La struttura più importante è senza alcun dubbio la prostata, definita come "la ghiandola parauretrale per eccellenza", di forma bilobata e costituita a sua volta da molte decine di minuscole ghiandole. Il tratto mediano dell'uretra prostatica, nei soggetti giovani e sani, è interamente contenuto nel diametro verticale della prostata, ed è in stretta connessione con la parete interna della ghiandola (nota come zona periuretrale prostatica). Inoltre, l'uretra intraprostatica divide esattamente a metà i due lobi laterali della prostata, ed è per questo chiamata "canale maggiore", per distinguerla dai due dotti eiaculatori, detti invece "canali minori" o canalicoli; anche l'utricolo prostatico è a volte considerato un canalicolo, tuttavia a fondo cieco.