 In linea con gli standard per la gestione delle fistole perianali complesse, si richiede la caratterizzazione delle fistole del paziente prima del trattamento. Ciò comprende una conoscenza approfondita della loro anatomia (numero di fistole esistenti e di aperture), topografia (estensione e relazione con gli sfinteri e altri muscoli pelvici) e potenziali complicanze associate (come gli ascessi). Prima di pianificare la somministrazione di Alofisel, il chirurgo deve assicurarsi che non siano presenti ascessi e che la malattia mucosale locale sia lieve o inattiva. In caso di ascesso, sono necessari l'incisione e il drenaggio e, se opportuno, devono essere posizionati i setoni secondo le procedure chirurgiche di routine. 