L'accertamento (diagnosi) della malattia invasiva da Haemophilus influenzae si basa sul riconoscimento dei disturbi (sintomi) principali e su esami di laboratorio. La diagnosi e le cure immediate sono fondamentali per combattere l'evoluzione della malattia e favorire la guarigione. Il sospetto di meningite o di altra malattia invasiva causata da H. influenzae di tipo b (Hib) diventa molto forte quando il bambino non è stato vaccinato contro Haemophilus influenzae di tipo b (Hib). Raramente si possono verificare casi dovuti a tipi diversi dal b, non prevenibili da vaccinazione; Haemophilus influenzae diversi dal tipo b possono causare infezioni anche a bambini vaccinati per Hib.