Una volta ottenuti i dati con la tecnica PC questi devono poi essere processati per ottenere le misure flussimetriche.Usualmente l'utente delimita manualmente, su ciascuna immagine anatomica ottenuta, il contorno del vaso di cui vuole misurare la velocità del flusso; in alternativa esiste una procedura automatica che delimita i contorni sulle altre immagini basandosi sulla definizione della prima (l'utente potrà comunque intervenire per correggere eventuali errori).Una volta che tutti i contorni sono stati definiti, il programma, analizzando i livelli di grigio dei singoli pixels, estrae il valore medio del segnale dalla regione individuata "ROI". Per ogni immagine di fase questo sarà proporzionale alla velocità del sangue nel vaso considerato. Per quantificare il flusso si moltiplica il valore della velocità media istantanea per la rispettiva area di sezione (ricavata dalle immagini di ampiezza); integrando i valori di flusso, relativi alle diverse fasi del ciclo cardiaco, si ottiene la gittata sistolica .Al termine dell'elaborazione dei Si stima che, adottando le dovute precauzioni, l'errore complessivo nella misurazione dei flussi con tecnica PC può essere minore del 10%, un'entità di errore assolutamente accettabile per l'uso nella comune pratica clinica [22] [27][34].