L'interesse e l'impegno verso i più piccoli portò Maria E. Zakrzewska a conoscere, una giovane donna che in passato aveva accudito e trovato una casa a più di ottocento bambini. Nel 1862 fondò il New England Hospital for Women and Children per donne e bambini, il primo ospedale a Boston che avesse una scuola per infermieri e il secondo ospedale in America ad essere gestito da medici e chirurghi donne. Diversi amici, tra i quali ricordiamo Mrs. Ednah D. Cheney, la aiutarono molto, anche economicamente, fornendole ad esempio alcuni apparecchi necessari ad un ospedale o alcuni mobili che sarebbero potuti tornare utili. Benché il nome iniziale fosse "New England Hospital for Women and Children", l'ospedale fu conosciuto col nome, più corto, di "New England Hospital". Maria Elizabeth Zakrzewska si adoperò moltissimo per l'ospedale e ben presto, ancora una volta, dimostrò sintomi dovuti a sforzi ed affaticamenti eccessivi. Decise così, qualche anno dopo, di farsi affiancare dal Dr. Sewall. 