Kan'eiji botere handiko eserlekua izan zen 1868ra arte. Orduan, armada inperialaren aurkako shogunatearen azken postuan bihurtu zen borroka-eremu, eta eraikin gehienak suntsitu egin zituzten.
Kan'eiji-ren hiru propietate bakarrik geratu ziren zutik 1868an hemen izan ziren gertaeren ondoren.