Per quanto riguarda la prognosi Daquin accenna all'estrema difficoltà di ottenere guarigioni, ma azzarda anche qualche precisazione in merito; a questo proposito si può notare come l'elemento mancante sia proprio la nosografia che di lì a poco avrebbe trovato sviluppo nei lavori ad esempio di Pinel. Senza la possibilità di una identificazione delle patologie, di una distizione dei casi a seconda degli elementi favorevoli o contrari (fattori di rischio, elementi positivi o negativi da un punto di vista prognostico) ogni tentativo di prevedere l'esito di una situazione di malattia era affidato in modo rischioso all'intuizione personale del medico non in possesso di dati in base ai quali formulare una previsione.Tuttavia le osservazioni di Daquin dimostrano in opera tutto l'impegno per sviluppare la capacità predittiva del medico curante; un aspetto messo in evidenza è l'importanza del carattere della persona che si ammala: caratteri particolarmente inclini alla tristezza, alla malinconia sarebbero più difficili da guarire, laddove i folli "furiosi" sarebbero curabili e guaribili soprattutto se la malattia non è di vecchia data, perché in tal caso i danni cerebrali o la fissazione di idee mal connesse condurrebbe ad una stato di irreversibilità.Nella prognosi vengono sempre associati il tipo di follia manifestata, furiosi, imbecilli, "gioiosi" (si tratta di coloro che che alcuni anni più tardi saranno chiamati "fatui" da Trompeo e da Bonacossa, direttori del manicomio di Torino nella prima metà del sec. XIX), etc., il carattere sottostante e precedente al manifestarsi della malattia, e la durata della patologia.Daquin distingue i folli "furiosi" in malati di cattivo carattere, difficili da trattare e che si oppongono vigorosamente a qualsiasi trattamento, e ne afferma una prognosi fondamentalmente infausta; e malati di buon carattere, che accettano le cure, rispondono meglio alle terapie fisiche, ma purtroppo vanno anche soggetti ad un "istupidimento" irreversibile se le cure vengono eccessivemente prolungate.Invece le "follie" caratterizzate da uno stato che oggi diremmo "catatonico", con accentuata tristezza o completa incapacità di rispondere agli stimoli sono dichiarate difficili da guarire proprio per l'impossibilità di riscuotere questi pazienti da qualcosa in cui sembrano costantemente assorbiti e assorti.Con esplicito riferimento alla teoria tradizionale più volte menzionata, Daquin afferma che i "furiosi melanconici" sono più difficili da guarire rispetto ai "furiosi sanguigni": la teoria dei quattro umori è qui chiamata in causa apertamente, ma in connessione a ipotesi di cause "solidiste" e quindi "nervose" di malattia; la lentezza con cui gli umori circolerebbero nel corpo del melanconico fa da controparte alla constatazione della "secchezza" delle fibre nervose in questi malati.Irritabilità o atonia, quindi eccesso o difetto di stimolazione sono chiamate in causa come origine di patologia, secondo teorie che si erano affacciate sul panorama del pensiero medico in particolare ad opera dei vitalisti, proprio in contrapposizione alle teorie tradizionali che attribuivano le diverse malattie a variazioni "umorali". E' inoltre da rilevare che il vantaggio delle teorie umorali era quello di dare ragione della "globalità" della malattia, cioè della capacità del male di interessare l'organismo nella sua totalità, mentre le più recenti teorie legate alla localizzazione del danno patologico offrivano il vantaggio di aprire la via a rimedi molto più mirati ed efficaci.A questo proposito occorre notare che il coivolgimento globale del corpo nella malattia, la teoria degli umori e l'esperienza tramandata dalle scuole mediche del tempo trovava un riscontro nell'osservazione di casi in cui la risoluzione della malattia si verifica in seguito ad una "crisi": può trattarsi di una febbre, o di un accesso diarroico, o ancora di crisi di vomito, e tali constatazioni condussero ad una vera e propria teoria della "crisi" come momento fondamentale in cui la natura opera la guarigione spontaneamente.Chiaramente di fronte a simili affermazioni suffragate da osservazioni di casi aveva buon gioco l'atteggiamento di coloro che ritenevano, seguendo il pensiero ippocratico, che "natura est morborum medicatrix, medicus vero naturae minister", affidando al medico il compito di agevolare l'azione della natura con la primaria preoccupazione di non ostacolarne il corso qualora si riscontri un effetto di miglioramento.L'aspetto interessante del procedimento diagnostico di Daquin è il suo osservare mettendo in relazione le conoscenze tradizionali e cercandone tuttavia la conferma e il completamento negli strumenti della scienza sua contemporanea, infatti alla teoria umorale e all'importanza attribuita alla "crisi" nella risoluzione della malattia egli affianca una notevole attenzione ai dati che l'anatomia patologica è in grado di fornire (a come abbiamo visto ne lamenta la scarsità attuale dovuta a disinteresse dei medici che se ne occupano). Lamenta Daquin: Al lettore contemporaneo non può non suscitare l'idea di una osservazione importante che tuttavia ancora una volta non può essere sfruttata in tutto il suo valore per la mancanza di una adeguata schematizzazione delle differenti tipologie di disturbo mentale: pensare alle malattie degenerative, alle demenze di origine vascolare che oggi sono riconoscibilie diagnosticabili grazie ad una accurata nosografia (lasciando da parte di discorso degli strumenti tecnici della dignostica) viene 57 "L'apertura e l'ispezione dei cadaveri dei folli non ha gettato alcuna luce su questa malattia e non ha dato che poco contributo al trattamento e alla guarigione" 58 "Dalle osservazioni di Meckel, dell'Accademia reale della Scienze di Berlino, il cervello dei folli è di pesantezza minore rispetto a quello dei sani. Questa differenza potrebbe essere sufficiente a spiegare tutti i fenomeni della malattia."L'[…] I vasi cerebrali sono stati spesso trovati contorti e di diametro molto inferiore rispetto allo stato naturale." spontaneo e offre la possibilità di comprendere meglio le tappe e i presupposti necessari dal punto di vista culturale e scientifico.Un interesse di tipo "frenologico" emerge dalle pagine che Daquin dedica all'anatomia patologica, infatti egli auspica ricerche capaci di associare determinate lesioni riscontrate nel cadavere alla patologia da cui era affetto:"Qu'il seroit à souhaiter que l'anatomie put decouvrir dans le cerveau les differentes lésions qu'y causent les différentes espèces de folie; quelles sont les parties alterées dans le fou furieux comme dans le fou tranquille, dans l'extravagant comme dans l'insensé, dans l'imbécille comme dans celui qui est simplement en démence!" (pag.43) 59Tale pensiero per cui ad una specifica forma di malattia mentale devono (o possono) corrispondere specifiche lesioni cerebrali, e soprattutto l'ipotesi secondo cui ad ogni tipo di manifestazione di patologia sia correlato il danno in una precisa zona cerebrale prelude alle ricerche frenologiche e alla psicochirurgia, che ha come base teorica proprio l'assegnazione di ciascuna zona del cervello ad una funzione perduta o esaltata nella malattia.59 "Sarebbe desiderabile che l'anatomia potesse scoprire nel cervello le diverse lesioni che causano le diverse specie di follia; quali sono le parti alterate nel pazzo furioso, quali nel pazzo tranquillo, nello stravagante o nell'insensato, nell'imbecille come in chi è semplicemente demente."