Darexaban inibisce sia il fattore Xa libero che quello legato al coagulo e l'inibizione del fattore Xa da parte della molecola previene la generazione della trombina e lo sviluppo del trombo determinando una diminuzione della formazione di coaguli di sangue che è dose dipendente. Darexaban non inibisce direttamente l'aggregazione delle piastrine, ma impedisce indirettamente l'aggregazione piastrinica che viene indotta dalla trombina.