Risultati meno soddisfacenti sono stati ottenuti ricorrendo all'aciclovir e all'acido retinoico. In tempi recenti hanno iniziato ad affacciarsi dubbi sull'utilizzo del cidofovir, e una Cochrane review del 2012 conclude affermando che vi è una insufficiente evidenza per affermare che gli agenti antivirali siano di qualche efficacia nel trattamento della papillomatosi respiratoria ricorrente, sia negli adulti sia nei bambini.