Poiché il protipendile ha proprietà leggermente ipotensive, possono verificarsi disturbi circolatori ortostatici, soprattutto all'inizio della terapia. I possibili sintomi includono ipotensione arteriosa, vertigini, tachicardia, in singoli casi, dopo somministrazione orale di 80 mg e dopo somministrazione intramuscolare di 40 mg o più, fino alla sincope. Un leggero aumento di peso durante il trattamento a lungo termine è comune e in parte dovuto al blocco del recettore 5-HT2A. È stata segnalata secchezza delle fauci. Esistono casi isolati di priapismo o fototossicitá.