Con questa evoluzione di metodo compiva lentamente i primi passi a Roma la moderna medicina scientifica e Maggiorani, rispettoso della tradizione e aperto al progresso, ne fu uno dei più attivi pionieri. Il 16 settembre 1825, lo stesso partecipò al concorso per la nomina di medico-assistente nell'ospedale del Santo Spirito, ma con sua grande meraviglia e disappunto, non risultò tra i vincitori. Convinto di essere vittima di un'intollerabile ingiustizia e rischiando possibili ritorsioni future, stigmatizzò pubblicamente l'accaduto dalle pagine del Giornale Arcadico con l'articolo "Sopra alcuni giudizi medici", in cui rivendicava la validità delle sue risposte ed evidenziava l'impreparazione della commissione esaminatrice e l'inadeguatezza dei loro metodi di valutazione. Dopo una breve parentesi presso il piccolo ospedale di Santa Maria della Consolazione, nel 1829 poté finalmente entrare al S. Spirito, circondato però da un alone di scetticismo da parte dell'ambiente medico a causa delle sue tecniche innovative. Parallelamente all'attività ospedaliera intraprese anche quella di medico curante a domicilio assorbendo gran parte della clientela che era stata dell'Angelucci.