El ahora excamarista presentó su dimisión por falta de garantías de los ministros del Poder Judicial, según sostuvo. Siendo juez de un tribunal de apelaciones integró la Sala Penal de la Corte para atender el recurso planteado por la defensa de los campesinos que habían sido condenados por la masacre de Curuguaty.	Es que los ministros de la Corte no pueden ser indagados por el Jurado, ya que tienen fueros. Lo que objeta Martínez Prieto es que se les abra un proceso y eventualmente sean destituidos del cargo, siendo que hicieron el trabajo que deben hacer los ministros. Sostiene que los jueces que integran las salas de la Corte también deben tener las mismas garantías a la hora de resolver.