Qualora i preparati colorati in E&E non consentano una diagnosi citologica di certezza, è possibile avvalersi di colorazioni in IIC.Numerose molecole coinvolte nel processo di carcinogenesi sono state proposte come markers di neoplasia tiroidea maligna (prodotti di oncogeni, enzimi alterati, integrine, caderine, lectine); tra queste, molecole utili sembrano essere l HBME-1 (Hector Battifora mesothelial antigen 1), la TPO (tireoperossidasi), la CK 19 (citocheratina 19), il KS (cheratan solfato), la MAP chinasi (ERK), la oncoproteina ret e p16, IMP3(Insulin-like growth factor mRNA binding protein 3) e la Gal 3 (galectina 3). Tra tutti questi, il marker più promettente nella distinzione tra lesioni tiroidee benigne e neoplasie maligne sembra essere la Galectina 3 19,20,21 .L individuazione di specifiche alterazioni molecolari, soprattutto per quel che riguarda il CPT, come le mutazioni di BRAF e le traslocazioni RET/PTC, per quanto promettenti per il futuro, non sono al momento attuale applicabili di routine nella maggior parte dei laboratori 20 .