E' un potente inibitore della replicazione sia dell'HBV che dell'HIV, approvato per il trattamento di quest'ultimo.Data la sua analogia strutturale con la lamivudina, l'emtricitabina seleziona i medesimi mutanti.In uno studio la somministrazione quotidiana di 200 mg di emtricitabina ha comportato una maggiore incidenza di risposta virologica, biochimica e istologica rispetto al placebo alla settimana 48 con un analogo tasso di sieroconvesione ad anti-HBe tra i pazienti HBeAg-positivi.Mutanti resistenti nel motivo YMDD sono stati individuati nel 13% dei pazienti Trials clinici mostrano che al dosaggio di 30 mg/die risulta ben tollerata con percentuali di risposta virologica del 59% negli HBeAg-positivi e del 92% negli 132].Non aumenta però il tasso di sieroconversione ad anti-HBe rispetto al placebo.Inoltre può selezionare mutanti nel motivo YMDD.