Al problema dell'anima Lagalla dedicò almeno tre corsi annuali della lettura ordinaria di filosofia, che tenne alla Sapienza dall'anno accademico 1601 alla morte; queste lezioni furono raccolte in un manoscritto dal titolo "De anima commentarii", descritto da Allacci e oggi perduto. Allo stesso argomento è dedicato il penultimo volume dato alle stampe dal L., il "De immortalitate animorum ex Aristotelis sententia libri tres" (Roma 1621), la cui composizione terminò prima del dicembre 1619, come risulta da una lettera di Lagalla a Galilei.