Se la causa dei disturbi non è immediatamente identificabile può prescrivere, come accertamenti iniziali, le analisi del sangue e delle feci. Gli esami del sangue possono mettere in evidenza carenze specifiche (lattosio o vitamina B12), anemia, eventuali alterazioni degli enzimi di fegato e pancreas o la presenza di anticorpi anomali. L'esame delle feci permette l'identificazione di un eventuale microrganismo responsabile di un malassorbimento di origine infettiva. Inoltre, permette di quantificare sia la quantità di grassi presenti, individuando così la steatorrea (malassorbimento lipidico), sia i livelli della chimotripsina (enzima chiave nella digestione delle proteine, prodotto nel pancreas) per valutare la funzionalità pancreatica.