La Fundación de la Misión Jesuita de San Miguel de Mocorito fue fundada en 1594 por misioneros jesuitas. Juan Salvador Avilés Ochoa, cronista del municipio de Mocorito, señaló que esta iglesia se instaló en este lugar para cumplir las órdenes del rey de España, las cuales eran enseñarles la religión católica y las primeras letras a través de la enseñanza del catecismo.	Detalló que la Misión Jesuita no era como actualmente se conoce; indicó que las primeras eran construcciones muy parecidas a las famosas enramadas que existen actualmente y que estaban elaboradas por palos de vegetación que existían en ese tiempo y con ramas; agregó además que esto se sabe gracias a cronistas de la época y algunos documentos.	“Entonces este tipo de construcción que ahorita tenemos viene a medidos del siglo 18”, dijo. La iglesia estaba dedicada al arcángel San Miguel cuando llegaron los jesuitas, porque se dice que la fundación de la iglesia y de los jesuitas fue el día 29 de septiembre, y después a mitad del siglo 18 hubo un decreto de un papa de que muchas iglesias fueran dedicadas a La Purísima Concepción y entre ellas la iglesia de Mocorito, comentó Juan Salvador Avilés Ochoa.	
Por la orden de un rey español existe la parroquia