Da un punto di vista scientifico fu importante l’avvio da parte di Magrassi di un programma di ricerca nel settore della patologia infettiva e dell’immunologia, studi che lo avrebbero imposto all’attenzione della comunità scientifica internazionale. Il suo nuovo approccio allo studio delle forme patologiche e di come esse si manifestavano da un punto di vista clinico, gli consentì di formulare il concetto di attenzione alle cause e alle modalità di comparsa di molte malattie infettive. Inoltre egli portò avanti il concetto di infezione focale, tenendo in considerazione tanto la trasmissibilità dei germi e del loro tropismo quanto i fenomeni immunitari che si instaurano nelle cellule e nei tessuti dell’organismo ospite. Si ricordano le parole del Prof. Giuseppe Giunchi che, ricordando l'amico e collega Magrassi, racconta come quest'ultimo avesse sviluppato una sua idea originale dell’eziologia complessa e condizionata di molte malattie.