La prognosi della sequenza di Potter è,molto spessa, infausta. Una serie di 23 pazienti nel 2007 ha registrato 7 decessi, 4 nel periodo neonatale. Tutti e 16 i sopravvissuti hanno una malattia renale cronica, con insufficienza renale in fase di sviluppo a metà (età media 0,3 anni, intervallo da 2 giorni a 8,3 anni). I sopravvissuti presentavano deficit di crescita (44%) e ritardo dello sviluppo cognitivo e motorio (25%).