Con la deposizione di Romolo Augusto, il 4 settembre del 476 d.C., Odoacre pone fine all'Impero Romano d'Occidente, mentre in Italia le guerre e le epidemie devastano la popolazione; d'altra parte, fiorisce nello stesso periodo l’Impero Romano d’Oriente sotto il governo di Giustiniano: Costantinopoli diventa in breve tempo il centro della religione cattolica. Proprio a causa dei dissidi tra i più intransigenti cattolici con gli studiosi e i medici che si erano formati grazie alla filosofia ellenistica, quest'ultimi furono additati come eretici e costretti a fuggire in Mesopotamia, dove diffusero la pratica dell'Alchimia, le teorie di Ippocrate, di Galeno e il formulario della Teriaca.