L'analisi genetica del genere "Shigella" ha dimostrato che le sue quattro specie in realtà possiedono caratteristiche biologiche e fisiologiche assimilabili a "Escherichia coli", di cui dovrebbe essere una sottospecie, tuttavia per ragioni di praticità continua a essere utilizzata una classificazione che le considera come un genere separato. Le specie "Shigella" sono classificate in quattro sierogruppi e 45 sierotipi.