I metodi di registratura d'immagini possono essere classificati basandosi sul livello di automazione che forniscono (sono stati sviluppati metodi manuali, interattivi, semi-automatici e automatici). I metodi manuali forniscono strumenti per allineare le immagini manualmente. I metodi interattivi riducono il bias introdotto dall'utente, eseguendo alcune operazioni chiave automaticamente mentre ancora si affidano all'operatore per guidare le registrature. I metodi semi-automatici eseguono la maggior parte dei passi della registratura automaticamente, ma dipendono dall'utente per verificare la correttezza della registratura. I metodi automatici non permettono alcuna interazioni con l'utilizzatore umano ed eseguono tutti i passi della registratura automaticamente.