Variabili in relazione a polimorfismi genetici o farmacogenetici calcificazioni o atrofia sono stati correlati con la presenza di complicanze neuropsicologiche, ma la dimostrazione di leucoencefalopatia correla scarsamente con i deficit funzionali a distanza. Tra i pazienti con LLA in trattamento con methotrexate, diversi patterns di espressione genica o polimorfismi in geni coinvolti nel metabolismo dei folati sono stati utilizzati per distinguere pazienti con maggiore rischio di tossicità o con diversa probabilità di risposta alla terapia [95].