Nelle donne si verificano spesso amenorrea, irregolarità del ciclo mestruale, inibizione della secrezione di gonadotropine. Frequenti gli effetti mascolinizzanti ed i relativi sintomi di virilizzazione: irsutismo, tono della voce grave, calvizie di tipo maschile, ingrossamento del clitoride. Alcuni di questi sintomi e segni possono non essere reversibili alla sospensione del trattamento. Durante terapia con oxandrolone sono state riportate ipercalcemia, in genere secondaria osteolisi (specie nei soggetti immobili od affetti da carcinoma metastatico del seno), ritenzione idrica, ritenzione di sodio, cloruri, potassio e fosfati inorganici. Raramente vengono anche segnalate reazioni di ipersensibilità. Possono inoltre verificarsi epatite, ittero colestatico e anomalie della funzionalità epatica, nausea, policitemia, cefalea, ansietà, depressione mentale, parestesie generalizzate ed ipercolesterolemia.