L'incubazione del rotavirus dura 48 ore in seguito alle quali si verificano diarrea acquosa profusa che perdura per 3-8 giorni, febbre, vomito e disidratazione. L'infezione da rotavirus di gruppo A normalmente è autolimitante e priva di sequele (se non un'intolleranza al lattosio che può persistere per settimane), è severa e talvolta mortale nei pazienti già denutriti e disidratati. Circa 1 bambino su 40 richiede l'ospedalizzazione. Negli adulti l'infezione causa diarrea lieve o è asintomatica.