Bouillaud fu uno dei primi sostenitori della digitale per il trattamento dei disturbi cardiaci. Si riferiva alla digitale come "oppio del cuore". Insieme al cardiologo Pierre Potain (1825-1901), eseguì studi sui "toni cardiaci" che coinvolgono la differenziazione tra ritmi cardiaci normali e anormali. Bouilland fu un ardente seguace di François-Joseph-Victor Broussais (1772–1838) per quanto riguarda la dubbia pratica del salasso . 