In collaborazione con altri medici, Nothnagel pubblicò ""Specielle Pathologie und Therapie", un manuale di medicina a 24 volumi. Le edizioni precedenti di questo lavoro sono state pubblicate da Rudolf Virchow (dal 1854 al 1876) e da Hugo Wilhelm von Ziemssen (dal 1875 al 1885) come "Handbuch der speciellen Pathologie und Therapie"".