La Biblioteca biomedica dell'Università degli studi di Firenze conserva il fondo di archivio Carlo Burci. costituito da 241 unità archivistiche. Sono contenuti, tra gli altri, manoscritti e appunti relativi all'attività di Carlo Burci come chirurgo e docente a Firenze e Pisa, carte relative alla stesura di un nuovo codice sanitario del Regno d'Italia, frammenti della sua traduzione dell'opera di Antonio Benivieni sulle cause e relativi rimedi di alcune malattie, notizie sul colera a Pisa del 1854.