Mercado Villar es investigado por contrato sin el cumplimiento de los requisitos legales y peculado por apropiación, dentro de un proceso que también vincula al exalcalde Miguel Francisco Vergara Román, al ex tesorero, Roque Miguel Castro Benavides y la representante legal de la Asociación de Municipios de Córdoba y Sucre, Lucia Solano Díaz.