Mandé à la cour, le cardinal reçut.du roi quelques reproches; mais Clément VIII approuva sa conduite, et adressa en 1602 au chapitre un bref des plus mortifiants. En 1606, un prêtre, nommé Philippe Premier, ne résidait pas depuis langtemps dans sa cure; sommé d'y revenir, il se targua de la protection du maréchal d'Ornano, et répondit avec arrogance aux ordres du prélat, qui alors l'excommunia. Sur son appel, le parlement déclara l'excommunication nulle et abusive, et ordonna au cardinal d'absoudre la partie dans le jour, ad cautelam, sous peine de 4,000 livres d'amende et de la saisie de son temporel. M. de Sourdis résista à cet arrêt arbitraire, défendit avec chaleur son droit devant plusieurs juridictions et sortit avec avantage de cette affaire.
Une fut pas aussi heureux dans celle que lui attira, en 1615, sa compassion intempestive pour Antoine de Castaignet, sieur de Haut-Castel. Ce gentilhomme ayant été condamné à avoir la tête tranchée pour ses crimes, le cardinal et le maréchal de Roquelaure obtinrent du roi sa grâce, qui fut ensuite révoquée sur les représentations de quelques membres du parlement. Le cardinal, accompagné de quarante ou cinquante gentilshommes, fit enfoncer la petite porte de la conciergerie et délivra Haut-Castel, qu'il conduisit aussitôt àLormont, pour le soustraire au supplice. Cette action fit d'autant plus d'éclat qu'elle coûta la vie au concierge de la prison, qui fut tué d'un coup d'épée pour avoir refusé la clé de la chambre où était le criminel. L'archevêque fut décrété de prise de corps, et Louis XIll, qui était alors à Bordeaux, renvoya au pape la connaissance de cette affaire. Le cardinal en fut quitte pour quelques mois d'interdiction et d'exil.
