La poliartrite ha spesso una eziologia autoimmune, come nel caso di artrite reumatoide, amiloidosi, artrite psoriasica e lupus eritematoso. La poliartrite può anche essere causata da un'infezione di alphavirus come il virus Chikungunya e il virus del fiume Ross. Tale condizione è definita sindrome poliartritica da alfavirus. Il Sindbis virus, che è endemico nel Nord Europa, in Africa, nel Medio Oriente e in Australia, è la più diffusa delle infezioni che causano poliartrite, anche se la presentazione è generalmente lieve o asintomatica.