In questo suo sforzo di umanizzazione della vita all'interno dell'ospedale psichiatrico, Barison si mantenne lontano dall'orientamento di Franco Basaglia, il quale, come si sa, invece che pensare a organizzare l'ospedale psichiatrico a servizio del paziente, mirava alla sua completa eliminazione. Tra i due non ci fu mai scontro aperto, ma Barison assunse un atteggiamento di silenziosa polemica nei confronti del collega veneziano: pensava che le innovazioni basagliane (l'apertura dei reparti, le riunioni con gli ammalati...) non andassero oltre i confini che lui aveva a Padova già raggiunto ben prima di Basaglia. Le loro due posizioni rimasero inconciliabili, come due modi diversi e alternativi di concepire la deistituzionalizzazione del manicomio.