Goiko Basilikan, berriz ere 2000. urtean ireki zen 24 orduko zaharberritze-lan gogorraren ondoren, Cimabuek absidean eta ezkerreko transeptuan egindako lanak beltz bihurtu dira, pinturetan oxidatutako berun zuriaren argazki negatiboen antzekoak. Hala ere, oraindik ere nabaritu daiteke bere Gurutziltziketan jendetzaren angustiaren intentsitatea, lurrikararen indar kaltegarriagatik onbera dena.
Goiko Basilika ez zen inoiz berriro ireki kalte handiak zirela eta.