Il trattamento per il virus HCoV-NL63 dipende dalla gravità della sintomatologia associata. La maggior parte delle infezioni da lievi a moderate scompare da sola. I sintomi possono essere alleviati prendendo un antidolorifico o farmaci per la febbre, facendo una doccia calda o usando un umidificatore . Il trattamento antivirale può essere necessario per i pazienti infetti che finiscono nel reparto di terapia intensiva (ICU) a causa di infezione respiratoria acuta . L'immunoglobulina endovenosa è un inibitore HCoV-NL63 approvato dalla FDA che viene anche usato per trattare la deficienza immunitaria primaria, l'RSV e la malattia di Kawasaki .