Sono stati sviluppati diversi metodi per ridurre la tossicità della cura, incluso l'uso di corticosteroidi e di agenti immunosoppressori o l'eliminazione delle cellule CAR-T attraverso geni cosiddetti di "suicidio" appositamente introdotti nelle cellule CAR-T ed in grado di attivare in maniera controllata processi di morte cellulare. La gestione di questi effetti indesiderati (tossicità) è diventata un passo fondamentale per il successo dell'applicazione clinica delle CAR-T.