Il meccanismo della defecazione è integrato con la motilità intestinale. La motilità del colon prevede due tipi di contrazione: le contrazioni segmentarie e le contrazioni propulsive. Le prime hanno sia un ruolo nella progressione delle feci attraverso il colon, sia un ruolo facilitante sull'assorbimento dell'acqua e degli elettroliti. Le contrazioni propulsive sono rappresentate da onde di bassa ampiezza e onde di grande ampiezza. Queste ultime determinano uno spostamento massivo delle feci dal colon al retto determinandone la distensione delle pareti e innescando quei riflessi precedentemente descritti che portano alla defecazione.L'integrazione di tutto l'apparato digerente si riflette anche nel riflesso gastrocolico e in quello ortocolico. Il primo determina un aumento della motilità del colon in seguito all'ingestione di cibo. Il secondo è correlato al ritmo sonno veglia e determina un aumento di motilità del colon al risveglio.  