Questa traslocazione fonde il gene del fattore di trascrizione tiroide-specifico PAX8 con il gene PPARγ, un fattore di trascrizione espresso ubiquitariamente che ha un ruolo importante nella regolazione di geni coinvolti nella differenziazione degli adipociti e nel metabolismo lipidico. La traslocazione coinvolge i cromosomi 3p25 e 2q13 e crea un gene di fusione comprendente il promotore e la sequenza codificante prossimale 50 di PAX8 e la maggior parte della sequenza codificante del gene PPARγ. Questo riarrangiamento è stato identificato in una significativa percentuale di FTC (36-45%), di adenomi follicolari (4-33%), e di varianti follicolari del PTC (o carcinoma a cellule di Hürthle) (37.5%) (48). Il meccanismo di trasformazione indotto da PAX8/ PPARγ non è tuttora chiaro. L'iper-espressione di PPARγ1 wildetype in linee cellulari di tumori tiroidei inibisce la crescita cellulare, un effetto esaltato dagli agonisti di PPAR (49).