El 23 de septiembre el poder judicial dio a conocer la orden de captura y allanamiento contra Maradiaga y el 29 de septiembre, la policía orteguista allanó las oficinas del IEEP en Managua, donde sustrajo papelería y computadoras. La persecución inició el 5 de junio, cuando la policía orteguista lo presentó como líder de una estructura criminal que trabajaba con una banda delincuencial conocida como El Viper.