Studi condotti sugli animali per valutare eventuali effetti ed interferenze sulla funzione riproduttiva, hanno messo in evidenza unicamente effetti caratteristici di soatanze glucocorticoidi, tra l'altro a dosaggi di gran lunga superiori a quelli consigliati per la terapia per via inalatoria. I test di tossicità non hanno evidenziato potenziale mutageno del composto. Non è noto se la molecola sia escreta nel latte materno umano. Studi sperimentali per via sottocutanea sui ratti hanno evidenziato la presenza di fluticasone propionato nel latte materno solo in concentrazioni plasmatiche molto basse ma comunque misurabili.