Sono recentemente stati identificati markers genetici, situati nel complesso maggiore di istocompatibilità (MHC) sul cromosoma 6, che sembrano essere associati alla sindrome nefrosica. Nella sindrome nefrosica del bambino infatti è stato riscontrato un aumento della frequenza di determinati alleli di classe I (HLA-A1, B8, B12, B27) e di classe II (DR3 e DR7). Poichè i bambini DR7+ erano spesso anche atopici, l'allele DR7 potrebbe essere il collegamento genetico tra atopia e sindrome nefrosica. Altri alleli di classe II (DR2 e DR4) sembrano invece avere un ruolo protettivo, poiché la loro frequenza nel genoma dei bambini nefrosici è inferiore a quella attesa. Non è comunque risultato possibile correlare la frequenza degli alleli con la prognosi della malattia, né con la risposta alla terapia o con il numero di ricadute.Note e caratteristiche sono le alterazioni nei livelli di immunoglobuline plasmatiche nei pazienti con sindrome nefrosica; i dosaggi sierici di IgG e di IgA sono in genere inferiori a quelli di norma, mentre quelli delle IgM sono elevati. Si può quindi ipotizzare che lo switch degli isotipi delle immunoglobuline avvenga in maniera anormale in questa malattia; lo switch è mediato dalle cellule B, ma è controllato dalle cellule T CD4+ attraverso interazioni cellula-cellula e attraverso il rilascio di linfochine. Poichè le cellule B di pazienti nefrosici, coltivate con cellule T di soggetti normali, producono quantità e distribuzione normali delle immunoglobuline, è stato ipotizzato che siano proprio le cellule T a rivestire un rolo chiave nella patogenesi delle sindromi nefrosiche [63,47].Numerosi studi dimostrano che il numero assoluto dei linfociti totali (cellule T, cellule B) nel sangue periferico è normale o leggermente diminuito e che non c'è differenza nella concentrazione dei CD4+ e dei CD8+. Tuttavia nelle GNLM non trattate e nelle GSFS alcuni markers di attivazione dei linfociti T periferici sono aumentati (CD25, il recettore per l'interleuchina 2; CD69, il recettore per la transferrina), così come sono aumentate le concentrazioni sieriche di IL-2 e del recettore solubile per l'IL-2, riflettendo un'attivazione delle cellule T. I linfociti dei bambini con sindrome nefrosica mostrano una diminuita reattività quando stimolati con mitogeni; questa iporeattività è causata da un fattore di natura ancora da definire rilevato nel plasma di alcuni pazienti nefrosici, che inibisce la risposta mitogenica. Tale fattore, noto come SIRS (soluble immune response suppressor), è una linfochina prodotta dai linfociti T CD8+ attivati dai macrofagi. SIRS [26,90,92,91] è in grado di sopprimere la risposta delle cellule T agli antigeni e anche la produzione di immunoglobuline da parte delle cellule B. Il ruolo del SIRS è discusso e non è stata rilevata una correlazione diretta con la permselettività glomerulare. E' noto da tempo che infezioni che provocano uno stato di immunodepressione, come per esempio il morbillo, possono indurre una remissione della sindrome nefrosica.Alcune malattie linfoproliferative (morbo di Hodgkin, linfoma, leucemia, tumori solidi) possono essere associate a sindrome nefrosica, suggerendo che i linfociti T siano coinvolti nella sua immunopatogenesi.