En lo que atañe a la Presidencia de la República, el gabinete militar del Jefe de Estado también ha sufrido un cambio significativo. El puesto de Jefe de Estado Mayor del Presidente de la República, anteriormente ocupado por el hijo del presidente, Adam Idriss Deby Itno, quedará a cargo del general Bichara Issa Djadallah, según Tchadinfo.	En esta zona del lago Chad opera principalmente la facción de Boko Haram que comanda Abubakar Shekau, mientras que en el noreste de Nigeria está operativa su escisión, Estado Islámico en África Occidental (ISWA, por sus siglas en inglés), que cuenta con el reconocimiento del líder de Estado Islámico, Abu Bakr al Baghdadi.