Pese a los esfuerzos por retenerlo y contar con él esta temporada, finalmente las 'Cabras' accedieron al traspaso a cambio de 15 millones de euros. Los 13 goles de la campaña anterior fueron la mejor carta de presentación de Córdoba, quien luego de varios rumores y posibles destinos por toda Europa, firmó contrato con el equipo azul de Berlín.	
Jhon Córdoba cambia de equipo, pero se queda en la Bundesliga