Ε.Α. Ρεθυμνιακού
 Η Ε.Α.Ρ. προέκυψε το 1983, ύστερα από τη συγχώνευση των σωματείων του Ρεθύμνου, «Ατρόμητος» (που ιδρύθηκε τη δεκαετία του 1920 και ήταν ένα από τα τέσσερα ιδρυτικά σωματεία της ΕΠΣΡ) και «Α.Ο. Ρεθύμνης», (ο οποίος με τη σειρά του είχε ιδρυθεί το 1967 με συγχώνευση των ομάδων Ρεθυμνιακός, Νέος Αστέρας και Νέος Κεραυνός με εντολή του Στρατιωτικού Διευθυντή Ρεθύμνου). Το ποδοσφαιρικό τμήμα της Ε.Α.Ρ. μετείχε για μεγάλο διάστημα στο πρωτάθλημα της Β΄ Εθνικής κατηγορίας. Από το 1999 είναι ανενεργό. Τα πρώτα δυο χρόνια της ύπαρξής της η Ε.Α.Ρ. αγωνίστηκε στο πρωτάθλημα της ΕΠΣ Ρεθύμνου. Το 1985 κατέκτησε το πρωτάθλημα ΕΠΣΡ και προβιβάστηκε στο Εθνικό Ερασιτεχνικό Πρωτάθλημα. Το 1987 κατέκτησε το πρωτάθλημα στο 2ο όμιλο και ανέβηκε για πρώτη φορά στη Γ΄ Εθνική, και την επόμενη περίοδο πετυχαίνει δεύτερη συνεχόμενη άνοδο ως δευτεραθλήτρια του ομίλου της. Στη Β΄ Εθνική αγωνίστηκε για 9 συνεχόμενες περιόδους από το 1988-89 έως 1996-97. Ακολούθησαν 2 ακόμα χρονιές στη Γ΄ Εθνική ώσπου το 1999 διαλύθηκε. Στο κύπελλο δεν είχε ιδιαίτερες επιτυχίες , το 1990-91 είχε την καλύτερη πορεία φτάνοντας στους 16 του θεσμού. Πριν τη διάλυση της ΕΑΡ, είχε ιδρυθεί η «Ακαδημία ΕΑΡ 2000» το 1996, η οποία έκτοτε συμμετείχε στα πρωταθλήματα της ΕΠΣΡ. Την περίοδο 2007-08 μετονομάστηκε στο σύγχρονο «Ρεθυμνιακό Α.Ο.», ο οποίος με τη σειρά του το 2015 ίδρυσε θυγατρική ομάδα-φυτώριο με την ονομασία «Νέοι ΕΑΡ» που συμμετείχε στη Β΄ Κατηγορία της ΕΠΣ Ρεθύμνου το 2015-16. Β΄ Εθνική : 9 (1988-97) Γ΄ Εθνική : 3 (1987-88, 1997-98 , 1998-99) Δ΄ Εθνική : 1 (1985-87) Κατά την αξιολόγηση των ελληνικών συλλόγων που εξέδωσε το Νοέμβριο του 2011 ο Σ.Ε.Γ.Α.Σ., η Ε.Α. Ρεθυμνιακού βρίσκεται στην 34η θέση (σε σύνολο 299 συλλόγων). 2 Πρωταθλήματα κλειστού στίβου γυναικών: 2009, 2010 Νικόλ Κυριακοπούλου Μαρία Πάνου «Η Ένωση του Ρεθύμνου», αφιέρωμα στον ιστότοπο OnSports.gr, 15 Ιουνίου 2011.
Η Ένωση Ατρομήτου Ρεθυμνιακού (Ε.Α.Ρ.) είναι αθλητικός σύλλογος που ιδρύθηκε το 1983 και εδρεύει στο Ρέθυμνο. Διαθέτει τμήμα στίβου, στον οποίο έχει πετύχει σημαντικές διακρίσεις. Στο παρελθόν διέθετε και ποδοσφαιρικό τμήμα, όμως ανέστειλε τη λειτουργία του το 1999.