La diagnosi è sostanzialmente ecografica e deve essere confermata una settimana dopo il primo riscontro di un sacco gestazionale vuoto, che cresce in dimensioni coerentemente a quello presente in gravidanze normali. La presenza di un sacco gestazionale di almeno 18 mm o in presenza di una concentrazione di hCG superiore o uguale a 5100 mIU/mL in assenza di riscontri ecografici della presenza dell'embrione in più valutazioni ripetute sono solitamente sufficienti per la diagnosi, che solitamente viene effettuata intorno alla 6ª-7ª settimana di gravidanza. Anche la presenza di un sacco gestazionale di 13 mm in assenza di sacco vitellino può essere ritenuta diagnostica.