Voluto da Carlo Borromeo, arcivescovo di Milano dal 1560 al 1584, viene però posta la prima pietra il 22 settembre 1588. Il suo primo nome è stato "Ospedale per convalescenti", e fu costruito grazie al successore di San Carlo Gaspare Visconti (1584-1595), che incaricò l'Opera Fatebenefratelli di occuparsene. L'area è più o meno quella di oggi, limitata da via Fatebenefratelli, corso di Porta Nuova e via Moscova (allora "stradone di Santa Teresa").