Nel 1892, Cope (allora cinquantaduenne) ricevette dal Texas Geological Survey una sovvenzione per i lavori sul campo. Con le sue migliori finanze fu in grado di pubblicare un'opera massiccia sui "Batrachians of North America", che era la più dettagliata analisi e organizzazione delle rane e degli anfibi del continente, e 1.115 pagine sui "The Crocodilians Lizards and Snakes of North America". Negli anni Novanta del XIX secolo, il suo tasso di pubblicazione aumentò a una media di 43 articoli all'anno. Lo stesso anno la figlia Julia si sposò con William H. Collins, un professore di astronomia di Haverford. Dopo la luna di miele europea, la coppia tornò a Haverford. Mentre Annie si trasferì a Haverford Cope non lo fece. La sua ragione ufficiale era il lungo tragitto e le tardive conferenze che teneva a Philadelphia. Nella corrispondenza privata, tuttavia, Osborn scrisse che i due si erano essenzialmente separati, sebbene rimanessero in rapporti amichevoli.