Si effettua la perfusione ipertermica dell'addome per 60 minuti con un flusso incrementale da 500 a 3000 ml\min (flusso medio 1000 ml\min). Si mantiene il monitoraggio in tempo reale dei flussi in ingresso ed in uscita, delle temperature intraddominale e di uscita dal peritoneo. Dopo il raggiungimento di una temperatura intraddominale stabile di 42° C (di solito si raggiunge la temperatura in 15 minuti circa), si aggiunge la Mitomicina C al dosaggio di 15 mg/mq al perfusato, che consiste in 4-5 litri di fisiologica. La quantità di liquido perfuso viene decisa in base alla costituzione del paziente.A questo punto inizia il trattamento vero e proprio con la circolazione del farmaco per 60 minuti, monitorando la temperatura in continuo attraverso la sonda intraddominale, esofagea, e rettale. Durante il trattamento, la posizione del paziente viene modificata ogni 5 minuti cambiando l'inclinazione latero-laterale e antero-posteriore del lettino operatorio. La copertura intraoperatoria con Cefalosporine di 3 a generazione e la profilassi antitrombotica postoperatoria con eparine a basso peso molecolare sono raccomandate.