Sierologicamente, il test ELISA può essere utilizzato durante la fase acuta della malattia grazie a IgM specifici contro la febbre gialla o con un aumento di IgG specifici in grado di confermare l'infezione. Insieme con i sintomi clinici, la rilevazione di IgM o di un aumento di quattro volte degli IgG specifici è considerato un'indicazione sufficiente per la malattia. Dal momento che questi test possono reagire con altri flavivirus, come il virus della dengue, questi metodi indiretti non possono dimostrare definitivamente l'infezione della febbre gialla.