La fratassina è una proteina solubile con una funzione solo parzialmente delucidata.La proteina è localizzata nella membrana interna mitocondriale, dove è elaborata dalla "mithocondrial processing peptidase" (MPP) per produrre la forma matura di 18 kDa attraverso un processo in due fasi, e nella matrice mitocondriale.  (B.Sturm et al., 2005).