La presenza di un catetere nel maschio può limitare o impedire il naturale drenaggio del secreto delle ghiandole parauretrali, con il rischio di provocare infezioni (uretriti) che possono eventualmente ascendere attraverso i dotti parauretrali, fino ad infiammare le ghiandole stesse. Viene inoltre limitato fortemente l'apporto del fattore antimicrobico uretrale e delle sostanze protettive, con il rischio di lasciare l'epitelio uretrale scoperto verso fenomeni infettivi o infiammatori. Inoltre, le fragili pareti dell'uretra maschile possono subire traumi causati dal catetere, che includono lesioni uretrali iatrogeniche di varia tipologia (da semplici ferite fino alla lacerazione o rottura - frattura dell'uretra).