La morte di Luisa Guidotti avvenne lo stesso giorno di quella della sua guida spirituale: il martire san Tommaso Moro. Qualche tempo prima, la Guidotti, rimasta profondamente colpita dalla vita di san Tommaso, aveva confessato a padre Dove di sentirsi molto vicina a lui: «Penso che sia stato un uomo molto solo. Trovo una grande forza meditando le sue ultime parole.» Le circostanze della sua morte appaiono tutt'oggi avvolte nel mistero: uno dei soldati che le sparò è in attesa di giudizio per falsa testimonianza. Secondo il documento ufficiale della polizia, la Land-Rover sulla quale viaggiava Luisa Guidotti non era stata riconosciuta nonostante il veicolo presentasse su ogni lato una croce di notevoli dimensioni e la scritta “All Souls Mission Hospital”, oltre alla consueta “Ambulanza”.