Nel 1990 l'istituto divenne Istituto di ricovero e cura a carattere scientifico (IRCCS). L'attività di ricerca portò alla scoperta dei fattori patogenetici di molte patologie dermatologiche e la messa a punto di nuovi protocolli terapeutici. Ne conseguì un rapido sviluppo dell'organizzazione ospedaliera, improntata all'interazione e allo scambio tra medici e ricercatori, e la creazione di nuovi servizi e ambulatori specialistici per la cura di un numero sempre più ampio di patologie.