Non di minore importanza furono le ricerche del Maggiorani nell'ambito della fisiopatologia. Il fulcro delle ricerche riguardava studi sul sistema cardio-respiratorio e sul sistema nervoso con annesse patologie. Questi ultimi si ricollegarono ai paralleli studi sul magnetismo, poiché egli ipotizzava effetti terapeutici da parte delle vibrazioni molecolari dei metalli sulle patologie riguardanti la conduzione dell'impulso nervoso. Altri orizzonti di studio riguardarono le febbri perniciose causate dalla malaria, le quali all'epoca flagellavano l'Agro Romano, e le funzioni della milza in cui egli tentava di conciliare le contrastanti teorie del tempo che circolavano sull'argomento.