Kristautasunean bere agintaritza zentralari mehatxu bat ikusiz, Hideyoshik sistematikoki kendu zuen kristau jarduera; 1597an, sei misiolari eta 20 japoniar bihurtuta gurutziltzatu zituzten Nagasakin.
Hideyoshik gogo biziz besarkatu zuen kristautasuna, eta bere boterea indartzeko modu gisa ikusi zuen.