Dal 1799 al 1806 studiò medicina a Parigi. In quel periodo fu amico di Jean-Baptiste Bory de Saint-Vincent (1778-1846) e controllò la stampa del suo "Voyage dans les quatre principales îles des mers d'Afrique". L'autore, per gratitudine, nella prefazione affermò che lo zelo del giovane Dufour nelle scienze naturali: «...promette a queste discipline uno dei maggiori esponenti».