Il VDR, costituito da 427 residui amminoacidici, appartiene alla superfamiglia dei recettori nucleari, in particolare alla famiglia NR1l, a cui appartengono anche il recettore PXR (Pregnane X Receptor) e il recettore CAR (constitutive androstane receptors). Il recettore della vitamina D è organizzato in [7]:-Un dominio di legame al DNA (DBD) all'estremità amino terminale.-Un dominio di legame con il calcitriolo (LDB) all'estremità carbossiterminale.-Un dominio cerniera (HD) che unisce DBD a LBD. Questa è una struttura comune a tutti i recettori nucleari degli ormoni. In particolare, il recettore della vitamina D presenta un motivo formato da due dita di zinco che interagiscono con sequenze specifiche del DNA, struttura comune anche ai recettori di ormoni steroidei e tiroidei. 