Agente dell'FBI, apparentemente ingenuo, è in realtà molto abile. Dopo la morte di Sweets diventa il nuovo partner di Booth. Un suo tratto caratteristico è l'essere perennemente affamato, riuscendo a mangiare senza alcun disagio anche nelle situazioni più drammatiche, cosa che sorprende Booth. Per via del trauma infantile della fuga del padre Philip, un truffatore, Aubrey nutre un grande rancore verso gli opportunisti e gli uomini ossessionati dal denaro. Ha un rapporto di profonda amicizia con Booth, al quale riserva spesso i suoi commenti e le sue battute ironiche e taglienti. È particolarmente sveglio, arguto e sagace, ed è molto ferrato in chimica, suscitando per questo l'ammirazione di Bones e Booth. Nonostante ami rimarcare la sua condizione da single, di cui va fiero, si innamora della tirocinante Jessica Warren, anche se all'inizio questa pare respingerlo optando per un'amicizia.