Tuttavia è d'uopo specificare che il tronco dell'encefalo contiene nuclei motori e sensitivi che omolateralmente proiettano e ricevono stimoli nervosi alle e dalle strutture di cranio e collo e grandi sistemi ascendenti e discendenti, come la via piramidale, che conducono stimoli nervosi destinati e derivanti da porzioni di soma controlaterali. Preso atto di questa caratteristica anatomica è possibile capire perché le sindromi del tronco encefalico vengono talora definite sindromi crociate o sindromi alterne. Un esempio tipico e comprensibile è la sindrome di Wallenberg in cui una lesione bulbare esita, per compromissione della porzione discendente del nervo trigemino, in una ipoestesia facciale termodolorifica omolaterale e, per compromissione del fascio spino-talamico, in una ipoestesia corporea termodolorifica controlateralmente.