Liberata Bologna il 21 aprile 1945, l'ospedale passò per qualche tempo sotto il controllo militare inglese e poi alle dipendenze della Croce Rossa Italiana. Il 31 agosto 1947 Scaglietti assunse la direzione dell'Istituto Ortopedico Toscano "Piero Palagi", lasciando a Bologna Leonardo Gui con il compito di sostituirlo alla guida del Centro ma tornandovi ogni settimana fino al 1951, quando il Putti cessò ogni attività. Nel 1956 vinse una cattedra all'Università di Firenze, che mantenne fino al 1977, fondando una scuola di ortopedia che raggiunse fama internazionale.