La biblioteca de este centro, junto a la otra corporación jesuitica de la provincia, el colegio de Santa Catalina de Córdoba, fue integrada en la del obispo por disposición de Carlos III cuando decidió la expulsión de la Compañía de Jesús, resolución de la que el jueves pasado se cumplieron 253 años. En 1999, según explica Arredondo, el hoy arzobispo de Granada, Javier Martínez, entonces al frente de la diócesis de Córdoba, dispuso la creación de la Biblioteca Diocesana para agrupar la del Obispado, «con toda la carga documental diocesana», la del Seminario, que se remonta a 1548, y la de los jesuitas.	, donde falleció en 1569, pudieron ser identificados en el conjunto de la biblioteca del colegio de la Encarnación, que él mismo había fundado, porque una mano anónima anotó: «Este libro fue del maestro Ávila» en cada uno de los ejemplares. No está documentado a quién pertenecía esa mano, pero sí que fue uno de sus discípulos, Juan de Villarás, el que se hizo cargo de sus pertenencias cuando falleció y las llevó al colegio de la Encarnación.	en púrpura, promovido por el Ayuntamiento para dar a conocer la importancia de la cultura cristiana, destaca que san Juan de Ávila «fue teólogo, pero la importancia que tiene más que nada es por su buena doctrina». A su juicio, «lo que realmente convierte interesante sus libros es que pertenecen a grandes teólogos del momento, cuando la Iglesia está pasando por una faceta de renovación, por el Concilio de Trento y toda la doctrina luterana, casi todo los libros que tiene son de controversias de la época».	
Una muestra da a conocer la faceta humanística de San Juan de Ávila