Cabanis sposò Charlotte de Grouchy, sorella del maresciallo de Grouchy e di Sophie, vedova di Condorcet. Fu eletto all'"Académie française" nel 1803. Divenne professore alla scuola di medicina di Parigi e deputato al Consiglio dei Cinquecento; approvando anche il colpo di Stato del 18 brumaio . Fu nominato senatore con l'avvento del Primo Impero.