L'ospedale è situato su una collina boscosa contigua alla via Emilia, al confine tra il comune di Bologna e quello di San Lazzaro di Savena, limitrofo al Parco regionale dei Gessi Bolognesi e Calanchi dell'Abbadessa. Il complesso fu costruito grazie a una serie di donazioni (a partire dal 1919), del marchese Carlo Alberto Pizzardi (come fece per un altro nosocomio di provincia, l'Ospedale consorziale di Bentivoglio).