In corso di trattamento con etoricoxib sono stati evidenziati effetti indesiderati a carico dell'apparato gastrointestinale, e fra questi dispepsia, pirosi gastrica, senso di fastidio epigastrico, nausea e vomito, dolore addominale, flatulenza, diarrea, esofagite, gastrite, ulcera gastroduodenale. Sono possibili anche effetti avversi di natura psichiatrica e coinvolgente il sistema nervoso, quali capogiro, cefalea, ansia, depressione, irrequietezza, e più raramente allucinazioni e stato confusionale.