La metaplasia può definirsi come matura o immatura. Quest'ultima è costituita da piccoli elementi cellulari, desquamanti spesso in gruppetti, con citoplasma cinofilo, omogeneo, denso a contorni netti e nucleo vescicoloso con reticolo cromatico granulare ed evidente. Le cellule da metaplasia matura si repertano sugli strisci citologici sia in gruppo che isolate, posso avere forma rotonda, ovale o poligonale, il nucleo è centrale, tondeggiante con cromatina finemente sparsa. Il citoplasma è denso, prevalentemente cianofilo. Particolare attenzione va posta alla zona di trasformazione, in quanto sede di continui rimaneggiamenti cellulari che possono evolvere in strutture irregolari se non francamente atipiche. Pertanto, è da segnalare l'importanza della giunzione squamocolonnare in quanto sede ad alto rischio per l'insorgenza di lesioni preneoplatiche e neoplastiche.