Nel 1805 pubblicò le sue tesi dal titolo“Le passioni considerate come cause, sintomi e significati della cura in caso di infermità mentale”. Esquirol, proprio come Pinel, credeva che l'origine delle malattie mentali fosse collegato alle passioni dell'anima e, inoltre, si convinse che la follia non intaccasse completamente ed irrimediabilmente il raziocinio del paziente.