L'elettroencefalogramma (EEG) è indolore e, generalmente, molto sicuro. Nessuna scarica elettrica è immessa nel corpo durante l'esecuzione dell'esame. L'unico disagio può essere rappresentato dai capelli che, al termine dell'esame, risulteranno sporchi e disordinati e da una leggera stanchezza. Per queste caratteristiche l'esame può essere eseguito anche nelle donne in stato di gravidanza.