Richiamato alle armi il 24 maggio del 1915, come capitano medico di complemento, Arturo Pinna Pintor presta servizio prima all’Ospedale Militare di Torino poi, promosso maggiore, in zona di guerra, e infine di nuovo a Torino. Il 20 giugno del 1919 viene congedato con il grado di tenente colonnello. Proprio alla vigilia dell’inizio del conflitto aveva conseguito la libera docenza all’Università di Pavia; ma come docente avrebbe tenuto un unico corso presso quell’Università , nell’anno accademico 1920-21. La riorganizzazione della clinica dopo il periodo bellico richiedeva tutte le sue energie e non lasciava quasi più spazio a quell’attività di ricerca che in giovinezza aveva svolto così intensamente.