Santorinik Zikladetako beste uharte askoren antza zuen 1500 b.c. ingurura arte, sumendiaren erupzio masibo batek uhartearen barnealde osoa atmosferara eraman zuenean, urte batzuk geroago lurreko klima aldatuz.
Santorini beti ikusi izan da beste uharte guztiak bezala; mendia sumendia da, baina ez da aktiboa.