La hidrovía Paraná-Paraguay tiene una gran relevancia económica para la región, atendiendo a que es ruta de salida y entrada de productos y manufacturas. Gran parte de la exportación de la soja paraguaya se realiza a través del río Paraná, y no siempre las condiciones de navegabilidad son las ideales, especialmente en temporadas de estiaje.	Entre los proyectos que se impulsan a través de este organismo está la construcción de la represa hidroeléctrica de Corpus, en el eje Misiones (Argentina) e Itapúa (Paraguay), que ya tiene culminado sus estudios técnicos y de factibilidad, y la construcción de la represa de Itati-Ita Cora, a la altura de la provincia de Corrientes (Argentina) y el departamento de Ñeembucu, (Paraguay).