Sin embargo, eso no ha impedido que en distintos momentos varios de sus sacerdotes hayan sido blancos de acoso e inclusive ataques físicos por parte de simpatizantes del Gobierno; el más grave ocurrió en julio del año pasado en la ciudad de Diriamba, cuando fueron golpeados el cardenal Leopoldo Brenes, su entonces obispo auxiliar Silvio Báez y el nuncio apostólico en Nicaragua Waldemar Stanislaw Sommertag.