L'indicazione più comune per tale procedura è un elevato valore dell'Antigene prostatico specifico o la presenza di noduli prostatici rilevati in un esame rettale digitale. L'ecografia può rivelare il tumore alla prostata, l'ipertrofia prostatica benigna o la prostatite. L'ecografia può anche essere usata per guidare una biopsia della prostata.