I metodi descritti finora permettono di misurare oggettivamente i parametri correlati ai meccanismi che regolano la funzione ano-rettale. Tuttavia il sintomo, ossia la percezione riferita dal paziente, può non corrispondere ai dati oggettivi rilevati, oppure fa si che il medesimo disturbo possa venire tollerato in modo diverso da individui differenti. Da questa premessa appare evidente che la valutazione clinica del sintomo sia possibile solo attraverso l'interazione con il paziente.Il questionario, ideato come strumento di valutazione clinica, offre la possibilità di raccogliere informazioni soggettive in modo standardizzato.L'efficacia di questo strumento è confermata dalla quantità di questionari sviluppati in campo medico. Molti sintomi o condizioni cliniche associati a svariate patologie vengono oggi valutate attraverso di essi. Ad esempio, il questionario "Migraine Disability Assessment Questionnaire" (MIDAS) valuta i disturbi provocati dall'emicrania, il questionario ABILHAND è stato sviluppato per valutare i disagi causati dall'artrite reumatoide, i questionari "Manitoba Inflammatory Bowel Disease Index" (MIBDI) e "Inflammatory Bowel Disease Questionnaire" (IBDQ) valutano la gravità delle malattie infiammatorie intestinali.