L'arbaprostil è un citoprotettore e, a dosi maggiori, è anche in grado di inibire la secrezione gastrica acida; è stato pertanto proposto nel trattamento dell'ulcera peptica. Il suo uso clinico è praticamente nullo, essendogli preferiti gli inibitori di pompa protonica e gli antistaminici H2 di seconda generazione, più efficaci è sicuri.