La causa più comune di meningite asettica è un'infezione virale, in particolare da enterovirus . In effetti, il 90 percento di tutti i casi di meningite virali sono causati da enterovirus. Altri virus che possono causare meningite asettica sono il virus della varicella zoster, l'herpes e la parotite. Altre cause possono includere micobatteri, funghi, spirochete e complicanze da HIV. Gli effetti collaterali di alcuni farmaci come i farmaci antinfiammatori non steroidei (FANS), Ranitidina, sulfametossazolo,gli antibiotici (ad es. Trimetoprim-sulfametossazolo o amoxicillina ) e i farmaci antiepilettici possono anche causare meningite asettica. 