Nel 2009 Eugene Braunwald ha presieduto una commissione amministrativa dei due Ospedali affiliati all’"Harvard Medical School", che ha redatto delle regole molto stringenti per evitare il conflitto di interessi tra i dirigenti medici dell'Istituzione e le Aziende farmaceutiche e biotecnologiche. Queste limitazioni si erano rese necessarie per le crescenti critiche dell'opinione pubblica americana sui legami tra industria e mondo accademico.