All'età di 17 anni si iscrisse alla facoltà di medicina presso l'Università di Bologna, conseguendo, nel 1829, la laurea ad honorem. Calori iniziò l'università in un momento in cui era già in atto la rivoluzione della medicina, che stava trasformando profondamente la società. Allievo di Francesco Mondini presso l'Istituto Anatomico, conseguita la laurea, rimase presso il maestro, e nel 1830 ottenne la nomina a prodissettore e l'anno dopo quella a capo dissettore.