Le infezioni da "C. difficile" si verificano in tutte le aree del mondo e il batterio è divenuto il principale responsabile delle infezioni nosocomiali, superando lo Stafilococco aureo meticillina-resitente. In uno studio retrospettivo su oltre 11.000 pazienti ospedalizzati, "C. difficile" è risultato la più frequente causa di infezioni ospedaliere, essendo responsabile del 12% di tutte le infezioni. Il "C. difficile" è causa del 10-25% di tutti i casi di diarrea associata agli antibiotici. 