I sintomi del rigetto cronico sono molto sfumati e progressivi in alcuni casi, e improvvisi ed acuti in altri. Comprendono tosse e sensazione di mancanza d’aria (dispnea) e, talvolta, stanchezza (astenia) e malessere generalizzato. Si verifica anche la riduzione progressiva della funzionalità polmonare. Poiché spesso, la prima alterazione è evidente solo nel test di funzionalità respiratoria (spirometria), è importante eseguirlo frequentemente per monitorare la funzione polmonare (almeno ogni 4-8 settimane). La terapia è efficace quando viene somministrata nel più breve tempo possibile (fase precoce) poiché la perdita della funzionalità polmonare, spesso, è definitiva.