Da giovane, Hunayn si recò a Baghdad, dove fu accolto nella scuola medica che si teneva sotto l'autorevole direzione di Yuhanna ibn Masawayh (Mesuè il Vecchio). Hunayn apprese il greco e cominciò privatamente a tradurre testi medici greci in arabo. Grazie alle sua profonda conoscenza del greco entrò in contatto con eminenti personalità del suo tempo.