Chase e Cameron, la quale è sotto l'effetto delle anfetamine, vanno a letto insieme. In "Euforia" (episodio doppio composto da "Parte I" e "Parte II") Foreman si ammala e rischia di morire, ma si salva; nell'ultimo episodio della serie, "Mr. Jekyll e Dr. House", un uomo spara a House in ospedale, che si fa operare con la ketamina nella speranza che sparisca anche il dolore alla gamba.