L'acido ibandronico è controindicato nei soggetti con ipersensibilità al principio attivo oppure ad uno qualsiasi degli eccipienti. Il farmaco è anche controindicato nei soggetti che presentano malattie, quali ad esempio la stenosi o l'acalasia, oppure alterazioni a livello esofageo che possano comportare un ritardato svuotamento dell'organo e, quindi, aumentare il rischio di effetti indesiderati. Allo stesso modo ne è controindicata l'assunzione in pazienti che presentano, per qualsiasi motivo, l'impossibilità a rimanere in piedi o seduti oppure in una posizione che comporta mantenere il busto eretto per almeno mezz'ora.