Fabbri si soffermò soprattutto, in ambito ortopedico, sulle lussazioni della testa del femore, tanto che le sue "Memorie di chirurgia sperimentale sulle lussazioni traumatiche del femore", pubblicate nel 1840, dopo due lunghe sedute scientifiche nella sede della Società Medico-Chirurgica di Bologna, sono considerate una pietra miliare della ortopedia italiana. Innanzitutto egli diede un inquadramento eziopatogenetico e diagnostico alle lussazioni traumatiche coxo-femorali, descrivendo una precisa divisione topografica delle lussazioni dell'anca e delineando, accanto a queste, il percorso di cura da compiere. Dedicandosi a questi studi egli entrò nell'alveo di un già acceso dibattito accademico, confrontandosi in particolare con Joseph-François Malgaigne, il quale aveva già affrontato questo tema, e pubblicando nel 1855 gli "Studi sulle lussazioni del femore di J.F.Malgaigne e riflessioni di Giovan Battista Fabbri", in cui se da una parte riconosceva l'importanza delle ricerche condotte dal professore francese, dall'altra ne criticava gli esiti principali, negando la possibilità di lussazioni incomplete, come sostenuto invece da Malgaigne.