Ancora perdurava l'eco dei fatti che nel 1861 avevano portato alla proclamazione del Regno d'Italia, che già i volontari pensavano alle due questioni rimaste insolute: Roma e il Veneto. A fine giugno del 1862 Ripari raggiunse Garibaldi a Caprera insieme ad un gruppetto di altri cremonesi; il medico fu tra i pochi intimi messi al corrente dal Generale del suo progetto («L'aquila vola verso il sud», scriveva Ripari a un amico genovese). Lo seguì poi nel suo rapido carosello di discorsi: a Palermo (6 luglio), a Marsala (19 luglio) e a Catania (24 agosto). È importante ricordare che in questa occasione Ripari, il 3 luglio a Palermo, fu affiliato alla massoneria di rito scozzese (nella Loggia "I Rigeneratori del 12 gennaro 1848 al 1860 Garibaldini", della quale era Maestro Venerabile Emanuele Sartorio) insieme agli altri componenti dello Stato Maggiore garibaldino (Giacinto Bruzzesi, Francesco Nullo, Enrico Guastalla, Giuseppe Guerzoni, Giovanni Chiassi, Giovanni Basso, Giuseppe Nuvolari, Gustavo Frigyesi e altri ufficiali): fu lo stesso Garibaldi, nella veste di Gran Maestro, a firmare la proposta di ammissione regolare «ai misteri dell'Ord:. M:. in alcune delle RR:. LL:. poste sotto l'O:. di Palermo». «A tal fine e con gli alti poteri a me conferiti – aggiungeva – gli dispenso dalle solite formalità». Il 19 luglio 1862, da Marsala che due anni prima l'aveva visto approdare con i Mille, Garibaldi lanciò il fatidico «O Roma o morte» e, attraversata l'isola raccogliendo volontari, passò lo stretto di Messina nella notte del 25 agosto. Il momento era gravissimo, minacciose le complicanze internazionali. Da Torino, dove ancora risiedeva, il governo Rattazzi diede ordine alle truppe regolari di fermare la marcia dei «ribelli». Il 29 agosto, sull'Aspromonte (v. anche giornata dell'Aspromonte), lo scontro: Garibaldi ordinò ai suoi di non fare fuoco, ma si svolse tuttavia un breve conflitto a fuoco durante il quale il generale fu ferito da due proiettili sparati dai bersaglieri del colonnello Emilio Pallavicini. Un proiettile gli produsse una ferita superficiale alla coscia sinistra, mentre una scheggia di un'altra palla, probabilmente di rimbalzo, gli penetrò nell'articolazione della caviglia del piede destro, producendogli una ferita assai più grave della prima. Garibaldi fu immediatamente soccorso dai medici dell'ambulanza: da Ripari (Capo medico) e dai medici siciliani dott. Giuseppe Basile e dott. Enrico Albanese. Albanese tentò sul campo un'incisione d'urgenza per estrarre la palla, decisione alla quale tuttavia si oppose nettamente Ripari, fautore di un rinvio dell'intervento a un momento più favorevole e convinto che il proiettile non fosse stato trattenuto nell'articolazione. Ripari si trovò così al centro di un fatto clamoroso, che commosse e scandalizzò l'Italia e complicò drammaticamente la questione interna per un episodio di guerra civile che avvelenò l'anima nazionale. Fu medico curante e amico dell'illustre ferito sulla fregata "Duca di Genova", che trasportò il prigioniero a La Spezia e successivamente al Forte del Varignano (Grazie di Portovenere), dove Garibaldi rimase detenuto fino al 22 ottobre quando, per effetto del decreto di amnistia del 5 ottobre, poté essere trasferito in un albergo a La Spezia, e di qui, l'8 novembre, all'Albergo delle Tre Donzelle a Pisa. Ripari, insieme agli altri due curanti Basile e Albanese, presenziò sempre ai numerosi consulti di medici più o meno illustri, italiani ed europei, che si succedettero al capezzale di Garibaldi e fu presente all'intervento del 23 novembre, quando il professor Ferdinando Zannetti di Firenze estrasse finalmente il frammento di piombo dalla ferita. Nel 1863 il Ripari pubblicò il libro "Storia medica della grave ferita toccata in Aspromonte dal Generale Garibaldi". Il suo racconto e la documentazione medica ad esso allegata, unitamente ad analoghi lavori pubblicati dagli altri due curanti, Basile e Albanese, costituiscono una delle principali fonti di informazione su cui sono basati i non pochi studi di critica medica della ferita, alcuni dei quali pubblicati anche in tempi recenti. Nel suo libro Ripari non si lascia sfuggire l'occasione di polemizzare aspramente con il Governo di Torino, lanciando anzi apertamente l'accusa di aver tentato di assassinare Garibaldi. il medico nella prefazione: «Questa medica storia della grave ferita toccata al generale Garibaldi in Aspromonte, ferita fatta da palla italiana, lanciata da braccio italiano, comandato e diretto da uomini italiani, governanti la gente italiana, io scrivo ecc.». E più avanti: «Il governo che si diceva italiano, fatto briaco di gioia dal tenere ferito e prigioniero l'uomo che aveva ordinato fosse morto, ordinava il trasporto immediato, affrettato di gravissimo ferito e per un viaggio di altre dodici ore di tempo nella speranza senza dubbio che quello che non aveva fatto l'offesa materiale potessero fare i disagi e lo strapazzo». Convinzione che traspare evidente anche dalle pagine dell'altro medico di Garibaldi, il dottor Albanese, il quale fra l'altro ricorda che il generale al Varignano rimase più giorni senza un letto di ricambio, che gli fu poi allestito da un privato cittadino della Spezia e, sino al 25 settembre, non vennero provvedute né bende, né filacce, ne sanguisughe, «niente insomma di quello che occorre per la medicatura di un ferito».