L'istologia della valvola ileocecale mostra un brusco cambiamento da una mucosa villosa tipica dell'ileo a una mucosa più colonnare. La sua struttura è tipicamente papillosa. La muscolatura esterna e la mucosa muscolare vanno incontro a un ispessimento. La valvola è composta da due pieghe che confluiscono nell'intestino crasso, ha lo scopo di non permettere il reflusso cieco-ileale. Il tessuto linfatico è presente in quantità variabile.