Durante le guerre napoleoniche la struttura aveva bisogno di essere ampliata, per poter accogliere gli infermi in continuo aumento: nel 1814 era già insufficiente, in seguito a un'epidemia di tifo scoppiata tra le truppe austriache. Un'insufficienza che continuò durante tutto il secolo per il ripetersi delle epidemie di tifo petecchiale e di colera e per l'acuirsi di malattie endemiche in una popolazione povera e malnutrita, come le malattie respiratorie e la pellagra.