Un fattore predisponente la malattia sembra essere la velocità di acetilazione nel metabolismo dei farmaci, che risulta essere molto ridotta nei pazienti con deficit genetico dell'enzima N-acetiltransferasi. Uno studio condotto su 30 pazienti con lupus iatrogeno ha dimostrato che 29 di questi erano acetilatori lenti; in più questi pazienti mostravano nelle urine una concentrazione di metaboliti dell'idralazina superiore a quella degli acetilatori rapidi. Tali metaboliti sembrano essere formati dall'attivazione dei leucociti, a significare che sono stimolati a produrre uno stress ossidativo, con formazione di radicali liberi e ossidanti come il perossido di idrogeno. Questi ossidanti reagiscono con l'idralazina nella formazione di prodotti reattivi capaci di legare le proteine. I monociti rilavano l'antigene e lo presentano ai linfociti T-helper, che inducono la produzione di anticorpi antinucleo (ANA) da parte dei linfociti B, responsabili della risposta autoimmune.