Le immagini ponderate in densità protonica (DD) vengono ottenute utilizzando un tempo di ripetizione lungo (TR) e un tempo di eco breve (TE). Nelle immagini dell'encefalo, questa sequenza permette di creare una distinzione più marcata tra materia grigia (più chiara) e materia bianca (in grigio scuro), ma con poco contrasto tra cervello e liquido cefalorachidiano. È, inoltre, molto utile per l'individuazione di malattie articolari e lesioni muscoloscheletriche.