La Corte Suprema en pleno analizó la situación de la togada. Los compañeros de Cristina Lombana aceptaron los argumentos de Cepeda y la recusaron de las investigaciones. Según el caso, su carácter como militar riñe "con la preservación de las garantías de independencia, imparcialidad y juez natural" que exige la legislación colombiana.	En el caso no se aceptó el argumento de Cepeda, según el cual Lombana había trabajado con el abogado de Uribe, Jaime Granados. Este argumento fue develado en una columna de Daniel Coronell, pero fue descartado. También se descartó que Lombana fuera "subordinada" de Uribe, quien como presidente fungía de jefe máximo de las Fuerzas Militares.