Pierre Marie condusse una vita riservata, riceveva pochi ospiti ed evitava apparizioni pubbliche, nonostante i numerosi riconoscimenti e la notorietà. I suoi interessi oltre la medicina erano l'arte, la scherma, il golf, oltre all'impegno profuso per la "Neurologique Revue", che lui e Brissaud fondarono nel 1893, e la "Société Française de Neurologie", che ha servito come primo segretario generale. È stato inoltre membro della "Académie de Médecine" dal 1911. La sua vita fu segnata dalla morte della moglie per erisipela, della figlia Juliette per appendicite, e del figlio, André, anch'egli medico, a causa del botulismo contratto durante le sue ricerche presso l'Istituto Pasteur. Dopo la tragica sequela di questi avvenimenti, Marie si emarginò ancor di più dalla vita sociale, e fu sempre più afflitto da problemi di salute fino alla morte, sopraggiunta il 12 aprile del 1940 a Pradel (Var), all'età di 86 anni.