Esiste una controversia filogenetica concernente il considerare tre specie distinte di cannabis ("Cannabis sativa", "Cannabis indica" e "Cannabis ruderalis") o una singola specie con più varietà. Molti studiosi oggi ritengono che si tratti di un'unica specie che varia il proprio fenotipo a seconda delle aree in cui cresce, dell'altitudine, delle caratteristiche del suolo, eccetera.