Gli anni a seguire furono di particolare importanza per la vita di Marcello Malpighi perché videro la rottura dell'amicizia con Borelli e l'inizio della collaborazione con la Royal Society di Londra, che dal 1669 in poi pubblicherà tutte le sue opere. Entrambi gli eventi rafforzarono l'autonomia scientifica di Malpighi che, pur rimanendo sempre fedele alla microscopia e alla iatromeccanica, estese ulteriormente il suo campo di ricerca: agli insetti ("De bombyce", 1669), all'embriologia ("De formatione pulli in ovo", 1673) e alle piante ("Anatomes plantarum", 1675/1679), aprendo per ognuno di essi nuove strade. Solo davanti ai minerali si diede per vinto.