El Vaticano instó en varias ocasiones a Cardenal y a los otros sacerdotes a renunciar a los cargos políticos que ocupaban, ya que el cánon 285.3 del Código de Derecho Canónico no se los permitía: “Está prohibido a los clérigos asumir cargos públicos que compartan una participación en el ejercicio del poder civil”.	Para entonces, Cardenal tenía 60 años y dijo que que aceptaba la disposición del papa Juan Pablo II “porque me la han impuesto”. Aseguró, además, que continuaría su sacerdocio “porque el canon religioso dice que se prohíbe ejercer cargos de poder civil, y yo tengo un cargo solamente al servicio del pueblo”.	La sanción contra Cardenal se produjo dos años después de la visita del papa Juan Pablo II a Nicaragua, cuando éste lo humilló en el aeropuerto de Managua como castigo por formar parte del gobierno de Ortega. Cardenal aseguró en una entrevista hecha por El Semanario en 1996 que el pontífice le dijo: “usted debe regularizar su situación”, éste se quedó callado y “entonces él lo repitió, no fue que me estuviera diciendo muchas cosas, únicamente la misma frase dos veces y con ese tono brusco que se ve en los videos”, asegura.